CmoCh08G006320 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)

NameCmoCh08G006320
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
DescriptionCytochrome c oxidase subunit 3
LocationCmo_Chr08 : 4081064 .. 4124498 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
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mRNA sequence

ATGGGGAACGACGGAATTGAACTGCGCATGGTGAATTCACAATCCACTGCCTTGATCCACTCAAAAAACGCTTTCACCAAAATCCCCTTTTCCAACCCCTACCCTTTCCCTTCCAGTGAAGCCATTTTAGCCCTTTCCTCGAGGAGTCGAGCTGCCTGGATTCTATGGCCCATTTCGGGTTCACTCGGAGCTTTCGCAACCACCGTAGGAGGTACTCTTTTCTTGATCATATGTGGTATTCGCCAATATCTTGGTCATCGGACCAAGGAGCATCACGTTGCTTTGAAGCAGCTGCATGACGTGGCATGGATCAATCACGCGGTTCCACAGCGTCCTCCAACTTGCTGTCCGGTCTTCCCACCACGTGAAGTTCACACCTCGCCGGAGAGAGAGAAGCGAATTGAAAATCGGTCTCAAATTGCTTCGCAATCGAAGAGAAGAAAAACGGCTTACGGACAGTACTCGAGCTTCAAATCAATGTCCCAAGAAGTAAGGAGTATGCCTGTGTCTTTCAATGTGAACACTGAAAAAGACCTAATTCAACTCCACTTTGGAATTAGGTGTAGCTATATCACAAGCTCATGTTTCTACGATCTCAATTTGTATCTCCATCAAAATGGTTATTTATTTATAATTGAACAAAAGCGAGGAGAGAAGCTACGAGACAAGAAGGGGAGAGGAGAGGAGAGAATATGTGAGACTGTAAAGGTCTGTGTCAAAGGTGGAACTGGATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGGAACGACGGAATTGAACTGCGCATGGTGAATTCACAATCCACTGCCTTGATCCACTCAAAAAACGCTTTCACCAAAATCCCCTTTTCCAACCCCTACCCTTTCCCTTCCAGTGAAGCCATTTTAGCCCTTTCCTCGAGGAGTCGAGCTGCCTGGATTCTATGGCCCATTTCGGGTTCACTCGGAGCTTTCGCAACCACCGTAGGAGGTACTCTTTTCTTGATCATATGTGGTATTCGCCAATATCTTGGTCATCGGACCAAGGAGCATCACGTTGCTTTGAAGCAGCTGCATGACGTGGCATGGATCAATCACGCGGTTCCACAGCGTCCTCCAACTTGCTGTCCGGTCTTCCCACCACGTGAAGTTCACACCTCGCCGGAGAGAGAGAAGCGAATTGAAAATCGGTCTCAAATTGCTTCGCAATCGAAGAGAAGAAAAACGGCTTACGGACAGTACTCGAGCTTCAAATCAATGTCCCAAGAAGTAAGGAGTATGCCTGTGTCTTTCAATGTGAACACTGAAAAAGACCTAATTCAACTCCACTTTGGAATTAGGTGTAGCTATATCACAAGCTCATGTTTCTACGATCTCAATTTGTATCTCCATCAAAATGGTTATTTATTTATAATTGAACAAAAGCGAGGAGAGAAGCTACGAGACAAGAAGGGGAGAGGAGAGGAGAGAATATGTGAGACTGTAAAGGTCTGTGTCAAAGGTGGAACTGGATAA
BLAST of CmoCh08G006320 vs. Swiss-Prot
Match: COX3_ARATH (Cytochrome c oxidase subunit 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=COX3 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 3.7e-06
Identity = 26/38 (68.42%), Postives = 27/38 (71.05%), Query Frame = 1

Query: 71  GTLFLIICGIRQYLGHRTKEHHVALKQLHDVAWINHAV 109
           GTLFLIICGIRQYLGH TKEHHV  +     AW  H V
Sbjct: 214 GTLFLIICGIRQYLGHLTKEHHVGFEA---AAWYWHFV 248

BLAST of CmoCh08G006320 vs. Swiss-Prot
Match: COX3_SOYBN (Cytochrome c oxidase subunit 3 OS=Glycine max GN=COX3 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 3.7e-06
Identity = 26/38 (68.42%), Postives = 27/38 (71.05%), Query Frame = 1

Query: 71  GTLFLIICGIRQYLGHRTKEHHVALKQLHDVAWINHAV 109
           GTLFLIICGIRQYLGH TKEHHV  +     AW  H V
Sbjct: 214 GTLFLIICGIRQYLGHLTKEHHVGFEA---AAWYWHFV 248

BLAST of CmoCh08G006320 vs. TAIR10
Match: AT2G07687.1 (AT2G07687.1 Cytochrome c oxidase, subunit III)

HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 2.1e-07
Identity = 26/38 (68.42%), Postives = 27/38 (71.05%), Query Frame = 1

Query: 71  GTLFLIICGIRQYLGHRTKEHHVALKQLHDVAWINHAV 109
           GTLFLIICGIRQYLGH TKEHHV  +     AW  H V
Sbjct: 214 GTLFLIICGIRQYLGHLTKEHHVGFEA---AAWYWHFV 248

BLAST of CmoCh08G006320 vs. TAIR10
Match: ATMG00730.1 (ATMG00730.1 cytochrome c oxidase subunit 3)

HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 2.1e-07
Identity = 26/38 (68.42%), Postives = 27/38 (71.05%), Query Frame = 1

Query: 71  GTLFLIICGIRQYLGHRTKEHHVALKQLHDVAWINHAV 109
           GTLFLIICGIRQYLGH TKEHHV  +     AW  H V
Sbjct: 214 GTLFLIICGIRQYLGHLTKEHHVGFEA---AAWYWHFV 248

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
COX3_ARATH3.7e-0668.42Cytochrome c oxidase subunit 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=COX3 PE=2 SV=2[more]
COX3_SOYBN3.7e-0668.42Cytochrome c oxidase subunit 3 OS=Glycine max GN=COX3 PE=2 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
AT2G07687.12.1e-0768.42 Cytochrome c oxidase, subunit III[more]
ATMG00730.12.1e-0768.42ATMG00730.1 cytochrome c oxidase subunit 3[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh08G006320.1CmoCh08G006320.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmoCh08G006320Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB1067
CmoCh08G006320Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB1072
CmoCh08G006320Watermelon (97103) v2cmowmbB912
CmoCh08G006320Wax gourdcmowgoB1100
CmoCh08G006320Wax gourdcmowgoB1130
CmoCh08G006320Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB234
CmoCh08G006320Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB312
CmoCh08G006320Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB280
CmoCh08G006320Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB367
CmoCh08G006320Wild cucumber (PI 183967)cmocpiB913
CmoCh08G006320Wild cucumber (PI 183967)cmocpiB914
CmoCh08G006320Wild cucumber (PI 183967)cmocpiB919
CmoCh08G006320Cucumber (Chinese Long) v2cmocuB901
CmoCh08G006320Cucumber (Chinese Long) v2cmocuB906
CmoCh08G006320Melon (DHL92) v3.5.1cmomeB811
CmoCh08G006320Melon (DHL92) v3.5.1cmomeB816
CmoCh08G006320Melon (DHL92) v3.5.1cmomeB823
CmoCh08G006320Watermelon (Charleston Gray)cmowcgB781
CmoCh08G006320Watermelon (Charleston Gray)cmowcgB805
CmoCh08G006320Watermelon (97103) v1cmowmB839
CmoCh08G006320Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB835
CmoCh08G006320Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB839
CmoCh08G006320Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB853
CmoCh08G006320Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB854
CmoCh08G006320Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB810
CmoCh08G006320Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB814
CmoCh08G006320Cucumber (Gy14) v2cgybcmoB956
CmoCh08G006320Cucumber (Gy14) v2cgybcmoB961
CmoCh08G006320Melon (DHL92) v3.6.1cmomedB914
CmoCh08G006320Melon (DHL92) v3.6.1cmomedB921
CmoCh08G006320Silver-seed gourdcarcmoB1378
CmoCh08G006320Silver-seed gourdcarcmoB1379