Cp4.1LG14g03540 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTGGTCTAAGTTTCAATAATAAATCCCATGTATTCAATAATCTCTGCATAAATAGATAATTTACGGGTTTCGTTAGTGATTTCGAGAGGTTTCTAAGTCTGAATTTAATAATTACTTGGATCTTTAAGTTCGAGTTTGTCGAGTCTGAGTATGTCAAATCTGTGTTGAGTTCGAATTGTGTTAAATCTGTATTCGTATTGTACAAAAAATAAAGTGAGTTTGCTAAATCTATGTTACGTGTTTGAATATTAATTTGTTAAAATAACACGTTGTAAATAAGATATTGTCCTTTTTTGACTTTCCTTTCCGGGCTTTTCCTCGAAGTTTTAAAATGTGCCAAGAGATTTCTACACCCTTATTAAGAATGATTCATTCCCCTCTTCAACTGATATGAGATTTCACCGCATAGAAGTATTGTATATGTCTTGTCTTACTAAACCATGATTTTATGTGGGACTTCATGCATGTTGTGTGTGCATCGAGCAATGATTACTTCTCCTCATATATTGTATAGATGTCCTATTTCTTCTCATTGTTCGACTGCGTGAGTGCACAAGCCCACATCCTATAGGGTAATCACCTAGTAGGTCCACGCGCATGTGCGTAGACCGTGAATAGAGAAGTATTATATGCATCCAAACCCACCATTAACAGTGAGTTCACTTATTAACTATTTTTCGAATAAAGGTAAGAAACTCATGCACAAATGATGACATCGGTTGAATTGTTGACGACACTCATCGACAACTTTTCGGCATTTTAGTTATATTTTTAAATCAATTCACTGATTAACAATTTAGAATTTTGATTGATAAAAATTATTAATTTCAAAATGTTACTTCAACCAAAAAATTTAATTACATAAATTTCACTTAATTTACTATTAATTAGTTAATTAATTAATAGTTTTATTTAATTTTTAGAGTAGGTTAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATAATTAATGTAATTTCACTCGATATCTTTATAGTTGAATTATGATGAGATCGTACAATTTTATTAACTTATTCAATGTATTCCCGATTTTCGGTCCTGTTTCACTAGCGAGAAGAAATATCTCTCCCCTCTTTCCTCATTCCGTGTTTAAACTTGGATTCTCCACTTCAACCAGGATGGGTCTCTAAGTTCCCGATGTTAAATGAACATATCTAATTTTGATTTTATAGTAGATCGAATCACTTTTCTCTAAACATAATTGATTTGGTTCGGATCTTCGATCCATAAAATTGGATCGCCCGAACAACCTAGCTCACCGTGACAATATAAGATCGTTAACTCAATATTCATTCTCATCTTAAACTCAGTTTAAACCTCAGAACAAAGATTGTCCTATAAAAGGCCCATAACTTGGCTACTCAGTTCATCATCACAGCTTGGCCAATTTGGTTGAAGCAAATGGAATCCATAAACATGAGCTCTGAGGAAGCCATTATGGGTCCTGAAAAGCACACACTTTCCTTACATTTGGAGGCTCCAAAGGTTCAATGGAGGATGGGCAAGCCCCCAAATTATGAAGCTGCTAACAAGCTCTTTGAACATGGAAGAACAAAGGTTCTCTTCTTTCATTTTTTCTTTGCCAGATCTAATATCATCTTTGTTTCTTAATTTTTTTTGTTCGTCGTAGGTTTGGCCGAAAGGATCTCTCGAAGAAACCGTGCAGAATATCGTAAAATCAATGCACGCTGAGTTAGCTTACATGACAAGATCACAAGATTTCAAGACCATAAACCCTAAAAAATTCGTAGTTTATATCAACGGTAATGCTAATTTTGTTACGTTAAATATGTTTCAATTAATTTAGCCTCTAATGTTTGATCGAAAATGTGATATCTCACATGGGTTGGGGAGGAGAACGAAACACCCTACATTATAAGGGTGTAAAAACCTTTCCCCAGCAGGCGTGTTTTAAAAACCTTAAGAGAAGCCCGAAAGGAAAAACCCAAATAGGACAATATTGAGTAGCGGTGGGCTTGGGCCGTTACAGAAAAGTACGGAAAAAAAACAAGTCTCTGTCTAAGTCGGGTCTAAAATATCATAAAATTAACCTAACTCGACTCGTAAAAGCCCTTAATTACTTGTAATTAATGGATGATTAGATGATGAATTAGTGAATTTGTTGTGTTTGGTAGTGTAGGAAGAGAGGGGCTCTCAGGTGAAGAGGCAGTGAGGCTTGGAAGCTTCAATGCAATGCTGAAGAGCTCTCTACCAGAGGAATTCCATTACTTCAAAGCAAAGGAAGAGACATTTGAATCAACTTATAATGACTTTAAGACATGTTTTCCAAGAGGGTTTGCATGGGAACTTCTCCAGGTTTATTCTCCTCCTCCTTTGATTGCCTACAAGTTTAGGCATTGGGGTTTCTTTGAAGGGCCCTATAAAGCTCATTCCCCTACTCTAGAAATGCTCGAGTTCTTCGGCATGGGAACTCTCAAGGTAACGTCGAGATTCAATAACGACCCTTCTTGTCAAATGTATCCCTAAACATATTTAACGTCACGCTCATGAATGTTTCGGTTAGTTTGTGCCCTTATCGACTCATTTGATCATAACATAATGACAATTGAACTGTAACAGCTCAAGTCCACTACTAGCAAATATTGTTCTCTTTTGACTTTCCCTCTCGAGCTTCCCCTCAAGGTTTTTAAAACGTGTTTGCTAAGGAGAGGTTTTCACACTCGTATAAAGAATGTTTTGTTTTTCTCTCCATCCGATGTGGGATCTCACAATCCACCCCCCTTCGGGTCTCAGTGTTCTCGCTGACACTCGTTCCCTTCTCCAATCAATGTGGGACCCCCCAATCTACACTCCTTTGGGACCCAACGTTCTTTCTTGTCCAGTGGCACATTGCCTCGTGTCTAGTGGCACATCGCCCGATGTCTGGCTTTGATACAATTTGTAACAGTCCAAGTCCACCGATAGTAGATATTGTCTTCTTTAGGCTTTCCATTTCAGGCTTCCACATCCTTATAAAAGAATGTTTCGGTCTCTTCTCCAACAGATGTGGTATCTCACGTTTACTTACGACGTTCTAAATCCCTTCATTTAAAGATTATATTAAAGATGACATTTATTTGCACAGGTAGATTCATCATGGAAGGTTGAAGAAGTTCATGTGTTCTTTGATCCAGCTGAGCTATTTGGAAGTCTTTTGAAAGGCAAAAAAACAGCTTCAGAATCCAAAACAGCTGATTCATCTGCCTCTGCCTGTCCACTCTTCAATCAACCAAAGTAGCTCCACAAACACAAACACAAACACAAACCCAACAGAAGTTGGTCCGAAATAAAATGTGTTATGTTATGTTATAGTGTTTTTGGATTCAGTTCTTACGTTGTTATGTTTGTTAATTGTACCCTTTTTCTGTCGGTTCTTATTACATATCAATGATAATAAGTTGTTCTTGGTATCATGTTTAGTTTGTTACGGGAAATTTTTTATTAGAACTTAGAAATCATTTTCGAAATATATAATATATTATAGGGATAAAATGGACTTTTGACACAGTTGTAATAATGAACGATCTTTGATCTACTAGTATGTAATGATTATATCTATTGAAATAATTTGTTCTCANTTCTTTTGACTTTTCCTCTCGAGCTTCCCCTCAAGGTTTTTAAAAGTGTCTGCTAAGGAGAGGTTTCCACACTCTTATAAAAAATGTTTTGTTCTTCTCTCCATCCGATGTGGGATCTCACAATCCACCCCCCTTCGGGTCCCAGTGTTCTCGTTGACACTCGTTCCCTTCTCCAATCAATGTGGAACCCCCCAATCTACACTCCTTTGGGACCCAACGTTCTTTCTTGCACACTGCCTCGTGTCCAGTGGCACATTGCCTCGTGTCTAGTGGCACATCGCCCGGTGTCTGGCTTTGATACAATTTGTAACCGTCCAAGTCGATATTGTCTTCTTTAGGCTTTCCATTTCAAGCTTCCACATCCTTATAAAAGAATGTTTCGGTCTCTTCTCCAACAGATGTGGTATCTCACGTTTACTTACGACGTTCTAAATCCCCTTCATTTAAAGATTATATTAAAGATGACATTTATTTGCACAGGTAGATTCATCATGGAAGGTTGAAGAAGTTCATGTGTTCTTTGATCCAGCTGAGCTATTTGGAAGTCTTTTGAAAGGCAAAAAAACAGCTTCAGAATCCAAAACAGCTGATTCATCTGCCTCTGCCTGTCCACTCTTCAATCAACCAAAGTAGCTCCACAAACACAAACACAAACACAAACCCAACAAAAGTTGGTCTGAAATAAAATGTGTTATGTTATGTTATAGTGTTTTTGGATTCAGTTCTTACGTTGTTATGTTTGTTAATTGTACCCTTTTTCTGTCGGTTCTTATTACATATCAATGATAATAAATTGTTCTTGGTATCATGTTTAGTTTGTTACGGGAAATTTTTTATTAGAACTTAGAAATCATTTTCGAAATATATAATATATTATAGGGATAAAATGGACTTTTGACACAGTTGTAATAATGAACGATCTTTGATCTACTAGTATGTAATGATTATATCTATTGAAATAATTTGTTCTCAAGTGTATAAGAGTCGACTATATATCTAGAGCAGAGTTACTTATCATTAATAAATAAAATTAATTAATTAAAGAGTTTGTTTAATTATTTAATTATTTAATTAAAGATCTTTTACGTAAAAAAAAATTAAAGAGTATTTTTGGACACGTCAACTGATAACTTTCTATTTTCAAGGGTATTTTTGGAAGATTAGTGAAAGTTCAAGGACAATATTGTAATTTTTAACAATATTTTAAAAAATAAATAAATAAACAAAATTCATGATTTTTTTTTAAAATATTGTTTTTAGCGTCAAGTGTTCGACAAATAATTATAGAAATGATGAAAAAGAAAGAGAAGGAAAGAAAAAAACTACTACAAATCTCATTTTTATATATATATATATATATATATTAAAATTAAGTATTTAAATT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MLAHNLATQFIITAWPIWLKQMESINMSSEEAIMGPEKHTLSLHLEAPKVQWRMGKPPNYEAANKLFEHGRTKVWPKGSLEETVQNAVKSWQVEINNKTRLQDFNTINPQKFKFFVNGREGLTGEEVVRIGTFNALLKSALPEELHHFKAHEETFESAHNDFKTCFPRGFAWEVIEVYSPPPLITYKFRHWGYFEGPYKAHSPTTELVQLFGMGTLKVDSWMKVEEAHFYFDPAELFGSLLKGNKIAASFHKMSYEEGIMGGDKYRASLHLEGPTVEWRMGKPPNYEAVNKLFEEGRTKVWPKGSVEEQVQNIVKSLQMEFAYKTTPQDFKNINLHNFIASINGRTVSCEEALKLGSFNTFLKNPLPEEFHYFKPQEETSESTHNDFKTCFPRGFAWEVIEVYSPPPLIAYKFRHWGFFEGPYKSHSPTGEMLPVWLKETEAIKMSSEEGIMGPDKYRVFLHLEAPTVQWKRGRPSYEAVNKLFEDGRTKVWPKGSVEETVQNMVKTLQMEFANKARLQDFKIINPHKFHIFVNGREGVSGEETLKVGTLNVLLKNSLPEEFHYFNAQTETFELTCNDFKTCFPRGFAWELLQVYSPPPLIAYKFRHWGFFEGPYKAHSPTREMLEFYGMGTLKVDSSMKVEEAHFFYDPAELFGGLLKGKKTASESKAVDSSPSGCPFSNLQN
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. Swiss-Prot
Match: PRPX_HORVU (Pathogen-related protein OS=Hordeum vulgare PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 193.4 bits (490), Expect = 8.4e-48 Identity = 105/239 (43.93%), Postives = 140/239 (58.58%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. TrEMBL
Match: A5BRQ4_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VITISV_035026 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 418.3 bits (1074), Expect = 1.8e-113 Identity = 193/421 (45.84%), Postives = 277/421 (65.80%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KYW6_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G082440 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 351.3 bits (900), Expect = 2.7e-93 Identity = 163/228 (71.49%), Postives = 188/228 (82.46%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. TrEMBL
Match: K7NBX2_SIRGR (Pathogen-related protein OS=Siraitia grosvenorii PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 342.4 bits (877), Expect = 1.2e-90 Identity = 171/270 (63.33%), Postives = 203/270 (75.19%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KVJ6_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G082450 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 333.2 bits (853), Expect = 7.6e-88 Identity = 150/233 (64.38%), Postives = 191/233 (81.97%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. TrEMBL
Match: M1B8U4_SOLTU (Uncharacterized protein OS=Solanum tuberosum GN=PGSC0003DMG400015388 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 305.4 bits (781), Expect = 1.7e-79 Identity = 131/217 (60.37%), Postives = 178/217 (82.03%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. TAIR10
Match: AT1G78780.2 (AT1G78780.2 pathogenesis-related family protein) HSP 1 Score: 288.5 bits (737), Expect = 1.1e-77 Identity = 123/202 (60.89%), Postives = 163/202 (80.69%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. NCBI nr
Match: gi|147774898|emb|CAN77211.1| (hypothetical protein VITISV_035026 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 418.3 bits (1074), Expect = 2.6e-113 Identity = 193/421 (45.84%), Postives = 277/421 (65.80%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. NCBI nr
Match: gi|659101725|ref|XP_008451759.1| (PREDICTED: pathogen-related protein-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 352.4 bits (903), Expect = 1.7e-93 Identity = 162/209 (77.51%), Postives = 181/209 (86.60%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. NCBI nr
Match: gi|449438919|ref|XP_004137235.1| (PREDICTED: pathogen-related protein-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 351.3 bits (900), Expect = 3.8e-93 Identity = 163/228 (71.49%), Postives = 188/228 (82.46%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. NCBI nr
Match: gi|343466193|gb|AEM42990.1| (pathogen-related protein [Siraitia grosvenorii]) HSP 1 Score: 342.4 bits (877), Expect = 1.8e-90 Identity = 171/270 (63.33%), Postives = 203/270 (75.19%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG14g03540 vs. NCBI nr
Match: gi|659101719|ref|XP_008451756.1| (PREDICTED: pathogen-related protein isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 335.5 bits (859), Expect = 2.2e-88 Identity = 151/214 (70.56%), Postives = 181/214 (84.58%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene:
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