CmoCh18G004470 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTCAATCCAACCAACCACCACCACCCACCGTCATGAACTCCACCGCCCTCCTCCACCGTGGAATCGCCCCAACACCGCCACTCCCGTTGTCGTTCCGACGCAACGTGTCTTCTTCCGTTCACCTCGTCCCTAACGAGGCCGTTAACAAGCACGACGCTCGGAGGTGTACTAATAATGGCATCAAAATAGTGTGTCACGTATTTAACCCAAAGGAGCCGTCCAGTTCTCATAACGATGGCTTTCCTTTATTAAACACCAAAGAGGCTATGCAGTCACTGCTGTGCCTCCCTTTGGATGCGGCGGCGGAGGGTGAAACCAAAGACATAAGTGCAAACAAGGTGAGTTTTAGTTTATACTTTGGATGGTGAAAGGCCCACATCGGCTAATTTACCGAATGATCAAGGGTTTATAAACAAAGAATACACTCTTTGTTAGTATGAGTCCTTTTGGAGAAGTCCAAAGCAAAGCCATGAGAGCTTATGTTCAAAGTGGACAATATCATACCATTATAGAGAGTCGTGTTCGTCTAATATGGTATCAGAGTCATGCTCTATATTTAGTCGTGCATATTGGTAAATCTTCGAATGTTGAACAATCCAAAATAAAAAGGAGTCAAGCCTCCTCGGAGGCAGTAAAAAATGACTAAGACTCCAAAGAAGTCGAGTCTCGATTAAGGGGAGTCGTACTTTGTTCGAGGAGAGGTGTTGGATGATGAAAGTCCCACATCAGCTAATTTAAGGAATGATTATGAGTTTATAAACAAAGAATACACTCTTCATTGGTACGAGGCCTTTTGGGGAAATCCAAAGGAAAGCCATGAGAGCTTATGTTTAAAGTGGACAATATCATACTATTGTGGAGAGTCGCGTTCGTCTAACACTTTCAACTATGTTTAGGTTTGATTATAAGTTTGAGGGTTTATTGTTTGTGGCAGAGAAAAGCTTTACAGGCATTGTTGGCTAATAATCCTTCAGGGGCTGAGAAGATAATGAAGAATGTGCTTCAAACATACGAAAAGGACAATATGCAGACTAAATATGAAGCTATCTTGGCAACAGTCGTAATTCTCATCCACACGGTATTTTCTCTGGAGTATACACGAGTTGGATTGGATTGGGTCGAGTTGAAATTGTTTTAAAATTTCACTTATCGATACATATTAGGTTGATAATTAGTTCAATTATTAAAGTCAGAATTGAGTTCCTTTGAGTTTTGTTGTTATTCTGTTTTTGGATTGATAGAAGATTTGAATTTTTTGTTTTTCAAAAATTTAATTGTGAGAGTGGAGGTCGATTGGAGAGGGGAATAAATACATTCTTTGTAAGGGTGTGGAAACTTGTATCTAGGAGATGGTTTTAAAAAACTTGAGGGGAAACCCAAAAGAAAAAATCCAAAGAGGACAAATATTTGTTGGCGGGAGGTTGGACTGTTACAAATGGTATTAGAGCTAGACATTTAGCGGTGTGCCAGTGAGGATGTTGAGCCCTAAAGGGGGGTGGACCCCGCCATAGTGTGCCAGCGAGGACGTTGAGCCCCTTAGGAGGGTGGACACTAGGTAGTGTGCCAGCGAGGACGCTAAGCCCCTTAGGAAGGTGGACACTGGGCAGTGTGCCAGCAAGGATGCTGAGCTTCGTTGGGGGTAGACATTAGGCGGTTTGCCAGCAAGGACACTAAGCCTCGAAGGGGGGTGGACACCAAGCGGTGTGCCATCGAGGATGCTAAGGCTCGTTGGGGGTGGACATCAGACGGTGTGCCAATGAGGATTCTAAGGCTCATAGGGGGTGAACAACGGGCGATATACCAACGATGATGTTGAGTCTCGAAAGGGGTGAACACCGAGCGGTATACCAACGAAGACGCTGAGCTCCGTAGGGGGGTGAACACGGGGTAGTGTGCCAGTGTGGATGTTGAGCCTCGTAAGGTGGACACCAAGCAGTGTGCCAACGAGGATTCTAAGGCTCATAGGGGGTGGACAACGGGCAGTATACCAGCAATGACATTGAGCCTCGGAAGGGGTGGACACCGCTGTTGAGCCCCAAAGGGAGTGGACACCAAGCGGTGTACCAGCGAAGACGCTGAGCTCCGTAGGGGGGTGAACACCAGGTAGTGTGCCAACGTGGATGTTGAACCACGTAAATGGTGGACATCAGATGGTGTACCAACAAGGACATTGAGCCACATAAAAGATGGACACTAAACAGTGTACCAGCGAAGGCGTTGAGCCACAGAAGAGAGTGGACAATGCTTTATTTTTCAAAATTGATCATGTATAAACACTTTTTGAAAAAAAAAATCAATAATTTAATGTTAGTTAATAATAGTTTATATTTGTTAATTTAGATCATAAAAGTGGGTTTTTGAGAAAATATTGATAAAAAGTAAAAAATAATATATATATATATATATATATAAAATTAAAAAAATTATTATTTTAATATAGGGAGGAAGAGAAAGCTTGGGTGATGCTATTCACCATCTGAACAAAATAGAAGAGTGGGACAATAAGCCAAGTGATGTAAAGCGTATCCTTTATCGGGTAAGCTATTTGATCTTAATACTTTTTATTTTTATTTAAATAATACTTTCATTTTAAAATATCTTTTATTTTTTATTTTGACTTTTGATTATTTAATCTTTATTTATAATAAAAATGGGTTAAAATAAACTATTGCCAAGAAATTTATTTAATCTCATGTTTTTAAATTCAAATTGTAAAAAATAATAATAATATTATTATTAAATAAAATTGAAAAAAAGCATCAACTAATATTGATATATATAAATCATTTCAATGTTGTTTTTTTTTTCTCTTTAAATTGATGAAATTAACTATATTACAACTTTTAAATTTTTTATATTTTAATAAATATTTAATATTTTTAGTAAGAATAAAATTAAAAAATTTTAAATGACGATTATAGTCCTATCTTTTTTTTTTCTTCTATAATAAATTTATATAAAAAAAAACTTTAAATTACAAGTTCAAACATTAAATTTTTAAAATTATATGTCCAAATGAGTTTGAATTTTTCTAATAAATGTCTAATGGATTGAGTACAAATAATATAAAAAAAAAAGAAAGTATATTTCAATTTTAACCTTTTATTTGTAAATTAAAGTTTAATCTTTTGAATTTTTTAATAAATATCAAATATTTTCCATTAAGAATAAAATTTAAAATTTTAAAAGTATATTTCAGAAGTGAAATGACAATCATAGCCTTCCCGTTTCCTTCCTTAGTTGTGTGTTAATTTTTTTTTAATATATGTCTAATAGATTTTGGTATGAATAATACCAAGAGTTTAAAAAGTGTATTTCATAAGTAAAATGACAATTTTAACTTTTTATTTTTCGTTATTATAGCAACTAATTAAAATATAGTAAATTATAAGTTTAAACTTTAAATTTTTTAATAAATGTCTAATAAATTTAAAAAGTATATTTTATAAGTAAAATTATAATTTTAGCCTTTTATTTTTCGTTATTATAGCAACTAATTAAAATAGAGTAAATTACTAAGTTTAACCTTTAATTTTTTAATAAATATCTAATAAATTAAAAAAAAAAAGTATATTTCATGAGTAAAATTACAATTTTAGCCTTTTATTTTTCGTTATTATAGCAACTAATTAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACCATTAATTTTTTAATAAATATCTAATAAATTAAAAAAAATATATATTTCATAAGTAAAATTACAATTTTAGCCTTTTATTTTTCGTTATTATAGCAACTAATTAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACCATTAATTTTTTAATAAATATCTAATAAATTAAAAAAATATATATTTCATAAGTAAAATTACAATTTTATCCTTTTATTTTTCGTTATTATAGCAACTAATTAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACCATTAATTTTTTAATAAATATCTAATAAATTAAAAAAATTAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACCATTAATTTTTTAATAAATATCTAATAAATTAAAAAAATATATATTTCATAAGTAAAATTACAATTTTATCCTTTTATTTTTCGTTATTATAGCAACTAATTAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACAATTTTATCCTTTTATTTTTCGTTATTATAGCAACTAATTAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACCATTTTATCCTTTTATTTTTCGTTATTATAGCAACTAATTAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACCTTTAATTTTTTAATAAATATCTAATAAATTAAAAAAATAAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACCTTTAATTTTTTAATAAATATCTAATAAATTAAAAAAATATATATTTCATAAGTAAAATTACAATTTTATCCTTTTATTTTTCGTTATTATAGCAACTAATTAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACCTTTAATTTTTTAATAAATATCTAATAAATTAAAAAAATAAAAAGTATATTTCATAATAAAATTACAATTTTAGCCTTTTATTTTTCGTTATTATAGCAACTAATTAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACCTTTAATTTTTTAATAAATATCTAATAAATTAAAAAAAAAAAGTATATTTCATAATAAAATTACAATTTTAGCCTTATATTTTTTATTATTATAACAACTAATTAAAATATAGTAAATTACTAAGTTTAACCTTTAAATTTTTAATAAATATCTAATAAATGAAAAAAAAAAAGTATATTTCATAAGTAAAATAAAAAGTATATTTTATAAGTAAAATGACAATTTTAACCTTTTATTTTTCATTATTATAACAACTAATTAAAATATTAAATTTAAAAAAAAATAGTATATTTGATAAGTGAAATGACAATTTTAGCCTTATTTTTCTTCTTTCTATAATAATTTTATAATTAAGTAATAATTTGATGCAGGCTGTTATATATACCTTATTGGACTGCGATTCTGAGGCTAAAACT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ATGAACTCCACCGCCCTCCTCCACCGTGGAATCGCCCCAACACCGCCACTCCCGTTGTCGTTCCGACGCAACGTGTCTTCTTCCGTTCACCTCGTCCCTAACGAGGCCGTTAACAAGCACGACGCTCGGAGGTGTACTAATAATGGCATCAAAATAGTGTGTCACGTATTTAACCCAAAGGAGCCGTCCAGTTCTCATAACGATGGCTTTCCTTTATTAAACACCAAAGAGGCTATGCAGTCACTGCTGTGCCTCCCTTTGGATGCGGCGGCGGAGGGTGAAACCAAAGACATAAGTGCAAACAAGAGAAAAGCTTTACAGGCATTGTTGGCTAATAATCCTTCAGGGGCTGAGAAGATAATGAAGAATGTGCTTCAAACATACGAAAAGGACAATATGCAGACTAAATATGAAGCTATCTTGGCAACAGTCGTAATTCTCATCCACACGGGAGGAAGAGAAAGCTTGGGTGATGCTATTCACCATCTGAACAAAATAGAAGAGTGGGACAATAAGCCAAGTGATGTAAAGCGTATCCTTTATCGGGCTGTTATATATACCTTATTGGACTGCGATTCTGAGGCTAAAACTAATTGGAAAACTTTCTCAGACCAAATCGGCAAGGGCCCAAAACCGAGGTGA
BLAST of CmoCh18G004470 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LXK7_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G441330 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124.8 bits (312), Expect = 1.3e-25 Identity = 87/234 (37.18%), Postives = 121/234 (51.71%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh18G004470 vs. TAIR10
Match: AT2G34540.2 (AT2G34540.2 unknown protein) HSP 1 Score: 50.4 bits (119), Expect = 1.5e-06 Identity = 35/116 (30.17%), Postives = 63/116 (54.31%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh18G004470 vs. NCBI nr
Match: gi|778660954|ref|XP_004151210.2| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101202955 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 124.8 bits (312), Expect = 1.8e-25 Identity = 87/234 (37.18%), Postives = 121/234 (51.71%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh18G004470 vs. NCBI nr
Match: gi|659068418|ref|XP_008444310.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487676 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 6.9e-17 Identity = 87/240 (36.25%), Postives = 122/240 (50.83%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |