Cla007873 (gene) Watermelon (97103) v1
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGATTCATTGGACCTTCTCAACTCAATTTCTGGGTTGGTGTCCACTCCATCCACCAAGAAACGGATCCAGATCTTCCGAAGCCAAATCCCTGCCATTTTCGAGAATTCTGGTTAGCTTGGGTTTTCTTCAGTCATTGTCTTTGTTATTCTTTTTGGTTTTTTCCCTTTTGGAATATCGATGCTTGAGTGTAATTCAATCATTGTCAGCATTTTGTTCGACTTTTGTTATGGGCTTCACACTCTATTTTCTTCTGGATTACGAGCACTGCCTTATGTTATAGCGTTCATGTTGGGATATATCTCCTGGAATTTTGTTTTTTCATGCCATTTTGAGTTTCTACTGTTGGGTTTATCTTTATTCTGTAAGTGTGTATGTCTTTATATATTTGGTAAAAAGCCATGCTTTCTGTAAGCGTGTATTTACGTTGCACAGTAATCCACATTCCACCACCTCTGTTAGTACTTAGTTTAGTATTTTTCATAGTTAAATACATTTTACTTTTTGTAAATTATCGAGGGAGGAAAAACACACTCGAAATGACAGCTCTTCTTGATGTAGTATGATTAGGATAAAATGAGTATCTCGATCAAATCCCTAATTGATTAGTAGGATTAGTTTCTCAATTAATTAGGATTATGATTAGTTTTCTTGGTTAATTAAGATTATGTTTAGTTGCCTTGATTAATTAGGACTAGGTTCAGCTTGTTTTCCCATTTTCTATAAATAGGAATTGCCATCTTGATCGATTATAAAATTTTTGTTGTTTAATTCTTGAAGAATTCTCTCCTTACCCATTCTTAGGCTACATCACTTCTGTTCCTAGAATTCTAAGATTTTGTTGCTTGGTTTGACCTGACCGGTTTTGTATCTAAGTCTGAACGTTCTGATAAGTCAGAAACTTCACTAGTAAATGTGAAAATAGTTCTCCAGCTGGATAGAGAGGCCTTTGGATATTTGCCTTACTAATGGAAGAGGCTTCTTGTTTGAAACGTCTTAAGAACGCATTCTTTAGTTTATTCTAGTGCAATTTCCCTTAGAGTAATGACGTGGTCTGAGAGGTTCATACGAATGCGTCCACTCTCTTTGCTTGTTGCAGCGACACCTATATGGTGAAGTCGAAATTTAACTTGTCAAAGCACAACAGGAATAAGAAAAGCTTTGAATGTAGGACAATCGCATTTGATTGCTCAATCAAATGTTTTTTCTCTATATTTCCTACTTAAGTGGTTCCATTCTTCGGAATAGAAAATACTATTATGATCTTGAAAAATGCTTGATCGCCTGTGCATTGGAGCGCTTAAAAGGGTTGATGTTTTGATCTGTAATAGTGAGGATTGAGAATTGTGCTTGGAGTTTGGACCATTGGAACTAGAAAGCATGATAGAATGAAGTCTCTTCAATGAATTGATAGGTGCACTGTATTCAATGAAGGACAAACACAAATATAGATAAGAGATATGGATACGATAGGATATGGCCATATGCCTACTTTTAAAAAACTAACATATAGGCACATTATTATTGTTACTTTATATATATATATTTTCTTTAGGCATGGTAGTTGGTCGCGGTGGTGAGGCTAAGGAGTGGTGGTTGGGTGTGAATGGTAGGGCAGTGAAGAAGTAGAAGATGAATTGGGGGGTGGGGGCACTGTGAATTACAAATTGAAAACCAGAGAGCTGTGCTGAGAGTGAGAGAGAATATCTGATTATCAATTAGGATGGTGGGATAAAAGGTGGCTGTGGCTTGGCTTAAATTTTTTAAATTTATCTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTAGTCCTATTTCTTTTAGTTTTTGTTTTGGGCTGCTAGGTTTAAGGGTGGATTTTTAAATTAAATGGGCTGGTGGGATACAGGGTGGCTGCAACATGGCTTAAATTTTCACAAATTATTGTAACATGTTCCCTTCACGTATTTGGACGGGGACACATGTATCCAGTAAAAATTAAGATACTTTAAATCATGTATCCGCCACATATTCTTTGCACGGTTTGAAGTATTTGTTGTTTTTTTTCGAAAGGAAACAAAGCTTTTTATTAATAAAGTGAAAATAGACTAATGTTTAAAGTATAAGGAAACCAAAATAAATTACCAAAATACCAAAAAGGAACACACAGAAAAGAACATGACTAAGCAGGAGAAATAAAATCAATCCAGATCAAACATGAAGAGGCTTGAACCCAAGTTGAAGCATAGTGTGGTGTCCATGGTAGAGACTTATCCAGTCTAAACCGTTGAACTCAATCAAAACAAAGCTTTAACACAAGAACTACAAACCAACTAAGCTTGAGAACTTGCACACAAAATAGAGAACATAGATATTGCAAGAAGAGAGTAGGAAGCTGGAGGATGAAGAACCCAATAGATACAACAACCTTCGATTATCTTCAAAAAGAAAAATTCCTTGAAAGCGTAGTTTGAACCTAAAGGACTACAACCAAAACAATGTGCAAACGAGCATTTTGGAAAACCTTAACCGACTTTTACGCAATTGAAGACCATAAGCTTCCACAATTGGATAAAATTTGAATGATATCTAAGGAGACAAAGGAGAAGCACTCAACTTTGCATCTTGACACATTGCTTTTTCTCAACCCTGTGAAACAAAATATCAAAAGCTTCCCCGATATGATCTATTGAAAAAGGTTCCTCAGGAATTGGGTTCAAATGATCAAGATCACATTCTTCACTACTCACACTAACAACCAAGTCTTGATCAGAATCATATGGCGAGAGAGAAATCGTTGGAGGAAGAATGGCAAGCAACACTTCTAATAAACTGAATCTTCAAACTTGGGAGGGAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAAGAGTCGAATGACTTGAAACTTTTGAACAGTCTAAACAATTTGCAGGAATAAAACCACACATGTCTTTTTTGCCCTCTATCATTGCATTGGAATAGTCTAAACAATTAAGATTTTGTGAAGAGATGCTAACCAAACCACCAAAATGTTGCCCAATAGCTCTAAAGGACTGATTTTTACCAATAAATCAAAGGTAAATTCTTAATATTAATCAAACCTCTGTAAGTTTAACTCCTATGTAATTTTAACTCCTATGAATTCCAAATGGGAATGGGACTGATCAGCCCAGTGTTCCAATTTTAGTTGTAAGTCCCCATAAAGCTGCCAGTTTCCATTAAAATTGAAGTTCGTAAAATCTTCATCAAACTTGTTCAAGGCCTTGTCATCCATAAAGGGATTAATGAAAATTTGAGATTGGAAATAATCTTCCAAAGCATATTGAATATCCTTCTAGGAAAACGTGTGAGTAGTCTATTAACTATAGTAACAATGTCAAACTTCGAATCCAAAACCTCTCACCCTTTTCAAACCCAAAAGGATGACTCATGGAAACATGGAATTGTTTCAACCAAACCAACATATTGTCTCGATAGGAAAGTTTGACAATTCACTTCTACAAAACATCTCAACATTGACTTACTAATCTGCAAATCCTCGTGAGGTTGATTATTCTCAAGAAAACAAACATGGTTAAAAGTTCAAGTTTCTCAGCTTGTCAAACTTAGAGAGAAAGTCTCTAACCATTTCCTAAAATACTAACTATCCCTTCTTGTCGAAGCCTGCCAGGAGATGGATATTCATTCTTCCCCCTAGACCAAACAACACACTCAAAAAACCTTCATAAGGAGATCTAAACTTAGATAAACAGATGACACATGAAGCTCCACAATCTTTCTTATGAAAAAAGAACAAATATGGGGATGGGCAAGAGAGGGTAATTAGAGATAAAAAGGAGACGAGAATCTAGCATTTTGGGCACGACGATTGACGACAGAGAAGCAACTAGGGTGTCAATGGTAGGTGGTTGGAGATGTCTGCAATTGTTGCCTGTCGGTGGAGGTTGTGGTGGAAGGAAGAGCAACACCCGTCGAAAGAATGAAGAAGAGGGGAAGATGACGACCTGAAAGAAGGAAAAAAGAAAAAATTGACGTTAGGATCGGCGACCAAGGGTGGTGGTGGTAGGTGATTGGAGGCGTCCGTGGTTGATAGTGGTGGTCCGAGGATGGACTAAGAAGCGATGATGGTTGGATGTAAGAAGGAAGGCGGCTAGGGTTTTCTTTTTTTGGGATAGTTTTTTCGTGGAGAGAGAAAAATTGGCTCCTGTCCTCGAAGTATATGTTGTTTATGGATGATGGTCTTTCGAATATGAAGAGGAATTTTCATCATGATGATGGTATGTTGAATGACCATGGCTCCTGTCCTCGAAGTATCTGTTGAATGAAAGATGAGTCCCTTTTTGTAGAGGGAGTTCCCTAACGCCCTCTTTATGTGGGCTTGTTTTTTGTATGGCTATGTATTGTTTCATTTTTTTCTCTATGAAACTTGTTTTCATAAAAAAAAAAAAAAATCAAAGAGAAATTTCTAATAGGCTAAATTAAACAAAATACCCCAATATTTGTACTTTGTGTAAGAAAATATCCTTAAACTTTCAAAAGTTTTAAAAATACCCTTAAACTTCTAAAATGAATCCAAAAATACCCTTATCATCAGTTTTGGATGGAAACCATTAGTGTTTTGTGTCAAAAATACCCAGGGACATTCAAAAATTTCAAAAATACCCTTAAACTTTAAAAAATACTAAAAATACCCCTACAGTTATATGAACATAAATAGTTAATTCCATCTTACTTCTCTATTTTCCTTTTTTTCTTCAAATCTCTTCTTCAATATCCTATTACTTCCCTTTTTGTTAATTGTTCGACATTTGTTTATCTAAAAAATAATAATAAATAAATAAATAAATAAAATTGTGCACTTCAGTTAAAGTGTATGGACTATAATACGAAGAAAGAAAATAAATGAAGCACCTAGGACTTAAATGTTTTATTAAAGTTGTACGTTAGTAGTTGAGTGTGTGTTAATAACCAAATACATTTTTTAT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TTTTTACTATGCAGAGGCATACGAGGAATTCGCTTTGCAGTTGGTTGACATAATATTTAGGACACTATTTATTTATGATGATCGTGGATCAAGGGAAGCTGTGGATAATGTAATTATAAAAGCTTTAAATGAGATAACGTTCATGAAAAGTTTTGCAGCAGCCCTTGTGCAGTCCATGGAAAAGCAGTCAAAGTTACATACACGTGTAGGATGCTATAGACTTCTCAAGTGGTCATGTCTTCTTCTTGTTTATAGTCAGTTTCCCACCATTTCAAAGAATGCCTTTTCTAGATTAGCATCAGCTCAAGCGAATTTAATCCACATTCTTATGGAGGGGTCTTTCCGTGAGCAAAGGGCTTGGAAGCAAACATTTTTCCATTTATTATCTCAGGTTTACTCTGTGTACCCTTTTCCATAAATAATGAGACGCTACTTGTAGCTCAATTTTGATCATTTTTGCAAATCTATTCTACTTTTGCAGTCAGCAGACATCTGCAGAATGTACATTGATGAACTAAATGATGCATGCATACCATACAAAGACGCTCCCGAGTTATTGACTCTGTTATTGGAGTTTTCAAATACTCTACCTCCCTTATTTGAAAACTTCAAGGTCAGTAATTGATTTTTTTTGACTTTGCACAATGTTGGAGACTTTTTTATTATTAAGTTTGATTTGTTCATGTTCTCACTTGGCATCTTTGATTGTTTGTGTCTTGTACAGCCAACATTTCTTGATCTCTATGTCAAGTCAGTTTTAAATGCCAGGGAAAAGCCTACCAAGAATCTTAGTGAAGCATTTCGTCCTCTTTTTGGACATATGTTACATGATGATCTCCAGAGTGTTGTGGTGCCATCTTCTGTCAAAATGCTTAAACGAAACCCGGAAATTGTGTTGGATTCAGTGTCATTCTGTTTACAATCTGTCACCCTTGATTTAAGCAAGTATGCAATAGAAATTCTTTCAGTGGTATCACCACAGGCTCGACACACAGATGAAAATAGAAGGATTGTAGCATTGGCTATTGTAAGATGTTTGACTGGGAAATCAAGTAATCCTGATACTCTGGAAGCAATGTTCAATAATGTTAAAGATGTTATTGGAGGTTTGCCTTTGTGCTTTTTATTGTGTTTTGTATTTTTAATTGGTTGAGCTGATGGTTCTTATGTTATTTATGTATTTCCTTTAGGCAATTAATAAACTTAGTTTCTTGTACAAAAAAAAAAAAAAAGTGATTGGTGCTTTGCTGCTTCTTTTTGATATTTTATGCAACCATTGGATCAAGTTTGTTTTGGTGCATGTTAACGAATGGTCATGTTCAGGTTCTGAATTTTAAGGTGTTGGTTATCATTCTTCTGCCTAACTTCTGGCCTATGTGGTTCCATTTTCGCAGGCTCAGAAGGAAGACTGGCATTCCCTTACCAGCGGATTGGTATGTTCAACATGGTGCAAGAGTTGGCTCATGCTCCAGAAGGGAAAAGGATTAGCAGTCTTTCACAATCAGTATGCAGCTTTCTTTTGTCATGTTATAAGGGTGAAGGTAGCAGTCTATCTATTGTTGCTTGTGATAATTGTTTTAAGGCCGACATAAGTTTCAACGGCTTTAACAATTCCCCAACTTAAGTTTTTGTTGTTGAAACGTTTTCATTTTCCTTTTTGATCTCCACATTGATGCTAATTATTTATTGTACTAATTGTAGGGAATGAAGAGGTAAAACTTGCAATTTTGTCTGCTATAGCTGCTTGGGCTGCAAGATCTTCTGATTCCATTCAACCGGAGCTTCTTTCACTTTTTGCATCTGGTCTCAAGGAGAAGGAAACATTGAGGAGGGGACACCTTCGTTGTCTACATGTTATCTCTAAAAATTCTGATGTGGTTGCAAGGGTTAGAAGCTGAATTTCGTAGATTTTTTTTTTAGTTCTCATATGGAATTCATCTTATTTTTGTTTCTTGTAAAAAATCAATTGCAGATATCAGGTCTTTTGGTGCCTCTTATCCAACTTGTAAAAACTGGTTTTACAAAAGCAGTGCAGCGCTTGGATGGAATATATGCTTTGCTTTTAGTTGGAAAGATTATGGCCGTTGATATTAAAGCAGGTGTTTACCACAATTAATCAGGTTTTTTATTATCTATGAGATTTGAATCATCATGTTTGCCAGATTATACAAAACACCCTCTTTTTACTTGTCTGCTTTCATTCTTTAAACGAACAAGAATAAAACTTTCCATTGAAATGAAGAAAAAAATCTCTTTTTTACTTGTCAGCTTTTGTTTAATATTCATAATCATGTGTTTGGGGTTTTTAATATGTACTTGTGATAGCGTAAGTCAGTGTTAATCTTTCTGCATATCTTACTTCTTAGGAGTTATGTTTTCACCTGTAAAGCTAAGGCATTCTGGTTTTTTGTGATCTTCACTATGAGCTGAGAATTTTTGTTGGAAGGGAATATGAGAACTTTTTATTCTGAGAATAATATTTTTTTTCCTTTTTTTTGATTAGAGACATTCCAACACAATTTCATTGATGGTATGAAATTACAAAAGCAAAAGATACAATGAAGATTGCAGGATGTATTTCCAGTTAGTAATAAGAAGTTTATGCTAAGACTAGATATGTTCATGTAACCTGCCATTCAACTCGTTTTCTGCTTTCTAGATGAAACTCTCTTTATAGTTTTTTTCCTTTCCTTTTCTAATTGCTGCTGTTTGAGGTTCTTTTGTTATCTCCTTTGCTGTTTGTGGTGCCTTTTATGTGCTCCCCTTTCTTCTTCTCATTATTTTTTCAATAAAATTATCCTTTCTTATTTATTTATTTATTTTTTTGTATACTTTAGTTGCAAAGGGGTTTTTTTCTTATTAAAAAAATCCCCTGAACATTTATTTCTTTTCATTATTTCAATGATGTAGTTTCTTGTTAAAAAAAATTATACCAAAAGTCTCTGATGTTCTTTGTTGGGCTTGTTTCTAAATGTATAATGATATGCCCATGCCTTTTTAGATTTTAAGAGGTTCATTCACTGCTATCTTCTTTGAATAATTTATTTTTTATTGTATGTTATTCCTATGATTTCAGAGGAGACTGTTGGTAAGGAAAAGATCTGGTCTTTGGTATCTCAAAATGAACCTTCAATCGTACCAGTTTCAATGGTAGCTTTTCAGAACATGTTTTTGCTGCCCATTTGTCCCTGTAAGTTAATTATCAAAAAATAACTTAATATTTATTGTGGGTATTTTTTTTTCTTTTGCTGTGCACAGGTGTCGAAACTGTCAAATGAAGATTGCATTGCATGTCTTAATCTTCTTGAGGTGCTTCTTGTGGAACACACACGCAGGTTATATTCTGATTAGTGATATTATCAATAATTCTTTTCGTATTGATTGAAGTAATAATAAATAAAAGCTGCTTTGTGCTTTTATTTTGTAGAGTGATGGACACCTTTTCAGTCAAATTGCTCTCGCAGGTGACTTCTTCACAAAATATATTATCATTTCAGTCTTCCAGCAATGTAAATTTTTGGTCACTGAGTAATTGAACTCTTGCAGCCATTACTGTTCTTTTTGTGCCATCCAAGTTGGGATGTTCGAAGAGTCACTTGCAGTGCTATTGGAAAGCTTGTTGCTGGGGCTCCAGAGCTTAGTGAAGCTCTTCTACTTGAATTTGCAAGTTTCCTTTCTACAGTAGGAGATAAACTCCATTCTTCAAAGATAAGGTCCGTCTATTATTTACCGTTTTATGAGTGA 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BLAST of Cla007873 vs. Swiss-Prot
Match: GCN1_HUMAN (eIF-2-alpha kinase activator GCN1 OS=Homo sapiens GN=GCN1 PE=1 SV=6) HSP 1 Score: 159.1 bits (401), Expect = 1.6e-37 Identity = 149/613 (24.31%), Postives = 283/613 (46.17%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. Swiss-Prot
Match: GCN1_MOUSE (eIF-2-alpha kinase activator GCN1 OS=Mus musculus GN=Gcn1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 152.9 bits (385), Expect = 1.1e-35 Identity = 151/604 (25.00%), Postives = 272/604 (45.03%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2SRV9_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_007G272000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 821.2 bits (2120), Expect = 8.2e-235 Identity = 422/608 (69.41%), Postives = 502/608 (82.57%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2PFF8_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_007G272000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 821.2 bits (2120), Expect = 8.2e-235 Identity = 422/608 (69.41%), Postives = 502/608 (82.57%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2R030_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_007G272000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 821.2 bits (2120), Expect = 8.2e-235 Identity = 422/608 (69.41%), Postives = 502/608 (82.57%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2SKM6_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_007G272000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 821.2 bits (2120), Expect = 8.2e-235 Identity = 422/608 (69.41%), Postives = 502/608 (82.57%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2TMB7_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_007G272000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 821.2 bits (2120), Expect = 8.2e-235 Identity = 422/608 (69.41%), Postives = 502/608 (82.57%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. NCBI nr
Match: gi|449470206|ref|XP_004152809.1| (PREDICTED: translational activator GCN1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1088.2 bits (2813), Expect = 0.0e+00 Identity = 563/606 (92.90%), Postives = 581/606 (95.87%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. NCBI nr
Match: gi|700206193|gb|KGN61312.1| (hypothetical protein Csa_2G079640 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1088.2 bits (2813), Expect = 0.0e+00 Identity = 563/606 (92.90%), Postives = 581/606 (95.87%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. NCBI nr
Match: gi|659082366|ref|XP_008441801.1| (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: translational activator GCN1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1082.4 bits (2798), Expect = 0.0e+00 Identity = 562/605 (92.89%), Postives = 577/605 (95.37%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. NCBI nr
Match: gi|763777648|gb|KJB44771.1| (hypothetical protein B456_007G272000 [Gossypium raimondii]) HSP 1 Score: 821.2 bits (2120), Expect = 1.2e-234 Identity = 422/608 (69.41%), Postives = 502/608 (82.57%), Query Frame = 1
BLAST of Cla007873 vs. NCBI nr
Match: gi|763777649|gb|KJB44772.1| (hypothetical protein B456_007G272000 [Gossypium raimondii]) HSP 1 Score: 821.2 bits (2120), Expect = 1.2e-234 Identity = 422/608 (69.41%), Postives = 502/608 (82.57%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (97103)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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