CmoCh07G012780 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)

Overview
NameCmoCh07G012780
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
DescriptionAspartate aminotransferase (2.6.1.1)
LocationCmo_Chr07 : 7015336 .. 7032584 (-)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAATTTAAACTTCAACTTCGAGGGCTTTGAGTTTCGGATGGTTTGATCATGTGAAACCGGCTCCTAAGGATCCGATCTTCGGTGCTACGGAGGCTTTCATGGCCGATCCATGCACGAACAAAATCAACCTTGGAGTGGTAATGATTAAACTCTGTTTTTTTATTGTTTTCTTTTGAATTCGTGGAAAGTTTTCGTGTTTTTGGTTTTTGAATTATTTACTTTGGAAGGGAGCTTATCGGATCGATTAGGGGGAACCGGTTGTGCTTCTATGTCTTGGAGATGCTGAATCGAAGATCGCCGGTAGTGAGTTCTTGTAAGTTCCAATGCTTAGTTTCCTGCTGAGTCCTTATTAAGAGGATATTTTGCCGTGATAATTAGTTAGAATATATCTTAGATATTTAGGAAGCTGTTAGTATAGATTTGATTAACAGTATATTTTATTTATTTACCAGATTTAATTACATATATATTTTTCTATTTTTAGGTATTAGTTGATAGTTTGTATCCTATTTAAACGTGTAAACCTGAATGAAGATCATACTTTCGATCCCAATTCTATTTCTATTTCTATTTCTCATTCTTAACATGGTATCAGAGCACCGATCTTGGTGTTCTTAAATATCAAAATTTCCTTTATGGCGGAATCAGCCAAATCTAGCTTCGAAATTTCGGATGTTGATTTAACACATCCGTACTATATTCATCACTCTGATCAGCCAGGATATTCACTTGTTCCAATCAAATTAAATGGAGCAAATTATCAATCCTGGAGGAAATCAGTTATGCATGCTCTTATTGCCAAGAAGAAAATTGGCTTCATTGATGGCACAATTGAGGAACCGTCCCAAGATGCAAATTCAACCGAATTCGAACTCTGGAATCAGTGCAACAGTATGATAATATCTTGGTTAACTCATTCCGTTGAAGCAGATATCGCTAAAGGCATTATTCACGCCAAGACAGCTCATCAAGTGTGGGTTGATCTTCACGATCAATTCTCACAAAAGAATGCTCCAGCAATTTTTCAAATACAAAACTCGATAGCAACGATGTCACAAGGAACCATGGCACTGTCAACATATTTCACCAAGCTCAAAGCACTCTGGGATGAACTGGAAGCGTACCGCACACCATTTACCTGTAATCAACGTCAAATACATATTGATCAACGCGAAGAAGACAAGTTGATGCAATTGCTCATGGGGCTCAATCAGTCTTATAAAACGGTGAGATCTAACATATTGATGATGTCTCCATTACCTAATGTGAGGCAAGCCTATTCATTACTTGTACAAGAAGAGATGTAGCGTCAGGTAACTTCCGAACCTACTGAGAAAATCTCGATTGCATCAGCAGTGCAAAAGAAAACAATATATTCAAAATTCGCCAAGGACAAATTGTGTGAACACTGCAATAAAAGTGGTCATAGAATTAATGAGTGTCGAATTCTTAAGTTTCACTGTAAGTTTTGTGATAGAAGGGGCCATACAGAAGATCGGTGTCGACAGAAAAATAATTCTGGAAGGACAAGACAAGACAATCAACACAATAACCGTGGATATCGATCATCTGCAAATATGGCCGATGTTTCACAGTTGAATACAGAAGAACAGTCACCTAATTCCATTCCAAATTTTTCTTCTGAGCAATTACGACAGATAGCACAAGCCTTATCTGCAATCAATCATCACCCTTCTGGTAATTCTGACAATCACATCAATGTTGCAGGTTTGTTTCCCATATCTACATTATCTATTAACTCTGCGAGTTCTAATTCATGGATTCTCGATAGTAGAGCTACGGATCATATAGTATCAAAATCTTCTGTTATGACTGAACCAAAGACTGCCATCATGTCTACAATAAATTTGCCTAATGGAGAGACAGCACGTGTGTCACATACTGGCAATATTTCCCTTAGCCCTAACCTTAAATTAAACAACGTTTTATGTGTGCCTTCATTCAATTTAAACCTAATGTCGATCAGCAAACTTACCAATAACTTGAAATGTTATGTCACCTTCTATCCTGATTCTTGTGTTATGCAGGACTTGGCTACGGGGAAGATGATTGGCTCGGGTAAACAATTTGGAGGTCTCTATCATATTTCTTCATCTCCAATCAAGTCTTCAGCTCATCAAGTATCTCAGTCATCTGATTTGTGGCATTTACGCCTAGGTCATCCTTCCTTTTCTCGTTTTAAATTTCTAGCTGATCAATTGCATCTTAATAATGCGAGTTATTCTCATAATTGCAGTATCTGCCCGTTAGCAAAACAAACTAGGTTGTCTTTCCCAAGAAGTTCAATAACAACCCATTCTGCTTTTGATCTGATACATTGTGATGTTTGGGGACCACATAAAATTCCTACCCATTCTGGTTTGCGTTTTTTTCTCACTATTGTTGATGATTTTACTCGATGTACTTGGGTTTTTTTAATGCAACATAAGTCAGAAGTACATCATTTGTTGATGAACTTTGTTAAATTCGTTCAAACTCAATTTCATACTACTATCAAGATAGTTCGATCAGACAATGGGACTGAGTTCCTATCTTTGCAACCATTCTTTACTTCTTGTGGTATTGAATTTCAGTGCACTTGTGTCTATACTCCACAACAAAATGGAGTCGTAGAACGCAAGCATCGCCATATCCTAAATGTAGCTAGGTCTCTTCTTTTTCAGTCACAGGTTCCACTTAATTTTTGGGGAGAGTGCATTTTAACGGCTGTTTATCTTATAAATAGAACGCCATCACCATTATTATCTAACAAGACACCCTTTGAAGCACTCTACAAACGACCACCTACATTTCATCATCTTAAAGTTTTTGGTTGTAAATGTTATGCAACTATAGTACATCCTAAGCAAAAATTTGAACCTAGGGCAACTCCTTGTGTTTTCGTAGGATATCCTTGTGGTCATAAAGGTTACAAGTTGTATGACATGCAATCTCACACATTCTTTATCAGCCGTAATGTCAAATTTTGTGAAGATGATTTTCCTTTTTCATCAGCTTCACAAACTTCGACATTAGCTCCTTCGACTCCTGTTGTACCACTTCATGATCCATCCTACTCAAACATCCATCCTCCACCTTCACCTCCTATTCCTTCACCTCCTACTCCTCCTTCACCTCCTATTCCTTCACCTCCTACTCCTCCTTCACCTCCTATCCCTTCACCTACTACTCCGTCGTCTCCTCCACCTTCTCCAGATTCGCCCACTAATTCCAATCCTATCCCACCTGATACATCAGCTCCACTTCGACGTTCTACTCGTACTAAACAGCCTCCAGCTTGGCATAAGGATTATGAGATGTCTTCTGGAGCCAATCATTTAACCTCTAGCTCAAGTCCCGGCACTGGCACCAGGTATCCCCTTCATCATTACCTTTCATTCTCTCGTTTTTCTCCTACTCAACGTGCTTTTCTAGCTCTTATTACATCCCAGACAGAACCTAAAACCTATGATGAGGCAGTTGGCGACCCGTTATGGCAGCAGGCTATGAATGATGAAATTGCAGCTTTGGAACGTAATCATACATGGTCTCTCGTTCCTCTACCACTTGGTCATAAAGCTATTGGTTGTCGTTGGGTGTACAAAATTAAATACAACTCTGATGGTTCTGTTGAACGTTATAAAGCTCGACTAGTAGCAAAGGGGTACACTCAGGTTGAAGGTATTGATTACACAGAAACATTTTCCCCTACAGCGAAACTTACTACACTTCGTTGCTTACTCACTGTTGCTGCTGCTCGAAAATGGTTCACCCATCAGTTGGATGTTCAAAATGCCTTTCTCCATGGTAATCTAGACGAGGAAGTTTATATGTCTTTACCACCAGGTCTTCGCCGACAGGGGGAGAATACAGTATGTCGGCTCCATAAATCTCTTTATGGATTAAAACAGGCTTCTCGCAATTGGTTCTCCATATTTTCTACAACTATACAAAATGCAGGCTACACTCAGTTCAATGCAGATTACTCTTTGTTTACTAAGAGTAAAGGTACTTCTTTCACTGCAGTTCTAATCTATGTTGATGATATTCTGTTGACAGGCAATGATCTCGAAGAAATTCAATATCTCAAGACTAGTTTACTCCAGAAATTTCTTATCAAAGATTTAGGAAATTTGAAATATTTTCTAGGTATTGAATTTTCTCGATCTAGAAAAGGAATTTTTATGTCTCAAAGGAAGTATGCTCTAGACATCCTTCAAGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN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mRNA sequence

ATGAATTTAAACTTCAACTTCGAGGGCTTTGAGTTTCGGATGGATCCGATCTTCGGTGCTACGGAGGCTTTCATGGCCGATCCATGCACGAACAAAATCAACCTTGGAGTGTTGATTTATGGAAAGGATTCAAGTGTTACAAAGGAAAGGAGATTTTCTGGAGTTCAGGCACTTTCTGGGACTGGAACGTGCCGACTGCTTGCTGAATTTCAGAGCCATTTCCATCCTGATGTTCCAATGTTCTTGCCCGAACCAACTTGGTCTAAGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAATTTAAACTTCAACTTCGAGGGCTTTGAGTTTCGGATGGATCCGATCTTCGGTGCTACGGAGGCTTTCATGGCCGATCCATGCACGAACAAAATCAACCTTGGAGTGTTGATTTATGGAAAGGATTCAAGTGTTACAAAGGAAAGGAGATTTTCTGGAGTTCAGGCACTTTCTGGGACTGGAACGTGCCGACTGCTTGCTGAATTTCAGAGCCATTTCCATCCTGATGTTCCAATGTTCTTGCCCGAACCAACTTGGTCTAAGTAA
Homology
[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. Swiss-Prot
Match: AAT1_ARATH (Aspartate aminotransferase, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana GN=ASP1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 63.5 bits (153), Expect = 1.3e-09
Identity = 26/51 (50.98%), Postives = 34/51 (66.67%), Query Frame = 1 

Query: 38  LIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
           L YG +S   K++R + VQ LSGTG CRL A+FQ  F P   +++P PTWS
Sbjct: 111 LAYGDNSEFIKDKRIAAVQTLSGTGACRLFADFQKRFSPGSQIYIPVPTWS 161

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. Swiss-Prot
Match: AATC_YEAST (Aspartate aminotransferase, cytoplasmic OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) GN=AAT2 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 50.8 bits (120), Expect = 8.8e-06
Identity = 23/55 (41.82%), Postives = 33/55 (60.00%), Query Frame = 1 

Query: 34  NLGVLIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
           N   +I+G  S   +E R   VQ+LSGTG   + A+F S F PD  ++L +PTW+
Sbjct: 82  NAAKIIFGTQSDAFQEDRVISVQSLSGTGALHISAKFFSKFFPDKLVYLSKPTWA 136

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KXS3_CUCSA (Aspartate aminotransferase OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G329570 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 2.0e-17
Identity = 54/120 (45.00%), Postives = 61/120 (50.83%), Query Frame = 1 

Query: 15  DPIFGATEAFMADPCTN------------------------------------KINLGV- 74
           DPI G TEAF+ADP  N                                     I+  V 
Sbjct: 34  DPIIGVTEAFLADPSPNKINLGVGAYRDDEGKPVVLQCVRDAESKITGSEFLESISAAVS 93

Query: 75  ---------LIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
                    LIYGK+S V KERRF+G+QALSGTG CRL AEFQ HFH DVP+FLP+PTWS
Sbjct: 94  SRFVEESVELIYGKNSDVMKERRFAGLQALSGTGACRLFAEFQRHFHHDVPIFLPDPTWS 153

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. TrEMBL
Match: A0A061EJB6_THECC (Aspartate aminotransferase OS=Theobroma cacao GN=TCM_019751 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 2.9e-16
Identity = 50/120 (41.67%), Postives = 59/120 (49.17%), Query Frame = 1 

Query: 15  DPIFGATEAFMADPCTNKINLG-------------------------------------- 74
           DPI   TEAF+ADPC  KINLG                                      
Sbjct: 35  DPINAVTEAFLADPCPYKINLGVGAYRDDDGKPVVLQCVREAEGKIAATNFLESTCAAIS 94

Query: 75  --------VLIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
                    L+YG+DS V KE RF+GVQALSGTG CRL AEFQ  F+PD  +++P+PTWS
Sbjct: 95  SKLVEESAKLVYGEDSDVIKEGRFAGVQALSGTGACRLFAEFQRRFYPDSRIYMPDPTWS 154

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. TrEMBL
Match: A0A061EI11_THECC (Aspartate aminotransferase OS=Theobroma cacao GN=TCM_019751 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 2.9e-16
Identity = 50/120 (41.67%), Postives = 59/120 (49.17%), Query Frame = 1 

Query: 15  DPIFGATEAFMADPCTNKINLG-------------------------------------- 74
           DPI   TEAF+ADPC  KINLG                                      
Sbjct: 35  DPINAVTEAFLADPCPYKINLGVGAYRDDDGKPVVLQCVREAEGKIAATNFLESTCAAIS 94

Query: 75  --------VLIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
                    L+YG+DS V KE RF+GVQALSGTG CRL AEFQ  F+PD  +++P+PTWS
Sbjct: 95  SKLVEESAKLVYGEDSDVIKEGRFAGVQALSGTGACRLFAEFQRRFYPDSRIYMPDPTWS 154

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. TrEMBL
Match: A0A067JJ16_JATCU (Aspartate aminotransferase OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_00375 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 2.3e-13
Identity = 35/51 (68.63%), Postives = 42/51 (82.35%), Query Frame = 1 

Query: 38  LIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
           L+YGKDS V KE RF+GVQALSGTG CRL AEFQ  ++P+  M+LP+PTWS
Sbjct: 95  LVYGKDSDVIKEGRFAGVQALSGTGACRLFAEFQRRYYPESSMYLPDPTWS 145

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. TrEMBL
Match: B9SZA2_RICCO (Aspartate aminotransferase OS=Ricinus communis GN=RCOM_1232370 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 3.0e-13
Identity = 35/51 (68.63%), Postives = 42/51 (82.35%), Query Frame = 1 

Query: 38  LIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
           L+YGKDS V KE RF+GVQALSGTG CRL AEFQ  F+P+  ++LP+PTWS
Sbjct: 102 LVYGKDSEVVKEGRFAGVQALSGTGACRLFAEFQRRFYPESGIYLPDPTWS 152

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. TAIR10
Match: AT2G30970.1 (AT2G30970.1 aspartate aminotransferase 1)

HSP 1 Score: 63.5 bits (153), Expect = 7.4e-11
Identity = 26/51 (50.98%), Postives = 34/51 (66.67%), Query Frame = 1 

Query: 38  LIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
           L YG +S   K++R + VQ LSGTG CRL A+FQ  F P   +++P PTWS
Sbjct: 111 LAYGDNSEFIKDKRIAAVQTLSGTGACRLFADFQKRFSPGSQIYIPVPTWS 161

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. TAIR10
Match: AT5G19550.1 (AT5G19550.1 aspartate aminotransferase 2)

HSP 1 Score: 50.4 bits (119), Expect = 6.4e-07
Identity = 25/51 (49.02%), Postives = 35/51 (68.63%), Query Frame = 1 

Query: 38  LIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEF-QSHFHPDVPMFLPEPTW 88
           LI G DS    E R + VQ LSGTG+ R+ AEF ++H+H  V +++P+PTW
Sbjct: 85  LILGADSPAITESRVTTVQCLSGTGSLRVGAEFLKTHYHQSV-IYIPKPTW 134

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. NCBI nr
Match: gi|659128554|ref|XP_008464260.1| (PREDICTED: aspartate aminotransferase, mitochondrial-like isoform X2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 99.0 bits (245), Expect = 4.5e-18
Identity = 55/119 (46.22%), Postives = 62/119 (52.10%), Query Frame = 1 

Query: 15  DPIFGATEAFMADPCTN-----------------------------------KINLGV-- 74
           DPI G TEAF+ADP  N                                    I+ GV  
Sbjct: 36  DPIIGVTEAFLADPSPNKINLGGAYRDDEGKPVVLQCVRDAESKITGSEFLESISAGVSS 95

Query: 75  --------LIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
                   LIYGK+S V KERRF+G+QALSGTG CRL AEFQ HFH DVP+FLP+PTWS
Sbjct: 96  RFVEESVELIYGKNSDVMKERRFAGLQALSGTGACRLFAEFQRHFHHDVPIFLPDPTWS 154

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. NCBI nr
Match: gi|659128552|ref|XP_008464259.1| (PREDICTED: aspartate aminotransferase, mitochondrial-like isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 98.6 bits (244), Expect = 5.8e-18
Identity = 55/120 (45.83%), Postives = 62/120 (51.67%), Query Frame = 1 

Query: 15  DPIFGATEAFMADPCTN------------------------------------KINLGV- 74
           DPI G TEAF+ADP  N                                     I+ GV 
Sbjct: 36  DPIIGVTEAFLADPSPNKINLGVGAYRDDEGKPVVLQCVRDAESKITGSEFLESISAGVS 95

Query: 75  ---------LIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
                    LIYGK+S V KERRF+G+QALSGTG CRL AEFQ HFH DVP+FLP+PTWS
Sbjct: 96  SRFVEESVELIYGKNSDVMKERRFAGLQALSGTGACRLFAEFQRHFHHDVPIFLPDPTWS 155

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. NCBI nr
Match: gi|778693945|ref|XP_011653716.1| (PREDICTED: aspartate aminotransferase, mitochondrial-like isoform X2 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 2.2e-17
Identity = 54/119 (45.38%), Postives = 61/119 (51.26%), Query Frame = 1 

Query: 15  DPIFGATEAFMADPCTN-----------------------------------KINLGV-- 74
           DPI G TEAF+ADP  N                                    I+  V  
Sbjct: 34  DPIIGVTEAFLADPSPNKINLGGAYRDDEGKPVVLQCVRDAESKITGSEFLESISAAVSS 93

Query: 75  --------LIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
                   LIYGK+S V KERRF+G+QALSGTG CRL AEFQ HFH DVP+FLP+PTWS
Sbjct: 94  RFVEESVELIYGKNSDVMKERRFAGLQALSGTGACRLFAEFQRHFHHDVPIFLPDPTWS 152

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. NCBI nr
Match: gi|449464416|ref|XP_004149925.1| (PREDICTED: aspartate aminotransferase, mitochondrial-like isoform X1 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 2.9e-17
Identity = 54/120 (45.00%), Postives = 61/120 (50.83%), Query Frame = 1 

Query: 15  DPIFGATEAFMADPCTN------------------------------------KINLGV- 74
           DPI G TEAF+ADP  N                                     I+  V 
Sbjct: 34  DPIIGVTEAFLADPSPNKINLGVGAYRDDEGKPVVLQCVRDAESKITGSEFLESISAAVS 93

Query: 75  ---------LIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
                    LIYGK+S V KERRF+G+QALSGTG CRL AEFQ HFH DVP+FLP+PTWS
Sbjct: 94  SRFVEESVELIYGKNSDVMKERRFAGLQALSGTGACRLFAEFQRHFHHDVPIFLPDPTWS 153

[Close]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. NCBI nr
Match: gi|590654004|ref|XP_007033581.1| (Aspartate aminotransferase isoform 2 [Theobroma cacao])

HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 4.2e-16
Identity = 50/120 (41.67%), Postives = 59/120 (49.17%), Query Frame = 1 

Query: 15  DPIFGATEAFMADPCTNKINLG-------------------------------------- 74
           DPI   TEAF+ADPC  KINLG                                      
Sbjct: 35  DPINAVTEAFLADPCPYKINLGVGAYRDDDGKPVVLQCVREAEGKIAATNFLESTCAAIS 94

Query: 75  --------VLIYGKDSSVTKERRFSGVQALSGTGTCRLLAEFQSHFHPDVPMFLPEPTWS 89
                    L+YG+DS V KE RF+GVQALSGTG CRL AEFQ  F+PD  +++P+PTWS
Sbjct: 95  SKLVEESAKLVYGEDSDVIKEGRFAGVQALSGTGACRLFAEFQRRFYPDSRIYMPDPTWS 154

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmoCh07G012780 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
AAT1_ARATH1.3e-0950.98Aspartate aminotransferase, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana GN=ASP1 PE=1 S... [more]
AATC_YEAST8.8e-0641.82Aspartate aminotransferase, cytoplasmic OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC... [more]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KXS3_CUCSA2.0e-1745.00Aspartate aminotransferase OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G329570 PE=3 SV=1[more]
A0A061EJB6_THECC2.9e-1641.67Aspartate aminotransferase OS=Theobroma cacao GN=TCM_019751 PE=3 SV=1[more]
A0A061EI11_THECC2.9e-1641.67Aspartate aminotransferase OS=Theobroma cacao GN=TCM_019751 PE=3 SV=1[more]
A0A067JJ16_JATCU2.3e-1368.63Aspartate aminotransferase OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_00375 PE=3 SV=1[more]
B9SZA2_RICCO3.0e-1368.63Aspartate aminotransferase OS=Ricinus communis GN=RCOM_1232370 PE=3 SV=1[more]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT2G30970.17.4e-1150.98 aspartate aminotransferase 1[more]
AT5G19550.16.4e-0749.02 aspartate aminotransferase 2[more]
BLAST of CmoCh07G012780 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|659128554|ref|XP_008464260.1|4.5e-1846.22PREDICTED: aspartate aminotransferase, mitochondrial-like isoform X2 [Cucumis me... [more]
gi|659128552|ref|XP_008464259.1|5.8e-1845.83PREDICTED: aspartate aminotransferase, mitochondrial-like isoform X1 [Cucumis me... [more]
gi|778693945|ref|XP_011653716.1|2.2e-1745.38PREDICTED: aspartate aminotransferase, mitochondrial-like isoform X2 [Cucumis sa... [more]
gi|449464416|ref|XP_004149925.1|2.9e-1745.00PREDICTED: aspartate aminotransferase, mitochondrial-like isoform X1 [Cucumis sa... [more]
gi|590654004|ref|XP_007033581.1|4.2e-1641.67Aspartate aminotransferase isoform 2 [Theobroma cacao][more]
Annotated Terms
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR000796Asp_trans
IPR015422PyrdxlP-dep_Trfase_dom1
IPR015424PyrdxlP-dep_Trfase
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0006520cellular amino acid metabolic process
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0008483transaminase activity
GO:0003824catalytic activity
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006520 cellular amino acid metabolic process
biological_process GO:0006534 cysteine metabolic process
biological_process GO:0006571 tyrosine biosynthetic process
biological_process GO:0000162 tryptophan biosynthetic process
biological_process GO:0009220 pyrimidine ribonucleotide biosynthetic process
biological_process GO:0006560 proline metabolic process
biological_process GO:0006107 oxaloacetate metabolic process
biological_process GO:0006536 glutamate metabolic process
biological_process GO:0009094 L-phenylalanine biosynthetic process
biological_process GO:0015976 carbon utilization
biological_process GO:0006531 aspartate metabolic process
biological_process GO:0006525 arginine metabolic process
biological_process GO:0009821 alkaloid biosynthetic process
biological_process GO:0006522 alanine metabolic process
biological_process GO:0006103 2-oxoglutarate metabolic process
biological_process GO:0009058 biosynthetic process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0008483 transaminase activity
molecular_function GO:0005507 copper ion binding
molecular_function GO:0004069 L-aspartate:2-oxoglutarate aminotransferase activity
molecular_function GO:0080130 L-phenylalanine:2-oxoglutarate aminotransferase activity
molecular_function GO:0030170 pyridoxal phosphate binding
molecular_function GO:0003824 catalytic activity
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh07G012780.1CmoCh07G012780.1mRNA


InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata
Date Performed: 2017-05-19
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR000796Aspartate/other aminotransferasePANTHERPTHR11879ASPARTATE AMINOTRANSFERASEcoord: 38..88
score: 1.2
IPR015422Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2GENE3DG3DSA:3.90.1150.10coord: 15..42
score: 2.1E-4coord: 43..88
score: 4.
IPR015424Pyridoxal phosphate-dependent transferaseunknownSSF53383PLP-dependent transferasescoord: 13..88
score: 3.3
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR11879:SF14SUBFAMILY NOT NAMEDcoord: 38..88
score: 1.2

Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CmoCh07G012780Lsi01G016010Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB779
CmoCh07G012780Cp4.1LG10g07710Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB807
CmoCh07G012780Cp4.1LG19g01430Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB817
CmoCh07G012780MELO3C026051.2Melon (DHL92) v3.6.1cmomedB888
CmoCh07G012780CsaV3_4G027010Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB1004
CmoCh07G012780Cla97C04G073110Watermelon (97103) v2cmowmbB860
CmoCh07G012780Bhi03G001745Wax gourdcmowgoB1064
CmoCh07G012780CsGy4G015720Cucumber (Gy14) v2cgybcmoB541
CmoCh07G012780Carg19502Silver-seed gourdcarcmoB0864
The following gene(s) are paralogous to this gene:
GeneParalogueOrganismBlock
CmoCh07G012780CmoCh03G003190Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB456
The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmoCh07G012780Cucumber (Gy14) v1cgycmoB0352
CmoCh07G012780Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB668
CmoCh07G012780Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB875
CmoCh07G012780Wild cucumber (PI 183967)cmocpiB862
CmoCh07G012780Cucumber (Chinese Long) v2cmocuB854
CmoCh07G012780Melon (DHL92) v3.5.1cmomeB785
CmoCh07G012780Watermelon (Charleston Gray)cmowcgB762
CmoCh07G012780Watermelon (97103) v1cmowmB817
CmoCh07G012780Silver-seed gourdcarcmoB0035
CmoCh07G012780Silver-seed gourdcarcmoB0395