Cp4.1LG15g02020 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCGTTTCATTCAGTTGTTGACTCGGTTCATTCATCTTCTTTACTCGGGTGTCGTACACGAACAAAACTCGGAATGTGAGTTGAAATGGAGGGAGTGGAGGACAGCTTAATGACACTGATTTTGTGAAATGGAGTGAAAGAGGGAGTGGGTAGGTGTAGATTTAGGGCCACCCACTTTCTCCCTTTTGCATGTGCCTCAACCACTCTCTCCACACAGCTTCCCTTATATAAACCCTTCACTCACTCCCTTTTCACTTCAACCATTCCCAAATGGCTTCTCATAAACGCCTTTCTTCTTTTCTCTTTTTTCTTTTATTAGGAATTGGGGTTTCTTCTGCAGCCAGAAATCTCTTAACTTATGGTGAAGGAAAGCCGGTGAACATTCCGGCATTTGCTTATGGTGCAGGCGGTGGTGCAGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGATATGGTTCTCTTGGTGGTTATGGCGGTGGTGGAGGAAATGGAGGTGGTAGTGGCTATGGTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGGTGGCTATGGAAGTGGTGGCGGTGGAGGAAGTGGTGAGGGAGGTGGGTATGGCCCGGGAGGTGGAAATGGATATGGTGGAGGTGGAGGAAGTGGCGGTGGAGGTGGTTATGGTTCTGGGGTTAGATATGGTGAAGTTGGATATGGCTCTGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGGGAGTGGAGGCGGTGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTGGAGGGTATGGAGGTGGCGGTGGAAATGGAGGTGGGGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTTCTGGATATGGAGGAGGTGGTGGAAATGGGGGTGGTGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGTTATGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGAGGGGGCGGTGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGAGGTGGAGGTGGAAATGGCGGTGGCGCAGGGTACGGTCATGACGGTGGTGGATACGGTGGGGGTGGTGGAAATGGTGGTGGCGCAGGGTATGGTCATGAAGGTAGTGGATACGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTTCTGGTGGTGCTGGGTCTGGCGCTGGAGGAGGAGAAGGGGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGAACATGGAGCAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAAATGGCGGCGGTGGAGGTGTAGGATATGGGCCAGGAGGAGAATATGGGTCAGGTTATGGAAGCGGAGCAGGTGGGGGTCATGGTGGAGGAGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGAAGCGGTGGAGGTGGTGGAGGAGGGTCGGGATACGGTGGAGGAAGTGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGTGGTGGTCATGAGGGAGGATATGGTGGAGGAAGCGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGAAGCGGTGGAGGAGGTGGTGGTCATGACGGAGGATATGGTGGTGGAAGCGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAGGAGGTGGTAGCAGCCAAGGCGGTGACCACGGTGGATATGCACCTTGAGAAAGACCTCACCATTACCTTATATATTTAGTATTATTATAAAAAGGGCATATACATATGGTCATTCATCCTTTTTACCCCAAGTAATTAATAGAAAATATAAATCCATGATTGGGAAAAGGGAATAATTAATTATATAATATATCGTAAGAAAAGTGTGATGTTAAAATGGGAAACTCTTGTATCTTCACCTCTCCAAATTTTCTTCATATATAAAATTATTCTCTCTTATTTCCACAAAACCACACCAATTGCATGCATGCTCCCT TCGTTTCATTCAGTTGTTGACTCGGTTCATTCATCTTCTTTACTCGGGTGTCGTACACGAACAAAACTCGGAATGTGAGTTGAAATGGAGGGAGTGGAGGACAGCTTAATGACACTGATTTTGTGAAATGGAGTGAAAGAGGGAGTGGGTAGGTGTAGATTTAGGGCCACCCACTTTCTCCCTTTTGCATGTGCCTCAACCACTCTCTCCACACAGCTTCCCTTATATAAACCCTTCACTCACTCCCTTTTCACTTCAACCATTCCCAAATGGCTTCTCATAAACGCCTTTCTTCTTTTCTCTTTTTTCTTTTATTAGGAATTGGGGTTTCTTCTGCAGCCAGAAATCTCTTAACTTATGGTGAAGGAAAGCCGGTGAACATTCCGGCATTTGCTTATGGTGCAGGCGGTGGTGCAGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGATATGGTTCTCTTGGTGGTTATGGCGGTGGTGGAGGAAATGGAGGTGGTAGTGGCTATGGTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGGTGGCTATGGAAGTGGTGGCGGTGGAGGAAGTGGTGAGGGAGGTGGGTATGGCCCGGGAGGTGGAAATGGATATGGTGGAGGTGGAGGAAGTGGCGGTGGAGGTGGTTATGGTTCTGGGGTTAGATATGGTGAAGTTGGATATGGCTCTGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGGGAGTGGAGGCGGTGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTGGAGGGTATGGAGGTGGCGGTGGAAATGGAGGTGGGGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTTCTGGATATGGAGGAGGTGGTGGAAATGGGGGTGGTGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGTTATGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGAGGGGGCGGTGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGAGGTAGTGGATACGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTTCTGGTGGTGCTGGGTCTGGCGCTGGAGGAGGAGAAGGGGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGAACATGGAGCAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAAATGGCGGCGGTGGAGGTGTAGGATATGGGCCAGGAGGAGAATATGGGTCAGGTTATGGAAGCGGAGCAGGTGGGGGTCATGGTGGAGGAGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGAAGCGGTGGAGGTGGTGGAGGAGGGTCGGGATACGGTGGAGGAAGTGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGTGGTGGTCATGAGGGAGGATATGGTGGAGGAAGCGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGAAGCGGTGGAGGAGGTGGTGGTCATGACGGAGGATATGGTGGTGGAAGCGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAGGAGGTGGTAGCAGCCAAGGCGGTGACCACGGTGGATATGCACCTTGAGAAAGACCTCACCATTACCTTATATATTTAGTATTATTATAAAAAGGGCATATACATATGGTCATTCATCCTTTTTACCCCAAGTAATTAATAGAAAATATAAATCCATGATTGGGAAAAGGGAATAATTAATTATATAATATATCGTAAGAAAAGTGTGATGTTAAAATGGGAAACTCTTGTATCTTCACCTCTCCAAATTTTCTTCATATATAAAATTATTCTCTCTTATTTCCACAAAACCACACCAATTGCATGCATGCTCCCT ATGGCTTCTCATAAACGCCTTTCTTCTTTTCTCTTTTTTCTTTTATTAGGAATTGGGGTTTCTTCTGCAGCCAGAAATCTCTTAACTTATGGTGAAGGAAAGCCGGTGAACATTCCGGCATTTGCTTATGGTGCAGGCGGTGGTGCAGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGATATGGTTCTCTTGGTGGTTATGGCGGTGGTGGAGGAAATGGAGGTGGTAGTGGCTATGGTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGGTGGCTATGGAAGTGGTGGCGGTGGAGGAAGTGGTGAGGGAGGTGGGTATGGCCCGGGAGGTGGAAATGGATATGGTGGAGGTGGAGGAAGTGGCGGTGGAGGTGGTTATGGTTCTGGGGTTAGATATGGTGAAGTTGGATATGGCTCTGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGGGAGTGGAGGCGGTGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTGGAGGGTATGGAGGTGGCGGTGGAAATGGAGGTGGGGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTTCTGGATATGGAGGAGGTGGTGGAAATGGGGGTGGTGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGTTATGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGAGGGGGCGGTGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGAGGTAGTGGATACGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTTCTGGTGGTGCTGGGTCTGGCGCTGGAGGAGGAGAAGGGGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGAACATGGAGCAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAAATGGCGGCGGTGGAGGTGTAGGATATGGGCCAGGAGGAGAATATGGGTCAGGTTATGGAAGCGGAGCAGGTGGGGGTCATGGTGGAGGAGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGAAGCGGTGGAGGTGGTGGAGGAGGGTCGGGATACGGTGGAGGAAGTGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGTGGTGGTCATGAGGGAGGATATGGTGGAGGAAGCGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGAAGCGGTGGAGGAGGTGGTGGTCATGACGGAGGATATGGTGGTGGAAGCGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAGGAGGTGGTAGCAGCCAAGGCGGTGACCACGGTGGATATGCACCTTGA MASHKRLSSFLFFLLLGIGVSSAARNLLTYGEGKPVNIPAFAYGAGGGAGGGSGGGYGSLGGYGGGGGNGGGSGYGSVGEYGVGGYGSGGGGGSGEGGGYGPGGGNGYGGGGGSGGGGGYGSGVRYGEVGYGSGGSGYGGGSGGGAGYGPGGGGYGGGGGNGGGAGYGPGGSGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGGYGGSGYGGGGGNGGGAGYGSGGAGSGAGGGEGGGSGYGGEHGAGYGGGGGGGNGGGGGVGYGPGGEYGSGYGSGAGGGHGGGGGSSGGGSGGGGGGGSGYGGGSAHGGASGGHEGGYGGSSGGGGGHEGGYGGGSAHGGASGGHEGGYGGSSGGGSGGGGGGHDGGYGGGSAHGGASGGHEGGYGGGGGSSQGGDHGGYAP
BLAST of Cp4.1LG15g02020 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LH77_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G902220 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 8.1e-46 Identity = 294/400 (73.50%), Postives = 303/400 (75.75%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g02020 vs. TrEMBL
Match: F6HT88_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_02s0012g01350 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 7.9e-09 Identity = 238/382 (62.30%), Postives = 258/382 (67.54%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g02020 vs. TrEMBL
Match: A0A169WK47_DAUCA (Uncharacterized protein OS=Daucus carota subsp. sativus GN=DCAR_005637 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 8.2e-06 Identity = 275/441 (62.36%), Postives = 286/441 (64.85%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g02020 vs. NCBI nr
Match: gi|700205246|gb|KGN60379.1| (hypothetical protein Csa_3G902220 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 1.2e-45 Identity = 294/400 (73.50%), Postives = 303/400 (75.75%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g02020 vs. NCBI nr
Match: gi|778687914|ref|XP_011652648.1| (PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1.8 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 179.9 bits (455), Expect = 1.0e-41 Identity = 283/391 (72.38%), Postives = 291/391 (74.42%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g02020 vs. NCBI nr
Match: gi|359474475|ref|XP_002278025.2| (PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 1.1e-08 Identity = 238/382 (62.30%), Postives = 258/382 (67.54%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG15g02020 vs. NCBI nr
Match: gi|645265635|ref|XP_008238243.1| (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Prunus mume]) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 2.4e-06 Identity = 158/256 (61.72%), Postives = 176/256 (68.75%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |