CmoCh09G013150 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCATGGTGGAGAGGAATCAATCCATTCAAATCACGAACCATGCAAGTGCTTGTGTTCTTCTCCAGCAAAGGTTGAACAATCTCGATCGTTCCATTTTTAGAAGCTAAGTGGAGAGGTGTCCTTTGCAGGGCATCAACTTCTCCAGCAAGTTCAAGCATGAGATTTAAAAGAAATCAAGTGAGTTCAAAGTGGCGATGCAAAACCGAAACGTGCAATGGAGTCTCAATGTTGTAAGAGCAGATTAAAACTCTTTGAATGATATTTTGGTAGCTTTGAATTAGTGTCTTTAAGCTTTGAATGGACTCGATCTTTGATGCTTCATAGAGCAATCGTTTGCTTTCTTTGATAGAGGACATGGCTAATCCAAGTTCGTTGCTTTCTCCGTTTGCAATATTGGAAGATTGTGCGAGTTGTTGATGAGTTGCATCCATTATTGAATATCTATCTTACTTTGAGATGGATTATTTACACTTATGATTCGAAAGTGAAAACAAAATATCACCATCCTAGTTAAGGTGGATGACAAGAAAAGATGACTATTTTACCCGTCAGTGAAGCATTTCAATTTAGACTAGAAATAGGGGAAGGGGTGGGGAACATTTTTATTCCGTTAGATAAAAGGGGTTGGGAACTCCGCCATATCTAATATAATATATATTTTTAGATAGATATCTTTTGAAATGGTTAGTAGTCAAATTTTGTCTATCAATTTTGAAGTGTCAAATTCTGTCTATCAATTTTAAAGTCTTTCTTCGGTATTAGAGCCAGGTTTCAATCTAGGGACATGTGGGTTATAGGCCCACCACGCTTCTGTTGCGACACTCTGATTTGTTAGACAGGAGGATGAGCTATTGCGATCTGTGCTCCAGGGTGATTTAAGGATGTTATCTTGCCGTTGAGCTTGTTTTCTTGTATTGTGCATGATACAGTATGTGTTAGCTCCTGGTGTTTGACAGTGTGTTCTCCCTATCTAGCTTGTTTATCTGCACAGAGCTAGGGTGTAAGAGTTAGGTTGGTTATACGATTACTTAGGTCAAGATGCGTACACTAGACTAAACACCTTAGGATCGTGGCGACATTAAGAGGGTTTAGACCCTACGAGTCCAAAACTAAAGAAAGAGAAGAGGAGTCAGAATAGAGTGACCTGGAGCCAAAATTTTGTGTGAAGCAACCTAGCTGGCCTAGGAATCCAATAAACCTCTTCAACTCCTAGACATGATCAAGTTGCATTTAAAACCGTGAGACTGATGACGATGCATCGGTACCTAAAAGTGGATAATATATGCTAGCAGTGATTTGTAGCTGTTATAAAAAAATAAATAGTCAAGATAGCCGAGTTGGTCTAAGGCACCGGTTTCAGGTACTAGTCTGAAAGGGCATGGGTTCAAATCCTATTCTTAAAGGTTGGAGAGGTATAATGCACAACATTTTAAAATGTGAGGCTTGCATATGTAGTGAGCAATGTAGCGGTGGGCGGCGATCTATAAAGCTTAGGAGTCATGAATTAAGAATCTCGTACAACTAATTTTGTATGTATATTTACCCATATATAAAAAATTTTGTTAACCAACTTGTAAAACTGTTTTATCTATCAATATTAAAGTTTTCTCTTCTTCATTAGAGCTAGGTTTCAGTCGTGAGACAGAAAAAAGATAGGAATGCAATAAACCTATAATGGTCCAAAGCAAATAAATAGGCCAAGCAGGTCTAAGGTACTTGTTTGAGAGTTAATGATCCTTGTGTGTCAAGGCTTCCCGGTGCGCCACTCTAAGCCAGATAGCCAGGATATGTATCCTTTTTTAGCCTTTCTTCTCTAAGATAGAGCCAGTTTTCGATCCTTTTTTAGTCTTTCTCTATCAGAGCCAGGTTTCGATCCTAGGACCTGTGGGTTATGGGCCCACCACGCTTCCGCTACGCCACTCAGATTTGTTAGAAAGGAGGATGAGCTATTGTGATCTGTGCTCCAAGGTGATTTATGATGAAATAGAGTGAACTAAAGAAAGAGTTGAGTCAAAATAGAGTAACTGGAATCAAAAGCTCGTGTAGCTAGGAATGCAATAAACCTATAACGGGAAAAAGCGAATAAATAGGTCGAGCAAGTCTAAGGTACATGTTTGAGAGTTAATGATCCTTATGATCCTTGTGTTGCAAAGAAGGTCAATATGTATCATTTTTTAGTCTTTCTTCTCTATTAGAGCCAGGTTTCGATCCTGGGACCTGTGGGTTATGGGCCCACAACGCTTCCGCTGCGCCACTCTGATTTGTTAGAAAGGAGGATGAGCTATTGTGATCTGTGCTCCACGGTGATTTATGAGGTGAATAAATAGGCCGAGTAGGTCTAAGGTACATGTTTGAGAGTTAATGATCCTTATGTTACAAGGAAGGTCAATTATGTATCATTTTTTAGTCTTTCTTCTCTATTAGAGCCAAGTTTCGATCCTGGGACCTGTGGATTATGGGCCCACCACGCTTCCACTGCGCCACTCTGATTTGTTAGAAAGGAGGATAGGCTATTGTGATCTGTGCTCTAAGGTGATTTATGACGAAATAGGATTTGTTAGAAAGGAGGATGAGCTATTGTGATCTGTGCCCCAGGGTGATTTATGACGAAATAGCGTGAACTAAAGAAAGAGTTGAGGAGTCGAAATAGAGTAACTCGTGTAGCTAGGAATGCAATAAACCTATAAAGGGCCAAAGTGAATAAATAGGCCGAGCAGGTCTAAGGTACATGTTTGAGAGTTAATGATCCTTATGATCCTTGTGTTGCAAAGAAGGTCACAATATGTATCATTTTTTAGTCTTTCTTCTCTATTAGAGCCAGGTTTCGATCCTGGGACCTGTGGGTTATGGGCCCACAACGCTTCCGCTGCGCCACTCTGATTTGTTAGAAAGGAGGATGAGCTATTGTGGGTTATGGGCCCACAACGCTTCCGCTGCGCCACTCTGATTTGTTAGAAAGGAGGATGAGCTATTGTGATCTGTGCTCCACGGTGATTTATGAGGTGAATAAATAGGCCGAGTAGGTCTAAGGTACATGTTTGAGAGTTAATGATCCTTATGATCCTTGTGTTGCAAGGAAGGTCAATATGTATCATTTTTTAGTCTTTCTTCTCTATTAGAGCCAGGTTTCGATCCTGGGACCTGTGGGTTATGGGCCCACAACGCTTCCGCTGCGCCACTCTGATTTGTTAGAAAGGAGGATGAGCTATTGTGATCTGTGCTCCACGGTGATTTATGAGGTGAATAAATAGGCCGAGTAGGTCTAAGGTACATGTTTGAGAGTTAATGATCCTTATGATCCTTGTGTTACAAGGAAGGTCAATTATGTATCATTTTTTAGTCTTTCTTCTCTATTAGAGCCAAGTTTCGATCCTGGGACTTGTGGATTATGGGCCCACCACGCTTCCACTGCGCCACTCTGATTTGTTAGAAAGGAGGATAGGCTATTGTGATCTGTGCTCTAAGGGTGATTTATGACGAAATAGGATTTGTTAGAAAGGAGGATGAGCTATTGTGATCTGTGCTCTAAAGAAAGAGTAGGAATGCAATAAACCTATAAAGGGCCAAAGTGAATAAATAGGCCGAGCAGGTCTAAGGTACTTGTTTGAGAGTTAATGATCCTTATGATCCTTGTGTTGCAAGGAAGGTCAATATGTATCATTTTTTAGTCTTTCTCTATCAGAGCCAGGTTTCGATCCTGGGACCTGTGGGTTATGGGCCCACCACGCTTCCGCTGCGCCACTCTGATTTGTTAAATAGGAGAATGAGCTATCGTGATCTGTGCTCCAGGGTGATTTATGACGAAATAGAGTGAACTAAAGAAAGAGTTGAGGAGTCAAAATAGAGTAACCTGGAATCAAGATCGTGTAGCTAGGAATGCAATAAACCTATAACGGGCCGAAGTGAATAAATAAGCCGAGCAGGTCTAAGGTACTTGTTTGAGAGTTAAGGATCATATTTTTAGTCTTTCTTCTTTATCAGAGCCAGATTTCGATCCTGGGACCTGTGGGTTATAGGCCCACCACGCTTCCTCTGCGCCACTCAGATTTGTTAGAAAGGAGAATGAGCTATTGTCATCTGTGCTCCAAGGTAATTTATGACGAAATATGATTTCTTAAAAAGGAGGATGAGCTATTGTGATCTGTGCTCCACGGTGATTTATGACGAAATAGAGTAAACTAAAGAAAGAGTTGAGGAGTCAAAATAGAGTAACCTGGAATCAAAAGCTCGTGTAGCAAGGAATGCAATAAACCTATAACGGGCCGAAGTGAATAAATAGGCCGAGCAGGTCTAAGGTACTTGTTTGAGAGTTAATGGTCCTTATGATCCTTGTGTTGCAACAAAGGTCAATATGTAATAGAGTGAACTAAAGAAAGAGTTGAGGAGTCAAAATAGAGTAATCCGGAATCAAAAGCTCGTGTACCTAGGAATGCAATAAACCTATAACGGGCCAAAGTGAATAAATAGGCCGAGCAGATCCTTGTGTTGCAAGGAAGGTCAATATGTATCATTTTTTAGTCTTTCTTCTCTATCGTAGCCAGGTTTTGATCCTAGGACCTGTGGGTTGTGGGCCCACCACACTTCCGCTGCGCCACTCTGATTTGTTAAAAAGGCGGATGAGCTATCGTGATTTGTGCTCCAAGGTGATTTAGTGAACTAAAGAAAGAGTTGAGGAGTCAAAATAGAGTAAATCCGGAATCAAAAGCTCGTGTACCTAGGAATGCAATAAACCTATAACGGGCCAAAGTGAATAAATAGGCCGAGCAGTTCTAAGGTACTTGTTTGAGAGTTAATAATGATCCTTATGATCCTTGTGTTGCAAGGAAGGTCAATATGTATCATTTTTTAGTCTTTCTCTATCAGAGTCAGGTTTCGATCCTGGGACCTATGGGTTATGGGCCCACCACGCTTCCGCTGCGCCACTCTGATTTGTTAAATAGGAGAATGAGCTATCGTGATCTGTGCTCTAGGGTGATTTATGACGAAATAGAG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BLAST of CmoCh09G013150 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LMQ1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G287040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 7.7e-11 Identity = 41/82 (50.00%), Postives = 52/82 (63.41%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G013150 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LCQ0_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G847090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 8.5e-10 Identity = 41/80 (51.25%), Postives = 51/80 (63.75%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G013150 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LFQ3_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G846590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 68.9 bits (167), Expect = 3.2e-09 Identity = 39/83 (46.99%), Postives = 51/83 (61.45%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G013150 vs. TrEMBL
Match: W9QL39_9ROSA (Ankyrin repeat-containing protein OS=Morus notabilis GN=L484_013457 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 8.8e-07 Identity = 30/65 (46.15%), Postives = 43/65 (66.15%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G013150 vs. TrEMBL
Match: K7LZG4_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_13G130300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 8.8e-07 Identity = 32/63 (50.79%), Postives = 42/63 (66.67%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G013150 vs. NCBI nr
Match: gi|659093595|ref|XP_008447612.1| (PREDICTED: ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 8.4e-11 Identity = 41/82 (50.00%), Postives = 53/82 (64.63%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G013150 vs. NCBI nr
Match: gi|700206903|gb|KGN62022.1| (hypothetical protein Csa_2G287040 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 1.1e-10 Identity = 41/82 (50.00%), Postives = 52/82 (63.41%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G013150 vs. NCBI nr
Match: gi|778670062|ref|XP_011649355.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101212496 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 1.1e-10 Identity = 41/82 (50.00%), Postives = 52/82 (63.41%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G013150 vs. NCBI nr
Match: gi|659128037|ref|XP_008464016.1| (PREDICTED: ankyrin-1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 72.8 bits (177), Expect = 3.2e-10 Identity = 41/80 (51.25%), Postives = 52/80 (65.00%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G013150 vs. NCBI nr
Match: gi|449446917|ref|XP_004141217.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101204214 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 1.2e-09 Identity = 41/80 (51.25%), Postives = 51/80 (63.75%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata
Date Performed: 2017-05-19
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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