CmaCh04G008310 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)

NameCmaCh04G008310
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr04 : 4266219 .. 4273079 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATCGAGCAACCGAGCTTAACAAAAACCAAATTAAGAGATAAAGAGAGAAAGGGAGATGAACCAGAGGCTGGGAACTGCAGAGAAGGAATGAATGAAGGATGGAGCAGGAGACAAGGGAAGAAGAAACTAGAAATCGATGGGTTCGACCATCAAAGTGGATAGAACGAAGAGAAAAAACGAAGAACACGGAATGAATGTGACGAAGGATGTTCATATGGCCGGCTTTTAAAGGGTTCAGGAGGAGCCGTAGCTAACCAGAGTTGATGGGGATAAGTAACCATGGTTAGATTCTATCTCCGAATTTTCGTAAGAGAAATTGTAATGGCGCATAAAACGAGAAGCTAAAGGGTAAAAGAGGAAATCCAGTGGAATCTAATACCATGCCGGTCTCTTGCATCCAGCGGCTATTAATGAATTGCGAGAAGTTCTTCTATATCGCTTCCCCATTCAACTTTGGCCTACATACATTTATTCTTTAGATTTTACCTTTTTTTTCTATAACGAAAAATAATAATAAATTACTTTCACTAAATTTCTATTTGAAAACATCGATAATATTGTTATACTAAAAAGAATATTGAAGTTAAATAATAAAATGATGAGTGGTATTAAAAATTGTTTGAACCAAACATTTTCTTTTTCTTTTTTAATGTTCTCATATTTATGTTGTTTTCTATTTATGTTTTAAAAACTATATCCTTTTTTTTTTCTCCCTTTTTCTTTTTATTTGAACTAATTGAATCCAGTAGAGATTTATGTTAGGTTAAATAATTATGACGTATTCAAATCTTCCTAAAATTAATAAATCTATAAGATATAAAATTAAATTTTGCATCTAAAAGATATTAAGCTTTCATGTCTATTTAAATGATATAGGATTTTTCATAGTTTTTTTTTTTTTATTTGAATAAAAAATTAAATGTTTTCAAGATGAATTCAATAAAATAGAGAAAGGGTAATTTAAGTTTAATTTTAAAAATTTTAAAATAAGAAAATTAAATTATTTTTAATAGAGTTTTTATAGCCTTTATAAATTGAGAGATGTTAAATAAATTTTAAATTTTAAGAATATTGATCTTATAAATATATCTTCAATAATACAAAGATTTAGGTTATAAATAAATATATATATACATATATGTGTCACCTTAGTTAAGTTGAAGAGTCAACTTGTAAACTGAATTTAGACAGAAGTTATCTAAATTGTATTTAATATATTGTCTTTATTCGTTTTCTATGTCCTTTAAATATGCCTTTGTTTAAACAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATTATATTTAAATGAGTTAAATTTATTATATTTTTATTTTATAATTTAAAAAATAAAAAAAATACCATTTCGCCTAATTAAAATAGCTTGCCTTAAAAAAGTATTCCAGCAAATTAAATATTTATTTTTAGTATTGAAAAAAATGTATGTTTGTGAAAAGATGCATACGAAGAAGATTGAGCTGACACCACCGATCAAGTTTACACTAGTTTAGTGGTCCTTCATGTAGAGGATTGAATTCTGCCGATGGACGTGGACCCCACACGTATGAGAAAATTTTGGAAAAGAAAATGTTTGATATTGGTGTCTCCAAATTGAAAAAAATGGGATTTAAATGGAAGTTCAGTTCCGGAGTTACCGTACGAAAGACGGGGTAATTATTTATGTTGAGATAATTTAGAATTTACTTTCCAGCTGTAAACCGTCAAGTTAAATAATAATATAATATAATAATAATAAATTCTGCGTCTGGTCGCCGCATTCAAGTAGGAATCTATCGAAAAATTGTCACCCCACTAACATTTTTTTGGGAATTATGTTTAATAATTGACTTACGAATTACCCTACCCAATTATTAGATTCCATCCTGCCCAGTTATTACATGCCATTTTCACTGAATTTATTTCTTTTAATTAATAAACTCATCAATTACCCTCTTAAATTTTGATGGTTATTTCTCTTATCATTGCAATTCAACTGTCCAATTTTTTGTTTAATTTTATTTGTTAAAAGCATTAAATTATTATTTTGAAATTAAAACTCTTTTTAAAATGAAGGTGGGAGGAGATTCGAAACTCCTCTTTTTCAAAAATAATAATAATAATAATAATAATAAAGAATTAAATAAAGAGTTGTTTTAGGCTAATAAAGTTTTTTTTTTTTTAATTGGACATGTCGATTACATTGTTTACTATGATTTTCAAATTTTTAATAAATTATTTAAATTTTAGTTAAACTTCAAAATATATATATATAAGTTAAAAAAGTTATAAAATTTGGATGTTAAATAAAAAATTTAAAAGATTGGGAGTGAAATTTAAAAAAAGAAATATAAACATTAATTACGTATTTGGGTTTGAGAGGTATTATCACGTAATTATCTGTAGTCATAATCAAATGCAGTTTAATTAGGATGTTTTCGAGTTAAGTTTGGACTTTTAATATGACTCATATTGTCTTATAATAAATAATAGCCTTATTTATGTTTGATCAAATGATGGTTATGAAAATACATTTGAAAGATAATGATAGGTTTGAATTTATTTGTTTTTGTTTACCACGTTTTCAAATTATTGTTAAGTAATGAAAAAAAAGAGTCAATAAAAAATATTATTAAATTTCCAACTTCTTATTTAGTCAACTTTAAACCCGTAAACATACCTACTAAAACATTAAATTGAATTAGGATTATTTTTATGAGAGTTGAAGTCATATTAGACCATAAAATTTAATTTTATATATTAATAAATTAGTTAATTTTATATAAAATTAAAATAAACTAAACACTTTCTAAAAACTTAAAATTTAGTAATCTTAACATTTTTTTAAAAGTATTTTTAATAAAACAAGATATAATATTTGGTGTACATATTTTTTTTATTGTTTGAAAACATCAAATTGAATATTTTGAAGTTAACTAAACACGTTTCATGGAATTATGGGTGAATATAAAAATTATTTGGTAAGGAAAGGTCGTGCATATATTTCAAAAATGGAGGCTAACTTTGTTAGAAATATCATCTCTGCTCGATTAAAAAACAAGAATAAAATGCACTTTCATACTATAAAATATAAGTTTACGTGGGACATCCTAAAGTTTAAATTTATCATTGTCATTTTCTTAATTTCCTCACCTTTCAACCCTTTAGGTTGAAAATTATTTTAAACTTGAATTAAACAATAATCGATAATAATAATAATAACTTACTACCAATTATCATAGATTCACACCCAGGCCCAGTTCCAGGTCCTTGCGGTCTGGATATAATTCCAACAAAAACATTGTTATTTCACCCTAGACTTTATGTTTAATTCCTATACTTTTAATTGAGATACAAATTTTTATAATTAATAAAAAAAATTTATAAATACCAATAAATTTATTAAATGATAAATATAATCTTTAATATTAAAGTAATTTAATAAAAAGATAGAATCAAATAATGCTGATTGGATAGGATCAAATAATTTAATAAAAGATACATAAGCAAATATTATCCAATAAGTTAATAAAAAAAACACGAAAAAATATAGATTTATCGTAAATAAGTGTGATGCTTAAAAAATTTAATTATTTGGATATTTGATTAGTAATTGGAAACGTGTCATTTAACGAAATTGGAGAAGTTATTTAGTTATTTAATTTTTAAAAATTTCAGTAAAAATCTATTTATTATAAAAATGTGTAATAATGGCTTAAAAATATTTATTTTATTGGGAGTAAATGATAATATGTGGTGGTGGAAAGCGGCGAAGGATAAAGATGCTCGTGCCCATTCCGCAACCTTGACGTGTCGGATTATTCCTTCTTTGCACCGCGTAAGCCTTCAATTTTTTAAAAATTTTAGGGAATATTTTTTCAAAATTATATATTTTTGTAGTATTACTTGGTTAAAATTATATATTTTATAGTATTACTTGGTTTTCTAATTGTTATTTATTTTTATAATTAACAATATAGAGACACTATGTCGTAGAAAATGTCATAAATCTAACCATGAGTAAAAAAAATATTTTTCTGTATACATCTTAACAAAACAATTATATATAATATTAGATTGTGACTATTGTTACTAATTATTCAGGAGGATGTTATAATTATTTTTCTTTAAGTCAATTTATATGTTATTTAAGTTGGCCAAATGATATTGTGTATGCCTTAGTATTTAAATAAATCGGTTTATATTTAATTAGTGGAAAATTTCATGAGTTAAAAGTATGAAAATTTAAAAATATTTTTATTTATTTAAATTTGTATAAAAAATTTATAAATTAAAAGAATGTTAATATCTAAATTAATAAAATGAAAGGAAATAGTAATTATGATTCATATTTTGTTGTAGATTTTTTCTATCTTATATATATATACATATATTTTTGAAAAACCTTGATAAAATATTTAATTTGATTCAAACAAAAATAAATTAGAAAATTGAAACTAGATAAAAAAAAAATTCTTAATTTGAAAATGAACCTAATTTTAAATCAAATCAATTTAGAAGATGAATATAAGTTCCTTGGACCAACAAAAAAAAAAAAAAATAATACTAAACAACGATTATTAGCATTTGCGTAATTAAAGAAAGATAATGAAATATAAATAATAATATTCAAACGCTAATAATTAATTAAATTAAATTAATTATAAAATAATTATAATAGATAATGTTTAACTCGAATTATTATTTTAATAATATCTGCCCATTAAGTTTATTCGTTTAAAATTGAATGAAACCTTTGTTATTTTAAACATAACACCATAATATATTCTAGAGTTTATTTGTAGGGACGATTTTTAATGATCTGTCCACAGATCATTAAAAATTTACTGTACAAAAAATATCATTCTATTTTCCTTTTACAAGAAAAATAATCTTTAAAATAGTTGGTCACTTAGATTTTATTTGCAACAATTATTTTCCAACTCACATAAAGATTGATTATCACAATATTATTATAAAGTATTTATATGACTTTCGCA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mRNA sequence

ATGATCGAGCAACCGAGCTTAACAAAAACCAAATTAAGAGATAAAGAGAGAAAGGGAGATGAACCAGAGGCTGGGAACTGCAGAGAAGGAATGAATGAAGGATGGAGCAGGAGACAAGGGAAGAAGAAACTAGAAATCGATGGGTTCGACCATCAAACTCTGGATTACGACGACTTCCTCCAAACCTGGGAAAACAAATCGCCTACCGCTAACTTGCTTGAGATTCCTGAAATTTTGGTTAGAAGGTATTTTCATTGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGATCGAGCAACCGAGCTTAACAAAAACCAAATTAAGAGATAAAGAGAGAAAGGGAGATGAACCAGAGGCTGGGAACTGCAGAGAAGGAATGAATGAAGGATGGAGCAGGAGACAAGGGAAGAAGAAACTAGAAATCGATGGGTTCGACCATCAAACTCTGGATTACGACGACTTCCTCCAAACCTGGGAAAACAAATCGCCTACCGCTAACTTGCTTGAGATTCCTGAAATTTTGGTTAGAAGGTATTTTCATTGTTGA

Protein sequence

MIEQPSLTKTKLRDKERKGDEPEAGNCREGMNEGWSRRQGKKKLEIDGFDHQTLDYDDFLQTWENKSPTANLLEIPEILVRRYFHC
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh04G008310.1CmaCh04G008310.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmaCh04G008310Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB544
CmaCh04G008310Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB788
CmaCh04G008310Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB804
CmaCh04G008310Silver-seed gourdcarcmaB1288
CmaCh04G008310Silver-seed gourdcarcmaB1414
CmaCh04G008310Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0917
CmaCh04G008310Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0845
CmaCh04G008310Watermelon (97103) v2cmawmbB712
CmaCh04G008310Watermelon (97103) v2cmawmbB718
CmaCh04G008310Wax gourdcmawgoB0822
CmaCh04G008310Wax gourdcmawgoB0883
CmaCh04G008310Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB350
CmaCh04G008310Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB546
CmaCh04G008310Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB700
CmaCh04G008310Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB727
CmaCh04G008310Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB728
CmaCh04G008310Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB717
CmaCh04G008310Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB785
CmaCh04G008310Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB711
CmaCh04G008310Melon (DHL92) v3.5.1cmameB698
CmaCh04G008310Melon (DHL92) v3.5.1cmameB710
CmaCh04G008310Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB614
CmaCh04G008310Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB639
CmaCh04G008310Watermelon (97103) v1cmawmB654
CmaCh04G008310Watermelon (97103) v1cmawmB715
CmaCh04G008310Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB714
CmaCh04G008310Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB702
CmaCh04G008310Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB720
CmaCh04G008310Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB741
CmaCh04G008310Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB639
CmaCh04G008310Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB664