Cla97C06G115290 (gene) Watermelon (97103) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTGGAGGCATCGGCCGGCAGTGGGCTTGGGCTTGGCCCTCGCGTGGGTCACCGGCCTTCTCTAACCACTTTTATTACTTGTATCTTCTTTTCCTCTCTTACCTTCTTTTTGTAACACTCTTTTTTTCTTTTTTTCTTTCTTTGTAAAGTTAATAATTTAAAGTGATCTTCCTTTAAGTTTCCTTTTATTTTTCTTTTCATTTTTTATTTTATTATTATTATTTTTTTTGTTGTAAAGGTGATACAAAGAGAGGGTTGAATAAGAAAGTATGGTTGGGGGGAAGAAGGAAGGAAAGAGAGTGCGGAAATCCATTTCTTTTAGTTTAATCTAAATTAAATAAATAATAAAGTGTTAAAATTATATGTTTGCGGGTTGCGAGTATATTGCAACCAAAAATCACACATTGATTAAGAAAAGAGAAAATCATGAGTGTATAAGTCAAAGAAAACATCTCTATTGGTATGAAGTCTTTTGAAACTAAATAAAAAAAAAAAAACAAAGTCACGAGGGATTATGTCTAAAATAATCAATGTCTTAGCATATGGTGAGAGAGGGGATAAGTTGTCTCTAACAAGTGGTATCAGACTATCAAAGTCATGTCACTGACTTATATAATAATGTTAATCGAATTCTTAGGAGCCAGAAAAAAAAAAAAAAAGTGTGGTGTGAGCCTTAGAACAAGGAGGGGGAGGCTCCTCCATTTTATACTTTATTCGAGGGAAGAATTGTTGAGAGTGCAACCAAAACTCCACATTGGCTAAAAACAATACTTTCCTGTTAGCTGGACAATAAGAAACTTTTATTGCCCTACCACCCAGTATAGTTTTTGACAAATGGGGAGAGGAATGTATGAAAAATTTAGACCCGGTTCAATAACTATTGGTTTTTTATTTTTTGTTTTTGAAAATCAAGCTTATAAAAACTATTTCAGCCTATAAATTTTCTTTGTCTCGTTTTTCATTTTGCTTTTAAAAACTTATTTTTACTTTTAGATTTTAACTAAGAATTCAAATGTTAAGTATTTTTTTAAGAAATGTGAGCACCACAATATGAAAGTAATTGAAGAGAAAATAAGTATAAATTTCAAAAACTAAAAACAAAATTGTTACCAAACAAGACCTTAACAACTCAACAAGTGCGTATTATTCCAAAAATCATATAGTCAATATGTAAATTAAAACATGACTTAATTCAAAATTCAAAAACTCGGAAAGGTATAAATATGAATCGACTCAAATATACCAAATATATAGAAAGTTAGAATGTAAAATTTTGTCCTCCGTCGTAGACGAAAAGGCAAAAGTCTTGGGAGATAAAGGAAAATGGTGTGGGGTTAACGAAAAGTTTTGTTGATAAACAGATAAGGTTGGAGAGTTCATGTTTACTTTGTTAATGGCAGGCAAGATTTATCTGAAAATGAGGTTTAAGTTGAAATTGTAGAGAGAGAGAAAGAAAAAGCCATGTGAAGTTGAAGAAAAAGTTAGTCCCTACAGCTAAGAACAAGGCTCTCTCAACTCAAAGGACTTAAAAAAAAAAAAAATTTAAATCAGAAACAGAAGATCTCATTGAAAAGAAAGAGAGAGAGAAGAATTTATTATGTATAAATTTGGGCATTTGGGTTGTTGGGAAATGGAAGAAGTGATACACAATTTAGAAGCAAAAGAAAGAAAGTTATTATATATATTATTATTATGATGGGAAAGAGATTTGCAAAGTGGAAGCAAATGGCAAGACAACAGAAAGGGAAGCTTTATATTATGAGGGTTTGCATCTCCATGCTTCTTTGTAGACATAAGTACTCTCTTCATACACCAACCAACAACACTTGTACTTTTACTTTCATTTAGGGTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTCTTCTTCTTTTCTTTTGATCTCTCAAACCCGATATCTCGTTTAGATAGGAATACGATGTAATTCTCAAGAAAAGTACTCAACTCAATGTCGTCGTTTTGGATAATAATGCATTACGACTGTTGATCATGTTTCTCGTTCAAAATGATGAGTTTGTGTGCAAAGTTGATATAAGTATGGTTATGTTTGTAATGTTGGTCTATCTAACTTAAATATCTTTAATATTGATGATCTGATCATTGAAGAAAATAAGTTAATAACAAAGATCGTCGCGATGTAGCCGGTAGGTTTTAAGATCATTTAGTATATGAGATCACAAGGAATTACAAAATGTATTTTTTCGTCCATGTTTGTATCAACTAACTCATGTGCAAAATTCATACAAATATTGAAAAGACAGTCGTTAAAAAAAAAAAATGGTTATAATATAATAAAGATGGTCATGACGATGTAGTTGGTAGGTTTTAGAATTACAAAATGTAATTGGTACATGCGCAAACAGCTAATAAATTTTGAATTTTTATCCAACGGTCATTAAGAACAGTTACATTACGGCGGCTACGTTCTATAATTTTACATGTTGGAGAGGTGAAAGAGAGATTGATTATATAATATATATATGCATGATTGGGGCAGCTAGGGGAGACAAGTTTCATGTGGGTTTGTCAAAACTTTAGTTGAATCAGACAAATGCCAATGAAATTGTAAAGCCAAATCATATATATATGATTGCATGAGGAAAGTAAAGGGTTTAATAATCACCGACATGTCGAAATAATGTTCATCAAACAAGTTCACTATGTAACGTAATCGTATCAAGAATGAGTTTAAAATTTATAACTTGACAAACAGATATCTATTATAGGTGTTCAAAAAACCCGACCAACCCAATTTAATCTATATGCTCTCAGTTAGGTTATCAACTCATTTGGATTGAGAATAAATGAAAATTTTGTGAGTTATGTTGATTCATAAGTTTACCTAAAATAACCTAAGTCAACCTTAATTTATTATTAATTTTAAAAAGTATGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTCTTATGATACAATTATATAAGCATATATTTATATTAATTTTATTTTATATCATTATTTTTTAGATAATTTATTCTTCAACGACTCTTAAAAATAATGTGAAAGAAAATTTTCATAAAGTAAGATTGAAATTGAGTTGTTAGTTTTAAAACAATAATATAAAAGTAATTAAATAAAATTGGTATATATTAACACTTTACTTATTTCTAGAAAAAAAATTAAATAAATGACCCGAGTAATCCAAACCAAGTAATCAACCCAACCCAAATGTTTTATGGTTAAATAGGGTTGAGTTCATTATTTAATAAAGGTTATTTGGGTTGAAGAAACTTATAATCTGAAATTTTTCATAGTCTTGAAATAACCTTATTTAATAACCACATAATTAGTTTTTCTAAATATGATAGGGTGGTTATTAAAAAAAAATGAAATAGTATATCAAAGCAACATTCAAAATGAAGTAATATATAGAAATCGTTTGGATTAATTAAAAAAAATATTTTTAAAAGGTTTTCTTCTTTTAAATACTTTTTATAAAATCTATTTAAAATAAAGACATTAATGACTTTCAAAATTCATTTTGAGTGGCTGCGAGACACATGTAATTCTTTCAAAAAAAATTATTTTTTTAAAATTAAACATTTGAAAAGATATTTCAAACACATCCATAATTGAGCAATTAGGTAAGAAATATTTTCTCCATTTACAATTAAAACGTTTGAGGAAAAAAAAAATTAAGGAGTATAGTAGAAAGTTAGAGCCTCTATTTTACGATCATATGGACAAAAATTAGTGTTGAGATATGAATATAGAAGAAATTTAAAAAGCTAAGAACATTTGTTTTTTCAATAGATTTCTTGCATTTCCTTTTCATTAATCTATCTTTTTCTTTTGTTATTCTTGTAGCATTTTAGCCTTTCAATTGACAATTTTCCTCTCATTAATTTACTCATCGCATAAACACTTTTCTCGTGCTTGAGTTTTCATAGTCAAAGAGGTGAATAACTATTACTAGTAAATGAATATTTTCATAATCGAGATGGTCACAATTAGTTTAAATGTGATTTGCCAAAGTATATGCCTACCTATAACCTTATTAAAATGATCCCATGTTCTATATTGATGAATTTGTTATTGATAGTAATCTTATAAGACACATGCTTTAATGAGCTACCAAAAACATAATCAAAGAAAATTTCTTAATTTTTTTTTTTTCAATTTTGTTTAAGAAATGGGCAATCTTAACTTTTCCTATCTGCTAAATATGAGGGCAGGTAAATTTATAGAGAAATTATCATTGAAAAATATTTAAACTTAAGGACATTAAGGTTTTGTTTGATATTGCTAGAGCTTTTAAGATAATTTTACTTTAACCATAAAAACGCAAGTAACAATATTTGAAAGTTCAACCCTAACTTGTTGCGATTGGAGGGTGTTTGAGACTCCAACTTTAAATGATAGAGTGGGCTATTATAGCTCATTCCATGTTTAGTGCTCTAATTATAATAATTGGTGTTGCCGACTATTATAATCTACAATTAATTACATTATTACTATTTTAAATCTCTCATCAACACAGATTATCACTACAAGAAAATATGTCTATTGCAACTATCTTTTTTTGCAGCAGTTCGACAATTATAACACTGCGACATTTGTAGCAACACATGACCAAACCGCTGCTTTTAATACAAACTTGCAACAGTTTCACAGCGTTTATTAAAGTGTCGTGATAGAGATTCAATTAGAATGGTTTTACCAACGAAGTATTTACAATATGTTTATTGCGACACTTATGTTGGAACATTTATTTTTAATGTCGCAATAGAGTCATCTGCAACAGTTAATTTGCAGCAATTAGTACATCGCCACGATAGTTTAGTGCAATTGCAACAATTTAATACCAACACATAAGACCACCGTTGCAATAGGGATCAAATTAAACTTGGAAAATCTGATATTTTTCTTAAAATAAAATAAAATCTATTTTACTTCTTTCTATTTTTCTTAAAATTAGAAAAAGGAAATAAGAGGAAAACTAAATAAAGAAAGAAA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BLAST of Cla97C06G115290 vs. NCBI nr
Match: XP_025676860.1 (uncharacterized protein LOC112776811 isoform X3 [Arachis hypogaea]) HSP 1 Score: 146.0 bits (367), Expect = 1.6e-31 Identity = 71/181 (39.23%), Postives = 116/181 (64.09%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. NCBI nr
Match: XP_020995981.1 (uncharacterized protein LOC107483955 [Arachis duranensis] >XP_020995982.1 uncharacterized protein LOC107483955 [Arachis duranensis] >XP_020995983.1 uncharacterized protein LOC107483955 [Arachis duranensis] >XP_020995984.1 uncharacterized protein LOC107483955 [Arachis duranensis] >XP_020995985.1 uncharacterized protein LOC107483955 [Arachis duranensis]) HSP 1 Score: 142.1 bits (357), Expect = 2.3e-30 Identity = 68/181 (37.57%), Postives = 114/181 (62.98%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. NCBI nr
Match: XP_025676857.1 (uncharacterized protein LOC112776811 isoform X2 [Arachis hypogaea] >XP_025676858.1 uncharacterized protein LOC112776811 isoform X2 [Arachis hypogaea] >XP_025676859.1 uncharacterized protein LOC112776811 isoform X2 [Arachis hypogaea]) HSP 1 Score: 137.1 bits (344), Expect = 7.5e-29 Identity = 73/211 (34.60%), Postives = 118/211 (55.92%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. NCBI nr
Match: XP_020088912.1 (uncharacterized protein LOC109710609 [Ananas comosus]) HSP 1 Score: 136.3 bits (342), Expect = 1.3e-28 Identity = 72/218 (33.03%), Postives = 112/218 (51.38%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. NCBI nr
Match: XP_025627534.1 (uncharacterized protein LOC112720705 [Arachis hypogaea] >XP_025627535.1 uncharacterized protein LOC112720705 [Arachis hypogaea]) HSP 1 Score: 136.0 bits (341), Expect = 1.7e-28 Identity = 72/211 (34.12%), Postives = 118/211 (55.92%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1R3HY01|A0A1R3HY01_COCAP (Uncharacterized protein OS=Corchorus capsularis OX=210143 GN=CCACVL1_16302 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 133.7 bits (335), Expect = 5.5e-28 Identity = 66/213 (30.99%), Postives = 112/213 (52.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0R0KFS3|A0A0R0KFS3_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max OX=3847 GN=100795315 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 2.1e-27 Identity = 76/216 (35.19%), Postives = 114/216 (52.78%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. TrEMBL
Match: tr|K7KDP3|K7KDP3_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max OX=3847 GN=100795315 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 2.1e-27 Identity = 76/216 (35.19%), Postives = 114/216 (52.78%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0B2Q4D2|A0A0B2Q4D2_GLYSO (Uncharacterized protein OS=Glycine soja OX=3848 GN=glysoja_045069 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 2.1e-27 Identity = 76/216 (35.19%), Postives = 114/216 (52.78%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2R6Q6L1|A0A2R6Q6L1_ACTCH (Bromodomain-containing protein OS=Actinidia chinensis var. chinensis OX=1590841 GN=CEY00_Acc21281 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 129.4 bits (324), Expect = 1.0e-26 Identity = 69/219 (31.51%), Postives = 111/219 (50.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. TAIR10
Match: AT1G40087.1 (Plant transposase (Ptta/En/Spm family)) HSP 1 Score: 78.6 bits (192), Expect = 5.8e-15 Identity = 57/212 (26.89%), Postives = 93/212 (43.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C06G115290 vs. TAIR10
Match: AT3G30200.1 (Plant transposase (Ptta/En/Spm family)) HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 1.3e-14 Identity = 58/212 (27.36%), Postives = 94/212 (44.34%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |