CmoCh08G001660 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)

NameCmoCh08G001660
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr08 : 952743 .. 960789 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCCATGATTCTAGCATTGCTGTTGGTAACCTCAATTTCCATGATTCTAGCATTGCTGTTGGTAACCTCAATTTGTGTTACAATTTTATGAGAGAATTTTAACTTGTGATGTCTGATATATGTGCTTGTTTCCCTGCAAAAGAAAAAGGTAATAACTCGTCTTTTGGGCTTCATAATATGATCACTTGCGTCATTTCAGAATATTTTTTGGGAACAAAATATAAAGGAAAGAAGTATGCCCGGGTCCCATGTGTTTCTAAATTCAACCTTTTACAACTCCTTGTTTCTGAAACATGCTACTATAGGACAGAAAACTTACCCTTCTGGATATTGGCTAGCTCTTGTTTGTTATTCATATTTATTGTTTACTTTCAGTAGTATCCTTTGCTTAAAGACATGGTTTCTGGGCGAGACAGGGTAAGAAGGAAGAGACGGAAGAAGGTGATGCACTCTGACATTGGTTGTGAAGTACAACAGAAGCAAACATGAATTCTTCTATTTTTTTCTCCTTTGACTGTTACAATAATTTGTGAATGTCCTGAGTCTCTGTGAGTTGTCAGAATTTGTAAAAAGGTCTTCCACTGAGCTTTTGTTTTTTAACCTTCCTAGGAAAGAAATTGATTTGATGTCAGTTCTGTCACCATATTTCTGAAACCTTCTTAAGTCATTTCCTTGAGCATGAAAAAGATCTCCTTTGCCTCAACCATGTCGTGGCTATGCTCCCAATATTAACTGTTTGTTTCTATTTTGTCAGTGGGAGTTCAAAAGAGATGAATAATATTACTTTGCTTTATGTGCTTTATAATTTCAGGTGAAAGATTTAGGAAGAAAGGCTTCTGATTTTATTAAGGTGGGACTACGATGTACAGCACCATGCGGGATGAAAAAACTTTTTCTTACCTCCACGAGCAAGTCATGATTTTATGTCAAATCTGCCTAAATATCCAGCTGATAAGTTGGCCTCCTCTATTTGTTTTTTGTTTTTAACCTGGTAGATTGATATTTAAATCTTAAGTTGATTAGATTTGCATTAGATCTGGTGACATAGTGGGAAAGATGCAAGGGGGGGCCATGCTCCATGAACTTGCAAACTTTTTGGTATGAGGATAGGTTTTTACCTGTGATACAAAAGCTTGTCAAATCCAACTAATATGATTGGTATATTCACCGATCGATGTTCAGACATGTTCATACTAACCCTTTTCACTAAATTCACTGTATGGAGAGATTCTATAATCAGCGGTTCAACGAATCAAACCTGATGAAAACCTTCTGCCATCTGGTATGTTTCTATCAAACGTTTCAAGTTTTCTATTCCTGCTGTTAAGAAAAAACTTACCTGGAAAGCCTGCTTCTGGATTTGGTAGTTGTTAAAATAGTCAAAAAGGAGTCAAATTCTTCTGCCCTTTTGTCAAAGTAAATCATCCTCGGTAAAATTACATTTTCAAAAAGGAGTGGAACTATAGATAAATTATCATATAAACTTTCTGTTATTCTTTATCATCGTTAGAGACATGGTTTTACAAGAATAAATTAAAACTAAAGAAATGAAGGCCAAAAATGTAATTTACTCACAATCAAAAGATTGGTAGATCATGATGCAGATGGAAAAAGTGAGCATTTTTTATCAGATTCTAGGACCTGCTTAAATTTTGTGCTGACTTTTGTTTTTAGGAACCAAACATGAAACTAAAATCCGAAAGTCTTGTCAGTGACATGAGGGAAACAATTCTGTTGTAGACAGACTGTGCCACATATTTATCCTTCTCTTGACCTTTTCCTTTTGACCAACATCCTAAAAGACCTATATATGCACTGAACATGTGTTATGAATCTCTTTGTCTAAATGCAACAGCCCTCATTCATTATGATTTGTACATGTGAAAGCAAAGCAAGTAGCCCTCCTTCATTGTGATCTGATTATGCAATGAGCATTAATATGTTTGTCTAAATGCTTTTTAACTTTCATTTCTGGATTGAACCCTACTTTTAAAGCAGAGAGATCAGTTTTTCTCTTGCCTTTGAACTCTTCTTTCCTGTTGATGTGAGGCTGGTTTTACAGGCTGATTGATTATCATTGAAGAACATTGCTGCCTGTGTTGTTTGGACAGTGGATAAAGATTGAGTCCTTAGACTCACTTTGAACCTTTCTGTACCATGATTTCAGTCTAATTTGAGGCCCCTGTAAGTCTTGAGCTCACCAAGACACAATTTTAGTACTTTAGCAATAGCATGAAATCATTGTATTGAGCTAATATGCAGTTACATTACCAACTTGTGAAATATTGTAGGCTCTACGAAATTAAATTGTTAGTTGAATGTTGATATGCAATGATATTGATGATAGTATTATAACTTCCTTGGGTTGAGGGTGACCCTAGCGGTTAGGACTTAAGATGTTTGGAGATACCTTTTACTTATTTTTAAAGGAAAAAGTACGGCCTCAACATCTAAACCCGGCAACAAAAATTGGAAAATATTTTTCGACCGAAGCTCTTATATATGTTAGTTTGAGCTAAAATCTACCAAGCAACGATGTGGTAAGTTGATCAACGTCACATAATACTCCAAAAATGACATTCTTTGATCGATGAAAATCGATATGTCAAATTTCTACATAGTTTGAACCCAAAATCAGTGCCAACCGATTGAGGAATTCCCCTAGTATCAATGAAGTTAAAAGAAATTAAAAATGAGACGAAAATTATTGAACTAATGATAAAAATGTTGATGCCTATTCTTAATTCATACGTTTCACCTTCTTCTTCAAGTATAACAAGTGCATATTTGTAGGATTGAACTCGATTCTAGTTCTTAACTTGTTCATCTTCTTGGCTCGGTACTAGTTCTTAACTTGTTGATCTTATTGTTTCAATAATTGGCTTGTTGATTTTATTCAATTGATCTTATTCGGCTTGTTGATTGCTCTTGTATTGATCTTGGTTTCTTGATCTTCTTGACAAGTTTATCAAAATCTTGAATTATTCTTACGCACTTAATAGTGTTTAAGATCATGCCTTCAACGTTGTTGTGTTTTCAAAGTCTTTGGTCTTCAAGTTCTCAATCTTCTTGGAGTCTTCTGAATTCTCTAATTTCTCAATCTTCTTGGACTATTCATAGAGCCTTTCTATGGGCATTGTATGCGTTTGGACTGCTTTGGGTTTTGGGCCAAATCGTCGTTTAACGACCTAACTTTTTATGACTGTAGGTGACCGTAAAATTCTAAGAAATTGGTAGAAAGCATGAGTTTTCTCTTCTAAAATTTTGTCATTTCGAGCAATATAATGCCATGTTAGGATTCATTATCCTACCAACAGGGATATGGAGATCTTCTGGAAGGGTGGAAGAAGCTTGAAGAAGAAGAAATATCGGTAAGCTTTTCAAAACCTCCTGCTGTGGGATTTTCGATTCTGAAGTTTTTACTAATGCTGAAGTGACTTCAGTTCTTCATGAATTCAATCTGGTGTGCAAAGCGAAGAACCACCCACTCGTACTTGGGAAAATACTTCCACCAAACCTTGTTTTAAGTCTGAATTTTGATTATTCTTCAAAAGAGACTCAAATGCTCTTCCCCCTTAGGTCATACTTACATCGGTGTTCTTGGGCATTCTGTGATATGAATGAAATATTGTGAGACCATGATAAAAATTGGCGAAGAGCTAAGAGAACGTAGCTTGATCTCTAAGTTTAGAGATGTGAGATTCCACATTAGTTGGGGAAGAGAACGAACCATTCTTTATAAGGGTATGGGAATCTCTCCCTAGTAAACGCGTTTTAAAAATCTTGAGGAGAAACTCGAAAGGAAAAATTCAAAGAGGACAATATCTGCTAGTGGTGAGCTTGGGGCGTTACCAGAGATGTTCAAGGTGATTATAATCTATTGGAAACAAAGCTCCAAAAGAGGATTGGTTGAAATGGGGTGATAGCAATACTAATTGTTTCCTCTAGAAGGCAACTGGGAGGAAGAAAGAGAATAGTACTGAAGCCATTTTTGATGCCTTGGGAGTATGGCAAGAGGAAGTTACAAAAATTTCCCTGACTTTTGTGGATTATTTTTAAAATATTTTTGCTTCAAATGCTCCTTTGCAGATTGATGTGAACAGGGTCATTGATTGCATTTCTTCAAGGGTTACTTCAGAAGTGATATCAAAAGGAGGTGGAAAGAGCAATAAAACAATGGATTCCCAACTTTGTTCTACCAAATACTTTGAAGATTTGCCTTGAAACAAGACTCGTATTGTGTTGATCCCTTAAACAAGGTATCAAAATTCATTTAGTGGTTTTCGCTCAATAAGTTCATATGCTATGTGTTGTATAAGATAGTTACAAAAGTTATATATAATTAGGTGATGACAAATCTGGACTAAATTCTCTCTTCTTCTTTGTTAGCTTTCATTCAAGGTCGTTCAATTTTTTATGGTCTGATTATCGCTCATGAATGCTTACATTTTGTGAAAAAAAGTACAGAGTTGAATGGAGTTTCTTGAAATAGATTATGTGCAAGCTGGGACATCAATTAGAGTGAGTTCATTTGATTTTTTATGTTATAGCTAATCAAAATGTTCCCAAACTAGCTGTCTCCAAACTAGCGAATCATTCATTGAGGAGTTAGATTAGAAGCATCCAAAGCAAAAGCTCTTCTTTTACTCCTAATCTTTTAAGAATTTGAAGCTTAAGCCAAATTTGAAGGAGATATTAGTCAGGTTTTTGAATCAATGATCCTCTTTGGCACTCGTTCCCCTATCTTTGTTTGGCCTCGTTACAAAGTTCGGGCAGGCAGGGTCAGCTTCAGGCCTAACCATTTCTCGGAGGGTCCTGACACAACCATTGTAACAGCCCAAGCCCATCGCTAGCAGATATTGTCGTCCTTTTTGGGCTTTCCCTTTCAGGCTTCCTCTTAAAGGCTTTAAAACGCGTCTAATAGGGAAATGTTTCCACACCCTTATAAAGGGTGTTTCATTCTCCTCTCCAACCAATGTGGGATATCACAATCCACCC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mRNA sequence

ATGGCCATGATTCTAGCATTGCTGTTGGTAACCTCAATTTCCATGATTCTAGCATTGCTGTTGTATCCTTTGCTTAAAGACATGGTTTCTGGGCGAGACAGGGTAAGAAGGAAGAGACGGAAGAAGGTGATGCACTCTGACATTGGTTGTGAAGTGAAAGATTTAGGAAGAAAGGCTTCTGATTTTATTAAGGTGGGACTACGATGTACAGCACCATGCGGGATGAAAAAACTTTTTCTTACCTCCACGAGCAAATCTGGTGACATAGTGGGAAAGATGCAAGGGGGGGCCATGCTCCATGAACTTGCAAACTTTTTGGGATATGGAGATCTTCTGGAAGGGTGGAAGAAGCTTGAAGAAGAAGAAATATCGATTGATGTGAACAGGGTCATTGATTGCATTTCTTCAAGGGTTACTTCAGAAGTGATATCAAAAGGAGTTTCTGGTGAGTTTCTGGCGAGTTTCTGGCGAGTTTCTGGCGATTTCGCTCTCTTGCATGATCGGAGTATCCACTTTTCCTTTCCGAATTACCTCCCGCCATGGTTGTTTTTGAAGATCAGTGTTGTAACGATGCTTTGCTGTGAAGTTTTGGCGTCTTCCAGTTCGTTCTGTTGCGTCAAGGAGCCAGGTGATAAAAGCAACAAAGGCTTCACAATTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCCATGATTCTAGCATTGCTGTTGGTAACCTCAATTTCCATGATTCTAGCATTGCTGTTGTATCCTTTGCTTAAAGACATGGTTTCTGGGCGAGACAGGGTAAGAAGGAAGAGACGGAAGAAGGTGATGCACTCTGACATTGGTTGTGAAGTGAAAGATTTAGGAAGAAAGGCTTCTGATTTTATTAAGGTGGGACTACGATGTACAGCACCATGCGGGATGAAAAAACTTTTTCTTACCTCCACGAGCAAATCTGGTGACATAGTGGGAAAGATGCAAGGGGGGGCCATGCTCCATGAACTTGCAAACTTTTTGGGATATGGAGATCTTCTGGAAGGGTGGAAGAAGCTTGAAGAAGAAGAAATATCGATTGATGTGAACAGGGTCATTGATTGCATTTCTTCAAGGGTTACTTCAGAAGTGATATCAAAAGGAGTTTCTGGTGAGTTTCTGGCGAGTTTCTGGCGAGTTTCTGGCGATTTCGCTCTCTTGCATGATCGGAGTATCCACTTTTCCTTTCCGAATTACCTCCCGCCATGGTTGTTTTTGAAGATCAGTGTTGTAACGATGCTTTGCTGTGAAGTTTTGGCGTCTTCCAGTTCGTTCTGTTGCGTCAAGGAGCCAGGTGATAAAAGCAACAAAGGCTTCACAATTTAG
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh08G001660.1CmoCh08G001660.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CmoCh08G001660CmaCh08G001640Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB913
CmoCh08G001660Cp4.1LG17g10700Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB851
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmoCh08G001660Melon (DHL92) v3.5.1cmomeB803
CmoCh08G001660Watermelon (Charleston Gray)cmowcgB802
CmoCh08G001660Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB800
CmoCh08G001660Melon (DHL92) v3.6.1cmomedB906
CmoCh08G001660Silver-seed gourdcarcmoB0119
CmoCh08G001660Watermelon (97103) v2cmowmbB899