CmaCh13G002910 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTGTTATGTATGTGGGTTTTTGTTTTCTCCCTCGCTCAACTTGTGAATGTTAAATATTAACGAACAAGTAGTCATATTGGATTTCTTTGAAGTAGTACTTTTACGAATTACTAGAATAGAGTAGCATGATTAAGGTGTTTAAATGAGTTGATTGATTTTTGTGTTTCCTCTTAGAACTAAGTGCTCTTATCTATATCAGAAGATTTTTGAATTAAGAAATAAAAAATGATGTGATTTATAAGTTTTAATCCTTATACAAGTCTGAGCAAGAGAAGTATGAAAAGATTAGGGCACCGAAACTGTAATGATTTCACGATTATCAGTAATGATGTTTCTAGTAAATCAAGCACCCATGGATCATTTAATATGATCAAAAAACTTAACTTTAGTGCTCCCAAATTATGATTGACCCCAAAAGCTAGTCTAAAGAGGGAAGTTAAGCATAAAGGATCAAAATGCCTTTTAAGTTTTTCGTTTACCAACATAGCGTTAAAGAGAACTTGAGATAGCTTACCAAGCTAACTTATTATCGTGAACATCATCATAAGAGTCGAGACTAATTTTTTATTCCCTTTAGTATACTATTAGTGATATTCTGGACTTAGATTAAGACGTAATAGTTTTATTGTCCTGATCGGTAGACTCATGATAAAGTAACATTAAGCTTGACCTAGATTTGTCATATAATATAAAAGTTTATTCCATTATAGTTTTAGAAATTTTTTTGGGCTTCTAAAGAGGGCCTTTGTTCCATAAACTATTAGTTAGTTGGCTAGCATACCTCCCCAAATTCAATATAACTTTATGGCTTTGTGGAGTTGTTGCCGAGTAACCTTTCATATATGATGTTAAAGATTCATAATACCATTTTGAACAATGATGAGGTCACACTTCTTAGATACATGGATTCTGATAATTCACTTACTAAGCAATGTAAGCTAGCCAATGAAGCAAGATGATCAGAAAAATTAGTTCACTCTAGAACTTCGATTAGGTGAACTATACATGACCACTAATGATGAGGTCACACTTCTTAGATACATGGATTCTAATAATTCACTTAATAAGCAACGTAAGCTAGCCAATGAAATAAGGTGATCAGAAAAATTAGTTCACTCTAGAACTTCGATTAGGTGAACTATACATGAACACTCATTGGATTTGTTAAGAGTAAAAGAATTATTTACCAGCCCCAAATGCATCACAATTGCCTTAAAAACTTCAAGATTGATTGGAAGGTTTAGAGTCCAAGTTTTGTAGGTGAGAGTTTGATACCACAAATTTCCACAAATTTTTTTCAATCCCACTCCCATGTAGACCAAAATCTTAATCCAACCCCTTAGACCAACTCAACCATTTCACCTTTGACTTCCAAATAGGTACAATTAGTTAGCCAGGCTAGCACATGAGATCCCTCCCAAAATAAAATGTAACTTTATGGTGTTATGTAGTGGTTACTAGCTAACTTTCATAGATGATGTTCAAAATTTGTGATACCATATTGAACAATGATGAGGTCACACTTCTTATATATATTGATAATTCAATTCCTAAGCAATGTAGTTAGCCTGCCAAGTAAGATAGCATAAAAGCTAGTTCACTCTAGAACTCATATAGGCAATTCACAGAATCGGATTGATTAGATGAACTATGCATGAACTCTCATTCGGTTTGTTACATGTAAAAGAACTACTTACGAACCCGAATTGAATTAGTGATTATGCATAAGAATTGCTTTGGGAAGTTTTAGAGCCCAAGTTTGATCAAAGGTGGGAAGTTTTAAGAATAGGATCAAAATATTAAACCTCATTGGATAAAAAGTAATATAATGTTAAAATGATAAGGGATTCCATTAAAATACTAAAAGGGATAAAAATATATGCATACCATGAAACATTTCATTGTAGTTTAGCAGACTAATAATGCTACAACAAATTTTGGAGCAATCTAATTAGGATGACAGTTGCTGTTGTAGCCATTCTGGCGGCAAATTTTATTCAGTATCAATATGCCATATTGATTATTGGCAGCCTAATTGGAGGCTATTTATGTGAATGACTAATGGCTTTTTTTTAACTCTAAATGCGAAGAAAGAAACAAAGGTGGCCAAAAAAGGAAGGTCACTCAACAAAGGCGAAAGAAAATACAGAATCTGAAAGGATAAAAAGCATAGGTTGTTCTTGTTGCTAAAAACAAGAGAGGAGAAAGAATCACTCTTAGCTGATGATGGCGGATGATTCTTAAAGTCGCTTAATTTTCAACAACAAATGTGATCCAACAAAAAGAAAAAAATTCATTTGTTTAATCGATAATTTACTTATTATTTACTACTTCTAATAGTGTATACTGATACTTATTCTTGTGAATGTTACATCATTTTACGATATATCTTCACAAGATAGTTTTTGGTGCCGTTGTCGAATAACCTAATTTAGTTACTTTATTTGTTGTCTTTATAGTGAGTTGTATCTACAAAATTTGGTGTATGAACCCACCAACGATTTTGAAATTTATTTTTGATCTCGAAATAGAGAAAACTTTCTTATGAAGTTTAACGGAAGAGCTAAATTTGTGCATTAATAAACATAAAAGGTAAGCAACTACTTTGGAGTTAAAGCTAGTGTTGTTTCAAATGCTTCAAATTATTGGGCAATATCATGGAGTATCGTCAGAAGATCCCCACCTACATCTAAAGTTATTTTTGGGAGTGAGCAACATGTTTTGATTCAAATGAGTGGATAAATATGTAATTAAAATGAGTTTACTCCCTTATTCTCCGAGGGTTGTTGCTAAATCATCTTTGAACACCTTAGTATGGGGAGAAATTGATTCTTGAAGTAGTCTAGCATAAATTTTTTTTATCAAGTACTTTCCACCAATTAGAAATGCATGGTTTAGAAATGAAAATGTTTGTTTTCCCGGGTGTGAAGTTAAAACATTATGTGAAGCTTGAGAGAAATTCAACAAGATTCTTAGAAAATATTCTCACCCTGGGGACTTTCTACAATGGATGAAAGATTGCTATTAAACATGGCTTACTTGATGTTGATGTTTTGACCTCCATAAATGCTCAATTAGCTCCGGTCACTAATATTCTACCGACTCTGACATTGGAACAAGGCTCAATGACTAAAGCACCAGTTTAGCTGCAACTATAATGACTCATCTAGCTGTTAAATCTTGTGTATATTGTGTAGAAAAACATACTTTTGATCAATGTTCATGTAATCCAGCTTCAGTGTTTTATGTGTGAATTCAAGCTAATCAAGGAAACAGAATAATAATTCCATCTCTAACACTTACAACTCATGGTAAAGAAACCATCCAAACTTCTCATGGAAGAGATAAAGCTCATACAATCAACAAATTCCACCTAAGAAAAATTACCCTCTAGATTTTGGACAAAAAAATCAAATGGCATACATCCCTCAACAAGCTAATACCCAAAGGAAAGAAACTAGCTCAGCACATACCACGGACATTACTTAAGAATCTAATGAAGAAATATACAATATCCAATCACTAAAAAGAGATGGCCAGAAATTATGTTTAGCATAGAATTGAGAAGTGGGAAGAAAATTTCAAATAGAAGAGTTGAAATTAAAGAAAACAACTTGTTACCCCAAAGATAGCTGATATACAATAGAGAAATGAGAAAAATACTAAACAAAAGGATCAAAATAAAAATGATGTAGAAATAGGAGTCACCTAAAATGCAAGTAACAAACAATAAACAAGAAGAGAGCAAAACCTACCTGCCAACACCTCCTTACCAAAAAAAGAATAAAAATAGAGAAAGAAGAAGACTCGAGATATTATAATGAAAAATTCATATAAACATATCACTCAGGAACCTGGAAGCAAATTACAAATTAGGTAAATTTATTTAAGGATATGCTCACTTATAGAAGAAAGTTTGAAGAATTAAACGTAGTTCAATCAAATGAGAAGTATAGATTAATTATGTAATATAAGATTCCGCTAAAGGAAAAAGACTTAAGCTCGTTCACAATTTCAATATCAATTGGATTAAAAGAGCTAGGTAGAGCAATATGTGACTTGGGGGCAACCATCAACTTAATGTCCCTATCCATTTTTATGGAGTTAGAGATTGGTGAGGCTAGACCAAGTATAGTCACCATCCAACTAGCTGATAGATCAATAACTTATCCAAAAGAAAAAAATTGAAGACATTTTAATTCAAGTGGATAAATTTATATTTCTAGAATATTTTATCATTTTGGATTATGAAGCATACCGTGATGTGCGATTTAAATTGGGGATACCATTTTTAAAGATTGGGTAAACACTAGTAGATGTCCACAAGGAACCTTACTTTGAGAATTGGTGACTAGTAAGTGGAGTTTGATATTAATTGCAACTTGAAATATCCAATAGAGGTACACGAATGAGATATATGCAAGAAGAAGACAATAGATGGAGTAGTTTCATGGAACGTCTAGCAATTTTAGATGAACTCAGTAGAGATTTTGAATCCCTATAATTGAAGGGAAGAAAAGTTCACTAATGAAGTCATCTATTGAAGAAGCATGGTAGCTAGACTTGAAACTACTACCCCTAATCTAAATATTCACATCTAGGTGATGAGGACATATTACCAATCATGATCTCAGCATAAATGTCATTAGTTCAAGAGATCATTCTTCTAGAAATATTAACGAAGCACAAGAGGGCAATAGGGTCGACTTTGGCGAACATAAACAAGATTCATCTTTCACTATGCATGCACAACGTTATATTAGAGGAAGGACAATTAAATTCATTGATCAACAAAGAAGATTAAATCCAATGATGAAGGAGGTTGTTAGAAAATATATTATTAAGTGACTAGATGCTGGAATAATCTATTTAACTGCAAACAAAAGTAGGGTTAGTTCTATTCAATGTGTTTCAAAGAAAAAATGAATGACAGTATTAACAAATGAGAACAATGTCCTGATCCCACTAGAATAATGAATGGATGGAGAATGT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ATGTGTTATCTCCCTAATTCTCCTCACCTTGATCAAACTTGGACTCTAAACCTCCCAAGCAATCCTAAAGTTCCTAAAGCGATTCTCATCATAATCACTAATCCATCTAGGAGATGGCAAACCGCCATTGGAGATCAAATCCAAGGCAAGAAATTTCGAAGCAATACTTCTCTCGGTGCTGGAAAAGGAGTTTGGGTGGTGGATCCACTCATTCCGGCAAGAAAATCCGAGAACGGACAAGAAGAACGGATGAAGTTGAATGAACCTAAACTCATCTTCTTCTTCTTGTTTTTCATTATCTTCATATTGTCCTCGGACAACACTAGGCGCTGCTCATCTGCTGAATCCGGCCATGCTCATATCCAGCCCATCGCTAATCATGAAGATCAGGAGTTGACCTTACCAAGAAGAGGATTGGGTGGGCCGGGATCATCGCCGCCAAACGGCGCCTCAAAGTGTGGGAGTTGCATGCCCTGCACTACGGTTCTTGTGTCGGTGCCGCCCGGGCCTCCAGGCGTTGGAGATGATTTACCCGAAGTCTGGAGATGCAAATGTGGAAACAAGCTCTACATGCCCTGA 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BLAST of CmaCh13G002910 vs. Swiss-Prot
Match: EPFL6_ARATH (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6 OS=Arabidopsis thaliana GN=EPFL6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 5.9e-15 Identity = 37/57 (64.91%), Postives = 39/57 (68.42%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. Swiss-Prot
Match: EPFL4_ARATH (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 4 OS=Arabidopsis thaliana GN=EPFL4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 1.6e-12 Identity = 32/53 (60.38%), Postives = 35/53 (66.04%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. Swiss-Prot
Match: EPFL5_ARATH (EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana GN=EPFL5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 3.0e-11 Identity = 39/101 (38.61%), Postives = 51/101 (50.50%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. Swiss-Prot
Match: PGLR2_JUNAS (Polygalacturonase OS=Juniperus ashei GN=JNA2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 6.5e-06 Identity = 27/82 (32.93%), Postives = 36/82 (43.90%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LXR9_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G533610 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 128.3 bits (321), Expect = 1.0e-26 Identity = 68/118 (57.63%), Postives = 74/118 (62.71%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TrEMBL
Match: A0A061GXY6_THECC (Allergen-related OS=Theobroma cacao GN=TCM_042272 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.4 bits (241), Expect = 2.0e-17 Identity = 56/119 (47.06%), Postives = 66/119 (55.46%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TrEMBL
Match: A0A067E402_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g032761mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 3.3e-17 Identity = 56/129 (43.41%), Postives = 61/129 (47.29%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TrEMBL
Match: A0A0B0MS25_GOSAR (Epidermal patterning factor-like protein 6 OS=Gossypium arboreum GN=F383_21220 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 95.9 bits (237), Expect = 5.7e-17 Identity = 46/95 (48.42%), Postives = 55/95 (57.89%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2MH03_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_003G152400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 1.3e-16 Identity = 46/95 (48.42%), Postives = 56/95 (58.95%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TAIR10
Match: AT2G30370.1 (AT2G30370.1 allergen-related) HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 3.3e-16 Identity = 37/57 (64.91%), Postives = 39/57 (68.42%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TAIR10
Match: AT4G14723.1 (AT4G14723.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: allergen-related (TAIR:AT3G22820.1)) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 9.0e-14 Identity = 32/53 (60.38%), Postives = 35/53 (66.04%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. TAIR10
Match: AT3G22820.1 (AT3G22820.1 allergen-related) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 1.7e-12 Identity = 39/101 (38.61%), Postives = 51/101 (50.50%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. NCBI nr
Match: gi|778661835|ref|XP_011658830.1| (PREDICTED: EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 128.3 bits (321), Expect = 1.5e-26 Identity = 68/118 (57.63%), Postives = 74/118 (62.71%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. NCBI nr
Match: gi|659114962|ref|XP_008457315.1| (PREDICTED: EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 5.6e-26 Identity = 66/115 (57.39%), Postives = 72/115 (62.61%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. NCBI nr
Match: gi|590591594|ref|XP_007017061.1| (Allergen-related [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 97.4 bits (241), Expect = 2.8e-17 Identity = 56/119 (47.06%), Postives = 66/119 (55.46%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. NCBI nr
Match: gi|694310757|ref|XP_009354667.1| (PREDICTED: EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 6 [Pyrus x bretschneideri]) HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 3.7e-17 Identity = 51/113 (45.13%), Postives = 59/113 (52.21%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh13G002910 vs. NCBI nr
Match: gi|641830697|gb|KDO49778.1| (hypothetical protein CISIN_1g032761mg [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 4.8e-17 Identity = 56/129 (43.41%), Postives = 61/129 (47.29%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima
Date Performed: 2017-05-20
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |