Cla97C11G224460 (gene) Watermelon (97103) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGGAAGGTTGTGGGGAACTCTGCCAAGATGGTTGTGGCTTTGCTCTTCCTTTTGGCCCTCATGCTTTCCATGAATGGTAATTAACAACACTATTTTCAGCCCTTTCCCCCACTTCTATTTATTTTTTTCATCTCAAACAAAACTTGGCCGCACTTACAAATTTTGAATGGTAGAAAGTACATAAAAAGAAACTTATTTAATTTGTGTATGACATAATTACTTATATTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTGCTTCTGTGACTTGGTGGCCACAGAGAAGCAAGGGGTGGTGGAGGCGAATGTGTGCGAGAAGCGAAGCAAGACGTGGTCGGGATGGTGCGGGAACACGAGCCATTGCGACCGACAATGCAAGAATTGGGAAGATGCCAAACATGGAGCTTGCCATGGTCCATTTTTTAGGAGGGCTTGTTATTGCTACTTCAACTGTTAAAAACCATGCAATAACCATATGATGATCATAATCTCCTTCTCCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATTTCCCTTTTACAACAAAAATAAATAAATAAAAGTTTGTGTGTTTTATTATGTAGGTGTGAAGGAGTCTATATGTAATATTAGTTTTTAATTAATGTTTTTAAGTTTAAGAAGTTTATTGTGGTTTGTGTGATAAATATATATGCTGCTACTTATCTTTGGCAGCTTGTTTGTGTGTTTCTTCTTCTTTACATCTTAATATTGAATAAAATGATTTAGATTACTCTCTCTTCTATTCAGTTATTTTTTCTCCAAAATCATAAATGTATAAAAATAAAATTTTCTAATAATTAACCTAAGTTTTAATATCAACATATCTCGTCGATAATTGATATGTAATATATATTCTTTTTATAATCGAAATGATTAATACTCCATATCTTAGTGGTCTTAGTGTGGTGTACATAGAAAAACTTACATAAGTTTCATTTAAAGCGAATAAAGATTATACATATATGTTAATTATTAATTATTAGAAAGATTTTCTGCTGGAATTTAACTTTTATTTTTTAAACTTCTTCTTTATGTTTTTTAGGGTTTTTTAATTACTTTTGTTATTTTGATAAATTCACTATGCCAGGTACAAGTCTTCTTAATCTGTGTTCTTTTCCTAAAAAAATCCTGTGTTCTTTTCCTAAAAAAATCCTCAATAACGGAGTCTAGAAATATTTGGAAGTTTTAATTTTCTAAAATTCTTAAGATGAAGAGTTGATAGTTTAAAAGTTTGAGTTTAATTTGGATATATTTTTCTCAATTTATACCCCAAACTTACTTATTTATTAATAGATTAATTTGTTGGGAATAGATTATTATGCCATCTTGATCTGATTTTAAATTATCTTTGTTGATTATGTTTTTCTTGTTTTTTTCCTAGATTATTTTTATTATATTCAAATCTATTTTTTAAAATTCATTTTTGTATTTATAAAAGTTTTATAATCATTTTGCTGTTCCTAAAGCTTTTACCATCGTTTTTTCTAAATAAAAATAGCTTTTGAGATTCTTTTCTCTGAAAATTCCTAGGATAGACAGGTCCTAGAAATATCCTAGAAATATTTAAAAGTTTTGATTTTTTTAGATTTCTTGAGCAAGAGATGAGGCAAGAGATCATATTATTTTTAAGAGTTAGAGATTTGATTTCAAGAAAAAGTAGATTTAGTTATTTGAAAAAGGAAACTTTCTTTAAATGGCTACTCTATAACAAATATGAGAATTTTTAATATTTTCTCACTCTCATGATGTGAAACTTTTTCCTAAATTTTAATATAGCTGATTGTTTCTACTCATTTTATGAGTTACAACTTTTCCCTTTTTTTTTTAATCATCCCTATTTGATAATATTGGCCGCTCTGCGTCATTTGATGCACGTGGCAAGAAAATGTTGAATCAAAAGTTAGTCACAATATGTGTGTATATATACATACACCTACGTACCTAACTGAATACTCTCCCTTCGGATCACATAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAAACAACTTAGGGTGGTTGGGGCTCCAACTTGGAATGAGTTGAATGTACAGATGTTCACAAGGCGGAGTGAGGACAAGGAAGCCCATCCCCTCCCCATGAAATTCCCTATAGGAATTAGAGAGGGGAGTTCCTATGGAGAATTTGCCAGGATCGAATTCTCTCATATAATTTTTTTTCATTTCTAACAAAGTTTAAATTTATTCTCAATCAAATAAAATGTTCTATATTAAATGGGTCATTTACAACAATAAATAATAAAAATTCAAATGTTTATTTATTTATTAAATTAAATAATATTTGGAACTAAAGAATCATTATATAATAGATAATATTAATTTAAACAAAATTAAAATATTAAATTGATATGAATGTGAAGTTCTAAATTTCCTAATAAAAGTACTTCAACAAGTATTTCAATTTTAAAGGATTGCTTAATTGCATATTCATGATTGTGTAATATTTTACTCATAAAACATTCTCGTTTATTGTTTCATCAGTTCAATTCTATTTTATTTTAATCTTTATTATTTTAATTGTCCAATTTTAATTTTTGTATTTTTACTAAATCTTAAAATTAGTTCTACAATATTAAATTTTAATAAAGAAAAAAATAGTTACTTATTTACAAATATAGGAAGAAATTAAAACTTACCACAAAGATGGCAATTTTATTTAGAATTTAAATTTAATTTCAAGTTTGCTCTTATTTTTTATAGAGATTACACACGTTTTATGAATGATATCACATATATTCATGTATAAGTTAAGTAGATATTAGTAATATTAGTCTGATTGAGATCCATGTATTGGTAATATTAATGGTATTAATGATAAAACTTAAATAGATATCAATGATATCAATCTATTAGTAATATCCATGTATCGATGATATTAGTGTACTTATATTGATGATCAAACTCAGTCTATCGATGATATCACTGATATAAAAAAAGCAGTGATATACCATGATATTCTCTTGTTAATTTATAAATTAATATCATTTTAATTAGTAATATATATATATATTTTGCCATATTAGTGAAAGTCATAGTTAATCTTCCTATAATGTGTTTTATGGTGGACAATGGAATCATAATAAGTTCTATGAAAATTACAAGACTATTAAAAATTAGTGGATAGAGATGAGCACTACATGGTTAATAAAACAAAATGTCACTTGATATCTTTGTATCACCAATATCTTTCAAAGCCGTTTTATTGTGCACTATTTTTTTGAAATTGTCAAGCACAGGTCTATCTATTTTAATGCAACAGTATGCTAGTAAATTCAAGGGTTTTAACATCCGATTTTGCCATTTTTGCATATAGTCTTAGGTTTTGCTATTTTTGTTATTGTATATATATATGCCTTATTGTGCTATCTATGCAAGGCTTCCCAATTTTGATCTATTGATTAAATAATAATAACAATTTTAGTAAAAAAGAAAAACTATGTAAATATATTTTCACAATTTATAAAGAGAATGCTAATAGAGACTGTATTGAAAAAAATCAACAATAAATTAACCATAAAAATTAATTTTCAGATTAATTAAGAATAGACACGGATTAACCAAGAAAGAAATCAAACAACAATTATGAATTATATTTGCACAAAGGTTTGGTTGGTATAACTTTGACTTTTTTTACCTAGACCATCTTGAACCGATCTCTCACACCTACCCACTCACACAATCATGTCAACTTCACTTTGTTAAACTTAAAAGAAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGAGTTATATAATATGAAATTAGAAAAATTAAATTTATTTTTGGTATGTAGTTGTTTTGTTTATCATGATTTACAACCTCAATTAAGTTTTTTATACATGGATACTCCATATCAAACTTTGTTTTTTAAAAAAAATTATTATAAATAGAAAAAATAACAATCTATTTAAAATAGACATTCATTTGTGTCTATATAGTAAAATGATAAATGTCTATATGGGTCTCTATTGCGATCTATCACAAATAGAAATATATTTATAATTATTTTTAACCATTCTTCTATTTTTTAAAATAGTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTGGGTTACTTTTAAATTTTCAAACTACAATGAACTCATTTCAAAGTGTAATAAATGATGAACAAATGGGTGGCCATGTGGGACTTGAATGATGTATCTGTCAAGAAACACATGTTAACGTGAAGTGAAGAGAGAGGCAATAAGTCACATATATATGAAAATTCTTTTGTTCTGTTTTAGTTTTTTAGTTAAACAATTATATAGTGAAGATTGAATTACACATCTTTGAGATGATACATCGATACCTTTATACACTAAACTACATATTTGGATTTGCATGCAAAGAAGAGTTATCTATGGTTAACATTTATTATACATTACACTTCTTCTTTCTATAATGAATTAAATAAAGTTTTCAATATTTCTTGCAATTTTAGAAAATAATTATTTTGCATATTAGATCTACTTCCCCAATAATTGTAACACACATCCACTCTCTTATATATATTTTAATGTGTTATTTAATCTTTTGAGCACGACTTTATTAACATGTCATTAACTTGAGATTGAAAGTTTAAATTTAGACAAAATTTCATAAAGAAAATTTAGGGAATAATTTTAGCATTACTATACATATAAATAATAATGAAAAGTTTGAATTTACAATAAAAGAGGTTGTTACTAATGTAAATCAACTAAATTATACTAAATCCGACTAAATAGATTAGAAATTTTACAATTCATAAAATAATATTATTATAATAAAAAGGGCTAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTGAAACTTGTTTTTTAAAAAAAAATACTCCTATTCTTTTAACAACGGCAATGTTACTTTGAAAATTTGAAGCTTGGAACAATGTGTCGGTGATAAAATGAAAATTTAGAACCCTAACACCAAACACAGCTAAGTCCCACAATTTCCATTGAAAATTCTTTAATTTTTTCTACACTGCCAAGAATAAAATATAGTGATGAAAGGGATAGAAGTGGGCAGCCTCAGGCTATAAATAGGTATCTTCATGGGGGGATTTTGCAAACACAAAATTCATAAAGAATTAAAAGAATAGAAATGGGGAAGGTTGTGGGGAACTCTGCCAAGATGGTTGTGGCTTTGCTCTTCCTTTTGGTCCTCATGCTTTCCATGAATGGTAATTGACAACACTATTTCAGCCCTTTCCCCCACTTCTATTTATTTTTTTCATCTCAAACAAAACTTGGCCGCACTTACAAATTTTGAATGGTAAAAAGTACACAGAAAGAAACTTATTTAATTTGTGTATGACATAATTACTTATGTTTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTGCTTCTGTGACTTGGTGGCCACAGAGAAGCAAGGGGTGGTGGAGGCGAAGGTGTGCGAGAAGCGAAGCAAGACGTGGTCGGGATGGTGCGGGAACACGAGCAATTGCGACCGACAATGCAAGAATTGGGAAGGTGCCAAACATGGAGCTTGCCATGGTCCATTTTTTAG ATGGGGAAGGTTGTGGGGAACTCTGCCAAGATGGTTGTGGCTTTGCTCTTCCTTTTGGCCCTCATGCTTTCCATGAATGAGAAGCAAGGGGTGGTGGAGGCGAATGTGTGCGAGAAGCGAAGCAAGACAGAAGCAAGGGGTGGTGGAGGCGAAGGTGTGCGAGAAGCGAAGCAAGACGTGGTCGGGATGGTGCGGGAACACGAGCAATTGCGACCGACAATGCAAGAATTGGGAAGGTGCCAAACATGGAGCTTGCCATGGTCCATTTTTTAG ATGGGGAAGGTTGTGGGGAACTCTGCCAAGATGGTTGTGGCTTTGCTCTTCCTTTTGGCCCTCATGCTTTCCATGAATGAGAAGCAAGGGGTGGTGGAGGCGAATGTGTGCGAGAAGCGAAGCAAGACAGAAGCAAGGGGTGGTGGAGGCGAAGGTGTGCGAGAAGCGAAGCAAGACGTGGTCGGGATGGTGCGGGAACACGAGCAATTGCGACCGACAATGCAAGAATTGGGAAGGTGCCAAACATGGAGCTTGCCATGGTCCATTTTTTAG MGKVVGNSAKMVVALLFLLALMLSMNEKQGVVEANVCEKRSKTEARGGGGEGVREAKQDVVGMVREHEQLRPTMQELGRCQTWSLPWSIF
BLAST of Cla97C11G224460 vs. NCBI nr
Match: XP_004150110.1 (PREDICTED: defensin-like protein 1 [Cucumis sativus] >KGN59894.1 hypothetical protein Csa_3G851940 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 2.3e-10 Identity = 39/43 (90.70%), Postives = 41/43 (95.35%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G224460 vs. NCBI nr
Match: XP_008454663.1 (PREDICTED: defensin-like protein 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 3.4e-09 Identity = 37/43 (86.05%), Postives = 39/43 (90.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G224460 vs. NCBI nr
Match: XP_022976615.1 (defensin-like protein 1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 9.1e-07 Identity = 33/43 (76.74%), Postives = 35/43 (81.40%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G224460 vs. NCBI nr
Match: XP_023535147.1 (defensin-like protein 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 1.0e-05 Identity = 31/43 (72.09%), Postives = 34/43 (79.07%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G224460 vs. NCBI nr
Match: XP_022935763.1 (defensin-like protein 1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 5.0e-05 Identity = 30/43 (69.77%), Postives = 34/43 (79.07%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G224460 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0LFX9|A0A0A0LFX9_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G851940 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 74.3 bits (181), Expect = 1.5e-10 Identity = 39/43 (90.70%), Postives = 41/43 (95.35%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C11G224460 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BZX7|A0A1S3BZX7_CUCME (defensin-like protein 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495015 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 2.2e-09 Identity = 37/43 (86.05%), Postives = 39/43 (90.70%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |