Cp4.1LG01g16970 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
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Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGGTGATTTGTTCCTTGCATTCAATGCACGTGAAAAAGGAATAAGGGGTAAAGAAAAACCAAGTTTGATTAGTATAAAAGACTACATATGGGGTTGAGGTTTGTTCATCTTCAATCTTTCCTTACAAACAAATATAACATTGGTATAGCAATGTTTATTCCAACCCTTCAAGCTTCCATGGCTAAGTATGAAGCAAGTGAGATGATGAAGAAGTATCCTAGAAATGGGGATGATGTTCAACTAAAATCTTTTATTGTTCGAGATTCAACTCAAGTCAACGATCAAGGCAAGATATCGAAAATCCAAAAAGATAACAAGAATGTTGTGCTCAAGCTTAGTTCAAATACTCACCCAAAGACATTTAAGTTGCAATTTAGTCGAGAGCAGATGAAGGAGATCTTTAGATATCATGATAGCGACAAAGATGGTTTTCTCAATCTAAGGGAGCTAACAAAAGCTTTTGCTTTTCTAGGCTCAATTATTCCATTTGAGAAAGCTTCCTATGGCATGACATATGCTGATGCAAATAAAGATGGCCTTATCAGCGAGGCTGAACTTGACAAACTCGTTGATTATGCCTAGAAATTTATTAAGAAAAAATGAGCTTTTAGACTACATTCCTTTGCATTTCATGTATGATAAGTAATTATCTTGTATGATAAAAAAAAATAATAATAATAAAAATAAAAATAAAAATAAAGGTACATTTGAAATAAAGAATTTATTTTCTTTTTATTTTAGCAATTTTCACTCTAAAATTGTTTGTACTTGGAACGATGCTTAAAATCAAGTAAATCTAAAGAGGTGGTATACTGCATTTAGTTTGTCCTTAGCAAAAATACCATAACTGATGTGTTTCATTCCAAAGGAGTATGCATTAATATTGTTGGTGGATATCCTAAGACAACTCTCCGGTTGAAAGTAAGCATCAAAACTTGCATAATATTGATTATGCTTTTGTTTCTTTCAATCGTGCTTGTCTATTCAATTATGGTATGAAGAATGTGCTTTGGAAGCTACCTTCTAAATTAACCTTACTCGTTTCCTTGTTCTTGATTAAAAGACATCATTCTCACCTATTAATGGTACAAATTTATTGTGATTCTCTTAGCCCTTTTTTGTAATTTTGTTCCCATTGATAACAAAATCTTTTTTGTAATTTTGTTTCTATTGATAACAAAATCTTCAAAAACTTTGCTTTAAGTCACCCTACAAACTGCTTAGTGTTACCCTTGTGAGCATTACACTCTACTTAATATATTTATAACCATTCTTGATTTCTACTAATCTAAAATTGTTACTATCATCTTAATCTAAGATCGTATGCGAAATTTAAGTCTTAAAATACCATCGTCAAATCATAACTTCATTGTAAAACATAATATAGTCATTGAAAAACACTATCATAGTCTTAAATGTTCGAAAACATAATTTAGAAACAAATCAAAAACAATAATAATAAATAATTTAAATCATGAAATGCATAACCTATTCGAACATAAGTCTAAGAATTAAAAAAAATGCTACTAGCCTATGCACATGTCATGGTCTCAGATTGCGATGACGTCGTCAGTCGTACAAGTGTGCCTTGCCTTTACCAGAAAATGATGTAGCACACTGCCTGAGTATTTCGAAGAATATTGAGTAAGTGACCCCACTATAGGGGCCGTGATATTGCAAACACATGCAAGCCATGCTGTAGGGATTTATCATTAAAAACATCATAGGGGTGGCCTCCAGTCAAAAATAAAATAGATGTTTAGTACTTTCCTATACACGACCCACACGTGCGAGCGTGAATCCCCAGGCGGTTCGCACCCCCCTGGACCCATCATAATCGAGCTAGCTGTCCGTAGCGACTTCTGGATGTCAGCATACCCCAAAGTGTCATGTGCAGCATGATGATCATCATCATCGTAATGTACGCGTCCATACTCATCATCGTAAAAGGGAAGTAGTCCGATGTTTATGTACACAGAGAATGCATGAGGTCTCTATGGTTTCTCATCTTTAAAACGTCTTTATGACGCAATCCTAATTCCATCGTTATGTTACGGTGAGTAATATATGTACATTAATCTTCATACTTTCATCATCATTGACATTAACAATGGTTGTGGGTTACTCTTGGGGCATAGTTTGGCTTGGAGTAGGTCCCTATTGTGTCTTAGTCTCAGGGACCTGAACAAGAGGTTGGGTCATTCCTACTTCGGGTGCTCCTTCCGTAGAATTTTCGGAAGCTAGCCTCTAGCTTTGGCTTCTTGTAGCAGTCCCCTTCTTAGGTGCCATGTCCCTGACTTCTCCGGTAAGAACACAAAATATAGTAAATTAAGGACCGAATTAGTCCATGGCCCTCACTCCAAGTTTGCTCCCATTCACGATCAGCTCCTAGTTACCTGAAAAAAAATGAGCCTACTAGCATATTCGCCTTGAAAACTTTTCCAAAGTAACCCTTAATTAGCCTACTGGTAGGCTCTTAATCGTGACCTTGAGTTAGGATATGACTTCTTGTTACATTTTAAAGAACTAAAACTTAGAGGTTATCATGTTAGTGCCTCGTATATTCGCCTTCAAAACTTTTCCAAAGTAACCCTTAATTTTTTTTTCTCCCAATGAGCGCATAAGTGGTGTGGACATAATTGTTGCATCCTGCTAGCAAATCGTGATGTAGGACATCTCATTTAGTGTGGGGGAAATGGTAGGTCCACCATAGCATGATACATATTGCAGGGCATCTCACCTATAGAGGAATAGAGGCCTCGTGGTGCTCCTCGTAACGGGAGACAAATGGTTATTTTAGGCATGGATCCTAGCAAAATGTTAAGTATGTTATTCACATAGTCTTAGGTGTTTTCTTGGAATTTTGATGAACCTAGGTTATGCATAACATTGTGGGTTAGGCTTGGAACTCTAAGGGTCTTCCTTAGGAATAGCCTACCGTGATCATGTGAGCGTAGAATCTTATTAGCGATTCAGGGTACATGTGGGCATGGGTACCTCATTTAGTTATTCTAAGAGGTAGAGTCATACCGGTCGTTATGGATGTTTTTCCCATCCCTTGGTTCTGCTACTTAAATTTTTCCAACGACTTCCAAACTTAACTACCTTCTCTTACATCCTTAGATAGGGATTCATACACAATTTCATAATATTAGGAGGTCATTTAAATCTAGGTAGTGATCCTTAGGGGCATTATGGTCATTTTACATTATGTCTTTGTTTACCAACTTATTCTTATCCAATAACCACAAAATTAAAGATATACCCTCATCATGCTATATTAAGCTAAGCATTAAAATTTTGTAAGGAGCAGAGTTCATTTAATAGGTTATTTTAATGTTACTTAAATCCCAAGCAATTTGATTGGTTCAAGACTTAACTCATGGTTCTTTGTGTTTTCCTTTCATATATCCTTAATTTATACTATTTTTAGGGTTCAACTGAAAATACAACAGATTCCTACAAGTATTTCTTAAGAAAAGTCCAAGGTAGCTACTTACATCTCGTCTGGTGTTCGGGACCCTGTTTCATGAACTTTCGAAACTCATTTTCTTCCTTAATTTATACTATTGTATGATTACTTGAACTATATGTAGAGACATAAGAGTGGATCAAGTTCAAGTATATAGTCAAAATGATCTATAGTACAGGGATAAGGCTGAGTACCTTATTCTGGGGACACTATGGATGCGGCCCACTTTTGTATATGATATAAAAAATGTAATCACTAAATTGTACATGTGGAGACATGTGAGTGGGGGCGTCCTATGCAATGAGTATTGCATAAGATCGGACCATGAAGAAAACCACTCTCACTTTATAATGCCATTTACTGTTGAGACTGATTTTTTTATTCAATGACCTAGGTAACTTCATCTTAATCCTGAGCTAACTATGAACTCCTATTTATCCGAAATTATCCTTAAAGTTGTATGGGTGAGAGTGGCCAAAGTTCGCAGACTCAATAAGCCTCCCATTTCAAGACTAAGACTGGGTGAATAGTTGGGAACATAGGGTGTAAGATGGAATTCACTCCTACCCGCTTTTATGGATAGTAGAGAGGTTGTTCCCTTAAATACTGACTCTAAGTCTTGAACAAGGGGCCCCACCCTCTCATTGGCCTGAGAGGGATTCGATTTGGTGGTTGGACCACAAACCAATTGTTGAGGATCAGTGGGACTTAAGGAACAAAAAATAACTTTAGAGGTAAAACGGTAAATCGACCCAACTCTAGTTACGAACAACCTGTGAAGGATTAACTTACTAATCATGGTTATATCAAATGGGCAGAAATATATCTATAGTGAGGGGAGTGCAACTACTAGGCTATAGTGGAGTGTCCTAGTAGTTAACGAATATTGGTTAACAAGGTTAATGAGATTAGTCGGTTAATCTCGAATCGTTGGAGTCCATGATCTATAGGTCCATTAGGTCTCTCTGCTAACTCATATCGAACAAAACCTTAGAACAGTGTGACAAGTGAGTTCGAAGTGTTCAAATTCAAATTAGTGAATACACGCTAAATATATACGATATACTTAACAGCATTTTGTTTTAATTATGAATGGAATAGAAAGAGTGAATGGGAGATATTTAAATAAGATTTAAATATTTTAGTTGTGAATAGTGATTCATAATCAATATGTGCGGAAATTGGTTGGGATTGACATTTTATTTAATGTTAAATATTAATTAAATTGTTTAATTAATCATTTAATATTATTTTGATTTCAAACTAATTATTTAAATTAATTGTTAGAATTAAAATAAAGAAAGTCAAAAGTTGATTTCACCTAATGGAAAAATTCATGTCTCAGTTAGTGGAATATTGAGTGTCAATATATGGTTTAACCAAACTTGCATGTTTGCACATAATCCCACAAATTTTGGTGGAATTTTGAGTGTTAAAATTTGGTTAACTCAAACTTGCATGCTTGCACATAATCGCACAAATTTGAGTTGAATTTTGAGTGTTAAAATTTGGTAATCT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MKYKRLHMGLRFVHLQSFLTNKYNIGIAMFIPTLQASMAKYEASEMMKKYPRNGDDVQLKSFIVRDSTQVNDQGKISKIQKDNKNVVLKLSSNTHPKTFKLQFSREQMKEIFRYHDSDKDGFLNLRELTKAFAFLGSIIPFEKASYGMTYADANKDGLISEAELDKLYEASEMIKKNTRNGGNVQLKTFNGIARASTQVNNQGMVPEILRDNKNVGPKFSSNTHLKASNMQFSREQMKKIFRYHDSDKDEMFIPKLQASLAKYEASEMIKKNTRNGGNVQLKTFNGIARASTQVNNQGMVPEILRDNKNVGPKFSSNTHLKASNMQFSREQMKKIFRYHDSDKDGFLNIRELTKAFAFLGSIIPFGKASYGMTYADANKDGLISEVELDKLYEESEMIKKYTTNGDDVQLKASSGNARGSTQVSNQGKTSKLQFSREQMKEIFKYHDSDKNGFLNIRELTKAFAFLGSIVPFEKASYDMTYADANKNGLISEAELDKLIDYAQKI
BLAST of Cp4.1LG01g16970 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KLF3_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_5G067670 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 2.2e-36 Identity = 96/173 (55.49%), Postives = 113/173 (65.32%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g16970 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KIY4_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_5G068170 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 1.6e-34 Identity = 89/167 (53.29%), Postives = 111/167 (66.47%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g16970 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KMQ1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_5G067410 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 153.7 bits (387), Expect = 6.1e-34 Identity = 89/170 (52.35%), Postives = 114/170 (67.06%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g16970 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LRC8_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G359950 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 138.7 bits (348), Expect = 2.0e-29 Identity = 86/171 (50.29%), Postives = 115/171 (67.25%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g16970 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LKX1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G359940 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 99.4 bits (246), Expect = 1.4e-17 Identity = 50/84 (59.52%), Postives = 57/84 (67.86%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g16970 vs. NCBI nr
Match: gi|700194512|gb|KGN49689.1| (hypothetical protein Csa_5G067670 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 3.2e-36 Identity = 96/173 (55.49%), Postives = 113/173 (65.32%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g16970 vs. NCBI nr
Match: gi|700194513|gb|KGN49690.1| (hypothetical protein Csa_5G068170 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 2.3e-34 Identity = 89/167 (53.29%), Postives = 111/167 (66.47%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g16970 vs. NCBI nr
Match: gi|700194510|gb|KGN49687.1| (hypothetical protein Csa_5G067410 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 153.7 bits (387), Expect = 8.7e-34 Identity = 89/170 (52.35%), Postives = 114/170 (67.06%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g16970 vs. NCBI nr
Match: gi|449470190|ref|XP_004152801.1| (PREDICTED: probable calcium-binding protein CML11 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 138.7 bits (348), Expect = 2.9e-29 Identity = 86/171 (50.29%), Postives = 115/171 (67.25%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG01g16970 vs. NCBI nr
Match: gi|449470198|ref|XP_004152805.1| (PREDICTED: probable calcium-binding protein CML10 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 136.7 bits (343), Expect = 1.1e-28 Identity = 77/184 (41.85%), Postives = 107/184 (58.15%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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