CmaCh13G003590 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTCCTTCCGAATTTCATCTCAATTTCGATTTCCTCTTTGCATTTCTTCTTCGAAAGTTGATATTTGCTTGCAAGATTTTGGGGATTGATTGAAATAATCCTATTGTGATCGATGAGGCCGATACGACTGCCGGAGCCACCGAGCCCTACTATGGTTAAGGCAGATATATTTGAAGGCGGGGTTTATGGCGTTATTAGGCGGGCGATTGTCATCGGTAATGGGTCTTCCGGTTCTGAGAATCAGTGTATCGGTTTGGTTCAGGCGCTTGGCCTGGCTGACAAGCATGTGCTCTATGTAAGTTCTGCGAATTCATCTTTTTCGAGGGTTGGAAGTGGTCTAGTTGTTTTGGTAATTGAAGTTATTGAAGTTAACTGTTTAATTGAAGCTCTATGTATTGCTTGTGGAATGCGTCGTTTTTTTTTTTTTGTTGTTGTTACGTGCACTGCGTTACTTTGCATATGGGACTGGTTGTTATGTTAATCTAATAGTAAGAAACAACTTCTGTATTTCCAGGTTTGATATCCTTAGTAAATCCTAAAACTAGAACTGCTCATGACCTTTTTTTTTTCAGTATTTGAAGGCTTGTATAGTGAAATCCCGAGACTAACGATTCTTATCTTATATGTGCTCCCCTCAAATGCAGCGAGTTTCGAGGCCTAGAGGAGGAATAAATGAATGGCTCCACTGGCTTCCCGTTTCTCTTCACAAACGATTAGATTATATCATGATCCAGATAGGTGTTTACACTCGGATTTTGTTGCGATCCAAAAGGACAAAACTTGTGCCTCTATCTTCAGAAAATGGTGGAAGCATGGGCTTGTCATGCATTCTAGAAGCTGACTTGAAGCATATTGTATCGATGGCTAAGGAGACTTATGAAAAGTAAATTCGTTTCCGGAATATTTTTATGGGAAATTTGATTATTGGACTTGATTTATGATGTGTGTTTGTATAATTTCCAGGGATGGACCTTTATTGGTGGTTGCATCTGGTAGGGATACCATAACTATTGCAAGTTCCATCAGACGCATGGCAAAAGAGAATGTTTTTGTGGTGCAAGTATGATAACTATCTTTCTTTGTTCTATTTCATATGTTACTTGTATTTGGCTAAGGGATATGTTTGATGATCATTATGGAAGTTGAAAAGTTCTTTCACAAGCTACTTCTTTTTGCAATTCTATCGAGTATTTAGTCGGAGAGGAGAAACAGGGTTTCTAGAGGAGTCCTGGAAGGAGGTTTGGAGTTTGACACGTTTCAATTGCTCCCTTTGGATGTTTTTGACTAATACCTTTCATAATTATCCTTTCCCCCCCATCTTTTTGAGACTATTTTTGTCAGTATTTTCCAGCTTTCTTAATCTGGGCTGTATTGTGTGTACATCTCATGTTGTTTCTTTTATTTAACTTATCTGAAGTTGGATTCTCCATTAAAAACAATAAATTATGAAGATGGATGATAATGGCCATAAGGGGAATGTCATCCTAGTAGGGGTGTAGGGGTGAATTGATTGGGATGAAAAGTTTCTTGGCATGAGATGCCGGTCAGTTTTCTTGGAAATCCTTCAACTTAACCATTTTAGGCTTTTTAGCAACAGTAGCCTTAAGTGAGAGGGTGAGAAGACTTTTGACTAACCCTCTTAGAGGAGGAGTTTATTCTTTTTGTGTGAAATTATGTACATTGCCCTTGCATTGGAACATAAGAGAAAGAGCTTATTAAGTAAACTTGAAAGTACTGTAATTGTGTTAAAAGTTTTTTCACATGAAGAAAAACCTATTATTCTCTCTCTCTGTATGTCCTTAAAGGGGGAATCAAGTTTCTTCTTTATTTGAAATTTTGCCCCATTTTTTTTTTTTGTCAATCACCCCTTGCTCTTGTTTCATGTTCTCATGCTTTGGAGGTTGGTAGTTAAGATTATTCTATTATTGAGGAGTTTGTGCATGTAATTGAAGGCTGAACTTTGTATGACATTATATTTGTTGAGAGTCTTGATAGGATTGTTAGGAGATATTTCCATGATGATTGGTACAAAGTTCTTGCTCTTTAGTTATGTGAGTGTGGATAATTTTCTAGCCGTTAGGGCGATGCTTAATTGTGTTGACAAGTATGAAGCTAGGTTATTGAGTATTGATTGTGAAGAAGAGTTGGCATTTACTCTTTGTTTCTTGTGGAAGTTCAAGTGGAGGTGTGGTCTAAACATCAGAAGGCCTTGTTATGTATGTTTATGAAGATACATTAGGACTAGGAACCTCCAACTTTGGATTGCTTCACATTTGTTAGAGATAGGCATGGGTCTTTTGGCAAGTGGCTTTGAAGTAAGCTCCATAACATGGAGCCATGTATCATGGTGAAGTTGAACAATAACTATTTTAAGTTTTTCCCTTTCTAGGTTAAGGCCTTTCTGCTCTTAAATCTTTTGTATGACGTTTGTTATTGTTAGCATGGGTCAAGTCAATGACTCTTTTTTCTTCATGTTTGTTTTTTTTTTTGGTCTTTGTTTAATGGCTTTAGAAGTTTGAAAGGAGCTTTTTGTCTCCACCTCTGTGAGTGCAAGGAGTCTTAATCATACAAAGCCTTTATTTCAACTTCTTCTTGAAAACATATAACCAAGTGGGACCCGCCTCAAAAACTCAGTTAGCTAGTAGAATGTTTTTCCCAAGATGTACATTAAAGTCACTAGAGAAATGTGACTTAGTCCTCTAGGTATTTATACTCTTGATTCTTGGTGAATATTGTTGCCTGTAATTTAGTATTGTTCCTTCATTTTCTTAGCTTTTGGCGAGGAGCAAAACTTGTATTAAAATTTAGTTTGAGGTGAATAAGGGTCTTCCNAAAAGAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAAAAGACGCCAATGGGCATAACTGAAGAGACTTGTGTCTGAAAAAAGGGCTGCTTTGTTAGTATATAAGATGATTGTAGGTGCGATGGTTGAAGATAGAGAAATGGTCAAACAGCTTGTGAATCCTCGGAGCTTTTGGATTTTATTGGAACAAAACTAGATATTTGGTTCTCCAAAGACTGAACAAATGTTTTTCACATGCATACCCATGCATATATTTTTCTGGGGAGGTGGGAGCACTTGTGTTGGAGTGTTTCATGGAGTTCATTTGTTACTTGTGAACTGGCAAAAAGAAACTAATGAGAAGTTGGACCGAGCCTAAGTTACAAAAGTTTGTGCCAGCCTTTAAAACTTTGGAGATATGAAGGGTTTTTTCTATCAAGCTCACACAAAGATTTGAATACGTGACCTCCGGTGGGTAGGTGTTACTTGATCAAGCCTCAGTTATTGATATTCAAGTCTCTAGTGGAACGAGCCTTGAGAAAGGAGGACCCACAAGAAGCAACCATTTGAACTGTTTGTATGGAATGTTTATTAAGGAAGAAGCTAGATGGAAGATCAATTGTGGGCTGGAATTGAATGGAGACAATTGGAAGGAAACTGAACATAATAACAAGGAAATGTTGGAAGGCATATTAAAATGTAAGATGTCATTAATGAGGCTCTCAATTTTCAAGTTGGTAATGGTTTTAACATCAGATTTTGGGATCAGGCATTTATACAGAAAAATCAGCTTTCTTTAACCTATTTAACTGACCTTATTCTGCTGATAAAGTTGATTTGGAATGGCAGAAGCCCAAAGAATGTAAAATGTTTCTCTGGTCTATGGCTTACAGAAGCCCAAAGAATGTAAAATGTTTCTCTGGTCTATGGCTTACAGAAGCTTCAATACTGATGATAAGCTGTAATGGAAGTTTTCTCTTGGGCTCTTTTCATATCTACCTGTAGATCGTGTTTAAGAGACAAAGAATCACTAGGTCATCTGTTTTTACACTGCCCATTTACGCCTAAAACTTTGACACTTTATTTGTGGAAACATGGGGGTATCGCATACCTGTCTTGGAAAATGGATGACTGGCTTATAAAAGACTTAAATGCATGGAATTTTAGGGGCAAAGCAAAGGTTTTGTGGAACCCTGCAACCAGAGCACTTTTGTGGCACATTCTGGAAGGACAAGAAAGATAAACTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCGATAAGAAAATTCAAAAGATTATATTCCAAAAGAACATAAACAACCTAAGGGTGGGGTTGAGGGAACCACCCGAACAAAGCTATAGAGTGAGTCTTCCAATCGCTAATAATCATCAAGAGGTCATTTACAAAAGAATTTCTTGTGTCCAGATATCTACCAAGACACCATATTTTGTAGAAGATTACAAAAAGTCATAAAACTATAAGAGTTAGAAGACTTATCGTCAAAGTATCTAGCGTTCCTATTCTTCCAAATGTGCCACAAAATAGCTCTAAAGATGCAACTACCCACCGCCTTAGCTTTCCTTTTCAAATTCCACTCAAGAAAACCTTTCATCAACCAATCATCAATTTCTTACAAAATGATAATCCTAAACTTACAAAATGATAATCCTAAACTTTCAGCTGAGAAGTTCTACGACCTATAAGCGAAATTGCAATGGAGGAAGAGGTGATCAATGTCTTCTGCCTCTTTCAAGCACATTCGACAACTAGAGGGCGACAAAGACCACCTTCTAATTTCCTTTGGATTCTGTCATTGGTATTTAAACTCCTACGGGCCAAAGACCAAATGTAGGGTTTTTATGCTTTTAAACTGTCCCAGTCAGGGATAAATTGACCTTGGAGGTTTCAGACGCAAGACTCTAAAAAGCAGACTTACAAGAGTATACAGGAGCCTTCAAGTGACCACAAAATACGATTTTATGCCTCTCCCATCTGCACCGAGCTCAACTTTTCTACTAGGGCCACCTAACTACGTAATTTTCTATCAAAGAGCCTTCTTCTCAAGCCCCAATCCTAGGTTTGGTTATTATCATCCCAACAATCAGCAAT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TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTCCTTCCGAATTTCATCTCAATTTCGATTTCCTCTTTGCATTTCTTCTTCGAAAGTTGATATTTGCTTGCAAGATTTTGGGGATTGATTGAAATAATCCTATTGTGATCGATGAGGCCGATACGACTGCCGGAGCCACCGAGCCCTACTATGGTTAAGGCAGATATATTTGAAGGCGGGGTTTATGGCGTTATTAGGCGGGCGATTGTCATCGGTAATGGGTCTTCCGGTTCTGAGAATCAGTGTATCGGTTTGGTTCAGGCGCTTGGCCTGGCTGACAAGCATGTGCTCTATCGAGTTTCGAGGCCTAGAGGAGGAATAAATGAATGGCTCCACTGGCTTCCCGTTTCTCTTCACAAACGATTAGATTATATCATGATCCAGATAGGTGTTTACACTCGGATTTTGTTGCGATCCAAAAGGACAAAACTTGTGCCTCTATCTTCAGAAAATGGTGGAAGCATGGGCTTGTCATGCATTCTAGAAGCTGACTTGAAGCATATTGTATCGATGGCTAAGGAGACTTATGAAAAGGATGGACCTTTATTGGTGGTTGCATCTGGTAGGGATACCATAACTATTGCAAGTTCCATCAGACGCATGGCAAAAGAGAATGTTTTTGTGGTGCAAATTCAACATCCAAGGTTGCATTTGAATCGGTTTGATATGGTCATCACCCCTCATCATGATTATTATCCTTTAACTCCTCAAGCACAAGAGCAAGTTCCTCGATTTATAAGGAAGTGGATAACTCCACGCGAACCTCCAGATCAGCATGTGGTCTTGACTGTTGGAGCCCTGCATCGGATTGATTTTGCTACATTACGTAGTGCAGCTAGTGCATGGCATGATGCATTTGCTCCTCTTCCAAAACCCTTATTGGTGGTCAATATTGGAGGGCCTACAAGTAGCTGTCGATATGGTGTGGATCTTGCAAAGCAGCTGGTAACCGGTTTGTTGAGTGTTCTTGCAAGCTGTGAAAGCGTCAGAATATCCTTCTCAGACAGAACTCCTGAGAAGGTATATAACGTTGTTGTGAAAGAACTTGGGGATAATCCAAAAGTTTACATCTGGGACGGACAAGAGCCAAATCCACACTTGGGCCACTTAGCTTGGGCAGATGCATTTGTTGTAACCGCAGATTCGGTTAGCATGATAAGTGAGGTTTGCAGTACTGGGAAGCCTGTCTATGTCATTGGAACTGAGCGCTGTAAGTGGAAGTATTCAGCGTTCCACAAATCTTTGAAGGAGAGAGGAGTCATCCGCCCATTCACAGGCACTGAAGATATCTCGGAGAGCTGGAGTTACCCTCCGCTGAACGACACAGCAGAAGCAGCTACTCGGGTGCGGGAGGAATTAGCCAAGCGCGGCTGGAGAATACGACCATAGGGGAAGTCTGTGGATATGTTTTACACACACTGCTTCATTTGTCATAAAAAATGGTACCCCTTCACCTCTTGAGCATTACTTTTGTACAATGGTGCACATAGGAACAGAGAATTACAAGCATTAATGGTTTCAAATCCAGTTCTTGGACAAAACTTGAGATAAGAATAATGAAGCTAGCAGCTGTTTGTTAGTGCGGCTTGTATCATATGCAGAGAGGCTTTGGCTTGCTCTTTTCCACAGATCTGGCAGCTCTTAGATTTTGATCAGGAAAATTTTTATACCGTACGGTGAAATATGTGTTTATTGTAAATTGGGTTAATTGTATTTGATTAAAATAAGCAGAATGTTAAATGGTTTTGTTAGTAGCTACCATTGGAACAAACAAATATGAAACTGACCTTGGTTTAGTGGAAATTAGTTACATCTGTGTATAAATCATTGGTTTAGTGGCCCATGCTTTACTAATTGAGCTTTGCAGCC ATGAGGCCGATACGACTGCCGGAGCCACCGAGCCCTACTATGGTTAAGGCAGATATATTTGAAGGCGGGGTTTATGGCGTTATTAGGCGGGCGATTGTCATCGGTAATGGGTCTTCCGGTTCTGAGAATCAGTGTATCGGTTTGGTTCAGGCGCTTGGCCTGGCTGACAAGCATGTGCTCTATCGAGTTTCGAGGCCTAGAGGAGGAATAAATGAATGGCTCCACTGGCTTCCCGTTTCTCTTCACAAACGATTAGATTATATCATGATCCAGATAGGTGTTTACACTCGGATTTTGTTGCGATCCAAAAGGACAAAACTTGTGCCTCTATCTTCAGAAAATGGTGGAAGCATGGGCTTGTCATGCATTCTAGAAGCTGACTTGAAGCATATTGTATCGATGGCTAAGGAGACTTATGAAAAGGATGGACCTTTATTGGTGGTTGCATCTGGTAGGGATACCATAACTATTGCAAGTTCCATCAGACGCATGGCAAAAGAGAATGTTTTTGTGGTGCAAATTCAACATCCAAGGTTGCATTTGAATCGGTTTGATATGGTCATCACCCCTCATCATGATTATTATCCTTTAACTCCTCAAGCACAAGAGCAAGTTCCTCGATTTATAAGGAAGTGGATAACTCCACGCGAACCTCCAGATCAGCATGTGGTCTTGACTGTTGGAGCCCTGCATCGGATTGATTTTGCTACATTACGTAGTGCAGCTAGTGCATGGCATGATGCATTTGCTCCTCTTCCAAAACCCTTATTGGTGGTCAATATTGGAGGGCCTACAAGTAGCTGTCGATATGGTGTGGATCTTGCAAAGCAGCTGGTAACCGGTTTGTTGAGTGTTCTTGCAAGCTGTGAAAGCGTCAGAATATCCTTCTCAGACAGAACTCCTGAGAAGGTATATAACGTTGTTGTGAAAGAACTTGGGGATAATCCAAAAGTTTACATCTGGGACGGACAAGAGCCAAATCCACACTTGGGCCACTTAGCTTGGGCAGATGCATTTGTTGTAACCGCAGATTCGGTTAGCATGATAAGTGAGGTTTGCAGTACTGGGAAGCCTGTCTATGTCATTGGAACTGAGCGCTGTAAGTGGAAGTATTCAGCGTTCCACAAATCTTTGAAGGAGAGAGGAGTCATCCGCCCATTCACAGGCACTGAAGATATCTCGGAGAGCTGGAGTTACCCTCCGCTGAACGACACAGCAGAAGCAGCTACTCGGGTGCGGGAGGAATTAGCCAAGCGCGGCTGGAGAATACGACCATAG MRPIRLPEPPSPTMVKADIFEGGVYGVIRRAIVIGNGSSGSENQCIGLVQALGLADKHVLYRVSRPRGGINEWLHWLPVSLHKRLDYIMIQIGVYTRILLRSKRTKLVPLSSENGGSMGLSCILEADLKHIVSMAKETYEKDGPLLVVASGRDTITIASSIRRMAKENVFVVQIQHPRLHLNRFDMVITPHHDYYPLTPQAQEQVPRFIRKWITPREPPDQHVVLTVGALHRIDFATLRSAASAWHDAFAPLPKPLLVVNIGGPTSSCRYGVDLAKQLVTGLLSVLASCESVRISFSDRTPEKVYNVVVKELGDNPKVYIWDGQEPNPHLGHLAWADAFVVTADSVSMISEVCSTGKPVYVIGTERCKWKYSAFHKSLKERGVIRPFTGTEDISESWSYPPLNDTAEAATRVREELAKRGWRIRP
BLAST of CmaCh13G003590 vs. Swiss-Prot
Match: ELM1_ARATH (Mitochondrial fission protein ELM1 OS=Arabidopsis thaliana GN=ELM1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 653.7 bits (1685), Expect = 1.4e-186 Identity = 307/426 (72.07%), Postives = 365/426 (85.68%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. Swiss-Prot
Match: Y120_RICPR (Uncharacterized protein RP120 OS=Rickettsia prowazekii (strain Madrid E) GN=RP120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 5.4e-21 Identity = 85/294 (28.91%), Postives = 144/294 (48.98%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. TrEMBL
Match: W9RQ34_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_016303 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 703.4 bits (1814), Expect = 1.7e-199 Identity = 332/427 (77.75%), Postives = 378/427 (88.52%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. TrEMBL
Match: A0A059DAA4_EUCGR (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_B03829 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 698.0 bits (1800), Expect = 7.3e-198 Identity = 324/424 (76.42%), Postives = 381/424 (89.86%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. TrEMBL
Match: B9SCW9_RICCO (Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis GN=RCOM_1282020 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 696.4 bits (1796), Expect = 2.1e-197 Identity = 330/425 (77.65%), Postives = 372/425 (87.53%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. TrEMBL
Match: F6HHD8_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_06s0080g00830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 694.1 bits (1790), Expect = 1.0e-196 Identity = 330/425 (77.65%), Postives = 374/425 (88.00%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. TrEMBL
Match: M5W5Q5_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa006236mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 691.4 bits (1783), Expect = 6.8e-196 Identity = 323/425 (76.00%), Postives = 375/425 (88.24%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. TAIR10
Match: AT5G22350.1 (AT5G22350.1 Protein of unknown function (DUF1022)) HSP 1 Score: 653.7 bits (1685), Expect = 7.9e-188 Identity = 307/426 (72.07%), Postives = 365/426 (85.68%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. TAIR10
Match: AT5G06180.1 (AT5G06180.1 Protein of unknown function (DUF1022)) HSP 1 Score: 493.0 bits (1268), Expect = 1.8e-139 Identity = 236/404 (58.42%), Postives = 300/404 (74.26%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. NCBI nr
Match: gi|449443460|ref|XP_004139495.1| (PREDICTED: mitochondrial fission protein ELM1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 807.0 bits (2083), Expect = 1.6e-230 Identity = 390/425 (91.76%), Postives = 403/425 (94.82%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. NCBI nr
Match: gi|659071638|ref|XP_008461166.1| (PREDICTED: mitochondrial fission protein ELM1 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 805.8 bits (2080), Expect = 3.5e-230 Identity = 388/425 (91.29%), Postives = 404/425 (95.06%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. NCBI nr
Match: gi|703120048|ref|XP_010102013.1| (hypothetical protein L484_016303 [Morus notabilis]) HSP 1 Score: 703.4 bits (1814), Expect = 2.5e-199 Identity = 332/427 (77.75%), Postives = 378/427 (88.52%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. NCBI nr
Match: gi|702279998|ref|XP_010045191.1| (PREDICTED: mitochondrial fission protein ELM1 [Eucalyptus grandis]) HSP 1 Score: 698.0 bits (1800), Expect = 1.0e-197 Identity = 324/424 (76.42%), Postives = 381/424 (89.86%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003590 vs. NCBI nr
Match: gi|255565697|ref|XP_002523838.1| (PREDICTED: mitochondrial fission protein ELM1 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 696.4 bits (1796), Expect = 3.0e-197 Identity = 330/425 (77.65%), Postives = 372/425 (87.53%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima
Date Performed: 2017-05-20
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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