CmaCh04G015810 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)

NameCmaCh04G015810
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr04 : 8006523 .. 8010511 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTCTGTACTTACGAGGTATCAACGACCCCAAAAATGCTAATGAAACAAATCTTTAAGGTATGGATTATCATTTAGTTATATGTATTGAACTTGGTTATAGAGTTGCAGGCACATTTGCTTCCTATTCTATTTATCTATCAAAATTGCCTTTGAATGCAATGGTGAGCGTCGGGGAATTGGAGTTGGAAGAAGAAGAGTTGTAAGGAAAGGAAGATCTTGAGTAGGAATGGAGAATTGGGTGGCCGACCGGCTCTGATAAAATAGTCTCTTGTGTTTTTGTTTTTGTCCTTACTCATTTGAACCCATCTCTACTTCTATTCTCTGTTCCTGTCGTTTTGCCGTATTAAGGTTGCGTTTTGACTATAAACTCCAAACACAACATAATCTTTGTCTCTCTTTCTTCCCTTCCCCTTTCCTTACAGACAAACAGACTGTCGGTTTGTTCATGATGTCTTCTTTCCAATGGATTCTCTGAGGACCCTACGCCTACATTTCTTTCTCCTTTTTTCGCTTCCCTTTTATCATGCCTGCCTACCTCTCCAATCCTAACTTCATTTTGGGTTCTTTTACAACTGCTCGGTCTCTATTTCTGACGTTTTCAGTTTCATGTCCAATACTTTTATCGTTAAGTTGTATCATGTCAACACTTAAGTCACACTGTGAGATTCGAAACCTTTCTTTTAAGGGTGTAAAAACCTCTTCTTTATAGACTCGTTTTAAAATCGTAAGGCTGATGATAATATGTAATGAGTAAAAGTGGACAATATCTGCTAGTGGTAGACTTGTACTGTTACAAATGGTATTAGAGCCTGTCACAGACAGTTTGTTAGTGAGGATGGTAGGTCCTCAAGAGGGGTGAATTGTGAGATCCCATCTTAATTAGAAAAGTGAACAAAACATTATTTATAAAGGTGTGGAAACCCCTCCATAATGAACACGTTTTAAAATCGTGAAGCTGATAGTATACGTAACGAATAGACCATGCTTTTTTAAAACTCAAATGAAATTAAGCACAAGCCACATGACTCATAAGAATGCGTGGACATGCACATCATGGGTCAATTCTCACATTCATATATAGAGATACTGACACATGCATACGTGTCATTTTATATTACAAATTCACTTAAAACAAATAGTTTCCCTATAATACTATTTTATTACTAGGTTGGATAGTTAGAAACGATTTGCGTGAAACAATCCAAAATTGCTTTAAAAAATTATCAAACAAATATTTCCCAAAGAGTTTAATTAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGGTTAGAGCTAGCGAAGACCTAAATGTAATCGAATAATAACTTCGAGTTACAATGAGACAAATATGTCAATGGAAATGGTTATGAAATAAAAAAATTCCACGTGGATATTCAACCTATCATATTTGTAATATAAAGTTATTTTACTTTTTAAACATATTTTGTCCGTGTTTATTTGATAATCCAACAAACTTAGATTTTAAAACCATAATTAGTATTTTTTTTATTAGGGTAGGGTTGAATTTTTGGAAAACAAAAAAATTTGTTCAATGTACCGGTTGACATTTTATGGTAAGAAAAAATTAAGAATATTTAATGTTTGTAACCAATATTAGTGGTATATAAAAAAATTATGATAACATTGTTAGACGAACAACTCTCCACAATAATATGATATGTCAACTTTGAACATAAGTTCTCGACTTAGCTTTGGACTTGGGCTTCATACAAAAGAGATAGTATTCTTTTATTATTGAATTTATAATCAAGAAATATTATCTCAATTGATACGAGGCTAAAGTAAAGTCATGAGAAGGAGTTATGCTCAAAATTGACAATATCATACCATTGTAAAGAATTGGTTTGTCTACGGAATACCCAAATCAGAATGATAGGAAAGAAAAAACGGACGCACAAAAACATAGAGAAAAAGGGGGGGCCGCTTCAGATCAGGAAACCTGCGCAGAACAGAGGTTTCGGGTAAAATCCAAAGAGACGAGGGAAGGAAGCAGCAGCCGAAATCAAGCACATTAAGTCCAGCCTGGTAGAGTACTCTAATCGCACTCCCAAGGAAACAACTCCGTCCAGCTAGTTCCCCCTGTTCTCACTTTGGCCGGCAAAAAAGAAGAGCCGATTAACAAAAACAAATATAAATTCTCCGGCGGTTGCTTTTGGAGTGGTGGAATTGGAAACATGTCCGGGTTTGACTTTGGAGCAAGAGAAAAAAGCCCTCTAGGGTACAGTTTCTGACATGATTGTCAGCTCCAGAAAAGGTGTCTCTCAACAGTTGATTCTCGGTTAATTTTAGATGAGGATGGTCTAATCAAATCAAGCTCTCTCCAATTTTACCGGGAGTGACTGCAGGAGGGTATTCGGGATTGCTGCTCAATCGATTTAAAAAATGATATATCACAGCGGCTTCTTCGGGATTGGAAACCAGAATCAATCGTGTTAGGTAAAACAAATTTTTAGCCGCAATGAAATTTGAATGCTGTGTGTATGTGTGAGCGTGAGGTATCATTCTTTTTCGTTTTTCCGGGAAAATATTTCCATGTTTGGGGAGATGGAAAGTTCTTGAATCTGGGTTTTAGTTTAAAAAAGAATTTAAAAAGGGTTGGAGAATGCATGGAAGTGCTAAAAAACAACCCATTTTACTAGCCGTTCACTTCCCTTATTAATTGCAGAGAGAGAGAAAGAGACAGTGTTTTCATGGTTGACCTTCAATCAGTGAAACAGATAATAACAACTCGTTTCTCCCCCTCTCTATGTCCATGCCCCATTTATTCCTTCTCTCATCTGCCTGTCGTAATAATCTTTGATGTCTATTCAGGCGCCCCTCATCGTTTCTGGTTGCTTTGGGGGGTTCTTCTGTACAGTTGCTGTAACATATTGTGGAGTGCATTTTCCTCTGTTCCTCTAGGCCTCAAGGTTTTCTCTCCCTTTCTTTTATCTTCATTTTTCTTTTCTTGTTTCTGTATTAACTGATGTGCAAGGGATTATGATTCCTCAATCATTTTCTTATGTTTTCTTCTTGGCTGTTTCAGAGTCTCATAGTTCCACTTTATGCTTTTTTTTCTCCATTTATTTTTATCCCCTTTTGTTTGAAGCACAAACGGGATAACCTCTCTTCCATGATCATGGAGAAAGGAAATTTGGGATTTCCCTTTTTGTAGCTCTTATATAAGTCAACAGATGTAGCATTTTTTTAATGGGGTTAATTAGATCTGCTTTGTTAGTTAGATTTCTGATTCATACCATGATTTGGATTCTCTCTTTTGATTCCACCCAGCAATGCACAGAATTGGTGAATTCCTATATGGGTTTTCTCTCAGTTCTTTTGAATTTTCTTTCAGCTTTGTTTGTAGTTTTCTGTTTCTAATTTTAAGATTAACTTACAAGATGGTCGGATCTAATTGGGACTACCAGACAAAAAAGGGTGGTGGGTACTTTGAGAGGGGCCGATATCGGATGCACTTCGATTTAATATTTGGATTTGCGTTTTGTTTTTCCTTTCAGATTTAAGATGTTTTCATAAATTCAAAATTTCTGTCTTTTTGTATGAACAGAACACTGAAATTCCATGTGTACAGGTTATTGTTTAGGGTATTTAGTCTACCCCTTGGAAATTAAGTTCTTAACTGGATCTCCCTTGCGAGGTAGGATAATATATTAGAAAAGCACCACGAGTTCTTGATTCTAAGTAGTGAAAGTGATCGAGTGGCTTCTTTTTTTCCTTTCCCTGCTTATAGTCAGTGGAATGATAATCTTGTTTTTTTGACTTCTGGGAACCATTGCTACGAAAACTTTCTAATTGTGACTTAAAACTTAAAAGTTGGCCTCTTTCATACTTCTTGAGCTGACCTTCTGCTGTGTAAATTGATAATTTATTCTGCAATTGTACGAAGGTGGAAGGTTTTGACTTGGTTTTTTTCACTTTACTTTTCTAGCCTATGAATGACAGACTCCAAATATAG

mRNA sequence

ATGTTCTGTACTTACGAGGTATCAACGACCCCAAAAATGCTAATGAAACAAATCTTTAAGGAGGGTATTCGGGATTGCTGCTCAATCGATTTAAAAAATGATATATCACAGCGGCTTCTTCGGGATTGGAAACCAGAATCAATCGTGTTAGGCGCCCCTCATCGTTTCTGGTTGCTTTGGGGGGTTCTTCTGTACAGTTGCTGTAACATATTGTGGAGTGCATTTTCCTCTGTTCCTCTAGGCCTCAAGCCTATGAATGACAGACTCCAAATATAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTCTGTACTTACGAGGTATCAACGACCCCAAAAATGCTAATGAAACAAATCTTTAAGGAGGGTATTCGGGATTGCTGCTCAATCGATTTAAAAAATGATATATCACAGCGGCTTCTTCGGGATTGGAAACCAGAATCAATCGTGTTAGGCGCCCCTCATCGTTTCTGGTTGCTTTGGGGGGTTCTTCTGTACAGTTGCTGTAACATATTGTGGAGTGCATTTTCCTCTGTTCCTCTAGGCCTCAAGCCTATGAATGACAGACTCCAAATATAG

Protein sequence

MFCTYEVSTTPKMLMKQIFKEGIRDCCSIDLKNDISQRLLRDWKPESIVLGAPHRFWLLWGVLLYSCCNILWSAFSSVPLGLKPMNDRLQI
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh04G015810.1CmaCh04G015810.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CmaCh04G015810CmoCh04G016530Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB728
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmaCh04G015810Silver-seed gourdcarcmaB1170
CmaCh04G015810Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB532
CmaCh04G015810Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB732
CmaCh04G015810Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB720
CmaCh04G015810Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB724