Cla97C02G047860 (gene) Watermelon (97103) v2

NameCla97C02G047860
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr02 : 35446623 .. 35460410 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCACGAGCACGGGATAACCGACATATGCGCGTGGGGCTACCCTTTCAACGCGCTCCGTAGGCGCGTGGCTCAAAGTCTAGATTTCTTAGCTGTCTGTCGGTGCTCGGAGCGATTGGATCCCAAGCGGCGACAGGGCAAGTTAGTTAAGCAGTGGACCCCTTTTTTCTCAGTAGTATTAACAATTTCTTTTAGTATTTTTATCAAACAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTTTTTTAGTATTAGCAATGAATGACGATAGATAGAATATAGAAGATTGAACTAGAGGAAGTACATATTAAGCTGGCTTCGTCCTCAATTTTATAAATATTTATGGCATGTTTATATTTAGTAAAAGGTAATCATAATATAAAAAGTGAGTTAGGTTGATTACTTTTAGTTTAAATACATTTTGTAATGAATTGTGGGCCCACTATAAAATTTGTAATCAAATAATGCAATCTACATATATTACTACTATAACAATATGAAAATTATGATTCTGCCACATTTATTGTTACCTACATTTAGCTTTACCGTTATCATTAAAGTTAAACAGTAACGATAACGGCAACAATGAAATGTTACAGATTCATAATTCTAGGTAAACACAATCAAAAGCAATTCAATTATGTCTGTGATTCAAGCCTATTACGATTCATCCATTAATGAAATATCATTTCGATTACACAAACTTTCATTACGGTTGGGTAAACATGGCCTTATTAATTTTGGTTTGGTTTAAGGTTACAATTAACAATTTGTAATCAAAATTGGTGTAATTGTAATGAGATTCTATTAATGGATCAATCATAAATGGTCTCAACAAAAAATATACTTGGATTGTTTTTTATCACGTTTACTTAGATATTTTGCAGATGTAATATGATTACGATTGAGGTTGTTTACTTTACATTGTCTATTTATCGTTAGAATCAATTAGTATAAGTAAAAGTGCCAGATTCATAATTCTCCTACCATAATAGTAGCAATAATGGTAAAGGGGCTTACTCCGTTCCTCAATCAGAATGCACGTTTTGATTATAAATTTGGAGGCGAACACCACAATTCATTACAATTACAGAACACAAGTAAACAACAATAAATATAGGGACTTACTTTTCGAATAACTATTGATGAATTACGTTTTACCTCCTGAGATAAGTGTTTAGCGTATTTTAGTTAAAGAGTAATATTTTGGTGATTTTCATGCAATCTCATTCAATTAAAAAAAATAATAATAATAAGCAAAAAGAATTTACGGTCTTAAATAATATTTAAAGAGTATTTTAGGTTTCATTGAATAATTATTTGATTATTTGTTTTTTTGTTTTTGCAAATTATGTATTTTCTTACCACTCATTTGGATGGTTTTCAACTTCTATGACAATAGATTTTATTATTAGTAAAATTAAAAACAAAAACAAAAACAAATTTTAAAGGCTAACTTTTTTTTTTTTCTTTTCAAATTTTGGTTTTTTCAAATACATTCATACGAATGACAAAAGCATATTAAAAAAAATATTTACAAACTTAATTTTTAAAGACAAAAAGACCAAATAGTAATTAAACAAGTCCTTAATTTTTAATTTTGTGTTTAATAAGTATCTAAATTTTCAACAACATATTGAATAAGTTTGGATACATTCACAAAAGTTAAAAATTAGCCAATCTATTAGACACGAAGTTGAAAATTTAGTGATGGTTTAGTGACCTAATAAACACAAACTCACAAATTTAGGGACTAATTTGTATAATTCAACCTATTTAGACTTTTATTAAAATTATATTTAAAAATTGTGCATCAATTTTTACATAAATATAAATTTTTTAAAATGTCGGATCGATATCTAAATGAAGCATAATAAATAGTAAAAATTGATATACTTTATAAAATTCAAGATTTAAATCGATAATCATTGTTAGTCAATGGTTTGGATGGGTACAACTCCTATCATTAAAGTTCAAAATTTTCTTTTAGCTTAATTTAATTGGAATTATCGATTCTAATATGATCTGGCCCCTTCCAAAAAAATAATAATAATGACAATAATATAATTATATAGACAATTTATCGATGTTTCCCAAATGCTGGCATGTATTTATTTAAATGTTTTTACCACTAAAATAGTGCAAAATAACTGTACTTCGAGAAGAAAGAATATACGTTTTTTTTTTCTTATTTTGTTTATTTAATTTAAGCTATAGAAGACAAAATTTACAAATCATCACTATTCTTAATTTATAGAGCTTTTCCATTTTTATATTATAAAATGTGAATCCAATTTCTTTATTCACGTGCCAATAATTCCAATTGTCTAATCCCATCCTTTTGTAGTAACCATCGAATTCGCAGTTTAATATTGATGTTTATTTACCGTAAACATGATATTTATTGAATAAATAGTTTATACTCAAAGAAAAAATAATTAAATAAGTTCAAATTAGTTCGCTAATTTGTTTAGAAGAAATTATTTCGCTAGAGTTTTACATTATTGTGTTTATATATAAGAAAATTATTTTAAATCACAAAATAGTTAAAAATATTTACAAATAATAGTAAAATATCACATTGATACATATAGATACAAATAGTAGTTTATTACGGTCTATCACAAATACAGTAAAATTTAGCTATATTTATAAATATTTTGATTCATTTTTATATATTTAAAAACAACTCTTATATATATTTATATATATAGCTAACTTAAATGGTCAAGATTAAAAATATAATAATAAAAAAACATATGGGCTAATTGGCGTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCATTTTTTTTCCCTCTTCTTTAGTACTACAAAATAGTTCATATTTTAATCAACCGGTCAGTATAACTTATAAAGACTTCGCACAGTTAAATAAAATATCAAGTCATAATTAAGAGTTTATATATATATATATATATATAATTAAAGTTTATCAAGTACAACATAGAGATCTAACTATCGACATTTGAGGTAATGATTGACATTTTATTTATTGACATGTGACTTTTGTAAGTCATAGTCAAACCATGTGTATATGATCCCTTTACTTCAAACTAAAGTTATCATGATAATAACTTTAGCTAAAATGCTAATTTGATCCCAATATTTTGAGATAATAATTATATTTTTGGTCACTAATTTTATAAAAAAAAAAGGATAGAATTTTAAAACGCGACAAGAGAATGGTGAATGGCAACAATGGGCATATGGTTAAAGGGAGAAAACCACAAGGGAGGAATCACTTTTTGTTAAGTCAACATCAGATGGGTTAGGGGACTATTTTTAACATTTTCCAAACCTTTTAATTGATTAACTTTTTTTTTTTTAAGTTAAAATGCCATTTTGGTTTCTATATTTTGGAGTTTGGTCTACTTTATTTTTTATATTTTCAATAAATCTTAAATTTAGTCCTCATATTAGTTTATTGTTGATTTTTTTATTTTTTTCATTTATTAGCATTTTTATTATAAATTTTGAAAATATATTTGCATATAGTTTCTTTGCATGAAAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATCCAATTTCAGTAAAAATTAACTTTAACGGACTATATCTAATTTATTAAAAGTACATGATAAAATTAGACAATTGAAAGTATAAGGACTAAAATTGAACATACTTCAAAATATATGGTCTAAAATAGTAATTTAACCTTATTTTTTTAGTTCAACAACTTATGGAATCGGATATTTAAATTTCTAATTTCTTAGTAGACGATATATGTATTAACTAGTAAAACTACGTTCGAATTGAATGGATTGTAAATTACTCTCTAGGCTTCTTTTTTCTTCTCCTTTCTTTTGAGTTCCATTGTCTCTATAATGTATTTCTTTAAAATAAATATTTCATTTGGGAGTTGTTTGTTTTTTTTGGGAATATAGATTACCAAAATTTTAAATGTCCAAAATTATATATGTCCAACATCTTTAGATTATCATGTTTCTTTTGTAGGAATATTTTTGCAAATATTGAAGAATATTTTGATAACTGTGTTTGTTTCGTAGGAATTCTACTAGAGAATATCTTAAATTTACTTAATACTTTAAATTTACATAATATTACAAGAATGTCTTTACAACTATTTATTAATTTATAAATAATTTGATATAATTTCAACTTATATAATGTATTTAGTTTTATTACTTTGAACTTTTTTTAAATTAATACAATTTATATTATTTCTATACAATATTTTTCTCAACAAAATAATACATCATAATTAATAAATATTAATATAAATTAAAATTTGAATATCTTACTAAAAAATATAAGAATTACGATATAACTAAAAACTATGATATAATGTTAAATTGTAGATTGACCCAAAAGTTTAAGCTAGTGAGTAAAGAAAAATTTAATTATATATAATCTAATAATATTATATGGTTGACAGTATTTATTTTAATTATATAATGCAAATGAAGATTAATATATATATGTGTGTAAAATGGGAATGCTCTCAGCTCGAGAATTTGGAAAACCTATGTTTTAGGAGGGCATCCAAAATTCTTGAGATTCCCTCTGTTTTGCGAAACAAACAGCCCCTTAGGAGATATTTGGTTGATCGTGATGGGATGAGATTGTAATGTAATCCAAAATCAATGTTTGGATTGAGTGTTTTGATCTAGATTTGTAATACATAACTCATTCCGCTTCAACAGTTTTCAATCCAACCTTATTTTCCATCGTTTTCACGATCTCATTTTCGTTTCTCCCTCAAGTTCTCACGCATTCTAATACTCTCTGATTCCTAATAGTTCTATTACATTTCAGCTTTCCAAACAGCTCCTCGGTGAGTGGACAATAAACAATGATTTGTGATGAGATTTTTCTATTTAGAATTAAATAATAAATAATTATTTATTAAATTCTAACGAATTAAAATGAGTAAAATAAATATAAATATATAATGTCGGTGGCAAAAAGAACCCATGAAATAAACTGGTTTTGGCTTTATGAAGTGCC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mRNA sequence

ATGCACGAGCACGGGATAACCGACATATGCGCGTGGGGCTACCCTTTCAACGCGCTCCGTAGGCGCGTGGCTCAAAGTCTAGATTTCTTAGCTGTCTGTCGGTGCTCGGAGCGATTGGATCCCAAGCGGCGACAGGGCAAGTTAGTTAAGCAGTGGACCCCTTTTTTCTCAGTAGTATTAACAATTTCTTTTATGCCGTTAGCCATTATTTCGAAGTTCAATAATTGTAGATGTGAGAATATATATCATAGTCATCAACATTTGAATTCTTCAAGTTTTGAAGTCGTGGTTGAAAATGCAATTAAAGTAACGAGAAAAATATCACCTAGAACACGTGTCCACTCTCTCGCAGCGAGTAGCCAAAATTTCATACTCCCCGGTGGAACGGTGGCATTTTCACACACTCGCTTTCCGTCCGCCTTTTCTCTCGCTCTCTGGTTCCCACTCCTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCACGAGCACGGGATAACCGACATATGCGCGTGGGGCTACCCTTTCAACGCGCTCCGTAGGCGCGTGGCTCAAAGTCTAGATTTCTTAGCTGTCTGTCGGTGCTCGGAGCGATTGGATCCCAAGCGGCGACAGGGCAAGTTAGTTAAGCAGTGGACCCCTTTTTTCTCAGTAGTATTAACAATTTCTTTTATGCCGTTAGCCATTATTTCGAAGTTCAATAATTGTAGATGTGAGAATATATATCATAGTCATCAACATTTGAATTCTTCAAGTTTTGAAGTCGTGGTTGAAAATGCAATTAAAGTAACGAGAAAAATATCACCTAGAACACGTGTCCACTCTCTCGCAGCGAGTAGCCAAAATTTCATACTCCCCGGTGGAACGGTGGCATTTTCACACACTCGCTTTCCGTCCGCCTTTTCTCTCGCTCTCTGGTTCCCACTCCTTTAA

Protein sequence

MHEHGITDICAWGYPFNALRRRVAQSLDFLAVCRCSERLDPKRRQGKLVKQWTPFFSVVLTISFMPLAIISKFNNCRCENIYHSHQHLNSSSFEVVVENAIKVTRKISPRTRVHSLAASSQNFILPGGTVAFSHTRFPSAFSLALWFPLL
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C02G047860.1Cla97C02G047860.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Cla97C02G047860Wax gourdwgowmbB369
Cla97C02G047860Wax gourdwgowmbB418
Cla97C02G047860Watermelon (97103) v2wmbwmbB012
Cla97C02G047860Watermelon (97103) v2wmbwmbB047
Cla97C02G047860Watermelon (97103) v2wmbwmbB098
Cla97C02G047860Silver-seed gourdcarwmbB0164
Cla97C02G047860Silver-seed gourdcarwmbB0255
Cla97C02G047860Silver-seed gourdcarwmbB0346
Cla97C02G047860Silver-seed gourdcarwmbB0966
Cla97C02G047860Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB026
Cla97C02G047860Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB187
Cla97C02G047860Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB406
Cla97C02G047860Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB414
Cla97C02G047860Cucumber (Gy14) v1cgywmbB663
Cla97C02G047860Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB255
Cla97C02G047860Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB568
Cla97C02G047860Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB629
Cla97C02G047860Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB850
Cla97C02G047860Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB884
Cla97C02G047860Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB235
Cla97C02G047860Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB545
Cla97C02G047860Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB602
Cla97C02G047860Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB826
Cla97C02G047860Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB854
Cla97C02G047860Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB026
Cla97C02G047860Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB450
Cla97C02G047860Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB458
Cla97C02G047860Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB025
Cla97C02G047860Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB444
Cla97C02G047860Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB451
Cla97C02G047860Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB026
Cla97C02G047860Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB426
Cla97C02G047860Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB434
Cla97C02G047860Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB052
Cla97C02G047860Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB124
Cla97C02G047860Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB227
Cla97C02G047860Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB228
Cla97C02G047860Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB085
Cla97C02G047860Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB314
Cla97C02G047860Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB520
Cla97C02G047860Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB091
Cla97C02G047860Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB326
Cla97C02G047860Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB528
Cla97C02G047860Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB043
Cla97C02G047860Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB138
Cla97C02G047860Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB197
Cla97C02G047860Watermelon (97103) v1wmwmbB062
Cla97C02G047860Watermelon (97103) v1wmwmbB287
Cla97C02G047860Watermelon (97103) v1wmwmbB316