CmaCh09G011890 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAAGGCTGGTATAACCAACCTCTTGTCGTTGCAGCAAAAGAGCAAATTTCCCAGTGAGGAGCGATTGAAGCAAACACAATGGAGTGTTGGAATTCTTATCTCTTCCCTCTTGATTCAAAAGGAAAATGTTTCTTCCAATCTTCATCATGAACACATTCAACTCCGCGATTATGAACTTCGATTCGTTTTCCAGCCTTGTTTTCGCCGAATGACAAATGCAGATTGAGATATGGCTTTATCATCCTATTGCTTTCTTTGCTTGTTTCATTTCAACAAATCGAACAATTGGTTTCGCCAGGAGACCAACATTTCCAAGGGATTTTCTGGCGGAAAGCGGGGCGGAAATGGAGATTTCATTGGTTCGCATTCGAGGCAAGCGGCTGATTCTCTTATCACTCGTCACATTTCTTGGAATTGGAGACTGAATGCTATCGGCCTTGACTCGACCACAAACTCCCAAGCTCGTATCTCCACCATTCACGACAAAGCCCACAATGCCGCCGCCGTTGCCACGATTGAAATCCATGTCACTTGTTACCAGGTGATTCTCTAGCCATCTCTCCTGTTCTCTTTTTGGTTTAATGATTTCTCTGCTCAGTTTACTATGATGATTTGCTAAGGTTTGTGAGCTTTTCTGTGGTCTATTTCTGTTTTGTACTGATGGTGTTGTTTTGTCTGAATCCGGTGGAAGCACAACTCTGATCCAAATTTCATGCTGGTTTCTTTTATTCTTGTTACATTTTTTTTTCTGTTTGGTTTCTTTTCGGTAATGGATACATCCTTTGATTTTTTTGTAGCTTGGCTGTAACTTAAGTTTGTAGAGATTGTTGGATGAACAAAATTCTGTTCATGCCACTAATTTAACCTTTAATTTAAAGAAACATTAAATGGCAAGGTCCTTTCCATGAAACATAAAGTGACAGTAATTTGTAGATTTCTTTTAAATACTCATGATGCCATCCAAAGAAGGCTCCCTCATTATGCCCACTCCCCAAGTTAGGGCATTATGCTTAAAAAGAATGCTGAAACTCGGGCATTTATTCACCAAGTGTGAATTTCCTAACAAATTCTGGAATTTTCTGAACTCCTTTGGCTTGCAGATTCCGTAGTATTGTGACATTAGTAGGCTTCTTCGTTCCTTAATTGTGGGACACCAGGATATTCAAAAGAACAAGTAGATCGGTTCGATGTAGTTAATTAGGATTTTTCTTTGGAGGTTTTGATGAAAATGAACAACAGGATATTCAAAACGGTTACGAGTCTTGGGAGTTTGAAGTCTCTGGTCCGGATGGTATGGACAAATAATTTTTTTAGTAAGTCTTAGAACATTGTGAAAGTTGATTTGCTAAGGGTGTTTCATGATTTTTTTTTTTTTTTAAAACAACATGTTATCAGAGAACAACTATAATTGTGCTTGATTCTAAAGAAGCTGAGAGCTAACTGGGTCAGAGAGTTTTGTCAACTATTGAAAAAATGCAAGCTGCGTTCGTGGAGGGGAAACAGATTTTTGATGCAATCTTAGTAGTCTCAGAGGTGTTAGGGGATTATTTGGGATCCCTCTTGGGGGACAACACAAATCCTCTTCTTTTTGGGATCCTTTGGTGGACAAGTTCAGAAACAAAATCACTAAGTGGAAGAATTCTTTACTTTCTGAAGGATAAAGGCTGATCTTGGTTAGTTCATTTCTAAATGGGCCTATATTATTTTTCCCTCCTTAAATCGCTGGCTGAAGTTATTAATAGTGTGGAGAAAATTAGGTGATTATATGCTGGTAGTCATCTTTTGAATTGGAAAATGACATCCCGCCCTTTACATCTTGGTGGTTTGGTGTTGGGTTCATTTAAACATTGAAATGTTGCCTTCCTTACCAAAGGGTTGGGTGTTTTTTTCTGTTGAATAAAACGCCCTCTGGAAACAGGAGGTGAGTAACTATGGCAAGGTGCCCCTTAGGTGGAGCTCCTCCCAGCCTAAAGGTTGCTCTAGAAATAGACGTGGTTTGACATTGCTTGTTTGACCTCCATCATTTTTAAGTTTGCTATTTTTAAAGTTGGGAAATGGCAGAGAATTAGATTTTGGAAAGATACTTGTTTTGGTGAAATCCCACTCCCAGAAGCTTTTCCTGAAATTTATAACATCTCCCTAAAAACAGATGCAACTATGACTGATTGTTGGGATAATGTGCATCGAAACTGGAAATTGAGCATCAGAAGGAGAGCTTTTGGCAGAGATCTCCTTGCATTCGTTAGTCTCTTTGAGATGCTGGAGTCCTTTGGAGGAAAATGCTCATTTTGATTGAGCCATTGTTTTTCCTTCTTTGTAGGTGGACAACTGAGGACCTTGATCATATCTTTTGGAGATGTGATTTATTCACGCTGATTGTTGCTGTTTCTTCTAGGAGTTCTACTTATGCATAGCTAGACATAGTGGTTGCAGAGAGGACAAAATCTTTAGAGTGCTTGATAGGTGTTTGAGTGATGTTTGGGTCCTTGTTAAGCTTGACGTCACCCTTTAAATCTTGTTTTGCTTTAGTAATCACCCTCATCATGGTTTTTTTTTGAAATATGTGGAAAGAAAGAAATCAAAGAATATACGCAGAAAAGACACGGGTTTATACAAAACTTTTCGACAATGTTGTTTACCAAGTTATATCTTGGTGTAAACTATCTAATATTTTTACTTCCTATGATTATACCTCCCTCATTGTAAATTGGGAAGGTCTTTTGTAAACATAATGGATATTACATCCCTTTTGTAAATGTAAATCAATTGTCTCTTATAAAAAAAAAAAAATTGTTTTACTTAATTGAAGCCCTTTTCTTTAGCTTCCTCCTTCCTTTGTGGCCTTTGGTTTTTTATGCCCTTGTATTCTTTCATTTGAAATGGAAGTTAAAAAGGAAAGAAAGTGTAAGAGATTTCAAGACTTTAAACCTAACATATTTTTTATTCCAGCAGCTACAAGTTTCATTAGCCTTAGCCTTAGCCTGACCTTGTAAGCCTTTTATGCCCGTGTCCAAATAATTAGAAAATATTGATTCTGGCAACAAAGTCAAATGTTAAAGAGCACTCAAAGCCTTGAAACATACTTGTAGCTTCTTGGTTCTTTTCTTGTTTTTACTGAGTAGCAATCCTGTCTTAACAACACTTGGGTTTAATCTTTTATTTTACGGAAACTTATGGTTTTTACAAGGTTGGTTGTTCAGTCTATTTAAATGGCTGGTTTGCAAGCTTTGAGACATCTTTTTCATTGTTAACAAAAGTCACCCATTTTGATTAATACATCTTTGGAAATCCATTATTAGGGAGGGTTAAACTCAACCTACCAATAGCACTTATGAGATCCTTGTATGTTGCCTTATCGGTAACAAGCCTAAACAATGGGACTTCTTTGTCTCAGGCTGAATTACAACCATATGCAGAATTGGTCCACAGGGAAGTCCCTACACTGTCACAAGTAGCAAGTGATAAGTAAATTATCGATTCTACAGAGAACTTATCTTTTTGGTTAATTTTATCGCTGGAAATTAAGTGAGTTTTTTAGGTAACATTCAAATGAGCGTTGGTGATTTTGACTAATTAAACAAAACTAAAGCAAAGTGCCACTGCTGTCGAAAAAACAAAAAATGATGAGACAATCAACTATAATGAGGAAGGTTTGGCTCAGAGAGATTAAATAGATAAGTTGTTGAGTTTTGTGGTAGATTTTAATTCCTTTTAATAGATTTCCAAGCCCACTTCCGAGGGTCATGCATGGTGATTATTTCCATAATCGTTTTTAATTTCTATTAACAAGGCTCTAGGAGAAGAATTATTCATAACTCTTCTATTACCTTCAAGTCTCCTTGCAATGGAACTAGATTATTAAAGATGGTTTCATTGCTCCCTCTCTTCTCTCGAATAAGAGAACAATTATGTATGTAAAACAGCTAATTAAACACACATGTAAATCATCAACCGCAACTCTTTAATAAACTAAAATCATACCGTCAACATACTTAAACTATATAAAACTCTCTCGCCTCTCTTATAAAGTTTAGCTCTCCATGCAAACTGAATTAAACAGAGGAACCCAAATCTCAATCATATAAAATTGATAGAATAAGAAAATATAGTAAGGAAATAGAAAGTTAACCAATTTTGTTGTTATTCTTCAATGAAAGTTCCCTTCCCTTGAGGTCTCACATCCACCTCCTTGCCCTAATCAATCATTTTTGGTCTTCTTTTCCTTCTGCTATCAACAACGGTTGGATTAGGGTTTTCTTCTTCTTCTCTGATTTCACAGCAGTTCACTGCAGCAGAGGCTGCTGCTGTCTAATTCGAAAATTAGCTCCCAAGGTGTGGCTCCTCCTTTTTTAGGTATCCTTTTCCTTTTATAATGTTTGTTTTTTCTCATTTAGGGCTGAGAAAAGATAAAAATCATCCACCTAAGATGTTTCTAATTTGGTAGTTAATGACCCACGTGGATTGCTGATGTGGATTAAAATTTTCATGTCATCTTCGAAAAGTCTACGTTTCGAATTATTACAGTATCATGGTTCAACATAAATGTTCTGGAATTTTACCAAATAACTCAATTAAGTATACAATTAAGCTCGATTTATGCAAATTGATGTTCTTTTCATATTAAACCATAATTGACTATTTCATGTATACTAATTAGAATAAATGGAGCAATTAATGAGAAAATGGTGAGTATGAGTGCAAAATTAACTATAGAAGACTTGATATAACTCTACTTTTGGAGAGTTATCACTGCCTGTATTCAAGAGCTGCGAACAGAGGTCAAGGATCATGTGGAAAACGCAACCGCTTACTATAAATCTTTGGTAAATGCTCACCGCCCGCTTGAGGACTTTCAAGTGGGCGATTTGGTGATGATCCACCTTTGTAAGTCTCGTCTATTGGCTGCCCATCACAATATGGGCCTATTCCTAATGTTGAGCGGCTGGGTAGCAATGCATATCAGATTGATCCTTCCTCCTTTGCGCATCAAC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BLAST of CmaCh09G011890 vs. Swiss-Prot
Match: CDP1_ARATH (Plastid division protein CDP1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=CDP1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 697.6 bits (1799), Expect = 2.1e-199 Identity = 420/833 (50.42%), Postives = 541/833 (64.95%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. Swiss-Prot
Match: ARC6_ARATH (Protein ACCUMULATION AND REPLICATION OF CHLOROPLASTS 6, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=ARC6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 1.4e-17 Identity = 109/434 (25.12%), Postives = 196/434 (45.16%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K7W1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G014700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1264.6 bits (3271), Expect = 0.0e+00 Identity = 662/806 (82.13%), Postives = 714/806 (88.59%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. TrEMBL
Match: M5WCV7_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa001548mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 786.9 bits (2031), Expect = 2.9e-224 Identity = 437/742 (58.89%), Postives = 545/742 (73.45%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. TrEMBL
Match: F6HVR3_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_17s0053g00090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 766.1 bits (1977), Expect = 5.3e-218 Identity = 418/742 (56.33%), Postives = 528/742 (71.16%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. TrEMBL
Match: U5FQ53_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0015s05630g PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 744.6 bits (1921), Expect = 1.7e-211 Identity = 414/724 (57.18%), Postives = 520/724 (71.82%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. TrEMBL
Match: A0A061EZJ2_THECC (ARC6-like protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_025224 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 743.4 bits (1918), Expect = 3.7e-211 Identity = 408/767 (53.19%), Postives = 538/767 (70.14%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. TAIR10
Match: AT3G19180.1 (AT3G19180.1 paralog of ARC6) HSP 1 Score: 697.6 bits (1799), Expect = 1.2e-200 Identity = 420/833 (50.42%), Postives = 541/833 (64.95%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. TAIR10
Match: AT4G10330.1 (AT4G10330.1 glycine-rich protein) HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 3.4e-30 Identity = 62/94 (65.96%), Postives = 74/94 (78.72%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. TAIR10
Match: AT5G42480.1 (AT5G42480.1 Chaperone DnaJ-domain superfamily protein) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 7.8e-19 Identity = 109/434 (25.12%), Postives = 196/434 (45.16%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. TAIR10
Match: AT1G66820.1 (AT1G66820.1 glycine-rich protein) HSP 1 Score: 50.4 bits (119), Expect = 7.5e-06 Identity = 30/57 (52.63%), Postives = 35/57 (61.40%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. NCBI nr
Match: gi|700190646|gb|KGN45850.1| (hypothetical protein Csa_6G014700 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1264.6 bits (3271), Expect = 0.0e+00 Identity = 662/806 (82.13%), Postives = 714/806 (88.59%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. NCBI nr
Match: gi|449441558|ref|XP_004138549.1| (PREDICTED: plastid division protein CDP1, chloroplastic [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1263.4 bits (3268), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/820 (81.10%), Postives = 719/820 (87.68%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. NCBI nr
Match: gi|659126272|ref|XP_008463100.1| (PREDICTED: plastid division protein CDP1, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1241.5 bits (3211), Expect = 0.0e+00 Identity = 662/820 (80.73%), Postives = 714/820 (87.07%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. NCBI nr
Match: gi|645270181|ref|XP_008240341.1| (PREDICTED: plastid division protein CDP1, chloroplastic [Prunus mume]) HSP 1 Score: 791.2 bits (2042), Expect = 2.2e-225 Identity = 435/748 (58.16%), Postives = 543/748 (72.59%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh09G011890 vs. NCBI nr
Match: gi|595852709|ref|XP_007210360.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa001548mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 786.9 bits (2031), Expect = 4.2e-224 Identity = 437/742 (58.89%), Postives = 545/742 (73.45%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima
Date Performed: 2017-05-20
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene:
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