BLAST of CmoCh15G006120 vs. Swiss-Prot
Match:
EXTN3_ARATH (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3)
HSP 1 Score: 337.4 bits (864), Expect = 2.1e-91
Identity = 276/422 (65.40%), Postives = 283/422 (67.06%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPP-------PVYHSPPPP 63
MGS A L+ + +SL S ++ANY Y+SPPPP K Y PP PVYHSPPPP
Sbjct: 1 MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60
Query: 64 KKSYYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSP 123
KK Y Y SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y KSPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 61 KKHYE----YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 120
Query: 124 PPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 183
PPPKK Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 121 PPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 180
Query: 184 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV 243
PPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 181 PPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPV 240
Query: 244 Y-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 303
Y SPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y
Sbjct: 241 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 300
Query: 304 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYY----PPPVYHSP 363
PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y PPPV H
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 360
Query: 364 PPPVYHSPPPP----VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYYYSSPPP 390
PPPVYHSPPPP VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPP VY SPPPPV +YS PP
Sbjct: 361 PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPV 391
BLAST of CmoCh15G006120 vs. Swiss-Prot
Match:
EXTN1_ARATH (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2)
HSP 1 Score: 326.2 bits (835), Expect = 4.7e-88
Identity = 258/393 (65.65%), Postives = 267/393 (67.94%), Query Frame = 1
Query: 15 AFLAI-LSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPP- 74
+FL + SL S T+ANY Y+SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP
Sbjct: 3 SFLVLAFSLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPV 62
Query: 75 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 134
K Y PPPVY SPPPP K Y PPPV PP PPVY SPPPP K Y PPPVY SPP
Sbjct: 63 KHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPP-------PPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPP 122
Query: 135 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 194
PP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 123 PPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVY 182
Query: 195 HSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 254
SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y P
Sbjct: 183 KSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSP 242
Query: 255 PPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 314
PPVY SPPPP PP VYHSPPPP PP VYHSPPPP V+Y P
Sbjct: 243 PPVYKSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPP--VHYSP----------- 302
Query: 315 YYPPPVYSPPPPKKVYYPPP-VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVY---YPPPVYHS 374
PP VY PPP Y PPP VYHSPPPPV++SPPP VYHSPPPPKK Y PPP H
Sbjct: 303 --PPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHY 362
Query: 375 PPPPVYHSPPPPVYYYS---------SPPPPHY 391
PP VYHSPPPPV++YS SPPPPHY
Sbjct: 363 SPPTVYHSPPPPVHHYSPPHQPYLYKSPPPPHY 373
BLAST of CmoCh15G006120 vs. Swiss-Prot
Match:
LRX1_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX1 PE=1 SV=1)
HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 2.7e-35
Identity = 159/281 (56.58%), Postives = 167/281 (59.43%), Query Frame = 1
Query: 32 YVYASPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKSYYPPP--VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPP 91
YVY+SPPPP VY PP VY SPPPP PPP VY SPPPP PPP S P
Sbjct: 479 YVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPPPSPPPPCPESSP 538
Query: 92 PPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH 151
PP VYY P +SPPPP VYYPP V SPPPP VYYPP V +SPPPP VYYPP Y
Sbjct: 539 PPPVVYYAPVTQSPPPPSPVYYPP-VTQSPPPPSPVYYPP-VTNSPPPPSPVYYPPVTY- 598
Query: 152 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 211
SPPPP VYYP V SPPPP +YYPP V SPPPP VYYPP V SPPPP VYYPP
Sbjct: 599 SPPPPSPVYYPQ-VTPSPPPPSPLYYPP-VTPSPPPPSPVYYPP-VTPSPPPPSPVYYPP 658
Query: 212 PVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK--KVYYPPPVYHSPPPPKKV 271
SPPPP VYYP SPPPP + YY P SPPP K K +PP S
Sbjct: 659 VTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPPTEYYYSPS--QSPPPTKACKEGHPPQATPS------- 718
Query: 272 YYPPPVY---HSPPPPKKVYYPPPV----YHSPPPPKKVYY 298
Y PPP Y SPPPP Y PP+ Y + PPP YY
Sbjct: 719 YEPPPEYSYSSSPPPPSPTSYFPPMPSVSYDASPPPPPSYY 744
BLAST of CmoCh15G006120 vs. Swiss-Prot
Match:
EXTN_DAUCA (Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1)
HSP 1 Score: 141.0 bits (354), Expect = 2.8e-32
Identity = 176/363 (48.48%), Postives = 199/363 (54.82%), Query Frame = 1
Query: 1 MGKM--GSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKK 60
MG++ GS + L+ + ++SLNL S T+A Y Y+SPPPP+ HSPPPP+
Sbjct: 1 MGRIARGSKMSSLIVSLLVVLVSLNLASETTAKYTYSSPPPPE---------HSPPPPEH 60
Query: 61 SYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHS 120
S PP Y SPPPPK HSPPPP VY PPP+ SPPPP PPP HS
Sbjct: 61 SPPPPYHYESPPPPK--------HSPPPPTPVYKYKSPPPPMHSPPPPYHFESPPPPKHS 120
Query: 121 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH----SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 180
PPPP VY Y SPPPPK + P PV+H SPPPP VY Y SPPPPK +
Sbjct: 121 PPPPTPVY----KYKSPPPPK--HSPAPVHHYKYKSPPPPTPVY----KYKSPPPPK--H 180
Query: 181 YPPPVYH----SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP 240
P P +H SPPPPK ++P P +H Y SPPPP VY SPP
Sbjct: 181 SPAPEHHYKYKSPPPPK--HFPAPEHH---------YKYKYKSPPPPTPVY---KYKSPP 240
Query: 241 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH----SPPPPKKVY-YPPPVYHSPPPPKKVY- 300
PP VY Y SPPPPK + P PV+H SPPPP VY PPP HSPPPP VY
Sbjct: 241 PPTPVY----KYKSPPPPK--HSPAPVHHYKYKSPPPPTPVYKSPPPPEHSPPPPTPVYK 300
Query: 301 --YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 342
PPP HSPPPP VY Y PPP PPPVYSPPPPK Y Y SPPPP
Sbjct: 301 YKSPPPPMHSPPPPTPVY----KYKSPPPPMHSPPPPVYSPPPPKHHY----SYTSPPPP 306
BLAST of CmoCh15G006120 vs. Swiss-Prot
Match:
EXTN2_ARATH (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1)
HSP 1 Score: 137.1 bits (344), Expect = 4.1e-31
Identity = 199/384 (51.82%), Postives = 210/384 (54.69%), Query Frame = 1
Query: 32 YVYASPPPPK-----KVYY----PPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKVYY-PPPVY 91
YVY+SPPPP KVYY PP VY SPPPP S P Y SPPPP VY PPP Y
Sbjct: 400 YVYSSPPPPTYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPY 459
Query: 92 HSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKV 151
+SP P KVYY KSPPPP PPP Y+SP P KVYY PP VY SPPPP
Sbjct: 460 YSPSP--KVYY----KSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYS 519
Query: 152 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 211
P Y SPPPP PPP Y+SP P KV+ Y SPPPP PPP Y+SP P
Sbjct: 520 PSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVH-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP 579
Query: 212 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 271
KV+Y SPPPP PPP Y P P KVY Y SPPPP PPP Y+SP
Sbjct: 580 --KVHYK----SPPPPYVYNSPPPPYYSPSP-KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSP 639
Query: 272 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY---PPPVYSPPPPKKVYYPP 331
P KVY Y SPPPP PPP Y+SP P KVYY PPP YSP P KVYY
Sbjct: 640 SP--KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYYSPSP--KVYYK- 699
Query: 332 PVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYH- 391
SPP P P PPPP Y P VY SPPPP PPP Y+SP P VY+
Sbjct: 700 ---SPPHPHVCVCP------PPPPCYSPSPKVVYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVYYK 735
BLAST of CmoCh15G006120 vs. TrEMBL
Match:
A0A0A0K8S7_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 578.9 bits (1491), Expect = 4.5e-162
Identity = 355/399 (88.97%), Postives = 361/399 (90.48%), Query Frame = 1
Query: 1 MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60
MGKMGSS AP+LF AF+A+LSL LPSTT+ANY+YASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY
Sbjct: 1 MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60
Query: 61 YPPPVYHSPPPPK-VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPP 120
YPPPVYHSPPPPK VYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPV KSPPPP KVYYPPPVY SPPPP
Sbjct: 61 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPP 120
Query: 121 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHS 180
KKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY S
Sbjct: 121 KKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-S 180
Query: 181 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240
PPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 181 PPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240
Query: 241 HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 300
SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYP
Sbjct: 241 -SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-PPPPPKKVYYP 300
Query: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPP------PPVYHSPPPPVYHSPP 360
PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY PP PP +SPPPPVYHSP
Sbjct: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPVYHSP- 360
Query: 361 PPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS-PPPPHY 391
PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS PPPPHY
Sbjct: 361 -------PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSSPPPPPHY 385
BLAST of CmoCh15G006120 vs. TrEMBL
Match:
A0A0D3CC16_BRAOL (Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 7.8e-90
Identity = 272/423 (64.30%), Postives = 280/423 (66.19%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
MGS A L+ + +SL S ++ANY Y+SPPPP K Y Y SPPPP K Y PP
Sbjct: 1 MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQ----YKSPPPPVKHYSPP 60
Query: 64 PVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPP 123
PVYHSPPPPK +Y PPPVYHSPPPPKK Y KSPPPP K Y PPP
Sbjct: 61 PVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---EYKSPPPPVKHYSPPP 120
Query: 124 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPP 183
VYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y PPP
Sbjct: 121 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVMHYSPPP 180
Query: 184 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVY 243
VYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y
Sbjct: 181 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 240
Query: 244 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 303
PPPVY SPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP
Sbjct: 241 SPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPP 300
Query: 304 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSP 363
K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVY PPPP K +Y VY SP
Sbjct: 301 VKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHPPPPPKKHY---VYKSP 360
Query: 364 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVYHSPPPP--VYYYSSPPPP- 391
PPPV H PPPVYHSPPPPKK Y PPPV H PPPVYHSPPPP Y Y SPPPP
Sbjct: 361 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKKYVYKSPPPPV 389
BLAST of CmoCh15G006120 vs. TrEMBL
Match:
D7KTY3_ARALL (Predicted protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_476851 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 309.7 bits (792), Expect = 5.1e-81
Identity = 244/409 (59.66%), Postives = 251/409 (61.37%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
MGS A L AF SL S T+ANY Y+SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1 MGSPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60
Query: 64 PVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 123
PVY KSPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y
Sbjct: 61 PVY------------------------------KSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYS 120
Query: 124 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 183
PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP
Sbjct: 121 PPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPV 180
Query: 184 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 243
K Y PPPVY SPPPP SPPPP K Y PPPVY SPPP
Sbjct: 181 KHYSPPPVYKSPPPP-------------------------SPPPPVKHYSPPPVYKSPPP 240
Query: 244 PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYS 303
P K Y PPPVY S PPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 241 PVKHYSPPPVYKSAPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYK 300
Query: 304 PPPPKKVYYPPPV--YSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY-- 363
PPP Y PPPV +SPPPP PP VYHSPPPPV++SPPP VYHSPPPPKK Y
Sbjct: 301 SPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHYEYK 350
Query: 364 ---------PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYS---------SPPPPHY 391
PPPVYHSPPPPVYHSPPPPV++YS SPPPPHY
Sbjct: 361 SPPPPVHYSPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVHHYSPPHQPYLYKSPPPPHY 350
BLAST of CmoCh15G006120 vs. TrEMBL
Match:
A0A0D3CWA0_BRAOL (Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 263.5 bits (672), Expect = 4.2e-67
Identity = 243/423 (57.45%), Postives = 251/423 (59.34%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
MGS A L + LSL S T+ANY Y+SPPPP K +Y PPVY SPPP K Y P
Sbjct: 1 MGSPVAFLAAALLVLALSLGFVSETTANYYYSSPPPPVK-HYTPPVYKSPPPLIKHYPAP 60
Query: 64 PVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYY-------------PPP 123
PVY SPPPPK Y Y SPPPP K Y P PV PPPPK +Y PPP
Sbjct: 61 PVYKSPPPPKKQYE---YKSPPPPVKHYSPRPVYKSPPPPKKHYEYKSPPPPVYQSPPPP 120
Query: 124 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 183
VYHSPPPPKK Y Y SPPPP PPP YHSPPPPKK Y Y SPPPP
Sbjct: 121 VYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVYQS 180
Query: 184 YPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP 243
PPP YHSPPPPKK Y PPPVY SPP PP +SPPPPKK Y SPP
Sbjct: 181 PPPPAYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVYQSPP-------PPAYHSPPPPKKHY---EYKSPP 240
Query: 244 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----P 303
PP PPP YHSPPPPKK Y Y SPPPP PPP YHSPPPPKK Y P
Sbjct: 241 PPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHYEYKSPP 300
Query: 304 PPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY----PPPVYSPPPPKKVYYPPP-----VYH 363
PPVY SPP PP +SPPPPKK Y PPPVY PPP + PPP Y
Sbjct: 301 PPVYQSPP-------PPAYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHYEYK 360
Query: 364 SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVYHSPPPPV--YYYSSPPP 391
SPPPPVY SPPPP YHSPPPPKK Y PPPVY SPPPP YHSPPPP Y Y SPPP
Sbjct: 361 SPPPPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHYEYKSPPP 390
BLAST of CmoCh15G006120 vs. TrEMBL
Match:
A0A078IGQ4_BRANA (BnaC06g18710D protein OS=Brassica napus GN=BnaC06g18710D PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 260.0 bits (663), Expect = 4.6e-66
Identity = 235/397 (59.19%), Postives = 247/397 (62.22%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
MGS A L + LSL S T+ANY Y+SPPPP K +Y PPVY SPPP K Y P
Sbjct: 1 MGSPVAFLAAALLVLALSLGFVSETTANYYYSSPPPPVK-HYTPPVYKSPPPLIKHYPAP 60
Query: 64 PVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 123
PVY SPPPPK Y Y SPPPP K Y P PV PPPPK +Y Y SPPPP
Sbjct: 61 PVYKSPPPPKKQYE---YKSPPPPVKHYSPRPVYKSPPPPKKHYE---YKSPPPPVYQSP 120
Query: 124 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 183
PPPVYHSPPPPKK Y Y SPPPP PPPVYHSPPPPKK Y Y SPPPP
Sbjct: 121 PPPVYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVYQSPPPPVYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPV 180
Query: 184 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYH 243
PPPVYHSPPPPKK Y PPPVY PP PP +SPPPPKK Y Y
Sbjct: 181 YQSPPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVYQSPP------PPVYHSPPPPKKHY----EYK 240
Query: 244 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY-- 303
SPPPP PPPVYHSPPPPKK Y Y SPPPP PPPVYHSPPPPKK Y
Sbjct: 241 SPPPPVYQSPPPPVYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVYQSPPPPVYHSPPPPKKHYEYK 300
Query: 304 --PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPK 363
PPPVY PP PP +SPPPPKK Y Y SPPPPV+ SPPPPVYHSPPPPK
Sbjct: 301 SPPPPVYQSPP------PPVYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVFQSPPPPVYHSPPPPK 358
Query: 364 KVYY--PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSSPPPPHY 391
Y PPP HSPPPPV++SPP Y Y SPPPP++
Sbjct: 361 HYEYKSPPPPVHSPPPPVHYSPPHQPYLYKSPPPPYH 358
BLAST of CmoCh15G006120 vs. TAIR10
Match:
AT1G21310.1 (AT1G21310.1 extensin 3)
HSP 1 Score: 337.4 bits (864), Expect = 1.2e-92
Identity = 276/422 (65.40%), Postives = 283/422 (67.06%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPP-------PVYHSPPPP 63
MGS A L+ + +SL S ++ANY Y+SPPPP K Y PP PVYHSPPPP
Sbjct: 1 MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60
Query: 64 KKSYYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSP 123
KK Y Y SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y KSPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 61 KKHYE----YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 120
Query: 124 PPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 183
PPPKK Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 121 PPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 180
Query: 184 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV 243
PPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 181 PPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPV 240
Query: 244 Y-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 303
Y SPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y
Sbjct: 241 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 300
Query: 304 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYY----PPPVYHSP 363
PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y PPPV H
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 360
Query: 364 PPPVYHSPPPP----VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYYYSSPPP 390
PPPVYHSPPPP VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPP VY SPPPPV +YS PP
Sbjct: 361 PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPV 391
BLAST of CmoCh15G006120 vs. TAIR10
Match:
AT2G24980.1 (AT2G24980.1 Proline-rich extensin-like family protein)
HSP 1 Score: 158.3 bits (399), Expect = 9.6e-39
Identity = 203/377 (53.85%), Postives = 216/377 (57.29%), Query Frame = 1
Query: 32 YVYASPPPP-----KKVYY----PPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKVYY-PPPVY 91
YVY+SPPPP KVYY PP VY SPPPP S P Y SPPPP VY PPP Y
Sbjct: 177 YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPY 236
Query: 92 HSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKV 151
+SP P KVYY KSPPPP PPP Y+SP P KVYY PP VY SPPPP
Sbjct: 237 YSPSP--KVYY----KSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYS 296
Query: 152 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 211
P Y SPPPP PPP Y+SP P KVY Y SPPPP PPP Y+SP P
Sbjct: 297 PSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP 356
Query: 212 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 271
KVYY SPPPP PPP Y P P KVY Y SPPPP PPP Y+SP
Sbjct: 357 --KVYYK----SPPPPYVYSSPPPPYYSPSP-KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSP 416
Query: 272 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 331
P KVY Y SPPPP PPP Y+SP P KVYY SPPPP PPP Y
Sbjct: 417 SP--KVY-----YKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSP--KVYYK----SPPPPYVYSSPPPPY 476
Query: 332 SPPPPKKVYY---PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVY-YPPPVYHSPPPPVYH 391
P P KVYY PPP +S PPP Y+SP P VY+ PPP VY PPP Y+SP P VY+
Sbjct: 477 YSPSP-KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPSYVYSSPPPPYYSPSPKVYY 512
BLAST of CmoCh15G006120 vs. TAIR10
Match:
AT1G23720.1 (AT1G23720.1 Proline-rich extensin-like family protein)
HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 1.8e-37
Identity = 197/380 (51.84%), Postives = 209/380 (55.00%), Query Frame = 1
Query: 32 YVYASPPPP-----KKVYY----PPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKVYY-PPPVY 91
YVY+SPPPP KV Y PP VY SPPPP S P P Y SPPPP VY PPP Y
Sbjct: 86 YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPTYKSPPPPYVYNSPPPPY 145
Query: 92 HSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKV 151
+SP P KV Y KSPPPP PPP Y+SP P KV Y PP VY+SPPPP
Sbjct: 146 YSPSP--KVEY----KSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVDYKSPPPPYVYNSPPPPYYS 205
Query: 152 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 211
P P Y SPPPP +Y SPPPP P PVY SPPPP VY SPPP
Sbjct: 206 PSPKPTYKSPPPPY-------IYSSPPPPYYSPSPKPVYKSPPPPY-------VYSSPPP 265
Query: 212 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY--PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH 271
P P P Y PPP VY PPP YSP P P+Y SPPPP VY+
Sbjct: 266 PYYSPSPKPAYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPS-------PKPIYKSPPPPY-------VYN 325
Query: 272 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVY-YPP 331
SPPPP P P Y SPPPP +PPP Y+SP P PVY PPP VY PP
Sbjct: 326 SPPPPYYSPSPKPAYKSPPPPYVYSFPPPPYYSPS-------PKPVYKSPPPPYVYNSPP 385
Query: 332 PVYSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP-PPP 391
P Y P PK Y PP VY SPPPP Y P P Y SPPPP PPP Y+SP P P
Sbjct: 386 PPYYSPSPKPAYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPTYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKP 421
BLAST of CmoCh15G006120 vs. TAIR10
Match:
AT1G76930.1 (AT1G76930.1 extensin 4)
HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 1.8e-37
Identity = 114/174 (65.52%), Postives = 117/174 (67.24%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
MG+ A L AF SL S T+ANY Y+SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1 MGAPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60
Query: 64 PVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 123
PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPV PP PPVY SPPPP K Y
Sbjct: 61 PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPP-------PPVYKSPPPPVKHY 120
Query: 124 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 177
PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPP Y
Sbjct: 121 SPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPSY 163
BLAST of CmoCh15G006120 vs. TAIR10
Match:
AT1G12040.1 (AT1G12040.1 leucine-rich repeat/extensin 1)
HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 1.5e-36
Identity = 159/281 (56.58%), Postives = 167/281 (59.43%), Query Frame = 1
Query: 32 YVYASPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKSYYPPP--VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPP 91
YVY+SPPPP VY PP VY SPPPP PPP VY SPPPP PPP S P
Sbjct: 479 YVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPPPSPPPPCPESSP 538
Query: 92 PPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH 151
PP VYY P +SPPPP VYYPP V SPPPP VYYPP V +SPPPP VYYPP Y
Sbjct: 539 PPPVVYYAPVTQSPPPPSPVYYPP-VTQSPPPPSPVYYPP-VTNSPPPPSPVYYPPVTY- 598
Query: 152 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 211
SPPPP VYYP V SPPPP +YYPP V SPPPP VYYPP V SPPPP VYYPP
Sbjct: 599 SPPPPSPVYYPQ-VTPSPPPPSPLYYPP-VTPSPPPPSPVYYPP-VTPSPPPPSPVYYPP 658
Query: 212 PVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK--KVYYPPPVYHSPPPPKKV 271
SPPPP VYYP SPPPP + YY P SPPP K K +PP S
Sbjct: 659 VTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPPTEYYYSPS--QSPPPTKACKEGHPPQATPS------- 718
Query: 272 YYPPPVY---HSPPPPKKVYYPPPV----YHSPPPPKKVYY 298
Y PPP Y SPPPP Y PP+ Y + PPP YY
Sbjct: 719 YEPPPEYSYSSSPPPPSPTSYFPPMPSVSYDASPPPPPSYY 744
BLAST of CmoCh15G006120 vs. NCBI nr
Match:
gi|700190951|gb|KGN46155.1| (hypothetical protein Csa_6G058200 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 578.9 bits (1491), Expect = 6.5e-162
Identity = 355/399 (88.97%), Postives = 361/399 (90.48%), Query Frame = 1
Query: 1 MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60
MGKMGSS AP+LF AF+A+LSL LPSTT+ANY+YASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY
Sbjct: 1 MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60
Query: 61 YPPPVYHSPPPPK-VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPP 120
YPPPVYHSPPPPK VYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPV KSPPPP KVYYPPPVY SPPPP
Sbjct: 61 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPP 120
Query: 121 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHS 180
KKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY S
Sbjct: 121 KKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-S 180
Query: 181 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240
PPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 181 PPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240
Query: 241 HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 300
SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYP
Sbjct: 241 -SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-PPPPPKKVYYP 300
Query: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPP------PPVYHSPPPPVYHSPP 360
PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY PP PP +SPPPPVYHSP
Sbjct: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPVYHSP- 360
Query: 361 PPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS-PPPPHY 391
PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS PPPPHY
Sbjct: 361 -------PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSSPPPPPHY 385
BLAST of CmoCh15G006120 vs. NCBI nr
Match:
gi|922497463|ref|XP_013587003.1| (PREDICTED: extensin-3 [Brassica oleracea var. oleracea])
HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 1.1e-89
Identity = 272/423 (64.30%), Postives = 280/423 (66.19%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
MGS A L+ + +SL S ++ANY Y+SPPPP K Y Y SPPPP K Y PP
Sbjct: 1 MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQ----YKSPPPPVKHYSPP 60
Query: 64 PVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPP 123
PVYHSPPPPK +Y PPPVYHSPPPPKK Y KSPPPP K Y PPP
Sbjct: 61 PVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---EYKSPPPPVKHYSPPP 120
Query: 124 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPP 183
VYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y PPP
Sbjct: 121 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVMHYSPPP 180
Query: 184 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVY 243
VYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y
Sbjct: 181 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 240
Query: 244 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 303
PPPVY SPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP
Sbjct: 241 SPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPP 300
Query: 304 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSP 363
K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVY PPPP K +Y VY SP
Sbjct: 301 VKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHPPPPPKKHY---VYKSP 360
Query: 364 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVYHSPPPP--VYYYSSPPPP- 391
PPPV H PPPVYHSPPPPKK Y PPPV H PPPVYHSPPPP Y Y SPPPP
Sbjct: 361 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKKYVYKSPPPPV 389
BLAST of CmoCh15G006120 vs. NCBI nr
Match:
gi|923925548|ref|XP_013731769.1| (PREDICTED: extensin-3-like [Brassica napus])
HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 1.1e-89
Identity = 280/448 (62.50%), Postives = 287/448 (64.06%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPP------------KKVYYPPPVYH 63
MGS A L+ + +SL S ++ANY Y+SPPPP K Y PPPVYH
Sbjct: 1 MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQYKSPPPPVKHYSPPPVYH 60
Query: 64 SPPPPKKSYY------------PPPVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPP 123
SPPPPKK Y PPPVYHSPPPPK +Y PPPVYHSPPP
Sbjct: 61 SPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPP 120
Query: 124 PKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHS 183
PKK Y KSPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHS
Sbjct: 121 PKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 180
Query: 184 PPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHS 243
PPPPKK Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHS
Sbjct: 181 PPPPKKHYVYKSPPPPVMHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 240
Query: 244 PPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 303
PPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPP
Sbjct: 241 PPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPP 300
Query: 304 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVY 363
VYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y
Sbjct: 301 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 360
Query: 364 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHS 391
PPPVY SPPPPKK Y VY SPPPPV H PPPVYHSPPPPKK Y PPPV H
Sbjct: 361 SPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY 417
BLAST of CmoCh15G006120 vs. NCBI nr
Match:
gi|15218966|ref|NP_173553.1| (extensin 3 [Arabidopsis thaliana])
HSP 1 Score: 337.4 bits (864), Expect = 3.3e-89
Identity = 276/422 (65.40%), Postives = 283/422 (67.06%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPP-------PVYHSPPPP 63
MGS A L+ + +SL S ++ANY Y+SPPPP K Y PP PVYHSPPPP
Sbjct: 1 MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60
Query: 64 KKSYYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSP 123
KK Y Y SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y KSPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 61 KKHYE----YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 120
Query: 124 PPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 183
PPPKK Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 121 PPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 180
Query: 184 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV 243
PPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 181 PPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPV 240
Query: 244 Y-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 303
Y SPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y
Sbjct: 241 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 300
Query: 304 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYY----PPPVYHSP 363
PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y PPPV H
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 360
Query: 364 PPPVYHSPPPP----VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYYYSSPPP 390
PPPVYHSPPPP VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPP VY SPPPPV +YS PP
Sbjct: 361 PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPV 391
BLAST of CmoCh15G006120 vs. NCBI nr
Match:
gi|923644285|ref|XP_013642307.1| (PREDICTED: extensin-3 [Brassica napus])
HSP 1 Score: 334.3 bits (856), Expect = 2.8e-88
Identity = 273/424 (64.39%), Postives = 280/424 (66.04%), Query Frame = 1
Query: 4 MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
MGS A L+ + +SL S ++ANY Y+SPPPP K Y Y SPPPP K Y P
Sbjct: 1 MGSPVASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQ----YKSPPPPVKHYSPS 60
Query: 64 PVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPP 123
PVYHSPPPPK +Y PPPVYHSPPPPKK Y KSPPPP K Y PPP
Sbjct: 61 PVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKDYV---YKSPPPPVKHYSPPP 120
Query: 124 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 183
VYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y
Sbjct: 121 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 180
Query: 184 YPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVY 243
PPPVYHSPPPPKK Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y
Sbjct: 181 SPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 240
Query: 244 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 303
PPPVY SPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP
Sbjct: 241 SPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPP 300
Query: 304 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHS 363
K Y PPPVYHSPPPPKK Y VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y VY S
Sbjct: 301 VKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKS 360
Query: 364 PPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVYHSPPPP--VYYYSSPPPP 391
PPPPV H PPPVYHSPPPPKK Y PPPV H PPPVYHSPPPP Y Y SPPPP
Sbjct: 361 PPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKKYVYKSPPPP 389
The following BLAST results are available for this feature:
Match Name | E-value | Identity | Description | |
EXTN3_ARATH | 2.1e-91 | 65.40 | Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3 | [more] |
EXTN1_ARATH | 4.7e-88 | 65.65 | Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2 | [more] |
LRX1_ARATH | 2.7e-35 | 56.58 | Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX1 PE=1... | [more] |
EXTN_DAUCA | 2.8e-32 | 48.48 | Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1 | [more] |
EXTN2_ARATH | 4.1e-31 | 51.82 | Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1 | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
A0A0A0K8S7_CUCSA | 4.5e-162 | 88.97 | Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1 | [more] |
A0A0D3CC16_BRAOL | 7.8e-90 | 64.30 | Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1 | [more] |
D7KTY3_ARALL | 5.1e-81 | 59.66 | Predicted protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_476851 PE=4 ... | [more] |
A0A0D3CWA0_BRAOL | 4.2e-67 | 57.45 | Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1 | [more] |
A0A078IGQ4_BRANA | 4.6e-66 | 59.19 | BnaC06g18710D protein OS=Brassica napus GN=BnaC06g18710D PE=4 SV=1 | [more] |