Cla011600 (gene) Watermelon (97103) v1
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTGTGTAGTTGCATGTAGTGGTGCGTTGAAACCTTCAATCTCGACCGAGAGGGTGTCGTCGGTGGTGGTACGGGCAGCCGAAAGCGTGGTTTTGGCCCCGCCCAATGGCAAGAGCGACGAGATTGGTGTGAAGAGTTTGGTTCCTTATGGGGGGATTGTAGATATGGATGAGGATGGAGGAATTGGCATTGTTAAATTCCTTAGAGGGAAAGTGTTTTTCATTACTGGTGCCACTGGATTTCTAGCAAAAGGTACCTTTTTTACTTTCTTACCAAGCGAGTTTAGCTCAACAATAATTGTGACATAATTTTTCATCATAGAGGTGCGAGGTTCTATCACCATTCATATTATAATTTTACCATTTTCCTTTTTTAAGCTAAAGCTTTGATTTAGTAGTTGTTGCTATGAGCTGTTGAGTTTTTTGCTTTAGTAATTCTCTCAGTCAAATTCTAATATAAATCTCATTAAATAAAATATTAGAAGTTTTGTTTTTTTTTTTGGCTTGTACTTGTCATACTAATGGTCCCTTTTTCTTTTATTTTATTTTTCGACCTCCTAAATCCAAATTATCTTTTTAAGTGATATGGTCAAATATAAAAAAAATATAAATAATAACAGTTATATATTTATTATAGAATATCATGCAGAAGTAAACATAGACCAAAGTTGCATGAATCATGTATTTTACGAAATTGATTCTCAGTGAAAAATTTTAAATATGGAAGAAAAAAATAATTGAAATATATAAGCAAGCCTTAAAGTTTGAAGGAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGTAAAGTAGATCATAATTAAAGACAATATAATCTTTGTTGAATTTTCCTATATAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAATGAATCTTGAATTCATTGAAATATTTCAGTTCTTATAGAGAAAATGTTGAGGACAGCACCAGATGTGGGTAAAATTTTTGTTTTGATTAAGGCCAAAGATGAAGAAGCTGCAGCAGAGAGGTTGAAAAAGGATGTATGTATTTCTTTATTTTTATCTTCTCATTTATTCATATTACTCAATCCATCATATGATTCCTAATTTTCATACACTTTCTTAATTTAATTTTTTATATATATATTTTCTCTTGATAAATTGTAAATTCGGTCCCTATTATTTAGGAAAGAAGAAGAATTTAATTCTTATGATTTGATAGAAGTTATTTAAATAGATAATAACTTTTATGAAGTTTTATTAAGATTAAATTTTAACTTTTATAATCGAAGAATCTAAATTCTAAAATTCTAATAACTAAATTTGAATTAATTATTTAAATTAATTAAATTACAATTTATTACCTGTAATTTTAAAGGTTTCTTTACCCAATCTTGTGATTTGGATTAATTAAAATATCATTTAATAATATGTTTGGAATAACTAGCAAACAAAATAGTGTTTAGCTAGACAAAATCAATCCTTCATACCTACTCTACAAAAAAAAATTAATTATATAATTTGAATTGTATTGTATAGTTTCTTGAAAATTTTAGATAATAAAAAAAATTCTTTTTTTTTCTTTTAAAAAAATCTTAATAATAGAAAAACACTCTAAGAATTTTGATTAATACAAAAGCTATTTTTTATAAGGGTCGTTTTCAAATATAGCAAAATGAACCAAAATATAATTATCTATCAATGATAAATAGTGATAAACCATGGTAGACTAATATCATCTATGGTTGTTTATTAGTGTCTATTGTTATCTATTACTGATAGACAATGATATTTTGCTATATTTAAAAATATTTTCAGTAGTTTTGTCATTTAAAACAATTACTTTTTTGATGATCTATCTCACAATAGTTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTACAAAAAAAAAAACCTTATTTTAATCCTAGTTTTTCTTTTAATTATTTTTAATAATAATAAAAAATAGTTTTGATTATCTTAAATAAATCAGCAAATTATGATGAGTGGTTTGATTAATAGTGGGAATTAATAAAAACTTTTAATTTTTATCAGATTATAAATGCAGAACTTTTCAAATGTCTAAGACAAATTCATGGGAAATACTACATGTCGTTTATGATGAGCAAGTTGATTCCCGTGGTGGGGAATGTGTGTGAATCAGATGTGGGACTACATGTCGACTTTGCTCATTTGATTGCAAATGAAGTTGATGTTATTGTCAACTCCGCTGCCAATACAACTTTTAATGAAAGGTCTCCTTTTTAATAATTCTATGCTTTGTAATATCTTAAAAAAAAAAAGAAATTAAAATAAATTTTATTCTCCTTTTAGTTAATCCCTATATTCTTTTTATTTACATATATAATTTCAAATATCTAAATTTACTTCCTTGTAACGTTATCACATAGTATCTCTAAAATAATTAATAATTTAAAGAGTATTTAGGAATAATCTTGTATGATCAAAACACTTTTTTTAGAAGTGATTTTCTAATCAGGATCAAGAGTTTCTTTGAAAATAGTTTTTAAAGATGTTTTTTAGTTTATTAGTTTTTTTTTTTCTTTAAAAAAAACCTTTGATCTTAAATCATTCAAGAAACCATAATTTGACTTTCTCATAGTACTTATGGAAAAAAAGAATGTGATTTGTTTTGAAAAAACACTATTTTTATTTTTTACAAGTTATTCCAAATATACTACAAATGACATTTTTTTTTTTTTTAATTAAAATTGAACATTTGCTTATTACCTCATATGAACTTGTAGATATGATGTTGCCATTGACATTAACACAAAGGGACCATCCAACCTCATGGGATTTGCTAAGAAATGCTCAAAACTAAAGCTCTTCTTGCAAGTTTCAACAGGTAATTTATTCACTTTACCAATCACATTTTATACCTATTTTCATTTGCAAATTCTTCTTCTTATTATTTTATTATTTACTTAAATCAATTTACTCACCATTAATCTTAATTAAAAGTATAAATTTGTACTATCAATCCTATCCTCTGAGACTAAGAATTCTTGACCTATATAAAAATGTTTAAAAGTTATTTACTCTAACTAACTCTTATCAGCGTGGTATGTTTCCATAATCAGAGTAAATGAGTAATTTTAATTAAAATCTGACCCATTTATGTAAATTAATTGGTTCAATTAAAAGTATGCCTACAATTAATTTTCATATTAATCGGTTCAATTAAAATTATACCCTATAATTACTTTTCTTTAATTTAAAAATAGTTGTGTTGGGATGAAAATATCCACTCCGAGAAGAATAATTAATGTCTTATCCATATAATTAGATCGTTGAAATGATGTAAGTCACATAAAAAATAATATTTAATAGATAAATACTTTCCAGATAAATTAAAATTTAAAATAAACCTTAAGAAACATTAATTCATAAAATAATGGTTAGATTTTAGTTAGTTTAAGTGGTGCTTAGAGAGTAATTGAATTTGTAATGGGGCAATATATTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGATTTAAAATATGCAATTTTTTAAACACATTTTATACTCTGAAATAAAGTTTTTGTTGATATATTAAAAAAAAATACCTAATATAGCTTAACTAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGAAATATAACTTAACTAGTATATTATTTTAAGAAAATTGATTAATTGGTATATTTTATGTAAATCAAACTTTATATTGGACCACTTACTATTTAACTAGTATTTTATCACGTGCAAATGCATGTGTTTTAATTTTTAAAAAAATTCAAAATAGATATTTTTAATAACTTGAATAAAATATTTTATATTTTTTTATCTTTAAAATTAGTTAGGATACATTTTATATGTTTTTATAATATATTATTATTTAATTGTTAATATATTATGGCTTATGTGAATATAATTTTAATCTAAATAATTTACTAATAATTTTAAATTAATTTAATAACTAAAAATAAGTTTTTAAAAATAAATATTAAATTTATAGAAAAAAATCTCTCATTTTTTTAGTTACTAATTTAAGTTCATAAAAATATATTTACTATTTAACTTTTAAGTTAAAATTAGTATGATAACAATATACAATTTTTTTTAAACTACTTTATTATACGTGATATATTTTAACTTTATTTTCTTTTATATAAGAAACTATGTTTTCATTTATTTTAAATTACTTCATATTATAAAATTGATAATCATCCGATAAACATACTTTTATGATCAATATATACTATAAATATAAAAATATAATATTAAAAGATATCATTATTATCAATAAAAATATGTTAAAAAATTTAAATTTACAAATATTCAGAGTTAGTTTTAGTTTATACAAGTAATTATAAGACATTTTTTATAATGATAGAAACATCTAGGATGTATATTTTTTAATTGGTCAATTTTTTCTTAAATTTACCCTACCATGTCTATTAACCATCCTTATCACATGCTTTAGTTATAATTAAATATAATTACATAAAAAGATAGACTAATAATTAATTTATTATAACTTTTCAAATTCCATTCATTCAATATTCATAAATTTCTTAAAATCATATTAACTTATACTACATTTTTTATGAATTTTAGGTTACATATTTTTTATAATGTAAATTAAAAAAAATATATATAGTTATCATCTTTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAAAAAGTTTTGGAATGACTTTTAAAGTTATTTTCCACTTTTGTAACTTTTTTTTTTGGTTATATAATATAATTTTTTTTTTAAAAGTTGTTTGTGAATGAAGTAATAAAACCTTTTCTGTTCCATCGTTTTAGTTTTTAATTACAACTTTTATTATCTTTATGATTTTTTATTAAAAAAAAAAAAAAGAAAACAACATAAGCATGTAAGAGATTGATTTATTGTTTTTTCCAACCATCATTTTCAATAATATAATGATATCCTAATTATAAAAGAAAAAAAAAAAGTATCCCTAAAAAAAGTAACCAAGAAAATTCAAGATTTAGTTATACACATTCTTA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ATGTGTGTAGTTGCATGTAGTGGTGCGTTGAAACCTTCAATCTCGACCGAGAGGGTGTCGTCGGTGGTGGTACGGGCAGCCGAAAGCGTGGTTTTGGCCCCGCCCAATGGCAAGAGCGACGAGATTGGTGTGAAGAGTTTGGTTCCTTATGGGGGGATTGTAGATATGGATGAGGATGGAGGAATTGGCATTGTTAAATTCCTTAGAGGGAAAGTGTTTTTCATTACTGGTGCCACTGGATTTCTAGCAAAAGTTCTTATAGAGAAAATGTTGAGGACAGCACCAGATGTGGGTAAAATTTTTGTTTTGATTAAGGCCAAAGATGAAGAAGCTGCAGCAGAGAGGTTGAAAAAGGATATTATAAATGCAGAACTTTTCAAATGTCTAAGACAAATTCATGGGAAATACTACATGTCGTTTATGATGAGCAAGTTGATTCCCGTGGTGGGGAATGTGTGTGAATCAGATGTGGGACTACATGTCGACTTTGCTCATTTGATTGCAAATGAAGTTGATGTTATTGTCAACTCCGCTGCCAATACAACTTTTAATGAAAGATATGATGTTGCCATTGACATTAACACAAAGGGACCATCCAACCTCATGGGATTTGCTAAGAAATGCTCAAAACTAAAGCTCTTCTTGCAAGTTTCAACAGCATATGTGAATGGACAAAGGCAAGGGAGGATAATGGAAATGCCATTTTGCAAGGGAGATAGCATTGCATTTGGCAGTGAGGAGTTGGATATTGAGAGTGAAATCAAGTTGGCTTTTGATACCAAACAGGCTTTTCAAGATAATTCAATGGCCCAAAACATGAAGGACTTGGGCCTTCAAAGAGCCCAAAAATATGGATGGCAAGACACTTATGTATTTACAAAGGCAATGGGAGAAATGGTAATTGACCAAATGAGGGGAGAGGTACCTGTTGCTATAATCAGACCAAGTGTCATTGAAAGTACTTTCAAAGACCCATTCCCTGGTTGGATGGAAGGAAATAGGATGATGGATCCTATAGTTTTGTACTATGGAAAAGGCCAACTCACGGGTTTTTTGGTGGATCCAAATGGAGTCATTGATGTTGTGCCAGCAGACATGGTGGTGAATGCGACATTAGCGGCAATGGCAAGGCATGGAAGAGCTCCACGGCCAAGCATGAACATCTATCATGTCGCCTCCTCCGTTGCCAATCCATTACTCTTTCACCGTCTCGCCGCCCTCCTCCACCAGTACTACCATTCTTCCCCTTGCCTCGACCTCGACGGTACCCCAATCCGTGTCCCCTCCTTCAAGCTCTTCAACTCTGTCGACGACTTCTCCGATCACCTTTGGCGGGATGCTGCCCGACGTTGCGCCTTGACCCCCGACCCGAAGCTCTCTAAGAAGCTTGAAGCTATTTGCAGAAAAACTGTTGAGCAACTTAAGTGTTTGGCTCGTATTTACCAACCTTATACCTTCTTCAATGGAAGGTTTGACAACAGCAATGTTCAAGGGCTGTTGGAAATTATGAGTGAAGAGGAGAAAAGGGAGTTTGGGTTTGACGTGGAGAGCATTGATTGGACGGATTACATTACTAATATCCATATTCCTGGATTAAGGAGGCATGTCATGAAAGGAAAAAGAGGAATTAATTAA ATGTGTGTAGTTGCATGTAGTGGTGCGTTGAAACCTTCAATCTCGACCGAGAGGGTGTCGTCGGTGGTGGTACGGGCAGCCGAAAGCGTGGTTTTGGCCCCGCCCAATGGCAAGAGCGACGAGATTGGTGTGAAGAGTTTGGTTCCTTATGGGGGGATTGTAGATATGGATGAGGATGGAGGAATTGGCATTGTTAAATTCCTTAGAGGGAAAGTGTTTTTCATTACTGGTGCCACTGGATTTCTAGCAAAAGTTCTTATAGAGAAAATGTTGAGGACAGCACCAGATGTGGGTAAAATTTTTGTTTTGATTAAGGCCAAAGATGAAGAAGCTGCAGCAGAGAGGTTGAAAAAGGATATTATAAATGCAGAACTTTTCAAATGTCTAAGACAAATTCATGGGAAATACTACATGTCGTTTATGATGAGCAAGTTGATTCCCGTGGTGGGGAATGTGTGTGAATCAGATGTGGGACTACATGTCGACTTTGCTCATTTGATTGCAAATGAAGTTGATGTTATTGTCAACTCCGCTGCCAATACAACTTTTAATGAAAGATATGATGTTGCCATTGACATTAACACAAAGGGACCATCCAACCTCATGGGATTTGCTAAGAAATGCTCAAAACTAAAGCTCTTCTTGCAAGTTTCAACAGCATATGTGAATGGACAAAGGCAAGGGAGGATAATGGAAATGCCATTTTGCAAGGGAGATAGCATTGCATTTGGCAGTGAGGAGTTGGATATTGAGAGTGAAATCAAGTTGGCTTTTGATACCAAACAGGCTTTTCAAGATAATTCAATGGCCCAAAACATGAAGGACTTGGGCCTTCAAAGAGCCCAAAAATATGGATGGCAAGACACTTATGTATTTACAAAGGCAATGGGAGAAATGGTAATTGACCAAATGAGGGGAGAGGTACCTGTTGCTATAATCAGACCAAGTGTCATTGAAAGTACTTTCAAAGACCCATTCCCTGGTTGGATGGAAGGAAATAGGATGATGGATCCTATAGTTTTGTACTATGGAAAAGGCCAACTCACGGGTTTTTTGGTGGATCCAAATGGAGTCATTGATGTTGTGCCAGCAGACATGGTGGTGAATGCGACATTAGCGGCAATGGCAAGGCATGGAAGAGCTCCACGGCCAAGCATGAACATCTATCATGTCGCCTCCTCCGTTGCCAATCCATTACTCTTTCACCGTCTCGCCGCCCTCCTCCACCAGTACTACCATTCTTCCCCTTGCCTCGACCTCGACGGTACCCCAATCCGTGTCCCCTCCTTCAAGCTCTTCAACTCTGTCGACGACTTCTCCGATCACCTTTGGCGGGATGCTGCCCGACGTTGCGCCTTGACCCCCGACCCGAAGCTCTCTAAGAAGCTTGAAGCTATTTGCAGAAAAACTGTTGAGCAACTTAAGTGTTTGGCTCGTATTTACCAACCTTATACCTTCTTCAATGGAAGGTTTGACAACAGCAATGTTCAAGGGCTGTTGGAAATTATGAGTGAAGAGGAGAAAAGGGAGTTTGGGTTTGACGTGGAGAGCATTGATTGGACGGATTACATTACTAATATCCATATTCCTGGATTAAGGAGGCATGTCATGAAAGGAAAAAGAGGAATTAATTAA MCVVACSGALKPSISTERVSSVVVRAAESVVLAPPNGKSDEIGVKSLVPYGGIVDMDEDGGIGIVKFLRGKVFFITGATGFLAKVLIEKMLRTAPDVGKIFVLIKAKDEEAAAERLKKDIINAELFKCLRQIHGKYYMSFMMSKLIPVVGNVCESDVGLHVDFAHLIANEVDVIVNSAANTTFNERYDVAIDINTKGPSNLMGFAKKCSKLKLFLQVSTAYVNGQRQGRIMEMPFCKGDSIAFGSEELDIESEIKLAFDTKQAFQDNSMAQNMKDLGLQRAQKYGWQDTYVFTKAMGEMVIDQMRGEVPVAIIRPSVIESTFKDPFPGWMEGNRMMDPIVLYYGKGQLTGFLVDPNGVIDVVPADMVVNATLAAMARHGRAPRPSMNIYHVASSVANPLLFHRLAALLHQYYHSSPCLDLDGTPIRVPSFKLFNSVDDFSDHLWRDAARRCALTPDPKLSKKLEAICRKTVEQLKCLARIYQPYTFFNGRFDNSNVQGLLEIMSEEEKREFGFDVESIDWTDYITNIHIPGLRRHVMKGKRGIN
BLAST of Cla011600 vs. Swiss-Prot
Match: FACR2_ARATH (Fatty acyl-CoA reductase 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=FAR2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 701.4 bits (1809), Expect = 7.5e-201 Identity = 354/531 (66.67%), Postives = 423/531 (79.66%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. Swiss-Prot
Match: FACR6_ARATH (Fatty acyl-CoA reductase 6, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=FAR6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 448.7 bits (1153), Expect = 8.8e-125 Identity = 218/482 (45.23%), Postives = 328/482 (68.05%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. Swiss-Prot
Match: FAR_SIMCH (Alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase OS=Simmondsia chinensis PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 361.7 bits (927), Expect = 1.4e-98 Identity = 202/495 (40.81%), Postives = 293/495 (59.19%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. Swiss-Prot
Match: FACR1_ARATH (Fatty acyl-CoA reductase 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=FAR1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 3.2e-98 Identity = 202/488 (41.39%), Postives = 294/488 (60.25%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. Swiss-Prot
Match: FACR4_ARATH (Probable fatty acyl-CoA reductase 4 OS=Arabidopsis thaliana GN=FAR4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 356.7 bits (914), Expect = 4.6e-97 Identity = 196/490 (40.00%), Postives = 294/490 (60.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KYS8_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G551130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 949.9 bits (2454), Expect = 1.4e-273 Identity = 481/546 (88.10%), Postives = 510/546 (93.41%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2SXW6_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_006G144700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 3.6e-210 Identity = 384/569 (67.49%), Postives = 444/569 (78.03%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. TrEMBL
Match: M5VX78_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa026306mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 738.8 bits (1906), Expect = 4.7e-210 Identity = 382/560 (68.21%), Postives = 451/560 (80.54%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. TrEMBL
Match: W9RER8_9ROSA (Fatty acyl-CoA reductase 2 OS=Morus notabilis GN=L484_007330 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 737.3 bits (1902), Expect = 1.4e-209 Identity = 380/567 (67.02%), Postives = 454/567 (80.07%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. TrEMBL
Match: V4SR75_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10011332mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 736.1 bits (1899), Expect = 3.1e-209 Identity = 379/566 (66.96%), Postives = 456/566 (80.57%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. NCBI nr
Match: gi|659083127|ref|XP_008442196.1| (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 2 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 956.8 bits (2472), Expect = 1.6e-275 Identity = 485/546 (88.83%), Postives = 508/546 (93.04%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. NCBI nr
Match: gi|449453912|ref|XP_004144700.1| (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 949.9 bits (2454), Expect = 1.9e-273 Identity = 481/546 (88.10%), Postives = 510/546 (93.41%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. NCBI nr
Match: gi|659083129|ref|XP_008442197.1| (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 2 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 849.4 bits (2193), Expect = 3.6e-243 Identity = 434/491 (88.39%), Postives = 455/491 (92.67%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. NCBI nr
Match: gi|694415422|ref|XP_009335888.1| (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 2 [Pyrus x bretschneideri]) HSP 1 Score: 754.6 bits (1947), Expect = 1.2e-214 Identity = 390/563 (69.27%), Postives = 457/563 (81.17%), Query Frame = 1
BLAST of Cla011600 vs. NCBI nr
Match: gi|657959204|ref|XP_008371142.1| (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 2 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 753.8 bits (1945), Expect = 2.0e-214 Identity = 390/563 (69.27%), Postives = 456/563 (80.99%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (97103)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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