CmaCh06G013170 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)

NameCmaCh06G013170
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr06 : 8700441 .. 8704092 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTGGGTCCAGTATTGGTCCTTGCCATTTCGATACATCATTAAATGTCCTATGGGTTTCAACGTTTTATTTGTCTCTTCACTAACTAAAGCTTCGGTTCATGTTGTGGAAAATGCAAGCACACATGCTTTCAGTCTGACAAAGGTACGCTGTTCGATTTCTTTTGAGACTCTTCATATTTATCATGTCAGGAATTTGCAATAACTCCATGTTAATGGTTAATAGAACCTTGTAGGCTCCCAATAGTTGACTTGTTTTCGATTCATTTAATGTGGGAGCGCATCTAGTTCATCCTAATTTTGACACTTTACATAAGTATTTGATCATTGACCTATAAAATTGAGCTAAATCAGGTTTTTACAACCTTATTTTCGATAATGACATTAAAAAGAGGGGGAGTTCTGCTTTCTGCACTGACTATGCAAGTTGCTAGAATGTTTTGGACTGTTAATCCACTAGTAAACTTAAAAGAGTGTGAACCACAAATTTGAGCAGATTTTGTCGGCATGGCTACGTGGGGCGTTTTCACATGCTGTCATGTTAACATAGAACTGCATCAACTCAACTCTGACAGGGCATGTTCCTTCCAAGTCGAACATAGTAGTACGTACCTTACTTTTGCTTAGTTTACACTTGCTATTTATTCTAGACAACCTTTTAGCCTCCAGCTATAAATCTATACTCGATGATGTATGCCACTCAGACTCACAACTCATAATTTTATCTTTGTGAATCAGCATGTATATCACTCTTCTTATTCGAATTTCATGTCTATCATGATTCTTATACAAAATACACTCTTAAACTCGATAAAAAATCTTATATGACCGGGTGGTTAGTAGTAACAGTTAAGCATTTCCTTGTGAATGGAATCTTTCGTAATCTTTTAAGATACACATAGTTTAACTTTTGGATGCTGTTTTTCTACCTTGTAGGTTGTTAGATGTGTAACTGTCCAAGCTCACCACTAGTAGATATTGTCTGCTTTAACTTCTTATGTATCGTCGTCAGCATCACGATTTTAAAATGCATTTATTGAGGTGAGATTTCCACCCCCTTATAAAGAATGCTTCGTTTTCATTTTCAACTGATGTGGAATACTTTTTTTCATAGTCGACTAATAAGATATTAATGTGATTTTAAAGATTCTAACATATAATTAAACTGTTAATGAGATAATTGCTCGATTTTAAGTTAAGAAGTTGCTAAGTGTGTGGTTAAAGCAAGCTCTACCGTCATCTTCCTCCATGATTGGTACCAAACTTTCCATTTTGTTTTTTCTGTTCTCGCATTTATTCTCTGTAGTGAAAAATGAGAATGCTTTTTCTGTTTTTGTCGAAATGTTTATGATAGGTGTGTGACATCTCTTTGGATTCTGCTGCGAGGGAGGGACCAACCCTCGCCGGGCCCTTACCTTTCACATGCTGTCTTTGACTCCATCGTCATCTCCTCATATGCTACTTTTTTGTTTTTTTTAGCTTCAAACCTTTCATAATATTTGGTGTTTGGCTTATAGAGTAAATTTTTGTACTTTCAACTTTAGAGATGAAATTTATATTTAGTGTCCAAATTTGTTTCTCCTAAATTATAGAAAGCAATCTCACATGTCACATAGATTTTGACTTGTATTTAAATCTAATCATTTGCCTCTCGATTTTACAAATTATAGATTTAGCAGTTTGGTTAGTTACTCAAATTTTCGATAATTTCATTTCCTAATAGAATCATTGTTTCGAGACTTTTTACTTTCTTTTTTTAATCATCCGGGAGTTAGAATTAATTTTTGTTTATTCCTTTTTCTACTTCTTCCAAGTGCAGGATAACTCCAAGGTGTTGCAGGTTTTTTTTTCCTACCAATTGGGGCCTTCCCTTCACCACTCCCATGGGATGGTCTATAGGGTTCATAACTACTCTTCTTACTACAGGACGCTTACCTAGCCAACATGTAGATCCGGGTCTACCCAAACTTTTTTGGTTTACTCCAATTTTTGGATATCAAACGGACCTCCCCAGATGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCTCCTCTTTTGCAATCAGTTTCACTACAGCACCGATAGGAGTTTTGGGCCATTAATAAACAAACTTTAAATATTGATTAGCTACTTAATTATATCCTATAGCAGGTTTAAAAAATGTATTATATTTTCAATATATATATATATTTTTTTATCAGAATAAAAGTATATGCGGGATGACTTAGAATAAAAATTTGGATTCCGGAGAGATTGATCTAAATTTTAATTTTTCAATAGTAATTTTAAAACGTTAGTAAAAGTCAAAGTCAAAAGGTAAAATAAAATTGAATGTTTTGGGAAGTTTCTTATTTTTTTCAATATCAATTCATATTATGTCACGACATGTTTTTAATTAATCTTTTTTTAAAAGGACAAAAAAATAAAGATGAAGTCAAAGACTTAATTTTATTTAAAACAAATAGTGTGATGATCCGGTAATTATTTAAATTGAATTACCCCACCACCTAATAATTATATTTAAGTCCAACTGTATTTGTTAATATGCTGAATTGACTCTTTCTTATTTTTCTTTCAAATATTAAAACCATATACTTTTTCTATCCAATATTAATTAATTCATTCTCGACGTATATATGCATTTTAAAAAATACGATAAAAATGTAATCTTTTAAAATTAGCGCTAAATAAAAATTAAATATAAAATTTAGAGATGAAAAATATATTTTTATATTATTATTATTATTTTATAAATACATTTAAAAATAAAATAAAATAAAAAATTTTGATCCCTTCTTCTATCAATCAAGAAGGCTAACGTTGAATATATATAATAAAAAAAAGTATTACAGGCATATAAATCTATCTTACAAATTTTTTTCTAACGTTGAATATATATAATAAAAAAAAGTATTACAGGCATATAAATCTATCTTACAAATTTTTTTTAAAAAAAAGGGAAAATCATAATTTACACGCGTCAAATTATAATTCGATAAAGCTAGGGGAGTGTAGCGGAGAAAAATAGGCTCAAGGACAGCAGATTGGCAGTTAGATTAAAATAATAAATAAAAACATAAACAGTGCTTTTAAGAAGAAGAATGAATCATCCGAAGCTTTTTTGTCATCCATTTTCCTTCATTTTCTCGCTTCCTTTTCTTCACTCCGTCAAATTCCACCAAATAATCTCCTCTTCCTCCTCTCTAATCCCCGAAGAAACTTGATCCTTGTCCGAAACTCAGATCCGAAAATCCCTTCCCGGTATATATTCCGACGTTAAAATCTTTACCATTCTTGTTATTATCAATTTATTCATGTCCTCTCCGCCAAATTATCTACCACCATCTCCTTTTCATCTCCAATTCCCTTTTTCCAGATGTAATTGCATTTCTCTTACATGCGTTTTCATTCCGTTTTTGATGTTTCCCCATTTTTGTTCTTCAATTTCTATGTGTAGGGAAGGAATGTATTTTGTGAGCTTTTGTGCCTGATTTGTGGATTTAATGGAATTTTCGATCATTTCCATTGGATTCCAAGGTGTGGATCAGAGGTTGTATTTGATGATTTGAATCCCGAGATTAATCGAGGCGGTACCTGGATTGGGAACGGGATTGTCCGGCGGGGAAGCATTTTTGTGCCATTTTTCCTTATGATGGGCTAA

mRNA sequence

ATGTGGGTCCAGTATTGGTCCTTGCCATTTCGATACATCATTAAATGTCCTATGGGTTTCAACGTTTTATTTGTCTCTTCACTAACTAAAGCTTCGGTTCATGTTGTGGAAAATGCAAGCACACATGCTTTCAGTCTGACAAAGATTTTGTCGGCATGGCTACGTGGGGCGTTTTCACATGCTGTCATATCCGAAAATCCCTTCCCGGGAAGGAATGTATTTTGTGAGCTTTTGTGCCTGATTTGTGGATTTAATGGAATTTTCGATCATTTCCATTGGATTCCAAGGTGTGGATCAGAGGTTGTATTTGATGATTTGAATCCCGAGATTAATCGAGGCGGTACCTGGATTGGGAACGGGATTGTCCGGCGGGGAAGCATTTTTGTGCCATTTTTCCTTATGATGGGCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTGGGTCCAGTATTGGTCCTTGCCATTTCGATACATCATTAAATGTCCTATGGGTTTCAACGTTTTATTTGTCTCTTCACTAACTAAAGCTTCGGTTCATGTTGTGGAAAATGCAAGCACACATGCTTTCAGTCTGACAAAGATTTTGTCGGCATGGCTACGTGGGGCGTTTTCACATGCTGTCATATCCGAAAATCCCTTCCCGGGAAGGAATGTATTTTGTGAGCTTTTGTGCCTGATTTGTGGATTTAATGGAATTTTCGATCATTTCCATTGGATTCCAAGGTGTGGATCAGAGGTTGTATTTGATGATTTGAATCCCGAGATTAATCGAGGCGGTACCTGGATTGGGAACGGGATTGTCCGGCGGGGAAGCATTTTTGTGCCATTTTTCCTTATGATGGGCTAA

Protein sequence

MWVQYWSLPFRYIIKCPMGFNVLFVSSLTKASVHVVENASTHAFSLTKILSAWLRGAFSHAVISENPFPGRNVFCELLCLICGFNGIFDHFHWIPRCGSEVVFDDLNPEINRGGTWIGNGIVRRGSIFVPFFLMMG
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh06G013170.1CmaCh06G013170.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmaCh06G013170Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0964
CmaCh06G013170Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0965
CmaCh06G013170Watermelon (97103) v2cmawmbB856
CmaCh06G013170Watermelon (97103) v2cmawmbB865
CmaCh06G013170Watermelon (97103) v2cmawmbB868
CmaCh06G013170Wax gourdcmawgoB0997
CmaCh06G013170Wax gourdcmawgoB1006
CmaCh06G013170Wax gourdcmawgoB1024
CmaCh06G013170Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB284
CmaCh06G013170Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB369
CmaCh06G013170Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB460
CmaCh06G013170Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB502
CmaCh06G013170Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB554
CmaCh06G013170Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0727
CmaCh06G013170Cucumber (Gy14) v1cgycmaB1058
CmaCh06G013170Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB797
CmaCh06G013170Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB809
CmaCh06G013170Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB817
CmaCh06G013170Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB819
CmaCh06G013170Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB829
CmaCh06G013170Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB837
CmaCh06G013170Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB825
CmaCh06G013170Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB826
CmaCh06G013170Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB813
CmaCh06G013170Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB814
CmaCh06G013170Melon (DHL92) v3.5.1cmameB760
CmaCh06G013170Melon (DHL92) v3.5.1cmameB763
CmaCh06G013170Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB737
CmaCh06G013170Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB745
CmaCh06G013170Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB749
CmaCh06G013170Watermelon (97103) v1cmawmB796
CmaCh06G013170Watermelon (97103) v1cmawmB798
CmaCh06G013170Watermelon (97103) v1cmawmB811
CmaCh06G013170Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB837
CmaCh06G013170Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB810
CmaCh06G013170Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB824
CmaCh06G013170Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB843
CmaCh06G013170Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB853
CmaCh06G013170Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB741
CmaCh06G013170Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB764
CmaCh06G013170Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB769
CmaCh06G013170Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB262
CmaCh06G013170Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB427
CmaCh06G013170Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB860
CmaCh06G013170Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB863
CmaCh06G013170Silver-seed gourdcarcmaB0316
CmaCh06G013170Silver-seed gourdcarcmaB0329
CmaCh06G013170Silver-seed gourdcarcmaB1086
CmaCh06G013170Silver-seed gourdcarcmaB1325
CmaCh06G013170Silver-seed gourdcarcmaB1494