Cla018128 (gene) Watermelon (97103) v1
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATTGTTTCCATGGACTTAAATGCCTCGCCGGTGCCTGAAGAGGATGAAGAGACGTTTGAGAGGCATGAAGAGGTGTATAGTGCTCCAGAGGAACATATAGAGACTGCTGTAAGCATAGCACGGCGGGTATGTGTTTTTCTACCTTGTATGTTCTTTTATTTATTTATTTATTTTCGAATGTGAAACATAAGTTTTCGTTATCCAGAATGATGGTACAAACAAAGGAAAATTTGTGGGAAAATTCTGTTTTAACTTCCTATTTGTTCTTTTTTTATACGACACCTCATTAGAACTATTTGCACGGAGTAGTGGATAGAGATACATTTGTTGGTTTTCTATGCTCTCCAGTGAGATTTGATATTCGAAGATACCAGCTCTCGTTAAGAAAAATGCAAGAACTTGAAAGAGGGAACTTTGTCTTTTTGTGAGTGCACCAGTGAATTGTACTTGCATGAACTCAAGCAGTATTCTTGCATACACATTGATACCTGGATGTGCAGTCCAGCTTGATTGTGCATTTATTCATTTGTGTTAGGAGCGAGAAGAAAGAAAAAGGCGGTTGAAAAGAGATCGCTCTCTCGAGAGACCGGTGCATGAATACCAGCAACCTGCACGGGATCAGTTTTACCCTTCTAAAAACCAAAAATCTGATAGAAACAGGCTTCCTCCAGGTGAGGCTCTTTGTCTTTGGATTTCACCTTTTTCCTTCTTTTACTCATGGTGTAAGATTTACGAAGGTTATGGTTCCTATGCATGTACCTATTTGTAAATATTTCAGTTTTCAACTGATCAAATAAGAGGAGGTTCACGAAAGGTTTAAAGGTTCCATTTATTTTTAAATACTTGAGGCTTTAAGTTGAGTACTCATGCTAAGACATAGACCATGTCAAGCATACATTCCTGTCAAGAAACTTTCTTTCCTATGCTTTATGTTGCAACCAGTTTTTTTACTTCTCTTTTACCTGTAGGTTGGTTGGATTGCCCTGCATTTGGTCAAGAAATATGTTGCATGATTCCGTCCAAGGTTCCTCTGGGCGAATCCTTCAATGATTGTATAACACCTGGTAAAAGATACTCATTTAAGCAAGTGATCCATCAGCAGAGAGTTTGGGGAAGAAAAGTAAGTCTCTGTTTTCTCACCCTCCTCCCCCAAACACATGCACGTATTGAAAAAATACACCAGAGAAAGAGAGAGAAAAGAAGAACTGCAATTTGTTTTTGATAAGGGACGCAGCTTCTTTATCTTTAATCTATCTTCCAGTCCATTAATAAGGAATAAAGTATTCATTAAAAATAGTAACATAAAGAAAACAAAAGAAATCTATAAGCTCAGTTGTTCTTATGCATATGGAGAACCAAAAGAAAAAATATGGTAATAAAGGATCTGTTATTCTTGCGCATTTTACCAAGTCTAAATAACAGATTATTTTGAACTAAATTTTCAGCTCGGTTTGGTGATCGATTTGACAAATTCTTATCGTTATTATACAACAGCAGATTTGAATAAGGAGGGTATCAAGTATGTTAAGGTGAGTCTTGGAATATGGCAGGCTATCTTAATTGTACATTCTAATTGTAGGAATTACACTTTACTAATTTTCAGTGATCTTTGTTCTTTTTGTTGGATGAAGATTCCTTGCAAGGGGAGGGATTCCGTACCTGACAACAAGTCAGTCAATATGTTTGTTTACGAGGTTTGTACCATTTTTTGCACACACACTGAGAAGCTTTTGTCATTTTCTTAGAAGTGCTTTCATACTTTAGATTTTGAGTGGAATGGATTAGCTTTCGTTTAATCTCTTTTTTTTTTCTCTTCGGATATTGGGTCCAACGTGAAATAAGGAACTGAACAATATCAATACTTGTTCCTGGTGTATTACTGTCTAGCTACTGTACACCAAATTTCTATCTTAGTGTCCACCAATTTCCTTAGTAAGCAGCATCTATGTCCTGGCAATGCCCATTAGGTCTTAGAATTCCTCATTCACTGATCTGTTTGATTTGGAAAAAAAAGGTATGTTGGCATGTGGGCACACACACAGTTTCATGTTTTATTTTAATTCTTATTTTTCAGGTCATGCAGTTCCTATCTCGTCAGAAACACTCGAAGAAGTATATTCTTGTCCACTGTACGCATGGCCATAATCGCACTGGATATATGATCATAAATTATCTCGTGCGTGCACTGTCCATTTCTGTTACCCAGGTTAGTTAGTATACCTGAGTAATGATTCAAGTGTCGTGATTGCTTCTTAATTTAGCTTTGTTCCTCATTGATTCATCTCTCATTTTGACTTGCTGCTACCCCTTGAGAGGGGGTGTTGGGTTATCCTCATTGAACAGGCTCTTAAAATGTTTGCTGATGCACGCCCTCCTGGAATTTACAAGCCTGACTACGTTGATGCATTATATACCTTTTACCATGAAAGAAAACCTGAAGCAGTTGTTTGTCCATCCACGCCTGAGTGGAAGAGATCTTCAGATCTTGATCTTAATGGCGAAGCAGTTCCAGATGATGATGATGATGGAGGTCCTGCTGCTCCTTTGAATGTATGCAATATTTAAGGAGTACTCATTCTTATCTATAATTCAATTTCTTCATATTAATGGAGCCAATACGTAAGAAGTGTACACAATCATATATAAGTTTATCTAGTTAGTGATGAGTAAATGGACTGTTTGTGCTTAATTGTCTTTTCAAGTAAGAAATGAAATCATATTTGCTCAATAGGAAAAATTGATGACTTATTTTTGTGGATTTATTAGGAATTTGTACCTAGAGTACCCTAATTAGGGTCCAAACTTGTAGTGTCCATGGATTTACAAAATTCCTGTGAAGACTTATATTACTCTCTCCCTAAATTTCCAATGGCACAGCCTTAGATGGATAGAGTCTCAAGACATTTGCCCTTTTTTCTTTAACATGACAGAGGAAATGATTGTGATTGAAGAGTACCAATTTGAAACTCTTCATTACTCCAATGAAGAGACTCGTGTCCTTTTAAGAAAAAGAGTACCAATTTGATACTTCTGTGCTACTTTTCACTTTTTCTTTGGAGCAAAGTTCCTTTTGGCACGTGGGTGGGTGTCAATCATAAATTTTGCCTCCATTTCAGTTGGTGGAAATGGAATCCTGGGTTTTGTGGGTACATGTTTGGCTAGTCCCTTGGTTTTTTTCCCCTGAATGCGAACCCCTAAACAAGATCAGAATCCAATTGTCTAAATAGCAGCTTGTGAAGGAAACTAGCTTCAAAGACTAAGAGCAGAAGAAAGGAGCAGTTTCTTTTAGTAAATTCTGGCATTAGGCTCCATCCCACTCATCCATACAGTTGCACTCAGTGTGCTAGTTCATGGAAAGATTAGACCTTAGACATGGTGCATTGCTTTCCCATGTCCCAAGCTCTTGACCAATATGATACTCTCTATAGTTTTTCTTGAACCCTCTCTGGCAAGGAAATTAGAAGAGAAATAGATCAGCACATTGTAGGTTTGGAGGCAAAATCTTTTCCTAGATAGAGAAATGAAGGGTTTTGTTCTAAAGAAAGTTACAAAAGGGGATGACCAATTCAGATCTATGAGCCTTCTCGATAGAGAATGGATTATGTTTTATATTTTTAGATTCACTGTGTTTGGAAGATAATCTGGATTGTGTTCAGTGAATATGTATGTGTTTGGAAGATAATCTGTATTCTGTTTTTGAAAACTGTTTTTGGATTCTGTGCATTGTTCGTATGTGTTTGGAAGGTAATTTGGATTCTGTTTTTGAAAAATCTTTTTGGATTATGTGATCTGAACAATGCACATTTTAAAAACAACATTTTTATGTTTTTAGTGGATATGGATTTTGAATTTGAAATTTAAAGTGCAGAATTATATTACAAAGGATAAGAAAAGCATTAATAAATCTACTATTTCATGTTGTAGACTCAACTCATTTTTTAAAAAAATTAAAATGTGTATTATGGTAATGTATTACAAATTATATGAAACAAAATAATAATTATACAAAATTTTTAACCTGAAACATGTTCATAAATTAATTAATATTAGTTGATAGTCAATTTAATATTAGGTGGGATAACTACAACTAGATTTATGGTTTGTAAATACATTATCAAATACATTTTGAACAATTTTTTAAATTACCAAACACATATATGGAAACATGAAATACAACCATGTTTCTATTAAATCTCTTGTTTTCAAATTTATGCTTTCAAATTCTCTACAAACATGCTCTTAATATTAGTTTGGATTTATCTGCCCTTGGGTTGTTTCTTTTTGTGATTAATATAGTTTCTTGTTTCTTTTATAAAAATGTTTTGATTTAGCTTATTTGAATTTTTTTTGAAGAATTATTTGTTTTCTTTGGTTTTCTTCCAGGAAAATCATGATGATGGTGCTCAAGTGATGACAAATGATGATATTTTGGGTGATGAGATACCTGAGGACCAAGAACGTGCTTTGAAACAATTTTGCTATCAAATGCTTAAATTGAATGCTGGAGTATGCTCTCTCAGTCCTTTCCTTTTTATTTTCAACTTCTTCTATGCCTGCACTTTTATGTCAGACTGGTCAAGATAATCCCTGGTTTCACGTCTTCCTTCATTGAACCTAAGACATCTTTTCCATCTAATATTCACACAAGACTGCTGTGGATTTTTACATGGGGTGCTCTTTTTTTTTCTCCTAACTGGATGATCATGCAATTTTGACTTAAACCATCTATTTACAAAGCTGCAATAAAAAATATAGGGAAAATTTTTATTTTATTTTATTTATTACCAATATTTATTAATTTTAAAAAAATTATATTACAAGTTTAGTCCCAGAACTCTTTGAGGTTTGTGTCTATTTTGTTCTTGAGCTTTCAAAAGTGTTTAATAGGTCTTTGAACTTTCAATTTTGTCTCTATTGGGTCCCTAACAAATTCAAAATTTTAAAAATTAATAGATATATTATATATAAATTTGAATTTTGTCTAATGGAGT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MIVSMDLNASPVPEEDEETFERHEEVYSAPEEHIETAVSIARREREERKRRLKRDRSLERPVHEYQQPARDQFYPSKNQKSDRNRLPPGWLDCPAFGQEICCMIPSKVPLGESFNDCITPGKRYSFKQVIHQQRVWGRKLGLVIDLTNSYRYYTTADLNKEGIKYVKIPCKGRDSVPDNKSVNMFVYEVMQFLSRQKHSKKYILVHCTHGHNRTGYMIINYLVRALSISVTQALKMFADARPPGIYKPDYVDALYTFYHERKPEAVVCPSTPEWKRSSDLDLNGEAVPDDDDDGGPAAPLNENHDDGAQVMTNDDILGDEIPEDQERALKQFCYQMLKLNAGDNELMTEPNDLVLLFSDPVVLHSSKNKTEPAGSVRDNLQLLRQRYYYATWKADGTRYMMLITMDGCYLIDRGFKFRRVQMRFPYRNANDGQGEKIHHYTLLDGEMIIDTMPDSQKQERRYLIYDMMTINHVPVIERPFYERWKMLEKEVIEPRNSERQSIYQSRNPHYRYDLEPFRVRRKDFWLLSTVTKLLKEFIPRLSHDADGLIFQGWDDAYVPRTHEGLLKWKYPEMNSVDFLFEVLGEDDSEVLILFERGKRKTMEGNRVKFKAECWLVEYWGFDDHQLLHMWLILAGKLSIFLNLYSQGFIIYAKIPGKSGDGDPSFYSGKIVECSWDSDEQVWVCMRIRTDKTTPNDFNTYKKVMRSIRDNITEEDLLKEIHEIIRLPMYADRIRIDSKAAQHTNSTRRR
BLAST of Cla018128 vs. Swiss-Prot
Match: MCE1_DANRE (mRNA-capping enzyme OS=Danio rerio GN=rngtt PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 253.1 bits (645), Expect = 9.8e-66 Identity = 182/515 (35.34%), Postives = 257/515 (49.90%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 43.5 bits (101), Expect = 1.2e-02 Identity = 22/53 (41.51%), Postives = 32/53 (60.38%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. Swiss-Prot
Match: MCE1_HUMAN (mRNA-capping enzyme OS=Homo sapiens GN=RNGTT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 245.4 bits (625), Expect = 2.0e-63 Identity = 171/516 (33.14%), Postives = 258/516 (50.00%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 46.2 bits (108), Expect = 1.8e-03 Identity = 24/55 (43.64%), Postives = 32/55 (58.18%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. Swiss-Prot
Match: MCE1_MOUSE (mRNA-capping enzyme OS=Mus musculus GN=Rngtt PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 240.4 bits (612), Expect = 6.6e-62 Identity = 165/510 (32.35%), Postives = 256/510 (50.20%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 43.9 bits (102), Expect = 9.0e-03 Identity = 23/55 (41.82%), Postives = 31/55 (56.36%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. Swiss-Prot
Match: MCE1_SCHPO (mRNA-capping enzyme subunit alpha OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) GN=ceg1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 143.7 bits (361), Expect = 8.3e-33 Identity = 117/371 (31.54%), Postives = 174/371 (46.90%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. Swiss-Prot
Match: MCE1_CAEEL (mRNA-capping enzyme OS=Caenorhabditis elegans GN=cel-1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 2.4e-27 Identity = 77/242 (31.82%), Postives = 122/242 (50.41%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 115.2 bits (287), Expect = 3.2e-24 Identity = 74/216 (34.26%), Postives = 113/216 (52.31%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L2J5_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G307930 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1223.0 bits (3163), Expect = 0.0e+00 Identity = 622/750 (82.93%), Postives = 637/750 (84.93%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. TrEMBL
Match: M5WJ38_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa002348mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1031.9 bits (2667), Expect = 3.7e-298 Identity = 532/752 (70.74%), Postives = 584/752 (77.66%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. TrEMBL
Match: A0A061ER30_THECC (MRNA capping enzyme family protein isoform 3 OS=Theobroma cacao GN=TCM_021767 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1012.7 bits (2617), Expect = 2.3e-292 Identity = 510/750 (68.00%), Postives = 585/750 (78.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. TrEMBL
Match: A0A061EQJ0_THECC (MRNA capping enzyme family protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_021767 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1001.5 bits (2588), Expect = 5.4e-289 Identity = 510/768 (66.41%), Postives = 585/768 (76.17%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. TrEMBL
Match: A0A067JNU6_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_25057 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 995.0 bits (2571), Expect = 5.1e-287 Identity = 510/747 (68.27%), Postives = 573/747 (76.71%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. NCBI nr
Match: gi|778693701|ref|XP_011653677.1| (PREDICTED: mRNA-capping enzyme isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1225.3 bits (3169), Expect = 0.0e+00 Identity = 623/750 (83.07%), Postives = 637/750 (84.93%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. NCBI nr
Match: gi|659069272|ref|XP_008449009.1| (PREDICTED: mRNA-capping enzyme isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1225.3 bits (3169), Expect = 0.0e+00 Identity = 623/750 (83.07%), Postives = 637/750 (84.93%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. NCBI nr
Match: gi|449460315|ref|XP_004147891.1| (PREDICTED: mRNA-capping enzyme isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1223.0 bits (3163), Expect = 0.0e+00 Identity = 622/750 (82.93%), Postives = 637/750 (84.93%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. NCBI nr
Match: gi|659069276|ref|XP_008449022.1| (PREDICTED: mRNA-capping enzyme isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1223.0 bits (3163), Expect = 0.0e+00 Identity = 622/750 (82.93%), Postives = 637/750 (84.93%), Query Frame = 1
BLAST of Cla018128 vs. NCBI nr
Match: gi|595840600|ref|XP_007208049.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa002348mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 1031.9 bits (2667), Expect = 5.4e-298 Identity = 532/752 (70.74%), Postives = 584/752 (77.66%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
This gene is associated with the following unigenes:
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following transcribed_cluster feature(s) are associated with this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (97103)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |