CmaCh19G005180 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTCAAGATTTTCAGTGAGGGTCTTCATGACAGATACTGCTCTGTGGCTTCTCCCGAGCTTCGAGAGTGAGGCCGGCTAGACTCAGATCTGAATCCACCTCCAAAATCTCATAATCCGTCCTGTCGTCCGCTTCCGGAGCAGCTTTCAGGTACTGTAAGCTTCTAATCTTTCAAAATTCTTGCTCCTTTCGCACTTTCTGTGTTCTAATTGGTAATTCCTTGATTTTGATTACGATGGAACTTTTTTTAGTTTAATTTTCATCTGCTTTGTCATTGAGTTATATAATTGATTCGCTATTGTTTTCTAATTTAGTCTCGGGACTGTTGATTTCCAGTGAACTTTGAATTTCGTTTGAAAATTTCTTATGTTGTTTAATCCGTTTATTTTATTCTTTTGTCGTTTGAAATGGGGGTTTAGAAAAAGAATTTTTATGATTGTTGAATATTTATGTCCGTTGATCCATGTCAATTAGACTCCTTTAAGAATTTAATTGATTCTGATTATTTAATGTCTACTTGGATGTGGGTGATGGATTTTTGGTTAATTTATTAAGTTTCCTGAAGTGGTCTCTACTCATCTATGCTTGTGGGTCGGTATTGTTTCTCAACATTCATTTTGAATTTTCCTGGTTGATCGGAAAAATCTGTTAGGAATCACGAACCTCCACAATGGTATGATATTATCCACTTTGAGCATAAGTTCTCGTGTCTTTGCTTTGGGCTTCCCCAAAAGGACTCATATCAAATGAAATGTATTCCTTACTTATATACCTAGGATCATTCCCTAAATTAGCCAACGTGGGACTCCCTCCCAACAATCCTCCTCTCGAACAAAGTACACTACAAAACCTCCCCTGAGGTCTATGGAGCCCTCGAACAACCTCCCCTTAATCGAGGCTCGATTCCTTCTCTGGAGTCCTTGAACAAAGTACACCCTTTGTTCGACACTTCAGTCACTTTTGTCTACACCTTCGAGGCTCACAACTTCTTTGTTCGACATTTGAGGATTCTATTGACATAGCTAAGTTTAGGGCATGACTCTGATTCATTGTTAGGAATCATGAACCTCCACAGTGGTATGATATGATATTTTCCACTTTGAGCATAAGCTCTCATGGCTTTGTTTTCGGCTTCCCCAAAAGGCTTCATACCAATGGAGATGTATTCCTTACTTAGAAATCCATGATCATTCCCTAAATTAACCAATGTGGGACTCTCTCCCAACAACCCTCAGCAAAATCTTGAATTTTGAGAGCATTTGTCAATGCTTAGAGAGACAAAAATGGCATCTAGCTAAAAAGATTCTAGCAAGTTTGACTGCACTGGTTTTTTTGTCAACTAGCCAAGGCATAATGGCTACTAGAACTTATGATTACTACTTTTTTAACTCGTGTGACTTGTGAGCTATTACTTTGTTACTACAAGAGCATCAGACAAGCATGTGTGTGAACAGTGCCTCCTTTTCTGATTTGGAGGTCTGAGATAAATTGGTGCACAAGTGAAAACATCTGCTTAGAAATGCTGTTATCAATTGTTGATAAAGAAGCGTGGCTTTGCAGGTTTCCTACTATCATAAAACCATGTCAAGGCGTCCAGTAAATCCTTCTCGACGTCTTGTTGATGGTGGGAGTCTTCCATTTGTCGGATCAATACATTCCAAGTCACGGTCATCGCCTTTGCTAACCATAGGGCTTGTTGTGGTACTTTTCTTTTCTAATTAAAGAATGAAGAACACTATTCTTAATCATATTTTTAGCAACTAATTTAACTTTCTATGTTTAAAATTTTCAGGGAGCAATGCTTCTTATTGGATTTTGTTATCATCAATCAGGTCTTTATTTTATCTCTTATCTTGATTTATTCTTAATTAAGTCTCTCTTGATCACTCTCAGCCACGATAATCCTCATTGTGTTGTTCATCTGTTTTAGGACGTTCCCTCTCTATTCAGTTTAACAATTTTATGGTCACAGCCACTGAAATGCGAATCCTTTCTGAATTTTTCATCCATATTCCTATCTCTGTTACATTTTTGCATGCATCTTCCTCTTATTAACAGCTATTCTTTTTGGGGTACAACACAAATATGATTACTTATTTATTACTGTGACTTCCATGTAATTCCTTACTCCATTTTTAAGTTTGACTATTGTATAGATGATCATATTGAAGAAACAGTTTCTTTTTGGTTGACCCTGCTCATAATTTTTCATTGAACCTGCAACTTGATTCGCTCGATAGTTCTAGTTATTTAGAAGTATCTAATCTCTAACAACATTTCCTTTAGTTAGTTGGTAAAGAGACAAACCGCTAGCTCTAGCTGGACTTATTTAAATTCATAGTTATGATGGATATCTCCTGCTAGTAACTGTATGAAACTGGTAGCAAAGAAGTAATAAAAAGGTTAAGGGTATGTTTTTGTTACTAATGGCTTGTGATGTTTCCTCTTTTCTTGATGTAATTACCATATTTGTTTGCTTATTCATTGTCAATTTTCATGAAAGGTGGATCAAGGAGCAATATAGAGGCTGTGAGTAAAGTTGAAGGTGAATATATATTACTCTATCTATTCTCGAGTAAAAGTTTAGTTTCATCAAAAGTTTTAGACTGAAATGCAATTGATTATTGAAGGGTAGGTACTATAATTTGTTATTATTCTTTTCTACTTTGATCAGGCATTGTTCTAGTAAACATGATCTCATGGATGTCGTGCCTATATTATTGTACATTATCTATCTTTATCTGCGTACATTCTAATGTATTAATATATGAAGTGTAGTTGATAAACGATAGGACGGTCCCAGGGTTGTGTGTAGTGCCTTGGGTACCGGGGTTATCTTTTTATGGATAGGAAATAATTTCATTGATTATACAAAACGCTACGAAAAGAGCTAACCCATCCAAAGAGATTACAAAAAAATTTCTCCAGTTGGATATGAGAGAATTCATGCAGAAGCTGTTTAAAGGAACAATAATTTTATACCAGTAAAGAGCCATAAAAGAGAGAGCTTCCTTTGTATTGAAAGATCATTGACTTCCTTTCAATCCAAATATTTCAAATACACGCATTCACACACATTTTGACACCCTCTAGCCTCTCACGCTCTATCGTAACTCCCTCATCTGTCTATCTCTAGCCTCCTCCCTATGTTATTTATGCAATTTTGATTCTTGCCATTCCCTTGTCCAGCCTATCCCGCGTTTGTTGAATTTAACTTTCCTCTCTGTGTCACATGCGATATGATTCCCTCCATCTACTTCGTGTCATTACGTTTTCCCTTTCTTTTGGTTGTTGCCATACCCCACTGCCCAGAACAGTCCGCCCCTAGCTTGTCTTTGTTGGAATTTAAGTCTCCTCTCTGGTTCATGCCTCTTGAACCATGCTTCTTTATTTATTTTGAAAGCGAAGATATTCAAATTATTGTGTAAATTCAATATTTTTATGCTAATTTATTTATATTTTATATATTTTTTCAAATAATGTATGATCATTGAGACCCATGCTTTCTTACAGATAGGCATTCAACCTTGATTTGCCAAATGAGTTAAAAATTGAAAGTGAATTAATGATTAATTTATCTTATCCAGATTGATTTATTTTGGTCAATCATTACCAACTACAGTGCAAGGCTCATTTTTTTTTAATCAACAACCATATTTGATGATCTCAAGCATATATATTATGCAGGTGGTACATTGTGCACTGCAGAGGTCCAACGAGCAATACCCATTCTAAAGAAAGCATATGGAGATAGCATGCGTAAAGTATTGCATCTAGGCCCTGATACTTGTTCAGTGGTGTCTAAATTATTAAAAGAAGAGGATACAGAAGCATGGGGTGTGGAGCCCTACGACTTAGATGATGCTGATGCCAGTTGCAGACGCCTTGTGCGGAAGGGCTTCGTGCGTGCTGCTGATATTAAGTTTCTCCTGCCATATAGAGCAAAGTCATTTTCTCTTGTCATTGTTTCAGATGCATTGGATTACTTGTCTCCCAGATACCTTAACAAGACTCTACCAGAACTGGCAAGGGTTTCTGCTGATGGTGTTGTTATATTTGCCGGTAAACCATTCTTACTTCGTCATTTGAGATTATTATATTTTCTTTACACCTAGTCTTGTTAAATGGGAGGAACCGTAACTCAATTGTGCCTGCTTGTGGTTTTGAGTGCATAGAAGGATAACACAAGCTACATTTTGTCTGGTTTTCGTTCATTCTCTTTATGATTCTCTCTGTCTTTCGTTGGGAATGGTATTAGAGCCAGACATCGGGTGATGTGTCAGCGAGGAGGCTGAGCCCCAAAGGGGTGGATACGAGGCGGTGTGCCAGTAAGGACGCTGGGCCCCGAAGGGTGGTGGATTGGAGGGTCCCACATTGGTTGCAGAAGGGAACGAGTGTCTACAAGGTCGTTGGGCCCCGAAGGGGGTGGATTGTGAGATCCCACATCGGTTGGGGAGGAGAAGGAAGCATTCTTTATAAGTGTGTGAAAACCTCTTCCTAGCAGACGCGTTCTAAAAACCTTGAGGGGAAGCCGGAAAGGAAAAGCCCAAAGAAGAAAATATCAACTAGCGGTTGACTTGGACTGTTACAAATAGGATCGTATAATAACTCGCTGAGGTCATTTTTAGTTACCTTTTACTGTCCATAATTCTTTTCTCAATCACGGGATAGTGGTCTAATCTTTTTTATTCTGAATTAATTTTGTTATAAAGATTGGGCATCAAAGGAAGGCGCCATTGTTGGAAGGACCCACAGTGCGCTCTCTCCCAGTCCACCACCTTGACCCATCCTCGTCGGAAACCATGACCAACCCCTCAACACCCCGTTCCCCACTGACTATATGCCTCCCCCAGCCCCACTACCACCCACCCACACTCTCAAAAACCAAAATGACCACCCACCTGTTGGCTTATTGGCCCTTGATCTCACATTAATTAATTTCAATGAATTAATTATTGATGTTTTGATGATAACAAACCTACTTTTAATTATTAA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BLAST of CmaCh19G005180 vs. Swiss-Prot
Match: Y3972_ARATH (Uncharacterized protein At3g49720 OS=Arabidopsis thaliana GN=At3g49720 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 378.6 bits (971), Expect = 5.4e-104 Identity = 188/259 (72.59%), Postives = 219/259 (84.56%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K2U6_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G070220 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 484.2 bits (1245), Expect = 1.0e-133 Identity = 235/261 (90.04%), Postives = 248/261 (95.02%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. TrEMBL
Match: A9PBS0_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0009s08600g PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 425.2 bits (1092), Expect = 5.6e-116 Identity = 206/261 (78.93%), Postives = 231/261 (88.51%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. TrEMBL
Match: W9S1Q6_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_002205 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 419.5 bits (1077), Expect = 3.1e-114 Identity = 204/261 (78.16%), Postives = 231/261 (88.51%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. TrEMBL
Match: B9S7U0_RICCO (Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis GN=RCOM_1381640 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 419.5 bits (1077), Expect = 3.1e-114 Identity = 209/261 (80.08%), Postives = 228/261 (87.36%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2RA85_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_002G212400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 417.9 bits (1073), Expect = 8.9e-114 Identity = 201/260 (77.31%), Postives = 231/260 (88.85%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. TAIR10
Match: AT3G49720.1 (AT3G49720.1 unknown protein) HSP 1 Score: 378.6 bits (971), Expect = 3.0e-105 Identity = 188/259 (72.59%), Postives = 219/259 (84.56%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. TAIR10
Match: AT5G65810.1 (AT5G65810.1 unknown protein) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 3.3e-104 Identity = 188/259 (72.59%), Postives = 218/259 (84.17%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. NCBI nr
Match: gi|449438287|ref|XP_004136920.1| (PREDICTED: uncharacterized protein At3g49720 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 484.2 bits (1245), Expect = 1.5e-133 Identity = 235/261 (90.04%), Postives = 248/261 (95.02%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. NCBI nr
Match: gi|659110145|ref|XP_008455072.1| (PREDICTED: uncharacterized protein At3g49720 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 481.9 bits (1239), Expect = 7.2e-133 Identity = 235/261 (90.04%), Postives = 247/261 (94.64%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. NCBI nr
Match: gi|743795485|ref|XP_011002655.1| (PREDICTED: uncharacterized protein At3g49720-like [Populus euphratica]) HSP 1 Score: 429.9 bits (1104), Expect = 3.2e-117 Identity = 208/261 (79.69%), Postives = 233/261 (89.27%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. NCBI nr
Match: gi|719975778|ref|XP_010248314.1| (PREDICTED: uncharacterized protein At3g49720 [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 426.0 bits (1094), Expect = 4.7e-116 Identity = 204/261 (78.16%), Postives = 230/261 (88.12%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh19G005180 vs. NCBI nr
Match: gi|224105811|ref|XP_002313939.1| (hypothetical protein POPTR_0009s08600g [Populus trichocarpa]) HSP 1 Score: 425.2 bits (1092), Expect = 8.0e-116 Identity = 206/261 (78.93%), Postives = 231/261 (88.51%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima
Date Performed: 2017-05-20
The following gene(s) are orthologous to this gene: The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene:
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