Cla97C05G092350 (gene) Watermelon (97103) v2

NameCla97C05G092350
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr05 : 10424788 .. 10434138 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGCAAGCGAAATTGCTACCGACCTATTTCCGTGTGCGTTACGTGTATGAATCTATATAGTAACGTATGGTAGAAGCGGGACCATGCTGCTGATCCAGAATGGGAAAAGATAAAGAATACGGAAGAAGAAATCGAGCGGTAGACGACGAATGAAAACCGCTGGAGATTGTGGACTGATCGGGCAGTGGGAGAATTGAGAAATTCGAGATTTACGGCCAATCAGCTGCTCGTGAAAATGCCCAAAGCCGGCTGAGATTTGTAAATATCGAAGAGTTGACGTAGTTGAATGGGATATTGTATATGAATGAAACAATGATGGAAACAGAGTAAATATGTACCCATAGTGGAAACAAGTTAGATGTACTTTTCATAAAATTAGAGACTGAAATTAATGTGTCAATCTCCTCAAAGATTAGTTGGTTGAGTCTTTCTCATTTCTAATCTTTTAAACTTAACTAGTTATACATGTTTATTTGTAAATATTTGGACTTATTTTGCTATCTTTATTTATAAATAAAATAAAATGAACAAAAAATTATAATTATAGCAAATTTTATTGTCTATCATTGGTATTCGCAAATGTTTGTCTATCAATGTAACTGAGACGCTAATAAATGTCCATTAGTAACATTTTACTCTATTTTTAAATATGTATAATAGTTAATACCTAAAATTTTATATATGTAATAAATAAATAATATCTAAACTTAGTACATTTATCGGTATTAGTGAAACAAAGATAGATATCTATCAGTGACATTTTACTATATTTACAAATATGTCTAATACTTTTGCCACTTAAAACAATTACCCAATATTTTTTTATATATAATAAATAAATAATATCTAAACTTAATTTTTACGATCCTAAACCTTTAATAGTAATAAAATAAATTGTTTTTAAAACTACCCAGAAGGTAGACATCAATGTATTTTATTATAAACAATAACTTTAAAATGAAATTTGATCCTATATGTCTATATATACACTTGTTGTCTATCACAAAATTTTGTGTCTCATGTCACTAACTTTTCTATATAAAATTTTATCATAATAATTATTATTATTATTTTAAATTCTTTTTGTTACTCTCCCTAATACTTTTTCGTTAAAACTTTGTATCATTCTAACTTATTTTCTCTGTAAAGCTTTGTTTTTGTTGGGTCATTCTCTTATTAATTTTTTTTTTTCTTTTTTACACCTTCCAAGATATCATCAAAATTTTTACTAATTTACTACTTAACAAACCTTCCAATTCAATATTAGTCTTAAAACATACTTGAAAAGACCAAGATGAGATTCAATTTATAAAAAGAGTAAATAGTAAATAATTTTTTTCTAAGGGCAATATAATTGTATTAAGTTAAAGAAATTGGTGAAGAACATAGAACGCTGGAAGGAAGTTAAAGAACGTACTTGTGAATAATTTTTTGAATGTTCTTGCTTTCGTTGAACTTCAAGAGAACCCGAAAATCGTTTTTAAAAAATGTAACAATAATGGGGCATTATATAATATCACCACAAAACTTCGATACTCCATAATAAAGCACATGTGTTATAATTTCTTAAGTTACAAACGATCAGACAAAATTGGAGACAAACAATAAAAAAGGAAGATGTCCATAAAAAAACATGTGAAAATGCATCAATGAATTAGTTTGCATTTTTGTATATAGACACTTTTGGTTGTTTATACATGGATTGTACCCATAAATAAATGGATGCACCGGTTCAATGTGTAACCACTTCTACCCCAACAAGTATGTCCCATCAAGAGCAACTGCTCCTATTGGAATTAAAAGACACTTACATTCAAACAATCACGTCCTATCAATGAATTGCAAAATAACTTAAAAGGCACATACATTCAAACAATCACGTTCCATCAACAAAAAAAAAAAACAAATATAGACATGCACTAATAATGTAGGGGCGAAAAAGAAAAGGAAAGATTCTCCCCTTATAGCCTCTTTTATATATAGTATAGATTAATGTTTGGTTAGATATGCAAATATAGACCTGTACTAATAATTGTGAGTCTAGTTTTTTTTAAAATGTCTGGATAGTTAATTTTGTGTTTGGATATGCAAGATAATTAATGTCTATGAAAGAGTTAGCAACATAGCAGCAGAAGTAATTAGGACCTAAAGCGCTCTAATTACATCAATTTTGAAGATTAAGCAGGTTTATTCTAAAACCGGAAAGCTGAGGAAGAGAGCTTACTTGTTGTAGCTCAAAATTGAAGATGGATTCTTTAAATTTCAAATCACGAACACTTCGTGGACAACCTCTAGTGTCTTGTTATTCTCAGACCTTAGAATGGATTGTGGGATCTAAAATTGAGTTCAATTTGGAGCATAAAGCTGAAGAATATATTGATTTTCCTGATTTTGACTTTGAGAGAGTTTTTGCACAAAATAGCAAAATTATTTAACCTTAATCATCAATTCCTCTCATCTGCATAAAGAGGATAGCATGCAGATTGAAACAACATGCATGAAGACAATACAAAGGCTGATTAAGGTGTTCAATTTGGAGGTAGAAGATGATAGTGGATATGATGTTTTGCATGAAAAACACCACCACCTTAAACATACAATTAATGGAAAAATCCATTTTCCAAAAATGGATTTAATATTCAATTTCCTAAAATTGAATTTAATTCAAAATTAATTTCAAAAATTAATCTTAAATAAAATTAATTTAATTAATATTTAATACTAAATTAATTATTTGTCCACTTTTTTCCAACAAATTCCAATCTGATGAATCTTTATTCATCCTAAAAATATTTATATCACGTCTAATTCATAATTAAACAAATAAACTGTATAAAATTCGCTCCACAACTGAATTGAACATTTCTAATTCACTCAATATAATGTTCTAAGGTTTATCCATGAGCTAATAAGGGGATCTAATGAACCTACAGATCATGAGCTCCAACGATCCAAAATTAATCAACTAAACTCTTTAACCTAGTTAATTAACATTTGTTAACTATCAAGTCACTCCATTAAAGCCTAGTAGTTGCACTCTCCTCACTGTAAATATATTTTTGTCCAATTGATATAACCATAATAAGTAAGTCTATCCTTCACAAGTAGTTCGTAATTACAGTTTGGTCAAAATTACCGTTTTACCCCTGTAATTACATCTCGTTCCTTAAGTCTCAAAGATCCTCTAATGAACAATTGATTTGTGGTCCAACCAACAAACCTAGTCCCTCTTGGGCCAATGAGAGGGTGGAGCCCTTGTTCAAGTCCCGGAGTCAGTACTTAAGGGAACAACTTATCTACTAATCTAGAAATAGGTAGAAGTGAGTTTCATCTTACAAGACTATGTCCCTAGCTATCTATCTGATCTTATCCCTAAAATGGGAGGCATATTGAGTTGGAAAACTTAGGCAACTTTCACCTATGCAGATTAAAGAATAATCTCAGACAAACTTCATAGTTAGCTCAGAATTTAGATCGAGTTACCTAGGTCATCAAGATTTGAAATAATCAGTTTTAATAGTAAATAGTATTATAAAGAAAAAGTGATTATCTCGTGGTTTAGTCTTATGCAAACTCATTGCATAAAATGCCCCCACTCACATATCTCTACATGTACGATATAGAATCACATCATTCGTATCAAATACAAAGTGAGCCGTATCCATAGTGTCCCTATGATAAGGTACCCAACTTTATCCTTATACTATAGACCGTTTTGGCTATTACTTAAACTTGATCCACTTTTATGTCTACACAGAAAATCTAGGCATACAACTTATAGCCAAGGGTTCTTAGTTTATTGGATATAATAGATGCAATTTGAATATTCAATAACAACTTTAGTGAATAAATCTCAATAACAACTTTATTGAGAATAAGTTTCAAATAGTTACAAACAATGAGTACCCAACAATCTAAAGTAAAACAAGTGTGTTTGATTTACCAATTTTGTATGTGGAAACTAAAACAAAATAATTACTTAATTAAATACAAGAGACTACATAGTCATCAATTAAATTTAGCATTATTAAATATATTGTTATAATAATTAATTATTTAATCAATTAAAATAAAAATAAATGAATATGTTTATATCAAACATTTATTTAACATAATTTGTTGGAGATCCATTGGTTGGCTCTTTGTTATTTTAAATCATTGAAGATTAATTCTATCTTAGGGGAGCCTAAGGTATTGCTGAAGAGAAGGGATTCTCGGTCTTAGAGGGAGCCTAAGATTTTATTCAAGAGAATAATTTCTGCATCTTAGGGAGGACCTAAGATTCGTCCTTGAAGGGAGTTCATTAAGTTACGAGGAAAATAATCAAGTGGAGAGGAGTCTTATACACTATCAAAAGCCGAAGTGTACAACACCCATATTAACATACTTAGGGGGAGCCTAAGTACACTTAAGAGGGAGTCTCACATCTAGGGGAGCCTAGATGGCCTGAGGGTTGAGTTTTACATGAATCACTATAGTAGTTAATGTATTACATATAAGTACTATGTTGTAATTGTTTAACTCTTTAATATTAGTAAATTATCTTTCTTGGGCACTTTGCCCCAGACGTGGGTGAATTTCACCAAATTGGGTTTCCAACTTTTGTGTGTCTTGGCTTGTTTTCTTGTTGTTAGTTTCAGTTGTTGTTACAGTGTGTGTTTGTACTTTCTGTTTATCATCCGTGTTTTAAAGTAACGAGTCATCTTTCAACTTTTTCATAATTAAATTATTAAAATTAAATACTAAAAATAATTAAATTAGTTAGAATATTAATAATGTATATTAAACCATTAATATAACATAAAATATATTAATTATAGATGTATTAGTTAAAATTTATTAAGTCTAAATAATATATTTACATTTAATAATTAATTATTATTGATTTAAATTAATTAATTATGTTATATTTTTATCATTCATCTCCGCATAAAAATCTCACAATTATATAGGGTTTTCCATGTTACATGTGTTTTAAAGTTTGTTTCCGGGTCCTA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mRNA sequence

ATGAAGCAAGCGAAATTGCTACCGACCTATTTCCGTGTGCGTTACGTTGGGAGAATTGAGAAATTCGAGATTTACGGCCAATCAGCTGCTCGTGAAAATGCCCAAAGCCGGCTGAGATTTGATCTTTTTGAAGCTGAGGTTGCTCTTGCGCTGACGACCTTTTGCATCATTGCGAGGTACATTTCTGTTGGGTTTTTGTGCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGCAAGCGAAATTGCTACCGACCTATTTCCGTGTGCGTTACGTTGGGAGAATTGAGAAATTCGAGATTTACGGCCAATCAGCTGCTCGTGAAAATGCCCAAAGCCGGCTGAGATTTGATCTTTTTGAAGCTGAGGTTGCTCTTGCGCTGACGACCTTTTGCATCATTGCGAGGTACATTTCTGTTGGGTTTTTGTGCTAA

Protein sequence

MKQAKLLPTYFRVRYVGRIEKFEIYGQSAARENAQSRLRFDLFEAEVALALTTFCIIARYISVGFLC
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C05G092350.1Cla97C05G092350.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
Cla97C05G092350CmoCh16G003860Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB332
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Cla97C05G092350Watermelon (97103) v2wmbwmbB101
Cla97C05G092350Silver-seed gourdcarwmbB0213
Cla97C05G092350Silver-seed gourdcarwmbB0395
Cla97C05G092350Silver-seed gourdcarwmbB0396
Cla97C05G092350Silver-seed gourdcarwmbB0681
Cla97C05G092350Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB206
Cla97C05G092350Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB514
Cla97C05G092350Cucumber (Gy14) v1cgywmbB396
Cla97C05G092350Cucumber (Gy14) v1cgywmbB435
Cla97C05G092350Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB129
Cla97C05G092350Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB347
Cla97C05G092350Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB536
Cla97C05G092350Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB763
Cla97C05G092350Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB111
Cla97C05G092350Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB516
Cla97C05G092350Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB735
Cla97C05G092350Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB221
Cla97C05G092350Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB567
Cla97C05G092350Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB217
Cla97C05G092350Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB562
Cla97C05G092350Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB215
Cla97C05G092350Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB541
Cla97C05G092350Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB236
Cla97C05G092350Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB329
Cla97C05G092350Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB178
Cla97C05G092350Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB424
Cla97C05G092350Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB192
Cla97C05G092350Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB434
Cla97C05G092350Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB159
Cla97C05G092350Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB229
Cla97C05G092350Watermelon (97103) v1wmwmbB206
Cla97C05G092350Watermelon (97103) v1wmwmbB343
Cla97C05G092350Wax gourdwgowmbB179