CmaCh19G006250 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)

NameCmaCh19G006250
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr19 : 6747427 .. 6750708 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGGAACCAATTGGATAAGTTGAAACATCACAATCATGGCTTAGGTGGCATTAAATTTTAGTACTTTTATCCCTTTATCTAAACCCTAATTATTGATTTTATTTATTAAATTTAATTCAACTTGACATCCAAGTGGAATGCTTCCTATCTTATCCATAAAATGCTTACCAAACATAATTTTTAAAAAATTAAATTTATTTTTTTTAAATATTAATAATTTCCATCCAATATATAATTTTTAGATTTTGATGCTTGGGACGTACATACTTCACTTTTTTAAAATTATAATAATAAAAAATAAATAAATAAACAATTCAATTGATACATCGTTTTAAATTATATAATAAAAGTTTTAATTATTAACGTGGGAATCATATTGGCGACCATTTCAAACTTCCTTATGCTTTAAATCCAAACTATATACTATATAGAATATGTTATTTTTTCAACAATAATGATGGAATATTATTTATTAGTAATTCAAATAAATATATTTTTTAAATTATGATGTCGAAAAAAAGTAAGGTCGAATAATTGCAAAACACATGCGAGTAACATGAGGGGTCGTGTGTCGGTCAAGTCAATTAAAAAATAAATAAAAAATAATTGTTTTTTTTTCATAATTTAAAAAACAAAAAGAAAAAAAGTACACAAAAAGTGAGGAAAATAAAGTGTGATATGGACTTAAAGTAATGAAAAATAAATAAATAAATAAAATAGAAAATAGAAAATAGTTGAAATATTATCCACAAGGAGACAGGATTCAAATAATGTAATGGGGAGTGATGATGATATTATGTTATAAATTTTGCAACCACCAGCTGTCACTCAAATAATGATTTTATTTTTATTGGGTCCTTCTATTTTGTTTTGGTTTGGTTTTCGACATTTTTGTCATTTTTTAAATTTCAATTTGAGTTTGAAGATAGAGTGAAGCACGAGTTTGTGGTCAGGGTGTTCGTATGATCCGATAATTCTAAGTTAAGATTTTTTTTGGGTTGGATTGTTTTTTTAAGACCAAAAATTTTAATTAGGCTTTTTTCAGATATATTATTTATGAAATATATCTTACCTATTATATCTTAATATTCTTTTATTTTATTCTCAATATTTAATTAGTTTAATTAGTTTATTTAACGCTAAACTAACCCTACCCTATTTTAAAGAAAAATTAAGAATATCTATGGTAGATAAATATGACTTTTTAAAAAAATAATAACTAAACTACCTCATCTGATGAGTTTAAATTCTAGTTGCGTTGTTCACGTCATGAACTCAAACTAATTTTGAATTATGAGCCGTCGAAAATAATTTAATTAACTACATTATTATTATTTTTTGAGGGAATCTTCATTATTCCTTAATTTTATTTTATAAAATAATTACTTTGAAAACTGTTATTATAAAAGGAATATTTTTAATAATAAATATGTTAAAAATATTGATTAGTAAAATCTAAACTGTCAGGTGATTGGTGGGATTTAATTTTAAATCACATTTTTCACGATCTTAATTCCTTGTCTGTTCATGCTAATAAATTTAATTAATTACTCCACTAAATATATTCCACTTCCATTTTATTTTTTTAAAATTGTAATTATTTTATTGGTTCTTGTATATTCGATATCTCAATCAAATAATAACAAATAAGAGGGTCCCGATTATTTAAATGTGTCTATTTATATGAGTACACGTGTTATTTATTGAGAATATATTTTATTTATTATTATTATTATTGATATTGTTAGGAAAGAAAATGATAGTAAAATAAAATATGATTTGAATATTAATTTTTGTTTTATTTAAGCCTACAAACTCTTAGCGACGGTTGGTAATAAATCGGAGGAAGGTGAGGATGACGTCATGTTATACGATGGTTGTTATTATTATTATTGATATTGTCATCATGCTCGTTATGCAATCTGTCCTAAGTGTGGAAGATAGATGCAATTGGTAATTGTAAGGTTAGCCATATAACACAGTTAATAATATTTTATTTCAAGCTGTATTATAATTTTTTTTTTGTTAAAAAATAAAAATTATTTAAAATTAAAATTCTAAAAATAAATAGAAAATTTTAGATAGGCTTATCCAGCCGCTGGCGACGTGTCCAACAAAGAGAGGTCGAAATCTGACAATTAAATAAACAAGGGTAGAATAGTAATTTCACATAAATAAAAGACAAAAGTAAATGGACACTTAGTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGAATCAATTTTAACCACTCAATTTAAAAATGAATCAAATCTAAACTACTAAAAATGATGAGATCATGGAAATTAAAATAAGAACAATACATGCAATAATTTTATTAAATAAATCTTAGCCACTCAAAAATAAACCATCCTTTTTTCTTTTTTTGTTAAAATATGTAATGATATCATGGTAAATAAAAAATAAAATTACCACCTAATACCAATTTAATGCTCTAATTAATTACATTAACACAACATAATTCTTTATTAAGTTATTAATTAATTAATTAAATTAGATAACCGTTCAAAAACTCATAATTACCAGTAACCCAACCGATTTAAGTTAAATTATAAGGGTTAGATTGGGTTTGAATTAAATTCGTTTTTTTGGAACTCAATATGTTTCGGTTTGAGCATGATTCATTTTTTGGAACCTTGATCTAGTTCAGGTTGGGTTTGGATCGAATTCTAATTTTTGTGATCCAACTCGAAAACTTTAAAAAAAATATTTACTTGGAAAAAAGGCCTACGAAGATGAGTTGATACTGAAACCACTCAAACCACTCTCAATCCAACCTTTACATGAAAACCCTCAACCCAACCTGTACAACCTAACCTGTATATCCTTATGTTTTAGTTCTTAGCAGGATGCGAGAGATTACCTTTTGATTTATCAGAAGCGGAAGAATAATTAGTAGCGGGTTATCAAACCGAGTATTCGGGTATCAAATTTGGTTTATTTTATGTTGCTTCTTATCTAAATCTATTAGTTTCTTCGTTATTTGTAACGGTTCTTTACTTGGGTGGTGGGGAAGGAAGTTGAGGGGTTTTGTTTTGCTGGAGCTGATCCTCCCAGAATTTTTCAGAATTTGTGGCGGTTTATGGTGTCCGTGACAAACCCTCCTTCCAAAACTGTGTGTTCATCCATCAACAGCTTTCAATTGAGGCGCAGCGATGGCGACGCACCTTCAAAGTTCCACTAAAATGGCTCTTCACGCCCCGGTTCTTCTAG

mRNA sequence

ATGAGGAACCAATTGGATAAGTTGAAACATCACAATCATGGCTTAGTAGCGGGTTATCAAACCGAGTATTCGGAATTTGTGGCGGTTTATGGTGTCCGTGACAAACCCTCCTTCCAAAACTGTGTGTTCATCCATCAACAGCTTTCAATTGAGGCGCAGCGATGGCGACGCACCTTCAAAGTTCCACTAAAATGGCTCTTCACGCCCCGGTTCTTCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAGGAACCAATTGGATAAGTTGAAACATCACAATCATGGCTTAGTAGCGGGTTATCAAACCGAGTATTCGGAATTTGTGGCGGTTTATGGTGTCCGTGACAAACCCTCCTTCCAAAACTGTGTGTTCATCCATCAACAGCTTTCAATTGAGGCGCAGCGATGGCGACGCACCTTCAAAGTTCCACTAAAATGGCTCTTCACGCCCCGGTTCTTCTAG

Protein sequence

MRNQLDKLKHHNHGLVAGYQTEYSEFVAVYGVRDKPSFQNCVFIHQQLSIEAQRWRRTFKVPLKWLFTPRFF
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh19G006250.1CmaCh19G006250.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmaCh19G006250Watermelon (97103) v1cmawmB484
CmaCh19G006250Watermelon (97103) v1cmawmB503
CmaCh19G006250Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB522
CmaCh19G006250Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB526
CmaCh19G006250Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB532
CmaCh19G006250Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB539
CmaCh19G006250Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB469
CmaCh19G006250Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB472
CmaCh19G006250Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB498
CmaCh19G006250Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB210
CmaCh19G006250Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB212
CmaCh19G006250Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB945
CmaCh19G006250Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB535
CmaCh19G006250Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB540
CmaCh19G006250Silver-seed gourdcarcmaB0288
CmaCh19G006250Silver-seed gourdcarcmaB1118
CmaCh19G006250Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0608
CmaCh19G006250Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0639
CmaCh19G006250Watermelon (97103) v2cmawmbB531
CmaCh19G006250Watermelon (97103) v2cmawmbB546
CmaCh19G006250Wax gourdcmawgoB0641
CmaCh19G006250Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB149
CmaCh19G006250Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB446
CmaCh19G006250Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB462
CmaCh19G006250Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0252
CmaCh19G006250Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0624
CmaCh19G006250Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB494
CmaCh19G006250Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB508
CmaCh19G006250Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB518
CmaCh19G006250Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB512
CmaCh19G006250Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB513
CmaCh19G006250Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB534
CmaCh19G006250Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB507
CmaCh19G006250Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB528
CmaCh19G006250Melon (DHL92) v3.5.1cmameB463
CmaCh19G006250Melon (DHL92) v3.5.1cmameB466
CmaCh19G006250Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB460