Cp4.1LG01g18670 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AATTAGAATAAAACTATGAATTAAAATTTAATGGTTTTGAAACAATAAGAATCAAATTGGTACTCTTGAAAAAGACTAATTTTATCTTTAATCAACGATATAATAAATGTCGGTATTCGACGGTGCATGTGGGAGGGAGGGTGGAAAAAGGAAGAAAGAGCTGAGGAGCAGATTATATAAAGAATCTGTAACCAGAATCCTAGTCGTTAAATTTGATGGAGAAAGAAACACAGTAGACTGCTCAATCTATTCATGGCGGAAGTAGAATTGCTGGAAATGTTTACAAACCGAGAGCTGGAAGAAGGAGCCATTGGTTCGTCTGATTGGAATCCAACTGATGCTGTGCTGTTCGTTGGACTGAGTTTGGTGCTTGGAATCGCTTGCAGACACTTGCTGCGAGGCACTAGAGTTCCTTATACAGTTGCCTTGCTTGTTCTTGGCATAATTCTTGGATCCATTGGTTGGTGACTCTTTTTTTCCATACATTTTCATGTTCTTCCTCATTTTCTGCTCATCGTTGTTTGCTTATTGTTGCTATCGTGTAGTTTAATAATCTTCAGTTTCCATAAAATTCGGGAAACTCAATCGTTTTTAGTTGGCGTTTATCAAGACATTTTACTTGTTTTACAGATCTCCTTTTATTGTATAATTTGTTTATGAATTTTGATTTCTACTTGAGTTCCGAACTCAACTGCTTTGAAGATGAAACGACGAGTTGTATTTTCTAGGAAAGAGTTGGAATAAGTTTGACCGGTTGGAAAAGAGTTCATCGTAGGAAAATTGACTCAAGTGAGTGGATTAACGGAAGAAGTTTAAATTCAAGTATGCGAACACAACAAGATTTATATAGCGGGAGTCGATGACTGAAATTGATTTAAAGGATATGATAGATGCCTAAAATCTGAAATTTGATATAAATATTGTTTGCAAGCGAACAATCTGTTGTTGACCCATTAATGCATTTCTGAATGGTCATTTGTCAACACTTCCTACCACTCACTCGAAGTTTTCTTTTCTCAAACTGTATTAATGAGCAGAATATGGCACACATCATCGATTGGGAAAGATAGGGGATGGCATCCGTCTATGTAAGTTTGTCTCTTCATTCTAGTAACTGTCACTGTATCATTAATTTTGAAGTGTATTCCCTTGAAGTATCAGTCGTAGCTGTTAAAACAGATTCGATGCTTCTAAATTTCAGGGGCAAAAATTGATCCTGATCTATTATTGGCTGTTTTCCTTCCTGCTCTGCTGTTTGAGAGTTCCTTTTCAATGGAAGTGCACCAAATAAAGGTTGATTCATGCTTTTCAAAACCATTATCCTGTTTTTAACTAAGCTTGGTGACAAGAGAGCTATAGTTATTTGGACTGATAACTTTATATAATTCTCACTTCCTTTAATTATTTTTGTAGAATGTGTTCTAGATGAACTTCTTGTCTTCTAAGAATTCCTGACTCTCTAGAGTGGTTCTAGTAGCACCTATATTAATCTGCCTTGATGTATCTGAAATATTGTGTACAAATTGGCCATCCAAATGGGTTAATGACAGTTTTAAACTTTCTTTTAAGGGCAACTGAACCGCTACCTTAGTTCAATGATTGCTTACTCATCTAACATAACAATTAATAGCTTCTATCAGCAGAAACAACACCTTACACATTAAAATGATGTGATGCCCCCACATTAGTTCTACAACACGCACTCTCATATACAAAAAGAAAAGAACTTGCCCTTGAGTTATTTTTTATGAACTATTTGCTAAATATATTTTTGGTGCAGAGGTGTCTGGCCCAAATGATCTTATTAGCTGGTCCAGGTGTTTTAATTTCAACGTTCTTGCTTGGATCTGCTTTCAAGGTAATACCAGACTATCAATTCAGATAGTAAGGATATTTTATGACATTAATTTTTTATGCTTTACTGCAGCTCACTTTCCCATATAATTGGAATTGGAAAACATCATTGTTGCTTGGGGGACTTCTGAGTGCCACAGATCCTGTGGCTGTAGTAGCTCTAATGAAAGAGCTAGGAGCAAGTAAAAAACTGAATACGATAATAGAAGGAGAATCCTTGATGAATGATGGGTATTAGTTTGAATTATTTTTCAACATCAATCGTTTAAATCATCTCTCTTTCAAACAAGTTGTTATATTATTAGGTTTGACTAGACTAAACATTTCAACTATTCATTATTCTGATCCTATTTTATAATACTCAGGACAGCAATTGTGGTTTATCAACTTTTTTATCAAATGGTCCTTGGAAAGAGCTTTAATTGGGGAGCTATAATCAAATATCTCACACAAGTCTCGCTGGGGGCGTATGTACCATTTTTTGTCCTTATTTTATTTGTGCATTAGGCCAGCTAATTTTTCGGAACAATATGCTTATTCAAATTTTGGTGCTGAGGTGTATGGCCCAAATGATCAGTTGGTTTAGGTGTTTTGATTTCAAGCTTCTTATTATCATTTTCCTTCTTATTCTAGTTGATCATTTGAGCCAGAACCAGTTTATCGACTTTATAATGAGATGGTCTTTGTAATCATGTTTGCCTGGTGTTTTAATGATCAGTTTGGGAATTGGTCTTGCATTTGGGATTGCATCTGTTTTATGGCTCGGGTTCATTTTCAACGACACAGTGATAGAGATTGCATTAACACTTGCTGTGAGCTATATTGCTTATTTCACTGTATGTGACTCTCTCACTCTCTTTTATGTTTATACTTGTATCAATACTGAATGATGTATCTGTTAATTAGTCTAGGCACGAATACAAATTAATACTGTTATTTGAAAGGAATTGTATATGGCTTTAGAAGTATTTTTAATTAGTTCTCAATGTATTGTGTTTAAGAAAACCCTGATTGGTGAATGGTTTGGCATTCTCTAATGGAGGAAGACTCCCTATCGCACAAGGTAACTGATAAAAGGAATGGCAATGTTCCTCCTGGCTGGTTTACTCTGAAACAATGTACAAAAATGAGTAGATGCATGAGGATGCTTATTTCAAGCTTCTATAATCAAGTCAATCAGATGTTTGCTTTGATATGGGTAAAGGAGAATGTATGAATTTTCAGGCTGACTTGTGAGTTGCCTACTCGCTGCTTCGCACTAATTTCCTTGACCTCTTTTGTTGGACCTTCAAACTGTTGTCAAGGAGATCAAAGATGAGTTTGAGTGTGGGACTGGCATTTGACAACCTTTAGAACTTGAAATTGGGAATGAGCTGAAATTTTGGCTTTACTGAAAAATGTTTGATCCCAACAAGCAAACAGATAATTGACTGTGGGTAGGGTGCTTTGGTGTGTCGTCCTCATAGTCTTATATTCTCCATGCTTACTACCGAGGACAATATTGTATAAAACCAATTGCGTGCTGGATACTTGGAGGGACTGGAATCATAGTCTACAGAAATCTTTTAAGCATACAAATTCCTATAAGGAATGAAAAAGAGAATTAAAAACAGAAACATTCTAAGCATGGGATATAAAGACTCCCCAATTAATACTAATATTATTGAAACAGAAATGCTTGTGCTTGGGTAAGGTGAACCGCTCTTCTCAACTTCTTAGTTAAACCATCAAACTCCTTGATTACGCTCTCTTGACTTCAAAAACCCAAACCAAGAGCACCCTCGGGAACAAAGCAAGCCTCTATAGAAGCTGGAAGTATTTTCTAAAGCAGAGATAAGGCCACTTTTGAGCATAATCCAAATAAGAATACTGATCTTCTTAGGGCTCTTTGATTTCCTTATAGCTTCAAACTACTCTGAGAAATCCTTCCGAAGTTTTAACAGCTGAAACATCAATTATCCAACCCCATGAAAATTTGAAACGCTCAACCCACTGCTTCCAAATTAGCCGACAATGATGTAAACACATCAATTCCAGTATCCTACAAATTATTCTAGTACCAATCTACCAATGAAGGAAACCAGCACCCCAGTGGTTGAAAACAAAAGAAAAAGACAAGGGATCCATCCTGAGCAGATTTGGAAAGCATATTTTGAAAGGAAAAGCTTACCAAAATAATTTATGCTTTCCATGCCAAGCTTCAAAGAAGTAATCTCTCCCAACCTCCGTTGTCTAGGTATATTGACCCAAGGATGTCAAAAACAAAGAATTTTCTTTCCTATTGTATGGCAATCTTATGCCAAGCAGATTTGACTAGGCCGTACTCTCCCCCCTTGTATTCCATGAAATTATCTTCATGTCTCCAAATTATTAGCGTGAAAAAAGGGAACAAACTTGGTCAAATCATAGCCTATCAAGTTCACGGAATCATTGGATCGCATTTAATACTTTTGGGCTTAATTTCGAATAAAGAAATCCCAACTTCCTCAAAGTATTTCAAGAAATCCCAACTTCCTCAAAGTATTTCAAGAAATCCATACGGTTAGAATCAGTGACGGGCATCGAACTCCTCAATAGATTTTAAAGTTGATCCTTGATGAGCCAATCTTGAAACTAGGACCATTAATATTAAGATTAAGCTCATTGTGAGGAGCCTCTAAACTAGGTGCTGTAATAACTTCATTTGATAGTGTCATAAATTCCAAATTTTAATGCATCTTCAATATTCCCAAAGCTTAGCTCTTTAGTTTCCTAGTAATTTCTCTCTGATTCAATGCTACTCTTGCTGAAATCAGAAACATTGCTGAAATCAAAATTTATTATTGTAGACATGAGATCCTTTTGGTTGGGTTGGTGCCTCATCTTCCCCTCCCTTTTTTATTTTTCTTTTTCGGTTTCTTCAATACCTCATTCTACCGTGACTGATTAATTAATTATAGTTTTATTATTTTTTTTTTTTATAAAGATAATCAACACATCATACTATTGAAGGAGTGTTTGTTCTTTGTGATTCTATTGATCTTTCTCTCTTCTCTTTCTTCTTTCTTCTTTTAACAAATTAACATTTATAACCAAACTGTTATCAACATTATTTTTAGTAGTAATATTTGAACTTGGTTCTTTTCAATCATTTATTTATT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MRDLRVLVVEGSVMTMYIQGETIEIPRHSIGFLLEGFVKSPGIQEELIASPAVLFSSHGNQSFHIMENSGMSGSSFSHQGSSYEVTTRARVIIFDMAALQSNNILNQSSSSADHLQRSPSRDHSGLMSWPQLLSAPRPPQKQKSEKTERPAESLSAKAMQLSIYGSMVDTRQRTKSFPGNVVEPSLSRSNPSIASYRCAPLPYVKSEGAATMRNRLDARKLPTSTARPPQEKSAQNETNARDDSSEESGAEDDGVVVRIDSPSVLSFHQVP
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. Swiss-Prot
Match: NHX7_ARATH (Sodium/hydrogen exchanger 7 OS=Arabidopsis thaliana GN=NHX7 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 160.6 bits (405), Expect = 2.4e-38 Identity = 122/280 (43.57%), Postives = 167/280 (59.64%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KJ31_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_5G098980 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 394.4 bits (1012), Expect = 1.1e-106 Identity = 215/274 (78.47%), Postives = 233/274 (85.04%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. TrEMBL
Match: H9DVC6_CUCSA (Plasmalemma Na+/H+ antiporter OS=Cucumis sativus GN=sos1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 394.4 bits (1012), Expect = 1.1e-106 Identity = 215/274 (78.47%), Postives = 233/274 (85.04%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. TrEMBL
Match: A0A0U2K9U2_MORAL (Sodium/hydrogen exchanger 7 (Fragment) OS=Morus alba var. atropurpurea PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 238.8 bits (608), Expect = 7.7e-60 Identity = 147/275 (53.45%), Postives = 184/275 (66.91%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. TrEMBL
Match: U5G5K6_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0008s14030g PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 230.7 bits (587), Expect = 2.1e-57 Identity = 147/271 (54.24%), Postives = 180/271 (66.42%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. TrEMBL
Match: Q19N58_POPEU (Na+/H+ antiporter OS=Populus euphratica GN=sos1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 229.6 bits (584), Expect = 4.7e-57 Identity = 143/271 (52.77%), Postives = 178/271 (65.68%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. TAIR10
Match: AT2G01980.1 (AT2G01980.1 sodium proton exchanger, putative (NHX7) (SOS1)) HSP 1 Score: 160.6 bits (405), Expect = 1.3e-39 Identity = 122/280 (43.57%), Postives = 167/280 (59.64%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. NCBI nr
Match: gi|700194568|gb|KGN49745.1| (hypothetical protein Csa_5G098980 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 394.4 bits (1012), Expect = 1.6e-106 Identity = 215/274 (78.47%), Postives = 233/274 (85.04%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. NCBI nr
Match: gi|659072706|ref|XP_008466844.1| (PREDICTED: sodium/hydrogen exchanger 8 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 394.4 bits (1012), Expect = 1.6e-106 Identity = 219/274 (79.93%), Postives = 234/274 (85.40%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. NCBI nr
Match: gi|793418733|ref|NP_001292661.1| (son of sevenless homolog 1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 394.4 bits (1012), Expect = 1.6e-106 Identity = 215/274 (78.47%), Postives = 233/274 (85.04%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. NCBI nr
Match: gi|951871430|gb|ALN94994.1| (sodium/hydrogen exchanger 7, partial [Morus alba var. atropurpurea]) HSP 1 Score: 238.8 bits (608), Expect = 1.1e-59 Identity = 147/275 (53.45%), Postives = 184/275 (66.91%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g18670 vs. NCBI nr
Match: gi|764578825|ref|XP_011463507.1| (PREDICTED: sodium/hydrogen exchanger 7 isoform X3 [Fragaria vesca subsp. vesca]) HSP 1 Score: 235.7 bits (600), Expect = 9.3e-59 Identity = 150/284 (52.82%), Postives = 189/284 (66.55%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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