Cla97C02G047050 (gene) Watermelon (97103) v2

NameCla97C02G047050
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr02 : 34778860 .. 34786080 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGTTTGATTGTTTGGAGTTTGATTTGCTGAATGGTGGGCTGGGAGTTGTCTCTTTCTTCCATATTCGTTATAGTCCAAATGTATTAACGCACTTTATCGTACATAAGGTTTTGAAGGAGCAAAGTTCAATCTCTTCATACTTTCTAAAAAACGTAAACTTATATTCAATGTTTAATAGAATTTTATTGAAAAGAAAATTACCTTGAAAATTACTAATGATATGATTACAAAATATTTTTATTGAGAAGTATGTTTGTCTTTAAAAAAAAAAAAATAATAATAAATAAATAAAAATACATTCATGGAGAGTAACCCCTTCAATGAAACTAAATCACACTACTTCAACATGTGTAGGCGGCACATAGATTTAGTTCTTATAAATTAGATTTACAGTACACTAAATTTTAATTGATATTGTCAAGACGAGTGTAGTTCATTTGATATAAAAATTGTATTATCAATTTTAAGGTTATCAGTTCGATTCTCCCACCCCACTTATTTATTAAAAAATAATTAATTGATACCAAATCTTTCTCTTAATAACAAATGGTAATCTCTCAAAATTTTGTAAGGATAATTAATTTTTACCCTAGACCATAATACATCAATTTTTTACACTAGATTTTCATTTTCGTCCAATCAAAACCTTCCATTTAAATGAGTGTTGTGATTCTACCAAATTCACTTGTTACATTTAATATTTTTTTTTTTAAAAAAAAAATCTACCAAAATTCATTGATTTCAATCAAAATCAGAATTTCTGAAAGTTTTTGGATTTTTTTTTTTACGAATTAACTCTTTGCCCAAATGAAAAAAAGAAGGCTCACTTTAATATATATATATATATATATATATATGTAAAAACTACTCACTCTTGCTCATCTCAATAATGCTCACTTTTGTTCTCATTGACTCAATACTTGCTTCAGCTTTTCCTCTCATTACTCATTCTTGATTCTCGCTTTATATATTTTAAATTTGGATGGACATATTTGTTTCATTTCTTCATTTCTTATTTTCTCATCTTTACTCTCTCTATAAATGAGTGATAATCAGGAACAAGCAGCAAGCTAGATTGAAATTGGGGCAAGTGTCAAGTAATCGAGAGTGGGTATTGAGATGATCAAGAGTGAGTAGTGAAAATCGAACGTTGAGGGCCACCAAATGTATTTCAAAGGGTTGTTATAATAATTTTACTATGTGATCATGATGCACTATATAAGGTAAAAATTTTAGTTTACTAAAAAATGAGATTTTTTTCATTTGTTCCCTCAAAAGAGGCCATGGGTTACCAAATTTCTGTCAATTTTATCTTCAATTTCATCAATTTTATTCCAAGCATATATTCTATAAAAGTAAAATTTGTAAAATTACTCGAGTTTATATCAATTATGACAATACTTATCAGATGGAATTAATGGTGTGATTAAATTTGATGCGATTGAAGTCATCAATCTTATTAGTGGTGTAGACTATTTTCTCTCTTAATTTGAGTTTTATTATTATTATTATTTTATCTCGGACGTTACTTTTGTTTGAAAGGTTGTTAGCGATTCTTGCTTTTGTTATGTTTTTCGATAGAAGAACAAAGCAGCCCATGCTTTTGTTTCTTTGGCATCCTCTATGAATTGCTATTTGATTTTAAAAATATATTTTTAAGATAACATTCTCTCGATGAGGAGGCTAAATTGTAATTATTTCTCTTTACATCTGTTTCAATTTGTTTAAGAAGAAAAAAGTATTGATCATGGTGGAAATGAATATACCATTCCAACTTGAGTGGTAAATTTTGACTCTTTATTATTATTTTTTTAAGTAATAAAAATGTTTCATCTAATTTAAATTAAAATTTTATTTTTCATTAAAATAAATGCAATTCAATGCCTCTAATTTGAAGATGGAAGTAACATTGGTGACTCGATTTATTGGGAAAAAAAATAATAATCCATTATATTAATCAATTTGCCATAAAATGGCAATTTAATGAAGTTGGCAAGAGATCAATGGTCATAAATGAAAGTAAGTTAAATTTGTACTGCTTCTTGATAAATAAATGAAAAAATTAATATATAATGTACCAAGGAAGGTTTATTAGTTAGCTCATCTTTTTTAATGATAGAGTGATAAGTTCATGTTGTGCCAAATTGAGTTTAGTTCAACGATAATTAGTGTGATCGTCTTCTCTAAAAGTTAGAGGTCCGATCCTCATATTCATAGTTGATGTACTAAAAGAAATTCACAACGTAAAATAAAAACTCTTTCAATCTAGACATATAATCTATATCTTTTTATATATTATTATTGTTACTATATATAGGTAGCAATTACAAGTGAGTCCATAAATATCACATGCATGTAATAAATTGCTTGGAAAAAAAACATGACAAACCATTTTAGTTGGCCAATGTTTGCATAAAATATATGAATTTCAAAAACGAAAATAAGTTTTTAATATTTTTTTCTTTTTAGTTTTTGAAATCATCAGCTGAGAAAGAGAAATATATATATACATATAAATTTACGGATAGAAATAGTGTATAGGTATAGTTTTTATAATTAAAAAATAAAAGTTGTCAAAATTGATTACTTTTTCATTGACCATAAACTTAAATAACCAGTGGAGTAACGCTCAACTTAAACTTGAACTAATAACATTTTCAAATATCAACTAAATAAATGACTTAAAATTTAATATACATAAAACAGAATGTATCACAACCTAATTACAAAGAAGCCTTTAAAAAGATCACAAAAATGTCAAACTTAGTTATATGAACTTCCTTCAATAACTATTTGATTTTGTGTTTTCTGTTTTTAATAATTACGTTTATAGATCTACTTCTATTAATAAAATTACTTTGTTTTGTTATCCTATTTCTACCAAAGCAAAATTTTGAAAGAAAAAAAATAATAAAAAGCTTGTTTTTGTTTTTGAAATTTAACTATGAATTCAACTATTTTTTTAGAAATGTGAAAACCCTAAGTTTGGTTTTTATATATGTATAAATATAAAAGCCACAATATATGAAATTTAGGAGAAAAGAAACATATGTTTTAAACATTGAAACAAGTGTCATAACACACTCAATTCCAAGCACAAAATCAATTAACAAGAGAAAAACGATTGCCCAATGTGAGTGTGATTATAATACAAGACCCATTGACATGTAATAATTTATATGACGTTGTTAATGCCAAATTTTGGATAGAGGAAAACCCACTTGACCTTTACGTGGTAAATTTGTAATTTGAGTAAGAGAAGACTTACAAATCAAAGAAAATGAACTCCGATGCCTAAGTCAGTATGAGAATTGTAAAATAGAGAAAAATAAGAAAAAATTTTAGATACCTCATCTAAGATCATAATGGTTTATTTATAGGGAGTTTGATTTAAGGTTTAATTTAACCCTCCTAAGATTAGGTTATTAGGCTTTCCTAATCCAAAAAAACTAGATCAAATCTTATCTTATCTTATTTTTATCTTAATTTTTAGCTTTATTCTACTACATAAAAATTCACCCATATTAGACATATTAGATGTCATACTTAATATTCACTCTATTGAAAAAGAAACTTCATTAACAACTACAAAAATCAACAAAATATGATGTTTAAATACACTCAAGAACCCAATTGTAAATATTCAATAAAACAAACTTATGATGATCAATAACTTTTATCTTATTACTCTCTTTTGAAAGATGAGAATCTTGCCAAATGTATAATTTAATCCTTAATATTTGATTTTTTTTTTCCAACTTAGCCTATAATATTAAGAAGCTTCAGTTTTATCATATGTTGATTCTGATTCAACCAAATTCCTAATAAAAAACAACCACGAAGTTAACTCATCAATTTAAAGTTTGACTAAGGCACTTTCCAAAACTCTCAAATTTTAACTCTAACGTCATTTTCATTTGAAATCTATTTAAGTAAAAATATACCAAGTGCTTCTTTTAGGAAATTTTGAAACAAAAAAAAAAAAAAAACCAATAATAAAAGTTGTAATACTTTTCAAATTTAAGATTAAGATTCCAACACTTACCTACATTTTGAAGTACAAGTTCATGTAATTAAAAAATTATAATTCGTTTATAGATAAAAAAATGTTAAAATATCATTTTGATCTCGTTACTTTTATACTCATTTAATTTTTGTCCACGTACTTTCAATTATTTAATTTATCAATCCCTATAATTTCAATCAATCTTAAATGTAGTTCTTATTACTAGTTCATTGTTGATTTTTTTATAAAAAAAATATAAGCATTTTTACATAAATATCGAAATATATTCAAATATTATACTTTTTATATAAAATTTAAATTATTATTATTTAACCAATTTCGATAGGAAAATGGTCACGATCAACTAAATTTAAGATTTGTTAAAAATATAATAACTAAAAAGTTAAAATATTATTTTGGTCTCTATACTTTGAAGTATATTCAATTTTAGTTTCCATAAATTTACTTTTGGATTTTTATTACATTTTATTTTTTATTAGCATTTTTACTAAAAATTCTAAAAATATATTAACATATTATGTTCGACAATTAAAATTACTTTCGATAGACTAAATTTAAGATTTACGAAAAACTATAGAGACTAAAATTCAACATTCAAATTATTTAACCAAAATGGTTAAAATGGTATTTTAAACTAACTAAAATGAGACATTTATATATATATAATCAAAGACATTTAAAATATATGGTGGTGAGTGGTGGGGCATTGAAGCAGCGCCAAAGGCGCAGGCCTCTCGACCACTTCCTCTCTTAAAACGACTAACTCAAACTCCACCCCCCCTCTTCTTCACTCGCCTTCTCTCTCGTTTCCACCACGCGCCCATTTCCAAATAATTCCATCTCATTTTCATACATTTTCAGCCCCAACATTATCATTTTATTCTCAATTTATGTTCCATACATTTTAGAAAATTTTCAAAATCAACCACTCTATCATTATTATGTCCAAGTTACTCTAACTAATTTCAT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mRNA sequence

ATGGAGTTTGATTGTTTGGAGTTTGATTTGCTGAATGGTGGGCTGGGAGTTGTCTCTTTCTTCCATATTCGTTATAGTCCAAATGTATTAACGCACTTTATCGTACATAAGTCCAAAAGCCACCAAAGCATTGGCCTTTTTTCGCCTTTTGCTTCTGTGTTTCCTATGCAATTGTCTATGTCTGTTGCTTCTGCTCCCTCTTCTCAGTACCTGCAAATGGGAGAGGAATCATACTTTGAATTTCTTGTTATTATTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGTTTGATTGTTTGGAGTTTGATTTGCTGAATGGTGGGCTGGGAGTTGTCTCTTTCTTCCATATTCGTTATAGTCCAAATGTATTAACGCACTTTATCGTACATAAGTCCAAAAGCCACCAAAGCATTGGCCTTTTTTCGCCTTTTGCTTCTGTGTTTCCTATGCAATTGTCTATGTCTGTTGCTTCTGCTCCCTCTTCTCAGTACCTGCAAATGGGAGAGGAATCATACTTTGAATTTCTTGTTATTATTTGA

Protein sequence

MEFDCLEFDLLNGGLGVVSFFHIRYSPNVLTHFIVHKSKSHQSIGLFSPFASVFPMQLSMSVASAPSSQYLQMGEESYFEFLVII
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C02G047050.1Cla97C02G047050.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Cla97C02G047050Watermelon (97103) v2wmbwmbB047
Cla97C02G047050Watermelon (97103) v2wmbwmbB095
Cla97C02G047050Silver-seed gourdcarwmbB0164
Cla97C02G047050Silver-seed gourdcarwmbB0222
Cla97C02G047050Silver-seed gourdcarwmbB0346
Cla97C02G047050Silver-seed gourdcarwmbB0465
Cla97C02G047050Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB030
Cla97C02G047050Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB187
Cla97C02G047050Cucumber (Gy14) v2cgybwmbB410
Cla97C02G047050Cucumber (Gy14) v1cgywmbB034
Cla97C02G047050Cucumber (Gy14) v1cgywmbB036
Cla97C02G047050Cucumber (Gy14) v1cgywmbB530
Cla97C02G047050Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB223
Cla97C02G047050Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB459
Cla97C02G047050Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB568
Cla97C02G047050Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB614
Cla97C02G047050Cucurbita maxima (Rimu)cmawmbB850
Cla97C02G047050Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB206
Cla97C02G047050Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB236
Cla97C02G047050Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB441
Cla97C02G047050Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB545
Cla97C02G047050Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB588
Cla97C02G047050Cucurbita moschata (Rifu)cmowmbB826
Cla97C02G047050Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB029
Cla97C02G047050Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB200
Cla97C02G047050Wild cucumber (PI 183967)cpiwmbB454
Cla97C02G047050Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB028
Cla97C02G047050Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB197
Cla97C02G047050Cucumber (Chinese Long) v3cucwmbB448
Cla97C02G047050Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB028
Cla97C02G047050Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB195
Cla97C02G047050Cucumber (Chinese Long) v2cuwmbB430
Cla97C02G047050Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB052
Cla97C02G047050Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB174
Cla97C02G047050Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwmbB228
Cla97C02G047050Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB085
Cla97C02G047050Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB140
Cla97C02G047050Melon (DHL92) v3.6.1medwmbB314
Cla97C02G047050Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB091
Cla97C02G047050Melon (DHL92) v3.5.1mewmbB326
Cla97C02G047050Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB043
Cla97C02G047050Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB138
Cla97C02G047050Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB185
Cla97C02G047050Watermelon (97103) v1wmwmbB062
Cla97C02G047050Watermelon (97103) v1wmwmbB123
Cla97C02G047050Watermelon (97103) v1wmwmbB316
Cla97C02G047050Wax gourdwgowmbB031
Cla97C02G047050Wax gourdwgowmbB371
Cla97C02G047050Wax gourdwgowmbB469