CmoCh12G011870 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)

NameCmoCh12G011870
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr12 : 10712692 .. 10721016 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCAAAGGTAAATTTCCCCCAATTTTCGGTGTATAAATCGTCTGGAAATGCGTTTTGGTTTTGCACAACTTTTTATTCATCGAGCAACTTATATGTATGCAATTGCCTGTGTTTATATAGCATATTCTAATTTTTTAACATAATTTTCATATTGTTCTTGTCTATATATATATATGTGAAAATTGTTCTTATTTGAAGACTTTTGTTTCGTTAAGATTTCTTTAAAATTACTTGCTACAATAAAATTTTTAGAATTATGATTGATATTCGAACAGTTTTCCATTGTTTGAAGACGCTTTTGCCGACTTACACAAATTTGTTTTACATTTTCTATTTCTACAGTAAGAAATTCATAAATAGTTACTTCTTGTATACTGAAGAATGGTTGAATTTTATTCTGTAAATGAAGAAATATTACTTCAATAATGAGTCGATCTTACTAAATAAATTATTGAATCACAACAAATAAGATATGACATCGATTAGTATTGATAATTAGTAATCTCTTAAATCATTAAATTGATGCGACTTGGGACTGGCGTGGTGTGTTTATGGCTATTATTTCACATGCATGATCAATTATGACTCTTTTTCAATAATTATTAAAAATATGTATTTGATATTTAATATACTTTTAAAACTGAATCCAGGCCTATTTAAGAATCTTCTTTTTATTTTTATATTTTTAAAACACAAATAATTTTTTTTATTTTTAATTGAATTTATATTTTTTTTTCTATTTGATTTTAAGCATTTAAAACAATTTTCAAAATATTTATTTTAGTTATAGAACTTTTTTTTAAAATACTATTTTTATATAGGTTTTTATATAAAATATATTTTTAACTTTGCACCGTCTTACGAAAATAATCTAAATTTTTACTTTTAATAATATTCTTAAAGTTTTAAAATATATTTATTATTATTAAATAAATGAAAATAGTTGATAACTCAAAAGTCGGTTACAATTAGTAATTAAGCAAAAGCTGTTTATGCATACTCCATCAAATAGAAAAGAAAAAAAAAAGAACTTATTACTATTTTTTTTTTTAAAGGACACTCTTTTGGTGCGTTTAGGCTAAGTTGGATGAAAGTCTAATTTAGAAAATGATCATGAAAGTCTCATATGAGGAGTTTATAATAAAAAAATATCATCTTCATTGGTGTTCATTGGTGTGAGGCTTTTTAAAGGTCTCACATCGGCTAATTTAAGGAAGGATCATGAGTTTATAATCATGAGGCCTTTTGGAGGAAAAGCTCAAAGCAAAGCGCAAAAGCTTATACTCAAAGTGGACAATATTATATTATTGTGGAGAGTCATGTTCTAAACTTAGCCATGTCAATACATGAGTATCATAGTCATGTTCTAAACTTAGCCATGTCAATACATGAGTATCATAGTCATGTTCTAAACTTAGCCATGTCAATACATGGGTATCATAGTCATGTTCTAAACTTAGCCATGTCAATACATGGTTTGAGAGTCCATCTAACATGGTATCAAAGTCATGTCTTAAACTTAGTCATGACAATACATGGTACCTAACATGGTATCAGAGTCATGTTCTAATGTCAATACATGGTATCAGAGTCATGTCCTAACGTCAATACATGGTATCAGAGTCATGTCCTAACGTCAATACATGGTATCAGAGTCATGTCCTAACGTCAATACATGGTATCAGAGTCATGTCCTAATGTCAATACATGGTATCAGAGTCATGTCCTAATGTCAATACATGGTATCAGAGTCATGTCCTAATGTCAATACATGGTATCAGAGTCATGTCCTAATGTCAATACATAGTATTAGAGTCATGTCCTAAACTTAGCCATGTCAATACATGGTCGACAATAGAATCCTCAGATGTCGAACAAGTATTGTGAGCCTCTAATGCATAGTAAAAATGGAAAAATGGAAGGAGAGGTTGAGATGAGATGTTGGATGAAAGTCCAGGTCGACTAATGAAGGGAATGATCATGGTACTTTATCTTGAGCCCTTTTGAAAAAGCCCAAAACAAACTCACCTAAGAGAGCTTATGTTTAGGACAATATCAACCCAGAATGAAGCACGAAACCAATTTCAATTTTCCATTCACGGTCGCGGAAGATCATGGTGAGTCTACAATGGAAGAAATTTTCAATTTCTATCCATTATCATTCCCCTTGCCAGAATATTCCTTAAGCTCATTAGTAACGAAGAAAGAGAGAAAGAAACAGTCGATCGGAAAGCCAGATGCTGCCGAAAAGATTTCCATGGCAGATTTCATAGAAATCAGGTACAAATTCAGAAGAAGACAGAGAAAAAAAAACAAGATATATATATGTACATACACCAAAAAAAAAAAACGTAAGATCGCATATCTGGATCACCAACTGTTCTCCAAACACAAAGAAGACCAAATTTCAATCCTCGCCATCTATATCACTGCAAATTGTAAAACACACGAACGGATCCAATAACATTTTTCAGATCACAGAAACATGGAAAAAAATAAAATAAAAAAGTCACAATTAAAAACCGCATCTCATCTCATCTCATCTGGTTCCAAATTATTAAACATCAAGGGCAGGAAAATCAACTCCTAAATTGTAGAAAACAATAGAATACGAAGAACGGAAAAATCAACTCCTGTTAAACTGAACAGGAGCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGCTCAAAGCGGCACCAGGCTGTGAGGACTTACCGACGACAGGGGAGGAGGAAGGGGAAGAGGAAGGAGAGGCGAAGGCGAGCGTCAAGCAACCTTCGCTCCAGGATCGGCGAATGGGATAGGAGACGGATTTGTACTTGGAATGGTAGCAGTGGGAAAGTTGACGGCGGGATTCGTGGAGAGCGCAGCCGCAGTTGCGATGGTAGGGACGACGGTGGATCTCGGAGTCACAGCCGGCGATGCAAGCCTCGTAGACGGGGCGGAGGACGCCGTCGGCGGCCATGGAAGAACGAGGAGGAAGGAGATGACCGACCACCACGTGCCCGGAAGGTGTTTGAAGAAAAGCGCGAGAGAGTGAAAGGTGAAGGGAGGAGAGGGAGTATTTATAGGCGCCAAAAATGCGCAAGGGAAGGCCTGGTTCGTGGAGAACGGGGGAATAAAGAGGCGAAGGGCGTTGTTTTTTATAATTTATTATAAATATTAATATTATAAATTAAAACTAAATTTATTTTTATTTTTATTTAATATTAATATTATAAATTAATTTATTAATTAATAATTTTAGCTTAAAATAAATATTAATATTATTTTGTTTTTGTGCTTAAGATTTATTAATATTTTAATTTTAATTTAGCTTAAAATAAAATTTATTTTATTTTAATGTTTTTATTTTCAAATTTAAATAAATCTTATGATTGGTCTTTATTAAAATAATATACTAATTTTTATACAATAAAAAATATATTTAAATATATTTATGAAATTTATATAGATAAATTTAATAAAATATTTTTTTATAAAAAAAAAAGTTAATTAATTTATTAAATATATAGGGAGAGAATTTTGACCAATAAAATCAGTCAAAATATATAAAAAAATAAATTTTAAAAACAAAATAAGGACTCAATTTATAATTTTAAAATTTCAAATATTAAATATAAATTTCAAATTTTATAGCCGGAGTTCTTAATCAGTACCCACTACTCCTAACCGTTTCACATAGAAAATGTGAGCCCACGTCCTACCGTCCATTAGATAAGGGAGAAGTCACGCCCCCCAATGAGAGGGACTATCATGGACCTAGGAGGTACTTAGCACACTCCTATGTAAAATACCATATAGTCTCAGATAGCCATGCAGAAGTAGAAAGACACCGACCAGTATAATGAACTCTCAAAGTTTAAATGAAACGAGAGAACCAGAATATATGAAATTTGTAATTTAATCTAATTGTTGGTTTAATTTCGATTTTGTTTTATTTTCTATTTATTTATCAATAACTTAATTTTCAATTTGAAAACTATCTTTTAAAATAAAATTTTCTTACATATTTTTAAATGTTATTAAAAGTAAATAATAAAACAAATAAAAAAATGCGCATATAGAGACATTTTCTTTCTATAGCTTTTATATATATATATATATATATATATATTTTATTTAATGTGACATTGAAATTAAATTTGTCTTATACACCTAACATCTTTGTTAACTATGTAGCATTGTATTATTATTATTATTATTTTTTAATATATAGTCTTTCATAGTGAAAATTTGTCACATCTAATATAGTAATACGGATAAAATTATTGATAAATACTAAGCTATATAACGGGAATTACATTGTATATTGACTTTTCATCGATCTCCTTAAATATATAAACAAGACATGCCTCTTCTCTTTACTAAGGTTTATGTACGAGGTTGGACTAGATTCTAGCTTGCCTTATCAACAAAGTCTGTTAGAGGATAAACGATTATCTACTATGATGACGTAAGGTGTTCGTGGGCTGAATTGGGTCGAGTTTGACCGTTTTTTAGATCAAATCCAAATATTCGGGTTATAAATTTTTTCAACCTAAACAATTCTTATTAAATAATGAACACACTTAATCCAATCATAAAATCTTTCAGTTGGGTTAGTTTAAGTTGTTCAAGTCGCCACATTGGCTAATTTAGAGAATGATCATGGCTCGGTAAACAAATAATAGATTTTCATTGGTATGAGGCCTTTTCGGTAAGCCCAAAGTAAAGCCATGAGAACTTGTGTTCAAAGTGGACAATATCATCATTGTGGATATCCGTGATTCCTAACATGGTATCAGAGTCATACCCTAAACTTAGCCATGTCAATAGAATCCTCAAATGTCAAACAAAGTATTGTGAGTCTCGAACGTATAGTCAAAAGTGACTAAAGTAGGGTGCACTTTGTTCGAAAACTCCAAAAAAAGAGTCGAGCCTCAATTAAAGGAGGTTGTTCGAGAGCTCAATAGGCCTATGGTATCTACTTAATAAAAGTAAAAATATTAGTGTAAAATATTTATTTAT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mRNA sequence

ATGCCAAAGGAGCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGCTCAAAGCGGCACCAGGCTGTGAGGACTTACCGACGACAGGGGAGGAGGAAGGGGAAGAGGAAGGAGAGGCGAAGGCGAGCGTCAAGCAACCTTCGCTCCAGGATCGGCGAATGGGATAGGAGACGGATTTGTACTTGGAATGGTAGCAGTGGGAAAGTTGACGGCGGGATTCGTGGAGAGCGCAGCCGCAGTTGCGATGGTAGGGACGACGGTGGATCTCGGAGTCACAGCCGGCGATGCAAGCCTCGTAGACGGGGCGGAGGACGCCGTCGGCGGCCATGGAAGAACGAGGAGGAAGGAGATGACCGACCACCACGTGCCCGGAAGGTGTTTGAAGAAAAGCGCGAGAGAGTGAAAGGTGAAGGGAGGAGAGGGAGTATTTATAGGCGCCAAAAATGCGCAAGGGAAGGCCTGGTGCACACGGCATTTGGGCTCCTCCACGCGTACAGATCTCGAACTCGTGGCAGTTGTCTCTTCCGCCATAGCAATTTCTTCGGTTTCCAAATCTTGCCTTCTTCCTCCATCTCTGCAGCCGCTGCTGTTCCCCATTTCCCTTCTCGTGGGGGATCGTTCAGATCTCTGTACAAAGGTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCCAAAGGAGCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGCTCAAAGCGGCACCAGGCTGTGAGGACTTACCGACGACAGGGGAGGAGGAAGGGGAAGAGGAAGGAGAGGCGAAGGCGAGCGTCAAGCAACCTTCGCTCCAGGATCGGCGAATGGGATAGGAGACGGATTTGTACTTGGAATGGTAGCAGTGGGAAAGTTGACGGCGGGATTCGTGGAGAGCGCAGCCGCAGTTGCGATGGTAGGGACGACGGTGGATCTCGGAGTCACAGCCGGCGATGCAAGCCTCGTAGACGGGGCGGAGGACGCCGTCGGCGGCCATGGAAGAACGAGGAGGAAGGAGATGACCGACCACCACGTGCCCGGAAGGTGTTTGAAGAAAAGCGCGAGAGAGTGAAAGGTGAAGGGAGGAGAGGGAGTATTTATAGGCGCCAAAAATGCGCAAGGGAAGGCCTGGTGCACACGGCATTTGGGCTCCTCCACGCGTACAGATCTCGAACTCGTGGCAGTTGTCTCTTCCGCCATAGCAATTTCTTCGGTTTCCAAATCTTGCCTTCTTCCTCCATCTCTGCAGCCGCTGCTGTTCCCCATTTCCCTTCTCGTGGGGGATCGTTCAGATCTCTGTACAAAGGTTAG
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh12G011870.1CmoCh12G011870.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmoCh12G011870Melon (DHL92) v3.5.1cmomeB145
CmoCh12G011870Melon (DHL92) v3.5.1cmomeB161
CmoCh12G011870Watermelon (Charleston Gray)cmowcgB144
CmoCh12G011870Watermelon (Charleston Gray)cmowcgB156
CmoCh12G011870Watermelon (97103) v1cmowmB156
CmoCh12G011870Watermelon (97103) v1cmowmB169
CmoCh12G011870Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB147
CmoCh12G011870Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB169
CmoCh12G011870Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB178
CmoCh12G011870Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB148
CmoCh12G011870Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB173
CmoCh12G011870Cucumber (Gy14) v2cgybcmoB170
CmoCh12G011870Melon (DHL92) v3.6.1cmomedB160
CmoCh12G011870Melon (DHL92) v3.6.1cmomedB177
CmoCh12G011870Silver-seed gourdcarcmoB0356
CmoCh12G011870Silver-seed gourdcarcmoB1441
CmoCh12G011870Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB0171
CmoCh12G011870Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB0185
CmoCh12G011870Watermelon (97103) v2cmowmbB161
CmoCh12G011870Watermelon (97103) v2cmowmbB173
CmoCh12G011870Wax gourdcmowgoB0171
CmoCh12G011870Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB084
CmoCh12G011870Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB148
CmoCh12G011870Cucumber (Gy14) v1cgycmoB0359
CmoCh12G011870Cucumber (Gy14) v1cgycmoB0959
CmoCh12G011870Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB123
CmoCh12G011870Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB177
CmoCh12G011870Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB763
CmoCh12G011870Wild cucumber (PI 183967)cmocpiB146
CmoCh12G011870Wild cucumber (PI 183967)cmocpiB159
CmoCh12G011870Cucumber (Chinese Long) v2cmocuB147
CmoCh12G011870Cucumber (Chinese Long) v2cmocuB157