Cp4.1LG16g00590 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCGCTCGGCGGTGAGAAGTGCTTGTGGCTTTGCCGGCTCGTCGATCATTGTCTTCGTCCTTTTGCAGTTAGGTTTCGCTGTTCTCAATTGTTGCCATTTCTTTTTCTCAATTGTTGCCATTTCTTTTTCTCGTTTACATCATTCGCCTCAAGTTTTCTGTGATTATCGTTGAAGAGGAGTTATGTTTTTCATTTTTTGGTGAATAGGAAGATGGAGTGGTCTTGGAGAGCAAAGAGAAGGAAAAGGAACTGCTTATTGCGCTCTCTCATGTTTGCTTCCCTTTTCTTTACTCTTTGTTTCTGTGACTCTGTTGTTGCTCTTTGATTTGGAACTTCTCAGTTTTCCTTACAAGTTTGTTGCCTCATTTTGTTGTCTGTTCATTCATTAGGTCGTAACTGAAATTCAGCGCCGGGTTCAAGAAATTGATGGTGACTCTGATAGTGTTGGTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGACACTTGCACTTTTCGGTAACTTCATTGATGTATTGTCGATCAGGAAGGGATTCAAATGTTGATTTCTCACGAGAAAAGCAGTGATGAGTGTGACCAATCTTTTGTGAGGCATCATTGTATGGCGAAGATTATCTCTGAATTGGTAATTTCTTACAATAAATATGGACTTAGGGAGGACCAGAACATAGTTTTTGAGTTCTTTGTTCTCAATATTGCTTTTGCAGTCTATTAACTAAATGTTGATTTCTCGCGAGAAAAGCAGTGCTTATGCTCAGATGCAAAGTCATCATGCATAAACATTGATTTGTTGTGAACAGTTGTGACATGCATAAACTTGGGTGTATTTCTCTGCTCTTGTTCGTAACCTCTGTAGAAAACGAAGCTATAAAGAGCCAAGCCAATGATGGAATTGACTAGCATATTTTAAGTTTAGTAAAGTATTTAGTTCTTTATGTACATACTTGTTTAATGCATAAAAATGGGAGTTTCTCTTCTTGTAGACAAAAAGAGTGTATTTTTGTTTGTACCTTGTTTCTGATGCTGCTGTGAAGTTAAATACAGGGTATGTAACGTTCTTATTTGCACAAAGAACGCATTGTAATAGCAGAATTTTCAGGGATGTTTCTTTGACTTTTACTGGTTTTATGGACTCAATTTTTTTGACACCTTCTGTAGGTGTAAATGTACCCACCCCTTTAGAGGCTATAGTCTTGCTTCTGGACTCTTCAATTGGAAATCTTTCTTGTGATTCTCTTTCTATTAGGGAGATTTTCCTCCCTTGTTTCATTTATCAATGAAATTTATTTCGCTTCCCCGAAAAGCAATCCTCTGGATAGTCTGGTATTCTATCTCTTAATTGTATTGTTAATCTAAGTCAACAATCCTTCCAAACTTCTTCTCTACTTCACCTCTAGGAAATTTACCTTTCTCCTTATCTGCAGGTACTTTTACTAGCTTTTGAGAATCAGTATGTCAAACATCTTGTGGGCAATGTTCTTACAGCCATTACAAAATTTGTGTTTCTAACTGTATGTTACTCTACTCGTGTCTGAAATTTTAGTGTATCACTATCACCTAGGTTTTACACTAATATTTCAACCTGTTTAATTATGCAGGGAAGCACAAGACACTGGTATGAATTGGTTCACTCATTATGTTTTTGCATGGAGTTGGTGCTTGCCAGATTCATATCTTCTACTGCACCCTCAATCACTGGGTCTGAAAATTTAGACTGTTATTTATCGACCTTAAGTAATATCTTACTACCTAAGCTGAAAAATTCCAATTTGTCCACAGTTGCTGGCATTATTCAAGTTTTGCGAAATACCTTGAAATTCTTGAAGCAAGAGCAGAGTGATCTTGTTGCAGTGTTCTTTGATTCTGTTAATTCTTGTCTTTCAAAGATCCCTTGGAATTTATTGGGTAAGATCCTCACTGAGGAAAGTTTTAACATTGTAGAAGTCCAGAGCAATGATGACTCATGTCACAGTAATTTGCATCGGAAGCAAGGATTAAAATTTCTGTTCTTAGGAAATTTTGTTCAATTTCTATGTTCCTTGGCTGAGCCAAGTGACTTTGAGGAAGCTTCAGGTGGTTCGCTTACGACTCACCCCCTACTTGGTACAATTATCAACCTGATTCCAAACCTTTTTGATTGGTGCCTCAACTACCAAGTAGATCACTTTGATGGGTGCTTGTCCCGATATTTCAGTCACAAGTTGTTGGTATAAATCTCTCCTTGTACTTGCCCTCCCCAGAATATACATTGGACTAGTTTTTTTTTTATATAAGGTCAATACAGTTAGAATACCTGTTGGCTAGCTAGATTATTCAAATATGGTTATTATTGTCGTCAATTATTTATTTGGTCGAATCTTTTTAACAAGTTTGATTCTCATCGGTGGCCAAGGTATCTAATTTTAACATACAAGGAACATGTGTTGTTAGTGAAGGTTAAGATTCTATTTAAGGTAATACTTGCCTGGAACGTGTGTTTTATTGGTAGTTAAGGAACCATACATTTTTATTATAGTTCTGATTCATTTTTTGATTTTTTAGCTTTTTATTTTATTTTCTTAAAGTTACTACTGCCTAAGTTTGCCAATAATAGCAAACTTAATGTATTTCTAATCTTCTTTTCTTCTTTTTGATTTTTAATCCTTAATCTAGTTAAATCTACACATTTAAATTAACTTTCGTACTTGGTTTAGTATTCTCAATGTTTGTGCTAAATGAATTTTGATTGGACTGAGGATTTTACGATTGGTTTCAATTTCAATGTAAGATATTCTGCTGTCTATATCGTGCCATTTACAGTGTTGTATAACTATTTTGTTTCTGCTTCCACATCTTTGGGTTTTGTGGAAGGGCAGTTCAAGTGTCTGAGTTATCATGTTCAAGTCAACATGTCTTGATACCGATCTATCACCTTCTGTATTTCTATAGGGATCAATTCAGTCGAGTTCCTCACTTCGACCATAGGAATGGCCATGAAGGTGGGTTCATTATAAGTGAGGCCTCACTTTTGCTGGAGGGTTGATATCATCTTCACCCTTTCTGGTTGCTTGATGTTCATTTGGACAATTGTGGGGCTGGACCCGTGATGACCAAGCATTTGGCAAAGGGCATGGGGACGTCTTTGTGTTCAAATAGGAACTTCATCCCTAATACGACATCGAAGTCATTCATCTAAACGATCTTGGAGTCCCTTTGTCCACTCCAAGTTCCTAGTTTGATGAGGATCTTCTTTGCCACTCCCAAAATTGGTAGGGCTGCCAAGTTGACGTCTTTTATTTTCCCGAGTCTCAGTGCTAGTTAATATTCAAGCGTTCGGCTTCGGTCTTTGTCATAAAGTTGTGGGTGATCCTAGAGTTGACTATAGTGCTCTTGGTCACTCTGTGGTTAACCCATGCTTCCACGAACATCATGCCCCTTTCGATCGGCTCCTTTGACTCCCCTACTTTCTTTTGAAGAGCAGATAGAAACTTTAGATCCCCATACAGGGGTTGTCAATGTTTTTAGATGAAGATCTTTCTGTCTCCTCTATTTCGAGTCTGGCTTCCGACTCCATTCCTGTGGCTTGGAAGGCCTGGAGGGCTGCCCACTTGGGGCACTCATACACCCTATGGGTCCCCTTGCAAATGAAGTAGGGTGGGGGCCGACTGAGTGATTTGGGTGGTAGAGTCCTCACCCAAAATTTCCACTCTTTTGTTGTGGGGGTCTATGATCTTCTCATCCCGTTCTATCGCCTTCCCCACTTTTGGGTGAGATCGGCTTGTTGTTCTTGTTGCCTCCAATTGAGGAGGGTTGGTTCTGTCTCACATCTTGAGATTGTTCATTGCTCCATTCAAATAACCATTCTGCCTCAGCATAAGCTGAGGAGAGGTCTTGCACTCGTTGTTCATATACCTTTGATTTTTCCCACGACTTCAATCCCTCAAGAAAATAGAAGACCTTGTCTTTCCCAGACATATCGCGAATATTCAACATTAGCACAAGAAATTGCTTGATGTATTCTCGGACATTCCCTATGTGTGTCAACTTTCTCCTAACCAATATTTCGACTTTCTCTGTAAAGAATTGTGAGCAGAGTTCTTGCTTCAATCTTTCCCATGTATCTACAGTGCATCGACCGTCTTGGATATCCATATACTTTGGCCACCACCATAGTTTTGCATCTTCAGCCAGATGCATCATCACCAATGTGACTTTTGATTCCTCTGTCATAGTGTTCCTGGCACGGAAGTATTGCTCAAGGTCGAAGATGAAGTTTTCTAGAGCCTTGGCATCCCAAACCCCACGGAAGGGTTTGGGCTTTGGAACTTTAACTTTATTGAATTGTACTGCCTCTATAGGAGTTTGGTTCCCCACCGCTCTTATGGTAAGATTTAGTTTGGCGCATAGGTTTGGCACTTTTGCCCTGACCATGTTGAGGGCCGCTTTCACATCTTCAGAGAGTCCATTGAGCATCTGAACAACCGCTTTCTGGGAGCTGTCCAAACCATTGACACGCTCTTTTATTTGGGCAACAGAACCCGTCAAGCTACCCCCTCGCTCGAAGCAACCAACTCTCGTGGCTATCTCTTCTAGGGTGTCAACCCTGAACATCAGTTCCTGAATAGGCATCCCATCAAGACAACTAGCTACTATATCAATCCAATCTTCCATCAAGACAACCAGCTCCTTTACATGCTCATCCTCGTAACGAAGATTGTCGAGGACTTGTAGATAGAGAATTTGCTCTTCGATGTCGACCAGTCGGTTGGCGTGAGACTTGTTAAATTGCTTTGTCGTGGACATGTTTACTGAAACGTTTCTTGGAGCCAATTTGGCTCTGATACCAACGGTCACAATCACACTTTCTTTTGACATTTGCAAATGATTGTGCGACACTCACCCTCGCCACTGAGTGAGTTAGCCAATTTGAATTCGAGTCATCATTGGTTGGAAGATGTATACCCAAGCCTTTGGCCCTG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MSLGGEKCLWLCRLVDHCLRPFAVSDECDQSFVRHHCMAKIISELVLLLAFENQYVKHLVGNVLTAITKFVFLTGSTRHWYELVHSLCFCMELVLARFISSTAPSITGSENLDCYLSTLSNILLPKLKNSNLSTVAGIIQVLRNTLKFLKQEQSDLVAVFFDSVNSCLSKIPWNLLGKILTEESFNIVEVQSNDDSCHSNLHRKQGLKFLFLGNFVQFLCSLAEPSDFEEASGGSLTTHPLLGTIINLIPNLFDWCLNYQVDHFDGCLSRYFSHKLLILMIRLSFGCHLQCSTLVLWLQLCRNRFQNLLLLPKLELESSSDTSLEDSPLTVSYFGEERSPCSMHLRRLAIFLFLRCSLSFICKQPTEKYDASIALKAQLMCTTNLESKCGGCNCSKKAILELYKWLQGNHPTNNLLDTKMYATNCIKFASSFLQLYMHESSEFQFRMMDDLLFKVLLQLLPLPSRSGPWSCEGQSQDVEEDILFHVSNFFYPQHMFHIFLKELNYDHEMLLDYLMSKDSGTYCLEYLLRCLHINDSRRAPEDLSTEWDVTTHSSCKRRKVLLDSSTIPDELLSSSPNQRNETLLSSVDAKNCDYSYKPQRFWVKALKKSKNCLQSLKRSLENLHRENLFPYNPEVLIKRLCEVSWHQERILFILVVVSCQLKDLFLIRLEFDEISGASHGVVK
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LLZ2_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G286460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 937.9 bits (2423), Expect = 6.7e-270 Identity = 484/617 (78.44%), Postives = 521/617 (84.44%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. TrEMBL
Match: A0A061DMU6_THECC (Golgin candidate 6 isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_000530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 429.1 bits (1102), Expect = 1.0e-116 Identity = 274/619 (44.26%), Postives = 358/619 (57.84%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. TrEMBL
Match: A0A067KA55_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_12324 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 408.7 bits (1049), Expect = 1.4e-110 Identity = 263/629 (41.81%), Postives = 359/629 (57.07%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2SWL0_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_008G072600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 404.1 bits (1037), Expect = 3.5e-109 Identity = 273/686 (39.80%), Postives = 367/686 (53.50%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. TrEMBL
Match: W9QRY0_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_020276 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 398.7 bits (1023), Expect = 1.5e-107 Identity = 262/629 (41.65%), Postives = 356/629 (56.60%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. TAIR10
Match: AT3G50430.1 (AT3G50430.1 unknown protein) HSP 1 Score: 321.6 bits (823), Expect = 1.1e-87 Identity = 224/618 (36.25%), Postives = 325/618 (52.59%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. NCBI nr
Match: gi|700206895|gb|KGN62014.1| (hypothetical protein Csa_2G286460 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 937.9 bits (2423), Expect = 9.6e-270 Identity = 484/617 (78.44%), Postives = 521/617 (84.44%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. NCBI nr
Match: gi|778670045|ref|XP_011649349.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101211532 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 924.5 bits (2388), Expect = 1.1e-265 Identity = 480/617 (77.80%), Postives = 516/617 (83.63%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. NCBI nr
Match: gi|778670047|ref|XP_011649350.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101211532 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 922.9 bits (2384), Expect = 3.2e-265 Identity = 479/616 (77.76%), Postives = 515/616 (83.60%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. NCBI nr
Match: gi|659115943|ref|XP_008457820.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497413 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 888.6 bits (2295), Expect = 6.7e-255 Identity = 466/617 (75.53%), Postives = 498/617 (80.71%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG16g00590 vs. NCBI nr
Match: gi|659115947|ref|XP_008457821.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497413 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 887.5 bits (2292), Expect = 1.5e-254 Identity = 466/616 (75.65%), Postives = 497/616 (80.68%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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