CmoCh15G006120 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)

NameCmoCh15G006120
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr15 : 2976030 .. 2977202 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGAAAAATGGGATCTTCATGGGCTCCTCTCCTTTTTGGTGCCTTTCTTGCTATCCTTTCCCTAAACTTGCCGTCTACCACGAGTGCTAATTATGTCTATGCCTCGCCTCCGCCCCCTAAGAAGGTATACTACCCGCCTCCGGTATATCATTCTCCGCCACCTCCTAAGAAGTCTTACTATCCACCTCCGGTTTATCACTCTCCGCCACCACCTAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTATCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTATTATCCACCTCCTGTGAAATCGCCACCACCACCACCGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCATTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTACTATCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTGTATCATTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTTTACCATTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTCTACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCGCCCGTCTACTCACCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCAAAGAAAGTATACTACCCACCACCGGTGTACCACTCTCCACCACCACCAGTGTACCACTCTCCACCACCACCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCGGTGTACCACTCTCCACCGCCACCGGTGTACCACTCTCCACCGCCACCGGTCTATTACTACTCATCACCACCACCTCCACACTACTAG

mRNA sequence

ATGGGAAAAATGGGATCTTCATGGGCTCCTCTCCTTTTTGGTGCCTTTCTTGCTATCCTTTCCCTAAACTTGCCGTCTACCACGAGTGCTAATTATGTCTATGCCTCGCCTCCGCCCCCTAAGAAGGTATACTACCCGCCTCCGGTATATCATTCTCCGCCACCTCCTAAGAAGTCTTACTATCCACCTCCGGTTTATCACTCTCCGCCACCACCTAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTATCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTATTATCCACCTCCTGTGAAATCGCCACCACCACCACCGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCATTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTACTATCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTGTATCATTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTTTACCATTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTCTACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCGCCCGTCTACTCACCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCAAAGAAAGTATACTACCCACCACCGGTGTACCACTCTCCACCACCACCAGTGTACCACTCTCCACCACCACCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCGGTGTACCACTCTCCACCGCCACCGGTGTACCACTCTCCACCGCCACCGGTCTATTACTACTCATCACCACCACCTCCACACTACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGAAAAATGGGATCTTCATGGGCTCCTCTCCTTTTTGGTGCCTTTCTTGCTATCCTTTCCCTAAACTTGCCGTCTACCACGAGTGCTAATTATGTCTATGCCTCGCCTCCGCCCCCTAAGAAGGTATACTACCCGCCTCCGGTATATCATTCTCCGCCACCTCCTAAGAAGTCTTACTATCCACCTCCGGTTTATCACTCTCCGCCACCACCTAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTATCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTATTATCCACCTCCTGTGAAATCGCCACCACCACCACCGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCATTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCTAAGAAGGTGTACTATCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCTGTGTATCATTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTTTACCATTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCAGTCTACTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCGCCCGTCTACTCACCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCAAAGAAAGTATACTACCCACCACCGGTGTACCACTCTCCACCACCACCAGTGTACCACTCTCCACCACCACCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCACCGGTGTACCACTCTCCACCGCCACCGGTGTACCACTCTCCACCGCCACCGGTCTATTACTACTCATCACCACCACCTCCACACTACTAG
BLAST of CmoCh15G006120 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN3_ARATH (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 337.4 bits (864), Expect = 2.1e-91
Identity = 276/422 (65.40%), Postives = 283/422 (67.06%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPP-------PVYHSPPPP 63
           MGS  A L+    +  +SL   S ++ANY Y+SPPPP K Y PP       PVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 64  KKSYYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSP 123
           KK Y     Y SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 61  KKHYE----YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 120

Query: 124 PPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 183
           PPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 121 PPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 180

Query: 184 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV 243
           PPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 181 PPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPV 240

Query: 244 Y-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 303
           Y SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y 
Sbjct: 241 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 300

Query: 304 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYY----PPPVYHSP 363
           PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y     PPPV H  
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 360

Query: 364 PPPVYHSPPPP----VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYYYSSPPP 390
           PPPVYHSPPPP    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV +YS PP 
Sbjct: 361 PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPV 391

BLAST of CmoCh15G006120 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN1_ARATH (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 326.2 bits (835), Expect = 4.7e-88
Identity = 258/393 (65.65%), Postives = 267/393 (67.94%), Query Frame = 1

Query: 15  AFLAI-LSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPP- 74
           +FL +  SL   S T+ANY Y+SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP 
Sbjct: 3   SFLVLAFSLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPV 62

Query: 75  KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 134
           K Y PPPVY SPPPP K Y PPPV   PP       PPVY SPPPP K Y PPPVY SPP
Sbjct: 63  KHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPP-------PPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPP 122

Query: 135 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 194
           PP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 123 PPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVY 182

Query: 195 HSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 254
            SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y P
Sbjct: 183 KSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSP 242

Query: 255 PPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKV 314
           PPVY SPPPP     PP VYHSPPPP     PP VYHSPPPP  V+Y P           
Sbjct: 243 PPVYKSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPP--VHYSP----------- 302

Query: 315 YYPPPVYSPPPPKKVYYPPP-VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVY---YPPPVYHS 374
             PP VY  PPP   Y PPP VYHSPPPPV++SPPP VYHSPPPPKK Y    PPP  H 
Sbjct: 303 --PPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHY 362

Query: 375 PPPPVYHSPPPPVYYYS---------SPPPPHY 391
            PP VYHSPPPPV++YS         SPPPPHY
Sbjct: 363 SPPTVYHSPPPPVHHYSPPHQPYLYKSPPPPHY 373

BLAST of CmoCh15G006120 vs. Swiss-Prot
Match: LRX1_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 2.7e-35
Identity = 159/281 (56.58%), Postives = 167/281 (59.43%), Query Frame = 1

Query: 32  YVYASPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKSYYPPP--VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPP 91
           YVY+SPPPP  VY  PP    VY SPPPP     PPP  VY SPPPP    PPP   S P
Sbjct: 479 YVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPPPSPPPPCPESSP 538

Query: 92  PPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH 151
           PP  VYY P  +SPPPP  VYYPP V  SPPPP  VYYPP V +SPPPP  VYYPP  Y 
Sbjct: 539 PPPVVYYAPVTQSPPPPSPVYYPP-VTQSPPPPSPVYYPP-VTNSPPPPSPVYYPPVTY- 598

Query: 152 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 211
           SPPPP  VYYP  V  SPPPP  +YYPP V  SPPPP  VYYPP V  SPPPP  VYYPP
Sbjct: 599 SPPPPSPVYYPQ-VTPSPPPPSPLYYPP-VTPSPPPPSPVYYPP-VTPSPPPPSPVYYPP 658

Query: 212 PVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK--KVYYPPPVYHSPPPPKKV 271
              SPPPP  VYYP    SPPPP + YY P    SPPP K  K  +PP    S       
Sbjct: 659 VTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPPTEYYYSPS--QSPPPTKACKEGHPPQATPS------- 718

Query: 272 YYPPPVY---HSPPPPKKVYYPPPV----YHSPPPPKKVYY 298
           Y PPP Y    SPPPP    Y PP+    Y + PPP   YY
Sbjct: 719 YEPPPEYSYSSSPPPPSPTSYFPPMPSVSYDASPPPPPSYY 744

BLAST of CmoCh15G006120 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN_DAUCA (Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 141.0 bits (354), Expect = 2.8e-32
Identity = 176/363 (48.48%), Postives = 199/363 (54.82%), Query Frame = 1

Query: 1   MGKM--GSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKK 60
           MG++  GS  + L+    + ++SLNL S T+A Y Y+SPPPP+         HSPPPP+ 
Sbjct: 1   MGRIARGSKMSSLIVSLLVVLVSLNLASETTAKYTYSSPPPPE---------HSPPPPEH 60

Query: 61  SYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHS 120
           S  PP  Y SPPPPK        HSPPPP  VY     PPP+ SPPPP     PPP  HS
Sbjct: 61  SPPPPYHYESPPPPK--------HSPPPPTPVYKYKSPPPPMHSPPPPYHFESPPPPKHS 120

Query: 121 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH----SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 180
           PPPP  VY     Y SPPPPK  + P PV+H    SPPPP  VY     Y SPPPPK  +
Sbjct: 121 PPPPTPVY----KYKSPPPPK--HSPAPVHHYKYKSPPPPTPVY----KYKSPPPPK--H 180

Query: 181 YPPPVYH----SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP 240
            P P +H    SPPPPK  ++P P +H         Y     SPPPP  VY      SPP
Sbjct: 181 SPAPEHHYKYKSPPPPK--HFPAPEHH---------YKYKYKSPPPPTPVY---KYKSPP 240

Query: 241 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH----SPPPPKKVY-YPPPVYHSPPPPKKVY- 300
           PP  VY     Y SPPPPK  + P PV+H    SPPPP  VY  PPP  HSPPPP  VY 
Sbjct: 241 PPTPVY----KYKSPPPPK--HSPAPVHHYKYKSPPPPTPVYKSPPPPEHSPPPPTPVYK 300

Query: 301 --YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 342
              PPP  HSPPPP  VY     Y  PPP     PPPVYSPPPPK  Y     Y SPPPP
Sbjct: 301 YKSPPPPMHSPPPPTPVY----KYKSPPPPMHSPPPPVYSPPPPKHHY----SYTSPPPP 306

BLAST of CmoCh15G006120 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN2_ARATH (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 137.1 bits (344), Expect = 4.1e-31
Identity = 199/384 (51.82%), Postives = 210/384 (54.69%), Query Frame = 1

Query: 32  YVYASPPPPK-----KVYY----PPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKVYY-PPPVY 91
           YVY+SPPPP      KVYY    PP VY SPPPP  S  P   Y SPPPP VY  PPP Y
Sbjct: 400 YVYSSPPPPTYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPY 459

Query: 92  HSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKV 151
           +SP P  KVYY    KSPPPP     PPP Y+SP P  KVYY    PP VY SPPPP   
Sbjct: 460 YSPSP--KVYY----KSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYS 519

Query: 152 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 211
             P   Y SPPPP     PPP Y+SP P  KV+     Y SPPPP     PPP Y+SP P
Sbjct: 520 PSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVH-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP 579

Query: 212 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 271
             KV+Y     SPPPP     PPP Y  P P KVY     Y SPPPP     PPP Y+SP
Sbjct: 580 --KVHYK----SPPPPYVYNSPPPPYYSPSP-KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSP 639

Query: 272 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY---PPPVYSPPPPKKVYYPP 331
            P  KVY     Y SPPPP     PPP Y+SP P  KVYY   PPP YSP P  KVYY  
Sbjct: 640 SP--KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYYSPSP--KVYYK- 699

Query: 332 PVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYH- 391
              SPP P     P      PPPP Y   P  VY SPPPP     PPP Y+SP P VY+ 
Sbjct: 700 ---SPPHPHVCVCP------PPPPCYSPSPKVVYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVYYK 735

BLAST of CmoCh15G006120 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K8S7_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 578.9 bits (1491), Expect = 4.5e-162
Identity = 355/399 (88.97%), Postives = 361/399 (90.48%), Query Frame = 1

Query: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60
           MGKMGSS AP+LF AF+A+LSL LPSTT+ANY+YASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60

Query: 61  YPPPVYHSPPPPK-VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPP 120
           YPPPVYHSPPPPK VYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPV KSPPPP KVYYPPPVY SPPPP
Sbjct: 61  YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPP 120

Query: 121 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHS 180
           KKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY S
Sbjct: 121 KKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-S 180

Query: 181 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240
           PPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 181 PPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240

Query: 241 HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 300
            SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY  PPPPKKVYYP
Sbjct: 241 -SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-PPPPPKKVYYP 300

Query: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPP------PPVYHSPPPPVYHSPP 360
           PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY  PP      PP  +SPPPPVYHSP 
Sbjct: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPVYHSP- 360

Query: 361 PPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS-PPPPHY 391
                  PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS PPPPHY
Sbjct: 361 -------PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSSPPPPPHY 385

BLAST of CmoCh15G006120 vs. TrEMBL
Match: A0A0D3CC16_BRAOL (Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 7.8e-90
Identity = 272/423 (64.30%), Postives = 280/423 (66.19%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
           MGS  A L+    +  +SL   S ++ANY Y+SPPPP K Y     Y SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQ----YKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 64  PVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPP 123
           PVYHSPPPPK +Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPP
Sbjct: 61  PVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---EYKSPPPPVKHYSPPP 120

Query: 124 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPP 183
           VYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPP
Sbjct: 121 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVMHYSPPP 180

Query: 184 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVY 243
           VYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y
Sbjct: 181 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 240

Query: 244 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 303
            PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP
Sbjct: 241 SPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPP 300

Query: 304 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSP 363
            K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY PPPP K +Y   VY SP
Sbjct: 301 VKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHPPPPPKKHY---VYKSP 360

Query: 364 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVYHSPPPP--VYYYSSPPPP- 391
           PPPV H  PPPVYHSPPPPKK Y     PPPV H  PPPVYHSPPPP   Y Y SPPPP 
Sbjct: 361 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKKYVYKSPPPPV 389

BLAST of CmoCh15G006120 vs. TrEMBL
Match: D7KTY3_ARALL (Predicted protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_476851 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 309.7 bits (792), Expect = 5.1e-81
Identity = 244/409 (59.66%), Postives = 251/409 (61.37%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
           MGS  A  L  AF    SL   S T+ANY Y+SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 64  PVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 123
           PVY                              KSPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y 
Sbjct: 61  PVY------------------------------KSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYS 120

Query: 124 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 183
           PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP 
Sbjct: 121 PPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPV 180

Query: 184 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 243
           K Y PPPVY SPPPP                         SPPPP K Y PPPVY SPPP
Sbjct: 181 KHYSPPPVYKSPPPP-------------------------SPPPPVKHYSPPPVYKSPPP 240

Query: 244 PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYS 303
           P K Y PPPVY S PPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 241 PVKHYSPPPVYKSAPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYK 300

Query: 304 PPPPKKVYYPPPV--YSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY-- 363
            PPP   Y PPPV  +SPPPP     PP VYHSPPPPV++SPPP VYHSPPPPKK Y   
Sbjct: 301 SPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHYEYK 350

Query: 364 ---------PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYS---------SPPPPHY 391
                    PPPVYHSPPPPVYHSPPPPV++YS         SPPPPHY
Sbjct: 361 SPPPPVHYSPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVHHYSPPHQPYLYKSPPPPHY 350

BLAST of CmoCh15G006120 vs. TrEMBL
Match: A0A0D3CWA0_BRAOL (Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 263.5 bits (672), Expect = 4.2e-67
Identity = 243/423 (57.45%), Postives = 251/423 (59.34%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
           MGS  A L     +  LSL   S T+ANY Y+SPPPP K +Y PPVY SPPP  K Y  P
Sbjct: 1   MGSPVAFLAAALLVLALSLGFVSETTANYYYSSPPPPVK-HYTPPVYKSPPPLIKHYPAP 60

Query: 64  PVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYY-------------PPP 123
           PVY SPPPPK  Y    Y SPPPP K Y P PV   PPPPK +Y             PPP
Sbjct: 61  PVYKSPPPPKKQYE---YKSPPPPVKHYSPRPVYKSPPPPKKHYEYKSPPPPVYQSPPPP 120

Query: 124 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 183
           VYHSPPPPKK Y     Y SPPPP     PPP YHSPPPPKK Y     Y SPPPP    
Sbjct: 121 VYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVYQS 180

Query: 184 YPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP 243
            PPP YHSPPPPKK Y     PPPVY SPP       PP  +SPPPPKK Y      SPP
Sbjct: 181 PPPPAYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVYQSPP-------PPAYHSPPPPKKHY---EYKSPP 240

Query: 244 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----P 303
           PP     PPP YHSPPPPKK Y     Y SPPPP     PPP YHSPPPPKK Y     P
Sbjct: 241 PPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHYEYKSPP 300

Query: 304 PPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY----PPPVYSPPPPKKVYYPPP-----VYH 363
           PPVY SPP       PP  +SPPPPKK Y     PPPVY  PPP   + PPP      Y 
Sbjct: 301 PPVYQSPP-------PPAYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHYEYK 360

Query: 364 SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVYHSPPPPV--YYYSSPPP 391
           SPPPPVY SPPPP YHSPPPPKK Y     PPPVY SPPPP YHSPPPP   Y Y SPPP
Sbjct: 361 SPPPPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVYQSPPPPAYHSPPPPKKHYEYKSPPP 390

BLAST of CmoCh15G006120 vs. TrEMBL
Match: A0A078IGQ4_BRANA (BnaC06g18710D protein OS=Brassica napus GN=BnaC06g18710D PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 260.0 bits (663), Expect = 4.6e-66
Identity = 235/397 (59.19%), Postives = 247/397 (62.22%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
           MGS  A L     +  LSL   S T+ANY Y+SPPPP K +Y PPVY SPPP  K Y  P
Sbjct: 1   MGSPVAFLAAALLVLALSLGFVSETTANYYYSSPPPPVK-HYTPPVYKSPPPLIKHYPAP 60

Query: 64  PVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 123
           PVY SPPPPK  Y    Y SPPPP K Y P PV   PPPPK +Y    Y SPPPP     
Sbjct: 61  PVYKSPPPPKKQYE---YKSPPPPVKHYSPRPVYKSPPPPKKHYE---YKSPPPPVYQSP 120

Query: 124 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 183
           PPPVYHSPPPPKK Y     Y SPPPP     PPPVYHSPPPPKK Y     Y SPPPP 
Sbjct: 121 PPPVYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVYQSPPPPVYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPV 180

Query: 184 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYH 243
               PPPVYHSPPPPKK Y     PPPVY  PP      PP  +SPPPPKK Y     Y 
Sbjct: 181 YQSPPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVYQSPP------PPVYHSPPPPKKHY----EYK 240

Query: 244 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY-- 303
           SPPPP     PPPVYHSPPPPKK Y     Y SPPPP     PPPVYHSPPPPKK Y   
Sbjct: 241 SPPPPVYQSPPPPVYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVYQSPPPPVYHSPPPPKKHYEYK 300

Query: 304 --PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPK 363
             PPPVY  PP      PP  +SPPPPKK Y     Y SPPPPV+ SPPPPVYHSPPPPK
Sbjct: 301 SPPPPVYQSPP------PPVYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVFQSPPPPVYHSPPPPK 358

Query: 364 KVYY--PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSSPPPPHY 391
              Y  PPP  HSPPPPV++SPP   Y Y SPPPP++
Sbjct: 361 HYEYKSPPPPVHSPPPPVHYSPPHQPYLYKSPPPPYH 358

BLAST of CmoCh15G006120 vs. TAIR10
Match: AT1G21310.1 (AT1G21310.1 extensin 3)

HSP 1 Score: 337.4 bits (864), Expect = 1.2e-92
Identity = 276/422 (65.40%), Postives = 283/422 (67.06%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPP-------PVYHSPPPP 63
           MGS  A L+    +  +SL   S ++ANY Y+SPPPP K Y PP       PVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 64  KKSYYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSP 123
           KK Y     Y SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 61  KKHYE----YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 120

Query: 124 PPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 183
           PPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 121 PPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 180

Query: 184 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV 243
           PPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 181 PPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPV 240

Query: 244 Y-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 303
           Y SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y 
Sbjct: 241 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 300

Query: 304 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYY----PPPVYHSP 363
           PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y     PPPV H  
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 360

Query: 364 PPPVYHSPPPP----VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYYYSSPPP 390
           PPPVYHSPPPP    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV +YS PP 
Sbjct: 361 PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPV 391

BLAST of CmoCh15G006120 vs. TAIR10
Match: AT2G24980.1 (AT2G24980.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 158.3 bits (399), Expect = 9.6e-39
Identity = 203/377 (53.85%), Postives = 216/377 (57.29%), Query Frame = 1

Query: 32  YVYASPPPP-----KKVYY----PPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKVYY-PPPVY 91
           YVY+SPPPP      KVYY    PP VY SPPPP  S  P   Y SPPPP VY  PPP Y
Sbjct: 177 YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPY 236

Query: 92  HSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKV 151
           +SP P  KVYY    KSPPPP     PPP Y+SP P  KVYY    PP VY SPPPP   
Sbjct: 237 YSPSP--KVYY----KSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYS 296

Query: 152 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 211
             P   Y SPPPP     PPP Y+SP P  KVY     Y SPPPP     PPP Y+SP P
Sbjct: 297 PSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP 356

Query: 212 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 271
             KVYY     SPPPP     PPP Y  P P KVY     Y SPPPP     PPP Y+SP
Sbjct: 357 --KVYYK----SPPPPYVYSSPPPPYYSPSP-KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSP 416

Query: 272 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 331
            P  KVY     Y SPPPP     PPP Y+SP P  KVYY     SPPPP     PPP Y
Sbjct: 417 SP--KVY-----YKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSP--KVYYK----SPPPPYVYSSPPPPY 476

Query: 332 SPPPPKKVYY---PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVY-YPPPVYHSPPPPVYH 391
             P P KVYY   PPP  +S PPP Y+SP P VY+  PPP  VY  PPP Y+SP P VY+
Sbjct: 477 YSPSP-KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPSYVYSSPPPPYYSPSPKVYY 512

BLAST of CmoCh15G006120 vs. TAIR10
Match: AT1G23720.1 (AT1G23720.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 1.8e-37
Identity = 197/380 (51.84%), Postives = 209/380 (55.00%), Query Frame = 1

Query: 32  YVYASPPPP-----KKVYY----PPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKVYY-PPPVY 91
           YVY+SPPPP      KV Y    PP VY SPPPP  S  P P Y SPPPP VY  PPP Y
Sbjct: 86  YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPTYKSPPPPYVYNSPPPPY 145

Query: 92  HSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKV 151
           +SP P  KV Y    KSPPPP     PPP Y+SP P  KV Y    PP VY+SPPPP   
Sbjct: 146 YSPSP--KVEY----KSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVDYKSPPPPYVYNSPPPPYYS 205

Query: 152 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 211
             P P Y SPPPP        +Y SPPPP     P PVY SPPPP        VY SPPP
Sbjct: 206 PSPKPTYKSPPPPY-------IYSSPPPPYYSPSPKPVYKSPPPPY-------VYSSPPP 265

Query: 212 PKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY--PPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH 271
           P     P P Y  PPP  VY   PPP YSP        P P+Y SPPPP        VY+
Sbjct: 266 PYYSPSPKPAYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPS-------PKPIYKSPPPPY-------VYN 325

Query: 272 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVY-YPP 331
           SPPPP     P P Y SPPPP    +PPP Y+SP        P PVY  PPP  VY  PP
Sbjct: 326 SPPPPYYSPSPKPAYKSPPPPYVYSFPPPPYYSPS-------PKPVYKSPPPPYVYNSPP 385

Query: 332 PVYSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP-PPP 391
           P Y  P PK  Y  PP   VY SPPPP Y   P P Y SPPPP     PPP Y+SP P P
Sbjct: 386 PPYYSPSPKPAYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPTYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKP 421

BLAST of CmoCh15G006120 vs. TAIR10
Match: AT1G76930.1 (AT1G76930.1 extensin 4)

HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 1.8e-37
Identity = 114/174 (65.52%), Postives = 117/174 (67.24%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
           MG+  A  L  AF    SL   S T+ANY Y+SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGAPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 64  PVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 123
           PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPV   PP       PPVY SPPPP K Y
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPP-------PPVYKSPPPPVKHY 120

Query: 124 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 177
            PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPP Y
Sbjct: 121 SPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPSY 163

BLAST of CmoCh15G006120 vs. TAIR10
Match: AT1G12040.1 (AT1G12040.1 leucine-rich repeat/extensin 1)

HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 1.5e-36
Identity = 159/281 (56.58%), Postives = 167/281 (59.43%), Query Frame = 1

Query: 32  YVYASPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKSYYPPP--VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPP 91
           YVY+SPPPP  VY  PP    VY SPPPP     PPP  VY SPPPP    PPP   S P
Sbjct: 479 YVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPPPPPPSPPPPCPESSP 538

Query: 92  PPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH 151
           PP  VYY P  +SPPPP  VYYPP V  SPPPP  VYYPP V +SPPPP  VYYPP  Y 
Sbjct: 539 PPPVVYYAPVTQSPPPPSPVYYPP-VTQSPPPPSPVYYPP-VTNSPPPPSPVYYPPVTY- 598

Query: 152 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 211
           SPPPP  VYYP  V  SPPPP  +YYPP V  SPPPP  VYYPP V  SPPPP  VYYPP
Sbjct: 599 SPPPPSPVYYPQ-VTPSPPPPSPLYYPP-VTPSPPPPSPVYYPP-VTPSPPPPSPVYYPP 658

Query: 212 PVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK--KVYYPPPVYHSPPPPKKV 271
              SPPPP  VYYP    SPPPP + YY P    SPPP K  K  +PP    S       
Sbjct: 659 VTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPPTEYYYSPS--QSPPPTKACKEGHPPQATPS------- 718

Query: 272 YYPPPVY---HSPPPPKKVYYPPPV----YHSPPPPKKVYY 298
           Y PPP Y    SPPPP    Y PP+    Y + PPP   YY
Sbjct: 719 YEPPPEYSYSSSPPPPSPTSYFPPMPSVSYDASPPPPPSYY 744

BLAST of CmoCh15G006120 vs. NCBI nr
Match: gi|700190951|gb|KGN46155.1| (hypothetical protein Csa_6G058200 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 578.9 bits (1491), Expect = 6.5e-162
Identity = 355/399 (88.97%), Postives = 361/399 (90.48%), Query Frame = 1

Query: 1   MGKMGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60
           MGKMGSS AP+LF AF+A+LSL LPSTT+ANY+YASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60

Query: 61  YPPPVYHSPPPPK-VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPP 120
           YPPPVYHSPPPPK VYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPV KSPPPP KVYYPPPVY SPPPP
Sbjct: 61  YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPP 120

Query: 121 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHS 180
           KKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY S
Sbjct: 121 KKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-S 180

Query: 181 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240
           PPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 181 PPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 240

Query: 241 HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP 300
            SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY  PPPPKKVYYP
Sbjct: 241 -SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-PPPPPKKVYYP 300

Query: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPP------PPVYHSPPPPVYHSPP 360
           PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY  PP      PP  +SPPPPVYHSP 
Sbjct: 301 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPVYHSP- 360

Query: 361 PPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS-PPPPHY 391
                  PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS PPPPHY
Sbjct: 361 -------PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSSPPPPPHY 385

BLAST of CmoCh15G006120 vs. NCBI nr
Match: gi|922497463|ref|XP_013587003.1| (PREDICTED: extensin-3 [Brassica oleracea var. oleracea])

HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 1.1e-89
Identity = 272/423 (64.30%), Postives = 280/423 (66.19%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
           MGS  A L+    +  +SL   S ++ANY Y+SPPPP K Y     Y SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQ----YKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 64  PVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPP 123
           PVYHSPPPPK +Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPP
Sbjct: 61  PVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---EYKSPPPPVKHYSPPP 120

Query: 124 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPP 183
           VYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPP
Sbjct: 121 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVMHYSPPP 180

Query: 184 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVY 243
           VYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y
Sbjct: 181 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 240

Query: 244 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 303
            PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP
Sbjct: 241 SPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPP 300

Query: 304 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSP 363
            K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY PPPP K +Y   VY SP
Sbjct: 301 VKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHPPPPPKKHY---VYKSP 360

Query: 364 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVYHSPPPP--VYYYSSPPPP- 391
           PPPV H  PPPVYHSPPPPKK Y     PPPV H  PPPVYHSPPPP   Y Y SPPPP 
Sbjct: 361 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKKYVYKSPPPPV 389

BLAST of CmoCh15G006120 vs. NCBI nr
Match: gi|923925548|ref|XP_013731769.1| (PREDICTED: extensin-3-like [Brassica napus])

HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 1.1e-89
Identity = 280/448 (62.50%), Postives = 287/448 (64.06%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPP------------KKVYYPPPVYH 63
           MGS  A L+    +  +SL   S ++ANY Y+SPPPP             K Y PPPVYH
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQYKSPPPPVKHYSPPPVYH 60

Query: 64  SPPPPKKSYY------------PPPVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPP 123
           SPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPK +Y             PPPVYHSPPP
Sbjct: 61  SPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPP 120

Query: 124 PKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHS 183
           PKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHS
Sbjct: 121 PKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 180

Query: 184 PPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHS 243
           PPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHS
Sbjct: 181 PPPPKKHYVYKSPPPPVMHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 240

Query: 244 PPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 303
           PPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPP
Sbjct: 241 PPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPP 300

Query: 304 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVY 363
           VYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y
Sbjct: 301 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 360

Query: 364 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHS 391
            PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPPV H  PPPVYHSPPPPKK Y     PPPV H 
Sbjct: 361 SPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY 417

BLAST of CmoCh15G006120 vs. NCBI nr
Match: gi|15218966|ref|NP_173553.1| (extensin 3 [Arabidopsis thaliana])

HSP 1 Score: 337.4 bits (864), Expect = 3.3e-89
Identity = 276/422 (65.40%), Postives = 283/422 (67.06%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPP-------PVYHSPPPP 63
           MGS  A L+    +  +SL   S ++ANY Y+SPPPP K Y PP       PVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 64  KKSYYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPPVYHSP 123
           KK Y     Y SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 61  KKHYE----YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 120

Query: 124 PPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 183
           PPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSP
Sbjct: 121 PPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 180

Query: 184 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV 243
           PPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 181 PPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPV 240

Query: 244 Y-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 303
           Y SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y 
Sbjct: 241 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 300

Query: 304 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYY----PPPVYHSP 363
           PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y     PPPV H  
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 360

Query: 364 PPPVYHSPPPP----VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVYYYSSPPP 390
           PPPVYHSPPPP    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV +YS PP 
Sbjct: 361 PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPV 391

BLAST of CmoCh15G006120 vs. NCBI nr
Match: gi|923644285|ref|XP_013642307.1| (PREDICTED: extensin-3 [Brassica napus])

HSP 1 Score: 334.3 bits (856), Expect = 2.8e-88
Identity = 273/424 (64.39%), Postives = 280/424 (66.04%), Query Frame = 1

Query: 4   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTSANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63
           MGS  A L+    +  +SL   S ++ANY Y+SPPPP K Y     Y SPPPP K Y P 
Sbjct: 1   MGSPVASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQ----YKSPPPPVKHYSPS 60

Query: 64  PVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPPKVYYPPP 123
           PVYHSPPPPK +Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPP
Sbjct: 61  PVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKDYV---YKSPPPPVKHYSPPP 120

Query: 124 VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 183
           VYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y
Sbjct: 121 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 180

Query: 184 YPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVY 243
            PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y
Sbjct: 181 SPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 240

Query: 244 YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 303
            PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP
Sbjct: 241 SPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPP 300

Query: 304 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHS 363
            K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY S
Sbjct: 301 VKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKS 360

Query: 364 PPPPVYHSPPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVYHSPPPP--VYYYSSPPPP 391
           PPPPV H  PPPVYHSPPPPKK Y     PPPV H  PPPVYHSPPPP   Y Y SPPPP
Sbjct: 361 PPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKKYVYKSPPPP 389

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
EXTN3_ARATH2.1e-9165.40Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3[more]
EXTN1_ARATH4.7e-8865.65Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2[more]
LRX1_ARATH2.7e-3556.58Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX1 PE=1... [more]
EXTN_DAUCA2.8e-3248.48Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1[more]
EXTN2_ARATH4.1e-3151.82Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0K8S7_CUCSA4.5e-16288.97Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1[more]
A0A0D3CC16_BRAOL7.8e-9064.30Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1[more]
D7KTY3_ARALL5.1e-8159.66Predicted protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_476851 PE=4 ... [more]
A0A0D3CWA0_BRAOL4.2e-6757.45Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1[more]
A0A078IGQ4_BRANA4.6e-6659.19BnaC06g18710D protein OS=Brassica napus GN=BnaC06g18710D PE=4 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G21310.11.2e-9265.40 extensin 3[more]
AT2G24980.19.6e-3953.85 Proline-rich extensin-like family protein[more]
AT1G23720.11.8e-3751.84 Proline-rich extensin-like family protein[more]
AT1G76930.11.8e-3765.52 extensin 4[more]
AT1G12040.11.5e-3656.58 leucine-rich repeat/extensin 1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|700190951|gb|KGN46155.1|6.5e-16288.97hypothetical protein Csa_6G058200 [Cucumis sativus][more]
gi|922497463|ref|XP_013587003.1|1.1e-8964.30PREDICTED: extensin-3 [Brassica oleracea var. oleracea][more]
gi|923925548|ref|XP_013731769.1|1.1e-8962.50PREDICTED: extensin-3-like [Brassica napus][more]
gi|15218966|ref|NP_173553.1|3.3e-8965.40extensin 3 [Arabidopsis thaliana][more]
gi|923644285|ref|XP_013642307.1|2.8e-8864.39PREDICTED: extensin-3 [Brassica napus][more]
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh15G006120.1CmoCh15G006120.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CmoCh15G006120Cp4.1LG13g04140Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB268
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None