CmaCh15G006060 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)

Overview
NameCmaCh15G006060
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr15 : 2873631 .. 2874797 (-)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGATCTTCATGGGCTCCTCTCCTTTTTGGTGCCTTTCTTGCTATCCTTTCCCTAAACTTGCCATCTACCACCCATGCTAATTATGTCTATGCCTCGCCTCCCCCGCCTAAGAAGGTATACTATCCGCCTCCGGTATACCATTCTCCACCACCTCCCAAGAAGTCTTACTACCCACCTCCGGTTTACCACTCTCCGCCACCTCCTAAGAAGGTGTATTATCCACCACCTGTGAAATCTCCACCACCGCCGAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCGAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCGAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTACTATCCACCACCTGTGAAATCCCCACCACCACCGAAAAAGGTGTACTATCCACCTCCCGTCTATCACTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCCGTCTACCATTCTCCGCCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCTGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCGCCCGTCTACTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCGCCAGTCTACTCACCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAAAAGGTATACTACCCACCACCAGTGTACCACTCTCCACCGCCACCGGTGTACCACTCTCCACCGCCACCCGTCTATTACTACTCATCACCACCCCCTCCACACTACTAG

mRNA sequence

ATGGGATCTTCATGGGCTCCTCTCCTTTTTGGTGCCTTTCTTGCTATCCTTTCCCTAAACTTGCCATCTACCACCCATGCTAATTATGTCTATGCCTCGCCTCCCCCGCCTAAGAAGGTATACTATCCGCCTCCGGTATACCATTCTCCACCACCTCCCAAGAAGTCTTACTACCCACCTCCGGTTTACCACTCTCCGCCACCTCCTAAGAAGGTGTATTATCCACCACCTGTGAAATCTCCACCACCGCCGAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCGAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCGAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTACTATCCACCACCTGTGAAATCCCCACCACCACCGAAAAAGGTGTACTATCCACCTCCCGTCTATCACTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCCGTCTACCATTCTCCGCCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCTGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCGCCCGTCTACTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCGCCAGTCTACTCACCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAAAAGGTATACTACCCACCACCAGTGTACCACTCTCCACCGCCACCGGTGTACCACTCTCCACCGCCACCCGTCTATTACTACTCATCACCACCCCCTCCACACTACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGATCTTCATGGGCTCCTCTCCTTTTTGGTGCCTTTCTTGCTATCCTTTCCCTAAACTTGCCATCTACCACCCATGCTAATTATGTCTATGCCTCGCCTCCCCCGCCTAAGAAGGTATACTATCCGCCTCCGGTATACCATTCTCCACCACCTCCCAAGAAGTCTTACTACCCACCTCCGGTTTACCACTCTCCGCCACCTCCTAAGAAGGTGTATTATCCACCACCTGTGAAATCTCCACCACCGCCGAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCGAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCACTCTCCACCACCGCCGAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCTGTTTACCATTCTCCTCCACCACCTAAGAAGGTGTACTATCCACCACCTGTGAAATCCCCACCACCACCGAAAAAGGTGTACTATCCACCTCCCGTCTATCACTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTGTATTACCCACCTCCCGTCTACCATTCTCCGCCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCCGTGTATCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTTTACTACCCACCTCCTGTGTACCATTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTATACTACCCACCGCCCGTCTACTCTCCACCACCACCAAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTATACTACCCACCGCCAGTCTACTCACCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTGTACCATTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCAGTGTACCATTCTCCACCACCACCGAAAAAGGTATACTACCCACCACCAGTGTACCACTCTCCACCGCCACCGGTGTACCACTCTCCACCGCCACCCGTCTATTACTACTCATCACCACCCCCTCCACACTACTAG

Protein sequence

MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSSPPPPHY
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN3_ARATH (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 347.8 bits (891), Expect = 1.5e-94
Identity = 281/443 (63.43%), Postives = 286/443 (64.56%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPP-------PVYHSPPPP 60
           MGS  A L+    +  +SL   S + ANY Y+SPPPP K Y PP       PVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 61  KKSYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 120
           KK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSPPPPK
Sbjct: 61  KKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK 120

Query: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 180
           K Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSPP
Sbjct: 121 KHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPP 180

Query: 181 PPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 240
           PPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPP
Sbjct: 181 PPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPP 240

Query: 241 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 300
           PPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 241 PPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVY 300

Query: 301 HSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYP 360
           HSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y P
Sbjct: 301 HSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSP 360

Query: 361 PPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVY 389
           PPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     PPPV H  PPPVY
Sbjct: 361 PPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVY 413

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN1_ARATH (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 325.5 bits (833), Expect = 8.0e-88
Identity = 258/384 (67.19%), Postives = 263/384 (68.49%), Query Frame = 1 

Query: 12  AFLAI-LSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPK 71
           +FL +  SL   S T ANY Y+SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP 
Sbjct: 3   SFLVLAFSLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPV 62

Query: 72  KVYYPPPV-KSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 131
           K Y PPPV KSPPPP K Y PPPVY SPPPP        VY SPPPP K Y PPPVY SP
Sbjct: 63  KHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPP--------VYKSPPPPVKHYSPPPVYKSP 122

Query: 132 PPPKKVYYPPPV-KSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV 191
           PPP K Y PPPV KSPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 123 PPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPV 182

Query: 192 YHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 251
           Y SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y 
Sbjct: 183 YKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYS 242

Query: 252 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV-YSPPPPKK 311
           PPPVY SPPPP     PP VYHSPPPP     PP VY  PPP   Y PPPV Y  PPP  
Sbjct: 243 PPPVYKSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPV 302

Query: 312 VYYPPPV--YSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 371
            Y PPPV  +SPPPP     PP VYHSPPPPKK Y     Y SPPPP   Y PP VYHSP
Sbjct: 303 HYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHYE----YKSPPPPVH-YSPPTVYHSP 362

Query: 372 PPPVYH-SPPPPVYYYSSPPPPHY 389
           PPPV+H SPP   Y Y SPPPPHY
Sbjct: 363 PPPVHHYSPPHQPYLYKSPPPPHY 373

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. Swiss-Prot
Match: LRX1_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 3.2e-36
Identity = 199/379 (52.51%), Postives = 208/379 (54.88%), Query Frame = 1 

Query: 29  YVYASPPPPKKVYYPPPV--YHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKK 88
           YVY+SPPPP      P V  Y  PPPP     P    +SPPPP      P V++ PPP  
Sbjct: 402 YVYSSPPPPPSSKMSPTVRAYSPPPPPSSKMSPSVRAYSPPPPPYSKMSPSVRAYPPP-- 461

Query: 89  VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPP 148
              PPP   SP PP     PP VY SPPPP        VY SPPPP  VY      SPPP
Sbjct: 462 ---PPP---SPSPP-----PPYVYSSPPPPY-------VYSSPPPPPYVY-----SSPPP 521

Query: 149 PKKVYY--PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV 208
           P  VY   PPP  +S PPP  VY  PP    PPPP     PPP   S PPP  VYY P V
Sbjct: 522 PPYVYSSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPP----PPPPSP---PPPCPESSPPPPVVYYAP-V 581

Query: 209 YHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 268
             SPPPP  VYYPP V  SPPPP  VYYPP V +SPPPP  VYYPP  Y SPPPP  VYY
Sbjct: 582 TQSPPPPSPVYYPP-VTQSPPPPSPVYYPP-VTNSPPPPSPVYYPPVTY-SPPPPSPVYY 641

Query: 269 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVY 328
           P  V  SPPPP  +YYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  VY
Sbjct: 642 PQ-VTPSPPPPSPLYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPVY 701

Query: 329 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV-----------YYPPPVY---HSPPPP-- 387
           YP     SPPPP + YY P    SPPP K             Y PPP Y    SPPPP  
Sbjct: 702 YPSET-QSPPPPTEYYYSPS--QSPPPTKACKEGHPPQATPSYEPPPEYSYSSSPPPPSP 740

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN_DAUCA (Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 149.8 bits (377), Expect = 6.0e-35
Identity = 171/330 (51.82%), Postives = 189/330 (57.27%), Query Frame = 1 

Query: 2   GSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPP 61
           GS  + L+    + ++SLNL S T A Y Y+SPPPP+  + PPP  HSPPPP     PPP
Sbjct: 7   GSKMSSLIVSLLVVLVSLNLASETTAKYTYSSPPPPE--HSPPPPEHSPPPPYHYESPPP 66

Query: 62  VYHSPPPPKKVYY----PPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 121
             HSPPPP  VY     PPP+ SPPPP     PPP  HSPPPP  VY     Y SPPPPK
Sbjct: 67  PKHSPPPPTPVYKYKSPPPPMHSPPPPYHFESPPPPKHSPPPPTPVY----KYKSPPPPK 126

Query: 122 KVYYPPPVYH----SPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYH----SPPPPKKVYYP 181
             + P PV+H    SPPPP  VY     KSPPPPK  + P P +H    SPPPPK  ++P
Sbjct: 127 --HSPAPVHHYKYKSPPPPTPVY---KYKSPPPPK--HSPAPEHHYKYKSPPPPK--HFP 186

Query: 182 PPVYH------SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH- 241
            P +H      SPPPP  VY     Y SPPPP  VY     Y SPPPPK  + P PV+H 
Sbjct: 187 APEHHYKYKYKSPPPPTPVY----KYKSPPPPTPVY----KYKSPPPPK--HSPAPVHHY 246

Query: 242 ---SPPPPKKVY-YPPPVYHSPPPPKKVY---YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 301
              SPPPP  VY  PPP  HSPPPP  VY    PPP  HSPPPP  VY     Y SPPPP
Sbjct: 247 KYKSPPPPTPVYKSPPPPEHSPPPPTPVYKYKSPPPPMHSPPPPTPVY----KYKSPPPP 303

Query: 302 KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 306
                PPPVYSPPPPK  Y      SPPPP
Sbjct: 307 MH-SPPPPVYSPPPPKHHY---SYTSPPPP 303

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN2_ARATH (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 137.5 bits (345), Expect = 3.1e-31
Identity = 202/406 (49.75%), Postives = 215/406 (52.96%), Query Frame = 1 

Query: 29  YVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSP--------PPPKKVYYPPPVKS 88
           YVY+SPPPP     P   Y SPPPP     PPP Y+SP        PPP  VY  PP  +
Sbjct: 350 YVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPT 409

Query: 89  PPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 148
             P  KVYY    PP VY SPPPP     P   Y SPPPP     PPP Y+SP P  KVY
Sbjct: 410 YSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVY 469

Query: 149 YPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 208
           Y    KSPPPP     PPP Y+SP P  KVYY    PP VY SPPPP     P   Y SP
Sbjct: 470 Y----KSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSP 529

Query: 209 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV 268
           PPP     PPP Y+SP P  KV+     Y SPPPP     PPP Y+SP P  KV+     
Sbjct: 530 PPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVH-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVH----- 589

Query: 269 YHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP 328
           Y SPPPP     PPP Y+SP P  KVYY     SPPPP     PPP Y  P P KVYY  
Sbjct: 590 YKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSP--KVYYK----SPPPPYVYSSPPPPYYSPSP-KVYYK- 649

Query: 329 PVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY--PPPVYHSPPPPKKVYY------------- 388
              SPPPP     PPP Y+SP P  KVYY  PPP Y+SP P  KVYY             
Sbjct: 650 ---SPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPHPHVCVCPP 709

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K8S7_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 599.0 bits (1543), Expect = 4.2e-168
Identity = 358/389 (92.03%), Postives = 363/389 (93.32%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 60
           MGSS AP+LF AF+A+LSL LPSTT+ANY+YASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP
Sbjct: 4   MGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63

Query: 61  PVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 120
           PVYHSPPPPKKVYYPPPV SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVY
Sbjct: 64  PVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVY 123

Query: 121 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 180
           YPPPVY SPPPPKKVYYPPPV SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPK
Sbjct: 124 YPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPK 183

Query: 181 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 240
           KVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY  PPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SP
Sbjct: 184 KVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-PPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SP 243

Query: 241 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 300
           PPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 244 PPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVY 303

Query: 301 SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 360
           SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPP     PPP
Sbjct: 304 SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPVYHSPPPP 363

Query: 361 VYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS-PPPPHY 389
           VYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS PPPPHY
Sbjct: 364 VYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSSPPPPPHY 385

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TrEMBL
Match: A0A0D3CC16_BRAOL (Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 344.4 bits (882), Expect = 1.9e-91
Identity = 274/439 (62.41%), Postives = 284/439 (64.69%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYY------------PPPVYH 60
           MGS  A L+    +  +SL   S + ANY Y+SPPPP K Y             PPPVYH
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQYKSPPPPVKHYSPPPVYH 60

Query: 61  SPPPPKKSYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHS 120
           SPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHS
Sbjct: 61  SPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---EYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 120

Query: 121 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPV 180
           PPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP   Y PPPV
Sbjct: 121 PPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVMHYSPPPV 180

Query: 181 YHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 240
           YHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y 
Sbjct: 181 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 240

Query: 241 PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 300
           PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y 
Sbjct: 241 PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 300

Query: 301 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKK 360
           PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY PPPP K +Y   VY SPPPP K
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHPPPPPKKHY---VYKSPPPPVK 360

Query: 361 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVY 389
            Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV+
Sbjct: 361 HYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKKYVYKSPPPPVH 406

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TrEMBL
Match: M4EAT0_BRARP (Uncharacterized protein OS=Brassica rapa subsp. pekinensis PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 333.2 bits (853), Expect = 4.3e-88
Identity = 273/440 (62.05%), Postives = 282/440 (64.09%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 60
           MGS  A L+    +  +SL   S + ANY Y+SPPPP K Y     Y SPPPP K Y P 
Sbjct: 1   MGSPVASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQ----YKSPPPPVKHYSPS 60

Query: 61  PVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPP 120
           PVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPP
Sbjct: 61  PVYHSPPPPKKHY---EYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKDYVYKSPLPPVKHYSPPP 120

Query: 121 VYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPV 180
           VYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPV
Sbjct: 121 VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPV 180

Query: 181 YHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV 240
            HSPPPPKK Y             PPP YHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 181 NHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYPPPPFYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPV 240

Query: 241 YHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 300
           YHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y 
Sbjct: 241 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 300

Query: 301 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPK 360
           PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP 
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPV 360

Query: 361 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPV 389
           K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV
Sbjct: 361 KHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKKYVYKSPPPPV 406

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TrEMBL
Match: D7KTY3_ARALL (Predicted protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_476851 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 2.5e-80
Identity = 253/393 (64.38%), Postives = 257/393 (65.39%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 60
           MGS  A  L  AF    SL   S T ANY Y+SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 61  PVYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV 120
           PVY SPPPP K Y PPPV KSPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K 
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKY 120

Query: 121 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 180
           Y PPPVY SPPPP K Y PPPV KSPPPP K Y PPPVY SPPPP           SPPP
Sbjct: 121 YSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPP-----------SPPP 180

Query: 181 PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH 240
           P K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY S PPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 181 PVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSAPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYK 240

Query: 241 SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPP 300
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP     PP VYHSPPPP  V+Y P             PP 
Sbjct: 241 SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPP--VHYSP-------------PPV 300

Query: 301 VYSPPPPKKVYYPPPV--YSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 360
           VY  PPP   Y PPPV  +SPPPPKK Y     Y SPPPP   Y PPPVYHSP       
Sbjct: 301 VYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHY----EYKSPPPPVH-YSPPPVYHSP------- 350

Query: 361 YPPPVYHSPPPPVYH-SPPPPVYYYSSPPPPHY 389
            PPPVYHSPPPPV+H SPP   Y Y SPPPPHY
Sbjct: 361 -PPPVYHSPPPPVHHYSPPHQPYLYKSPPPPHY 350

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TrEMBL
Match: R0IMM6_9BRAS (Uncharacterized protein OS=Capsella rubella GN=CARUB_v10009850mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 285.4 bits (729), Expect = 1.0e-73
Identity = 224/353 (63.46%), Postives = 234/353 (66.29%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 60
           MGS  A L+    +  +SL   S + ANY Y+SPPPP K +Y PPV H  PPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASLVAALLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVK-HYSPPVKHYSPPPVKHYSPP 60

Query: 61  PVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 120
           PVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y
Sbjct: 61  PVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHY 120

Query: 121 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 180
            PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP 
Sbjct: 121 SPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPV 180

Query: 181 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 240
           K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SP
Sbjct: 181 KHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSP 240

Query: 241 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 300
           PPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY              +
Sbjct: 241 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVY--------------H 300

Query: 301 SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 353
           SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPV+HSPP      + P +Y SPPPP
Sbjct: 301 SPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVHHSPP------HHPYLYKSPPPP 302

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TAIR10
Match: AT1G21310.1 (AT1G21310.1 extensin 3)

HSP 1 Score: 347.8 bits (891), Expect = 8.5e-96
Identity = 281/443 (63.43%), Postives = 286/443 (64.56%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPP-------PVYHSPPPP 60
           MGS  A L+    +  +SL   S + ANY Y+SPPPP K Y PP       PVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 61  KKSYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 120
           KK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSPPPPK
Sbjct: 61  KKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK 120

Query: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 180
           K Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSPP
Sbjct: 121 KHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPP 180

Query: 181 PPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 240
           PPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPP
Sbjct: 181 PPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPP 240

Query: 241 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 300
           PPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 241 PPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVY 300

Query: 301 HSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYP 360
           HSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y P
Sbjct: 301 HSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSP 360

Query: 361 PPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVY 389
           PPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     PPPV H  PPPVY
Sbjct: 361 PPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVY 413

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TAIR10
Match: AT1G76930.1 (AT1G76930.1 extensin 4)

HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 1.8e-37
Identity = 116/175 (66.29%), Postives = 118/175 (67.43%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 60
           MG+  A  L  AF    SL   S T ANY Y+SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGAPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 61  PVYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV 120
           PVY SPPPP K Y PPPV KSPPPP K Y PPPVY SP        PPPVY SPPPP K 
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSP--------PPPVYKSPPPPVKH 120

Query: 121 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV-KSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 174
           Y PPPVY SPPPP K Y PPPV KSPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPP Y
Sbjct: 121 YSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPSY 163

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TAIR10
Match: AT1G12040.1 (AT1G12040.1 leucine-rich repeat/extensin 1)

HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 1.8e-37
Identity = 199/379 (52.51%), Postives = 208/379 (54.88%), Query Frame = 1 

Query: 29  YVYASPPPPKKVYYPPPV--YHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKK 88
           YVY+SPPPP      P V  Y  PPPP     P    +SPPPP      P V++ PPP  
Sbjct: 402 YVYSSPPPPPSSKMSPTVRAYSPPPPPSSKMSPSVRAYSPPPPPYSKMSPSVRAYPPP-- 461

Query: 89  VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPP 148
              PPP   SP PP     PP VY SPPPP        VY SPPPP  VY      SPPP
Sbjct: 462 ---PPP---SPSPP-----PPYVYSSPPPPY-------VYSSPPPPPYVY-----SSPPP 521

Query: 149 PKKVYY--PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV 208
           P  VY   PPP  +S PPP  VY  PP    PPPP     PPP   S PPP  VYY P V
Sbjct: 522 PPYVYSSPPPPYVYSSPPPPYVYSSPP----PPPPSP---PPPCPESSPPPPVVYYAP-V 581

Query: 209 YHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 268
             SPPPP  VYYPP V  SPPPP  VYYPP V +SPPPP  VYYPP  Y SPPPP  VYY
Sbjct: 582 TQSPPPPSPVYYPP-VTQSPPPPSPVYYPP-VTNSPPPPSPVYYPPVTY-SPPPPSPVYY 641

Query: 269 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVY 328
           P  V  SPPPP  +YYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  VY
Sbjct: 642 PQ-VTPSPPPPSPLYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPVY 701

Query: 329 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV-----------YYPPPVY---HSPPPP-- 387
           YP     SPPPP + YY P    SPPP K             Y PPP Y    SPPPP  
Sbjct: 702 YPSET-QSPPPPTEYYYSPS--QSPPPTKACKEGHPPQATPSYEPPPEYSYSSSPPPPSP 740

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TAIR10
Match: AT5G06630.1 (AT5G06630.1 proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 150.6 bits (379), Expect = 2.0e-36
Identity = 192/364 (52.75%), Postives = 205/364 (56.32%), Query Frame = 1 

Query: 29  YVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVY 88
           YVY+SPPPP     P   Y SPPPP     PPP Y+SP P  KVYY    KSPPPP    
Sbjct: 58  YVYSSPPPPYYTPSPKVNYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSP--KVYY----KSPPPPYVYS 117

Query: 89  YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPK 148
            PPP Y+SP P  KVYY      SPPPP     PPP+Y+SP P  KVYY    KSPPPP 
Sbjct: 118 SPPPPYYSPSP--KVYYK-----SPPPPYVYSSPPPLYYSPSP--KVYY----KSPPPPY 177

Query: 149 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV 208
               PPP Y+SP P  KVYY    PP VY SPPPP     P   Y SPPPP     PPP 
Sbjct: 178 VYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPP 237

Query: 209 YHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 268
           Y+SP P  KVY     Y SPPPP     PPP Y+SP P  KVY     Y SPPPP     
Sbjct: 238 YYSPSP--KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVY-----YKSPPPPYVYSS 297

Query: 269 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVY 328
           PPP Y+SP P  KVYY     SPPPP     PPP Y  P P KVYY     SPPPP    
Sbjct: 298 PPPPYYSPSP--KVYYK----SPPPPYVYSSPPPPYYSPSP-KVYYK----SPPPPYVYS 357

Query: 329 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSSPP 388
            PPP Y+SP P  KVY     Y SPPPP     PPP Y+SP P VY+  PPP Y YSSPP
Sbjct: 358 SPPPPYYSPSP--KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPNVYYKSPPPPYVYSSPP 368

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TAIR10
Match: AT2G24980.1 (AT2G24980.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 149.1 bits (375), Expect = 5.8e-36
Identity = 208/398 (52.26%), Postives = 220/398 (55.28%), Query Frame = 1 

Query: 29  YVYASPPPP-----KKVYY----PPPVYHSPPPP-----KKSYY----PPPVYHSPPPP- 88
           YVY+SPPPP      KVYY    PP VY SPPPP      K YY    PP VY SPPPP 
Sbjct: 202 YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPY 261

Query: 89  ----KKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPKKVYY 148
                KVYY    KSPPPP     PPP Y+SP P  KVYY    PP VY SPPPP     
Sbjct: 262 YSPSPKVYY----KSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVYSSPPPP----- 321

Query: 149 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKK 208
               Y+SP P  KVYY    KSPPPP     PPP Y+SP P  KVY     Y SPPPP  
Sbjct: 322 ----YYSPSP--KVYY----KSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVY-----YKSPPPPYV 381

Query: 209 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVY 268
              PPP Y+SP P  KVY     Y SPPPP     PPP Y+SP P  KVYY    PP VY
Sbjct: 382 YSSPPPPYYSPSP--KVY-----YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYKSPPPPYVY 441

Query: 269 HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPP 328
           +SPPPP     P   Y SPPPP     PPP Y+SP P  KVYY     SPPPP       
Sbjct: 442 NSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVYYK----SPPPPY------ 501

Query: 329 PVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY--PPP--VYHSPPPPKKVYY--PPPVYHSPPP 388
            VYS P       PPP YSP P  KVYY  PPP  VY SPPPP   YY   P VY+  PP
Sbjct: 502 -VYSSP-------PPPYYSPSP--KVYYKSPPPSYVYSSPPPP---YYSPSPKVYYKSPP 537

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. NCBI nr
Match: gi|700190951|gb|KGN46155.1| (hypothetical protein Csa_6G058200 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 599.0 bits (1543), Expect = 6.0e-168
Identity = 358/389 (92.03%), Postives = 363/389 (93.32%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 60
           MGSS AP+LF AF+A+LSL LPSTT+ANY+YASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP
Sbjct: 4   MGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSYYPP 63

Query: 61  PVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 120
           PVYHSPPPPKKVYYPPPV SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVY
Sbjct: 64  PVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVY 123

Query: 121 YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 180
           YPPPVY SPPPPKKVYYPPPV SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPK
Sbjct: 124 YPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPK 183

Query: 181 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP 240
           KVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY  PPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SP
Sbjct: 184 KVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-PPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SP 243

Query: 241 PPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY 300
           PPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVY
Sbjct: 244 PPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVY 303

Query: 301 SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 360
           SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPP     PPP
Sbjct: 304 SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPVYHSPPPP 363

Query: 361 VYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS-PPPPHY 389
           VYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSS PPPPHY
Sbjct: 364 VYHSPPPPVYHSPPPPVYYYSSPPPPPHY 385

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. NCBI nr
Match: gi|15218966|ref|NP_173553.1| (extensin 3 [Arabidopsis thaliana])

HSP 1 Score: 347.8 bits (891), Expect = 2.4e-92
Identity = 281/443 (63.43%), Postives = 286/443 (64.56%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYYPP-------PVYHSPPPP 60
           MGS  A L+    +  +SL   S + ANY Y+SPPPP K Y PP       PVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 61  KKSYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 120
           KK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSPPPPK
Sbjct: 61  KKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK 120

Query: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 180
           K Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHSPP
Sbjct: 121 KHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPP 180

Query: 181 PPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPP 240
           PPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPP
Sbjct: 181 PPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPP 240

Query: 241 PPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY 300
           PPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 241 PPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVY 300

Query: 301 HSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYP 360
           HSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y P
Sbjct: 301 HSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSP 360

Query: 361 PPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSPPPPVY 389
           PPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     PPPV H  PPPVY
Sbjct: 361 PPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVY 413

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. NCBI nr
Match: gi|923925548|ref|XP_013731769.1| (PREDICTED: extensin-3-like [Brassica napus])

HSP 1 Score: 345.9 bits (886), Expect = 9.2e-92
Identity = 281/447 (62.86%), Postives = 286/447 (63.98%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYY------------PPPVYH 60
           MGS  A L+    +  +SL   S + ANY Y+SPPPP K Y             PPPVYH
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQYKSPPPPVKHYSPPPVYH 60

Query: 61  SPPPPKKSYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHS 120
           SPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHS
Sbjct: 61  SPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---EYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 120

Query: 121 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPV 180
           PPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPV
Sbjct: 121 PPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPV 180

Query: 181 YHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV 240
           YHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPV
Sbjct: 181 YHSPPPPKKHYVYKSPPPPVMHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPV 240

Query: 241 YHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 300
           YHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y 
Sbjct: 241 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 300

Query: 301 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPK 360
           PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP 
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPV 360

Query: 361 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY----PPPVYHSP 389
           K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     PPPV H  
Sbjct: 361 KHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 417

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. NCBI nr
Match: gi|922497463|ref|XP_013587003.1| (PREDICTED: extensin-3 [Brassica oleracea var. oleracea])

HSP 1 Score: 344.4 bits (882), Expect = 2.7e-91
Identity = 274/439 (62.41%), Postives = 284/439 (64.69%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYY------------PPPVYH 60
           MGS  A L+    +  +SL   S + ANY Y+SPPPP K Y             PPPVYH
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQYKSPPPPVKHYSPPPVYH 60

Query: 61  SPPPPKKSYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHS 120
           SPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHS
Sbjct: 61  SPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---EYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 120

Query: 121 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPV 180
           PPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP   Y PPPV
Sbjct: 121 PPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVMHYSPPPV 180

Query: 181 YHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 240
           YHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y 
Sbjct: 181 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 240

Query: 241 PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 300
           PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y 
Sbjct: 241 PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 300

Query: 301 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKK 360
           PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY PPPP K +Y   VY SPPPP K
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHPPPPPKKHY---VYKSPPPPVK 360

Query: 361 VYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPVY 389
            Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV+
Sbjct: 361 HYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKKYVYKSPPPPVH 406

[Close]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. NCBI nr
Match: gi|923644285|ref|XP_013642307.1| (PREDICTED: extensin-3 [Brassica napus])

HSP 1 Score: 342.0 bits (876), Expect = 1.3e-90
Identity = 276/440 (62.73%), Postives = 285/440 (64.77%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGSSWAPLLFGAFLAILSLNLPSTTHANYVYASPPPPKKVYY------------PPPVYH 60
           MGS  A L+    +  +SL   S + ANY Y+SPPPP K Y             P PVYH
Sbjct: 1   MGSPVASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQYKSPPPPVKHYSPSPVYH 60

Query: 61  SPPPPKKSYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPVYHS 120
           SPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPVYHS
Sbjct: 61  SPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKDYV---YKSPPPPVKHYSPPPVYHS 120

Query: 121 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVKSPPPPKKVYYPPPV 180
           PPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y     KSPPPP K Y PPPV
Sbjct: 121 PPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV---YKSPPPPVKHYSPPPV 180

Query: 181 YHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY 240
           YHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y 
Sbjct: 181 YHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYS 240

Query: 241 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------ 300
           PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             
Sbjct: 241 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 300

Query: 301 PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPK 360
           PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP 
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPV 360

Query: 361 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP----VYHSPPPPV 389
           K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV
Sbjct: 361 KHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKKYVYKSPPPPV 406

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh15G006060 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
EXTN3_ARATH1.5e-9463.43Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3[more]
EXTN1_ARATH8.0e-8867.19Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2[more]
LRX1_ARATH3.2e-3652.51Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX1 PE=1... [more]
EXTN_DAUCA6.0e-3551.82Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1[more]
EXTN2_ARATH3.1e-3149.75Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1[more]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0K8S7_CUCSA4.2e-16892.03Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1[more]
A0A0D3CC16_BRAOL1.9e-9162.41Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1[more]
M4EAT0_BRARP4.3e-8862.05Uncharacterized protein OS=Brassica rapa subsp. pekinensis PE=4 SV=1[more]
D7KTY3_ARALL2.5e-8064.38Predicted protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_476851 PE=4 ... [more]
R0IMM6_9BRAS1.0e-7363.46Uncharacterized protein OS=Capsella rubella GN=CARUB_v10009850mg PE=4 SV=1[more]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G21310.18.5e-9663.43 extensin 3[more]
AT1G76930.11.8e-3766.29 extensin 4[more]
AT1G12040.11.8e-3752.51 leucine-rich repeat/extensin 1[more]
AT5G06630.12.0e-3652.75 proline-rich extensin-like family protein[more]
AT2G24980.15.8e-3652.26 Proline-rich extensin-like family protein[more]
BLAST of CmaCh15G006060 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|700190951|gb|KGN46155.1|6.0e-16892.03hypothetical protein Csa_6G058200 [Cucumis sativus][more]
gi|15218966|ref|NP_173553.1|2.4e-9263.43extensin 3 [Arabidopsis thaliana][more]
gi|923925548|ref|XP_013731769.1|9.2e-9262.86PREDICTED: extensin-3-like [Brassica napus][more]
gi|922497463|ref|XP_013587003.1|2.7e-9162.41PREDICTED: extensin-3 [Brassica oleracea var. oleracea][more]
gi|923644285|ref|XP_013642307.1|1.3e-9062.73PREDICTED: extensin-3 [Brassica napus][more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh15G006060.1CmaCh15G006060.1mRNA


Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CmaCh15G006060Cp4.1LG13g04140Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB305
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmaCh15G006060Wax gourdcmawgoB0391
CmaCh15G006060Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB325
CmaCh15G006060Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0135
CmaCh15G006060Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB283
CmaCh15G006060Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB287
CmaCh15G006060Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB309
CmaCh15G006060Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB317
CmaCh15G006060Melon (DHL92) v3.5.1cmameB268
CmaCh15G006060Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB245
CmaCh15G006060Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB273
CmaCh15G006060Watermelon (97103) v1cmawmB253
CmaCh15G006060Watermelon (97103) v1cmawmB260
CmaCh15G006060Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB318
CmaCh15G006060Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB335
CmaCh15G006060Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB273
CmaCh15G006060Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB294
CmaCh15G006060Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB917
CmaCh15G006060Silver-seed gourdcarcmaB0087
CmaCh15G006060Silver-seed gourdcarcmaB1148
CmaCh15G006060Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0370
CmaCh15G006060Watermelon (97103) v2cmawmbB319
CmaCh15G006060Watermelon (97103) v2cmawmbB323