CsGy1G004700 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGGAAATCTTAAATAAGTAGATTCCGTTCCGATTTCATTTCCAACCACGGCATCCAGTGTTTTTTTGGTGTGTAATTGTATTTTCGCTTCCGAAGCGAGGAAAGTAAAGGAAAAAGAGAGAAAAAAAAGAATATAAACTAGAACTTTTGATCAAACCTATACCCACTCTGACTTTGTCATTGTTATTTTATTGTCTTTCCACGACTTTGATGGAGTGCAGAAAGGGATGGCTTCCGTCGTCATCAGCTACAGCAATTTGAAACCAAACTAAAAGTAAAACTCAATAACAATAGATGCTAACCTTCTACAGCCACCATCACCTACTTTGCCTTTTCATCTTCTGAAACCCAAACATCTGTTCTCAACTACTCATCCTCCCCAAAGCTTTCAATTCTTTGTGTATTTTGAGTGCTTCCACTTCTGAAATGTGTCGTCGATCACAGCAGTGGGCTTATGTAGCCCTTCTGCTCCTCTGCTTCTCGTCGTCCTTACTAGTTGTTGTTGCAGCAGAAATGGGTACCCACCCCTCTGAAGGTAATTCATCCTCTCCCTTCTAATTGATTTTCACTTCTCTTTCCCACAAAACCATTCTTCTTCAATTCTCCAAATTATCTGAAGCTAGCATTGCGTTCACCAGTTTGTAGATTCAGAAAATGTCACGATTGAATTCGCATCTTTTTCTGGACACTTTATCTATTTTTAGCACCAATTTTTTAAACTCAGAAGACTATGGACCAACTTAGCTCTTAATTCTAACTTCCTTGAAGTTCTGGTCACTCTTTCTTTTTTGTTTTCAGTGGACGCTTTGCTCCTCATCAAAAGTAGTTTGTTCGATCCTAATGGGAATCTGAGCAACTGGAACAAAGGAGACCCTTGTAATTCAAACTGGACTGGTGTTCTGTGCTACAATACGACATTTGATGATAACTATCTACATGTTGCTGAATTGTATGATTTCAAGTACTTATGGACTTTCATAACTTATGTTAAGACGTATCTCCATCTATCCTTCGGTACCAGTTTGAATTTGTTTTTTGTAATTGTTACTTTGGAAATTGTTGTTATGGAAAATCTCAAAATTTTAATTTTATTAGTTAGTCGCCGACCTAACTTTGGGACTTGAACATTTATGAAACGGCTTCTTGTTCAAATAATCGACTGCATACTTCAAATTTGTAAATTATTGCGTAGTGTGGTTATGTTTGCATCTCATATTTTGGTTGGTCACATATAAGACGTTAAATTCTACTTTTCCCCTCGTACCTTTTCATGAACAAGAAGCTAAACCATCAATCTGTATAATCCTCTGCAGGCAACTTCTAAATATGAGTTTATCAGGAAAATTGTCACCTGCGCTTGGCCGTTTATCTTACCTGAGAGTTTTGTAAGTAACTAAAGAATAGGAAATAGAACTTTCATTGAGTTTAAACTATCATCTCGTGGGTGCCATATGGTTTTCTCATTCTGCTAACAGATTTTTTCCTACTTTGTGAGAAGGGATTTTATGTGGAATAAGATAAGTGGGGAAATACCAAGAGAGATAGGCAACCTAACGTCCTTAGAACTGTTGTAAGTTGTTCTCCTTTTCTGCTGGTATACTTATTCACTTTGACAAAGTTTGACTGGTTTATCTAAAATATACTGATACACCATTATATCTTCACTTAAGTTTTTAGTATGCTCATCTTCCATGAACAAGTTCTCACAGTGTTAGTATATATAAACCACTTGATGTAAATGAATATTTATTATTACAAGGAAATACTCGTAATATGGATCTGATGCTTTCTATTTCCTCTCCTGCACTGCTTCACTTTCTATAAGATGTTTTACAGGCTTCTGAATGGGAACCAGTTGTCAGGTTCATTGCCTGAAGATCTTGGTAATCTTCTACATTTAGACAGAATACAGATTGACCAGAACCATATATCAGGACTAATACCCAAATCTTTTGCAAACTTAAAAGCAACAAAGCATTTGTAAGCACGTTTCTGTTTCTGGAAGGAGAAAATATTCCTGCAACTTCCTTTTCATCTTAAAGGTTTTTGTAATCCTCGTTTGACTTTTTGGCTCAGTCACATGAATAACAACTCTATCAGTGGTGAAATCCCGTCTGAGCTATCTGGATTGCCCAATCTTGTTCACTTGTAAGTTGCTTGCCCCTCCCTTACGACCAGCAAAATACTTTCTAATGCAAGTTTTGTTTCCTGCAAATTTGTTGGCTTCTCCAGGCATTCTAGTGTGCGCATACACTCTACACTCAACACTGTACTTCTTTTAATGTAAAAATTATTTGAATGCTTATACTTTTGGCTAATGACATATTTTTCCACTCTTGGCAGCCTTCTTGACAACAACAACTTGTCGGGGAAACTTCCACCTGAGTTGTTTCAATTGCCAAACTTAGAAATACTGTATGCCTTCATCTCCTACCACCTTAATTGCTTTAAATATATGAACACCCTTCCCTGGCTCAGTCTTCCAACAGTTTGTTTTTTATCTCTCACCTTTTTCTTCTGTCTGTCTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTGGGCGGGGGTGGGTGGGGGCATAATATATATTGTAAACTCCATTATAAAGCACGAACACAAGCACAACCATGGAGCCTAGTGCTAACTTTCTCACCCTGCTAACCTACCAAGAGTGTAAGTCACAATATTTGCATGTTTGTTCCAATTTTTTCGGATATCCCCAACAGAAACGTACTCTAATATTCAAACTCGTTCATTTTTTTTAAAGGAAACAAACCTTTTCATTAAATTAATGAAAAGAGACTAATGGTCAAAGTACAAGGAAACTAAAGAATCAAAGAAAATTATGAGACAGACGTATTATCTTTTTTTATTTTGAAAAGGAAACCAGCCTCTTTATTGATAAGAATGTAGCTCGAGGTACAAAAGGTTTATACAAAGAGCTAAACAAAAAAGAGACCATAGGATCAGCAAGCGCACCTGGACATCTCAACTAGGTTGGCACCCCCTTAGCACCCTTATCATATCCAACAAAAATAAAGCCCAAAGATACAAAGTATAATCTTTGAAGAGTACAAAGCTGAGACAAAACATATTATCAATTACATCATTCTAAGAAATACGACAAAATAAGCTACGCTACAAAATAAATGCCCCCCAATTCAAACAAATATCTTGGATGGAAAAATTCCAAAAGAGCTAAGAAAGAGAGCACCAGGTCGAGCCGTTGATCCTTGCAATTTCGGATCGATCTAACGATTGAAGGGATTTATCATGGAACCTCCTTTAGATTCTTTCATAAAGTAGATGAATTTTTTATCGGAAAAGGCGTGAGGGTAGTTACCTACTTGTGCCAAGGAAATACAAAGATTACCAGATGAGACATTGGGTCGTAGCAGTTGTGGAGTTTGATTAATTTGCTCGATGCGGGAAAAAAATGAACCACACCCAATCTAAACTAGCCAAGTTCAATCACAAAACGACCTACAAACCAAACATCCAAACAAATTTAGGGTGGAACTCCAGCTGAGGCAATGGAGAACGCAACAACGCGTGATTTCAGGGAGTTTAGGTTGAAAAATCCCACTCAATTGTGTGGGTATAAGTTTACGACTGGAGAAGACAGTCGTAACTAATCCCTTACCTCTGCAAATAGGAAAGTTTGGTCTGGAAGTAGGATGCGCCGCTGATTTTGACATTTAGGGTTTCAATGGTGAGGCTAAGAATGTGCAGCTATGGTTAAAAATACCAACGTACAGCAGAAAACGCAGCTTCCAATGACATCCTACAAGGCGTGATCAGAGGCGGTGGATGGTGATGGAATCGATGGTGGACGACATAGAAAGAGGCGACACGCAAGGACCATGATGAAGGCGAAAAAAAAAACCATCACTTACAGCCAAAAAAACGCAAGAAACGTGGCTGCTGGCGGTGTCCGGTGAGTGATGGTCACTGCTGATCATTGGTCGGAGTAGTATGACCGGCAGTGACAATCCTCGAGGCGGCAGTGGCGGGTAAGGGTTTTAATGTTTTTTTAGGTTTTTAGCAAATTAGGGTTTTTTGTTAGGGTTTCAACATAAAAATGGGAACTAAAAAGTTCAATACTATTCATCTCTAACTATTGAATGAAATACAAGGTCTTATATCGAGAAAGACCAACAACAGATAAGAAAAAGTTAAAGAAAGACCAACAACAAATAAGGAAAAAATATAGACAAATTAAAAATAATATTACTAGAGAAAGGGAAATTCAGCAAGTTTCATCTGCTGTCAATTGTTTGAAAAGAGAGTTAATCAGAAAATATTCCAGAAGACTCCAGTTAGAATCGTCACGACCCTAACGAAACCAAATTAGTTTGCTTTTCTGATAGAATCATGCTGTTTAGTGAGATAAATTCCCTTTGATTGCTGCACAAATAGGCACTTCCATTTCAGAAAAAGCAGAAGCCTCGGCTTTTGATTCAAGGAAAGACAAAACATTCTGGAAGCTCTTTCCTTCTTTTTTCTTGGAGTTCAACAGTTGCCTTCCACTTTTTAACAGCTCCTTTAACCTTTCTCAGGTCAAAATGTATAACAAAACCTATCCATCCTTGAATATTACAGCCAGCAACGGAATCTTCAATAATTTTAAGTCTATTGAAGAATTTAAAAGGTGAAGGACTCCAAAAATTAAGGAACGGTGGATGGGTCTTTGGAAAACGTTTGATCTCTTGTCAGTTTCCATTTCCGATGAGTTTTGTAATGTTAGTTTAATTTTAGGTTAAAATATCATTTTGGTCACTATACTTTAGAGTTTGCTCACTTTTAGTTTTTGTACTTTCAGATGTTCAATTTTAGTCCTTGAACTTAATTTAGTCCTTACTACTAGTTTATTGTAGATTTTAAAAATCATAAGTCAACACTGTCAATTTTCAAAAGCAACCCCTCACAAAAAGGTAAGTTCTCTCCCTTCTCTCTCCTCTCTCCTCTGTCCCACCCTCTTCTCCCCTCTCTCCGGCCACAGCAT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BLAST of CsGy1G004700 vs. NCBI nr
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BLAST of CsGy1G004700 vs. NCBI nr
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BLAST of CsGy1G004700 vs. NCBI nr
Match: XP_023520125.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1122.5 bits (2902), Expect = 0.0e+00 Identity = 719/953 (75.45%), Postives = 754/953 (79.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004700 vs. TAIR10
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BLAST of CsGy1G004700 vs. TAIR10
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BLAST of CsGy1G004700 vs. TAIR10
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BLAST of CsGy1G004700 vs. Swiss-Prot
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BLAST of CsGy1G004700 vs. Swiss-Prot
Match: sp|C0LGU1|Y5374_ARATH (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g37450 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g37450 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 501.1 bits (1289), Expect = 2.4e-140 Identity = 277/594 (46.63%), Postives = 376/594 (63.30%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004700 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9LFG1|Y3359_ARATH (Putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g53590 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g53590 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 471.1 bits (1211), Expect = 2.6e-131 Identity = 276/585 (47.18%), Postives = 358/585 (61.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004700 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9LT96|Y5977_ARATH (Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g49770 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 304.3 bits (778), Expect = 4.3e-81 Identity = 200/518 (38.61%), Postives = 282/518 (54.44%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004700 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9FLW0|Y5241_ARATH (Probable receptor-like protein kinase At5g24010 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g24010 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 261.2 bits (666), Expect = 4.2e-68 Identity = 174/464 (37.50%), Postives = 249/464 (53.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004700 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C580|A0A1S3C580_CUCME (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1221.1 bits (3158), Expect = 0.0e+00 Identity = 753/956 (78.77%), Postives = 765/956 (80.02%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004700 vs. TrEMBL
Match: tr|M5W1Q2|M5W1Q2_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_6G039100 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 800.0 bits (2065), Expect = 5.0e-228 Identity = 582/960 (60.62%), Postives = 654/960 (68.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004700 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A067EUM1|A0A067EUM1_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis OX=2711 GN=CISIN_1g002174mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 798.5 bits (2061), Expect = 1.5e-227 Identity = 567/935 (60.64%), Postives = 640/935 (68.45%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004700 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A067ELY4|A0A067ELY4_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis OX=2711 GN=CISIN_1g002174mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 792.7 bits (2046), Expect = 8.0e-226 Identity = 564/950 (59.37%), Postives = 639/950 (67.26%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004700 vs. TrEMBL
Match: tr|V4V0M2|V4V0M2_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina OX=85681 GN=CICLE_v10000174mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 792.7 bits (2046), Expect = 8.0e-226 Identity = 564/950 (59.37%), Postives = 639/950 (67.26%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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