CmoCh08G011980 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)

NameCmoCh08G011980
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr08 : 7612783 .. 7617560 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TTTCTCCTCATTCAGGTTTCCTTCTCTCTTATCATCTGTAATTTGATTTGTAAATTCGTGTTTAAAATCTGCACTGCGTTTGCATTTTGATCTGATCTGTTTCCGTCGATGTTGTTCCTTTCTTTAGGAAGAGATTGAGATTCCGATTGGCTTGAAATCGCGGTGTTCTACTCGGAAGCTTCCTTGAGTTTTCTGTTCATCGATGTTCTTGTGCACTTTGAAGGATACAAGAAAACAGAGGACGATTCATCGGAGATTCGAGTGAGTTGATTCTTAACCGACTTGAATTTACTTCTTAAAAATGTTTGTGAATATGAAGCTACTGAAGCTCGAGATCAGATATTGTGTTTCTAATTTATGAATGAAAATTTATTGGATGCCAGAACCAAACACTAATTCTTTAAAAAGTCGATCGTTCAAACATGCGGTAGTTCACTACGTACTAACGAATTAAATTGAACTAGAGGAGGTAGATGTAACTGTAATAGCTATTATATTTTTAAGTATGTTATGTTCTGTTGAGTTGAAAGTCTGTTTAGTCATTATGATTTCTTAGTCTATAAATATCAGTTGTAAGGCATCTTTTTAAAAAAATGAAGAGTATCTGTACGATTCGTGAAGATTATTTCATGATATCGGCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGAATAATGTCGTTTGATCCTTCTTCAAAGCGTCCAGTTCGTTTCCACTTGTCATCTTCGTTCATTCCTTTGCTATAGTTGATTCCACCGATCGTGACATGCGTTCACCGATTTTTGTCCTTTCAAACATTTGTGTACTTGTATCCGTATGACTGGATTCCTCGAATCTTCGCCTCAACAATCTTAGTTCCAGACTACTGCCACATACTTTTCCGATAGAACTTCTTCTAAGCAAATCCTCTGTCTGAAGATTACCACATCTCATGCACTCATGATTCTTATCAACACTACGTTATCGCCTCCAGCCCTTGCGTATGTCGTTGGCCGTGAAACATCATGTCAGATGTAGGAAACTCTAGAAAAACACTATTCTTCAACCTCGCGTGCCAATTTTGTCAATCTATGCTTTAAAAGGGATGCCTATTGCATATAATACATTTCGTACATCTTTACGTACGTGATCGTACTTTGTTTCTTTTGATGAACTTCTTGTTCTTCTTGTCATTGAGGAATCTGCCATCGAGATATAGTTTAAGCGTAACCAGAATTTTCTTCACCGGCTACTCTTCTTACTCGAACAGGATTCTCTAAGAAATCAGAATCTAATCCTAGTGTCTGTCGTAACTGAGGTGATAATGGTAGAGGACGTGGTAATTGGGTTAAACCTGGAAATTATATGCCCTACGGAAGTTGGTCGAGGTTTTGGTCCTCCTCAAGATTCTTCTAATAAATTTTAGTTGAATCAAACAGCCTCAAAGATACAAATTATGTGTTGAGGATGGTTGGAGTCCCATATTGATTGTTATAATCGCATGAACAACAGCTTCCAAGGTCCACATCCACCATCTCAGCTTGCTGCTATGGTGGTTACGCAGAACTATAATGTTGTTGCAAATACATCTACTGTTTCCAATTCTTCCATCGTGTTACTTCCGATTTAAATAATTTTTCTGTTGCAAATGAATAGTCTGGAGAGGAACAAGTAGCTGTAGCCTGTAGGCAATGGTCAATCCCTCCTAATAAATTCAGGTCGTGTTATTCTTCCAACTCCCTTAAAACTTCTTGATCTTATTCGAGTTCCTCTCATTTCTTCCAATCTTCCTTCTGTTAATCGCTTGTGTGCTGACAAAAATTATATTATAATTTCCGAAAATGGCTTTTTCCTCCTTTAGGACAAGTCTTCGAGCAAGATTCTTCACCGAGGTCCCAACATTAATGGCCTTTATCCTATTCATCCTGCAAAATATACTTCCTTTCCAAGTCCACTTGGTATCGTTCATGTTGGAACAGAACATCAACTTCAGTCTAGCATAAACTAGTCAGGCATATCCTAGAAGTTACTTCGATTTTAATGACTCAATTTTCTCTTCCTAACAACTTTTGGCCTTTCGCTTTTGCTGCTGCTGTCTTTTTAATCAATCCTCTTCCTACCCCAACTCTAAACCTTCTTTTTAGCCTTTTTTTTTTTTTTTTCCATAAGCCACTCGATTATACAATTCTTAAAACCCTTGGTTGTCTGTTATACATTTCTTAGGGCCTACACTTCAGCCCAAAAGAACTCGTTTAGTTTTACTTGATTATCCTAAAGACTTTGTGGGATATCTGTGTTACAAAATGAGCAATAGGCGTCTCTATACATCTAGGATAATCATGTATACTCTGAGGGATATCTTGTGCATAGTAATCGTTCTATTATTATTATTTTTTTCTTTCTTTCTTTTGATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTCCTTCCAAATTACCACTGATGTTATTAATTTTGAATTTCCCACTCTGCTGTTCTTGCTAACACTTCTGCAGCCACTGAGTTGACTAGTGGATCACATATGGTAACTGATGTTTAAGATCCTTGTGTTGTTCAAACTGATATTGTTGCATCGGACGCTATTCGGCCTGCTCCAGTTAATACTAATGTTTCATCATCTTACATGCCTCTTGTGCATGGTAATCGTTCTATGAAAACCATATCAAAGCACAAAGTTTAGTTGCTATTACCAATGTTTGTTCTGATTTGGAACCATCCTCTTTCACAAAGCCTTCTTAAATTTTCGGCTAACACTTTGGAATATTAGTTTTTTTTTATTGTAACAGCCTAAACCCATCGCTAGAAGATATTGTTCTCTTCGAGCTTTTCTTCAAGGTTTTTAAAACACCTCTACCAAGGAGAAAATAACTCTTTTCCCTACGGGCAAAAGTGTTATTGGTTGGAAGTGGTTCCGAACAATGCACTCTCCTTGCGTATCTTATTTAGTGGTTCTCAGATGAGTGCTTTGATATCTTGGAGGAACAATGACGAAAGGTTTCCTTTTTCGAAGGCCAATTCTAATACTTTTTTTTGCTCATGACATATTCTTACTCTGATTGGGCTGCTGATCATCTTGATTGCTGTTTAACTACTGGCTTTGTGATCTATCTAGGCTCCATAAATCTCGCAAGCTACCGGAAGCTATCAGACCTATTACGAATTCACGATTGCCAAACAGGAGTGCTCAATCACTTGATCCATTTCAGGTACTAAGTTTTGTTATCATTAATAAAATTTGAATTCTATTTTTTTAATTATTTTGTGCATGTGCGTGATACTCAATCGATTGCTTGAATTTAATTTACATACTTTGGTTGCATCACAACGAAAGTCAAATTGGAAATCTTAGTCTTTAAATATTAAAAATAAAATAAAATAAAATAAATTCTTGAAAATAATATACTATTTGTTTTTTTTTTTTTTCAATAATAACGAAATAGAGTGAATTTTTCAATTTTATTATTCACTTCAGGGAAAACGGGATTGATGCCAACTGTTCAAAAATTTGAAATAATCTTTTTAGGCCTCCAAAAAGTGGTGGAAAGTAAAAGCAATAAAGTCACAAATACTCTTCAACGACCATAATTTTTTGCAATTTCGAATTTTGGAATACAAACTTGTTGATTGGACTTGAATCTCTCACTATTTTAATAAATATTTAGTTTTTTATTTTTTATTTCAAAATTTAAGTCTATAGATACTACTTTTACCTATAATTTAATTATTTTATAATCTATATTTTACTTGGTACTTTTAAATGAAAAACCAAAACAGAAGTTTTCGTTTTTTAAATTGTCTATAAATTTCAAATGTTTTACCTACAATTGTAGAGTAATATTGGAAAAACAAATTCAATTTTTATAAAATCAAATAGTGATTAAATAAGATTTAATTTTTTTATTTCTGTTTTATACATTTAATAATTCCTTACCGCAATCTCGTGTTTTAAGCATGTTTTATGTGATAAAAAAATGCATGTTCTACGTTTGTGTAGATGAATGATGCTTACTTTAGGTTGAAATCTTAAATAGTGGTTTCATACTTTGTGGTTCAAAATTTAAATTTTTTGTTAAATTAAAATTTCAATTCTTTGAAATTTTAGATTGTCATGAATTTTTTATTTTTTAAATTTTGCCTGATAACATTCTGATATATTTAATATTTTACTTTAAAAAAATTAACTATTAGACGAAATTGGATTACATGTGATAAATCATGGACTTTTCAACTGTTCCAACATCAATTTTAAAATATTGAAGATTTTTTTAATATAATTATTAGTTTAAAGATTTACTAGATAGAAAAATCAGTAGAAACTTCTTTGGAGCTAAGGATGCAATTAAACTTTATTCTTGTTCTTGTACTAAGGATGAAAAGTGTAAGCAAATATATTTATGATCTTATTTCAAAATTGTATTTTCACTGTTTCACGAGTTAAGGCTGAAAATTGTAAGCATATATATTTTTGAATAACTTATTTCAAAATTGTATTTCTGATGACATTTGAATGATTATTAACTTCTTACCTTCTTTTAAAAACAATATCGGTACCATACCCCAATCAGTTTAGTTACATTCCTAACATAATCATTTTATTAAAAAAAATGATATAATTCTAAATTAATTGAACGAAAAAGTCAAATATAAATAAACTAATAAATCATCAAAAACTAACTTTCACTGAAGTAATAATCCAACAAACACAACTTTAGAAGCATTCATCAAAACATTAACGCGGGAGGCTCTCATCATTCATAATTTGCAATATAGCTTAACATCTTAA

mRNA sequence

TTTCTCCTCATTCAGGAAGAGATTGAGATTCCGATTGGCTTGAAATCGCGGTGTTCTACTCGGAAGCTTCCTTGAGTTTTCTGTTCATCGATGTTCTTGTGCACTTTGAAGGATACAAGAAAACAGAGGACGATTCATCGGAGATTCGAGCTCCATAAATCTCGCAAGCTACCGGAAGCTATCAGACCTATTACGAATTCACGATTGCCAAACAGGAGTGCTCAATCACTTGATCCATTTCAGATGAATGATGCTTACTTTAGTAATAATCCAACAAACACAACTTTAGAAGCATTCATCAAAACATTAACGCGGGAGGCTCTCATCATTCATAATTTGCAATATAGCTTAACATCTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTCTTGTGCACTTTGAAGGATACAAGAAAACAGAGGACGATTCATCGGAGATTCGAGCTCCATAAATCTCGCAAGCTACCGGAAGCTATCAGACCTATTACGAATTCACGATTGCCAAACAGGAGTGCTCAATCACTTGATCCATTTCAGATGAATGATGCTTACTTTAGTAATAATCCAACAAACACAACTTTAGAAGCATTCATCAAAACATTAACGCGGGAGGCTCTCATCATTCATAATTTGCAATATAGCTTAACATCTTAA
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh08G011980.1CmoCh08G011980.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CmoCh08G011980Carg18840Silver-seed gourdcarcmoB0960
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmoCh08G011980Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB1029
CmoCh08G011980Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB1032
CmoCh08G011980Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB1058
CmoCh08G011980Watermelon (97103) v2cmowmbB896
CmoCh08G011980Watermelon (97103) v2cmowmbB887
CmoCh08G011980Watermelon (97103) v2cmowmbB921
CmoCh08G011980Wax gourdcmowgoB1092
CmoCh08G011980Wax gourdcmowgoB1104
CmoCh08G011980Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB233
CmoCh08G011980Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB310
CmoCh08G011980Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB484
CmoCh08G011980Cucumber (Gy14) v1cgycmoB0491
CmoCh08G011980Cucumber (Gy14) v1cgycmoB0720
CmoCh08G011980Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB279
CmoCh08G011980Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB365
CmoCh08G011980Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB383
CmoCh08G011980Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB837
CmoCh08G011980Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB912
CmoCh08G011980Wild cucumber (PI 183967)cmocpiB883
CmoCh08G011980Wild cucumber (PI 183967)cmocpiB906
CmoCh08G011980Cucumber (Chinese Long) v2cmocuB872
CmoCh08G011980Cucumber (Chinese Long) v2cmocuB893
CmoCh08G011980Melon (DHL92) v3.5.1cmomeB832
CmoCh08G011980Melon (DHL92) v3.5.1cmomeB800
CmoCh08G011980Watermelon (Charleston Gray)cmowcgB792
CmoCh08G011980Watermelon (Charleston Gray)cmowcgB799
CmoCh08G011980Watermelon (97103) v1cmowmB848
CmoCh08G011980Watermelon (97103) v1cmowmB856
CmoCh08G011980Watermelon (97103) v1cmowmB867
CmoCh08G011980Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB833
CmoCh08G011980Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB852
CmoCh08G011980Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB862
CmoCh08G011980Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB866
CmoCh08G011980Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB797
CmoCh08G011980Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB808
CmoCh08G011980Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB819
CmoCh08G011980Cucumber (Gy14) v2cgybcmoB255
CmoCh08G011980Cucumber (Gy14) v2cgybcmoB421
CmoCh08G011980Cucumber (Gy14) v2cgybcmoB857
CmoCh08G011980Melon (DHL92) v3.6.1cmomedB903
CmoCh08G011980Melon (DHL92) v3.6.1cmomedB940
CmoCh08G011980Silver-seed gourdcarcmoB0104
CmoCh08G011980Silver-seed gourdcarcmoB0826
CmoCh08G011980Silver-seed gourdcarcmoB1126