CmaCh14G016870 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)

NameCmaCh14G016870
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr14 : 12547878 .. 12551092 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTAAAGGATTATGCCATTCAAGGAAACCACCACCCCAAATGTGCTGCCAGTTTCAGCTGTCAAACATCATATGTTCTTCCTTTTCCTATTTTAAATTCGCCCCCCCTTTTTTTAGTGCAATTGTATGGATGCCTACCTAGTTGTTCACCCTAAAATCCCGTGTATTAATTTTTTTTATTAGTCAAAAGTGACTCAAGTGTCATAAATTATGAAATTTATTTGAAGGCTCCAGAGAAAGAGGTTTTATGATATACTTTGATGAACAATACCGAATACCGTAGAATTATGAATAAAATATTAAAAAAAAAACATAAAATAATGAATACTTTTCCGGCCGTCCGTCAAGCAAAACGACATGTCGGAGTGGCTTTTGCGTCAGATCTTCTAATATCAGCGGTTTGAGAGTGGGTCCGCACCACCAATGCTGACTACACCCACCAACTAGTCAAATATTGGCTCCCAAAGTTCTATATGCACCCACTTCCCTTTCTCAATTTTTTTTTTATTATCTTTAATTTCCTCCTGCCTTTTTTCCGAAAAATAAAAAATTAATTAATTGGGTTCAATATCCATTCGTGGACTTGAATGCCATATGATTGCTACGACCCATGTCGATTCATATGAGAATTTAACACCTATTGACCTTTACTATTTACTTCTTAAGAGTGAAGACTATCCTCACAAACCAACAGAAGTTCTTCCAGCATGTTTTGTCCTCACTCGTCACCCAACATAAAAATGTGGTATCAGTTCATTCATGCACCCCTTATTTACTTAGGTTCCCCATGTTCATCAACTTTTACCTTAGTTTATTCCCGAACCATATCCTATTACTATAAAATTTGTCAACATTTCCAAAATTATTTTAAAATTCAAACAAAACCCAAAGAAAAGGGTATCATAAGGCAGTGAATGGATTGTGATTTTCTAGTATAAAATAAGGAATTAATTAATGAAGCTTCGAATATATTGGATTGAGAAGAGAATTAATTAGTGTAAAATATGGCGTAAAATACCCAAAATTGAGATTTCGAAAGCTAATTATATGCTTAACATGCGATCATACACGTGAAGCTATGGTATTTGATTCTTTCCACTATCTCACGTAAACAAAAAATATATATTATTAAATTAATTTATTATAATTTAAAATTTTAAATAATTATTGAGAGGGAATAAGGGAATGATGTCACTTTAAAAAAAAAAAATTGATTGATTTTATGAGGTGTTTCAATTTCATTGGTTGATTTGTAAAATTATGAATTTATGTCAATTTTAAAAAATATTATAATTTAAATAAATATTTTAAAACTTTATTTGTACTAAAAAACATGGTTTAATTTTTTTTTTTAGTTATTAATGGAGAATCTTTTTTTCTCTTAAAGGGTTAATGCATGCGTGATACGGCTTGTCCATACGTGAAAGCCAAAGAGTTAATTAGGGATTAATTAAGGGTTAATCAATGAAATTTAAGCTAATACTTTAGTGCAAGAAAGACAAAGAATCCAGTTCAATTCTCACATTAATTAATTAATTAGTTAATTAGTTAATTAATTAACCTTAAAAAGGCCTCTTTTTTGGCCCCATGTTGCTCCCACATTTTCTCTCTCTCTTTTTATTTATTTCTTTTCAAAATAAAAAATAAATATTTATATATGATAATGGAATCTTATGCAATCCATGCAACAAAATATTTTATGTTCAAAAGTAGTAATAGATGATTACATCATCACCCTAACCCGTTCTTAGTATCATCAACTGAACCGATAGATAACAAGGACCCTCTTAAGTTCATCGTTTTAGGTCGGGTTTTCTTAACTATTATTATGAACACGAGACTTCGCCTCAAAATCGGACTCGTATGGAAGCAATTTTGACGAGTATTATAATTCATTAGTGGTTTAATTTAATACGAATATAAATTTTTAATTGACTTGATATATAATAAGAACGAGTGAGGCAGCCATGTGCATAAGTAATTTCATTAAAAATAATGACGTAAAGTTAAGTGTAATGATATGAGTGGTATAAACTACTAAGATAGATAAAGTATGTAGAGTTTTAAAAACACGAGAATGTGGGCCGTAAATTAATGGTCACTTTTGAAAAGTATTGACTATGCACATCAAATTGAAATATAATAAACAAACCCTTTTGTTGTCGAGAGAGCGATTCTTACTGTTTTATGATGAACAGAGCATTTTTTATAATAATGTAGAAACATTTCATTAATAAACACGTTTTAAAATTGTGAGGTTGACGATGATACATAATTTACTAAAATATCTGTTAGCGGTAGATTTGGGCGGTTACCGTTCGTCGGGTCGAATTAAAAAAAAATTTAAAAGAGTTAAAGGGAGGGAGAAAGTGGGAAACAGAAGACAAGGGAAGTAGATTCCATGTTCCTCTAGGAAGGGAAGGGATAAAAAGAGGTTGGGGAGAAAGACAGGTTTGTCCTTTGGAGTTTCCATAGGCTTATTTTCTTTTTATTTATTTATATTCTTAATTATTAAAATATTTTACTATAATTATATAAATAAAAAAAGTAAACAATTGGTTGACATGCTTTACCGGGAATCGCTTTGGAAGCTGGTGGAGAATCCGCCAACGTAAGCTTTTACCTACTTTTTCTTCGACTTTTATTTATTTATTTTTTTAAATAATTATTTTCTTCTTTTAACCTCTACTATTATATGGTTGGCATAAATATTATAATTATTTTTTAAAACTAAAAATTAAGTAACACGGATCTAAAAATAAATATAATTTAATATTTAGGAGCACGATTGAAACGATAATATATAATTTAAATTATTATATAAAATGCAAGTTACATCGGTATTATTCTTACAAAAACGACCATCAATATCGGTATATAAATACTGGGTAAGTGGCACTAGTATAAATATCAATAATAATTATTTAATTCAATAAATATTTATACAACATTTTGTTTAATTTTTTTTTTATTTTTAAAAAATATTTAATGGCTTAATTTAAATTATAATTTGAAAAATGAGTAAATAACTTTTTGATATGGATATTGATATTGGTCGTAATTCGATATGAAACGAGCGGGCGTAATGGAGTTTCCATCTACCGCCAATCCGAATTAGTGGTTGAAATTCATAAAGGATAGCATGGTCCTGTTCTTCCAGGTCTCATGCAGTCCATGTGAGCACTCCTCGCTCGATGCTTTCTGCAACGTCTAA

mRNA sequence

ATGCTAAAGGATTATGCCATTCAAGGAAACCACCACCCCAAATGTGCTGCCAGTTTCAGCTGTCAAACATCATATGTTCTTCCTTTTCCTATTTTAAATTCGCCCCCCCTTTTTTTAGTGCAATTATCTTCTAATATCAGCGGTTTGAGAGTGGAAGACAAGGGAAGTAGATTCCATGTTCCTCTAGGAAGGGAAGGGATAAAAAGAGGTTGGGGAGAAAGACAGGTCTCATGCAGTCCATGTGAGCACTCCTCGCTCGATGCTTTCTGCAACGTCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCTAAAGGATTATGCCATTCAAGGAAACCACCACCCCAAATGTGCTGCCAGTTTCAGCTGTCAAACATCATATGTTCTTCCTTTTCCTATTTTAAATTCGCCCCCCCTTTTTTTAGTGCAATTATCTTCTAATATCAGCGGTTTGAGAGTGGAAGACAAGGGAAGTAGATTCCATGTTCCTCTAGGAAGGGAAGGGATAAAAAGAGGTTGGGGAGAAAGACAGGTCTCATGCAGTCCATGTGAGCACTCCTCGCTCGATGCTTTCTGCAACGTCTAA

Protein sequence

MLKDYAIQGNHHPKCAASFSCQTSYVLPFPILNSPPLFLVQLSSNISGLRVEDKGSRFHVPLGREGIKRGWGERQVSCSPCEHSSLDAFCNV
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh14G016870.1CmaCh14G016870.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmaCh14G016870Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB255
CmaCh14G016870Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB253
CmaCh14G016870Melon (DHL92) v3.5.1cmameB242
CmaCh14G016870Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB215
CmaCh14G016870Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB233
CmaCh14G016870Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB236
CmaCh14G016870Watermelon (97103) v1cmawmB242
CmaCh14G016870Watermelon (97103) v1cmawmB250
CmaCh14G016870Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB262
CmaCh14G016870Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB268
CmaCh14G016870Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB283
CmaCh14G016870Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB292
CmaCh14G016870Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB225
CmaCh14G016870Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB250
CmaCh14G016870Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB318
CmaCh14G016870Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB273
CmaCh14G016870Silver-seed gourdcarcmaB0090
CmaCh14G016870Silver-seed gourdcarcmaB0307
CmaCh14G016870Silver-seed gourdcarcmaB0453
CmaCh14G016870Silver-seed gourdcarcmaB0847
CmaCh14G016870Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0291
CmaCh14G016870Watermelon (97103) v2cmawmbB263
CmaCh14G016870Watermelon (97103) v2cmawmbB266
CmaCh14G016870Watermelon (97103) v2cmawmbB280
CmaCh14G016870Wax gourdcmawgoB0306
CmaCh14G016870Wax gourdcmawgoB0328
CmaCh14G016870Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB249
CmaCh14G016870Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB284
CmaCh14G016870Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB298
CmaCh14G016870Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0709
CmaCh14G016870Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB245
CmaCh14G016870Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB251
CmaCh14G016870Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB271
CmaCh14G016870Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB279