Cp4.1LG01g17450 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGGATTGCACAATTAGATCTTGTGACTTTGACTCAGAGCAAACTTGTGTCTTGCATTCTCCTGAAAAGAAGATGGAACAGATTTCCTCTAATACAGAAGTACATCTTGCTTTGACACCCCTACAACCTGTTGTGTTTTTTGGATTCCACAAAAGAATGAGCGTGACAGGTCAGCTACTATCAATTAATAAATTTTCATATTCTTTGGGATTATGCCTTTTTATCTTGTTAAGACTCATTGCCTGTGTAACTGTCGAATATTTGTTGCTACATGGTAGTTGTTGGGACGGTTGAAGGGGGTAGGACACCAACAAAAATTAAGACTGACTTGAAGAAACCTATTGTGAATCTTGCATGCCATCCTCGCCTACCTCTATTGGTAATATTTGTATCCTTCACTAAGTTTTAAATATCTTCTTCTTTTGTCTTATATGATACTCTAAGGTTCTGTTCTTCTTTCCCATACAGTATGTTGCTTATGCTGATGGTTTGATTCGAGCATATAACATTCATACTTACGCTGTTCATTATACTCTGCAACGTGAGATGATAGTAGATTTTTCCTTTTTTCTTTGTTAGTATGGTGCATATTGTATTTATGAAAGTAACAAATGTTTTAATGTCGTTTTGCACTCAGTTGACAACACTATAAAACTCATTGGTGCTGGAGCATTTGCATTTCATCCAACGCTGGAGTGGATTTTTGTTGGTGACCGTAGGGGTACACTTTTGGCTTGGGACGTTTCAACTGATAAACCTAGTATGATTGGAATGTAAGTCATTATGTTTACATGTTCCATTTGCATGATTTACATGCCAACAAATTGATTAGATTTGGCCATCTTCTGGTGCATCAATAAGAAGTAGCTTATTTATTCTTGACATTATTGCTAGCGACATATTTAAATTGGTACTCTAGAAGTTCTAACTCTAAGTAGTTACAATATTACTTGATCCTAAAGGAGTTTGTTATGTTTAGTGAACATAGTTCTAATTCCCTGAATATCTTAACTGTATCATTGTTGGATCTTTAGCTTGGTTCTGCCATTAAGCATAACTCTGGGGGTTCTGACAGGATTGCTCATCTCTGCATCTTGTAAGGGTTTAATGGGGCATGTGCAGTTTTAAGTACTAGATATCAAAGAAGTTCACGTTCTAACAATCCAACTAGAACTTTCTAAGACCTCTAAGGGGTCATTACTACTACATGCATGATACAGAAAATTTCAAGAATAATTTAACTTTCTAAGACCTCTAGGGGGTCATTACTACCCTCCTCATAGTTAGGTTGTGACATTCTTCCCACTTAAACTAGTCATCGTCCTCGATGACTTACTTGGGGGATAATCATTCTGTGGATTGTGACACTATGCAGTGACGGACATGCAACATGAAGTGGATGACTCTAACGAGTGGGACTTAAAACTGATTATTATGTAAATGTTTTGTTATGGTCATCTTAGTGGACAATTAACCTCATCCTACAATAGCCTCTCCCAACTATTCGGTATAGCAAACTCCTCTATAGACTTACCCCAACTGATGGTTAGTTGACATCCAGTTAGTGGAGCAGAGCCTCAGTGTACTAGGTTACTAGATATGAATTGTAAATCTGTGTTGTTCATAAATTCTGGTAAATGTGGGATGCACACATCAGTTATGGTTGGAGGGGTAGTTGCCACCGACTATCATATCAATCATGCTATAAGTGAGATCCCACTACATACTCATCATGTTAAATTATGAAACTTTCATAAACATCATTTATAAAATCCTCATCCATCATCACATAAAAGACACTCAAGCTATCATACAAAACTGCTGGGCAAAAAAATATTTTTTCTATTGTATAAAAACGGTTTGACAAGGTGAAATATATTATTAAAAGAATCCCAATCTAGCTCTTAAGTGTTTCTAGTAGAATCTCAATCTAGCACTTAGTGTTTTAAAGTCATTTGGCCGATCGGCAATTCAAGGTAAAAAAAATCACAGTTGGCTCAACCAAATATTCTCAGATCAACCTAAAATAAATTTCGGAAATTAAACTCAGTTACAACCCTTATTGGAAATGATTAAAACAAATCCTTGCCCACTGATTTTCGCTAAAAAAAAAACTAGATTGCAAGTGATGATTCTATTTCGCCCAAATTAATTTTTCAAGAGAAGCAAAATACTTGCATTTAAATTTCTCAAGGGAAAGGGTTGCAAGGTGTCACAACTTGATTTTTGAGCTACTCCAAACATGGATCGCGATGTGGACTAACGTGGAAGAGTTCTGAAGATATGGTAAAATTTTTCGCTTTTAAAAAGAGGAAGACGCTGAACATTGAAAACATAATAAAAACATACAAAAGTACATACATATATATTTGAGTTTAAATACAAAAGAGGGAACGATACTTAAAAGACAAGACTGGGACAAAAGTGTACAAAAATCAGAGGAGACATTCTAACCTAGACTATCTATGGCCTCTTGCTCTAGACCGCTCTCGCCTCGACCAACATCTAGTCATTATCTAAAAAACAGTAAAGAACTAGAGTGAGTATAAAATACTCCATAAGTTGCCTACTTGTAAGCTCTTAAGTGTGGAATTGAGATTCCACACTCTAACATGATGATAAGGCATATATGTAAAGGTTTTGATCTGGGATTCTAAGTCTTGAGGCCTTGACCAGTTTTATGGCTAAGTTTTGGCTTATGTACTTATGTGGTCCCTCGTCCCTTTCAAGACGGGTTTAAGGAGAGTGGATCCGATTAGGCTGTCCACTTCCTTTTCTACACACAATACAAAGCGGAAGTCCTGAACTTTTGATAGACTGCTAGGTCATATGGCTGGTACTAACATCATGAACATAGTAAAAACTATATCTAAGGTTCAAATTAGGATTCAGAATCGGATTCGGCTCTTAACTGCCCTGACATTCGCCTTCATCCCCTTGACATGGTCTAATGCTCAAAGAAAACAAAGATATCCTATCCTAATCGATGTTTTGGGGAGAAGCCACTTTTAATTTTCCAGGTTGTATAAATAAAGTTGTTACTTTACCTAGCCCTTCTATAGCTAGAGTCTCAACTAGCACTCAGACTACAGTAATTTGAATGTTCATCTTTGCTTGAAATGCTGGATCCATTGGGTTTTTTTTTAGTCTCTTCAAGAGTAGATGTCATTTATTGCATTAATCACTTTAAGTAGTTTTCCTTTTAAACCTTGGAAAATATCATAACAGTCTTCTTTTTCATTGGAATTTCAGTACGCAAGTAGGTTCTCAGCCAATTACTTCAGTTGCTTGGTTACCAATGTTGCGGTTACTTGTAAGTCTCTCCAAGGATGGTAACCTCCAAGTTTGGAAAACACGAGTCATTCTGAATCCAAATAGACCTCCCACGCAAGCAAATTTTTTTGAGCCTGCAGGTGATATTATTGAATGATTTCAACAGAAATCTATTATTAGGATACATATTGTTGATTTGTTGAATTAATATTGGTTTTTTGTTGAGGTCTTCCCTTGTGGAAGTCAATTACTGACGTGAGTTCTTATTATTTTTTAATATAAGCAGTTGGGCTTTTTTCTTTAATACTTTTTGTTTATTATTCGATAGAAGAGTTGACTAAAGTTTTTCTGGTGCTCTATGCATTTTTTAAAACATTTAAAGTTTTTTGGTATGAATATTCTTATTCCATCTTTGTTGTTTCTTTACTTGATTCTTCCCTTGGTGGAAGTTGTATGGCTTATGGTATGCTCATTTTGCCTCTAGTAATCGATATCGATTGTTTTGATTGTGACAATCATTAGTTTGTTTATTATCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTATTGTGCTTTTTGCCCAAAGTGTCCGTGATCGATCAATTTTGGAACAAGAAACAAATTTTTCATTAATGCCTAAAAGAAACAAAAATTGATTAAAAAAAAAAATCTCGTTGGGTGAGAAGAAAGCAGAAAAATGAAACTTACAAGGGAATATGAAGACAACCCAATCAAGACAATTATCATTCCTTTTTATGTATTTGTTGTACTAACTGTTTTAATTTTCTTATATTTATGTATGTTTTGGCAGTGATTGAATCAATCGATATACCTCGCATCCTTTCCCAGAAGGGTGGAGAAGCAGTTTATCCCCTACCGAGGATCAAAGCATTAGAAGTTCACCCTAAACTCAATTTAGCAGCATTGCTGTTTGCAGTTATGTGAATTGATGGTATAGAGTCTTAATTGTTTGTTAGTTTTCAGAAAGATTCACATTTTTTGGTTGACAGAATGTGTCAGGTGCTGATACTGTAAAAAATAGGGCTGCATACACAAGGGAAGGACGAAAACAACTATTTGCAGTTCTGCAAAGTGCAAGAGGATCTTCTGGTAATCGGACTCCTTACTGAGCAAACTTTGGGCCATATGCTTTCAGTTGGGTTCTCATGGTGTAAATATTTTGCTCCTTTCAAATCTTGCATTCTCTCTTTTCTTTGGCCAATTGGTAACTTCCACTTGGCTCGGAATTTGCCTATATTCCCCTCATTTTTATAATTTCATATCTTCTATAAAATGCATTGTGTTCCTTATTAAAATAGTAATAATAAACAAGTGTGTTGATCCTTATCGTACTCTTGAAAGGCTTCCTAATCCTGGCCTAACTTTCCCAATGATTTGTAGATCTCCTTAAGGGAAGTTGTTAGTAGGTTGACATTATTTTAAAAATGCTCTAACTACCTTGACCAATTGTAATTAGTTTACTGTGGTGTACTTCCTGTTTGCAGATCCAAAATTAGGTTAATGAAATGATATGCACACCTTTTCTAATTGATGTTATATTGCCTTTTGTCACGCCCGCACAATTTGACGTTCCCATAAATCATAGAAGCTTTCTTCTTTTTGTAAGCGTGCCATCTTCTACACGTCATGTCCAACTTATTGTTGTTTGGCTATTACAGCTTCTGTTTTGAAAGAAAAGCTTTCATCCTTGGGTGCATC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BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. TrEMBL
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BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. TrEMBL
Match: M5VVS1_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa000161mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1299.3 bits (3361), Expect = 0.0e+00 Identity = 689/874 (78.83%), Postives = 743/874 (85.01%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. TrEMBL
Match: B9S8J3_RICCO (Nucleotide binding protein, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_0601590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1279.6 bits (3310), Expect = 0.0e+00 Identity = 685/872 (78.56%), Postives = 743/872 (85.21%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. TrEMBL
Match: V4SPP0_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10024690mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1277.3 bits (3304), Expect = 0.0e+00 Identity = 678/873 (77.66%), Postives = 742/873 (84.99%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. TrEMBL
Match: A0A067GHV4_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g000346mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1275.0 bits (3298), Expect = 0.0e+00 Identity = 676/874 (77.35%), Postives = 740/874 (84.67%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. TAIR10
Match: AT3G50590.1 (AT3G50590.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein) HSP 1 Score: 1148.3 bits (2969), Expect = 0.0e+00 Identity = 620/874 (70.94%), Postives = 702/874 (80.32%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. NCBI nr
Match: gi|659115939|ref|XP_008457818.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497411 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1551.2 bits (4015), Expect = 0.0e+00 Identity = 790/865 (91.33%), Postives = 821/865 (94.91%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. NCBI nr
Match: gi|778670027|ref|XP_011649345.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101204486 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1525.8 bits (3949), Expect = 0.0e+00 Identity = 781/865 (90.29%), Postives = 814/865 (94.10%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. NCBI nr
Match: gi|595818154|ref|XP_007204305.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa000161mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 1299.3 bits (3361), Expect = 0.0e+00 Identity = 689/874 (78.83%), Postives = 743/874 (85.01%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. NCBI nr
Match: gi|645272695|ref|XP_008241519.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103339937 [Prunus mume]) HSP 1 Score: 1290.0 bits (3337), Expect = 0.0e+00 Identity = 685/872 (78.56%), Postives = 737/872 (84.52%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g17450 vs. NCBI nr
Match: gi|658006273|ref|XP_008338291.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103401355 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 1287.7 bits (3331), Expect = 0.0e+00 Identity = 681/872 (78.10%), Postives = 744/872 (85.32%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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