Cla97C11G224430 (gene) Watermelon (97103) v2

NameCla97C11G224430
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr11 : 30137317 .. 30146990 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCAATAGTGGAAATGGGTATGTAAAGAAAAATGCATTTGTATTCTACTGATTATGTGTAAAGAACTAGATTCACATAACCCTAATTATTTTTTTAGGGTTTGGAGATTATATATGCTTGTTGTATATTCATATACTTGTTATATATATAAAGATATGAAAAAATTAATATATAGTTTGGTTTGAATTCTTTATTGTATCTAATTACATTTGGTGATACGATATCTGTTATCTTTCGAAAGATTGATGATTTGATCTCACCCACCTATAATTATCGTTTCTTGAATTTAGAATAATTGATTTAAGAACAAACACGAGATGATAAATTCTTACTAATTATTACTTCGATTGATTGAATTTTGCTAGATAAGTTATTGGGGAAGAATAAATAGAGAAATAAATTTCAATTTCACATTTATATTTTAATCAATTAAGGTCATGTTAACTAGATGCTAAATCTTTATAGATTTGATTAGGTAGAGTTATTGGATTTTTTTTTTTTTTGTTCTTATGCTTAATTTCAATAATTTACTTAGCTACCAAACGAAACAAAATAATTAATAAAATGAATTAAGGTTTCTTAAATGCTATTAAAATTATATAAGAAGAACAATAATTCTTTGCATTAAAAAGGATATACAATTAATTAGTTAGACAAGAAAATTTCTCATATTCCTCCAATCACTTAAGGGGAAAATATTAGAGGTACAACACAAAGCTGTATTGTTATTTTATTTGAAGTAATTAATATAACTCTTTTTAACATTATAAAAAAATAACAATTAAATTAAATTTTATATTAATTATTTGCCACTTCTCTAAATGAATGGGTGTATTTAAGTGGAGGGAATCATTCCTTTTAGAAGTAACATCTATTATTAAAGTATTTTTAAACATTTGATGCTGCATGTGTTTGAACCCTCTTTTTGGCCCACAAAATTTGACTTGTGAATTAGGAAATGAAGTTTAAGCTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATAATATTCCTCTTAGTGTTGATGAGTCATTATTGGGTTGGAAGTGAAAAGATGTGATTTTAGAATCAAATAATAATTTATTAAAATAATGGGATTCATTTTTTTTCAAAGTAGTGACAAATTAGAAAGACTTTAATTTGCTGTATTTCTTTGTCTATATATTAATATGTATACTATTGATTCCTTTCGCCTATTTTGTTAAGTTATGATGCTATATCTTGAAATTTACATAGCTCAAATAGTTGATTTTATCCGCCAATCATGGCATTGAAAGAAATTAAGAGGAGAGATTAGTGTGTTTGACAATTCGAGTCTTCTTATTTCTATAGAAATAAGTTTTGTAATGGTAATTCACTAATTAACTACTCGGGTCATTAATCAAATCATTAATAACTATTATGAATGATTTTGCCTTCATAAGGTCGGCCTTAACCTTCCATACTTGGCCATTATTTTTCTCTCATGCCCAAGACCCTATGAATTGGCCCTCATAAAGTCTCTGGAGTTGGCCTCTTTGGTCTTCTTAACTTGCATGATTGACCCTTGGAGTTGGGCCTTCATGGTTCTTGTTGATCGTATGACATGAATTGATCTCTAGTCATTATAGTTGAGCATGTGGGTTGATCACAAACTTAACCAAATAAAACACTTCTCTTGAAATATTTTATTGTGTCATCCCCTATGATTAAATACTTAGACATATTTTTTAAGCACAACCTTAATCATAAGAAAACCATAGAGATCAAGTGGTGTAAACTTCAAACATTTTCTTTTTAGTTTTGTTAGTTTAAATTATGACTAATGATCTTGTTCTTCTTAAAAGTTTAAGAGCTTGTTTACTAGTAAGAGTTTCACTCTTGTGTTAGTGTTTCATCTCTTAAAATTAGTTTAAAATTTTATTGGGGTTGCATAATAATAATTTTCTTTGCAACAATTTGAGAGGTAACAAAGGTTGGTAATTGTTCATTGTTAATTGAATTGAAAATTTATACAATAAATAAAAAAAAAAAAACTCAATAATGACAAATTTTCAAACAGTCATTGATCCCCTTTCTTTGATGGTCGAATTAAGAACTAAAAAAAATTAAAAGTCATGTCTATGACAGTTTTTTATAGCCATGAAAACCGGTTTTTGTTGGAGTGCATATGACTCACACATTTTTTTTTTTTTTCTATATTGAGAATTGTTATGAGATAATATAGTATGAATTGAAAACTAAATTAAATAGTTTTAAAACTTCTAAATTTATTTTTCCATGGATATATTTTCAAAAGAAAAAATGGAATGAAATATAATGTTAAAAAACGCCAAAAGTGAAAGAAAGATGAATTAATCAAAATTTGAAGGACTTGAAATAAAAGAATTAGATCCCTCTCAATCTTTTGAACCAAAAATAACAAAATCAAAGAGATGGGTGGATGTCATTTTCTTTTGATTAAGACATTGAAAGATATATTCCATAGACTTTGAGGTCACAAGAAATTAGCCTCTCTTTTTTTTATATATAAATATAAAAGGAATAAAAAAAATCTCATATATATCCACCCCATTTTTATCAATTAATTAATTGCATATCCTCTCTTCTAAGTAAAGCCTCCAAAACTACTTTTCTAAAACATGACCCAATTGCTTCTTTCTTTTGGAATTAGATATACATCTATCCACTATCAAAGTTTTTCTATCCTACTCATGCATGTATATATGTATATATTAAGATATGTAAATTTACATTTATGATTTTTTTAATATTTGTTTTCCATATTTCCATACAACTTAGAGTAGTGTTAGCAATAAGAAAATTTGGAACTTTATTACTTTTGGTTCACTTGGTTTTATATTACACAAATATTGTGGTTTATTATGGGAAAAGAAGGTGGTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTAATATTTTTTATGATTTGACAAAATAAAAAGTTGAAAAATTATTTTATGTGATAAAGATATTCAAAATATTTACAAATAATAGTAAAATTAAAAATAGTAGTCTATCGCCAATAGATAATATAATTTTGCTGTAATTATAAATATTTTGAATATTTTTTAAATTTGAAAACATCCCTAAAAATTTTATGGATAAATTTATTCACATTTTCTTAAAACTAAAGAAATTAAAATTAAAAATTTATAGTATTATATACTTGAAATATAAAATGAATGACGGCCCAATTTGATATTTACGTATTTTTCATTTTTACCATCAAGATTGATGAACTTCCAAAGTTATCCAATTTAAGCTAGATTTATTATCTTAAAGTTTGATGGTAACAAACTATTGAAGTATATATATGTGTTTCTGAAATATAGCATTGAAATTCATTTCATCCTTTGATCTTTCTGATTCTTTTTTATAAGCCATGAATCTTAACATGGTGTATTTGTAGCACAAATTACTAAAATGTAGATTGAGTTGTAATTTGCTGTTATATTTTTAAATAATTATTGTGTAAACAAGTTGTTTATTTTGGTTTGAAAATCATCAAATTTCAACCGTGAAATAATTTCTCTTTAAAAAGAACAATGAGTTAATAACTATGATCCGTGGCGAATTTAGAATTTTCAATGAGTTAATAACTACACAAAAATATTAAAATGAGTCAATAAATTTAGATTACATTGTAAACTATATATTCATCAACTTTCAATTTTGTATCTTATAAATCATTGAGCTTCAAAAAGTTTAATAAGCCTTTAAACTTTTCATTTTATGTCTAAACGTCTTTGACATTTATGCTTTTCTTTTTTTAATATAATTGATCTATTAGACATAAAAATTTATGCATGATGAAATATGAACTTTTAATTTTGTATTTAGTAGATCCATAAACTTTAAAATATATGAAATAGCTAAGGACTTATGTTACTGCGTTATGATTGACTAATTTTATTATGGGCAAAACTTAAACAACATGTCATATATTATGTTAGCAACATGTTACATGATGAATAGATTTGGAAGAATCTTTTTTTTTTATATGTTAGACTGTATTCCAGATTCGGTGGCATGCCTTCTTTTCTTGCATAGATTATTTGTTCCTTCCTTGAAGATAATCTTCTCAAAGCTATATATATTTATTGTGGTTTTATTTATTTTTTAGGGTTAGCCTCTTTATTTTGAAGAGTATAGGGGGTTAAGGGTTTGAGAGTTTGTTCAAAGTAAAATACTTTGAATGCATTGTCTTTAATTTGTGTGTACCTCACTATTGAGGGTGTTGCCAATTGTCTTCTAAACTAGCTTTGAGTTTAATCATTGTTTATGCATGTCACTGTGAGTGAAGAAAAGTTTATCTCATACTGAAGGGGAGTCTAAGTTCCATTGCATTGAGAGGATCTCATACTAGCTTAAGAGAAGAGTTTGTTCATGAACGTAAGGGGAGTTCACATTTAGGGGGAGTCTAAGTACATTTTATTGAGGGGATCTCATACAAAGCTTGAGAGATGTTTTATTATGGAAGTGAGGCTGGGAGCTCAAATTTGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTAAGTTCAAACTGAAGTACTGTAAACTATATATGTGAGTGACAGCTAAAGAGTGAGTCTATCAGATAAATACTTTGTTGTAATTGCTAAACTCTTTACATAGTGATCCACCAAGCACACAGTCCCCTAGACGTAGGTGATATTGCACCAAACTAGGTTACTAATCTTTGTGTCTCTCCATCTCTGCTATTATTGTTTTGATATTTAATATACTATTGATATAACTGTTGATAATCTTGAAAGTTTATTGGTATGTGATATATATTGTTGATCATATACTATTGACATTCTTGAAGTTGCTTGATATGTAACGTCCAAGTTTATAAAGGGTACATGAATGGATCAAAATTACATCTGAATTAGAGAGATTGTGAGGATATGGAAATGTAGTTAAGAAATGTTTAAAAGAATTGAAAGTTACTACCTATAGC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mRNA sequence

ATGTCAATAGTGGAAATGGAGAATTGTACTTGGTTGCATGCTTGTCTTACTAGAATGGATTCACATAGCAAAGGCAAGTGGGTCAAAATTCTCTGTCAATCAAAACATGACGCAAGGGCATGCGTGGTTTTGTTGGGAGTTTGGGAATGGACCATAATTATCCCCCACCCACGTGCACCGCATGCTTTGCCTGATTTCTTCCATACCCTCCTTTTTCTTCGCCTACATTTTAGACCATTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCAATAGTGGAAATGGAGAATTGTACTTGGTTGCATGCTTGTCTTACTAGAATGGATTCACATAGCAAAGGCAAGTGGGTCAAAATTCTCTGTCAATCAAAACATGACGCAAGGGCATGCGTGGTTTTGTTGGGAGTTTGGGAATGGACCATAATTATCCCCCACCCACGTGCACCGCATGCTTTGCCTGATTTCTTCCATACCCTCCTTTTTCTTCGCCTACATTTTAGACCATTGTAA

Protein sequence

MSIVEMENCTWLHACLTRMDSHSKGKWVKILCQSKHDARACVVLLGVWEWTIIIPHPRAPHALPDFFHTLLFLRLHFRPL
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C11G224430.1Cla97C11G224430.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Cla97C11G224430Watermelon (97103) v2wmbwmbB068
Cla97C11G224430Silver-seed gourdcarwmbB0155
Cla97C11G224430Silver-seed gourdcarwmbB0998
Cla97C11G224430Silver-seed gourdcarwmbB0321
Cla97C11G224430Silver-seed gourdcarwmbB0945
Cla97C11G224430Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB024
Cla97C11G224430Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB185
Cla97C11G224430Cucumber (Gy14) v1cgywmbB199
Cla97C11G224430Cucumber (Gy14) v1cgywmbB583
Cla97C11G224430Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB020
Cla97C11G224430Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB219
Cla97C11G224430Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB410
Cla97C11G224430Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB454
Cla97C11G224430Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB008
Cla97C11G224430Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB203
Cla97C11G224430Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB393
Cla97C11G224430Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB436
Cla97C11G224430Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB023
Cla97C11G224430Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB197
Cla97C11G224430Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB022
Cla97C11G224430Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB194
Cla97C11G224430Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB023
Cla97C11G224430Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB193
Cla97C11G224430Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB169
Cla97C11G224430Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB272
Cla97C11G224430Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB137
Cla97C11G224430Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB310
Cla97C11G224430Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB149
Cla97C11G224430Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB321
Cla97C11G224430Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB064
Cla97C11G224430Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB179
Cla97C11G224430Watermelon (97103) v1wmwmbB117
Cla97C11G224430Watermelon (97103) v1wmwmbB358
Cla97C11G224430Wax gourdwgowmbB562