CsGy5G001830 (gene) Cucumber (Gy14) v2

NameCsGy5G001830
Typegene
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Gy14) v2)
DescriptionUnknown Protein
LocationChr5 : 1147251 .. 1153167 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCTCGTTAATCAGTAGACATTAAAAAGTCAGTCATTCAAGATTATTAATTGAAGTTGAGTAAATTACAAAACATCGATTTTCATAAGAAATGTTGTCGTTTGAATATGTTTTGAAAATCTATAAGTGGCTGATCTTTTTTTTAAAAAAAAAGCAACAAATTAATAGGAATTTTAAATTAATTTAAAGTAGGTATCAAATTAAATTGAATATGTATTAAGTACAATAAATTTAATGAAATCAAATGACGATAATAATAATTTTGGTGGTTAAAATGCTCTTGTGTATTTTAATATTTCAAATTTAACTTCTACAGAGTTAATTTATAATATTTATTAATATTACTAGTCAATGTTGATTATAAAAATTCAAAAACTTAAATTTAGGATTTTCACGTAAATTTTAGATAAAACGATTGAAAATATCTCTAAAGTACAGCATATTATATACGGCAAAATTTCATATTATATCAATATCAATTATCGATAGGATTTTTTCATGACAATCTATCAATATTTATTATGGATTAAATTTTAAAATGCCTATTTCTTAAATTAGAATCCACGAGTAAAATCAAATAAGTTCTGAACGGAAGATTTTATAAAAATAAAAAATTGATAAACTATTTACGTTTGAAAATAAAGTTAATTATGTTTATTTTTGTTAGGAAGTATAAACGTATTTTAAGGTCTTTCTTTATTGAAAAAAAAGATATATTAATATAAAATAAAATAGAAATTTAGAGGGTAGATCACAAATATGGAGTGAAGCGGTCATGGAGTTGGCGCTTTTACTTCCTCAATAGCACTAAACGGTGCGTTTCCACTATTTATTATCATATTTTCAAAATGTTATAATTATAATTACAATTATTGTTGTTCCTTCAAACCCAATATTTTATAGACACCTTTCACCTTGCTTTTAATTGGGTGGGTGTGCTTTCTAAGTGCATTGAACTAATTTATGTTTGAGTCTCACCTCTACTTTTTTTTTTTTTCTTTTCATTCTAACTAAAATTATCATCTTCAAATATAATCCAAATCAATCTAAATATTTAAAAATATTACTAATAAACATTCATAAAATTTTTTATTATAAATTGATCAAATCTAAAATTTATTCTCTCCTACAATTATTGAGATGAAATATAAAAGTATTAAATTAACCCATTAAATCTCGAGGTAGTCCAGAAGCAATGATTAACACCAACTTCCCTGCGGTCATAAAATATGTATAAATTGCTCTTTTATTTAAATAAAAAGTTAGGTAAAATAATCATGCTCATTATATTATTGGAAGACTATATATATGATAATAAGATAGAAATATGATTTGTTGAATAGCCTTTCCCATTTTAAACTTTTTATATTTTTTTATATGTTTAACGATATGAAATAATAAAATAATTCGAAAGTTAGGTGGAATCTATTAAATTATTTGTTACATTGAAGAGAATAAGAGTTTTCAATTTTTTATGGTAAAGAAGAGCATTGATTCAACTATAAATTTAGGTCTCAAGTAATCATATATACTTTTGTTTATTTGATTTTTAAACTTAAAAAATTACCTTTCAATGATATATGTTTTCGAAATTATGTATTTTCATAAATTGTATTCTTATATGGTTTGTTTCTAAAAATTGTTTTGAATGTCTGTTCTTGTAAATAATAATAATAATAAACAAATAAATACGATTTTTAAAAAGAGTAAATATTAAATTTATTTATAAAATATAATAATATTTATATATAGTTTCATTTTTATATCATTACACTTCTCATAAATAAAAATAAAAGAAATTAAACAAATTCTTTCCGCTCCATATTTTTTTTCGTTTTACGTTTTTCGTTTATAAAATTTGCATCTTATCTTATCTCTGAACTGTACTTTTTATTTTTCCAAGAATCAAGAATATTTTGGAAAGAAACAGAAAAAGAGGTACTAAATTACAAATGACGTCAAATTTTATATTAAGGAATAATTTGTCAAATTAGAAATACAAGGCAAAAAAAGAGTAATATAATATCATTTCTTGTCTAAAAACCATAATTTGTACCACTTTTAAGTTGGTGAAAATTGAAATTGGAGTAAAAAGATAATAACGTGACATTATTATTAACTTTTAATATAATATATGCTTTTCAAGGTTAAACAATAGTCCTAATCTGTTGTAGTTACTACCAAGATAGAGGCAGATAGATATATTTGATGTTAAAGGATATATATGTTAATTCATAGATCAGATTGGTATTTCTTTAACATCAAACCATATATTACTTAGTTAACTCCAATCATGTCATTGAATATAGAGTTCTGTTAATAGTTTGAACATTATACTTAATTTTTATTTTTGAAAATTTTAATTTATATATTTTATCGAGAGTTCATGCAGTTTCATATAGCTAGAGTAAAGATGATTTTAAAATATATATATATATATAAAAACTTTTAAAAATCTTTTTATTTCCCTCGAAAAATAGAAGATACAACAACTTAACATAGAAAATATTTGCAAAATTGAAGAAAGTCATGATTAGTAAAAAAATCTGAAAAGTTAAAGTTCATACTTATCTTAATAGCCATGGAAAATAGAGATATTTAAATGAATTACCATATTTTAATTATTTAATAGGTGTTAACTAAACCGAAAGTTTCCTTCTTTAAGAATTTAAGTTAAAATTATAAATCTTGAAATTAATGAATCTCCAAATAAACTAAATAAGAGTATAACGTTCTAGAACTACACATTAAATACAAATCAAATTCAAATTTTGAGTCAATTAAACTTTATATAGAAATGAAATAAACTAAAAAAAACGGTATTGTTTCTTTTTTTTATTATTGTTTTGGAAAGATAATAAAGAAAAAGATATTTTTAAAAATAACAAAATATTAAACTTTTAAAAAATATAACAAATTTTATCCATTTTTTCATAAATTGTAAATCACTTCAATATTCCGTTAAACCCTCCTAAAAATATATATATTTAAAATAAATATTTAATTATTGAAAAGTTTAAAAACAAATAATTACTTAATTTTATAAATATAACAAAGTGTCATTAAAAATATATATGAAATTTATCATTTTTTAAAACATTAGGTTTGTCCTTCTTTATCCTCATCTCCTGGGATATTTTTTATTTTCATAGTTTTTATTCTTCTTCTCAATATTTTTCAGAAATATTTTAATATCCTCCCTTTTAATTTACTTTTGTTTGCAATTTTTCTTTTTCTTATCATCATTTTTTGTAAGTATTTTTTCTTTTCTTTCTATCCTTCTTTCTTCGATATTTTTTTAAATTTTAGTCAGATTGTTATTTTATTCAATAATATATTTTTTTCTAATTGTTATTTGATTTTTTAAGATCATCGTTTTTAAATATATTAGATGTCATGACATTTTTATATTGTTTATTTTAGGTTTTTAGGTTTTTTATTTTTAAAATTGTAAATATTTGGGTGTTTGGTTGTATTTGAGAATACTGTTAGATACTTTGTATTAATTTTAAAGACTAAAGTATATAATTAAGAAAAGGCAAGAAAAAATAGACGGGTGTGTCGGTGGAGGGAATCTAGAAGTTAATTCGGGCACATTATTCGAATAAATGACTTTTGTTACCAATAATTGATTTACAACTCACATGGCATTTCAATGTTTAAACAAAATATATTCGGTGAACGATTTCACAATAATTTTCATTTCAACTCTATTCCAATTTCGACATTTAATTTTATAATATAAAGTTCAAACCTATCAATTTTTTTAAGGTTATTTTTTCATTCCCTTCTAAGAAGAGTTTTATTGCACCCAAATTGATATTTCTTCCCTTTGTGACATCGAAATATTCACAAGAACGATGGTTGATATCAAGGATCAATTCACTTTTGTTTCTTTCTTCAATTACGACATCGTTACAAACCTTTTCATTCGTTTTTAGTAATTTGAATTTTCAACTTTAGTATTTGATGTTTTGGTATGTTCCTTCTGCATAGTGATTTTGTTTAGGTTAAAAACATCATTTTAGTTGTTTGAATTTAATCTTTATATATATATATATATATTTATTGTGAATCTTAAATTAATTCATGTACTTTTATATTTAACTTAAAATATTAAATTTAAGATCTACAAAAATACGTAGATAAATCGTTTAGATTTATTGAAATAAAAAAATAGAGAAACCATAATAGATCAAAATATGTACTAAAACCAAAAAGAGCTTTCCTCTCGTTTTATGAGTTGTGTTTATTTATTTTATTTTCTTTTTGAGTTAAGATATTGCTAGACTTGTCGGTGTTCAACTAATAAGTTAAGTTGAATTCGTATAATTTAAAATTTTAAAATTATAGAGTATTTACATTAGTTATGTTCCTAAACTTCTCATCGATTTATTTTGATGATGAAACCGAGCATGTCTATATCTAATATTCCAACCTAAGTTTTATAAAAATTCAAATTTGGTGGACTAGCAATTAGCTGGCCAAATACCCTAGAAATGTAGTGAGCTTTTCTTGAGAAGACAAATAGTACTAAGAAGAGAGTAAAGACAATATACCTTTTTTTTTAGTAGAATTTGAGGCTTGGAATGTGAAGTAATAACAGTAATAATACATATATATTGATATGATCTCAAAGTTGAAAATTTAATCTTACTATAAGTGAACTAGCTATCCATGTGCTTTTACTTCAAGAAAATCCTTCCATATTCATATCCCTATCATTCTTTAATTTTTTTTTTCTTTTTGCATCCTTATTGAATTTGACTAATGTGTATCGATCAGTGTTTGATTTATTCACTTTAATTTAAACACCACACTCCACTAATTTTCCAATATAAATGTAAATCATAATGAAATGAATAGCTAAGGTATAGTAGATCAAAACACAATTGTCTTGTATAGATGTGAGGAAAAGCAAATCAAATGGTATATTGGATTAGTCAATGAGATAAACATATACTAAAATAAGAGAGTTTTTTTTTTTTTTATAGAAATTTGAAGTTTAATTGATCATGACCCAAAATAATTGAAGGAGACTATTTGAAAATACAATGGAAGATTTACAACACACTCTCTTTAGGAGCATATATTAGTGGGAAGAAGTTTTTGATCAGTCAATATTATTCTCTCTTTTCACCAAAAGCAATTAATTGCTTTGCACATCCTTCTAATCTATGGATAAATTCTACTGGAAATTAAAACTACTTCCCAACGACAAATCTCTAATGGGATAGTTTATCACTTTCCAGTTAGAAAGGCTCACAAAACAACACACACATAAGAAGAAATGGACATTAACGAATACAATAACCAAAGTACACCTCGTCAAAGCTCTAGGCAATTGCAATAGTGGCATCCACCAAACACGTAATCACTCTTGGCTATTGCAACAAAGGAATTGATTACTAACACTTTTTTCAATAGCATTATATCAACTACCATCACATCAAAAGTGAAAAAGTGAGTCATAATATTTGTAATAAGATCATGTCAAGGCCACAAACATTTTAGGTAAGTTTGAATTTCATACAAACACACAGTAGGAAAAAGCTGTAGGAAGGGGTAGATCCTTTTTGGAGGGACCAAAATTTCACAGCACAAAAGAAATTTGAAGGCATTTGGGACAAAGAAATGGTCTTTGTTTCATAAAAGGAAGCATCAAATGCTTATTCTTGTACTTTCATTCCTATCTCTAAACAAAAAGAAGACTAATACCACTTCAGATAGTTTTCAAGTAATTAATGATATATATTTTTATTTGTTTTTTTGGTTTTAAGTTTAATCAACTATTTTACATTATGGAAAGTGCTTTTTTTAATGCTTTTAAAGTCTTGGTTTTCCAGCTTGCCAAACATGGAGATGGAGATGCAGTATGTACAGATGGGAAAAGAATTGAATGGATGTGGCCCTTGA

mRNA sequence

ATGTCTCGATTTTCACGAAGTATAAACACACCTTTCACCTTGCTTTTAATTGGATGTGAGGAAAAGCAAATCAAATGTTTAATCAACTATTTTACATTATGGAAAGTGCTTTTTTTAATGCTTTTAAAGTCTTGGTTTTCCAGCTTGCCAAACATGGAGATGGAGATGCAGTATGTACAGATGGGAAAAGAATTGAATGGATGTGGCCCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCTCGATTTTCACGAAGTATAAACACACCTTTCACCTTGCTTTTAATTGGATGTGAGGAAAAGCAAATCAAATGTTTAATCAACTATTTTACATTATGGAAAGTGCTTTTTTTAATGCTTTTAAAGTCTTGGTTTTCCAGCTTGCCAAACATGGAGATGGAGATGCAGTATGTACAGATGGGAAAAGAATTGAATGGATGTGGCCCTTGA

Protein sequence

MSRFSRSINTPFTLLLIGCEEKQIKCLINYFTLWKVLFLMLLKSWFSSLPNMEMEMQYVQMGKELNGCGP
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsGy5G001830.1CsGy5G001830.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePROSITEPS51257PROKAR_LIPOPROTEINcoord: 1..19
score: 6.0

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CsGy5G001830Cucumber (Gy14) v2cgybcgybB127
CsGy5G001830Cucurbita maxima (Rimu)cgybcmaB608
CsGy5G001830Cucurbita maxima (Rimu)cgybcmaB620
CsGy5G001830Cucurbita maxima (Rimu)cgybcmaB638
CsGy5G001830Cucurbita maxima (Rimu)cgybcmaB661
CsGy5G001830Cucurbita moschata (Rifu)cgybcmoB583
CsGy5G001830Cucurbita moschata (Rifu)cgybcmoB596
CsGy5G001830Cucurbita moschata (Rifu)cgybcmoB617
CsGy5G001830Cucurbita moschata (Rifu)cgybcmoB639
CsGy5G001830Cucurbita pepo (Zucchini)cgybcpeB597
CsGy5G001830Cucurbita pepo (Zucchini)cgybcpeB619
CsGy5G001830Cucurbita pepo (Zucchini)cgybcpeB685
CsGy5G001830Cucumber (Chinese Long) v2cgybcuB222
CsGy5G001830Cucumber (Chinese Long) v2cgybcuB224
CsGy5G001830Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cgyblsiB294
CsGy5G001830Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cgyblsiB353
CsGy5G001830Melon (DHL92) v3.5.1cgybmeB298
CsGy5G001830Melon (DHL92) v3.5.1cgybmeB355
CsGy5G001830Melon (DHL92) v3.6.1cgybmedB298
CsGy5G001830Melon (DHL92) v3.6.1cgybmedB357
CsGy5G001830Watermelon (Charleston Gray)cgybwcgB332
CsGy5G001830Watermelon (97103) v1cgybwmB381
CsGy5G001830Wild cucumber (PI 183967)cgybcpiB224
CsGy5G001830Wild cucumber (PI 183967)cgybcpiB226
CsGy5G001830Silver-seed gourdcarcgybB0048
CsGy5G001830Silver-seed gourdcarcgybB0370
CsGy5G001830Silver-seed gourdcarcgybB0709
CsGy5G001830Cucumber (Chinese Long) v3cgybcucB229
CsGy5G001830Cucumber (Chinese Long) v3cgybcucB232
CsGy5G001830Watermelon (97103) v2cgybwmbB319
CsGy5G001830Wax gourdcgybwgoB413
CsGy5G001830Wax gourdcgybwgoB459