CmaCh08G000990 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ACGGGGAAGAAAACGCCATCCGTTGCATTCTTCCCTCTTCCCCTCCCACCCGTTTTACCATCTGAATCCGAGGGAATACGGGGACTCACATGGCGTTCTCTTCTTCTCCGGCGAGATGTCCAAATATCCATCTCTTTTCAATCCTGTTTATCCTTTTTCTCTTCGGTATATCGTATGTCTTCGCCGAGGATGTCCCCGCTCCCAAGTCCGGCAATTGCAATAATCCATTCGAAATGGTACTCCCACCCTCTCTTGTTTTGTTATTGTAATTGTACTGTTATTGTTAGAATAGGCTGGCTAAACTTCTATGGGGAAGGAGAAAGAACCAAACCCGTTGTTTGTCATTCATCTGGCATCTTCGGTTCTGATCGTTTTACCGTTGGCTGTATCTATTCCTATTGTTTGTTTGTTTATTTTGGGATGGATGATCGTGGTGTGAGACTTACGCATGATTTCTGAAAGGATTTAGCTAAGCATCTAGCGTTCTGCAATGTGATTGAAATTACGGTTTTGAGTTTCATCTGCGTTTATTTTCAGGACTACAAATAGATACGAAGTAATTGCTTTCGCCTGTTTTGTTGTTTAATTTTAATGACAACAGTAATTTTCTACGGTGATTCTTGTAAAAGTGGTTTGGATCAATAAGCTTTGGAATCTCCTTTCTCCTTGGAAGAGATTAGGAGGGTGGTTTCACTATTTCCTTCTACTAGGATGACTAGGATTGCATCAAGGATGATTTCTAGAAGGTCTTCGTGATTTTTTTATGAGAGAGGTTCACGATGACTCCTTGAATGAAATCTATGTTTGTCTTATTTCTAAGAAGGTAAGGATGAGGAAAGCCAAGGATTTCAAGTTCATTAGTCTGATTACGAGTGTATATAAAATAACTGCTAAGGTCTTGGTCGATTGATTGAGGAAGGTCATTCATAATGCGATTTTTTATTCTTAAGGAGCCGTTATTGACGTGAGTTGAACAAAGCTCTTATTACTAATTAAGCTATTGAAGATTATAGGAGCCATAATCAGGAGAGTGTTATCTCTAAGATCAATTTTGAAAAGACTTAGGATCACGTGTGTAGGGACTTCTTCAATAAAGTGCTTTGGAAGAAATGCTTTGGTTTTAAGAGGAGATCATTCTACCTATCCTTGTTAAGGGCAAGATGAGAGGTTGGATTCTAGCCTCGAGAATCCTAATAAAATGTGATCTTCTTTCCCCTTATCTTTTCTTGTTGGTTGTGGATATTTTGAGTAGAGTGTTTCCAGGGGGAGTGGAGAAAATTATTATTCAGGGGATTAAAGTGGGAAAGATAGCCTACATTGATCGGATCTTCAGTATCCTAATGACATATCTTTTTTGCTCAGACAAGGAAGAGTCTATTATTAATCTTATCTGAATTTTGTAATTTTCCAAATATACTTCTAGCTAGAAGAATAATAGAAGCAAGTGTTTGGTTCTGCACATTAATTCTGATTCTTATAAGCTGGCTAATTGGCTTCTTTTGTGGATTGCAAGATAGGTTATATCCCTTGTTCTTATTTTGAACTTCCTTGGTCAAAGTCCTATGAGTTTGTTGTTTAGGAACCTCATTTTGAAAAATGTTAAAAAAGCAACTTTTACTTGGGAGAAGAATTTCTTATTTAAGGTGGGTCGACTTACTTTTGTTCATCTTGTTTTGAGTGAATTTTGACTTCCTTCATCTTCTTGCTTAGGCTCCATGTTTCCATTAGCTGTTGGCAAGAATTTAGAGAGGATTATGAGGAGCTTTTTGTAGGTAAGAGTTGATAAGGGGAGGGTTCTCATTTAGCAAGTGGGAGGTGATGGAAGTATTTTCTTATTTTTTAAAAAATTATGCTAGAAGACAAGATTGACAAGTGATTATTGACTGCCACATTTTAGTGATATTTTTTATTTTATTTTTATATAACTTAAGCATTTGAACTTCTGAATGAGTATCATAATGAGACGTTTCGCTTTAAGCATGTAAAGAAACTAAATTTGTCTTTTTGTTGCACATTCTTCAGGTCAAAGTTAAGATCTGGGTTAATGATGCCGAAGGTGAAACCTTAGTTGGTTTAACTGCAAGATTTGGGGCTTTGCTGCCTTCTCAGGCTGAAGATGATCTCAAATTGCCAGCTGTTTTTATGAATCCTATAAATGGCTGTTCTAGTTCTTCAAAGGTGATGATAACTGTTCTTACTACATTGATTGTTAAAATTGACCTTTTGGTGTGTTACCCAAGAAGAGATTACATTTATTATTGAATGATGGAAAAGGGTATACCAGTATTATACTAGTGGACAGAAGCCAAACAACTTCTAACTAACAATTTAACAACTTAATAACTTAAGAACCAACAAACGAATCAGAACTGATTAACAGAAATAGCCCTCGGCTATACAAAAGGAAAGGGGATAGTAGCAGGGGAACTAAAGAACTACATCACCTTTAGGTTTAAGTGATTATGTTTGAGACGTTTTATTATGCTTCTGTATAATCATGATAATATTAATTAGCGCTGTTTTATAATTTTTCACGCGTCCATTGGAAGAAATTATCATTAATACTTGTAACTCTTTTTTCTTTTTTTGAAACAAACAAATTATTTTATCGAAAAATGAAAAGAGACTAATTCTCAATAGATTCAAACTTCACAGGGGAGAGAATACATAAAACAAGAATAAAATAAAAAAAGAAGATAAAACAAAAGAAAATAAGAAAGCATCCCAAGTAAGACGTAAATTTAAGAAGAAAAGTTCATCAAAGGTCTGGAGAGAGAACACCATGACGAGACTTGAAATCTTGCGGAATCAAACCAAACAAACCAAGGATGAACTGAGATAGAAACAACTAGCCAACTAGAAAACTGTCCATTATGAGCGGTAGCCTTCACTTTTTTCAAAGTTCAATATTTTTCTTATATAAAATTCTATGCATATTCCATAAGATGACCTTATTCAAGCATATTGCAAAATATGCTGGATGAATGGAGCTAGAAACAAGTGTAAGTTTCCAGTCTGGAAATACAGCCAAATCAGGTTCCACTACCTCAATATAATCGTAATCAAAAGGAACCTATTTAGAAACCGTGTACATTCATTTCACGCTGTTTCAAGATTTTAATTGCAATACAAACCTGGTACATTCGTTTCCCATTGTTTATGTGGAAGCTTGTTTGAAGCTAGAAGGGCGGATGTAAATCTCTCTCTATATCTCTCTAAAATATGACAAGGATGAGCAGCGATGAATGGTAGCTTGGGTTCGTGACTTTCTTGTGGAAGCTTCAAAGGTCAGTGACTCGTCAGGTTTTTAGAGAAGAAGAGGACTGGTTTCAATAGTTTATCTTCTTTCAAGTTCTGTCCAATTCGAAGTGGAGATATGGCCTCTCGTCCTTGGAGAAGTTTGAATGCAGAAGGCCTTTTTTTTTAATAAATCTTGAGGGTCTGAATAGCAAGGGCTGGAATGCATTGATAGGTGAGTTTAAAGCGGTCAAAGATGCTTAGGAAATGGAATGGGCCTTTGTGTTTGGGTGTTCAAAGCCGTTAGGAAAGGAGTAAAGGTATGGGTTGGACCATCCACTTCTTTTATGAAGGTTATAAATCCTTTAAATCTTCAACAGTTAGTTTGATGGTGAGAGAGAAGACTTAAAAGGAAGGGTTTTTGGTGGAGGAAGGGAGCTCACAAGGAATTCGGCCAGGGTCTTTGATGGGTTTTTTGATTGAAGGGGTTCACCGTTTGCCTTTCTGTTCTAGGGAGCACGGGTGCTCTTCTCCCAATATGTTCGAAAGCAAGTTTTGGAGAAGCAAGTACACAAACTCACAACCCCAATAAAAGAATGCATATGAATTCACCAAGAACAAATGCTCCTTTCTCCTTGGATTATTGAGGTAAATTTTGGTGGGATTTTTTACTGTACGAGTATCATTGTGCTTTGACTGATAGGGAACCGACAAATGTTGTATCTTTCTTTCGTGGATTGAGGAGCTCCTGTTAGGCTTGGGAAGAGGGATATTCATTGTTGGATCCCCATCCCGTCTAAGGGATTTTCATGTAGCTTATTTTTTTGTTGGTTGTTGAATCTCTCTCCCCCTAGTGAGTCTATCTTTTCTTATCTGTGAAAAGTGAAAATTCCATAGAGATTAAATTCTTCACTTGACAGGTTAAAATTTTCACTTTATAGACCTATGAGAAAGATGCCTTCATTGGTTAACTCGTTTTGTTGCATTCTCTATTGGAAGATAGAGGAAGATCTGGATCATTTGTTGTGGAGTTGCAATTTTCCGCGGTCCGTCTGGAATTATTTCTTTGGATAGTTTGGTTTTAGTGAGCTAGAGAAAGATATCACGAGAGATGATTGAGGAGTTCTTCCTACATCTGCCTTTTCGCGAGAAGGGTAGGCTTTTGTGGCGAGTTGGTTTGTATGCTTTGTCATGGGGCCTTTGTGGTGAGTGAAACATTGGAACTTTTAGGGGAGTTGAGAAGGACCCTTTTGAAGCGTGGTCCCCAACAAAGTTTAATGTTCTTTCTGGGCATTAGTGACGATTTTTTTCTTTTTTGTAATTACTCTTTAGGTCTTGTTTTACTCGGGGCTCCCCTTTTGTGGGCTTAGTTCTTTTGTATGCCTGTGTATTCTTTCATTTCTTTCTCAATGAAAGTTGGTTCTTTTATGAAAAAAGAACTGGTCCATGACATTATCTAGTCTAGAACTACTCTGGTGTGGTCATGGAATATATATTATTTTATTTCATTTTTAAATTCTAAACTGAACCTGTTATTGTGGTTTCACTAGTTCATAGTATGTTGGGTTAGCTGATTCATTTGATTTGGCTGTTTAGCCCTTTCAATTTTTTGAATTAACATTTTAGACATGAAGATATTGTTTATTTGTTTTACTTTACTTACCTGAATTGATGTCAAATCACTCGTGTCTTCCCAAGTCATTAACAGTTACGATTTACTTTACTTTTGTATTTTCTTTTCCCTCTCTCTCTCTCTG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ATGGCGTTCTCTTCTTCTCCGGCGAGATGTCCAAATATCCATCTCTTTTCAATCCTGTTTATCCTTTTTCTCTTCGGTATATCGTATGTCTTCGCCGAGGATGTCCCCGCTCCCAAGTCCGGCAATTGCAATAATCCATTCGAAATGGTCAAAGTTAAGATCTGGGTTAATGATGCCGAAGGTGAAACCTTAGTTGGTTTAACTGCAAGATTTGGGGCTTTGCTGCCTTCTCAGGCTGAAGATGATCTCAAATTGCCAGCTGTTTTTATGAATCCTATAAATGGCTGTTCTAGTTCTTCAAAGCTATCTAGATCAGCTGCCTTGGCTTTACGTGGTGAATGTGACTTCACAATTAAGGCCGAAATTGCACAGGCAGGGGGTGCTTCAGCTCTGTTGGTAATAAATGACAACGAAGATCTTTACAAGATGGTCTGTTCTGAAAAAGACACTGCCCTTAACATTTCTATTCCTGTTGTGATGCTTCCCAAGAGCAGCGGAGAAACTATTACAAAATCTATAACCGACGGCAAGAGAGTGGAACTTCTATTATATGCTCCAAAGCGACCAGTTGTGGACTTCTCTGTTGTGTTTTTGTGGATGATGTCTGTTGGAACAGTTGCATGTGCTACACTTTGGTCAGACATCACTGCTCAGCAGACCGAGGAGAGCTATAATGAATTATCACCAAAGGGACCTTCCAATATCGAAGCAGCCAAAGATGACTTTGATAATGAAACTCTGGATATTAATGTGCAGAGTGCAGTAGTATTTGTCATTTCGGCATCTAGTTTCTTGGTGCTGCTATATTTCTTTATGTCCTCGTGGTTCGTTTGGCTGTTGATTATAATGTTCTGCATTGGTGGTGTTGAGGGTATGCATTCCTGTATATTAGGACTTATATTGAGTAGATGCAAAAATTGTGGGAAGAAGACTCTGAATTTGCCTTTAATAGGGGAAATCTCTGTTATTTCATTTGTTGTGCTGCTTTGTTGTATAACATTTGCTGCTGTCTGGACTCTGAATCGACGTTCATCATACTCTTGGGCTGGCCAAAATATTCTTGGTATCTGCCTGATGATAACAGTCTTGCAGATGTCCCGATTACCTAATATTAAGGTAGCAACGGTACTTCTTTGCTGTGCATTTGTCTATGACATCTTCTGGGTGTTCATATCCCCAGTAATATTCCAAGAAAGTGTAATGATTGCGGTTGCCCGCGGGAACAATAGTGGTGGGGAAGCCATTCCAATGCTCTTGAGAGTTCCTCGCACCTTTGACCCTTGGGGCGGCTTCGATATGATTGGATTTGGAGATATACTCTTCCCTGGTTTGCTTGTTTCGTTTACACACAGATTTGACAAAGCAGAGAAGAAAGAGAAGTGTAATAGATATTTTCCTTGGTTGCTCGTTGGATATGGAACTGGTCTCTTCTTTACGTATTTGGGCTTATATTTAATGAATGGACATGGCCAACCTGCACTCCTTTATCTAGTTCCATGCACTCTGGGTGTTACTGTTGTTTTGGGTTTGATCAGAGGTGAGATTGGTCTACTTTGGAATTATGGAACAGAAGCTGCTGGAGAACCTTAA MAFSSSPARCPNIHLFSILFILFLFGISYVFAEDVPAPKSGNCNNPFEMVKVKIWVNDAEGETLVGLTARFGALLPSQAEDDLKLPAVFMNPINGCSSSSKLSRSAALALRGECDFTIKAEIAQAGGASALLVINDNEDLYKMVCSEKDTALNISIPVVMLPKSSGETITKSITDGKRVELLLYAPKRPVVDFSVVFLWMMSVGTVACATLWSDITAQQTEESYNELSPKGPSNIEAAKDDFDNETLDINVQSAVVFVISASSFLVLLYFFMSSWFVWLLIIMFCIGGVEGMHSCILGLILSRCKNCGKKTLNLPLIGEISVISFVVLLCCITFAAVWTLNRRSSYSWAGQNILGICLMITVLQMSRLPNIKVATVLLCCAFVYDIFWVFISPVIFQESVMIAVARGNNSGGEAIPMLLRVPRTFDPWGGFDMIGFGDILFPGLLVSFTHRFDKAEKKEKCNRYFPWLLVGYGTGLFFTYLGLYLMNGHGQPALLYLVPCTLGVTVVLGLIRGEIGLLWNYGTEAAGEP
BLAST of CmaCh08G000990 vs. Swiss-Prot
Match: SIPL5_ARATH (Signal peptide peptidase-like 5 OS=Arabidopsis thaliana GN=SPPL5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 641.7 bits (1654), Expect = 6.9e-183 Identity = 311/507 (61.34%), Postives = 401/507 (79.09%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. Swiss-Prot
Match: SIPL3_ARATH (Signal peptide peptidase-like 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=SPPL3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 613.6 bits (1581), Expect = 2.0e-174 Identity = 309/521 (59.31%), Postives = 395/521 (75.82%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. Swiss-Prot
Match: SIPL2_ORYSJ (Signal peptide peptidase-like 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=SPPL2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 598.2 bits (1541), Expect = 8.7e-170 Identity = 291/493 (59.03%), Postives = 383/493 (77.69%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. Swiss-Prot
Match: SIPL3_ORYSJ (Signal peptide peptidase-like 3 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=SPPL3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 473.0 bits (1216), Expect = 4.2e-132 Identity = 238/489 (48.67%), Postives = 343/489 (70.14%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. Swiss-Prot
Match: SIPL4_ORYSJ (Signal peptide peptidase-like 4 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=SPPL4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 460.7 bits (1184), Expect = 2.2e-128 Identity = 232/491 (47.25%), Postives = 330/491 (67.21%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. TrEMBL
Match: A0A067E628_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g009527mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 718.8 bits (1854), Expect = 4.9e-204 Identity = 347/513 (67.64%), Postives = 421/513 (82.07%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. TrEMBL
Match: V4U2L2_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10019670mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 715.3 bits (1845), Expect = 5.5e-203 Identity = 345/513 (67.25%), Postives = 420/513 (81.87%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. TrEMBL
Match: A0A061ERF8_THECC (Signal peptide peptidase family protein, expressed isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_020054 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 713.4 bits (1840), Expect = 2.1e-202 Identity = 351/514 (68.29%), Postives = 423/514 (82.30%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2RE09_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_005G128500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 704.9 bits (1818), Expect = 7.4e-200 Identity = 341/489 (69.73%), Postives = 411/489 (84.05%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2PS56_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_005G128500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 703.4 bits (1814), Expect = 2.1e-199 Identity = 343/490 (70.00%), Postives = 412/490 (84.08%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. TAIR10
Match: AT1G05820.1 (AT1G05820.1 SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 5) HSP 1 Score: 641.7 bits (1654), Expect = 3.9e-184 Identity = 311/507 (61.34%), Postives = 401/507 (79.09%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. TAIR10
Match: AT2G43070.1 (AT2G43070.1 SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 3) HSP 1 Score: 613.6 bits (1581), Expect = 1.1e-175 Identity = 309/521 (59.31%), Postives = 395/521 (75.82%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. TAIR10
Match: AT1G63690.2 (AT1G63690.2 SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 2) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 4.0e-128 Identity = 229/491 (46.64%), Postives = 322/491 (65.58%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. TAIR10
Match: AT1G01650.1 (AT1G01650.1 SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 4) HSP 1 Score: 444.9 bits (1143), Expect = 7.0e-125 Identity = 232/519 (44.70%), Postives = 332/519 (63.97%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. TAIR10
Match: AT4G33410.1 (AT4G33410.1 SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 1) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 2.1e-20 Identity = 97/328 (29.57%), Postives = 141/328 (42.99%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. NCBI nr
Match: gi|778709906|ref|XP_011656474.1| (PREDICTED: signal peptide peptidase-like 5 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 886.7 bits (2290), Expect = 2.0e-254 Identity = 446/530 (84.15%), Postives = 482/530 (90.94%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. NCBI nr
Match: gi|778709902|ref|XP_011656473.1| (PREDICTED: signal peptide peptidase-like 5 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 885.2 bits (2286), Expect = 5.7e-254 Identity = 448/531 (84.37%), Postives = 483/531 (90.96%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. NCBI nr
Match: gi|659128725|ref|XP_008464342.1| (PREDICTED: signal peptide peptidase-like 5 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 877.1 bits (2265), Expect = 1.6e-251 Identity = 439/530 (82.83%), Postives = 479/530 (90.38%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. NCBI nr
Match: gi|659128723|ref|XP_008464341.1| (PREDICTED: signal peptide peptidase-like 5 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 875.5 bits (2261), Expect = 4.5e-251 Identity = 441/531 (83.05%), Postives = 480/531 (90.40%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh08G000990 vs. NCBI nr
Match: gi|1009139314|ref|XP_015887060.1| (PREDICTED: signal peptide peptidase-like 5 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 719.2 bits (1855), Expect = 5.4e-204 Identity = 356/529 (67.30%), Postives = 440/529 (83.18%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima
Date Performed: 2017-05-20
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene: |