Cp4.1LG01g21120 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)

Overview
NameCp4.1LG01g21120
Typegene
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (Zucchini))
DescriptionUnknown protein
LocationCp4.1LG01 : 17853898 .. 17855423 (+)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGTAATAAGGAGTGAGTGAAGTGGGGGTTGAGGGACAAAGCTATATAAAGGGGAGGAGAAGGGTGTTGTGATCCATCAAGGATGGGGAAAATGGGATCCTCAATGGCTCCTCTTCTTTGTACTGCCTTTCTGGCTCTTCTTTCCCTAAGCTTGCTATCAACCACCAATGCTAATTATGTCTATGCCTCTCCCCCGCCTCCTAAGAAGGTAGACTATCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCCGTCTACCATTCTCCTCCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCTCCTCCTGTCTACTCACCACCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCGGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCGCCTCCAGTCTACCATTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCGGTCTATCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAAGTCTACTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCTCCACCCGTGTACTCTCCACCACCACCCAAGAAAGTATACTACCCGCCACCAGTACACTCTCCACCACCACCGGTGTATTACTACTCATCCCCACCTCCTCCCCACTACTAGGAACTAAATTCCCTTCCACGTCAAGGTAATTTAATTCTTTTACTAAATCACGTCGTCTTTTCTCCGCATAACTAACATAATACCATAATATATATTAATTTTATAAAGAAAAAAAAAATAAACAAAAATTTTCCTTAAAAAAGTTGGTCCAAGTAATAACATGGGTTTAATGTTGCTGTAGCGCAGGAAGATGAGGTGAGCATACAGTATATGTCGAACTCAAAATAAGACGCTTTGAAAGATCCGAAGCATAGTGTGAAGTTCTTTTTCATATATTAATGTATCCGTTCTCAAATTCTATGTATTTGCTTCCAATCCTATGTTGTCTTAGGTTGTCTTGTAACGGAGCTCAGCTCAGCTCAGCTTTTTTTGCTCAAAGCAAAGGTTGTGCTTTATTTATCTATACTTACGTCTTCACGAATGCATTCTCAACTTTCTTCGTCCCTAAT

mRNA sequence

ATGAGGTGTTGTGATCCATCAAGGATGGGGAAAATGGGATCCTCAATGGCTCCTCTTCTTTGTACTGCCTTTCTGGCTCTTCTTTCCCTAAGCTTGCTATCAACCACCAATGCTAATTATGTCTATGCCTCTCCCCCGCCTCCTAAGAAGGTAGACTATCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCGGTCTATCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAAGTCTACTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCTCCACCCGTGTACTCTCCACCACCACCCAAGAAAGTATACTACCCGCCACCAGTACACTCTCCACCACCACCGGTGTATTACTACTCATCCCCACCTCCTCCCCACTACTAGGAACTAAATTCCCTTCCACGTCAAGGAAGATGAGGTGAGCATACAGTATATGTCGAACTCAAAATAAGACGCTTTGAAAGATCCGAAGCATAGTGTGAAGTTCTTTTTCATATATTAATGTATCCGTTCTCAAATTCTATGTATTTGCTTCCAATCCTATGTTGTCTTAGGTTGTCTTGTAACGGAGCTCAGCTCAGCTCAGCTTTTTTTGCTCAAAGCAAAGGTTGTGCTTTATTTATCTATACTTACGTCTTCACGAATGCATTCTCAACTTTCTTCGTCCCTAAT

Coding sequence (CDS)

ATGAGGTGTTGTGATCCATCAAGGATGGGGAAAATGGGATCCTCAATGGCTCCTCTTCTTTGTACTGCCTTTCTGGCTCTTCTTTCCCTAAGCTTGCTATCAACCACCAATGCTAATTATGTCTATGCCTCTCCCCCGCCTCCTAAGAAGGTAGACTATCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCGCCACCACCTAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCGGTCTATCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAAGTCTACTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCTCCACCCGTGTACTCTCCACCACCACCCAAGAAAGTATACTACCCGCCACCAGTACACTCTCCACCACCACCGGTGTATTACTACTCATCCCCACCTCCTCCCCACTACTAG

Protein sequence

MRCCDPSRMGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPPPVYYYSSPPPPHY
Homology
[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN1_ARATH (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 196.4 bits (498), Expect = 3.5e-49
Identity = 171/252 (67.86%), Postives = 175/252 (69.44%), Query Frame = 1 

Query: 16  MAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY- 75
           MA  L  AF    SL+ +S T ANY Y+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 1   MASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYK 60

Query: 76  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY--------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPP 135
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y         PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPP
Sbjct: 61  SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPP 120

Query: 136 PKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY- 195
           P K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 121 PVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYK 180

Query: 196 SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVH-SPPPPVYYYS-- 244
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPV+ SPPPPV YYS  
Sbjct: 181 SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPP 240

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN3_ARATH (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 173.7 bits (439), Expect = 2.4e-42
Identity = 164/263 (62.36%), Postives = 172/263 (65.40%), Query Frame = 1 

Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKK-----VDY--PPPVYHSPPPP 71
           MGS MA L+ T  +  +SL+ +S + ANY Y+SPPPP K     V +  PPPVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 72  KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPK 131
           KK Y      SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPK
Sbjct: 61  KKHY---EYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK 120

Query: 132 KVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SP 191
           K Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SP
Sbjct: 121 KHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 180

Query: 192 PPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV 244
           PPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 181 PPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPV 240

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. Swiss-Prot
Match: LRX1_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 6.9e-37
Identity = 132/220 (60.00%), Postives = 134/220 (60.91%), Query Frame = 1 

Query: 40  YVYASPPPPKKVDYPPP---VYHSPPPPKKVYY---PPPVYSPPPPKKVYY--------- 99
           YVY+SPPPP     PPP   VY SPPPP  VY    PP VYS PPP  VY          
Sbjct: 470 YVYSSPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPPPSP 529

Query: 100 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 159
           PPP   S PPP  VYY P V  SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  V
Sbjct: 530 PPPCPESSPPPPVVYYAP-VTQSPPPPSPVYYPPVTQSPPPPSPVYYPPVTNSPPPPSPV 589

Query: 160 YYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 219
           YYPP  YSPPPP  VYYP    SPPPP  +YYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  V
Sbjct: 590 YYPPVTYSPPPPSPVYYPQVTPSPPPPSPLYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPV 649

Query: 220 YYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPPPVYYYSSP---PPP 242
           YYPP   SPPPP  VYYP    SPPPP  YY SP   PPP
Sbjct: 650 YYPPVTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPPTEYYYSPSQSPPP 688

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. Swiss-Prot
Match: LRX2_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 115.5 bits (288), Expect = 7.9e-25
Identity = 129/236 (54.66%), Postives = 137/236 (58.05%), Query Frame = 1 

Query: 40  YVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPK-------KVYYP---PPVY 99
           Y+Y+SPPPP     PP +Y SPPP   V  PP   SPPPPK       + YYP   PP Y
Sbjct: 504 YIYSSPPPPSPSPPPPYIYSSPPPV--VNCPPTTQSPPPPKYEQTPSPREYYPSPSPPYY 563

Query: 100 H---SPPPPKKVYY--------PPPVYH---SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV 159
               SPPPP   YY        PPP Y+   SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYY P +
Sbjct: 564 QYTSSPPPP--TYYATQSPPPPPPPTYYAVQSPPPPPPVYYPPVTASPPPPP-VYYTPVI 623

Query: 160 YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV 219
            SPPPP  VYY P   SPPPP  VYY PPV   PPP  VYYPP   SPPPP  VYY P  
Sbjct: 624 QSPPPPP-VYYSPVTQSPPPPPPVYY-PPVTQSPPPSPVYYPPVTQSPPPP-PVYYLPVT 683

Query: 220 YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPP---PVYYY--SSP---PPPHY 244
            SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPP   PV Y+  +SP   PPP Y
Sbjct: 684 QSPPPPSPVYYPPVAKSPPPPSPVYYPPVTQSPPPPSTPVEYHPPASPNQSPPPEY 731

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. Swiss-Prot
Match: LRX3_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 8.7e-24
Identity = 113/212 (53.30%), Postives = 120/212 (56.60%), Query Frame = 1 

Query: 44  SPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 103
           SPPPP  +   PP   SPPPP     PPPVYSPPPP     PPP  +SPPPP     PPP
Sbjct: 409 SPPPPAPIFSTPPTLTSPPPPSP---PPPVYSPPPPPP---PPPPVYSPPPPPPPPPPPP 468

Query: 104 VYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP 163
           VY  PPPP     PPPVYSPPPP     PPPVYSPPPP     PPPVYSPP       PP
Sbjct: 469 VYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPPSPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPP-------PP 528

Query: 164 PVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY-- 223
           PVYS PPP     P PVY   PP     PPP +SPPPP+        +SPPPP+  YY  
Sbjct: 529 PVYSSPPPPPSPAPTPVYCTRPP-----PPPPHSPPPPQ--------FSPPPPEPYYYSS 588

Query: 224 ------------PPPVHSPPPPVYYYSSPPPP 242
                       PPP HSPPPP+Y Y SPPPP
Sbjct: 589 PPPPHSSPPPHSPPPPHSPPPPIYPYLSPPPP 594

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K8S7_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 362.8 bits (930), Expect = 3.2e-97
Identity = 220/257 (85.60%), Postives = 225/257 (87.55%), Query Frame = 1 

Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKK-- 68
           MGKMGSSMAP+L  AF+ALLSL+L STTNANY+YASPPPPKKV YPPPVYHSPPPPKK  
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60

Query: 69  --------------VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 128
                         VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPK
Sbjct: 61  YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPK 120

Query: 129 KVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPP 188
           KVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPP
Sbjct: 121 KVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPP 180

Query: 189 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPP 242
           PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV+SPPP
Sbjct: 181 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPP 240

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TrEMBL
Match: D7KTY3_ARALL (Predicted protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_476851 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 201.1 bits (510), Expect = 1.6e-48
Identity = 172/253 (67.98%), Postives = 177/253 (69.96%), Query Frame = 1 

Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 71
           MGS MA  L  AF    SL+ +S T ANY Y+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 72  PVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKV 131
           PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K 
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKY 120

Query: 132 YYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY------SPPPPKKVYYPPPVY 191
           Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY      SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 121 YSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPSPPPPVKHYSPPPVY 180

Query: 192 -SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVH-SPPPPVYYYS- 244
            SPPPP K Y PPPVY S PPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPV+ SPPPPV +YS 
Sbjct: 181 KSPPPPVKHYSPPPVYKSAPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSP 240

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TrEMBL
Match: R0IMM6_9BRAS (Uncharacterized protein OS=Capsella rubella GN=CARUB_v10009850mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 170.6 bits (431), Expect = 2.3e-39
Identity = 163/269 (60.59%), Postives = 170/269 (63.20%), Query Frame = 1 

Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 71
           MGS MA L+    +  +SL+ +S + ANY Y+SPPPP K  Y PPV H  PPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASLVAALLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVK-HYSPPVKHYSPPPVKHYSPP 60

Query: 72  PVY-------------SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYH 131
           PVY             SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYH
Sbjct: 61  PVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYH 120

Query: 132 SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPP 191
           SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PP
Sbjct: 121 SPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPP 180

Query: 192 PVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKV 244
           PVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K 
Sbjct: 181 PVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKH 240

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TrEMBL
Match: A0A0D3D7I6_BRAOL (Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 168.7 bits (426), Expect = 8.8e-39
Identity = 163/272 (59.93%), Postives = 170/272 (62.50%), Query Frame = 1 

Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPP-KKVDY---PPPVYHSPPPPKKV 71
           MGS MA L  T  +  +SL+ +S + ANY Y+SPPPP K  +Y   PPPV H PPPP K 
Sbjct: 1   MGSPMASLAATLLVLTVSLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYEYKSPPPPVKHYPPPPVKH 60

Query: 72  YYPPPVY-------------SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PP 131
           Y PPPVY             SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PP
Sbjct: 61  YPPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPP 120

Query: 132 PVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKV 191
           PVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K 
Sbjct: 121 PVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKDY----VYKSPPPPVKH 180

Query: 192 YYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPP 244
           Y PPPVY SPPPPKK Y      SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP
Sbjct: 181 YSPPPVYHSPPPPKKHY---AYKSPPPPVKHYTPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPP 240

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TrEMBL
Match: A0A0D3CC16_BRAOL (Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 168.3 bits (425), Expect = 1.1e-38
Identity = 167/292 (57.19%), Postives = 174/292 (59.59%), Query Frame = 1 

Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPP-KKVDY-----------PPPVYH 71
           MGS MA L+ T  +  +SL+ +S + ANY Y+SPPPP K   Y           PPPVYH
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQYKSPPPPVKHYSPPPVYH 60

Query: 72  SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHS 131
           SPPPPKK Y      SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHS
Sbjct: 61  SPPPPKKHY---EYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 120

Query: 132 PPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYY------------PPPVY-- 191
           PPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y             PPPVY  
Sbjct: 121 PPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVMHYSPPPVYHS 180

Query: 192 -----------SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-S 244
                      SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY S
Sbjct: 181 PPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 240

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR10
Match: AT1G21310.1 (AT1G21310.1 extensin 3)

HSP 1 Score: 173.7 bits (439), Expect = 1.4e-43
Identity = 164/263 (62.36%), Postives = 172/263 (65.40%), Query Frame = 1 

Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKK-----VDY--PPPVYHSPPPP 71
           MGS MA L+ T  +  +SL+ +S + ANY Y+SPPPP K     V +  PPPVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 72  KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPK 131
           KK Y      SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPK
Sbjct: 61  KKHY---EYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK 120

Query: 132 KVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SP 191
           K Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SP
Sbjct: 121 KHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 180

Query: 192 PPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV 244
           PPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 181 PPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPV 240

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR10
Match: AT1G12040.1 (AT1G12040.1 leucine-rich repeat/extensin 1)

HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 3.9e-38
Identity = 132/220 (60.00%), Postives = 134/220 (60.91%), Query Frame = 1 

Query: 40  YVYASPPPPKKVDYPPP---VYHSPPPPKKVYY---PPPVYSPPPPKKVYY--------- 99
           YVY+SPPPP     PPP   VY SPPPP  VY    PP VYS PPP  VY          
Sbjct: 470 YVYSSPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPPPSP 529

Query: 100 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 159
           PPP   S PPP  VYY P V  SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  V
Sbjct: 530 PPPCPESSPPPPVVYYAP-VTQSPPPPSPVYYPPVTQSPPPPSPVYYPPVTNSPPPPSPV 589

Query: 160 YYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 219
           YYPP  YSPPPP  VYYP    SPPPP  +YYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  V
Sbjct: 590 YYPPVTYSPPPPSPVYYPQVTPSPPPPSPLYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPV 649

Query: 220 YYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPPPVYYYSSP---PPP 242
           YYPP   SPPPP  VYYP    SPPPP  YY SP   PPP
Sbjct: 650 YYPPVTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPPTEYYYSPSQSPPP 688

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR10
Match: AT1G76930.1 (AT1G76930.1 extensin 4)

HSP 1 Score: 142.9 bits (359), Expect = 2.6e-34
Identity = 116/175 (66.29%), Postives = 121/175 (69.14%), Query Frame = 1 

Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 71
           MG+ MA  L  AF    SL+ +S T ANY Y+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGAPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 72  PVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVY 131
           PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP  VY      SPPPP K Y
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPP--VY-----KSPPPPVKHY 120

Query: 132 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYS 183
            PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPP Y+
Sbjct: 121 SPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPSYT 164

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR10
Match: AT1G62440.1 (AT1G62440.1 leucine-rich repeat/extensin 2)

HSP 1 Score: 115.5 bits (288), Expect = 4.5e-26
Identity = 129/236 (54.66%), Postives = 137/236 (58.05%), Query Frame = 1 

Query: 40  YVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPK-------KVYYP---PPVY 99
           Y+Y+SPPPP     PP +Y SPPP   V  PP   SPPPPK       + YYP   PP Y
Sbjct: 544 YIYSSPPPPSPSPPPPYIYSSPPPV--VNCPPTTQSPPPPKYEQTPSPREYYPSPSPPYY 603

Query: 100 H---SPPPPKKVYY--------PPPVYH---SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV 159
               SPPPP   YY        PPP Y+   SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYY P +
Sbjct: 604 QYTSSPPPP--TYYATQSPPPPPPPTYYAVQSPPPPPPVYYPPVTASPPPPP-VYYTPVI 663

Query: 160 YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV 219
            SPPPP  VYY P   SPPPP  VYY PPV   PPP  VYYPP   SPPPP  VYY P  
Sbjct: 664 QSPPPPP-VYYSPVTQSPPPPPPVYY-PPVTQSPPPSPVYYPPVTQSPPPP-PVYYLPVT 723

Query: 220 YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPP---PVYYY--SSP---PPPHY 244
            SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPP   PV Y+  +SP   PPP Y
Sbjct: 724 QSPPPPSPVYYPPVAKSPPPPSPVYYPPVTQSPPPPSTPVEYHPPASPNQSPPPEY 771

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR10
Match: AT4G13340.1 (AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein)

HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 4.9e-25
Identity = 113/212 (53.30%), Postives = 120/212 (56.60%), Query Frame = 1 

Query: 44  SPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 103
           SPPPP  +   PP   SPPPP     PPPVYSPPPP     PPP  +SPPPP     PPP
Sbjct: 409 SPPPPAPIFSTPPTLTSPPPPSP---PPPVYSPPPPPP---PPPPVYSPPPPPPPPPPPP 468

Query: 104 VYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP 163
           VY  PPPP     PPPVYSPPPP     PPPVYSPPPP     PPPVYSPP       PP
Sbjct: 469 VYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPPSPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPP-------PP 528

Query: 164 PVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY-- 223
           PVYS PPP     P PVY   PP     PPP +SPPPP+        +SPPPP+  YY  
Sbjct: 529 PVYSSPPPPPSPAPTPVYCTRPP-----PPPPHSPPPPQ--------FSPPPPEPYYYSS 588

Query: 224 ------------PPPVHSPPPPVYYYSSPPPP 242
                       PPP HSPPPP+Y Y SPPPP
Sbjct: 589 PPPPHSSPPPHSPPPPHSPPPPIYPYLSPPPP 594

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match: gi|700190951|gb|KGN46155.1| (hypothetical protein Csa_6G058200 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 362.8 bits (930), Expect = 4.5e-97
Identity = 220/257 (85.60%), Postives = 225/257 (87.55%), Query Frame = 1 

Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKK-- 68
           MGKMGSSMAP+L  AF+ALLSL+L STTNANY+YASPPPPKKV YPPPVYHSPPPPKK  
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60

Query: 69  --------------VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 128
                         VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPK
Sbjct: 61  YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPK 120

Query: 129 KVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPP 188
           KVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPPP
Sbjct: 121 KVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPP 180

Query: 189 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPP 242
           PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV+SPPP
Sbjct: 181 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPP 240

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match: gi|778722016|ref|XP_011658392.1| (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: extensin-1-like [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 298.5 bits (763), Expect = 1.1e-77
Identity = 203/250 (81.20%), Postives = 207/250 (82.80%), Query Frame = 1 

Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSL-SLLSTTNANYVYA-----SPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPK 71
           + +S   L  T    LLS  SLLSTT    +       SPPPPKKV YPPPVY SPPPPK
Sbjct: 25  LSTSSVSLSTTTQEGLLSTTSLLSTTTKEGILPPPXVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPK 84

Query: 72  KVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPP 131
           KVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPP
Sbjct: 85  KVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPP 144

Query: 132 PPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSP 191
           PPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSP
Sbjct: 145 PPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSP 204

Query: 192 PPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP------PPKKVYY--PPPV-HSPPPPVYY 244
           PPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP      PP  VY+  PPPV HSPPPPVYY
Sbjct: 205 PPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYY 264

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match: gi|659081816|ref|XP_008441528.1| (PREDICTED: extensin-1-like isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 243.4 bits (620), Expect = 4.0e-61
Identity = 164/236 (69.49%), Postives = 169/236 (71.61%), Query Frame = 1 

Query: 9   MGKMGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 68
           MGKMGSSMAP L  AF+ALLSL+L S+ NANY+YASPPPPKKV YPPPVYHSPPPPKKVY
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPHLFAAFVALLSLTLPSSANANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 60

Query: 69  YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKK 128
           YPPPVY                SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY       
Sbjct: 61  YPPPVYK---------------SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYK------ 120

Query: 129 VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKK 188
                   SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY  P    
Sbjct: 121 --------SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSP---- 180

Query: 189 VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPPPVYYYSS-PPPPHY 244
              PPPVY  P       PPPVY  PP      PP  HSPPPP+YYYSS PPPPHY
Sbjct: 181 ---PPPVYHSP-------PPPVYHSPP------PPVYHSPPPPIYYYSSPPPPPHY 187

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match: gi|297842453|ref|XP_002889108.1| (predicted protein [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata])

HSP 1 Score: 201.1 bits (510), Expect = 2.3e-48
Identity = 172/253 (67.98%), Postives = 177/253 (69.96%), Query Frame = 1 

Query: 12  MGSSMAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 71
           MGS MA  L  AF    SL+ +S T ANY Y+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 72  PVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKV 131
           PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K 
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKY 120

Query: 132 YYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY------SPPPPKKVYYPPPVY 191
           Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY      SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 121 YSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPSPPPPVKHYSPPPVY 180

Query: 192 -SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVH-SPPPPVYYYS- 244
            SPPPP K Y PPPVY S PPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPV+ SPPPPV +YS 
Sbjct: 181 KSPPPPVKHYSPPPVYKSAPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSP 240

[Close]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match: gi|21263615|sp|Q38913.2|EXTN1_ARATH (RecName: Full=Extensin-1; Short=AtExt1; Short=AtExt4; Flags: Precursor)

HSP 1 Score: 196.4 bits (498), Expect = 5.6e-47
Identity = 171/252 (67.86%), Postives = 175/252 (69.44%), Query Frame = 1 

Query: 16  MAPLLCTAFLALLSLSLLSTTNANYVYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY- 75
           MA  L  AF    SL+ +S T ANY Y+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 1   MASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYK 60

Query: 76  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY--------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPP 135
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y         PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPP
Sbjct: 61  SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPP 120

Query: 136 PKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY- 195
           P K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 121 PVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYK 180

Query: 196 SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVH-SPPPPVYYYS-- 244
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPV+ SPPPPV YYS  
Sbjct: 181 SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPP 240

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
EXTN1_ARATH3.5e-4967.86Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2[more]
EXTN3_ARATH2.4e-4262.36Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3[more]
LRX1_ARATH6.9e-3760.00Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX1 PE=1... [more]
LRX2_ARATH7.9e-2554.66Leucine-rich repeat extensin-like protein 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX2 PE=2... [more]
LRX3_ARATH8.7e-2453.30Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX3 PE=1... [more]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0K8S7_CUCSA3.2e-9785.60Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1[more]
D7KTY3_ARALL1.6e-4867.98Predicted protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_476851 PE=4 ... [more]
R0IMM6_9BRAS2.3e-3960.59Uncharacterized protein OS=Capsella rubella GN=CARUB_v10009850mg PE=4 SV=1[more]
A0A0D3D7I6_BRAOL8.8e-3959.93Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1[more]
A0A0D3CC16_BRAOL1.1e-3857.19Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1[more]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G21310.11.4e-4362.36 extensin 3[more]
AT1G12040.13.9e-3860.00 leucine-rich repeat/extensin 1[more]
AT1G76930.12.6e-3466.29 extensin 4[more]
AT1G62440.14.5e-2654.66 leucine-rich repeat/extensin 2[more]
AT4G13340.14.9e-2553.30 Leucine-rich repeat (LRR) family protein[more]
BLAST of Cp4.1LG01g21120 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|700190951|gb|KGN46155.1|4.5e-9785.60hypothetical protein Csa_6G058200 [Cucumis sativus][more]
gi|778722016|ref|XP_011658392.1|1.1e-7781.20PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: extensin-1-like [Cucumis sativus][more]
gi|659081816|ref|XP_008441528.1|4.0e-6169.49PREDICTED: extensin-1-like isoform X1 [Cucumis melo][more]
gi|297842453|ref|XP_002889108.1|2.3e-4867.98predicted protein [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata][more]
gi|21263615|sp|Q38913.2|EXTN1_ARATH5.6e-4767.86RecName: Full=Extensin-1; Short=AtExt1; Short=AtExt4; Flags: Precursor[more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG01g21120.1Cp4.1LG01g21120.1mRNA


Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
Cp4.1LG01g21120Carg01595Silver-seed gourdcarcpeB1158
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Cp4.1LG01g21120Cucurbita pepo (Zucchini)cpecpeB199
Cp4.1LG01g21120Cucurbita pepo (Zucchini)cpecpeB404
Cp4.1LG01g21120Cucumber (Gy14) v1cgycpeB0136
Cp4.1LG01g21120Cucurbita maxima (Rimu)cmacpeB318
Cp4.1LG01g21120Cucurbita maxima (Rimu)cmacpeB721
Cp4.1LG01g21120Cucurbita moschata (Rifu)cmocpeB014
Cp4.1LG01g21120Cucurbita moschata (Rifu)cmocpeB280
Cp4.1LG01g21120Cucurbita moschata (Rifu)cmocpeB673
Cp4.1LG01g21120Cucumber (Chinese Long) v2cpecuB473
Cp4.1LG01g21120Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cpelsiB338
Cp4.1LG01g21120Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cpelsiB382
Cp4.1LG01g21120Watermelon (Charleston Gray)cpewcgB415
Cp4.1LG01g21120Watermelon (97103) v1cpewmB393
Cp4.1LG01g21120Melon (DHL92) v3.5.1cpemeB401
Cp4.1LG01g21120Cucumber (Gy14) v2cgybcpeB943
Cp4.1LG01g21120Silver-seed gourdcarcpeB0096
Cp4.1LG01g21120Cucumber (Chinese Long) v3cpecucB0572
Cp4.1LG01g21120Cucumber (Chinese Long) v3cpecucB0584
Cp4.1LG01g21120Wax gourdcpewgoB0533