CmaCh04G013650 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATCCTAAGAATCCCAACAAGCCTGCTCCTATAATCACTCCAAAGCCAATGCCTGCCTTTTGTCCGCCACTCAGTCCTTTTGAATCTGCACCACCCTTTTCATTCAATGCTTCGTTCGTGGTCGGCGCCGGTGGCGGAGATGAATTTACATCAGGCGAAGGTGCGGGTGGCGGTGGTGGAGTCTCAGTGGTATTTGATGGTGGCGGTGGCGGAGGCGGACTGCCAGCTGTGTTGGATGGCGGTGGCGGAGGTGGACTGCCGGTTGTGTTGGATGGCGGCGGCGGAGGTGGACTGCCAGTTGTGTTGGATGGCGCTGGCGGAGGTGGACTGCCAGTTGTGTTGGATGGCGGCGGCGGCGGCGGTGCACCATCAGTTGTATTCAATGGCGGTGGTGGAGGAGGAGGAGATGCATCTTGAGAGAGAGTAAAATTTGTGAATTGAAAGAACACAAAAATGAGAATAAAAACAGAAATTCCAATCCTTCTTGCCATGAGGCTACCTATGATAAAGATGCACATAAACACAAATATTTATACACTTTTAATATAAATACACATTCTTGAAAGCTTTAAGAGCTTTAATTTATGTTCTGTCTTGTTTTATTTGTCTGCAATTTTAAGATTATTGTGTGCATAAAATTTATGTAAATTTTATTTATGGGGTCTTTTAAATGTATAAATTAGCCTTCAAAACTTTACTTTTATCGATCAAAGATTATTTTAGCTATAGAATCAAATGGCAGGCGTAGCCGGCTGCCTACAAAACCAAACAATTAAATAGTATGCGTAGTTAACGTTACTTAATATTAACATTACTTTATAGAATATTAATACTTGATTCAAATTTACATCAAAATTAGGTTGTTTATTTAAAGTATATTTTGAATTTTGTAATTCAAAACAATAATTTTTTAAAGCTAAGATTTATATGTTTTTAGTGTATCTTGATATTCAAGTTGAAATACATAATTATATTTTAAATTATGTTAAATTTATGTTTTTAAAATTTTAATTTATAATTTCATTCGCTTTTTATTACTTATGAATGGGTGTGGATGGAACGTTAGGAAGAGCGTTTGGGCCGGGCCTTGATTATTATGGAATTTGAGCTGAGCTTTTGTATATAAAAGGGATGTAATTGGGCTTCTTTGATCTTTGAGCCCATTAATTTCTATCATTAACGGGTCTACTGAGCGTCAACTTAAAACGCCGACGTTTTATACTCCTCCGTAAATAAAAGCGCAAGAGCTCTCGTGGATTCTCTTTATAAAGGCCAATAGTGGTATCTGGAATACTGACGAGAGCCATTTTTTCGCGCGAAAGTTGAAATTGCTCTGTTGAGAAGTGCGATGATTTTTCGTTCGAAGTTTTTGGTTGCTCGAGATGCTGTAAGTAAACGCCGTTCCACTTCCAGTGATTTTCCTTTCACAAAACGATATTGTTTCTTGTTAGGTCTTGTAAATACGAAGTTCTTTACGATTTTGTTTAGTCGAAGAGGAATCCAAATCGTTTATTGAACTAATAACGGTGATTTCTCACTCTCGTAATCCTTGATATGAAAAGTTTTGTTCGTCGATCGGATTAGATTAGGTCTTTTAATTGATCGATTTATCTCTTAGGATGTGTACGGTCTGATGTCTCAATACTTAATATCTTGGATTTTGCCATTTCGAACTAGCTGCGGCAGTGCTGGTTATCGTGAGTTCAAATTAGACTCCCTCTGAACATATTGTTTCTACAATCAATAGTCGTGATTGTAGTCTTATGAATCTTAATTGCGTTACGATTTTGATTAGTCGGAGAGGAAACCGAACCGTTTATTTAACTAGCGATCGTTATTACTCAGTGTCGTAACTCTGATGATAAAAATTTTTGTTGTTCGTCGATCAAATTAACTTAGGTGAGTTAGTTGATTGATCTGAATCATATATCGATTTGTCTCTTGTGCACGATTCCGATGATTAATAGAATCTCTCTCGATATAATTTATCTTATGTTTTGCATAAATCGCTGATATTCCTTGTTCTTCTAACTTTAAATTAAAAATGATTCCTCGACGAGCGTTCAGATATTTATTTTTTATCTCAGAATTTTGAAGACGATTTGGCGTCAGGAGTGATTTACGTGGATGCGTGTTTTGAATTGCTACCAGAAGGTCCGGAACATATTTATTGGTACGTATTTTGATGATTTTACACCGTGATACTCTTATAGTCTTTTATAAAGTTCAAATCGTGAAGCAAGTACTTCGAAAATCTAGCAAACTTCTCTGAATTTTTTTCTTGCTAATTTATTTCATTTTTGTGCAATTAGAACTGTGATACTTTTCGATTTGTTGAATATTATGTCCGGTAGAAGCTTGCACTGATTCATTAGATTTCGTACATTCGAGGCTTGAGTTGTGTTTCTTTTTAGAAAAGGAAAAGATAAGAGTTACTGCTGCCTATCAACATTGTGATCTGAGTCTTGGTTTTATTCATTTAGGAACTCTCGGGTTGTAATATTATCTCAAATATTTTGTATAAAACAACTTTCCTAAAATAAGTTTTTTAAGCATGCTATTTCTCTTATTAACTTTTTAGTCATTATTTTTGAATAGTTCACGTCTAACCGTCTTCCAGTAGTCTTAATTTATTGTACATAATTATATTATCTGAAATATCTTATACAAAACAATTTTCCTGCTTCTCGTTACTCCTAATTGCTTCTAGGCTTGAACTCCCAAAAAAAATTATTGTTGGTTTAAGTATTCTCTTCCTTCGAAGTTCGACGTCTTATTGTTTCTTAATAGTCTTAGTTTCCTTTAGGTTTATGTTGTTCTTTGATGTTTTTCGTCATATATAGAATGACTTTTTTTCGTTATTTATTATTAATGTACTCTGTTCAGTCTATACACTATGATACTTATGGAATAATTTAAGTTGCTTAAAATACCATCCTGAGTAAATCATATGCCAGTTAAGGATACAAAATCAGAAAATTCCAGTTATCAATCAGCCTTCTTTTGATTATGACTTTATTGCTCCCCGTGCTTATCCTAAAGCTGAGAAAGAAAAATAAAAAATTCTAAGAGCTTTAGTGAAGGGAACAATGAAAGATCTTGGGAAGTCTCAAAACTGCGACATCCTAAAACTTCTCAATTTTCTGGATTTATCATTGAGTGTTCTTTGGTTTCTTTTCCATCAAAATTAGCACCTAACCGTACAAACTACAGTACCCTTATGCTTGAGAGGGTTGCCAACCAAAGGTAGCTCCAAACATTTTCGGATTAAGAGAGTGTTTCAATAGTTGACACCAAATGATTTTGGGTTGGAATATTTAACTTTTCTTGTTATTTTAATCTCTATTTACTCTTAATGGAGTTAGATTAGAGAGATTTGTACGGGCAGACATTTAGTTCACTTCCATCCAGTGTCCAAAATACTCGTTATCAACAGATGTATTGAAAATGAAAAATGTTGTGTAAATTTTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCACAATTAGGTCGAGAGAAGAAAGTCCTCCAAGAATTAGTGTTGGAATCCCCACAATCTTTAATCAAAACAATTGAAGAGTTGAAAATTTTGATTGAACAAACTTTTAAGGGATTTGAACCAAAAACTCACTTTTTCCTTATCCTTAGTTCTAAAGAAGAGATCCTCGTTTATTTTCATACAGATGAGAGAACTTGTAGAATATCAAGTCTTGTGATCATTTTGATTGATATATATTTTTCTGAGGAAATTATGGTTGATATATTTTATTTATTGTCTAGAGGGGAAATATGTATCTCGGTATTGCGCTATATAATATTTTTTTTTTATTGAGAATATCCCACTCACATCTTCTCACATGTACAACACTAAAGAAATAGGTGGCATGTACAGTGTCATAGAAACCAAATAATATTCATATAACCCAAGACAATTTAGGTAATTCTCAACTTAAGTTTTGTGCATTCTCTAATAAACATTTTTGTCCATCGAAAATACCACCAAACTTATCCCATATATATTCTAAGTGATCCGAAGCACTTCCTAGTTCCTATTTCAGATGTTTGAGTTTGGTTACTATTTTAAAACACTTTTCAATAAAGTAAGAACACTATTTTCAAAAAAAGAAATTAGTTCATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNTAATTCTTCTCTTTCTAATATCTTTCTTGACAGTTTTTTCTCTCGTTAATTTCTCTTTTTGCACCATTTCTTTCTCCAGCTTCTCTCTCCCATTTTATCTCACTAATTTTCGTGACACTAACTTCCTTCTCTAATTTACTCTCTTCACACACACTTGTTTGTACTAGTCTCTCTACAGTAACGAGTCTCTTGTTAATATCTCTCTGCAAGTATTATCTCATTTGTTTCATTTTTGTGATTTAGTTTTAATAATTTTAACATATTTGATTGTGGTGATATGTGAATTCTAGAAACTAGAAGCATCTATAGTCTGTATTTTACCAAGTACTTGTAGATGACTAAAAGTATGTTGCGAAAACTTGGTTTGAGAATTTTAAAATAGATAGAAATCGCTTTAGATGGATCATTTAACTAATCTTTAAAACGTTAGTAGGATGAATACTTGTTTTATAACCTTCTATACTTATTTTACATGTTCGAAGTACTCCATCAACTTATGGTCATCAGGGGTGTAACTGATTTGATTCGATTTGGGTGTCTAATCTAAGCCATAAATGTTATGGTCAAGTATATATTTAGGAGGGATTTTGAAATTGCTAAACTGCTTTTGTGAGTTTAAAATTACTTAGAACATGCATCAAATGATTCAACCATTTTTAAATTTGCAGGATGAATTTGATAAAATTCCTAGTTACTTTGACCATGAAAGATTGATCAAAAGGGCTGTGTACACATTTCTTGTTCCTAGTAATATAGGTTTGAGAATCATGAGCGAAACTTCAAACGTTGTTAATAAAACATTGAGACTAAAAGCTTCTGCATGTTGCATTGTGTGCATACTTTTCGATAGTTTACATCTTGCACTATCTTTTAGGAATGAGTTCGAACCAATATGCATCTGGACTTCGCGTTGATGTTGAATTTGATGCATAAGCTTTGAAGCGAAGTAATTGCAACTGCAACATGTCGCAGAGGTTTGTTCCTCTACCAACGCTTTTCTTTCTTTTTCTCTTTCTTGCACATCTACAAAGTCAGAAAATTCTCAAAATTATTCATATTAATAGAACAAGAATTCTAACAAAAAGATCAATAATCTTAGCAATAAGTTAGTGCTAGCATTTCAGAAAGTTCGTAATGAGATAATTTCAAATTTCTTGCTGAAAACAATTAAGGTAAATATGATGTGTTCCCCTTATGTTTATACAACCATTTGGCAGAAAAGTTTTCTTAATAAAAGGGTTACACGGTTGTTTAACTTTCAAGTGGGAGGGTGCTATATAGAATTTCTATTCTTTTTTAAAAAGAAATTAAATAAAATAGAAAATTTTAATTTACAAATGTATTTCTTTCATAACGAAGCACTTGAAGTTTAGATAATATTTTTAGAATTGGAGATAAACTTAAAAGAGAATGATGCAACAAAAAAGAAAGATGAGTTAAGAAGATTTCCTAGGCTTAGAAAAGAAAAGTCTAATATGAGAAAGAAAGCAATTGAAGGAAAACTAGATTTTCCAAGATGGAAAAGAATGAAAATGAATGAGAGAAAGAGTTTTAGTTTTAAAATTTACTTACATTTCCAAAATTTAAATTTAGAAGTTTAATAGATTGTTGAGGCTTTGTATGATAACCGAAATTTTTTGGTTATTGGTTTTTCTACCCTCTATTCTTCTCTCCCTGCTTTTTAATCGATAAAAAACAGAAAATGCCACTGAACATTCTTTTTTCATTATCTATAAGAAGACTTCTTATTGCGTTTTTTATCTTAAATAAAAATGTTAGGGAAAGGAACAAGTGAAAAGGTTGGGGGAGAAATCTTAG ATGAATCCTAAGAATCCCAACAAGCCTGCTCCTATAATCACTCCAAAGCCAATGCCTGCCTTTTGTCCGCCACTCAGTCCTTTTGAATCTGCACCACCCTTTTCATTCAATGCTTCGTTCGTGGTCGGCGCCGGTGGCGGAGATGAATTTACATCAGGCGAAGGTGCGGGTGGCGGTGGTGGAGTCTCAGTGGTATTTGATGGTGGCGGTGGCGGAGGCGGACTGCCAGCTGTGTTGGATGGCGGTGGCGGAGGTGGACTGCCGGTTGTGTTGGATGGCGGCGGCGGAGGTGGACTGCCAGTTGTGTTGGATGGCGCTGGCGGAGGTGGACTGCCAGTTGTGTTGGATGGCGGCGGCGGCGGCGGTGCACCATCAGTTAATTTTGAAGACGATTTGGCGTCAGGAGTGATTTACGTGGATGCGTGTTTTGAATTGCTACCAGAAGGTCCGGAACATATTTATTGGTACGGAAAGGAACAAGTGAAAAGGTTGGGGGAGAAATCTTAG ATGAATCCTAAGAATCCCAACAAGCCTGCTCCTATAATCACTCCAAAGCCAATGCCTGCCTTTTGTCCGCCACTCAGTCCTTTTGAATCTGCACCACCCTTTTCATTCAATGCTTCGTTCGTGGTCGGCGCCGGTGGCGGAGATGAATTTACATCAGGCGAAGGTGCGGGTGGCGGTGGTGGAGTCTCAGTGGTATTTGATGGTGGCGGTGGCGGAGGCGGACTGCCAGCTGTGTTGGATGGCGGTGGCGGAGGTGGACTGCCGGTTGTGTTGGATGGCGGCGGCGGAGGTGGACTGCCAGTTGTGTTGGATGGCGCTGGCGGAGGTGGACTGCCAGTTGTGTTGGATGGCGGCGGCGGCGGCGGTGCACCATCAGTTAATTTTGAAGACGATTTGGCGTCAGGAGTGATTTACGTGGATGCGTGTTTTGAATTGCTACCAGAAGGTCCGGAACATATTTATTGGTACGGAAAGGAACAAGTGAAAAGGTTGGGGGAGAAATCTTAG MNPKNPNKPAPIITPKPMPAFCPPLSPFESAPPFSFNASFVVGAGGGDEFTSGEGAGGGGGVSVVFDGGGGGGGLPAVLDGGGGGGLPVVLDGGGGGGLPVVLDGAGGGGLPVVLDGGGGGGAPSVNFEDDLASGVIYVDACFELLPEGPEHIYWYGKEQVKRLGEKS
BLAST of CmaCh04G013650 vs. TrEMBL
Match: A8E425_PSEVI (HrpW OS=Pseudomonas viridiflava GN=hrpW PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 2.9e-09 Identity = 56/105 (53.33%), Postives = 62/105 (59.05%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh04G013650 vs. NCBI nr
Match: gi|659092081|ref|XP_008446890.1| (PREDICTED: serine, glycine, tyrosine and glutamine-rich protein-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 6.3e-13 Identity = 58/87 (66.67%), Postives = 63/87 (72.41%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh04G013650 vs. NCBI nr
Match: gi|659092083|ref|XP_008446891.1| (PREDICTED: serine, glycine, tyrosine and glutamine-rich protein-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 77.8 bits (190), Expect = 2.0e-11 Identity = 53/79 (67.09%), Postives = 58/79 (73.42%), Query Frame = 1
BLAST of CmaCh04G013650 vs. NCBI nr
Match: gi|62001501|gb|AAX58457.1| (HrpW [Pseudomonas viridiflava]) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 4.2e-09 Identity = 56/105 (53.33%), Postives = 62/105 (59.05%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |