CmaCh17G001090 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAAAATTTGAAGATCATTATTTCTCGACATCCTTAACTACTTCAACCAAGTCTCAAGCTTGCTTCTTCCTCTTCCTCCTCGTTCTTCTCCTCCTCGTCGTTCCTTATCGATTCTCAACTGGGCCGAGCTCCATGGCTTCAACTAGTAATCCATCCCGTCCTCCTTCGTCTAAGGCCATGGCAGAACAAGCCTTCTCTAGACCTCAGTTTGAAGCATCTATGCATGAAGTTCCTAGTGGCCCAAATCCCACATCCAACAAGTAAGATTGAAATAAAAATGAAAGAGGGTCATATTAATAGATGATTAATTATTATTATTATGAAATATTTCTATATATATAATTCCTTTGATTAATGTTTATATAATATTAAACTTAGTTTTGTGAAGTACAAATTTTATGAGCCTTTTGTGTGGGGATTTGCTGTTTTTTTTTTTTTTAAGGTTATGATAAATGTGATGATTTTATATGGAGCTTATTAAAAATTATTTTTTTTTATTTCAAATTTTTCCTAAAATTTTAAAAGAAATTAATTTTTTTTAACATGTCACGCCCACGAGAAAATGTAATTCCTAAAATATTAAAAAAAATAAAAAAAATAAAAACTATTCCTGAATTGGCCCAATTCACGGCCCAGTCTCATGGCCCTTATGTAACATTTGCGGAACTACGACTCTCCATAATATACCATAAAGCCGCCTCTCTTAAGGTCTCTTTCTCTGGAGCCCTTGAACAGCCTTCCCTTAATCGAGACTCAACTCTTTCTTGAGAGCCCTCGAACAAAATACTCTTTTTGTTTGCACCTTCGAGACTCACAACTTATAGTTGTTAGATACTTGAGTATTCTATTGACATGACTAAGTTAGAAGTATGACTCTCATACAATGTTAAAAATCACGAGCCTCCACAATGATATAATATTGTCCACTTTGAGCATAAGGTCTCGTGGTTTTACTTTTTGTTTCCTTAAAAGTTCTCGTACCAATAGAGATAGTATTGTAAGATTCCTCTAGATAATCATTCATCATATTTGAATTTAAAATCCTAGTATTCTCCTACCTTGAGTGTTACAAAAACATTTCAACGAGATAATTCTCCTATGTTATTATCTTTTTTATTTATTTTTAAAAATTACGAACGGAACTTTTAAAAATCTTTGAATATAAATTATATAAAATATTGTATATATGCTGACGTTTGACAAATTTGGTATAATTTAACCCTTTCTTTTTCCCTTAGGTTTGAAAAATGAGATATTAAAAGAAAGGAATAATTTATGCTGACGTTTGGTAAATATTTGGGATTGGTGAAAGATTAAATAAATGCACGTGATTACTCACGTGCGGTGGCGCCGATTTAACGCCACTTTTTACAGACGTTGGCGCCTCGGATTCCCTCTGTTTTCCTTTCATTCCATGTTCACTCGCCTTCCTTGCGCGTGAATCTCACCCTCCATTTATTTCATTCGTCTAATTAAATTAAATATTAATTTTTGATATTATCAATAGTACAAATAAAAAATATATTATTTAAAATTTAATAATATGATAACTAAATTATAAATTGTTACATTGTTTTATTTTATTTTGTTATATCTAATAAGTCTAGAAAACAATTTTATAATTTTTAAATCAACTATTTTTTTTATGAATGTTTAAATATTAAAAATATTTCAAATTTATAATTTAAGATTAAGATTTAGGGTTTATAAAAAAAAGAATAATATAGAGACTAAATGGTAAATTGTTACATTGTTTTTACTTTATTTTGTTTTGTTAAAACTCCTATTAGAATAAAAATTATTTAGAATTTAATTAATAATATTATTAAAAAACAACTATTTATCATTCTTAAATATTTTACTTTTAAGTTCCAACTTAAAAAGCAATGACTAAATTAATTATTAAAAAAAAAAAAAGAATTGGCGGTCCGATTCAAGTATTCAACCTCGGGCCAGCCCAACGGTCAAGAATTTAGGTCGGAAGTCAAAGTTTACGGCTTGTCGTGTAATGGGGTTGCGTGAGGTTCACGCACTTAATATGAGAGACCTTTGGAAAGCGCGTGGTAAGCCTGCTGAAGACAAAGGAATCCTTCAAAAAGAGCGGGAACTATTATCATTGGTCCACGTCTGCATTTAATGCCGCTGTTTTGTTTTCTACGCTTCCAAAAATTAATATATTTAGGCGTGATTATCGACGCGTTTGATCCCTTCTTTTTGTAAACAAAATTAATTATGGAAATGAAAATACTAAAAATTAAACCATTTTGTTAATTTATACCTAATTTTAATAAAAAGTGACTTAATAGAATATTGGTAAAAATTCAAATCCACTCCTAGTAAATATTCTCTGTTTTGACTTATTACGTATAGCTATCAACCTTATGATTTTAAAACGCAAATGTTAGAGAGAGGAGGTTTCCACTCTTATAAAAAATGTTTCGTATCCCCTCCAACCGATGACAATATCAACTAGCTGTGGGGTTTGGCTGTTGCAAATGGTATAAGAGTTAGGCACAGGGCAGTGTGCCAACAAGAACGTTGGGACCCCAAAGTGGGTGGATTGTGAATTGTGTGAAAACTTCTTTCTAAAAGATGCATTTTAAAACATTGAGGAGAAACTCACTTGAGAAAGTTCAAAGAGGACAATATCCGTTAACAGTGGGCTTGGGCTTTTACAATATTTCTCCATACAGTTTGAACTAATAATTATTTCGACCAATGAGAAAATTCTAACCCCCGAACTTCATGTAGCTAATTTTTTTACTTAGGTCCAGAGTTACTCACAATATCAGGCTTGTAAAAGTAAAAAGTCCATATATCTCGTGTCATACAAACATGATATTTCTTTTTAGTTTATTTTAATCCTTTAAATTCAAGGAGGGAGGAAGGCTTTATAAAAGCAGCTTTTGACGAGCTCTCAACGTTAATATAAATAATCATATTTTAATACTTGTCCCAACTTTAATCACTACAAAAGTATAGATACTCTTATTTATTGTCTATCCCGTCAATATTATTTTAAAAATGATTCAATTTATTAATATTAAAAAAATAGTTATAAAATAATAACCATAATTTTTACAACTTTTCCCTTTTGCAAATGAGTTGTAACTTGCAAGTAATTATTATAATCAAGTAAATAATAAAAAGGGTGGGGATAAAGTTGGAAAGAAAAGTATCAATTACGTCACAAGTCAAAATAAAGAAATTCCCCCTCTTTGTGGTTTTCATTGGGCCCCCACCTCGTCATGGATTAACTTGCTTTTCAAGGCGCGTGGCGAGCAAACAAAACGGTTCGTGTGACATTCGCTCATTCTCTATTTTAACGCGCGTGGTTTCCACGTTCTTCTTTGTTTTAGTTATATAAAAATTTATATTTATAACTAAAATTGGATGAAACTCAAATATTCATCCATCAAAATAAACACTGATATCAGTTACAAATGTGAAATATTCGATCTTTATAATAATATTAGAAGTAGGATTGAGTTAGATTACAATCCTATTTTTGAGCGGGTCAAGTTAACCCAACTCAAAAAATGTAAACCCACGACCCGAACCCAAAATTTTCAACTTTTCAAAAACTAAACTTAACCTAAATCTAACACAACCCAACTTTTATAGTTTGAGCTAAGTGATTTGGGTCGGTCAGGCTGGAATGTCTTGTTATTTATCTTTTTCCTAATGACGTGGTCATTTAAGCACGGTAAAAAGAATACGTCAAATTTTCATGCTCGTTTTATTTACGAATTTGAAAGTTAGGTAGGTAGTTGTTTCAATATTTGCCTTAAAAAGTTAAATTATAATTCAAACCCGAATTCTAATAATGTGTTTTTGTTGTAGGGTGAAAAGACATCAAAAGTTTCATAATTTTGGTTACAATTTCCCCACTTTCATTGTGAAGCTATTAAGGAATAAAGTGGCCAAACATGGGAATGGGCTAAGCTTTTAGAAGGATAGAGAATTTAATTCTAAGGCACCATATACGAAGTTTGCCAAACATAAGACAATACTAGTGTGTGGGTTTGAAGAACTTTTAATGACTTCCAAATTTGAGACACAAGTTTTTGTCTCTAAAATAACAAAAACAGCCGCCATTTTGTCCCCTCAAAACTTAGAGTCGAGATACGAGATACGGGTTTTTGCTCATTTCGAGTCGAGAATGATTCGAGTGATGTAGAGGTGTGCTAGGGTTAGGTTTGATTGGTTCGGAAAATCTTTTGGACCAACCCAAATTTCGAGTTGGTTAAGTTAGTGAATCGAGTAACCCGAATAAAGTTCACAACTTAATCCAACCCAACCATTTTAATGTCGAGTTCACAACCTAAACAATGATTATAGCATTAACTAAAAATCTCATGACAATGAATTAAAGTTTAATAAAGAAAAAGAGAAGGAAAATGGGAGCCATAAATTTAGTGACGTAAGGCTCTACCAAAAAATTAAATGACTTTCCCATTCGATCAACTGTCAAAAAAAGCAGTTTAAGTACCACAAACGACGACGTCTTGAAATAGTAGGCCAACACGTAGTAACATACAGGTATTTTAGTGTGATTTTCAAGCTTAGCGTCTTAGTAAGAAAATAATAATTAATTAAATGAAAAAAATGTAGAAAAAGTTTCCTTGTAGTCTCTTCATTATTAGATCGGTTCGGCCATAAAAAGTGCATATCCAATCTCGGTTCAAGTCCAAGTCGAACGGGTTTACAGTACTATATTGTAGAGATGTTTAAATGACTCGATAATTTGTACTATCCCTCCAAATAGTAAAAATTGGGTTAGATTAAATTTTGATCCCGAAATCAATTGGGTGTGTACTTTATTCGACTTGACTAATCTGAAATTTTGAACTCCTAAATTTCTTTATCTTGATTCGACCCGTGTACACCACTAACTATTTAGGTTGAATAGAGCTAATCCAACTTTAACAAGATTTTGACCCAATCCTTAGACGAACGTGATTTTTAAAATGGTGATCTATATCCAATCT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ATGGCAAAATTTGAAGATCATTATTTCTCGACATCCTTAACTACTTCAACCAAGTCTCAAGCTTGCTTCTTCCTCTTCCTCCTCGTTCTTCTCCTCCTCGTCGTTCCTTATCGATTCTCAACTGGGCCGAGCTCCATGGCTTCAACTAGTAATCCATCCCGTCCTCCTTCGTCTAAGGCCATGGCAGAACAAGCCTTCTCTAGACCTCAGTTTGAAGCATCTATGCATGAAGTTCCTAGTGGCCCAAATCCCACATCCAACAACTCCCCCAGCTCTCTGCTTCTTCTTCTTCCTCCATTTTCCCTTCTTGGGCTCTGCAACTTTCTTCTTCAATCCCTTCTGTGTTGGGGCCATTTCCTTCGGTTTGTGTCTGGTTCGCTAACTTCATGA ATGGCAAAATTTGAAGATCATTATTTCTCGACATCCTTAACTACTTCAACCAAGTCTCAAGCTTGCTTCTTCCTCTTCCTCCTCGTTCTTCTCCTCCTCGTCGTTCCTTATCGATTCTCAACTGGGCCGAGCTCCATGGCTTCAACTAGTAATCCATCCCGTCCTCCTTCGTCTAAGGCCATGGCAGAACAAGCCTTCTCTAGACCTCAGTTTGAAGCATCTATGCATGAAGTTCCTAGTGGCCCAAATCCCACATCCAACAACTCCCCCAGCTCTCTGCTTCTTCTTCTTCCTCCATTTTCCCTTCTTGGGCTCTGCAACTTTCTTCTTCAATCCCTTCTGTGTTGGGGCCATTTCCTTCGGTTTGTGTCTGGTTCGCTAACTTCATGA MAKFEDHYFSTSLTTSTKSQACFFLFLLVLLLLVVPYRFSTGPSSMASTSNPSRPPSSKAMAEQAFSRPQFEASMHEVPSGPNPTSNNSPSSLLLLLPPFSLLGLCNFLLQSLLCWGHFLRFVSGSLTS
BLAST of CmaCh17G001090 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LNB8_CUCSA (CLAVATA3/ESR-related protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G131680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 2.0e-10 Identity = 45/70 (64.29%), Postives = 50/70 (71.43%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh17G001090 vs. NCBI nr
Match: gi|700206342|gb|KGN61461.1| (CLAVATA3/ESR-related protein [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 2.9e-10 Identity = 45/70 (64.29%), Postives = 50/70 (71.43%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |