Cp4.1LG06g05890 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TACGCCCAAATTCGTAAATGTATATATAATCTGCGGCGCCATCGTTGATTTTGGCGACAAAACAATGGCCACTGGCTTTGGCGGCAATGGGAGTAGCAGTTGCAAGTACAAGTGCGACACTGCCGCCAATACTCTGCAATGGATAAAAGCCATCGCCGACTTCATTAGACCTTACTCGTTCCTGATCAATGCTCCCGTCGTCAATTTTTTTAAGGTTTGTTGATTTATTTTTTCATTCGCACAAGTTTTGGAATCTGCTTTGAGTGTAGCTTGTAATTTGATTTTGATTTTTCCTTTTCACTCGTGGATGTTCTTTTATGATTTACATCATGCTACTGCTTCCATTCTCTTTTACAGGATAGACTATGGGAAGCTGTTGATGAGGAATGGATGGAGTGCTTGCGCAAGGAACATGTGAAGAATCTGCTTCTAATTCCTTCTGGAGCTGTCCAGGTGCGTCTGTAATTGGAGAACATTTTTAGACTTGATTTTATTTCAATTAGCTTGTGTTTGAACGTTTGAAGCTTAGTTTTGAAGCTAGATTTGAGCTCACTTGTAAGATTTTTGTCCATAACAAAAGTACGCAGGTAGTATTTGACTGAATTGACAGTTACACTTTCTCAATGATCCATTATAAGCCTTATTTGGATATGTTTAGGACATAATCCTCTATATGCATGTTAATTTAGACATAATTGTCTGATTATCTGGATCAAAGTATAATATCGATCAAAATATTGATTCGTACCTGTCGAGTAATTTAAAAATATTCACGGAACTGAAATTGATCATTATTTGTAATAATAACGTCATTATTTTCAAAGTAGTTATTATCCGTGTTGGTATGTAGTTGGATGATTAATTCTATGGAAGAATGCTGAGACTGTACAATGACATATTGCATTGCATAAATCCAGTTTCAATTTCTGGGAAAATAGATGTGTAATGGATTGAATTTTATTGTTATTATTATTTTATTCTGAATCAGATACCATAAAGATTTCTGACTAACCTTGTGTTTGCTTGGGGAGCATATAAATCCGCTTATCAACATCTATAATTGATTAGTTGGGTTTCAAAATAAGGGTGAACTAAAAAAAAAACTCCCATATTTAGGGGTGTCGTTAACTAACTCCATATGTTGACGTCTTTTTTTTTTGTTCCTTTTAAAAATTGAATTAATTTTTTCATACTGTCAGTAGATTTCTTATTAAATATTGGTACATCCTTATGGGGCATGTGTGATGTCTTTGACTAATTAGATTAAATAGAACTGAAGTTATGAAATGGCAAGAACTCAGAAATGAAAAATGAGTGGCGAAATATGGCTAGAGTAAAAAAGGTTGATGATAGCCTTCTGCGTGTCACTGTATGTTATGATATATTTCTAAAAATGCATCATCGTTGTTGAGAAGTATCAGAGTACGAAAGTTATGAGCATTGGTCACAGGGGAGCGTTTTGTCTGGAAATATTGCTGATAGTTTAATCCATTTTAAGGAATTTATGGAACTATGTGATCTGCTTTTCTTTGTGTTTCTTGTTATGAGTGCATTTACTCTAATGTACTGAAGTCTAAGTTTCTGATTGACAAAATCTTTCAGGAATACTGGCCAGATTCACTAAAGAAATTTATCCGTACTTCAAGATCTCTTGCCTTTGGACGTGAACAAGCAGACTTGCAGATGGTAGTGCTTTTATGTTATACAGTTGATAGTTTCCGATTGATTATATAGATTTGCTGCGTATAGCAAGAAAAAGAAACATAGGCTTGAAAATTGCATAATATCCATTATCCACTTCGACTCATATGTTACTTTCAAGAAGATGAGAGCTCGCTCCACTCAGGAAGTTCTCTTTCATTGAGCTGTCTTCTAAACCTGAGATTCCAGCTATTATCAACCAAATTCCCTTATCCTTGAAACAATGAAGACTCACATTCTGTAATACAAAAGAATGTGCAGATTTTCTGATATCAGTCTCGTAAGGATAGAACAGAAGTATCTGAACATGGCATTTTAAAACGTGTTGATGACCTTATCTTACATAAGATTTCTGTAGATTTACCCCTTTTCCTTTTTTTTTTTGGATAAAAACTGGGAAGCTTCTTCTTGATCTTCACCCCTCAACTTTAGGAGTCTGGTCCCATTCGTATTCTTTTGTTGCTATTAGAATTATTTTTCACTAAGGACATGGATGGAGAGTTATTGACATTTAACCACCCTTTCTTTAAGATAGACTTCCTGTTATTAGTGTGTCTTGTTGGATTGAGACAAAGAGTGGTCCGTGGTTGGAGTATAATTAAGCTACTTTGAGGCCTGTTTGTAACTAACGGTTACTAGGAGTATGGAAAGGGAAGGTGTGAGTGGGTATCTATCCGGCTAATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTTAATTTTATATAAGAGGGAATTATTCCTTTGGACATTGTACTGGGAGATGGGAGAGCGAGATCTCTTGAATCGCACTTCTCTGTTTCTTTTTAATAATAAAGAACTGTCACTAACGTCATCCCACTTATGCGTGTCAAACAGAATGTTCCAGGTTGATTTTATCCATTTCTTAGTACCACAGTTGTGTGTATTATTGCAGGTTCTACCTGGTTGGTGCATCGCTTCACTTAACACTGTTCTTTCTCAAGGCATGAATCAGAAGAAAAAACATGAAGTAGGTTATTGGGTCTTACATTTCCGAATGGAATACTTTATGCCTTTTCCAATTTACTAAGAGAGAGCTATCCTTGAGTGCGTGTTAAACAAATCATTTAAATTCAAAATCAGAGAGAAACATATCTATCAGACTAAATAAGTTAAAATCTAAATCAGTAACAAATTACTCTTATTTATGAAATAAAGTCCAAATATTCTCATTTTAATGTGAAACCCTCTTTCTTTTCAAAGCTTGACCATGATTTTTAAATTGAGGTTCTAATTCTTATGATCTTGTTTTCCTACGTGGGAGTCGAATTTCCTAGCATTAGTTTTCAATTTGGTGTAAAACTATGACCATTTAAATTGAATATGATGTATTTCATCTTTAACTTTGCATCCGGATATGATTTATGCTTGGTCCATTTTGTATGATACAATCTGTGGGTTTCATGGCTTGTCAAACGCGTTGATTCAATCTACAAATTGTGTTGTGATATATTATAACCAAAACATTTTCTATATGGTTCATTAAGAAATTTTTTAATGCTTCAACAGGTTGAAGTCCTTTCCGCCATTATTAGTTTGATTGCAAGTGACCTGAAAAGTCATGCAATTGTTGATGTTGGTGCTGGGCAGGTAACACTTACTTTCATTACTGTATGCAAGATGGGTAAGTTTGATTCTGCATCCAGCTTCTTTATATTAGACTGTACTAAAAAAAGAGTCATTCCACAGGGATGGGCTTAAACATCTTCCATTATTTTGGATCTATTAGGTTCCTTTCATTTTCTCCTAAAATGTATGGGAAAAAGTACTTCCTCAATTAAATATGTAAATTTCTTTATGAAATCAACTTAGTTGATTTTATGTTGTAGTACTTGAAGAAATGAACTTCACTTCCTTGCCTTTATGATCAATGTCTGAGAGGTAACTGAGTCTAGGATATTCCTGTACATACTTCTTCCACAGCAGCAACAAAATTCTATTCTTTCTAGGCTTCTAATTTAAGCATTTTCTGATAACTCCTTTTCTACATTTTAATTGAATCTCACTCATATTTTTTGAATGATTTATTCCTCTGTAATCTACTTTCTCTGTCGATCTGTTTTTTCTTCCATTATTGTTTCGGTGTATTCCTAAAAGGGTTTATGATCCATATAAATTCTTCTTACAACAAAAATTTCCATGTACTCGTATGCTCTATATAACGTTCTACTATTGCAAGTGCTTTCATACTTATGATCTTTTCTTGTTAGGGTTATTTAGCGCAAGTGCTTTCCTTCCATTACAAGCATTCAGTTCTTGCAATTGATGCTTGTTCTCATCATGGAAATGTGACAAGTGCACGTTCAGAACGGATTAAGAAGTATTACTCAGCACAGATTCGTAAATCTGGGTAAGGGTATAGAAAACGTTTTTAGGCAAACATTTTGTGTTGATGCGAGCAGATAGAATTAAAATGTTTTACTTTCATTTCTCCTATTTTTTTAAATCTCTTGGAAGCTATTTCTCTTATTTGTGTTTTCTTGAACTTGGTCCCATCTTCTATTGGTTATCTTAAGAACTTCTGGTTTCAAGGGAGTGATAATGAGATCAGCGAGAGCATCTACCACCCACACGGCAATTTATGAGGCCAAACTAAGCTCATACCCATTGTATTTATTCTTTTATAAAATGTTCCCTTCTGAAGACTGATATAAGTTATAGAAAAGTGTTATTATGTATCTACAAATCTCAGAGATCCACATTATTAAACTTTCTAGTCCTCTCACAACAACATAGAAATCACTTTTCAATTTTGATGAAACTCAAACCATCTTGGATTGAGAAATGGTTCTCGCATATTTCCATCTCGAAGAAGCCAGTCACTGATTTTGTATGTGGTTTCAGTCATTGTAACTTAGAGGGAAAGACTTCTGGATACTCAGGTGTATCTTAGAGGACTAAATGCAAACCTTTTTTTTTCTCTTGCCCTGCTTAAATGTTCTTAGTTTCTTACTAGACTAAAATAGTATTTTGGTTTCTACTTATTGTTTTTTTTAACTTAATATCTAAAAAATCATTACTCTTTTTCTAATTTCGCTGAACTCTTTACAGATTGGAAACCAACAATTTGAGACTGCCGAAGGCAATGACATTTCATGTATTATCCGTTGATGCATTAAAATCCCTTGCTAACATGTCACTACAAGACGATCATGCTGATAAGACAAGTGTGACTGGCGATGATCTAGAGAAAACCAATCGGCAGGAGTCAAAGGGTTTGTGCCGTTCAGGCAAAGAGCCTTCATTGGTTCTTGCTGGACTTCATGCTTGCGGTGA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ATGGAGAATAATATAAGCATGGTGGAGGCCAAACTTCCTCCTGGATTTAGGTTCCATCCAAGAGATGAAGAATTGGTCTGTGATTATCTGATGAAGAAGATTGGCTCTGTTTGTGATTCTTCTTCTCTCTTGATTGAAGTTGACCTCAACCAGTGTGAGCCTTGGGATATTCCAAGAGAGGCATGCGTGGGGGGAAAAGAGTGGTACTTCTTCAGCCAGCGGGACCGTAAGTACGCGACTGGGCTTAGAACAAACCGCGCCACAGCCTCAGGGTACTGGAAGGCCACTGGCAAAGACAGGCCTGTCTTTCACAAGGCCAATCAACTCGTTGGGATGAGAAAGACTCTTGTTTTCTACCAAGGAAGGGCCCCTAAAGGCCGAAAAACCGAGTGGGTTATGCATGAATTTCGGCTTGAGGGTCCACTTTCTCCTCTCAAAGATCCACCTCCTAGGGAGGACTGGGTTCTGTGCAGAATGTTCTGTAAACAGAAAGAAGTGCCCGCCCGACCGAGCACGGGAAGCAGCAGCTCCTACAGCAACGTCGCTGCCTCGTCGTCTCTCCCAGCTTTGATGGACTCATACCTCAGTTTTCACCAAAATCCAAGCAGCTATTTAAATGAGTTTGAGCAAGTGCCCTGCTTCTCCATTTTGTCTCAAAACCAAACCATCCCATCTCTCTCAAACCTCATACAAATGGAGGCAAACACAGGCAACAACATCAAGAACTTCACCACAATGTATGGAGGAATGCCAAATTCAAGCACTTATTCTTCAAATATTGACCCTTTTGCCTGTGACTCATCAGTGCTCAAAGTTGTTCTAAATAACATTACTAAGATGGAAACAAATGGCAACCCCTTCATAGGGCAACCCAGCATGGGAGAAGGCAGCTCTGACAGCTACTTGTCTGAGGTTGGTGATGATATTTCCAGCTTTTGGAACAGATGA MENNISMVEAKLPPGFRFHPRDEELVCDYLMKKIGSVCDSSSLLIEVDLNQCEPWDIPREACVGGKEWYFFSQRDRKYATGLRTNRATASGYWKATGKDRPVFHKANQLVGMRKTLVFYQGRAPKGRKTEWVMHEFRLEGPLSPLKDPPPREDWVLCRMFCKQKEVPARPSTGSSSSYSNVAASSSLPALMDSYLSFHQNPSSYLNEFEQVPCFSILSQNQTIPSLSNLIQMEANTGNNIKNFTTMYGGMPNSSTYSSNIDPFACDSSVLKVVLNNITKMETNGNPFIGQPSMGEGSSDSYLSEVGDDISSFWNR
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. Swiss-Prot
Match: NAC22_ARATH (NAC domain-containing protein 21/22 OS=Arabidopsis thaliana GN=NAC021 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 318.5 bits (815), Expect = 8.0e-86 Identity = 180/324 (55.56%), Postives = 229/324 (70.68%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. Swiss-Prot
Match: NAC98_ARATH (Protein CUP-SHAPED COTYLEDON 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=NAC098 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 206.8 bits (525), Expect = 3.4e-52 Identity = 96/153 (62.75%), Postives = 115/153 (75.16%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. Swiss-Prot
Match: NAC92_ARATH (NAC domain-containing protein 92 OS=Arabidopsis thaliana GN=NAC92 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 206.1 bits (523), Expect = 5.8e-52 Identity = 109/216 (50.46%), Postives = 138/216 (63.89%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. Swiss-Prot
Match: NAC79_ARATH (NAC domain-containing protein 79 OS=Arabidopsis thaliana GN=NAC079 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 205.7 bits (522), Expect = 7.5e-52 Identity = 121/270 (44.81%), Postives = 164/270 (60.74%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. Swiss-Prot
Match: NC100_ARATH (NAC domain-containing protein 100 OS=Arabidopsis thaliana GN=NAC100 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 201.8 bits (512), Expect = 1.1e-50 Identity = 108/212 (50.94%), Postives = 133/212 (62.74%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LDG6_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G523580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 556.6 bits (1433), Expect = 1.9e-155 Identity = 273/318 (85.85%), Postives = 293/318 (92.14%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. TrEMBL
Match: A0A0B2QZ54_GLYSO (NAC domain-containing protein 21/22 OS=Glycine soja GN=glysoja_011392 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 390.6 bits (1002), Expect = 1.8e-105 Identity = 207/314 (65.92%), Postives = 234/314 (74.52%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. TrEMBL
Match: B2ZGS0_SOYBN (NAC domain protein OS=Glycine max GN=NAC34 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 389.4 bits (999), Expect = 4.1e-105 Identity = 206/314 (65.61%), Postives = 234/314 (74.52%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. TrEMBL
Match: C6TN89_SOYBN (Putative uncharacterized protein OS=Glycine max PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 389.4 bits (999), Expect = 4.1e-105 Identity = 206/314 (65.61%), Postives = 234/314 (74.52%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. TrEMBL
Match: A0A0B2R272_GLYSO (NAC domain-containing protein 21/22 OS=Glycine soja GN=glysoja_025555 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 386.0 bits (990), Expect = 4.5e-104 Identity = 203/314 (64.65%), Postives = 231/314 (73.57%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. TAIR10
Match: AT1G56010.2 (AT1G56010.2 NAC domain containing protein 1) HSP 1 Score: 318.5 bits (815), Expect = 4.5e-87 Identity = 180/324 (55.56%), Postives = 229/324 (70.68%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. TAIR10
Match: AT3G12977.1 (AT3G12977.1 NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein) HSP 1 Score: 259.2 bits (661), Expect = 3.2e-69 Identity = 151/315 (47.94%), Postives = 195/315 (61.90%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. TAIR10
Match: AT3G18400.1 (AT3G18400.1 NAC domain containing protein 58) HSP 1 Score: 214.5 bits (545), Expect = 9.1e-56 Identity = 119/271 (43.91%), Postives = 168/271 (61.99%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. TAIR10
Match: AT4G28530.1 (AT4G28530.1 NAC domain containing protein 74) HSP 1 Score: 209.9 bits (533), Expect = 2.2e-54 Identity = 103/175 (58.86%), Postives = 121/175 (69.14%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. TAIR10
Match: AT5G18270.1 (AT5G18270.1 Arabidopsis NAC domain containing protein 87) HSP 1 Score: 208.4 bits (529), Expect = 6.5e-54 Identity = 123/287 (42.86%), Postives = 168/287 (58.54%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. NCBI nr
Match: gi|449466123|ref|XP_004150776.1| (PREDICTED: NAC domain-containing protein 21/22-like isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 556.6 bits (1433), Expect = 2.8e-155 Identity = 273/318 (85.85%), Postives = 293/318 (92.14%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. NCBI nr
Match: gi|778681513|ref|XP_011651529.1| (PREDICTED: NAC domain-containing protein 21/22-like isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 548.9 bits (1413), Expect = 5.8e-153 Identity = 271/318 (85.22%), Postives = 292/318 (91.82%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. NCBI nr
Match: gi|659087103|ref|XP_008444276.1| (PREDICTED: NAC domain-containing protein 21/22-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 484.2 bits (1245), Expect = 1.8e-133 Identity = 241/284 (84.86%), Postives = 262/284 (92.25%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. NCBI nr
Match: gi|734390512|gb|KHN26800.1| (NAC domain-containing protein 21/22 [Glycine soja]) HSP 1 Score: 390.6 bits (1002), Expect = 2.6e-105 Identity = 207/314 (65.92%), Postives = 234/314 (74.52%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG06g05890 vs. NCBI nr
Match: gi|255647843|gb|ACU24381.1| (unknown [Glycine max]) HSP 1 Score: 389.4 bits (999), Expect = 5.9e-105 Identity = 206/314 (65.61%), Postives = 234/314 (74.52%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene:
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