CmaCh04G012030 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)

NameCmaCh04G012030
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr04 : 6123803 .. 6129451 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAAATGGAAGTGTTGCATTTGACGGAAGACGAGAAATTCATGTCCGCCGGACTCCATTGCCAGTAAACCCCTTTTCTTTTTCCGCATTTTGCTTTGATAATACTAATTGCTCACTTGAATCATGCTTGAAATTTCGCGTTTAGGCTTCGTAATCGTTGGAATTTCGTGCCGATTCTTTTGTATTATAGTCAATCCCCTATGGTACGATTTGGTAATCGTCCTAAAATACCGCCAATGTCCAATTTCCAATTGCCTTTTGAAGTTCGCGCAAAACAGGAACTGGATTTTCTTTGTTTGAATATCACAAGTGATTTCTTTCCTGAATTAAATCATCCACCACTTTTCTCGTTTATCTCGTGTTTAAATCCCCAATTATGATGATAAGATCGCTTCCTTCTAGGTGCGGTATCAAGAAATCAGCAGGAAAGTGCACAGAAATAACCTTTGTAGTTAGTTCCATTTATACTAAGCAACAATTTCCGTAGTGGAGGGACAAATTTTGTTGCTATCAATCTGAACAGAAACAAGAACTACGCGTTGCATGAACATTTGACCATCTTTTTGTTGAACTACAGGGGAGAAGTTTGAATGCATGGTTTTGTGTTACAGCCATGTCCTGATAGTGTGGCGGCAAGTTGTTGGGTTGATGATTCATAATGGAGCTTTTCTTGTTTGACTTTGCAGTTCAAGGAAGGATGGCGTTCTTCAATTCCTACTGAACTTTTGTATTATATGCTGACTATTTGGGGTCCGTACATCACAGGTGAGGAAACTAAGCTGTTAGAATTAGTTTTATTTCGTGGAAGCTACGGAGCTTTAGATTTTCAAAGTGAAAACCAAACTTAGAAATGGTTATGCTTATGCTTATGCTTATGCCTTGTGCTATTATGGGAGCTTGGAAACTCTATATTTGGCCCCTAAGACTAAGAACTAAGAACTTTCCTTAGTCTAATAGTAAATTTAGAGTGGACCTCTTGCATTTATTTCTGATAGGTTTGTTTATCAAAAGCTACTTTTGGCCTTTGGGCCATCCAAAGTGTCACAGACAAAAACAAATCTGTTCTGGTTAGATATATGATTGAGTTTTCAATTTTGTTTATCATGTTTGTACCATTTTGTCAATTTCTGGACTTTTGAATCATTAAAGACAAAATTGAAAAATGGTGTGAAGGACTTAATTATGGGTGAAGTCTTGTGGTTTTCTAAACTAAGTAGCTTTTCTTTCAATCATTTCGAAATTGTAGGCATGTGCTGGACCATGTTCATGTACTGGGAAGTAGTATATGGCTGTGGTTGTGAAATCTGTCTCTTTTGTAATGGGAACTTAACAACAAATTTACAATTACCATTGCCATATTGGTCTTATTGTTTGCCCAATTAGAAAATTCCCTGAAGGTGGCTAAATTGTTTAACGCCATGGACTTTTGGTTTCTGTTTGTGTGAACTAGTAGTTTAAAAAAGCAGCAGCCCTTTTTGTTTGTTCTTTGTTTGTTCTTACTGTTTTCCAGGTCTGCTGCTTAACAACCCAGAATTTATATTTCAGATGCAAAACCATCCAACATCTATTCTCCTATCAACATCAGCGGTATTATGCTGAAGATCTCGAGACACCTGGTCAAATAGGTAATAATAATTCTGGTCTTTCTATTTGATGTAAATGGTTGCCTCTGTTTAAGTAGGAGTGTGAGATCCCATGTTGGTTGGAGAGGGGAATGAAATATTTCTTATAAGGGTGTGGAAATCTCTCTCTAATCGTGAGGCTGACTGCAATACGTAACAGACTAAAGTGAATATCGGCTAGCGGTGGGCTTGGACTGTTAAAAATGGTATCAGAGTTAGACACTAGATGGTGTGCCAACAAGTACACGCCTCAAAGGGGGTGGATTGTGAGATCCCAAATTGGTTGGAAAGAAGAACGAAGCATTCCTTATAGGGGTGTGGAAACCTCTTCTTAGCATACACATTTTAAAATTGTGAAGCTGATGGTGATATATAATGGGCAAAAGCAAACAACATCTGCTATCGGTAAACTTGTAAAGGGAGAGTTGAATTACAATTCGGACTCCATTTGTCATTTGAGGGAATCATGAAGATGTCATTCAGGCCTTGTAACAGTTGAGTTTGGCTAATGGGAAATGAAAGCTGCACTTGATAAACTCTTAATCTAGTGGTAAATGACACTAAAAGTCGTTACTTGCTTAAGTCAATGCATATTTCTCACCAAGCCACCAATAAATAAGATGAGAATAATATGAAGTGGACTATTCCTAATCTTGCTGATGATCATGGAGTTGACTTTTTTAGAGCATCACGTCTTTTTACCTCTACGCCATGGTACTCATCAGGTAATACGACAATACTTGACGAGTACTATGGCATAGAGGTAAAAAGATTTGAAATATCAGTATGTCTTCAAAATATACAGCGAAAAGATTAACGAATACTTTATTGTTTTTTGCAAAAGTTAATTAGAAGCTAGCCCAATGCAGTCGATAATTAAAATTTTGACATTTACAAGTATAATAACTATACTTAAAAGTCTCAAATTACGAAATTAAAACTCGAGAGTTCCAATTAGAAAATTTGAAAGACAAAATTGAGAGATTGGAGTCCAAAAAGCTATCAATTTAAAGGATCTTTAGTTGAATCTTTTGCTTATTCTATATAATTAGCAAATAATTGAATCAATTAATGCGTTTGGAAAATTTTAAATCAAAGATTTTAAGATATTAAAAAAAAAAAATCCAGGATGATTTTCTGTTTTAATATGGAAAGATTTTCAAGTATAAAGTCAACACACGTGTGAGAGCCTACTTTTGGATATTAAAATTGGCAAGAAAGTCAACTAGAGATTAGTAATTTTTTAAGTCTAATTTATAATTAATGGGCAATTGTTTTTTTTTTTAAATATTTTAATGAGGTGATGTATGTATTAACAATATTTTCTAAAATTATTATTTTATTAATATTTATTACATTAATTATTATAGAAATGGAGGAGGTGAATCCAGTCTTGAATGTAACACTTTCCAATATTTTCTTTGCGTATTTTATAATCTTCATAATATTATTAATTTTCCGCTTTCAATTTCAAAGCTTTTCCACTTTACCCACCAAAAAATAATCTCCTTTTAATTAAAGTGTAAATCAATCCACAAAATTTTAAAATAATTAGTGTTCCGCCAATCCGGTCTCGACAGATGGCGTAACCCTATTGGCTATGACTAATAATGGAATTTCAAACAATTTCATTTTGAGAATGTCTCGAGTTAGGTTGTCGTGCATCCTAAAGTTAGGCCATTTCCCGTTGTGTCCTACGGGATTTTGTTTTTCCAATTTATTTTTTCAATCAAAATTTCAAATTTAATTATATATATATATATATACTTATTATTGTAAATATTTTTTAAAGATATAATTAGGCATAATTGATTAGTGCAATTAAGCTGTATTAGTTTCTTCATTTATTTTAAATATTAGGTATCAATTATGTTACCCTAATTAACCTTCCTTCGATAATCAAATTAAACTAGTCTCAATTAAATAAAATAACTTTAAAATCAAACATAGTTCGGTACATAAGACGTTCAAAAGTCGTTCGTCTCTATTGAACTCTATTATTTTATGTAAATATAAATATTGATTTTATTAATTTTATTTATGGGCTTTTTAAAAATAAACACTTCATTATTTTATTATTATTCTTAATTTTATGTGAATGAGATTTTTATTAGTTAATATAAAATTTTCTGCTAAATTAATTTAATGGCTTTGTTTTGTTAACATAACAATGGATAAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTATACAAAATTTGAATTTATTTGTTTTTTTTTTCCTGTATTTAAAATTTATATTTAATAGTAAATTTATCATCTACTTACAATTTTTTATATAAAAAACATAGTCAAAATTTAGAAATTGAGGGAAAATGTAATTGAAAAATTTTGGTTTTTTTGAAAATAAATTGTAGATATAAGTACTTAATTAATTTATTAAAAAAATAAAAAAATTAATATAGATTATTTTAATATAATTCATTATTGTTGAACTATTTGAATATAAATTAATGGATAATATGGTTTAATTTCTATTATCCTAATTATTGATCTATAGATAAATGTATCTCTTATAAGGGTATATTGGTCTTCTTGGCACATATATTTCCGATATAAATAGATTTTTGGTCGTGTTTCTATAGGGAAATGAAAGAAATGTATGTCTTGTTGGTATAAATAGTAACTTTGATTTCCTTTAGTCCTTTCTTAGTCATTTCATTATCAAGATCACTCTTATTTAAATGTAGTCTCGATTCATTCATGTATACCTCTTTTACTAAAGTTTCACAAAAAAAATACGTTTATAATCTTCTAATTTGAAAATTAAATTACGTAATTGATTTAATAAATAAATAATTAAAATGAAAAAAAAAAAAAAAGATTGGGCAAGAGGAAAAGGGTTTGTTTTTGTTGGCGTAGGTGTGTATGGAGTCTTGTGCTACCATATACAATTTACCAATTAATTTGACAATTTATAGATTCAACTACCCTTATATTCATATTCCTCCTCTTTTAAATCAAATATATACCCAAAAAAACAATTAATTGATTAATTACTTTTTTCCCAAAAGACAAAAAAACATTGGAATATATATTTCACTAAATTATGTGTCACTACTTATTTGGGCTGATTTAATTATTAAAATATTTAATTTCATTTTTTAATATTGGCTAATTTTAAAATATATATATATATATATATATAGCTAAAGCTTTGCAAACATTTCTGTTTTTTTTTTTTAAGAAAAATCATTAATTATTATGAAAGTCTTTCGAGTTGTTATTAACAACGAAAATCAAAATTAATTAAGTCTCTAGTTATTATTACCCACTTAGCCTTATAAATTGAGTCAGTCGAGTGACTAATGTTTATTAATATTTCCGTTAATTTTGAGGGGAAAAAAAACAAGTTTATACGACGATTAATTAAAAAAAACTTAGAAACTGATTTTTTTAAAAAAAGAAATTAAAACCATTTAGCAGTTTTTTTTCTCTGTTTTGTTAAATTCACTGTTTCATGTATTAATTATTAGTCGAGATTGATGATTCTCGGAAACAAAATCCTAATTAAATAATAGATCTTAAATATTAGAAATGCTAAAGTTGTGAAATTCTGTATACATGCAATGTAATTGAAGAAGAAAGATGAAAAAATTGATTGTTCAATGGAATTATTTCTTGAAATTAATATGGACTTAAAAGTATAATGATAGAATAACAAAATTTACCGAACACCACAATGAATTAAAATTGATTTCTAAGAGATCGTGAAATGATCGCAAACCAAATTAATTGAATTATACGCTTTAATCGCCTCTGGATTTGAAATGCTTGAGCTTAGATCAATGGAGAGATAAGCCAAACTGATGTAAAGCAGATTTTCACATGAGTTATCGATGATATTGAGAAATCGAACGCAACAGAGATTGAATTGACGCATATGAAGATCTGGATTTATGTATGTACTATATGTTGTGAACGAACAAAGAGATCAAGATTACAGTATCAAAAAGGAAAAAGAAAACGCAAAAACTAGTTTAACTCATCGTGTTCGATCTGATTGA

mRNA sequence

ATGGAAATGGAAGTGTTGCATTTGACGGAAGACGAGAAATTCATGTCCGCCGGACTCCATTGCCAGTGCGGTATCAAGAAATCAGCAGGAAAGTGCACAGAAATAACCTTTGTATTCAAGGAAGGATGGCGTTCTTCAATTCCTACTGAACTTTTGTATTATATGCTGACTATTTGGGGTCCGTACATCACAGATGCAAAACCATCCAACATCTATTCTCCTATCAACATCAGCGGTATTATGCTGAAGATCTCGAGACACCTGAGCATCACGTCTTTTTACCTCTACGCCATGGTACTCATCAGATCTGGATTTATGTATGTACTATATGTTGTGAACGAACAAAGAGATCAAGATTACAGTATCAAAAAGGAAAAAGAAAACGCAAAAACTAGTTTAACTCATCGTGTTCGATCTGATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAATGGAAGTGTTGCATTTGACGGAAGACGAGAAATTCATGTCCGCCGGACTCCATTGCCAGTGCGGTATCAAGAAATCAGCAGGAAAGTGCACAGAAATAACCTTTGTATTCAAGGAAGGATGGCGTTCTTCAATTCCTACTGAACTTTTGTATTATATGCTGACTATTTGGGGTCCGTACATCACAGATGCAAAACCATCCAACATCTATTCTCCTATCAACATCAGCGGTATTATGCTGAAGATCTCGAGACACCTGAGCATCACGTCTTTTTACCTCTACGCCATGGTACTCATCAGATCTGGATTTATGTATGTACTATATGTTGTGAACGAACAAAGAGATCAAGATTACAGTATCAAAAAGGAAAAAGAAAACGCAAAAACTAGTTTAACTCATCGTGTTCGATCTGATTGA

Protein sequence

MEMEVLHLTEDEKFMSAGLHCQCGIKKSAGKCTEITFVFKEGWRSSIPTELLYYMLTIWGPYITDAKPSNIYSPINISGIMLKISRHLSITSFYLYAMVLIRSGFMYVLYVVNEQRDQDYSIKKEKENAKTSLTHRVRSD
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh04G012030.1CmaCh04G012030.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CmaCh04G012030Carg00281Silver-seed gourdcarcmaB0948
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmaCh04G012030Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0884
CmaCh04G012030Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0899
CmaCh04G012030Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0832
CmaCh04G012030Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0853
CmaCh04G012030Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0916
CmaCh04G012030Watermelon (97103) v2cmawmbB719
CmaCh04G012030Watermelon (97103) v2cmawmbB742
CmaCh04G012030Watermelon (97103) v2cmawmbB753
CmaCh04G012030Watermelon (97103) v2cmawmbB780
CmaCh04G012030Watermelon (97103) v2cmawmbB796
CmaCh04G012030Wax gourdcmawgoB0825
CmaCh04G012030Wax gourdcmawgoB0879
CmaCh04G012030Wax gourdcmawgoB0881
CmaCh04G012030Wax gourdcmawgoB0892
CmaCh04G012030Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB272
CmaCh04G012030Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB322
CmaCh04G012030Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB487
CmaCh04G012030Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB516
CmaCh04G012030Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB531
CmaCh04G012030Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB549
CmaCh04G012030Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0472
CmaCh04G012030Cucumber (Gy14) v1cgycmaB1049
CmaCh04G012030Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB720
CmaCh04G012030Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB723
CmaCh04G012030Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB726
CmaCh04G012030Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB728
CmaCh04G012030Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB731
CmaCh04G012030Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB729
CmaCh04G012030Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB770
CmaCh04G012030Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB756
CmaCh04G012030Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB720
CmaCh04G012030Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB746
CmaCh04G012030Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB765
CmaCh04G012030Melon (DHL92) v3.5.1cmameB652
CmaCh04G012030Melon (DHL92) v3.5.1cmameB714
CmaCh04G012030Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB652
CmaCh04G012030Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB673
CmaCh04G012030Watermelon (97103) v1cmawmB678
CmaCh04G012030Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB720
CmaCh04G012030Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB723
CmaCh04G012030Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB739
CmaCh04G012030Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB752
CmaCh04G012030Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB631
CmaCh04G012030Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB642
CmaCh04G012030Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB666
CmaCh04G012030Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB676
CmaCh04G012030Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB412
CmaCh04G012030Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB555
CmaCh04G012030Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB673
CmaCh04G012030Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB692
CmaCh04G012030Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB739
CmaCh04G012030Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB771
CmaCh04G012030Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB802
CmaCh04G012030Silver-seed gourdcarcmaB0428
CmaCh04G012030Silver-seed gourdcarcmaB0373
CmaCh04G012030Silver-seed gourdcarcmaB1199