CmoCh18G006160 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)

NameCmoCh18G006160
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr18 : 7566663 .. 7573956 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTGACGATGAGGTAAGTAACCACCTTGGACTTTTCTTAAGAAATACTTGTAGGAATCTCTTGAATTTTCATATGAACCCTAAAAAAAAGTACGACACAAGGATATATGAAAGAAAAACTCAATGAACCGTAAGTTAAGGCCCTGATCCGACCAAATTGCTCGGGATTTAAGGAACGTTAAGATAAACCACTAAATGAGCTTTTATGCTTATGAAATTTTAATGCTGAGCATAACATATCATATTAAGGTTATGTATGAAATTTGGTGGTCATTGGATAAGGATAAGTAGGTAAACCAAGAAACAGGGCAAAATGACCATAATGCCCTGAAGGATATCTACCTACGGTTCATGACCAAGATGACCTCAAAATGCTATGAAACTCTACTATAGTTCTTATTTTATGATTCTTAATGAGGTGGTATAATTTGAAAGCCATTGGAACTCGTTAAGTAGCAAAATCAAGAATTAGGGAAAAATTAACATAATGCCCCTAAGGAGGACTACCTACGGGTTAAGCCCTAAATGACCTTCCAACATTGTGAAATGTTGTATGAATCCTTACCTCAAGATGTTGTATAAGGTAATGAAGTTTGGGAGTCATTGGGAAACGTTAGATAGCAAAACCAAGATATGGGGAAAATGTACATCACGATCCACATGACTTTACCTCCTAGAATGACTAACGAGGTACCCATGAAATAAGAGATTCCCCATAGGTACCGTTGGTTGCTAAAAAGATTTTAAGTGCATAAGGTTACATTGGGCTATTCCTAAGAAGAACCTTTAAGTTCCAAGCTTGACCCAAGACGTTATGCATAAACCTAGGATCCCCAAGAATACAAGGAAACACCTAGGTTAATGCAGATGGTATGCTTAACAAGTTGCTAGGATCCATGCCCAGAGTAACCATTATCTCCCATCATGAAGTGTATCACGAGACCCCTATTCCTCTTTTGGTGAGATGCTCTGCTATATGTACCGATGCCATGATGAACTTATTATTTCCCTCACCTAAATGAGATGCCCTGCATCATGAATTTCCAGTAGGATGTCACGATTATGATAATGTCACCTATGCACTCATGGGGAGAAAACTAAGGGTTACTTTGAAAGAGTTTTCAGGACCAAAACACGATGTATGACATGACAACCTCTAAGAGTTAGTTCCTGAAAACGAAACAAGAAGTCATATCCTAGCTCAAGGTCTAAATATGCTCCAAATCACCAACCATGTCCTATAAGGTCTATTTTATATGACACGAGGATAAGCTCAAGATTTCAAGTTGGTTGGAGCAAGTTTGTAACATAAGCCAAGATGGAACTTAAGGAAACGCCTAAAGAAAACATGTCAATATTCAAGACTCTTCTAGAACCTTCTAAAAAATTCCCTAGGAATCTATCACCTTCTGAAATAACACACGCTAAGATGGGTTCATATGGTTACAAATACAAGTTACAACTTATGCCTCAAGGAATTAAGGACCTTAGAAACTTACAAGATTAAGAATCAAGAACAAGCTATACAACTCTCAAGATAAGGAGAATGCTAGGTACCACTAAAAAATAAGGGACCAAAGTCCCTAGACATGAAAATTCAAGAATGCTAGGCAATACTCTAAGCATGTCCAATTGTGGCCCATAACTCCCACCACACGGTGCTTTCTAAAGAGGCCTTTTTCCTCTTCTAGGTGGGATGCCCTGCACCGTGTTTCCTTTGCAAGATGTCATGTTTGGCCTCATTCCCCTCACCTAGATGAGATGCCCTGCGCCATGTTATGTTTTGCAGGATGCCATGTTCATGTATGCACCGATCACGCGACCTATATGGTCTATGGTAGATTAAGCAACCTTTATGGTCTATGCCATGTTCATGCATGCATCGATCACATGACCTTTATGGTCTATGCTAGGTTCATGCATGCATCAATCACGTGACCTTTATGGTCTATCATGGGGAGTAATCATATGGCCATCATGGAGCAAGAAGAGAGTAAGTTACTCTAGCCATGAATCAAGAACCTCTTAAGGCCTCCCACAGTACATCATGTTTATGACTTAGACTACGCTGCTTGGAACATATGAAGCCTTGAGCGTAGGTATTAAGACTGTGTCGCTTGGAACGCATGAAACTTCAGACACAGGATGACAAGTTTATGTCTAGTACCGTAAGTCCTAAGGGGAGTGTCTTAGAGAACGAATTAAGAAACATAACAAGAATTTACAACAAGAACAAAAACAAGAACATGAAAAGGAAAAGTGTGGTACCCTAGCATATCAAGGACATGATTAAGAGCCTACAAGTAGGCTGATTACTGAGTCTTGTACTCATTCCTTATTCTCCATTTTTTTAGGAAATAAGGGGCTGGTCGAGGTTGGGAGCGGACTCTAGAGCAGGTGCCATAGACAAACTTCATCTGTCGTCCTTCAACCCTTTTGTGTCGTCCCTTAACTTGTGTTTTAATTGTTGTGTTGTGTCTTAAAATACTTTGTATCATCTTTATTTTGATATAATGTTTGATATGTTTTAAGTTTTGGTTGTTTTATTTTGTTAAAAATTTTACCCGTCTTTTAGAGGCATCGAGTCAGCCCGGTCCTTACAGTTAAGGGGAATGAATCATTCCTTACATAAGGGGTGTCAATATGTCCGAGTCGTTAACGAGACAGATTTCAAAATTTGTTGGGCCATGCCTGCACGGTTCGAATCCTACTGTTGACAAATTTTTAACTTTATGTGAAATCCCACATTGGTTAAATAAGAAACTAATCATTCTATATAACAGGGTGTCAATATTTCTAAGTGGCTAAGGAGATAGAGTCGAAATCTGTTGGGCTATGCCTGCCTGTGTAGGTTTGGATCCTACAATTCTTTATATAAGGGTGTCAATATGGCTATTCTTTATATAAGGGTGTCAATATGTCCCAATGATAAATCTGTTGGGCTATGCATGCACAAGTTTGAATCCTGTTGCTATGTTCCTTATATAAGGAGTGTTAATATGTCCGAGTGGTTAAGGTGATAGACTTGAAATCCATTTATTTATGCCTACACAAGTTTGAATCCTGCTGTTGATGAATTATTTTATCAGGGGCGTCAATATGTCTGAGTGGTTAAAGAGACAAACTCAAAATCTGTTGGGCTATGCTTGCGTAGATTCAAATCCTGCTATTGACGTATTTTTTAGCTTTATTGTGAAAACACACATCGGGTTGAACAAGGAACGATGCAATTTTTAGCTTTAGGCTATGCAATTTTTAGTTTTATTATGAAATCTTACATCCTACATAATACTTATATAAGTAGAAGTGGGATACTGTTGTTGCCACAATTAGTAGTACCTGGGAAAATGAAGTTTGGGGTGTCAATATGTCCGAGTAGTTAAGGAGATAGACTCGAAATCTGTTGGGCTATGCCTACGTAGGTTTGAATCCTACTCTTGACATATTTTTAGCTTTATTGTGAAAACACACATCGGTTGAACAAGGAACCAAAGAACGAATCATTCTTTATATAAGGGTGTAAATGTCCAAATGGGTAAGGAGACAAACTCGAAATTTGGGCAATTTTTTTAGCTTTATTACTAAATCCCACATCCTACATAATACTTATATAAGTGGAAGTGGGATACTGTTGTTGCCACAATCGGTAGTACCTGAGAATTTGAGAAACTGAAGTTTGGGTGTCAATAAGTCCGAGTGGTTAAGGATAAGTATGAGCGGTCAAGGAGATAGACTCGAAATTTGTTGGGCTATGCCTGCATAGGTTGAAATCCTGCTATTGACGTATTTTTAATCTTATTGTGAAAACACCATTGGTTGAACAAGGAACGCATCATTCTTTATATAAGGGTGTCAATATGTCCGAATGGTTTAGGAGACAAACTCGAAATTTGGCTGCAATTTTTAACTTTATTATGAAATCCCACATCCTACATAATGCGAATCATTGTTTATATAAGGATGTCAATATGTTCGAATGGTTTAGGAGACAAACTCGAAATTTGGCTGCAATTTTAAGCTTTATTATGAAATCCCACATCCTACATAATACTTATATAAGTGGAATGGGATACTGTTGTTGCCACAATCAGTAGTACATGAGAATCGGACAAACTAAAGTTTGAGGTGTCAATATGTCCGAGTGGTTAAGGAGTGAATCCTGCTATTGACGCATTTTTAGCTTTATTGTGTTAAAACACACCTTAGTTGAATATGAAACATAAGGGTGTCAATATATCCAAAATGGTTTAGGAGACAAACTTGAAATTTGGCTGCAATTTTTTTTAGCTTTATTATGAAATCCCACATCCTACTTAATAACACTACAACAAAACTGTCTCTTATAACATTTGAATATTGCATTTTTTAAAAAAGGCATTTTCCTATTTATCTTTTATTTGAATTTTTTTATTCTATTGGTTTTCTCTCTTCTTCGTATTCTTTTCTACATTCTTCCATACTTTCTTTTTCTTTTCCCCCTTTCTCCCTTTCATTTTTCTCCGATTCCTTCCTTTCTCTTTTCCATCTGTTTGGTTTCTTCTTTTTCCTTTCTCTTCTCTACTCTCCGACAGAAAGTTTAGACAAGATTGTAAATGATGAAACCCCAATCTATTTGCCGAAGATGATGAGAAAGTTTTGAGTTCACGGTGGTTCAAAAAATTGAAGCCCTAAACTCTTTGCAGAAACCATTTGAAGGTGAGGGCCCCTTGTTATCGAAGGAACCCTGGTTTTTTATTCCCTCCTTCCTTCTTTATTATTTTTGCATTTACGTGATTTTAAAGTTTTGATTTTTCAGATAACACGTTGTGGCCTTTCTTGTTCAAATGTTCTGTCTTCGCTGAACTCCTTTCTTTTGCGTAACTCTAGTTTTTATTCATCTCTTACTCCAACATTTCTCCCTTTTTAATTTAATTTTTAGTTTACATTCCAACTCAACCATCTGGAGGGGTTGACTCTGTACCTAGAGTGTGTGGTTTCTCTTTGATTATTTTTATTTGAG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mRNA sequence

ATGTTGACGATGAGGTGGGATGCCCTGCACCGTGTTTCCTTTGCAAGATGTCATGTTTGGCCTCATTCCCCTCACCTAGATGAGATGCCCTGCGCCATGTTATGTTTTGCAGGATGCCATGTTCATGTATGCACCGATCACGCGACCTATATGGTCTATGGTAGATTAAGCAACCTTTATGGTCTATGCCATGTTCATGCATGCATCGATCACATGACCTTTATGGTCTATGCTAGAAACCATTTGAAGTTGGTTGAGATTTTACCTTCTTCTCTGGTCCTCTTCATTCTGAAAAAGCTGCCTCCCAAAGTGGAATTACGCATTGCATACAGAAGGAAGCGAAGAATTGGGAATGAAAAGGTGTGTCTAAAGATGAGGCCATGATAGCGGTCCCCAGATGTTGAAAATCATTGCAAAGTAGTGGAGAATATTTTATCTTGTATCGTTTGAATAACTTTATTTTAGGAAAGGAATGAATACTACTCTTGTGATGGAAATAGATTATGAAATATCAATTATGAATGGAAGTCATG

Coding sequence (CDS)

ATGTTGACGATGAGGTGGGATGCCCTGCACCGTGTTTCCTTTGCAAGATGTCATGTTTGGCCTCATTCCCCTCACCTAGATGAGATGCCCTGCGCCATGTTATGTTTTGCAGGATGCCATGTTCATGTATGCACCGATCACGCGACCTATATGGTCTATGGTAGATTAAGCAACCTTTATGGTCTATGCCATGTTCATGCATGCATCGATCACATGACCTTTATGGTCTATGCTAGAAACCATTTGAAGTTGGTTGAGATTTTACCTTCTTCTCTGGTCCTCTTCATTCTGAAAAAGCTGCCTCCCAAAGTGGAATTACGCATTGCATACAGAAGGAAGCGAAGAATTGGGAATGAAAAGGTGTGTCTAAAGATGAGGCCATGA
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR009457DUF1084
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh18G006160.1CmoCh18G006160.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata
Date Performed: 2017-05-19
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR009457Domain of unknown function DUF1084PFAMPF06454DUF1084coord: 69..109
score: 3.

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None