CsGy4G002310 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATAAGAGTAAGATTGGTATTATATATATATATTATTCTTTGACCTTTTTGTTTCCACACCAAACCTCCCTACTCTCTCTTTCCTCAACGCTTCCTTTAGTCCTTTACCTAACAGGCCATCGTCTCCCCCACTTTACCCAATGCCTTACTGATCAAAAACTCTCTCTATTTAATCACAACTTCATCTTCCCCATTTCTCTTCAAATCTCATCACCAAATAACCAATTCAATTTGATACTTGAACTCCTATCTTCGTTCAACTCCTTCTACTAATCTTATATCTTTGTCGTTTATACAAATACAATTATACATGGCTCAGAAGGTTTGTGCTAACCAAAATGGTTCGGTGGAGACCTTGTGCAATACCCATCAGGATCCACTCAACTGGGGTTTGGCAGCTGAGTCCATGAAGGGAAGTCATTTGGATGAGGTGAAACGGATGGTGGAAGAATATCGAAGGCCTCTGGTGAAGCTTGGAGGAGAAACTCTCACCATTTCTCAGGTTGCTGCCATTGCCACTCGTGATAATGATGTTCTTGTGGAATTGGCTGAGTCTGCAAGGGCCGGTGTCAAAGCTAGCAGCGATTGGGTGATGGAGAGCATGGGTAAAGGCACTGATAGTTATGGTGTCACTACTGGCTTTGGTGCTACTTCCCATAGAAGGACCAATCAAGGTGGAGCTCTTCAAAAGGAGTTGATTCGGTTTTTGAATTCTGGCATCTTTGGAAATGGAAGTGAATCAAATCACACTTTGCCTCACTCTGCAACAAGAGCAGCTATGTTGGTGAGAATCAACACTCTTCTTCAAGGGTATTCTGGCATTCGATTCGAGATTTTGGAAGCCATTACTAATCTCTTGAACCACAACGTCACTCCATGTTTGCCACTTCGAGGAACAATTACTGCTTCGGGAGATTTGGTTCCTTTGTCTTATATTGCGGGGTTGCTTACCGGTCGTCACAATTCAAAAGCTATTGGACCGAATGGAGAAACCCTTGATGCAAAGGCTGCTTTTACACAGGCTGGTATTGATTCTGGGTTCTTTGAATTGCAGCCTAAGGAAGGTCTTGCTCTTGTTAATGGCACTGCCGTCGGTTCTGGATTGGCTTCCATTGTTCTCTTTGAGGCAAATATTTTAGCCGTTTTGTCTGAAATTTTATCGGCCATATTTGCTGAGGTGATGCAAGGAAAGCCCGAATTCACCGACCATTTGACCCATAAGTTGAAGCACCATCCTGGTCAAATTGAAGCAGCTGCAATCATGGAGCACATTTTAGATGGAAGCTCCTACATGAAAACGGCAAAGAAATTGCATGAAATGGATCCTCTCCAAAAGCCCAAACAAGATCGTTACGCTCTTAGAACTTCTCCTCAATGGTTGGGTCCTTTGATTGAAGTGATTCGTTTCTCCACTAAGTCAATTGAGCGGGAAATTAATTCAGTTAATGACAACCCTTTGATTGATGTTTCAAGAAACAAGGCGCTACATGGAGGTAACTTCCAAGGAACGCCGATTGGAGTTTCTATGGACAACACTCGTTTGGCCGTTGCATCCATTGGAAAGCTAATGTTTGCTCAATTTTCAGAATTAGTCAATGATTTTTACAATAATGGTTTGCCTTCTAACCTTTCTGCAAGTAGAAATCCAAGCTTGGATTATGGCTTTAAAGGTGCTGAAATTGCCATGGCTTCTTACTGCTCTGAGCTTCAATATCTTGCAAATCCCGTGACAAGTCACGTCCAAAGCGCCGAGCAACACAACCAAGATGTTAACTCTCTTGGTTTAATTTCCTCAAGGAAAACAGCTGAAGCCATCGATATTCTTAAACTCATGTCTTCCACATTCTTAGTTGCTTTATGTCAAGCAATTGACTTGAGGCATTTGGAGGAAAACTTGAAGAGCGTGGTGAAAAGCACAGTTAGCCAAGTAGCAAAAAAAGTGTTGACTACCTCTTCCAATGGCGCACTTCATCCATCAAGATTTTGTGAGAAAGATTTACTCAAAGTTGTTGACAGAGAATACACTTTTGCATACATAGATGATCCATGCAGTGCTACCTACCCTCTTATGCAGAAGTTAAGGCAAATTCTTGTCGAGCATGCACTTAAAAATGGTGATAGCGAAACGAACGAAAACACCTCAATCTTCCAAAAGATTGGTGCTTTCGAAGAGGAGTTGAAGGCAATCTTACCAAAGGAGGTAGAAAACGTAAGGTTGGCATATGAGAATGGAAATTCCGAAATTGAAAATCAAATCAAGGATTGCAGGTCTTACCCATTATACAAATTTGTGAGAGAGGAGTTGGGAACAAGATTGCTAACCGGCGAAAAGGTAATTTCTCCAGGAGAAGAGTGCGAGAAGGTATTCACTGCTTTAAGTCAAGGAAAGATGATCGATTCGATCTTCGAATGCTTGAAGGAGTGGAATGGAGCACCCCTTCCTATTTGCTAATAGCTTATAATAATTCTTATGCTATTCGTTTAGTTGGACGATGCATTTCTCAAATTATTGAAAGATATATGATTACATTTTGTATTGGCTATTGTTTTTCATTCACATTTTAAATCAATTTTAAACACAATTGATATCCACATGTAACTTTTATTTTTTGAATAATCACCATATACATTATATTTTGACATAATTTATGAGTATTGCACAAAATTATTATGGAATGGAAGTGTATTAGTAAGACTTCGTGCACTTAATACTATATAATGCCTCAGTGATATTATATATATTTTGGTAATGTATATCAGTAAGGTAATTAAAAAATGGCAAGCAGTATAAATTAATCTATCCTCCAGTTGTATTAATTAAAACCTATTTTGATAATTTATATCGAGTTATAATTGATTTAATTGCGACACACCTTTCTCTAAATCTTGCTTTACTTCTCAATTTTCATAGTCAATCGAGTTAGACTCTCTTTATACAATAATACCTTTGAATACCGTTCACATGCATTAATTGTCAAACACATGTATACTTTTTTCATATGTTGATTTTACAAAAAATAAAGGATTATTAGAGGCTACACGGTTGATTAACTTTAAGGATTTAATTAATATAATTATATAAATCATTTTACATATATAAGATTTATCTTCAAACGAAACAAGAAGGTAAAATGATATAGTTACGAAAGTTCGAAAATACAATTATTAGTTCATCAAATTGATAATACTTTTAACTTTTTTTCTTTACTACAACTCCTATAAGGTTTAGAAAATATAAATTGATATTTTCTTCAAAAACAAATATATACAAATTTGTCTTAGCATATCTATCGATAACATACTTACTAATGTAATAATTTGGATAGACAAATAACATTTTACTATATTTTAAAACATTTTCAACAGTTTTATCATTTTAAAGTCATTCTTACGTTTAATAATTTTCATAGTATCGGTTTGACAGTTATTTTTAATTTTTCTCAAATTTCATTTTATATGACTTTTTTTTTGTTGTTATATGTAAAGAGGAAAAGTGTAGACACCCTTGAAGTTCATTTATTTTTATTTTTAAACTAAATAATTTGGGACTCTTACGTATATATATTTATAATATATATGTTAGTTGAGATAGAATCACTCTCTCATTTTCTAAAAATTTAGGGTTAGGTTAGTAAGAAATCTCCAACTAACATATTAAGTTTAATCAAATTATATTAACAACAAAAGTAAATGAGTCAAAAGGTTCACCAACCCCATCTTTCACACTCTCATATCTATATTTGAAAGCAATGATATATAAATGGATGAATTAAAGTTATGTGAGTGTTCAACGAAGGTGTGCTCCAATATCATAACTCCACATTTATAATATACTTAATTCATCCTTTTATTTAACTAACATAACAATAATTATATATATATATATATGCACCATATTGGACTTCCAAATTCTTTAACTAAACAAGACATAATTTTCACATCAAATAATATCACACATGGAAATAACATACTGTCAAATAAACTATAAATAAAAGTTATTACCAAGGCAATTTGGGGTTGGAATGCCTTCTTGACATGATTAATCTTCTACAAACTTAAGTGCCTACTAGAAGTCTATTAGCGACTATCAATGTCTATTTTGCTATATTTATAATTTTTAATCAAATACTAGCTATTTTATGATATTTAAAAGTTATATATTTATTGTATATTTTGGCTTACTACCCAACTTCTTGTTTTCTAAAATGTTGGAAGAATTATTTTAAGTCATTGTTATGAATCTCTGACATAGATATACCATTGTAAAATTGGTTTTCACATGTTTGGTTCACAATTATTCAAAGCGATTTGTATATATTAAAAGGTGGTGGTGAATTACTATATTTAATTTGTGATTTTAGAATTACATATACATCACTAATTTGTTTTTTTAAAAAAGAAAATCAGTACATAGGTGATGCAAATTTTAATTTTAAAGAAACAAATTAAAAAGGTGGACTATAATTTTGTGGGTAATTGATTGCCTCAATCACCCTAATAATAAAAGTACATTTTAATTATGGATCAAACATAGTTCCAAATTATTTTTAGATTTTTGTAAAATGATGTTAATATTTGTCAAACATTAAATCTTTAAAAACAATTATAAAGTCATTTTAATCAAAGAAGAATGAGTAATATATCAATTAAACGTACCAAATGCCACAGAAAAAAGAAAAAAAACTTGAGAGAAACTTTATTCCTCTATTCTATAATTTAAAAAAAATCACATGGAGTAAAAGAAAGTGAGAGGGAGGTGGCCAGCAAACGAAAAAATAGTACTGGCGATCAACTTTGACCATATATATATATATATATATATACACATAAAATAGGATTATGATTATTCTTATCATTACTACTTTTGACCTTTCTTTTTCCACACCAAACAAACTCCCACCTCTCTCTTTCCTCAATCCTTCCTAAGTCCTCTACCTAACACACACCTCTTCTCTATTTAACCACAAAGCTTCTCATTTTCTCTTCACAAA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MAQKVCANQNGSVETLCNTHQDPLNWGLAAESMKGSHLDEVKRMVEEYRRPLVKLGGETLTISQVAAIATRDNDVLVELAESARAGVKASSDWVMESMGKGTDSYGVTTGFGATSHRRTNQGGALQKELIRFLNSGIFGNGSESNHTLPHSATRAAMLVRINTLLQGYSGIRFEILEAITNLLNHNVTPCLPLRGTITASGDLVPLSYIAGLLTGRHNSKAIGPNGETLDAKAAFTQAGIDSGFFELQPKEGLALVNGTAVGSGLASIVLFEANILAVLSEILSAIFAEVMQGKPEFTDHLTHKLKHHPGQIEAAAIMEHILDGSSYMKTAKKLHEMDPLQKPKQDRYALRTSPQWLGPLIEVIRFSTKSIEREINSVNDNPLIDVSRNKALHGGNFQGTPIGVSMDNTRLAVASIGKLMFAQFSELVNDFYNNGLPSNLSASRNPSLDYGFKGAEIAMASYCSELQYLANPVTSHVQSAEQHNQDVNSLGLISSRKTAEAIDILKLMSSTFLVALCQAIDLRHLEENLKSAVKSTVSQVAKKVLTTSSNGALHPSRFCEKDLLKVVDREYTFAYIDDPCSATYPLMQKLRQIIVEHALKNGDNETNENTSIFQKIGAFEEELKAILPKEVENVRLAYENGNSKIENQIKDCRSYPLYKFVREELGTRLLTGERVISPGEECEKVFTALSNFQGTPIGVSMDNTRLAVASIGKLMFAQFSELVNDFYNNGLPSNLSASRNPSLDYGFKGAEIAMASYCSELQYLANPVTSHVQSAEQHNQDVNSLGLISSRKTAEAIDILKLMSSTFLVALCQAIDLRHLEENLKSVVKSTVSQVAKKVLTTSSNGALHPSRFCEKDLLKVVDREYTFAYIDDPCSATYPLMQKLRQIIVEHALKNSDNETNENTSIFQKIGACEEELKAILPKEVENVRLAYENGNSKIENQIKDCRSYPLYKFVREELGTRLLTGERVISPGEESEKVFTALSQGKMIDSIFECLKEWDGTPIPIYVN
BLAST of CsGy4G002310 vs. NCBI nr
Match: KVH90475.1 (Aromatic amino acid lyase [Cynara cardunculus var. scolymus]) HSP 1 Score: 1483.8 bits (3840), Expect = 0.0e+00 Identity = 814/1366 (59.59%), Postives = 898/1366 (65.74%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. NCBI nr
Match: XP_008454138.1 (PREDICTED: phenylalanine ammonia-lyase-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1328.5 bits (3437), Expect = 0.0e+00 Identity = 675/690 (97.83%), Postives = 684/690 (99.13%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. NCBI nr
Match: NP_001295839.1 (phenylalanine ammonia-lyase-like [Cucumis sativus] >AER58180.1 phenylalanine ammonia lyase [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1323.9 bits (3425), Expect = 0.0e+00 Identity = 677/690 (98.12%), Postives = 683/690 (98.99%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. NCBI nr
Match: XP_008454137.1 (PREDICTED: phenylalanine ammonia-lyase-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1315.4 bits (3403), Expect = 0.0e+00 Identity = 671/690 (97.25%), Postives = 681/690 (98.70%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. NCBI nr
Match: XP_008454139.1 (PREDICTED: phenylalanine ammonia-lyase-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1305.4 bits (3377), Expect = 0.0e+00 Identity = 667/684 (97.51%), Postives = 674/684 (98.54%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. TAIR10
Match: AT3G53260.1 (phenylalanine ammonia-lyase 2) HSP 1 Score: 1128.6 bits (2918), Expect = 0.0e+00 Identity = 566/677 (83.60%), Postives = 618/677 (91.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. TAIR10
Match: AT2G37040.1 (PHE ammonia lyase 1) HSP 1 Score: 1126.3 bits (2912), Expect = 0.0e+00 Identity = 564/669 (84.30%), Postives = 616/669 (92.08%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. TAIR10
Match: AT3G10340.1 (phenylalanine ammonia-lyase 4) HSP 1 Score: 1083.6 bits (2801), Expect = 0.0e+00 Identity = 550/685 (80.29%), Postives = 605/685 (88.32%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. TAIR10
Match: AT5G04230.2 (phenyl alanine ammonia-lyase 3) HSP 1 Score: 944.9 bits (2441), Expect = 4.1e-275 Identity = 493/676 (72.93%), Postives = 564/676 (83.43%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P45730|PALY_POPTR (Phenylalanine ammonia-lyase OS=Populus trichocarpa OX=3694 GN=PAL PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1173.3 bits (3034), Expect = 0.0e+00 Identity = 589/682 (86.36%), Postives = 641/682 (93.99%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P45734|PALY_TRISU (Phenylalanine ammonia-lyase OS=Trifolium subterraneum OX=3900 GN=PAL1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1164.8 bits (3012), Expect = 0.0e+00 Identity = 592/699 (84.69%), Postives = 638/699 (91.27%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P45732|PALY_STYHU (Phenylalanine ammonia-lyase OS=Stylosanthes humilis OX=35628 GN=PAL17.1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1160.2 bits (3000), Expect = 0.0e+00 Identity = 580/668 (86.83%), Postives = 623/668 (93.26%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q04593|PAL2_PEA (Phenylalanine ammonia-lyase 2 OS=Pisum sativum OX=3888 GN=PAL2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1154.4 bits (2985), Expect = 0.0e+00 Identity = 582/668 (87.13%), Postives = 630/668 (94.31%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P45726|PALY_CAMSI (Phenylalanine ammonia-lyase OS=Camellia sinensis OX=4442 GN=PAL PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1154.4 bits (2985), Expect = 0.0e+00 Identity = 580/669 (86.70%), Postives = 627/669 (93.72%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A124SBF6|A0A124SBF6_CYNCS (Phenylalanine ammonia-lyase OS=Cynara cardunculus var. scolymus OX=59895 GN=Ccrd_007512 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1483.8 bits (3840), Expect = 0.0e+00 Identity = 814/1366 (59.59%), Postives = 898/1366 (65.74%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BZ45|A0A1S3BZ45_CUCME (Phenylalanine ammonia-lyase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494629 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1328.5 bits (3437), Expect = 0.0e+00 Identity = 675/690 (97.83%), Postives = 684/690 (99.13%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. TrEMBL
Match: tr|G8HZH6|G8HZH6_CUCSA (Phenylalanine ammonia-lyase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=PAL PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1323.9 bits (3425), Expect = 0.0e+00 Identity = 677/690 (98.12%), Postives = 683/690 (98.99%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BYN7|A0A1S3BYN7_CUCME (Phenylalanine ammonia-lyase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494628 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1315.4 bits (3403), Expect = 0.0e+00 Identity = 671/690 (97.25%), Postives = 681/690 (98.70%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G002310 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BXE2|A0A1S3BXE2_CUCME (Phenylalanine ammonia-lyase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494630 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1305.4 bits (3377), Expect = 0.0e+00 Identity = 667/684 (97.51%), Postives = 674/684 (98.54%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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