CmoCh19G002490 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	CmoCh19G002490
Type	gene
Organism	Cucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
Description	Unknown protein
Location	Cmo_Chr19 : 1764956 .. 1766773 (+)

Genome Viewer

Gene Expression

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGCTTCTCATAAACGCCTTTCTTCTTTTCTCTTTTTTCTTTTATTAGGAATTGGGGTTTCTTCTGCAGCCAGAAATCTCTTAACTTATGGTGAAGGAAAGCCGGTGAACATTCCGGCATTTGCTTATGGTGCAGGCGGTGGTGCAGGCGGTGGTAGTGGTGGTGGATATGGTTCTCTTGGTGGTTATGGCGGTGGTGGAGGAAATGGAGGTGGTAGTGGCTATGGTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGGTGGCTATGGAAGTGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGAGGGAGGTGGGTATGGCCCTGGAGGTGGAAATGGATATGGTGGAGGTGGAGGAAGTGGCGGTGGAGGTGGTTATGGTTCTGGGGTTAGATACGGTGAAGTTGGATATGGCTCTGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGGTAGTGGAGGCGGTGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTGGAGGGTATGGAGGTGGCGGTGGAAATGGAGGTGGGGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTTCTGGATATGGAGGTGGTGGTGGAAATGGCGGTGGTGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGTGGGGGTGGCGGGAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGAGGTGGTGGATATGGAGGTGGAGGTGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGAGGTGGAGGTGGAAATGGCGGTGGCGCAGGGTACGGTCATGAAGGTGGTGGATACGGTGGGGGTGGTGGAAATGGTGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTAGTGGATACGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTTCAGGCGGTGCTGGGTCTGGCGCTGGAGGAGGAGAAGGGGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGAACATGGAGCAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTAGTGGATACGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTTCAGGCGGTGCTGGGTCTGGCGCTGGAGGAGGAGAAGGGGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGAACATGGAGCAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAAATGGCGGCGGTGGAGGTGTAGGATATGGGCCAGGAGGAGAATATGGGTCAGGTTATGGAAGCGGAGCAGGTGGGGGTCATGGTGGAGGAGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGAAGCGGTGGAGGTGGTGGAGGAGGGTCGGGATACGGTGGAGGAAGTGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAAGTAGCGGTGGAGGTGGTGGTCATGACGGAGGATATGGTGGTGGAAGCGCACACGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGGTATGGAGGAGGAGGTGGTAGCAGCCAAGGCGGTGGCCACGGTGGATATGCACCTTGA

mRNA sequence

ATGGCTTCTCATAAACGCCTTTCTTCTTTTCTCTTTTTTCTTTTATTAGGAATTGGGGTTTCTTCTGCAGCCAGAAATCTCTTAACTTATGGTGAAGGAAAGCCGGTGAACATTCCGGCATTTGCTTATGGTGCAGGCGGTGGTGCAGGCGGTGGTAGTGGTGGTGGATATGGTTCTCTTGGTGGTTATGGCGGTGGTGGAGGAAATGGAGGTGGTAGTGGCTATGGTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGGTGGCTATGGAAGTGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGAGGGAGGTGGGTATGGCCCTGGAGGTGGAAATGGATATGGTGGAGGTGGAGGAAGTGGCGGTGGAGGTGGTTATGGTTCTGGGGTTAGATACGGTGAAGTTGGATATGGCTCTGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGGTAGTGGAGGCGGTGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTGGAGGGTATGGAGGTGGCGGTGGAAATGGAGGTGGGGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTTCTGGATATGGAGGTGGTGGTGGAAATGGCGGTGGTGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGTGGGGGTGGCGGGAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGAGGTGGTGGATATGGAGGTGGAGGTGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGAGGTGGAGGTGGAAATGGCGGTGGCGCAGGGTACGGTCATGAAGGTGGTGGATACGGTGGGGGTGGTGGAAATGGTGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTAGTGGATACGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTTCAGGCGGTGCTGGGTCTGGCGCTGGAGGAGGAGAAGGGGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGAACATGGAGCAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTAGTGGATACGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTTCAGGCGGTGCTGGGTCTGGCGCTGGAGGAGGAGAAGGGGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGAACATGGAGCAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAAATGGCGGCGGTGGAGGTGTAGGATATGGGCCAGGAGGAGAATATGGGTCAGGTTATGGAAGCGGAGCAGGTGGGGGTCATGGTGGAGGAGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGAAGCGGTGGAGGTGGTGGAGGAGGGTCGGGATACGGTGGAGGAAGTGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAAGTAGCGGTGGAGGTGGTGGTCATGACGGAGGATATGGTGGTGGAAGCGCACACGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGGTATGGAGGAGGAGGTGGTAGCAGCCAAGGCGGTGGCCACGGTGGATATGCACCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCTTCTCATAAACGCCTTTCTTCTTTTCTCTTTTTTCTTTTATTAGGAATTGGGGTTTCTTCTGCAGCCAGAAATCTCTTAACTTATGGTGAAGGAAAGCCGGTGAACATTCCGGCATTTGCTTATGGTGCAGGCGGTGGTGCAGGCGGTGGTAGTGGTGGTGGATATGGTTCTCTTGGTGGTTATGGCGGTGGTGGAGGAAATGGAGGTGGTAGTGGCTATGGTTCTGTAGGAGAATATGGTGTTGGTGGCTATGGAAGTGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGAGGGAGGTGGGTATGGCCCTGGAGGTGGAAATGGATATGGTGGAGGTGGAGGAAGTGGCGGTGGAGGTGGTTATGGTTCTGGGGTTAGATACGGTGAAGTTGGATATGGCTCTGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGGTAGTGGAGGCGGTGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTGGAGGGTATGGAGGTGGCGGTGGAAATGGAGGTGGGGCTGGGTATGGTCCTGGAGGTTCTGGATATGGAGGTGGTGGTGGAAATGGCGGTGGTGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGTGGGGGTGGCGGGAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGAGGTGGTGGATATGGAGGTGGAGGTGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTGGTGGTGGATATGGAGGTGGAGGTGGAAATGGCGGTGGCGCAGGGTACGGTCATGAAGGTGGTGGATACGGTGGGGGTGGTGGAAATGGTGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTAGTGGATACGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTTCAGGCGGTGCTGGGTCTGGCGCTGGAGGAGGAGAAGGGGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGAACATGGAGCAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAGGGTGGTGGATATGGTGGAGGTGGCGGAAATGGCGGAGGGGCAGGGTATGGTCATGAAGGTAGTGGATACGGTGGGGGTGGCGGAAATGGCGGTGGGGCAGGGTATGGTTCAGGCGGTGCTGGGTCTGGCGCTGGAGGAGGAGAAGGGGGAGGTTCAGGGTATGGTGGAGAACATGGAGCAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAAATGGCGGCGGTGGAGGTGTAGGATATGGGCCAGGAGGAGAATATGGGTCAGGTTATGGAAGCGGAGCAGGTGGGGGTCATGGTGGAGGAGGAGGAAGTAGTGGTGGAGGAAGCGGTGGAGGTGGTGGAGGAGGGTCGGGATACGGTGGAGGAAGTGCACATGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGATATGGAGGAAGTAGCGGTGGAGGTGGTGGTCATGACGGAGGATATGGTGGTGGAAGCGCACACGGAGGTGCATCTGGTGGTCATGAAGGAGGGTATGGAGGAGGAGGTGGTAGCAGCCAAGGCGGTGGCCACGGTGGATATGCACCTTGA

Homology

[Close]

BLAST of CmoCh19G002490 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LH77_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G902220 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 147.9 bits (372), Expect = 4.0e-32
Identity = 295/413 (71.43%), Postives = 304/413 (73.61%), Query Frame = 1


Query: 1   MASHKRLSSFLFFLLLGIGVSSAARNLLTYGEGKPVNIPAFAYGAGGGAGGGSGGGYGSL 60
           MASHK  S  LFFLLLGIGVS AAR LLTYG G PVNIPAFAYGAG G GGGSGGGYG L
Sbjct: 1   MASHKFSSFVLFFLLLGIGVSYAARTLLTYGGG-PVNIPAFAYGAGNGGGGGSGGGYGPL 60

Query: 61  GGYGGGGGNGGGSGYGSVG-EYGVGGYGSGGGGGSGEGGGYGPGGGNGYGGGGGSGGGGG 120
           GG GGG G+GGG  Y SVG +YGVGGYGSGGGGGSG G GYGP GG G GGGGGSGGG  
Sbjct: 61  GGGGGGYGSGGGGSYSSVGVQYGVGGYGSGGGGGSGGGEGYGPSGGYGGGGGGGSGGGSA 120

Query: 121 YGSGVRYGEVGYGSGGSGYGGGSGGGAGYGPGGGGYGGGGGNGGGAGYGPG------GSG 180
           YG         +G    G GGGSGGG GYGPGGGGYGGGGGNGGGA YGPG      G G
Sbjct: 121 YG---------HGGSAYGGGGGSGGGGGYGPGGGGYGGGGGNGGGASYGPGEGSGYGGVG 180

Query: 181 YGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGGYG 240
           YGGGGG+GGG GYG  GGGYGGGGGNGGGAGYG  G GYGGGGGNGGGAGYGHEG G YG
Sbjct: 181 YGGGGGSGGGVGYGPGGGGYGGGGGNGGGAGYGLGGAGYGGGGGNGGGAGYGHEGAG-YG 240

Query: 241 GGGGNGGGAGYGHEGGGGYGG-GGGNGGGAGYGHEGGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYG 300
           GGGGNGGGA YG   G GYGG GGGNGGG    HE GG YGG GGNGG     HE GGYG
Sbjct: 241 GGGGNGGGASYGPGEGSGYGGVGGGNGGG----HESGG-YGGNGGNGGS----HESGGYG 300

Query: 301 GGGGNGGGAGYGHE-GSGYGGGGGNGGGAGYGSGGAGSGAGG--GEGGGSGYGGEHGAGY 360
           G GGN GGAGYG E G+GYGGGGGNGGG   G GGAGSG+GG  G G GSG GG HGAG 
Sbjct: 301 GSGGNSGGAGYGGEHGAGYGGGGGNGGG---GGGGAGSGSGGEYGSGYGSGAGGGHGAGG 360

Query: 361 GGGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYG 403
           G  GGG  GGG G    G GYGGG  +GG  G   EG GYGGGGG+G G G+G
Sbjct: 361 GNNGGGSGGGGGG----GSGYGGGSAHGGAYGGHEEGNGYGGGGGSGQGGGHG 386

[Close]

BLAST of CmoCh19G002490 vs. TrEMBL
Match: A0A169WK47_DAUCA (Uncharacterized protein OS=Daucus carota subsp. sativus GN=DCAR_005637 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 2.0e-15
Identity = 384/621 (61.84%), Postives = 393/621 (63.29%), Query Frame = 1


Query: 46  GGGAGGGSGGGYGSLGGYGGG-------GGNGGGSGYGSVGEYGVGGYGSGGGGGSGEGG 105
           GGG G G+GGG G   GYGGG       GG GGG G G  G YG GG G GGG G G GG
Sbjct: 137 GGGYGSGAGGGNGGGNGYGGGVEHGPGYGGGGGGGGNGEGGGYGGGGAGGGGGHGGGNGG 196

Query: 106 GYGPGGGNGYGGGGGSGGGGGYGSGVRYGEVGYGSGGSGYGGGSGGGAGYGPGG---GGY 165
           G G  GG GYGGGGG+GGGGGYG+G  +G      G  G GGG+GGG GYG GG   G Y
Sbjct: 197 GGGEHGGGGYGGGGGNGGGGGYGTGGEHG------GAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAY 256

Query: 166 GGGGGNGGGAGYGPGGS---GYGGGGGNGGGAGYG---HEGGGYGGGGGNGGGAGYG--- 225
           GGGGGNGGG GYG GG     YGGGGGNGGG GYG     GG YGGGGGNGGG GYG   
Sbjct: 257 GGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGG 316

Query: 226 HEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEG--GGGYGGGGGNGGGAGYGHEG--GGGYGGGGGNGGGA 285
             GG YGGGGGNGGG GYG  G  GG YGGGGGNGGG GYG  G  GG YGGGGGNGGG 
Sbjct: 317 EHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGG 376

Query: 286 GYGHEG--GGGYGGGGGNGGGAGYG---HEGGGYGGGGGNGGGAGYG---HEGSGYGGGG 345
           GYG  G  GG YGGGGGNGGG GYG     GG YGGGGGNGGG GYG     G  YGGGG
Sbjct: 377 GYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGG 436

Query: 346 GNGGGAGYGSGGAGSGAGGGEGGGSGYGGEHGAGYGGGGGGGNGGGAGYGHE-GGGYGGG 405
           GNGGG GYG+GG                 EHG  YGGGGG G GGG G G E GG YGGG
Sbjct: 437 GNGGGGGYGAGG-----------------EHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGG 496

Query: 406 GGNGGGAGYG---HEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGG 465
           GGNGGG GYG     GG YGGGGGNGGG GY               GAG G  GG YGGG
Sbjct: 497 GGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGY---------------GAG-GEHGGAYGGG 556

Query: 466 GGNGGGAGY---GHEGSGYGGGGGNGGGAGYGSGGAGSGA---GGGEGGGSGY--GGEHG 525
           GGNGGG GY   G  G  YGGGGGNGGG GYG+GG   GA   GGG GGG GY  GGEHG
Sbjct: 557 GGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHG 616

Query: 526 AGYGGGGGGGNGGGGGVGYGPGGEYGSGYGSGAGGGHGGGGGSSG-GGSGGGGGGGSGYG 585
             Y  GGGGGNGGGG  GYG GGE+G GYG G G G G GGG  G GG GGGGGGGSG G
Sbjct: 617 GAY--GGGGGNGGGG--GYGTGGEHGGGYGGGGGAGGGSGGGGYGPGGHGGGGGGGSGGG 676

Query: 586 GGSAH-------GGASGGHEGGY--GGSSGGGGGHDGGYGGGSAHGG--ASGGHE----- 606
           GG  +       GGA  G  GGY  GG  GGGGGH GG GGG   GG   SGG E     
Sbjct: 677 GGGGYVPGGGYGGGAGSGSGGGYGTGGEHGGGGGHGGGGGGGYGPGGGHGSGGGEGGGAG 714

[Close]

BLAST of CmoCh19G002490 vs. NCBI nr
Match: gi|700205246|gb|KGN60379.1| (hypothetical protein Csa_3G902220 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 147.9 bits (372), Expect = 5.7e-32
Identity = 295/413 (71.43%), Postives = 304/413 (73.61%), Query Frame = 1


Query: 1   MASHKRLSSFLFFLLLGIGVSSAARNLLTYGEGKPVNIPAFAYGAGGGAGGGSGGGYGSL 60
           MASHK  S  LFFLLLGIGVS AAR LLTYG G PVNIPAFAYGAG G GGGSGGGYG L
Sbjct: 1   MASHKFSSFVLFFLLLGIGVSYAARTLLTYGGG-PVNIPAFAYGAGNGGGGGSGGGYGPL 60

Query: 61  GGYGGGGGNGGGSGYGSVG-EYGVGGYGSGGGGGSGEGGGYGPGGGNGYGGGGGSGGGGG 120
           GG GGG G+GGG  Y SVG +YGVGGYGSGGGGGSG G GYGP GG G GGGGGSGGG  
Sbjct: 61  GGGGGGYGSGGGGSYSSVGVQYGVGGYGSGGGGGSGGGEGYGPSGGYGGGGGGGSGGGSA 120

Query: 121 YGSGVRYGEVGYGSGGSGYGGGSGGGAGYGPGGGGYGGGGGNGGGAGYGPG------GSG 180
           YG         +G    G GGGSGGG GYGPGGGGYGGGGGNGGGA YGPG      G G
Sbjct: 121 YG---------HGGSAYGGGGGSGGGGGYGPGGGGYGGGGGNGGGASYGPGEGSGYGGVG 180

Query: 181 YGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGGYG 240
           YGGGGG+GGG GYG  GGGYGGGGGNGGGAGYG  G GYGGGGGNGGGAGYGHEG G YG
Sbjct: 181 YGGGGGSGGGVGYGPGGGGYGGGGGNGGGAGYGLGGAGYGGGGGNGGGAGYGHEGAG-YG 240

Query: 241 GGGGNGGGAGYGHEGGGGYGG-GGGNGGGAGYGHEGGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYG 300
           GGGGNGGGA YG   G GYGG GGGNGGG    HE GG YGG GGNGG     HE GGYG
Sbjct: 241 GGGGNGGGASYGPGEGSGYGGVGGGNGGG----HESGG-YGGNGGNGGS----HESGGYG 300

Query: 301 GGGGNGGGAGYGHE-GSGYGGGGGNGGGAGYGSGGAGSGAGG--GEGGGSGYGGEHGAGY 360
           G GGN GGAGYG E G+GYGGGGGNGGG   G GGAGSG+GG  G G GSG GG HGAG 
Sbjct: 301 GSGGNSGGAGYGGEHGAGYGGGGGNGGG---GGGGAGSGSGGEYGSGYGSGAGGGHGAGG 360

Query: 361 GGGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYG 403
           G  GGG  GGG G    G GYGGG  +GG  G   EG GYGGGGG+G G G+G
Sbjct: 361 GNNGGGSGGGGGG----GSGYGGGSAHGGAYGGHEEGNGYGGGGGSGQGGGHG 386

[Close]

BLAST of CmoCh19G002490 vs. NCBI nr
Match: gi|778687914|ref|XP_011652648.1| (PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1.8 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 1.4e-25
Identity = 281/407 (69.04%), Postives = 290/407 (71.25%), Query Frame = 1


Query: 1   MASHKRLSSFLFFLLLGIGVSSAARNLLTYGEGKPVNIPAFAYGAGGGAGGGSGGGYGSL 60
           MASHK  S  LFFLLLGIGVS AAR LLTYG G PVNIPAFAYGAG G GGGSGGGYG L
Sbjct: 1   MASHKFSSFVLFFLLLGIGVSYAARTLLTYGGG-PVNIPAFAYGAGNGGGGGSGGGYGPL 60

Query: 61  GGYGGGGGNGGGSGYGSVG-EYGVGGYGSGGGGGSGEGGGYGPGGGNGYGGGGGSGGGGG 120
           GG GGG G+GGG  Y SVG +YGVGGYGSGGGGGSG G GYGP GG G GGGGGSGGG  
Sbjct: 61  GGGGGGYGSGGGGSYSSVGVQYGVGGYGSGGGGGSGGGEGYGPSGGYGGGGGGGSGGGSA 120

Query: 121 YGSGVRYGEVGYGSGGSGYGGGSGGGAGYGPGGGGYGGGGGNGGGAGYGPG-GSGYGGGG 180
           Y         G+G    G GGGSGGG GYGPGGGGYGGGGGNGGGA YGPG GSGYG   
Sbjct: 121 Y---------GHGGSAYGGGGGSGGGGGYGPGGGGYGGGGGNGGGASYGPGEGSGYG--- 180

Query: 181 GNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGGYGGGGGN 240
                      G GYGGGGG+GGG GYG  GGGYGGGGGNGGGAGYG  GG GYGGGGGN
Sbjct: 181 -----------GVGYGGGGGSGGGVGYGPGGGGYGGGGGNGGGAGYG-LGGAGYGGGGGN 240

Query: 241 GGGAGYGHEGGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNG 300
           GG    GHE  GGYGG GGNGG    GHE  GGYGG GGNGG     HE GGYGG GGN 
Sbjct: 241 GG----GHE-SGGYGGSGGNGG----GHE-SGGYGGNGGNGG----SHESGGYGGSGGNS 300

Query: 301 GGAGYGHE-GSGYGGGGGNGGGAGYGSGGAGSGAGG--GEGGGSGYGGEHGAGYGGGGGG 360
           GGAGYG E G+GYGGGGGNGGG   G GGAGSG+GG  G G GSG GG HGAG G  GGG
Sbjct: 301 GGAGYGGEHGAGYGGGGGNGGG---GGGGAGSGSGGEYGSGYGSGAGGGHGAGGGNNGGG 360

Query: 361 GNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGGGYGGGGGNGGGAGYG 403
             GGG G    G GYGGG  +GG  G   EG GYGGGGG+G G G+G
Sbjct: 361 SGGGGGG----GSGYGGGSAHGGAYGGHEEGNGYGGGGGSGQGGGHG 361

[Close]

BLAST of CmoCh19G002490 vs. NCBI nr
Match: gi|1021047020|gb|KZN04800.1| (hypothetical protein DCAR_005637 [Daucus carota subsp. sativus])

HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 5.4e-14
Identity = 383/624 (61.38%), Postives = 391/624 (62.66%), Query Frame = 1


Query: 46  GGGAGGGSGGGYGSLGGYGGG-------GGNGGGSGYGSVGEYGVGGYGSGGGGGSGEGG 105
           GGG G G+GGG G   GYGGG       GG GGG G G  G YG GG G GGG G G GG
Sbjct: 137 GGGYGSGAGGGNGGGNGYGGGVEHGPGYGGGGGGGGNGEGGGYGGGGAGGGGGHGGGNGG 196

Query: 106 GYGPGGGNGYGGGGGSGGGGGYGSGVRYGEVGYGSGGSGYGGGSGGGAGYGPGG---GGY 165
           G G  GG GYGGGGG+GGGGGYG+G  +G      G  G GGG+GGG GYG GG   G Y
Sbjct: 197 GGGEHGGGGYGGGGGNGGGGGYGTGGEHG------GAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAY 256

Query: 166 GGGGGNGGGAGYGPGGS---GYGGGGGNGGGAGYG---HEGGGYGGGGGNGGGAGYG--- 225
           GGGGGNGGG GYG GG     YGGGGGNGGG GYG     GG YGGGGGNGGG GYG   
Sbjct: 257 GGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGG 316

Query: 226 HEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEG--GGGYGGGGGNGGGAGYGHEG--GGGYGGGGGNGGGA 285
             GG YGGGGGNGGG GYG  G  GG YGGGGGNGGG GYG  G  GG YGGGGGNGGG 
Sbjct: 317 EHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGG 376

Query: 286 GYGHEG--GGGYGGGGGNGGGAGYG---HEGGGYGGGGGNGGGAGYGHEGSGYGGGGGNG 345
           GYG  G  GG YGGGGGNGGG GYG     GG YGGGGGNGGG GY              
Sbjct: 377 GYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGY-------------- 436

Query: 346 GGAGYGSGGAGSGAGGGEGGGSGYGGEHGAGYGGGGGGGNGGGAGYGHE-GGGYGGGGGN 405
            GA                     GGEHG  YGGGGG G GGG G G E GG YGGGGGN
Sbjct: 437 -GA---------------------GGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGN 496

Query: 406 GGGAGY---GHEGGGYGGGGGNGGGAGY---GHEGGGYGGGGGNGGGAGY---GHEGGGY 465
           GGG GY   G  GG YGGGGGNGGG GY   G  GG YGGGGGNGGG GY   G  GG Y
Sbjct: 497 GGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAY 556

Query: 466 GGGGGNGGGAGY---GHEGSGYGGGGGNGGGAGYGSGGAGSGA---GGGEGGGSGY--GG 525
           GGGGGNGGG GY   G  G  YGGGGGNGGG GYG+GG   GA   GGG GGG GY  GG
Sbjct: 557 GGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGGEHGGAYGGGGGNGGGGGYGAGG 616

Query: 526 EHGAGYGGGGGGGNGGGGGVGYGPGGEYGSGYGSGAGGGHGGGGGSSG-GGSGGGGGGGS 585
           EHG  Y  GGGGGNGGGG  GYG GGE+G GYG G G G G GGG  G GG GGGGGGGS
Sbjct: 617 EHGGAY--GGGGGNGGGG--GYGTGGEHGGGYGGGGGAGGGSGGGGYGPGGHGGGGGGGS 676

Query: 586 GYGGGSAH-------GGASGGHEGGY--GGSSGGGGGHDGGYGGGSAHGG--ASGGHE-- 606
           G GGG  +       GGA  G  GGY  GG  GGGGGH GG GGG   GG   SGG E  
Sbjct: 677 GGGGGGGYVPGGGYGGGAGSGSGGGYGTGGEHGGGGGHGGGGGGGYGPGGGHGSGGGEGG 714

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmoCh19G002490 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmoCh19G002490 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0LH77_CUCSA	4.0e-32	71.43	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G902220 PE=4 SV=1	[more]
A0A169WK47_DAUCA	2.0e-15	61.84	Uncharacterized protein OS=Daucus carota subsp. sativus GN=DCAR_005637 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of CmoCh19G002490 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmoCh19G002490 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|700205246\|gb\|KGN60379.1\|	5.7e-32	71.43	hypothetical protein Csa_3G902220 [Cucumis sativus]	[more]
gi\|778687914\|ref\|XP_011652648.1\|	1.4e-25	69.04	PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1.8 [Cucumis sativus]	[more]
gi\|1021047020\|gb\|KZN04800.1\|	5.4e-14	61.38	hypothetical protein DCAR_005637 [Daucus carota subsp. sativus]	[more]

Annotated Terms

The following terms have been associated with this gene:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0008150	biological_process
cellular_component	GO:0005575	cellular_component
molecular_function	GO:0003674	molecular_function

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CmoCh19G002490.1	CmoCh19G002490.1	mRNA

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata
Date Performed: 2017-05-19


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PRINTS	PR01228	EGGSHELL	coord: 7..23 score: 9.7E-10coord: 171..189 score: 9.7E-10coord: 131..141 score: 9.7E-10coord: 103..118 score: 9.7

Synteny

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:


Gene	Organism	Block
CmoCh19G002490	Wax gourd	cmowgoB0644
CmoCh19G002490	Wax gourd	cmowgoB0656
CmoCh19G002490	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocmoB109
CmoCh19G002490	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocmoB277
CmoCh19G002490	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocmoB387
CmoCh19G002490	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocmoB396
CmoCh19G002490	Cucumber (Gy14) v1	cgycmoB0866
CmoCh19G002490	Cucumber (Gy14) v1	cgycmoB0888
CmoCh19G002490	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacmoB147
CmoCh19G002490	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacmoB331
CmoCh19G002490	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacmoB508
CmoCh19G002490	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacmoB598
CmoCh19G002490	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacmoB816
CmoCh19G002490	Wild cucumber (PI 183967)	cmocpiB507
CmoCh19G002490	Wild cucumber (PI 183967)	cmocpiB509
CmoCh19G002490	Cucumber (Chinese Long) v2	cmocuB501
CmoCh19G002490	Cucumber (Chinese Long) v2	cmocuB503
CmoCh19G002490	Melon (DHL92) v3.5.1	cmomeB462
CmoCh19G002490	Melon (DHL92) v3.5.1	cmomeB472
CmoCh19G002490	Watermelon (Charleston Gray)	cmowcgB440
CmoCh19G002490	Watermelon (Charleston Gray)	cmowcgB453
CmoCh19G002490	Watermelon (97103) v1	cmowmB464
CmoCh19G002490	Watermelon (97103) v1	cmowmB479
CmoCh19G002490	Cucurbita pepo (Zucchini)	cmocpeB480
CmoCh19G002490	Cucurbita pepo (Zucchini)	cmocpeB481
CmoCh19G002490	Cucurbita pepo (Zucchini)	cmocpeB498
CmoCh19G002490	Cucurbita pepo (Zucchini)	cmocpeB509
CmoCh19G002490	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	cmolsiB447
CmoCh19G002490	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	cmolsiB466
CmoCh19G002490	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	cmolsiB481
CmoCh19G002490	Cucumber (Gy14) v2	cgybcmoB349
CmoCh19G002490	Cucumber (Gy14) v2	cgybcmoB351
CmoCh19G002490	Melon (DHL92) v3.6.1	cmomedB533
CmoCh19G002490	Melon (DHL92) v3.6.1	cmomedB544
CmoCh19G002490	Silver-seed gourd	carcmoB0678
CmoCh19G002490	Silver-seed gourd	carcmoB1055
CmoCh19G002490	Silver-seed gourd	carcmoB1292
CmoCh19G002490	Silver-seed gourd	carcmoB1301
CmoCh19G002490	Cucumber (Chinese Long) v3	cmocucB0599
CmoCh19G002490	Cucumber (Chinese Long) v3	cmocucB0601
CmoCh19G002490	Watermelon (97103) v2	cmowmbB504
CmoCh19G002490	Watermelon (97103) v2	cmowmbB529
CmoCh19G002490	Watermelon (97103) v2	cmowmbB535