Cp4.1LG19g01150 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTCAGACGATGTAAAAACTTATACATGACGATGGTTATGAGATAATAATAAGAAAATTCGAACCTTCTTCCAAAAATCATTTCTAGACACATCCAGAAAAGCGAGGACTTCACTACCCTCTTTATATCACGCCGTTTAATCTCCGGGAAGACGATCTAAACACTCTCGATTTAGAGTTCCTTCTCCCTCTCGAGGCATTGTGGATCTAAAAATTCTAAAAGGGATTGTTGTTGATGACGAGGAGAAGGAAATGCATAGGTGGTTTCCATTGACTCCATGAAATTTCACCATTTTTTTTTCTAACTGCTACGTCACTAAATCAAATTAAGTAGAAATTGATCTATAAAATAAAAAAAGGTATCTCACATGAAAATATGAGGTGTTATGATTCATCCTATTATCGTTATGTATTCATAATCGGCTGAATATGAAACAATTTAATCTTAAGTAACGTAATTTTTTTTTGTGAGAGTTGATTGTTTGTTAGTGAATTATGAAGCTTCTGAAAAAATGAACTCTTTTATAATTTGTATTTACTATAAAAAATAAACTTTCATCTCATTTTTCTTTTCTATGATATATTTATACCTTAAAATAAAGAAATAACAATGGAAAAGCTTGTTCTTCGTCCACCCATAGAACAAAAAACTTAAAAATAGAAAATAAACAAAGACCTTGTCATTATTTCTGAAAAATAAAAACCTAATTTTGCACTTAATAGTCTAAATTTAACAAATAACATCCTTATAAAAAGGCATTCTTCATTTTCAAACAATCATCCACAAGAAAAAAAAAACATAAAAAGGGAAAAGAAAAAAAAAAGTCGAAGAATTTTCTTCAAGGCAAGAAAAAAATGGCAAAGAAGACGATGACAGTGGTTCTAATGTGTGTTTTGATGGTATCGGTACTGCAATTCTCCACTGCTGACAAATCATCAGTTGAAATGGAGGCAAAATTCAAGTCGTTCTTTAACGACTTCGGTTCCGTGGAAGCAAATTTTAAGACGTGTTCTGCAGCCTGCCATAAGAAATGCGCTGATACTACATGTCGTAATAAGTGTGACGCAGATTGCGGCAAAAAGGAAGTTGAAAGTACATTTTTCTATCTTTTTAGACAAAAATCATTTTAATATTCAATATCAGAAAATGTATTAACTTTTTATTTTAACCTATTAATATATCTACAAATACAATAGTTATTGCAACCCTTAATTTAAATGTATAGTTTTCTCATCGAATTTTGGTAGATTTACTCAATAGAAGGGAAGTTTGATTTCATATCAAATTTGACTTTCTTTTTTATTTAAGTTTGTGAGATTCTTATTTTTTAATTTTGTGCATTATTATTAATTTTTGTTGTGCTTATTTTGCAGATAAATTTAAGATCAAGATACCCCAATGATAATCGAGGTGGATGAAATGAAAAGTGAGCGGTGAAGAATGATTTATTTAAATAATATTTATTTCATTCTTGTAATTTATTTATTTATTTTTATTATAAATTGTTTGTTTGATGGGGTTGAATATAATTTATTTAAATAATATTTGTTTCATTTTTGTAATTTATTTATTTTTTTATTATAAATTGTTTGTTTGATATGGTTGAGTTTATAAGGTGTATACTTCTACACACTGTGAACGTTGACCCATCAGGTGAGCTCGCACACCCTTAAACTTGCTGGTCACGCTAGTAATCAATGACAGATTGTTGTTGAACACCTTAAAATTAACGATGAATTTTCTATTTCAATGATCACAATTCACAAATGTCCCTTAGGAAAAACTTCCTTCAATATTTTTTTTAATTATTTTTAGTATCATTTCAATTTTTGTCCCATAAGTGGGTTATGTCTTAGACTTGATTTTACATTAGAATAAAAATAACATCAAGATTAAATACAAAATAAAATTCAATTATAAAATATTGTTGTTCAAATTTATTAGTAGGATACAATTACAAAAGACTCAAATACATAAAAACGGACGAACATGCTGGAAAGACCCAAGACCCCTCTATAACCGTACAACTATCATATGCTCCTCCATTTCGATCAGCAATATAACCCCCTCTATGATCGTGCAATTCTCATACCCTCCCCACCTCGATCAGCATCGCACGAACTCAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGGTGATTATAGCAATCAACCTAATTCTTGGTTGATGCTCCTTTCTAGAAGGTGGGTTGATGCTCCTTTCTACCTTACTAGTATTTGACTTACCTAGCTTGCTCTGTCTATATAGTGAAAAACCGAAATTTTGAGGGCTAACTTGCATGTCTTCCACAGAAGGTTAGCTGGTGAACCTTTCATAAGGTTGGGAAACTCCCTAACCCCCTATGCTTAACTCGGCAATATTGGTACAAGAGTGCAAAGAGTAGTGGAGATTGTGATGACACCGTTAAATAGCTAATAGCCTAGAGAGCTACTATCGGATGTTTTGATGCTCCCATACATACTACTAATGGCTTGGAGGGCTACCATTTTCATTCTCTAGGTGTTGTGGTCATCTATTAGGTTCTTAGGGCCGTCTACTAGGTTTCAAAGATGTTCAAGACCAACTCCTTGGAGTTAATCCATTCTCTGAGTGCACAAAGGTCTAGACCTGTAATGGTCGCTCATGATCTACTAGAAACATATTGACTAAAATGCTCTAGCTCGAGTGCCCTAGTCTTAACTTGGTTCGCGCATGCATGCTTGTTAGGGAGATATTCCTATCGATCACTGAAAATACGGGATACATATCTTAAACGTCACCTTGGTTATCTCTGGGTGCTTACGAGGTTTACCAGGATTTCTAGTGTGGCTAGGTGACTTAACATGGACTTTCGATTTCAAGGTACTTTATTCTAAGTCCTTGAGTTTTTCTTAATTTAGGAGCACTTGGATCTAGACCCATCCACCACTCACAATCATAAGGTGTTCATTCTACTAGAGGCCCCAGACCTAGATCATCATCTAGAGCTAAACATACTATATCTACCAACATACAAGATCAAAGGTTGATAATATCTATCAATCGCCTTGAGCATATATCACAACATGTCATCCTCCATTCTAGCATAGTGAAAAGCATATAAACAAAATCTGTCTCAAAATCTCGTCAAAGATACATTTTGGTAATTACCCAGATCATACATCTTTACCATATACTAATTATAATATTCTTTCTTCCACAATTTAGTTGCTTGCTTTATAGCCTATTTTTTGGGAAGTTTCGCATAAATCTTTATTTTTGTTTAAACACTTCATTTTCACAAGATAAAATAATTATGGACATGAAAGTATATATGTAAGCCTAAAACTATAATAGAGTAAGAATTAAAAGATACTACATTTTTTTATTATATTTTTGTTTTGTTTTCTTATATTTTTCTCCTCTCTCCATCTCCATTTCATCACCAACTCTAACACAAGGATGATCGAAGTGCTTTTGAATTTGCTACTTGCTCTTGTGAAGTTTTTTTTATAGGTCGGACAACGCGAAAATCTACACACGATGATGGTTATGAGATAATAACAAGAGTTTTTTTCTTTTTATAGGCCAGACAACGCGAAAATCTACACACGATGATGGTTGTGAGATAATAACAAGATTCGATCCATCTTCCAAACATAATTTCTGGACACAGCAAGAAAAGCGAGAGCTTCACCACTGATTGATCTTCGGGAAGACGAACTAAACACTCTCGATGTATAGTTCCTTCTCCCTTTCGAGTCATTGTGGATCTAAGAACTCTAAAAGGGATTGTTGTTGATGAGGGGAGGGAAAAATGAGTATGTGGTTTCCAATGACTCCCATGAAATCTCACCCTTTTTTTTTTTTTGTTTCCAATGATTCCCATGAAATCTCACCCTTGTTTTCAATGACTCCCATGAAATCTCACCTTTTTTTTTCTAACTACTAAGCCACTAAATCAAATTAGGGTGTTATGATTTATCTTATTATAGTGATGTGTTCATAATGGACTGCATATGAAGCAATTTAATCTTAAAGTAATATGGTTTTCTCTAAAAGCCGATAAACATTCAAATAGATGGTTTGTTAGTGAATTATGACCTTATTACTTCGTTTGTATTTAATATAAAGAATAAACTTTCATCTCAATTTTTTTTTCTATGATATATTTATACCTTAAATTAAAGGAAATAACAATGGAAAAGCTTTTTCTTCGTCCATCTATAGAACCAAAAAAAACTTAAAAATAGAAAATAAACAAAGACCAGTTCTTATCATTATTTTTCAAAGGCAAAAACCTAATTTTGCACTTAATCGTCTAAATTTAACCAATAACATCTTTTATAAAGGCCTTCTTTATTTTCAGACAATCATCCACAATCAAATTAAGAAAAAAAAAACATAAAAAAGGCAAAAAAAAAAAATTGAAGAATTTTCTTGGAAGGCACGAAAAAAATGGCAAAGAAGATGATGGCAATGGTTCTAATGTGTGTGTTGATGGTATCGGTACTGCAATTCTCCACTGCTGACAAATCATCAGCTGAAATGGAGGCAAAATTCAAGTCGTTCTTTAACGACTTTGGCTCCGTGGAAGCAAATTTTAAGACGTGTTCTGCAGCCTGCCATAAGAAATGCGCTGATGCTTCATGTCGTAATAAATGTGACGCAGATTGCGGCAAAAAGGAAGTTGAAAGTACATTTTTCTATCTCTTTAGACAAAAATCATTTTAACATTCAATATCAGAAAATGTATTAACTTTTTATTCTAACCTATTAATATATCTACAAATACAATAGTTGTTGCAACCCTTAGTTTAAATGTATAGTTTTCTCATCGATTACTAATAGACGTGAAGTTTACTTTTCAAACTTTCTTTTTTATTTAAGTTTGTGAGATTCTTACTTTTCAATTTTGTGCATTAATATTAATTTTTGTTGTGCTTATTTTGCAGATAAATTTAAGATCAAGATACCCCAATGATAATCGAGCAGGATGAAAGGAAAAGAGCGGGGAGGAA ATGGGCAAGAAAAAAATGGCAAAGAAGACGATGACAGTGGTTCTAATGTGTGTTTTGATGGTATCGGTACTGCAATTCTCCACTGCTGACAAATCATCAGTTGAAATGGAGGCAAAATTCAAGTCGTTCTTTAACGACTTCGGTTCCGTGGAAGCAAATTTTAAGACGTGTTCTGCAGCCTGCCATAAGAAATGCGCTGATACTACATGTCGTAATAAGTGTGACGCAGATTGCGGCAAAAAGGAAGTTGAAAATAAATTTAAGATCAAGATACCCCAATGATAATCGAGCAGGATGAAAGGAAAAGAGCGGGGAGGAA ATGGGCAAGAAAAAAATGGCAAAGAAGACGATGACAGTGGTTCTAATGTGTGTTTTGATGGTATCGGTACTGCAATTCTCCACTGCTGACAAATCATCAGTTGAAATGGAGGCAAAATTCAAGTCGTTCTTTAACGACTTCGGTTCCGTGGAAGCAAATTTTAAGACGTGTTCTGCAGCCTGCCATAAGAAATGCGCTGATACTACATGTCGTAATAAGTGTGACGCAGATTGCGGCAAAAAGGAAGTTGAAAATAAATTTAAGATCAAGATACCCCAATGA MGKKKMAKKTMTVVLMCVLMVSVLQFSTADKSSVEMEAKFKSFFNDFGSVEANFKTCSAACHKKCADTTCRNKCDADCGKKEVENKFKIKIPQ
BLAST of Cp4.1LG19g01150 vs. NCBI nr
Match: gi|659119712|ref|XP_008459802.1| (PREDICTED: major pollen allergen Ole e 6-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 7.0e-06 Identity = 37/91 (40.66%), Postives = 49/91 (53.85%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
|