CmoCh04G000640 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	CmoCh04G000640
Type	gene
Organism	Cucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
Description	Jasmonate ZIM-domain protein 2
Location	Cmo_Chr04 : 346766 .. 363403 (+)

Genome Viewer

Gene Expression

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

CAAAAGCATGCTTAAATTCCAACGACGGCCAGGATCCAATAATACGCCCTCTCTCTTTCTCTCTTGCTTGCTTTCGTTTTTGGTGCAGTTGAATTTTCTCTTAAGCGTCTTTGCCCTTCTCTTTGTTTCAGAGTTGGTCGGATTTGAGGTCTTTTCTGGTGTCAACTTTGGTCTGAAATGGAGAGGGATTTTTTAGGTCTCAGCTCCAAGGAGGAGCCATTGGCTAAGGTGAAAGAGGAAATTGACAACGATGGAGCCCAAGGTTTTGGTTATTTTTCCAATTCCATTTTGTTTACCTTAATGAACTTTCACGAACTTTGTCGTTGTTTAATTCATTTTATTTCTTCTGTTTTTTAATTCTCTGTTTATGGCTGGTTGAATCTTGATGTTTGGAATTTTCTTTTTTTAATAGTGTTCTTGATTGGAGATGTTTTTTGTTAAGTGGTGATTGTTTGTGATTGGTCGGTGAAATTTTGTTGGATGACCAAATCCTCTTTAATTTCAGTTTAAATCTGTTTTTCTGCCAAGAAATTTGGGGGCCTTGATGTTTTGAAGCTCCATAATTTCATTTGTAGTTCTTGTTAGTCAAGATAATTGTTAAGGATAGTTGACCGTCACTATAAGGCAAATATCTAGATATTTGCCTTACATTACGGGTTACCATATTTGCCCTCTTATTAAAGGCAAATATATTGCATTCATTTATTATTCTTTCCTTTTATTACTATTTCCATAATATTTGTAATTTACCATATTTCTGTATTCTGAAAATAATTATAAATAAGAGAACTCTCACCCCCATTGAGGTGTGGTGATTCAGCAAACATTCACATGGTATCAGAGCCCTTTCGGTTTAACAACCCTGATCCTTTCTTCTCTATGGCTTCCGAATCTTCTTATCATCTTCTTCCTTTCAATACTCTAATCCATATGATCACCATCAAACTTTCTTCCTCCAATTATCTTCTTTGGAAAAGCCAACTTCTCCCTCTTCTTGAGAGTCAAGACATGCTGGGCTATGTCGATGGAACCAGGGTTCCACCACCTCGCTTTGAACCAGAAACCTCTTCAACACTCAACCCCAAATATTTGGCATGGAGAGCAGCCGATCAACGACTTCTCTGTCTCCTGCTCTCCTCTCTCACTGAGGAAGCCATGGCTGTTGTCGTTGGTCTCCCTACTGCACGTGATGTTTGGCTTGCGTTGGAAACTACGTTCAGCCATCAGTTCAGCACATTATGACAATTTTCATCCCTTTGGTTGTCGTGTTTATCCTTATTTGCGTGATTATATGCCTAACAAGCTTTCTCCCCGCAGCATTCCTTGTATTTTTTTGGGTTATAGTCCTGCTCATAAAGGGTTTCGCTGTCTTGATCCGGCCACCACTAAGCTATATATCACCTGTCATGCTCAATTTGATGAAACCCACTTTCCTGCTATCCCTAGCTCCCAGACCCAACCTCTTTCCTCTATTCCTATTTCAAATTTCTTAGAACCACATTTTCATCATATTGATTCATCCCCCCCTACCACTTCATCACCGCAAACTCCTCGATCCAGTTCATCCCCGTGTGATATTTGTTCTGACCTTGTAGATGAGTCTGTGCAGGTTGATACTTCTCTTGCAGGTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTTGTCGTTGTTTAATTCATTTTATTTCTTCTGTTTTTTAATTCTCTGTTTATGGCTGGTTGAATCTTGATGTTTGGAATTTTCTTTTTTTAATAGTGTTCTTGATTGGAGATGTTTTTTGTTAAGTGGTGATTGTTTGTGATTGGTCGGTGAAATTTTGTTGGATGACCAAATCCTCTTTAATTTCAGTTTAAATCTGTTTTTCTGCCAAGAAATTTGGGGGCCTTGATGTTTTGAAGCTCCATAATTTCATTTGTAGTTCTTGTTAGTCAAGATAATTGTTAAGGATAGTTGACCGTCACTATAAGGCAAATATCTAGATATTTGCCTTACATTACGGGTTACCATATTTGCCCTCTTATTAAAGGCAAATATATTGCATTCATTTATTATTCTTTCCTTTTATTACTATTTCCATAATATTTGTAATTTACCATATTTCTGTATTCTGAAAATAATTATAAATAAGAGAACTCTCACCCCCATTGAGGTGTGGTGATTCAGCAAACATTCACAATAATCTTGTGTTCTAGTCTGGTAATCTCACTGATCTTCACGAGTTTTTTTTTTTTAGGGTATTCTAAAAGCTCTGGTGTTCCTCATCCGATGGCTTTCAAGATTTCTGCTGAGGACAAGACTGCGTATCCGGTTGTGGCTGCTTCGGATCAACGCAGAGCAGCGGATGCCCAGGTTTGATATCTGTTCCTCGGTTTTGTTTTTGATATGTTCTTCCTTCACTCGTTTGCTTTTAGTCGCGGTAGCTCCTAAACTAGAGGTGTATGGCTTGCTTTTGTTTGGGCTGATGTGGTTGTATCTCTTTCTCCGGTTGTATCCTTCACTTTTTCAATCTAGAAAACGTTCAATCTGGATAGGCAAGGTGGCCCTCAAATTTCCCTGGCAGCTTATCCTATGCAATCTGATTTGTATTCGATTCATCGTCCTCATGAAACGAAACTATTTTCCGTTCCAAATCAAGGTATATCTGTTTCATTAGGTAATCCATCCGTGAAGAACCCTTTTGCTCTTCCTGCTCAGATGGCTGGTCCTATCCTCAAACAACCACTTGGAGGAGTCCCGGTTTCAAGCGCTCTGAATTCATTTTTCCCGCCATTTGGATCCATTTCTGGGATCACTGAACCATGGTAACACTCTTGTACTTGTACTTTTTAACTTCTTTCTTAAGCTTTAATGAACATTTGTAGGAAGAACTGAATGTAATTTGAACAGTTTTTTAATCCTCTGTTCAGGAATAGCATGAAACCAACTGGTGGGTCTCCAGCTCAACTGACTATTTTTTATGGTGGTACCGTCAAAGTCTATGATGACATTACCCCTGAAAGGGTAATTATCATATAAGTTCTCTTTTGAAGTGCCATGAGTAAAGGAAGGGCTCTGAGATCGATATCCCTTTTGCAGGCTCAGGCTATAATGTTCTTGGCTGGAGCTGGGGCTTCCGTATCCAACATTGCACATCAAAAAGCTCAAGCTCAAGCTCAAGCTCATGGAATGGGTGCAAAAATGGCAACCGCAAGTGATGGTGCTCCCAAGAACCAACCCGTGAGCACCTTGCCCTGCCCTGCTCTATCTAGCCCCTTGTCTGTTTCTTCTCACACAGGAGCCCAGTCTGGGAGTGGTTCAAGTTGTTCTGATGAGTTGGGAGGAGTTAAAACCAATGGACTTCCCACCACTCCTATCAGCAAAGGAGAGCCTCCAAGAATAGTCAATGCAGTCGGACCTGTTGCTGCTACTGCTATGCTGCCCTCTGGTATGCCATACGCCAACAAGAGCCATCATTTTTTCTTCTTTCATTCATTGATGTGCCTGTTTTAGCTGATGATTCACGAATTAGGTCAAATTAATGTATCAATAACTTAGGATGTTCAATGATTTGGGAGCAAGCATTCCGACGGTATAATTAGTAGGAACTTTCTTGAGTTGCAACTTATATTTCATTTTTGGTTTACTTCTACAGCTGTTCCACAGGCTCGTAAAGCATCCTTAGCTCGGTTCTTAGAAAAGCGCAAGGAAAGGTAAGTCATTTTACGATATCTTGTCACAAATAGAACATCATCAAAGAACATATAGAGATCCAAATTATGGCCATCTAAATTATCTGCATTTTGATGTACATATAGGGTCATGAGCTCTTCTCCATACAATCTTAGCAAGAAACATCCCGAGTGTGCTGCGACAGAATCCAACGGTGCAAATTTCTCGAGTCCTATCACGAGCAACAGTGCTAATGTGGCAAGCTGAGAACAACAATCCTTTATGATGTAAAACATAGAGAATGATGGTTTTGTAAGTTAAAGAAGAAGATGTAAGCTAATGGTTCTTATGGTCTATTATTATGTGAACAGCCTTCATGAGCCTTGACTATTAAAGTTTTAATAGTTCCATGTCTTAAATAATATTTTGCCTACACAAAGCTGTTCTAAAGTTTTCAATTAATATCTGTTCATGATCAACAATCAGATATCATAGAATTCTATTTAGTATAGCATTTGGATGACATGAGACTGTTTATGTGTATTGATAAAGATTTGGTTAGTAG

mRNA sequence

CAAAAGCATGCTTAAATTCCAACGACGGCCAGGATCCAATAATACGCCCTCTCTCTTTCTCTCTTGCTTGCTTTCGTTTTTGGTGCAGTTGAATTTTCTCTTAAGCGTCTTTGCCCTTCTCTTTGTTTCAGAGTTGGTCGGATTTGAGGTCTTTTCTGGTGTCAACTTTGGTCTGAAATGGAGAGGGATTTTTTAGGTCTCAGCTCCAAGGAGGAGCCATTGGCTAAGGTGAAAGAGGAAATTGACAACGATGGAGCCCAAGGGTATTCTAAAAGCTCTGGTGTTCCTCATCCGATGGCTTTCAAGATTTCTGCTGAGGACAAGACTGCGTATCCGGTTGTGGCTGCTTCGGATCAACGCAGAGCAGCGGATGCCCAGAAAACGTTCAATCTGGATAGGCAAGGTGGCCCTCAAATTTCCCTGGCAGCTTATCCTATGCAATCTGATTTGTATTCGATTCATCGTCCTCATGAAACGAAACTATTTTCCGTTCCAAATCAAGGTATATCTGTTTCATTAGGTAATCCATCCGTGAAGAACCCTTTTGCTCTTCCTGCTCAGATGGCTGGTCCTATCCTCAAACAACCACTTGGAGGAGTCCCGGTTTCAAGCGCTCTGAATTCATTTTTCCCGCCATTTGGATCCATTTCTGGGATCACTGAACCATGGAATAGCATGAAACCAACTGGTGGGTCTCCAGCTCAACTGACTATTTTTTATGGTGGTACCGTCAAAGTCTATGATGACATTACCCCTGAAAGGGCTCAGGCTATAATGTTCTTGGCTGGAGCTGGGGCTTCCGTATCCAACATTGCACATCAAAAAGCTCAAGCTCAAGCTCAAGCTCATGGAATGGGTGCAAAAATGGCAACCGCAAGTGATGGTGCTCCCAAGAACCAACCCGTGAGCACCTTGCCCTGCCCTGCTCTATCTAGCCCCTTGTCTGTTTCTTCTCACACAGGAGCCCAGTCTGGGAGTGGTTCAAGTTGTTCTGATGAGTTGGGAGGAGTTAAAACCAATGGACTTCCCACCACTCCTATCAGCAAAGGAGAGCCTCCAAGAATAGTCAATGCAGTCGGACCTGTTGCTGCTACTGCTATGCTGCCCTCTGCTGTTCCACAGGCTCGTAAAGCATCCTTAGCTCGGTTCTTAGAAAAGCGCAAGGAAAGGGTCATGAGCTCTTCTCCATACAATCTTAGCAAGAAACATCCCGAGTGTGCTGCGACAGAATCCAACGGTGCAAATTTCTCGAGTCCTATCACGAGCAACAGTGCTAATGTGGCAAGCTGAGAACAACAATCCTTTATGATGTAAAACATAGAGAATGATGGTTTTGTAAGTTAAAGAAGAAGATGTAAGCTAATGGTTCTTATGGTCTATTATTATGTGAACAGCCTTCATGAGCCTTGACTATTAAAGTTTTAATAGTTCCATGTCTTAAATAATATTTTGCCTACACAAAGCTGTTCTAAAGTTTTCAATTAATATCTGTTCATGATCAACAATCAGATATCATAGAATTCTATTTAGTATAGCATTTGGATGACATGAGACTGTTTATGTGTATTGATAAAGATTTGGTTAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGAGAGGGATTTTTTAGGTCTCAGCTCCAAGGAGGAGCCATTGGCTAAGGTGAAAGAGGAAATTGACAACGATGGAGCCCAAGGGTATTCTAAAAGCTCTGGTGTTCCTCATCCGATGGCTTTCAAGATTTCTGCTGAGGACAAGACTGCGTATCCGGTTGTGGCTGCTTCGGATCAACGCAGAGCAGCGGATGCCCAGAAAACGTTCAATCTGGATAGGCAAGGTGGCCCTCAAATTTCCCTGGCAGCTTATCCTATGCAATCTGATTTGTATTCGATTCATCGTCCTCATGAAACGAAACTATTTTCCGTTCCAAATCAAGGTATATCTGTTTCATTAGGTAATCCATCCGTGAAGAACCCTTTTGCTCTTCCTGCTCAGATGGCTGGTCCTATCCTCAAACAACCACTTGGAGGAGTCCCGGTTTCAAGCGCTCTGAATTCATTTTTCCCGCCATTTGGATCCATTTCTGGGATCACTGAACCATGGAATAGCATGAAACCAACTGGTGGGTCTCCAGCTCAACTGACTATTTTTTATGGTGGTACCGTCAAAGTCTATGATGACATTACCCCTGAAAGGGCTCAGGCTATAATGTTCTTGGCTGGAGCTGGGGCTTCCGTATCCAACATTGCACATCAAAAAGCTCAAGCTCAAGCTCAAGCTCATGGAATGGGTGCAAAAATGGCAACCGCAAGTGATGGTGCTCCCAAGAACCAACCCGTGAGCACCTTGCCCTGCCCTGCTCTATCTAGCCCCTTGTCTGTTTCTTCTCACACAGGAGCCCAGTCTGGGAGTGGTTCAAGTTGTTCTGATGAGTTGGGAGGAGTTAAAACCAATGGACTTCCCACCACTCCTATCAGCAAAGGAGAGCCTCCAAGAATAGTCAATGCAGTCGGACCTGTTGCTGCTACTGCTATGCTGCCCTCTGCTGTTCCACAGGCTCGTAAAGCATCCTTAGCTCGGTTCTTAGAAAAGCGCAAGGAAAGGGTCATGAGCTCTTCTCCATACAATCTTAGCAAGAAACATCCCGAGTGTGCTGCGACAGAATCCAACGGTGCAAATTTCTCGAGTCCTATCACGAGCAACAGTGCTAATGTGGCAAGCTGA

Homology

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. Swiss-Prot
Match: TIF6B_ARATH (Protein TIFY 6B OS=Arabidopsis thaliana GN=TIFY6B PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 2.1e-29
Identity = 130/359 (36.21%), Postives = 177/359 (49.30%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQGYSKSSGVPHPMAFKISAEDKTAYPVVAASDQ 60
           MERDFLGL SK  P+  VKEE  ++ ++  + + G+    + K+SA            + 
Sbjct: 1   MERDFLGLGSKNSPIT-VKEET-SESSRDSAPNRGMNWSFSNKVSASSSQFLSFRPTQED 60

Query: 61  RRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSIHR--PHET----KLFSVPNQGI---S 120
           R        ++L   G    S  A     D+Y   R  P+ +    ++F   NQ     +
Sbjct: 61  RHRKSGN--YHLPHSGSFMPSSVA-----DVYDSTRKAPYSSVQGVRMFPNSNQHEETNA 120

Query: 121 VSLGNPSVKNPFALPAQ---MAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSISGITEPWNSMK 180
           VS+  P  ++    P     M      QPL GVP+ +   S  PP GSI G T+  +S K
Sbjct: 121 VSMSMPGFQSHHYAPGGRSFMNNNNNSQPLVGVPIMAPPISILPPPGSIVGTTDIRSSSK 180

Query: 181 PTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQAQAQAHGMGA 240
           P  GSPAQLTIFY G+V VYDDI+PE+A+AIM LAG G+S+  +       Q   H   A
Sbjct: 181 PI-GSPAQLTIFYAGSVCVYDDISPEKAKAIMLLAGNGSSMPQVFSPPQTHQQVVHHTRA 240

Query: 241 KMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVK-TNGLPTTP 300
            + +++       P S +P  +  SP + SS  G            LG  K T GL +T 
Sbjct: 241 SVDSSA------MPPSFMPTISYLSPEAGSSTNG------------LGATKATRGLTSTY 300

Query: 301 ISKGEPPRIVNAVGPVAAT--AMLPS-AVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPYNLSKK 344
            +       +N   PV+ +   M P+ A+P ARKASLARFLEKRKERV S SPY L KK
Sbjct: 301 HNNQANGSNINCPVPVSCSTNVMAPTVALPLARKASLARFLEKRKERVTSVSPYCLDKK 331

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. Swiss-Prot
Match: TIF6B_ORYSJ (Protein TIFY 6b OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=TIFY6B PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 111.3 bits (277), Expect = 2.3e-23
Identity = 126/399 (31.58%), Postives = 184/399 (46.12%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPL---AKVKEEIDNDGAQGYSKSSGVPHP-------MAFKIS----- 60
           MERDFLG   K+E     A+ ++E D  GA G + ++ +          M+F+ S     
Sbjct: 1   MERDFLGAIGKDEEQRRHAEERKESDYFGAGGGAAAAAMDWSFASRAALMSFRSSSSAAA 60

Query: 61  --AEDKT---AYPVVAASDQRRAADA------QKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSI 120
             A ++T   A+P  +A D  +   A      QK+F  +  G PQ + AA        ++
Sbjct: 61  AAAREETRELAFPHFSALDGAKMQQASHVLARQKSFGAESHGIPQYAAAA--------AV 120

Query: 121 HRPHETKLFSVPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQMAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPF 180
           H  H  +   V N    +   +P   N      Q + P L   +G      A     PPF
Sbjct: 121 HGAHRGQPPHVLNGARVIPASSPFNPNNPMFRVQ-SSPNLPNAVGAG--GGAFKQ--PPF 180

Query: 181 GSISGITEPWNSMKPTGGSP----AQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVS 240
              + +      +  T   P    AQLTIFY G+V V+++++PE+AQ +MFLA  G+  S
Sbjct: 181 AMGNAVAGSTVGVYGTRDMPKAKAAQLTIFYAGSVNVFNNVSPEKAQELMFLASRGSLPS 240

Query: 241 NIAHQKAQAQAQAHGMGAKMATASDGAP-------KNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGA 300
             A        +AH       T  + +P       K Q VS+ P PA+S P+SV S   +
Sbjct: 241 --APTTVARMPEAHVFPPAKVTVPEVSPTKPMMLQKPQLVSS-PVPAISKPISVVSQATS 300

Query: 301 QSGSGSSCSDELGGVKTNGLPTTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLAR 360
              S SS + +    K++G    P +   PP     +    A A++P AVPQARKASLAR
Sbjct: 301 LPRSASSSNVDSNVTKSSGPLVVPPTSLPPPAQPETLATTTAAAIMPRAVPQARKASLAR 360

Query: 361 FLEKRKERVMSSSPYNLSKKHPECAATESNGANFSSPIT 363
           FLEKRKERV + +PY L+K   E + T  +  +  S  T
Sbjct: 361 FLEKRKERVTTVAPYPLAKSPLESSDTMGSANDNKSSCT 383

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. Swiss-Prot
Match: TIF6A_ARATH (Protein TIFY 6A OS=Arabidopsis thaliana GN=TIFY6A PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 99.0 bits (245), Expect = 1.2e-19
Identity = 117/349 (33.52%), Postives = 157/349 (44.99%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQGYSKSSGVPHPMAFKISAEDKTAYPVVAASDQ 60
           MERDFLGL SK  P+  VKEE + D A     S G+   M +  S++      V +    
Sbjct: 1   MERDFLGLGSKLSPIT-VKEETNEDSAP----SRGM---MDWSFSSK------VGSGPQF 60

Query: 61  RRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSIHRPHETKLFSVPNQG----ISVSLGN 120
                +Q+   ++      +S AA       Y      E ++F   +Q     I+VS+  
Sbjct: 61  LSFGTSQQETRVNTVNDHLLSSAAMDQNQRTY-FSSLQEDRVFPGSSQQDQTTITVSMSE 120

Query: 121 PSVKNPFALPAQMAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSISGITEPWNSMKPTGGSPAQ 180
           P+  N F         I  Q LGG P+ +   S FP   +I   ++P          P Q
Sbjct: 121 PNYINSF---------INHQHLGGSPIMAPPVSVFPAPTTIRSSSKPL---------PPQ 180

Query: 181 LTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQAQAQAHGMGAKMATASDG 240
           LTIFY G+V VY DI PE+AQAIM LAG G       H K  +Q +   +       +D 
Sbjct: 181 LTIFYAGSVLVYQDIAPEKAQAIMLLAGNG------PHAKPVSQPKPQKLVHHSLPTTD- 240

Query: 241 APKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVKTN-GLPTTPISKGEPPR 300
            P   P S LP        S+S        SGS+    LG  KT   L +T  ++     
Sbjct: 241 -PPTMPPSFLP--------SISYIVSETRSSGSNGVTGLGPTKTKASLASTRNNQ----- 288

Query: 301 IVNAVGPVAATAMLPS-AVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPYNLSKK 344
                   AA +M P+  +PQ RKASLARFLEKRKERV++ SPY +  K
Sbjct: 301 -------TAAFSMAPTVGLPQTRKASLARFLEKRKERVINVSPYYVDNK 288

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. Swiss-Prot
Match: TIF6A_ORYSI (Protein TIFY 6a OS=Oryza sativa subsp. indica GN=TIFY6A PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 89.0 bits (219), Expect = 1.2e-16
Identity = 127/405 (31.36%), Postives = 176/405 (43.46%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLG-LSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQGYS------------KSSGVPHPMAFKISA- 60
           MERDFLG +  KEE   K +E  D  G  G +              +     M+F+ SA 
Sbjct: 1   MERDFLGAIGRKEEAAGKPEEHSDYRGGGGGASAAMQWQFPATKVGAASSAFMSFRSSAA 60

Query: 61  -----EDKTAY-------------PVVAASDQRRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAY--- 120
                + K A              P  +  D    A A K       G  Q + AA    
Sbjct: 61  AAREEDPKEAAVFDRFSLSGFRPPPRPSPGDAFDGAAAMKQRQFGFNGRQQYAAAAQHGH 120

Query: 121 -PMQSDLYSIHRPHETKLFSVPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQMAGPILK-----QPLG 180
                D Y +  PH    F  P+         PS ++P  +P   A P+L+        G
Sbjct: 121 REQGVDSYGVAAPHH---FPSPS---------PSPRHP--VPFGHANPMLRVHSLPNVAG 180

Query: 181 GVPVSSALNSFFPPFGSISGITE-----PWNSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPE 240
           G P     N  F    S++G T      P +   P      Q+TIFY G V V+D+I  E
Sbjct: 181 GSPYR---NQSFSVGNSVAGSTVGVYGGPRDLQNP---KVTQMTIFYDGLVNVFDNIPVE 240

Query: 241 RAQAIMFLAGAGASVSN-IAHQKAQAQAQAHGMGAKMATASDGAPKNQ-----PVSTLPC 300
           +AQ +M LA   +  S   A +K+ +   A    A   T  +  P  Q     P +++P 
Sbjct: 241 KAQELMLLASRASIPSPPSAARKSDSPISA----AAKLTVPEALPARQIVVQKPEASVPL 300

Query: 301 PA-LSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVKTNGLP--TTPISKGEPPRIVNAVGPVAA 351
            + +S+P+++ S       S SS +D   G K+ GLP   TP+S+  P + +  V    A
Sbjct: 301 VSGVSNPITIVSQAVTLPKSSSSSNDS-AGPKSGGLPLAVTPLSQASPSQPI-PVATTNA 360

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. Swiss-Prot
Match: TIF6A_ORYSJ (Protein TIFY 6a OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=TIFY6A PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 6.0e-16
Identity = 127/405 (31.36%), Postives = 176/405 (43.46%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLG-LSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQGYS------------KSSGVPHPMAFKISA- 60
           MERDFLG +  KEE   K +E  D  G  G +              +     M+F+ SA 
Sbjct: 1   MERDFLGAIWRKEEAAGKPEEHSDYRGGGGGASAAMQWQFPATKVGAASSAFMSFRSSAA 60

Query: 61  -----EDKTAY-------------PVVAASDQRRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAY--- 120
                + K A              P  +  D    A A K       G  Q + AA    
Sbjct: 61  AAREEDPKEAAVFDRFSLSGFRPPPRPSPGDAFDGAAAMKQRQFGFNGRQQYAAAAQHGH 120

Query: 121 -PMQSDLYSIHRPHETKLFSVPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQMAGPILK-----QPLG 180
                D Y +  PH    F  P+         PS ++P  +P   A P+L+        G
Sbjct: 121 REQGVDSYGVAAPHH---FPSPS---------PSPRHP--VPFGHANPMLRVHSLPNVAG 180

Query: 181 GVPVSSALNSFFPPFGSISGITE-----PWNSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPE 240
           G P     N  F    S++G T      P +   P      Q+TIFY G V V+D+I  E
Sbjct: 181 GSPYR---NQSFSVGNSVAGSTVGVYGGPRDLQNP---KVTQMTIFYDGLVNVFDNIPVE 240

Query: 241 RAQAIMFLAGAGASVSN-IAHQKAQAQAQAHGMGAKMATASDGAPKNQ-----PVSTLPC 300
           +AQ +M LA   +  S   A +K+ +   A    A   T  +  P  Q     P +++P 
Sbjct: 241 KAQELMLLASRASIPSPPSAARKSDSPISA----AAKLTVPEALPARQIVVQKPEASVPL 300

Query: 301 PA-LSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVKTNGLP--TTPISKGEPPRIVNAVGPVAA 351
            + +S+P+++ S       S SS +D   G K+ GLP   TP+S+  P + +  V    A
Sbjct: 301 VSGVSNPITIVSQAVTLPKSFSSSNDS-AGPKSGGLPLAVTPLSQASPSQPI-PVATTNA 360

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KRV6_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_5G628650 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 553.5 bits (1425), Expect = 1.9e-154
Identity = 305/386 (79.02%), Postives = 324/386 (83.94%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQ--GYSKSSGVP----------HPMAFKISAED 60
           ME DFLGLSSKE PLA VK+EIDNDGAQ  GY KSSGVP          H   FKISA+D
Sbjct: 1   MEMDFLGLSSKE-PLAVVKQEIDNDGAQDSGYPKSSGVPWSSNKASALPHLKPFKISADD 60

Query: 61  KTA----YPVVAASDQRRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSIHRPHETKLFS 120
           KT+     PV A SDQRRAA+ QKTFN DRQGGP  SLAAYPMQ DLYSIHRPHE KLFS
Sbjct: 61  KTSKLGSLPVGATSDQRRAAEIQKTFNHDRQGGPHFSLAAYPMQPDLYSIHRPHEAKLFS 120

Query: 121 VPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQMAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSISGITEPW 180
           V NQGISVSLGNPS+KNPFALP QMAG ILKQPLGGVPVS+A NSFFPPFGS+ GITEPW
Sbjct: 121 VQNQGISVSLGNPSLKNPFALPGQMAGSILKQPLGGVPVSTASNSFFPPFGSVVGITEPW 180

Query: 181 NSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQAQAQAH 240
           NSMKPTGGSP QLTIFYGGTV VY+DITPE+AQAIMFLAGAGA++SN+ H K    AQAH
Sbjct: 181 NSMKPTGGSPNQLTIFYGGTVNVYNDITPEKAQAIMFLAGAGAAISNLTHSK----AQAH 240

Query: 241 GMGAKMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVKTNGLP 300
            MGAKMA ASD AP NQPVS LPCPALSSPLSVSSH+G QS SGSSC+DEL G KTNG P
Sbjct: 241 AMGAKMAAASDAAPMNQPVSALPCPALSSPLSVSSHSGTQSASGSSCTDELRGGKTNGGP 300

Query: 301 TTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPYNLSKKH 360
           TTPISK EP RIVN V  V A+AM+PSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSS+PYNLSKK+
Sbjct: 301 TTPISKVEPQRIVNPVVSVTASAMMPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSAPYNLSKKY 360

Query: 361 PECAATESNGANFSSPITSNSANVAS 371
           PECAATESNGANFSSPIT +SANVAS
Sbjct: 361 PECAATESNGANFSSPITGSSANVAS 381

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. TrEMBL
Match: W9SUD6_9ROSA (Protein TIFY 6B OS=Morus notabilis GN=L484_003994 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 363.2 bits (931), Expect = 3.7e-97
Identity = 226/399 (56.64%), Postives = 280/399 (70.18%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQ--GYSKSSGV-----------PHPMAFKISAE 60
           MERDF+GLSSKE PLA VKEEI+NDG +  GY+K S V           PH M+FK+  E
Sbjct: 125 MERDFMGLSSKE-PLAVVKEEINNDGFKDSGYTKGSVVQWPFSNKVSALPHFMSFKVGQE 184

Query: 61  DK-----------TAYPVVAASD-----QRRAA-DAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSD 120
           DK           + +  V+ +D     Q+RA  + QK+FN DRQGGP  SL AYP+Q D
Sbjct: 185 DKIRKTTSETHISSGFGPVSTADAFDQSQKRAMFEFQKSFNHDRQGGPHFSLTAYPVQHD 244

Query: 121 LYSIHRPHETKLFSVPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQ---MAGPILKQPLGGVPVSSAL 180
           +YS+HRPH+ K+FSVPNQ ISVS+GNP +K+ F    Q    A  + +Q LGG+PV+S  
Sbjct: 245 MYSVHRPHDVKMFSVPNQAISVSMGNPFLKDQFPSAGQNLAAATTMKQQLLGGIPVTSP- 304

Query: 181 NSFFPPFGSISGITEPWNSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGA 240
           +   P   SI+GITEPWNS K +G SPAQLTIFY GTV VYD I+PE+AQAIMFLAG+ +
Sbjct: 305 HMVLPSACSIAGITEPWNSSKASG-SPAQLTIFYAGTVNVYDCISPEKAQAIMFLAGSAS 364

Query: 241 SV-SNIAHQKAQAQAQAHGMGAKMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSG 300
           S+ SN A+ KAQ  A +  +GA     +DG P NQP++T   P LSSPLSVSSHT  QSG
Sbjct: 365 SMPSNAANLKAQVLAPSSKLGA-----ADGVPVNQPMNTSNSP-LSSPLSVSSHTSPQSG 424

Query: 301 SGSSCSDELGGVKTNGLPTTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLE 360
           SGS+C+DEL   KT G+PTT +SK EPP+I+NAVG V ATAM+PSAVPQARKASLARFLE
Sbjct: 425 SGSTCTDELMAAKTTGIPTT-VSKMEPPKIMNAVGSVPATAMMPSAVPQARKASLARFLE 484

Query: 361 KRKERVMSSSPYNLSKKHPECAATESNGANFSSPITSNS 366
           KRKER+M+++PYNL     EC A ESNGANF++   ++S
Sbjct: 485 KRKERMMNAAPYNLCNSSSECTAAESNGANFAASPAADS 513

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. TrEMBL
Match: M5XEB2_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa007235mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 319.3 bits (817), Expect = 6.1e-84
Identity = 207/390 (53.08%), Postives = 256/390 (65.64%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQ--GYSKSSG------------VPHPMAFKISA 60
           MERDFLGL+SKE  L  VKEEI+NDG +  GY++ +G            +PH M FK + 
Sbjct: 1   MERDFLGLNSKESVLV-VKEEINNDGCKDSGYARGAGGAHWPFLNKVSALPHLMPFKAAQ 60

Query: 61  EDKTAYPV-----------VAASD-----QRRA-ADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQS 120
           +DKT   V           ++ +D     Q++A  + Q  FN DRQ G   SL AYPMQ 
Sbjct: 61  DDKTKKMVSESFLSSGFMPISTADAFDHCQKQAPCEIQNYFNHDRQDGTHFSLTAYPMQH 120

Query: 121 DLYSIHRPHETKLFSVPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQ-MAGPILKQPLGGVPVSSALN 180
           D++S+HRPH+ K+ SV NQG SV + NP  KNPFA   Q  A   +KQ L G+PV++   
Sbjct: 121 DVHSVHRPHDVKMISVTNQGFSVPVSNPFFKNPFATTGQNFAATTIKQQLQGIPVTAPY- 180

Query: 181 SFFPPFGSISGITEPWNSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGAS 240
           S  P    +SG TEPWN+ K   GSP+QLTIFY GTV VYDDI+PE+ QA+M LAG   +
Sbjct: 181 SVLP----VSGSTEPWNNSK-NSGSPSQLTIFYAGTVNVYDDISPEKVQAMMLLAG---N 240

Query: 241 VSNIAHQKAQAQAQAHGMGAKMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSG 300
           VS+I+   AQ + QA    AK+A   DG P NQ  +T P   LSSPLS+SSHTG QS SG
Sbjct: 241 VSSISSNAAQPKTQAPS--AKLAV-EDGVPVNQLTNTPPS-GLSSPLSISSHTGVQSVSG 300

Query: 301 SSCSDELGGVKTNGLPTTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLEKR 359
           S+ +DEL   +T G PT+P+SK EPP+IVNAVG VAAT+M+PSAVPQARKASLARFLEKR
Sbjct: 301 STNTDELMAPRTTGHPTSPVSKMEPPKIVNAVGSVAATSMIPSAVPQARKASLARFLEKR 360

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. TrEMBL
Match: G4XSW3_9ROSI (JAZ3 OS=Vitis rupestris PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 314.7 bits (805), Expect = 1.5e-82
Identity = 202/382 (52.88%), Postives = 254/382 (66.49%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQG-YSKSSGV-----------PHPMAFKISAED 60
           MERDF+GLSSKE PLA VKEEI   G    ++K SG+           PH M+FK + ED
Sbjct: 1   MERDFMGLSSKE-PLAVVKEEIIEGGKDSAFTKGSGIQWPFSNKISALPHFMSFKTAQED 60

Query: 61  KTAYPVVAA--------SDQRRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSI-HRPHE 120
           K+      +        S++  A + QK  N DRQGG   ++ AYP+Q D + + H PH+
Sbjct: 61  KSKKVASDSLVTSGFDPSNKCPAGEMQKAVNPDRQGG-SFAVTAYPVQHDSHLMNHHPHD 120

Query: 121 TKLFSVPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQ-MAGPILKQPL-GGVPVSSALNSFFPPFGSI 180
            K+F V NQ ISVS+GNP  K  FA   Q M G  LKQ L GG+PVS A +   P  GS 
Sbjct: 121 VKMFPVSNQTISVSMGNPFFKTHFAAAGQNMVGAALKQQLLGGIPVS-APHGILPSAGSF 180

Query: 181 SGITEPWNSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKA 240
           +GITEPWN+ K T GSP QLTIFY GTV VYDDI+PE+AQAIMFLAG GAS+   A +  
Sbjct: 181 AGITEPWNNFK-TSGSPTQLTIFYAGTVNVYDDISPEKAQAIMFLAGNGASM---ASRMG 240

Query: 241 QAQAQAHGMGAKMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGG 300
           Q +AQ     +K+A A DG   NQP++  PC  LSSP+SVSSH  AQSGSGS+ ++E+  
Sbjct: 241 QPRAQVQTPASKLA-AGDGVLANQPMNISPCSGLSSPISVSSHPVAQSGSGSTSTEEVLA 300

Query: 301 VKTNGLPTTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSP 360
            KT G+  TP++K + P+I++    VAAT M+PSAVPQARKASLARFLEKRKERVMS++P
Sbjct: 301 AKTTGVSATPVTKLDSPKILS----VAATPMMPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSTAP 360

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. TrEMBL
Match: I1ZHW0_9ROSI (Jasmonate ZIM-domain protein 2 OS=Vitis quinquangularis GN=JAZ2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 313.9 bits (803), Expect = 2.6e-82
Identity = 202/382 (52.88%), Postives = 254/382 (66.49%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQG-YSKSSGV-----------PHPMAFKISAED 60
           MERDF+GLSSKE PLA VKEEI   G    ++K SG+           PH M+FK + ED
Sbjct: 1   MERDFMGLSSKE-PLAVVKEEIIEGGKDSAFTKGSGIQWPFSNKISALPHFMSFKTAQED 60

Query: 61  KTAYPVVAA--------SDQRRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSI-HRPHE 120
           K+      +        S++  A + QK  N DRQGG   ++ AYP+Q D + + H PH+
Sbjct: 61  KSKKVASDSLVTSGFDPSNKCPAGEMQKAGNPDRQGG-SFAVTAYPVQHDSHLMNHHPHD 120

Query: 121 TKLFSVPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQ-MAGPILKQPL-GGVPVSSALNSFFPPFGSI 180
            K+F V NQ ISVS+GNP  K  FA   Q M G  LKQ L GG+PVS A +   P  GS 
Sbjct: 121 VKMFPVSNQTISVSMGNPFFKTHFAAAGQNMVGAALKQQLLGGIPVS-APHGILPSAGSF 180

Query: 181 SGITEPWNSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKA 240
           +GITEPWN+ K T GSP QLTIFY GTV VYDDI+PE+AQAIMFLAG GAS+   A +  
Sbjct: 181 AGITEPWNNFK-TSGSPTQLTIFYAGTVNVYDDISPEKAQAIMFLAGNGASM---ASRMG 240

Query: 241 QAQAQAHGMGAKMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGG 300
           Q +AQ     +K+A A DG   NQP++  PC  LSSP+SVSSH  AQSGSGS+ ++E+  
Sbjct: 241 QPRAQVQTPASKLA-AGDGVLANQPMNISPCSGLSSPISVSSHPVAQSGSGSTSTEEVLA 300

Query: 301 VKTNGLPTTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSP 360
            KT G+  TP++K + P+I++    VAAT M+PSAVPQARKASLARFLEKRKERVMS++P
Sbjct: 301 AKTTGVSATPVTKLDSPKILS----VAATPMMPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSTAP 360

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. TAIR10
Match: AT3G17860.1 (AT3G17860.1 jasmonate-zim-domain protein 3)

HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 1.2e-30
Identity = 130/359 (36.21%), Postives = 177/359 (49.30%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQGYSKSSGVPHPMAFKISAEDKTAYPVVAASDQ 60
           MERDFLGL SK  P+  VKEE  ++ ++  + + G+    + K+SA            + 
Sbjct: 1   MERDFLGLGSKNSPIT-VKEET-SESSRDSAPNRGMNWSFSNKVSASSSQFLSFRPTQED 60

Query: 61  RRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSIHR--PHET----KLFSVPNQGI---S 120
           R        ++L   G    S  A     D+Y   R  P+ +    ++F   NQ     +
Sbjct: 61  RHRKSGN--YHLPHSGSFMPSSVA-----DVYDSTRKAPYSSVQGVRMFPNSNQHEETNA 120

Query: 121 VSLGNPSVKNPFALPAQ---MAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSISGITEPWNSMK 180
           VS+  P  ++    P     M      QPL GVP+ +   S  PP GSI G T+  +S K
Sbjct: 121 VSMSMPGFQSHHYAPGGRSFMNNNNNSQPLVGVPIMAPPISILPPPGSIVGTTDIRSSSK 180

Query: 181 PTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQAQAQAHGMGA 240
           P  GSPAQLTIFY G+V VYDDI+PE+A+AIM LAG G+S+  +       Q   H   A
Sbjct: 181 PI-GSPAQLTIFYAGSVCVYDDISPEKAKAIMLLAGNGSSMPQVFSPPQTHQQVVHHTRA 240

Query: 241 KMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVK-TNGLPTTP 300
            + +++       P S +P  +  SP + SS  G            LG  K T GL +T 
Sbjct: 241 SVDSSA------MPPSFMPTISYLSPEAGSSTNG------------LGATKATRGLTSTY 300

Query: 301 ISKGEPPRIVNAVGPVAAT--AMLPS-AVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPYNLSKK 344
            +       +N   PV+ +   M P+ A+P ARKASLARFLEKRKERV S SPY L KK
Sbjct: 301 HNNQANGSNINCPVPVSCSTNVMAPTVALPLARKASLARFLEKRKERVTSVSPYCLDKK 331

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. TAIR10
Match: AT1G48500.1 (AT1G48500.1 jasmonate-zim-domain protein 4)

HSP 1 Score: 99.0 bits (245), Expect = 6.6e-21
Identity = 117/349 (33.52%), Postives = 157/349 (44.99%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQGYSKSSGVPHPMAFKISAEDKTAYPVVAASDQ 60
           MERDFLGL SK  P+  VKEE + D A     S G+   M +  S++      V +    
Sbjct: 1   MERDFLGLGSKLSPIT-VKEETNEDSAP----SRGM---MDWSFSSK------VGSGPQF 60

Query: 61  RRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSIHRPHETKLFSVPNQG----ISVSLGN 120
                +Q+   ++      +S AA       Y      E ++F   +Q     I+VS+  
Sbjct: 61  LSFGTSQQETRVNTVNDHLLSSAAMDQNQRTY-FSSLQEDRVFPGSSQQDQTTITVSMSE 120

Query: 121 PSVKNPFALPAQMAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSISGITEPWNSMKPTGGSPAQ 180
           P+  N F         I  Q LGG P+ +   S FP   +I   ++P          P Q
Sbjct: 121 PNYINSF---------INHQHLGGSPIMAPPVSVFPAPTTIRSSSKPL---------PPQ 180

Query: 181 LTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQAQAQAHGMGAKMATASDG 240
           LTIFY G+V VY DI PE+AQAIM LAG G       H K  +Q +   +       +D 
Sbjct: 181 LTIFYAGSVLVYQDIAPEKAQAIMLLAGNG------PHAKPVSQPKPQKLVHHSLPTTD- 240

Query: 241 APKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVKTN-GLPTTPISKGEPPR 300
            P   P S LP        S+S        SGS+    LG  KT   L +T  ++     
Sbjct: 241 -PPTMPPSFLP--------SISYIVSETRSSGSNGVTGLGPTKTKASLASTRNNQ----- 288

Query: 301 IVNAVGPVAATAMLPS-AVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPYNLSKK 344
                   AA +M P+  +PQ RKASLARFLEKRKERV++ SPY +  K
Sbjct: 301 -------TAAFSMAPTVGLPQTRKASLARFLEKRKERVINVSPYYVDNK 288

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. TAIR10
Match: AT1G70700.1 (AT1G70700.1 TIFY domain/Divergent CCT motif family protein)

HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 3.5e-14
Identity = 83/261 (31.80%), Postives = 114/261 (43.68%), Query Frame = 1


Query: 99  ETKLFSVPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQMAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSIS 158
           E K F    Q  SVS  N   +  F    Q A P+L   LGG        S  P   S  
Sbjct: 59  EAKAFPGAYQWGSVSAANVFRRCQFGGAFQNATPLL---LGGSVPLPTHPSLVPRVAS-- 118

Query: 159 GITEPWNSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQ 218
                        GS  QLTIFYGGT+ V++DI+P++AQAIM  AG G        +  +
Sbjct: 119 ------------SGSSPQLTIFYGGTISVFNDISPDKAQAIMLCAGNGLKGETGDSKPVR 178

Query: 219 AQAQAHGMGAKMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGV 278
              + +G                         + +  + SS +   + + S C D     
Sbjct: 179 EAERMYGK-----------------------QIHNTAATSSSSATHTDNFSRCRD----- 238

Query: 279 KTNGLPTTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPY 338
                  TP++      ++ +    A   M+P +VPQARKASLARFLEKRKER+MS+ PY
Sbjct: 239 -------TPVAATNAMSMIESFN-AAPRNMIP-SVPQARKASLARFLEKRKERLMSAMPY 263

Query: 339 NLSKKHPECAATESNGANFSS 360
              K   + +  ES+G N+SS
Sbjct: 299 --KKMLLDLSTGESSGMNYSS 263

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. NCBI nr
Match: gi|659098699|ref|XP_008450263.1| (PREDICTED: protein TIFY 6B-like isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 553.9 bits (1426), Expect = 2.1e-154
Identity = 304/386 (78.76%), Postives = 326/386 (84.46%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQ--GYSKSSGVP----------HPMAFKISAED 60
           ME DFLGLSSKE PLA VK+EIDNDGAQ  GY+KSSGVP          H + FKISA+D
Sbjct: 1   MEMDFLGLSSKE-PLAVVKQEIDNDGAQDSGYTKSSGVPWSSNKASALPHLIPFKISADD 60

Query: 61  KTAY----PVVAASDQRRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSIHRPHETKLFS 120
           KT+      V A SDQRRAA+ QKTFN DRQGGP  SLAAYPMQ DLYSIHRPHE KLFS
Sbjct: 61  KTSKLGSDSVGATSDQRRAAEIQKTFNHDRQGGPHFSLAAYPMQPDLYSIHRPHEAKLFS 120

Query: 121 VPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQMAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSISGITEPW 180
           V NQGISVSLGNPS+KNPFALP QMAGPILKQPLGGVPVS+A NSFFPPFGS+ GITEPW
Sbjct: 121 VQNQGISVSLGNPSLKNPFALPGQMAGPILKQPLGGVPVSTASNSFFPPFGSVVGITEPW 180

Query: 181 NSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQAQAQAH 240
           NSMKPTGGSP QLTIFYGGTV VY+DITPE+AQAIMFLAGAGA++SNI+H K    AQAH
Sbjct: 181 NSMKPTGGSPNQLTIFYGGTVNVYNDITPEKAQAIMFLAGAGAAISNISHSK----AQAH 240

Query: 241 GMGAKMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVKTNGLP 300
            MGAK+A ASD AP NQPVS LPCPALSSPLSVSSHTG QS SGSSC+DEL G KTNG+P
Sbjct: 241 AMGAKLAAASDAAPMNQPVSALPCPALSSPLSVSSHTGTQSASGSSCTDELRGGKTNGVP 300

Query: 301 TTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPYNLSKKH 360
           TTPISK EP RI N    V A+AM+PSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSS+PYNLSKK+
Sbjct: 301 TTPISKVEPQRIANPGVSVTASAMMPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSAPYNLSKKY 360

Query: 361 PECAATESNGANFSSPITSNSANVAS 371
           PECAATESNGANFSSPIT +SANVAS
Sbjct: 361 PECAATESNGANFSSPITGSSANVAS 381

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. NCBI nr
Match: gi|778706986|ref|XP_011655950.1| (PREDICTED: protein TIFY 6B-like isoform X1 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 553.5 bits (1425), Expect = 2.8e-154
Identity = 305/386 (79.02%), Postives = 324/386 (83.94%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQ--GYSKSSGVP----------HPMAFKISAED 60
           ME DFLGLSSKE PLA VK+EIDNDGAQ  GY KSSGVP          H   FKISA+D
Sbjct: 1   MEMDFLGLSSKE-PLAVVKQEIDNDGAQDSGYPKSSGVPWSSNKASALPHLKPFKISADD 60

Query: 61  KTA----YPVVAASDQRRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSIHRPHETKLFS 120
           KT+     PV A SDQRRAA+ QKTFN DRQGGP  SLAAYPMQ DLYSIHRPHE KLFS
Sbjct: 61  KTSKLGSLPVGATSDQRRAAEIQKTFNHDRQGGPHFSLAAYPMQPDLYSIHRPHEAKLFS 120

Query: 121 VPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQMAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSISGITEPW 180
           V NQGISVSLGNPS+KNPFALP QMAG ILKQPLGGVPVS+A NSFFPPFGS+ GITEPW
Sbjct: 121 VQNQGISVSLGNPSLKNPFALPGQMAGSILKQPLGGVPVSTASNSFFPPFGSVVGITEPW 180

Query: 181 NSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQAQAQAH 240
           NSMKPTGGSP QLTIFYGGTV VY+DITPE+AQAIMFLAGAGA++SN+ H K    AQAH
Sbjct: 181 NSMKPTGGSPNQLTIFYGGTVNVYNDITPEKAQAIMFLAGAGAAISNLTHSK----AQAH 240

Query: 241 GMGAKMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVKTNGLP 300
            MGAKMA ASD AP NQPVS LPCPALSSPLSVSSH+G QS SGSSC+DEL G KTNG P
Sbjct: 241 AMGAKMAAASDAAPMNQPVSALPCPALSSPLSVSSHSGTQSASGSSCTDELRGGKTNGGP 300

Query: 301 TTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPYNLSKKH 360
           TTPISK EP RIVN V  V A+AM+PSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSS+PYNLSKK+
Sbjct: 301 TTPISKVEPQRIVNPVVSVTASAMMPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSAPYNLSKKY 360

Query: 361 PECAATESNGANFSSPITSNSANVAS 371
           PECAATESNGANFSSPIT +SANVAS
Sbjct: 361 PECAATESNGANFSSPITGSSANVAS 381

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. NCBI nr
Match: gi|659098701|ref|XP_008450264.1| (PREDICTED: protein TIFY 6B-like isoform X2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 540.4 bits (1391), Expect = 2.4e-150
Identity = 301/386 (77.98%), Postives = 323/386 (83.68%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQ--GYSKSSGVP----------HPMAFKISAED 60
           ME DFLGLSSKE PLA VK+EIDNDGAQ  GY+KSSGVP          H + FKISA+D
Sbjct: 1   MEMDFLGLSSKE-PLAVVKQEIDNDGAQDSGYTKSSGVPWSSNKASALPHLIPFKISADD 60

Query: 61  KTAY----PVVAASDQRRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSIHRPHETKLFS 120
           KT+      V A SDQRRAA+ QKTFN DRQGGP  SLAAYPMQ DLYSIHRPHE KLFS
Sbjct: 61  KTSKLGSDSVGATSDQRRAAEIQKTFNHDRQGGPHFSLAAYPMQPDLYSIHRPHEAKLFS 120

Query: 121 VPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQMAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSISGITEPW 180
           V NQGISVSLGNPS+KNPFALP QMAGPILKQPLGGVPVS+A NSFFPPFGS+ GITEP 
Sbjct: 121 VQNQGISVSLGNPSLKNPFALPGQMAGPILKQPLGGVPVSTASNSFFPPFGSVVGITEP- 180

Query: 181 NSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQAQAQAH 240
             MKPTGGSP QLTIFYGGTV VY+DITPE+AQAIMFLAGAGA++SNI+H KAQA    H
Sbjct: 181 -CMKPTGGSPNQLTIFYGGTVNVYNDITPEKAQAIMFLAGAGAAISNISHSKAQA----H 240

Query: 241 GMGAKMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVKTNGLP 300
            MGAK+A ASD AP NQPVS LPCPALSSPLSVSSHTG QS SGSSC+DEL G KTNG+P
Sbjct: 241 AMGAKLAAASDAAPMNQPVSALPCPALSSPLSVSSHTGTQSASGSSCTDELRGGKTNGVP 300

Query: 301 TTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPYNLSKKH 360
           TTPISK EP RI N    V A+AM+PSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSS+PYNLSKK+
Sbjct: 301 TTPISKVEPQRIANPGVSVTASAMMPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSAPYNLSKKY 360

Query: 361 PECAATESNGANFSSPITSNSANVAS 371
           PECAATESNGANFSSPIT +SANVAS
Sbjct: 361 PECAATESNGANFSSPITGSSANVAS 379

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. NCBI nr
Match: gi|778706988|ref|XP_011655951.1| (PREDICTED: protein TIFY 6B-like isoform X2 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 540.0 bits (1390), Expect = 3.2e-150
Identity = 302/386 (78.24%), Postives = 321/386 (83.16%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQ--GYSKSSGVP----------HPMAFKISAED 60
           ME DFLGLSSKE PLA VK+EIDNDGAQ  GY KSSGVP          H   FKISA+D
Sbjct: 1   MEMDFLGLSSKE-PLAVVKQEIDNDGAQDSGYPKSSGVPWSSNKASALPHLKPFKISADD 60

Query: 61  KTA----YPVVAASDQRRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSIHRPHETKLFS 120
           KT+     PV A SDQRRAA+ QKTFN DRQGGP  SLAAYPMQ DLYSIHRPHE KLFS
Sbjct: 61  KTSKLGSLPVGATSDQRRAAEIQKTFNHDRQGGPHFSLAAYPMQPDLYSIHRPHEAKLFS 120

Query: 121 VPNQGISVSLGNPSVKNPFALPAQMAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSISGITEPW 180
           V NQGISVSLGNPS+KNPFALP QMAG ILKQPLGGVPVS+A NSFFPPFGS+ GITEP 
Sbjct: 121 VQNQGISVSLGNPSLKNPFALPGQMAGSILKQPLGGVPVSTASNSFFPPFGSVVGITEP- 180

Query: 181 NSMKPTGGSPAQLTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQAQAQAH 240
             MKPTGGSP QLTIFYGGTV VY+DITPE+AQAIMFLAGAGA++SN+ H KAQA    H
Sbjct: 181 -CMKPTGGSPNQLTIFYGGTVNVYNDITPEKAQAIMFLAGAGAAISNLTHSKAQA----H 240

Query: 241 GMGAKMATASDGAPKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVKTNGLP 300
            MGAKMA ASD AP NQPVS LPCPALSSPLSVSSH+G QS SGSSC+DEL G KTNG P
Sbjct: 241 AMGAKMAAASDAAPMNQPVSALPCPALSSPLSVSSHSGTQSASGSSCTDELRGGKTNGGP 300

Query: 301 TTPISKGEPPRIVNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPYNLSKKH 360
           TTPISK EP RIVN V  V A+AM+PSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSS+PYNLSKK+
Sbjct: 301 TTPISKVEPQRIVNPVVSVTASAMMPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSAPYNLSKKY 360

Query: 361 PECAATESNGANFSSPITSNSANVAS 371
           PECAATESNGANFSSPIT +SANVAS
Sbjct: 361 PECAATESNGANFSSPITGSSANVAS 379

[Close]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. NCBI nr
Match: gi|778706991|ref|XP_011655952.1| (PREDICTED: protein TIFY 6B-like isoform X3 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 530.4 bits (1365), Expect = 2.5e-147
Identity = 291/374 (77.81%), Postives = 311/374 (83.16%), Query Frame = 1


Query: 1   MERDFLGLSSKEEPLAKVKEEIDNDGAQGYSKSSGVPHPMAFKISAEDKTA----YPVVA 60
           ME DFLGLSSKE PLA VK+EIDNDGAQ                 ++DKT+     PV A
Sbjct: 1   MEMDFLGLSSKE-PLAVVKQEIDNDGAQ----------------DSDDKTSKLGSLPVGA 60

Query: 61  ASDQRRAADAQKTFNLDRQGGPQISLAAYPMQSDLYSIHRPHETKLFSVPNQGISVSLGN 120
            SDQRRAA+ QKTFN DRQGGP  SLAAYPMQ DLYSIHRPHE KLFSV NQGISVSLGN
Sbjct: 61  TSDQRRAAEIQKTFNHDRQGGPHFSLAAYPMQPDLYSIHRPHEAKLFSVQNQGISVSLGN 120

Query: 121 PSVKNPFALPAQMAGPILKQPLGGVPVSSALNSFFPPFGSISGITEPWNSMKPTGGSPAQ 180
           PS+KNPFALP QMAG ILKQPLGGVPVS+A NSFFPPFGS+ GITEPWNSMKPTGGSP Q
Sbjct: 121 PSLKNPFALPGQMAGSILKQPLGGVPVSTASNSFFPPFGSVVGITEPWNSMKPTGGSPNQ 180

Query: 181 LTIFYGGTVKVYDDITPERAQAIMFLAGAGASVSNIAHQKAQAQAQAHGMGAKMATASDG 240
           LTIFYGGTV VY+DITPE+AQAIMFLAGAGA++SN+ H K    AQAH MGAKMA ASD 
Sbjct: 181 LTIFYGGTVNVYNDITPEKAQAIMFLAGAGAAISNLTHSK----AQAHAMGAKMAAASDA 240

Query: 241 APKNQPVSTLPCPALSSPLSVSSHTGAQSGSGSSCSDELGGVKTNGLPTTPISKGEPPRI 300
           AP NQPVS LPCPALSSPLSVSSH+G QS SGSSC+DEL G KTNG PTTPISK EP RI
Sbjct: 241 APMNQPVSALPCPALSSPLSVSSHSGTQSASGSSCTDELRGGKTNGGPTTPISKVEPQRI 300

Query: 301 VNAVGPVAATAMLPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSSPYNLSKKHPECAATESNGAN 360
           VN V  V A+AM+PSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSS+PYNLSKK+PECAATESNGAN
Sbjct: 301 VNPVVSVTASAMMPSAVPQARKASLARFLEKRKERVMSSAPYNLSKKYPECAATESNGAN 353

Query: 361 FSSPITSNSANVAS 371
           FSSPIT +SANVAS
Sbjct: 361 FSSPITGSSANVAS 353

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmoCh04G000640 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
TIF6B_ARATH	2.1e-29	36.21	Protein TIFY 6B OS=Arabidopsis thaliana GN=TIFY6B PE=1 SV=1	[more]
TIF6B_ORYSJ	2.3e-23	31.58	Protein TIFY 6b OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=TIFY6B PE=1 SV=1	[more]
TIF6A_ARATH	1.2e-19	33.52	Protein TIFY 6A OS=Arabidopsis thaliana GN=TIFY6A PE=1 SV=1	[more]
TIF6A_ORYSI	1.2e-16	31.36	Protein TIFY 6a OS=Oryza sativa subsp. indica GN=TIFY6A PE=3 SV=1	[more]
TIF6A_ORYSJ	6.0e-16	31.36	Protein TIFY 6a OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=TIFY6A PE=1 SV=1	[more]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0KRV6_CUCSA	1.9e-154	79.02	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_5G628650 PE=4 SV=1	[more]
W9SUD6_9ROSA	3.7e-97	56.64	Protein TIFY 6B OS=Morus notabilis GN=L484_003994 PE=4 SV=1	[more]
M5XEB2_PRUPE	6.1e-84	53.08	Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa007235mg PE=4 SV=1	[more]
G4XSW3_9ROSI	1.5e-82	52.88	JAZ3 OS=Vitis rupestris PE=2 SV=1	[more]
I1ZHW0_9ROSI	2.6e-82	52.88	Jasmonate ZIM-domain protein 2 OS=Vitis quinquangularis GN=JAZ2 PE=2 SV=1	[more]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT3G17860.1	1.2e-30	36.21	jasmonate-zim-domain protein 3	[more]
AT1G48500.1	6.6e-21	33.52	jasmonate-zim-domain protein 4	[more]
AT1G70700.1	3.5e-14	31.80	TIFY domain/Divergent CCT motif family protein	[more]

BLAST of CmoCh04G000640 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|659098699\|ref\|XP_008450263.1\|	2.1e-154	78.76	PREDICTED: protein TIFY 6B-like isoform X1 [Cucumis melo]	[more]
gi\|778706986\|ref\|XP_011655950.1\|	2.8e-154	79.02	PREDICTED: protein TIFY 6B-like isoform X1 [Cucumis sativus]	[more]
gi\|659098701\|ref\|XP_008450264.1\|	2.4e-150	77.98	PREDICTED: protein TIFY 6B-like isoform X2 [Cucumis melo]	[more]
gi\|778706988\|ref\|XP_011655951.1\|	3.2e-150	78.24	PREDICTED: protein TIFY 6B-like isoform X2 [Cucumis sativus]	[more]
gi\|778706991\|ref\|XP_011655952.1\|	2.5e-147	77.81	PREDICTED: protein TIFY 6B-like isoform X3 [Cucumis sativus]	[more]

Annotated Terms

The following terms have been associated with this gene:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR010399	Tify_dom
IPR018467	CCT_CS

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0008150	biological_process
cellular_component	GO:0005575	cellular_component
molecular_function	GO:0003674	molecular_function

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CmoCh04G000640.1	CmoCh04G000640.1	mRNA

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata
Date Performed: 2017-05-19


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR010399	Tify domain	PFAM	PF06200	tify	coord: 173..204 score: 2.2
IPR010399	Tify domain	SMART	SM00979	tify_2	coord: 170..205 score: 4.8
IPR010399	Tify domain	PROFILE	PS51320	TIFY	coord: 170..205 score: 15
IPR018467	CO/COL/TOC1, conserved site	PFAM	PF09425	CCT_2	coord: 314..338 score: 1.0
None	No IPR available	PANTHER	PTHR33077	FAMILY NOT NAMED	coord: 1..259 score: 4.8E-91coord: 287..343 score: 4.8
None	No IPR available	PANTHER	PTHR33077:SF7	PROTEIN TIFY 6A-RELATED	coord: 287..343 score: 4.8E-91coord: 1..259 score: 4.8

Synteny

The following gene(s) are orthologous to this gene:


Gene	Orthologue	Organism	Block
CmoCh04G000640	Cucsa.029920	Cucumber (Gy14) v1	cgycmoB0002
CmoCh04G000640	CmaCh04G000700	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacmoB728
CmoCh04G000640	CmaCh04G010150	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacmoB731
CmoCh04G000640	Cla003391	Watermelon (97103) v1	cmowmB680
CmoCh04G000640	Csa5G628650	Cucumber (Chinese Long) v2	cmocuB744
CmoCh04G000640	ClCG07G005870	Watermelon (Charleston Gray)	cmowcgB676
CmoCh04G000640	CSPI05G27960	Wild cucumber (PI 183967)	cmocpiB753
CmoCh04G000640	Lsi04G011120	Bottle gourd (USVL1VR-Ls)	cmolsiB673
CmoCh04G000640	Cp4.1LG01g06150	Cucurbita pepo (Zucchini)	cmocpeB673
CmoCh04G000640	Cp4.1LG01g07520	Cucurbita pepo (Zucchini)	cmocpeB674
CmoCh04G000640	CsaV3_5G037080	Cucumber (Chinese Long) v3	cmocucB0883
CmoCh04G000640	Cla97C07G133990	Watermelon (97103) v2	cmowmbB755
CmoCh04G000640	Bhi07G000325	Wax gourd	cmowgoB0889
CmoCh04G000640	CsGy5G027350	Cucumber (Gy14) v2	cgybcmoB659
CmoCh04G000640	Carg22013	Silver-seed gourd	carcmoB0250
CmoCh04G000640	Carg00126	Silver-seed gourd	carcmoB0924

The following gene(s) are paralogous to this gene:


Gene	Paralogue	Organism	Block
CmoCh04G000640	CmoCh04G010930	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocmoB464

The following block(s) are covering this gene:


Gene	Organism	Block
CmoCh04G000640	Watermelon (97103) v2	cmowmbB679
CmoCh04G000640	Wax gourd	cmowgoB0826
CmoCh04G000640	Cucurbita moschata (Rifu)	cmocmoB471
CmoCh04G000640	Watermelon (Charleston Gray)	cmowcgB638
CmoCh04G000640	Cucurbita maxima (Rimu)	cmacmoB746
CmoCh04G000640	Melon (DHL92) v3.5.1	cmomeB629
CmoCh04G000640	Melon (DHL92) v3.5.1	cmomeB636
CmoCh04G000640	Melon (DHL92) v3.5.1	cmomeB700
CmoCh04G000640	Watermelon (97103) v1	cmowmB708
CmoCh04G000640	Melon (DHL92) v3.6.1	cmomedB724
CmoCh04G000640	Melon (DHL92) v3.6.1	cmomedB794