CmaCh13G003170 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATAACGACGCCTTCAACGTCTGTATATCTTTTCTACCTAATTCCTTGATCACTCTGAACATCATTTTTGGGGTGCCCATTTTCTTCTTCAATTCTGCACCTCTCTGCAAGCTACCTACTGCCGCTCTCTTCTGTTCATTTTTTCTTTTCTTTGTACAGCTTCCTTCTCTCCCATGGCTCCTCTTTCCTCTGATTCCATCAACCCCCGAGGTTCTTCAATTCTCCCCTATTTATTTAAACATATGTTTTGATTCAATTTTCGCTCCTTTTTCATGAATGAAATCATGGGCTGGGATCGCCTCTTTGTTATGTTGGCACAGATGTTTGTATTGTGGGTGTTGCTCGTACGCCAATTGGTGCCTTTCTTGGTTCACTTTCATCTTTCTCTGCTACCCAACTCGGTTCTATAGCGATTGAATGTAAGTTTTCTCCGGATTTGAGTACCCTGTTTTAAGATGATATGAATTGAAGAGCGAGGATGCTTACAGGTGCCCTTAAGAGGGCAAATGTTGATCCTTCTCTTGTGCAAGAGGTATTCTTCGGAAATGTTCTCAGTGCAAATTTAGGGCAAGCTCCTGCGAGGCAGGCTGCCTTAGGTGCTGGTATACCAAACTCTGTTATTTGCACCACTATTAATAAAGTCTGTGCATCCGGCATGAAAGGTGTTTCTTCATCTATCAAAATTTTTATTGTATTAGGATAACAGCATTGGTTCTGCAAAAGAACTAACACTTGTTTTTTCTTTCTTTTTTGTTGGCACAGCAACAATGATTGCAGCGCACACGATTCAGTTAGGTATAAATGATGTTGTTGTTTCTGGTGGTATGGAAAGTATGTCTAATGTGCCCAAATATCTCCAACTAAGGTTGGCCCTTTATCCTTCACAACCCCCCAATTATTTTATTTTATTTTAATCACTACTTCTTCTTCTTGTTGTCCTCATAACCTTTAATCCCTGATCATAAAGTATAGTTTAAGAAAACATTATACTTCAATGTAAGAATAAATTCATATATCTGATTGACTATATATTGTTATCAACTAATGCAAATTTCTCTTGCCATAGCTGGAACAGGGTGAGTTTTCCTTAAATGAGAATTATGTCTTTTGTTCATGGAGTATAAATTTTGATTATGTTATGTTTTGTTTATTACTCGCTACTTGTTCTTCTAGGTAATATGTTTATCGTTGTTGAAATATTTACTTTAATTTTCGTTCATCCTTAAAATATATGGTTAGATCACATGTTTAGTCCTTAAACTTTCAAGTTTGTGTCTATTTGGTCTCTAAACCTTTAAAAGTGTCTAATTGGTCCTTGAACTTCACGTTTTGTCTAATAGGTCTTTGAAATTTCAATTTTGTAAATAGGTTCCGGAATTTTTTTTTTATTTTTTTATTTAATTGATCTTATAGATATAAAACTGAATTTTATATCTAATGGGACTTTATACTTTCAATTTTGTACCTAGCACGTTCTTGGATTTTTAAAAAAATGTTGAATAGGTCATTGACCTATTAGACACAAAATTGAAAATTAAGAGGCCTATGGGACACAATACTGAAAGTTTAAGGATCTATTAAATGCTTTTTAAAGAAATTTCTGACTAAATCGACCCGAAGCTGAATTTGTAATTCAACCTAAAAATAATGACCTTATTTTCCACCTCCATTGGAGCCAAAAACCTTGTTTAGTGCATTGCATTGAAATGCACTTTCTCACTCACGGACACATTTATAGAAGAGAAACTAAGCTTTCATTTAGAAGAATGAAATACTTTCTCGCACTAATTTTGTTAGGGGAATAACTACTTCTCATCCTGACTCAAAGTTATGAACAGAAAAGGGTCTCGATTTGGAAATGATACTGTTGTAGATGGTATGCTTAAAGATGGTCTTTGGGATGTTTACAACGACTTTGCGATGGGTGTTTGTGGTGAGATGTGTGCCAGCCAGCACTCCATTACAAGAGAAGATCAGGTAAAGTTTACCAGATAGGTAGTTTCACTCAGTACTATTATTTTTGTTCAAAATCCAATTTGTGAAACCTCGAACTTTTTCAAGCCATCAAGAGCAACTCTTTTGGGATAGGACAAGCCAGCTAGAAACAGTTAGCAATTGAAGTACTCTGATTCTCGTTGAAATGTTTTTTCTTATCTGCTCCTTCAGAAATGATTTATCTATATAACATGTTCAAGTATAAATAAATGATCATATTTATCATACGCATAATCCATTGGGCTAAACTTTTTAGTTTACTGGCTGTTTCAAAGTCTTGTAAATGTCACTTCCTCCTCAATTATTAACATAATCACTTGTTGGGCCTTGTACTAATTTCCGACTGTGAAGGAAGCTAAAATATGAACACAAATATTCAAATTTTCATAACCTATAAGCTTTAAGCTTTTAGCTTCAGGGTGATTTAGCACAATTTAATGACCTTTTTTTAAATTACTCTCTCTTATGTTTATTAATCCCCCTCAATAGGATGCATATGCTATTAAGAGCTTTGAGCGAGGACTTGCAGCACAAAATAATGGTCAATTATCCTGGGAAATAGCTCCGGTAAGATTGCTATTCCGCTCTAAGAAAGTCTATTCTATTATAAATCAGACCTAACTAATTGTTTGAATTTTTTAGGTCAAGGTTCCTTCCGGAAGAGGGAAGCCATCTTCAATTTTTGACAAGGACGAAAGCTTGAGACAGGTAAATTGTCACTAAAAACAGTAAAAAGCACTGAATATTTGTTTTCTTAAAGTAATTAATAAACACCCAGTATTATATGCATACTTGATACTTAGGAAGATGAAGCAAGCTTATCATAGGGAACTAAGGGGATTGACATCAAAATTTTTGCTAGTTGATTGGGAGACATGTTTGAATTTAGAATGAAGCATTTATAAGCAAAAATTGGAGTTTCTTGTTTAGAAATAGGAACTGACTTCAGGTTCCTGCTAAGGTTAGTAAGTTCCGGAAAAAGTTCTTAATGATTTTCAAGGTAGGGGATAGTTTTGTCAGTGGAACTGCAAGTTGTATATGGGGCCATTCATTTTGTGTGAAGGGATTCCAAGAAAGTTGATTGGGTAAGTTGGGGGTCATCTCTCTACTTTTGTCTATATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTGAAATTCTGGAAAGGTTACTAGTTTTCTGAAATATTGAGAACTTCCATTTTTCTGAATATGGACCTTTTTGATGCTACATTCTACTTCATTGTCAATCAATTTTCTTGTTCTTGCTAGTTTGATGCTGCAAAACTAAGGAAGCTCAGGCCAAGTTTTAAGGAGGATGGCGGTACTGTTACTGCTGGCAATGCTTCTATCATAAGGTTCTCTTTCTTGTAATTGTATTTTCATATTTTCTGCCAATTAATTTTATATGCTGGTCTTGAAGAGATTTGATACAAAATAATGTGTCTTAATTATGCCACAAAAACTTCATGGTGGATGACAAGATTTTACCATACATGTTTGGATTTAGGGAGGTTTCATTGTATTTTTCAATTTTAGAGTATTATTTTTAAGGTTTTAAGTTTTATTTTCAAGGCTATAAATATCCGATCATGTTGTTGCTTTAGTATGAAGATTTTGGATATTAAAATGAAAGTTGTATATTATGCTTCTCAAGCCATGAGCTTGTTCCTTTACCTTTCTTGTGTTTAGATTTGCACCTAGAGTTATTCAAGTAGTCTTGATCAAGTTATCTTGTAAATTAATTCAAATCACGAGTTTAGAAACAAGTATTTTTTACTCTTGATCTTGATCATTAAGGTAATCCGTATCAAAACATTCTCTTAGGTTGATTCCTTATCATTTTTGAGGTTCTTGGATAATTTATTTCGAAAGATCTTGTTCTTCAACAAGGTTGTTAGATCAAATCCCAAGAGTTTTATAACAAGATCACTAATGTTTCTAAGGTGTTTCTTGAGCTGAACTGAATGCAGAAATGCATGACCATCAATGTTATTTGTTTATTTATTTGCTATTGAGTGAATTTTTTTAGAGCACATGATTTGGTAAGTTATGGAAAGACATGGTAGTATCAGTGGGTTTGTTTATTCCAGCGACTGATTTGTGAAGTACCTAGGCTAAGAAATTTACTTTCACTTTCCGTTGATGCCAAAGAGAGAACATTTTTAGGCAGCTGCATTATTTTTTATTATTTGATCTTGAACAGTGATGGTGCTGCTGCTTTAGTGCTGGTGAGTGGGAAGAAGGCGGTCGAACTCGGTTTAGAAATAATTGCCGTAATTAAAGGATACGCTGATGCAGCTCAGGTAATTAAGTTCTTGATGTTATTATCCTTCATACTGGAGAAAGATCATGTGGCTTACAGAAAAAATGACTACCAGGCGCCTGAATTATTTACAACGGCTCCAGCCCTTTCAATTCCAAAAGCTATCTCAAATGCTGGTTTACATGCTTCTCAAATTGATTATTATGAAATAAATGAAGCCTTTTCCGTAAGAACTTGTGCTTCATTTACTGCTATTGCATTTTCTTGTTCATCATGCATGATCTTGTTGTTAAGTTGCTCTAATTTTTCTCTTCAGGTTGTGGCTCTTGCTAATCAGAAGCTGCTTGGTCTTGATCCTGTGAGTCTTTTTTGTCATTTATTAAGTTCATCACCCATTTGGTATTCTTCAGAGTTCAACTAATTGTGTGCTGTTGTCCGGTAATGGTTAGTTTAGCAATCTGGTCGTTGATACATAAAGTAGGTTGTTGGACATGTCTTTTGTTACATGGTCGCCGAGCTCACTCCGCTGTCCGTTTTTGCTAGTGTTCGCTTGCATTTTTCTGTCCACTTCAGGAATTCTCATGAAAAAAGAAATTGAATTGGAACGTTTTCTTTCCGACATATGTCTTCTTTTTTTAATCTTTGGAGTTCATGGCAGTAGGGTATGTGAATTTTATTCAATTTTGGGTGGACTGTTGGCGCAAAAGGTCCTCTTCTTTCTTTTTTTCCCTT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BLAST of CmaCh13G003170 vs. Swiss-Prot
Match: THIC2_ARATH (Probable acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=At5g47720 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 590.5 bits (1521), Expect = 1.5e-167 Identity = 309/437 (70.71%), Postives = 355/437 (81.24%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. Swiss-Prot
Match: THIC1_ARATH (Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=AAT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 582.4 bits (1500), Expect = 4.1e-165 Identity = 308/425 (72.47%), Postives = 348/425 (81.88%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. Swiss-Prot
Match: THIL_SCHPO (Acetyl-CoA acetyltransferase OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) GN=erg10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 391.3 bits (1004), Expect = 1.3e-107 Identity = 215/415 (51.81%), Postives = 282/415 (67.95%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. Swiss-Prot
Match: THIA_CANTR (Acetyl-CoA acetyltransferase IA OS=Candida tropicalis GN=PACTA PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 364.8 bits (935), Expect = 1.3e-99 Identity = 201/415 (48.43%), Postives = 270/415 (65.06%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. Swiss-Prot
Match: THIB_CANTR (Acetyl-CoA acetyltransferase IB OS=Candida tropicalis GN=PACTB PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 363.2 bits (931), Expect = 3.9e-99 Identity = 201/415 (48.43%), Postives = 269/415 (64.82%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LTB9_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G173130 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 690.6 bits (1781), Expect = 1.2e-195 Identity = 370/439 (84.28%), Postives = 383/439 (87.24%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. TrEMBL
Match: B9HC23_POPTR (Truncated acetyl Co-A acetyltransferase-like family protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0006s00630g PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 622.5 bits (1604), Expect = 4.0e-175 Identity = 329/435 (75.63%), Postives = 364/435 (83.68%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. TrEMBL
Match: A0A058ZX35_EUCGR (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_L00148 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 617.1 bits (1590), Expect = 1.7e-173 Identity = 324/435 (74.48%), Postives = 361/435 (82.99%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. TrEMBL
Match: A0A061GPF0_THECC (Thiolase family protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_030451 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 613.2 bits (1580), Expect = 2.4e-172 Identity = 325/436 (74.54%), Postives = 363/436 (83.26%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. TrEMBL
Match: A0A0B0PUC9_GOSAR (Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 1-like protein OS=Gossypium arboreum GN=F383_12929 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 609.4 bits (1570), Expect = 3.5e-171 Identity = 323/431 (74.94%), Postives = 358/431 (83.06%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. TAIR10
Match: AT5G47720.2 (AT5G47720.2 Thiolase family protein) HSP 1 Score: 590.5 bits (1521), Expect = 8.4e-169 Identity = 309/437 (70.71%), Postives = 355/437 (81.24%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. TAIR10
Match: AT5G48230.2 (AT5G48230.2 acetoacetyl-CoA thiolase 2) HSP 1 Score: 582.4 bits (1500), Expect = 2.3e-166 Identity = 308/425 (72.47%), Postives = 348/425 (81.88%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. TAIR10
Match: AT5G48880.2 (AT5G48880.2 peroxisomal 3-keto-acyl-CoA thiolase 2) HSP 1 Score: 180.6 bits (457), Expect = 2.0e-45 Identity = 147/443 (33.18%), Postives = 222/443 (50.11%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. TAIR10
Match: AT1G04710.1 (AT1G04710.1 peroxisomal 3-ketoacyl-CoA thiolase 4) HSP 1 Score: 180.3 bits (456), Expect = 2.6e-45 Identity = 145/444 (32.66%), Postives = 223/444 (50.23%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. TAIR10
Match: AT2G33150.1 (AT2G33150.1 peroxisomal 3-ketoacyl-CoA thiolase 3) HSP 1 Score: 178.7 bits (452), Expect = 7.7e-45 Identity = 146/447 (32.66%), Postives = 220/447 (49.22%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. NCBI nr
Match: gi|659128578|ref|XP_008464272.1| (PREDICTED: acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 1-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 691.0 bits (1782), Expect = 1.3e-195 Identity = 370/441 (83.90%), Postives = 383/441 (86.85%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. NCBI nr
Match: gi|778659629|ref|XP_011654773.1| (PREDICTED: acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 1 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 690.6 bits (1781), Expect = 1.7e-195 Identity = 370/439 (84.28%), Postives = 383/439 (87.24%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. NCBI nr
Match: gi|449443498|ref|XP_004139514.1| (PREDICTED: probable acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 2 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 672.9 bits (1735), Expect = 3.7e-190 Identity = 361/429 (84.15%), Postives = 373/429 (86.95%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. NCBI nr
Match: gi|659128580|ref|XP_008464273.1| (PREDICTED: acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 1-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 671.0 bits (1730), Expect = 1.4e-189 Identity = 360/431 (83.53%), Postives = 373/431 (86.54%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G003170 vs. NCBI nr
Match: gi|659128582|ref|XP_008464274.1| (PREDICTED: acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 1-like isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 642.9 bits (1657), Expect = 4.1e-181 Identity = 351/441 (79.59%), Postives = 364/441 (82.54%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima
Date Performed: 2017-05-20
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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