Cla003882 (gene) Watermelon (97103) v1
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAACGTGTGTATTGCCTCCTGCTTCAATTGTCTTTAAGTGAACAGTTGGATTTATCTACAACTGAAGCTGCGTTGAACGAGTTGAACCACGAATTTAGTCAGTCTGGATTCAAGGAAACTTATCGGGATATTTGGGGTCTGGCAGATTCTTTGTTCAAAGAACTTGATAGGAGGTTTAAGGGAGTTTTCCATGATTTGAGAAGTATTTCTTTTAGCCCTTCTCCTGAACTTGCTCGTAAAGACGATGATTTGTGGGATACCATTAAAGAGTTTATGTTGCTCTTAAGAAGTTGTTTGGTTATCATGACTCTGGTTGATTTCGAACAAAATGCTCTACTGGAAAAGGGCGGTGTAGTTCTTTCAGTTCTCAGGAAATTGCTATATTTGATTACAAGTGGAAAGGAGGAGCAAGAGTCCATCAGCTTGGAAAAATCTTTTTTACACGAATGCAGAATCACGGAATCTGATTGTACTACCCTTGTCTCTGAGGATTATTTTGCTTCCTTGTGTATTTTAGAACCTTCTGATCCATGCCATCCATTCATATGTGCAGTCCTTGAGGTTCTTACAAATTTTCCTTCTATCTTTGGGGACTTGATATCATTTCTCTGCTTTTTACTGCATTTTCACCATTATTCCTTTGCATGAAATATCTTTTTTTAACAAGTTATTTATCAATTACCATGATAAAAAAGATTTAATATTTTGATATCTTTACCAATTAGATAAGAATGTTGTAGTGTAGGAATATTATAAGGAACTCACATGCTCAAGTGCACTCACTTTGGGAAGTGGCTCACTAGCATTATCACTTTTGCTCTCTGATCTTTGATGTTGGCTTGTCTTCACCCACCATTCAACTTGAAAATCTCCGTATGTTCACATAATATCGTCTGAGTGGAGGAGTGGGTTTCATCGGGCAGTCAATTGTCATGATTTTCTTGCACAAACTGTTCACCTTGTTGTGATGAGCTTCTTACGTTTGGTTCCTATTTTGGCTTTATTTATTTATTCATATATTATTAATACTCGTGTGCATGTGTTGCTTTGGCTAGGTATTTGTGGATGAGCTTCTGATGCATAGATCGTTAAGAGAATACTTTATGCTGATAGATTCTGCAACTTCTACTAATAAAATGGTATTTTTGCACAACCTAGATCATGGTGGAATTGGGACGGTGCTGGAGGTGATTTCTGCTCATTTTATCCTGTCAGCCTCTGATGATCAAGCGTTTCATAATTTCCTCAATAGACTACATTGGGCGCACTATGAGGATTTAAAAGTTCCTGAATTAAGCCTGACGTCAGCTTTATCATTACTTCTAAATCCTGTCATGCTCTCTGCACCCAAACTGTTCCAGGCTCATTTTATTTCACTGGTTTCTGAAGTCATTGGCATCGGCGTTTTCTTGAAATCCCCAAACCCAGATCATAGGCTTATGGATTGGTACCTTATTGCGTTTGAAAAGGCAATCATGTTGTATAACAGGCATATGTCTAATTCGTGTTTGAAGGATACCCCATTGAATTCCAATGGCTGTTTTTCCAGTTCAAGTGTACCTTGGAATGGTGGTCAGCAACCTTTTGAATCTTATATTCATCAAGTTAGGAGAGAAAAAATTGAAAATCTTATTTCCAAGTATGAAAATACATGTTTTTTCTTTAGGGAAAAATCAGAGCTGCTAGCCTTATCGATTTCGTTTGTGGAGGAGAACCAACATATCTTGGATGAATCGCTTAAAGATGATCCTTTATCAATCTTACATTGTATAATTCTTGGAGCTTCTCAGGATGATGTTAGTGACACTGAAATATACAAGACTGGGTATACAAGTCACTATGAGATTTTTCTTCTTGCTTCTATATTGAAGTTGATGAGTTCGTCGTTTTTGCCTGCTATCTGGTGTCTAAGGCACCATGGAAACTCTGGTGGCCTTAAAACCTTACGAGACATTTCATCTAGTACGGAGTATGGTTTTATTTTGAGTATCATTAGCTGTTTTGAGGAATTTGATACTTTCCTACCAAATCAGAATCTCATATCTAAAGTGATGAAATCTCACCCAAATAGGCATAAGAGTTCCAAGTGGATGTTCCTGCATTTTACAGGACTACTGGCATTAAGTTTTTCTAGAGGGTCTGACATCTTAGTGAAAGACTGCGTACTTGCAATTATGACAACATTGAATCTGTTTGTTTTTGAAGAGGGAGATTTAGATGCATTATCATCGTTAATTGGATCTGAGAAAGCTGAAGAGGTACATTTATTTTTAATTACTTCGATTTGCCTTGCTCTTCAATTTTTCTTCTCTTTCACCATTTCTTTGAATTATTGCTTTTAACTATTGACATATCCTATAGGGCTTCTTACACCTAAAATCTAGTGAAACAGTTGCAATGGAGTTCCAAAAAACTCAGACAGTTCACATAAGGTACAGGGAGCCACTTTTTGCAATATCTTTAGAACTATCCCATAAATGGACAAAATGAAACTCTTACCTTCTGGGTTCGTTATACTTCACTCTTATGTATTTGTGTCATCGGGTGTCTGAATTCAGCTGCTCCTCTTTATGGATGTGTTAAAACTGTTTTACCTTTAAATGCAAATTCCATGGGGATCTCTTTTATGTACTTGTTCCTGCTTCCTCATCTCTTAGATTGCTATTCTTAATAGTTGGTTCTTCTTTAGAGAGAATTTCAAAACTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGACATTGTACAAACATGACAACGAGAAAAATGTTTGTAAACCCAAATGCTTCAGCTGACTGGATTAAATTGTTCTCTTCTATAGCATTAGCCTTGTTTTAAGATGTTTGATTGTTTAAGTTGTATTTCTTATTAGCAGTTCTTTATGCAGAAACTTTGCTGCTTGTGTATTTTTCAGTTCTTGTGACATTAACATATCAGAAAGATCTGGCTGGAATGGAAAGCTTTGACCATATTTTACTATTAAGAAGTTTTATCAGAGGTATACTTATTTAACCTTCATCTTGCAGCAGAAATTCTCTCGAAAGCTGCCATGGAAGAATACAGGATGAGTCGGGACAATGGTTGGAAACTGCAGCCATTCATAATAGTGAAAAGGGGAGTAGTGTTGAGATAGAGGAAGCGGAAGAAACTTGCAGTGGGGAGATATTTCTAAAATGTTTGGGCTCTTCATCCTATGATGATGATATAGCAGACTTTGTGGAGTGTAAGCGTGGGAAGGATTATTTGCAGTGGATGAAGAACAGACAAAAATATCGCAAATGGAAATCACATAAATTGGCAGTGTTGAGATGGAAGAAAAAGAAAAAAATTTGGAAATGTATCAAAACAACAAAAAGATGATAACTGATTTGCTAAAATAGCTTTCTGGGTATATTCTCTCTCTCTCTATATATTTTCTTTTTTAACAAACTCAATCTGCCAAATTCAATTGTTACTGGTCTAAAATATTGTGCAGACTTTACGATATCACAAAATCTTTAGAACATGTACAAATAATCGAATTGAAACTTCCAAATCAAAAGACACATTAGAAGTTTTCAATTCTGTCAAAATCTCGCTACTCCCTGTGATGATGATTCTTGCACTTACTCCTCTTGATTCTCGCATCTATTGTTTCTAGTTCATGTCCCCCTATGAGGGAGGAGGGAGAAGAAGACAAAGATGAGAGGAACAGAAAAAAGTGAAGAAACAATACAAAATATTTTGTTAATCTTTTTTCTAGTTTAAATTAGCTTATTAGCTGCAGTGTCAGTTAAGAAGGATCTCCATGGTCGAAGATAATATTCCTTTGTTGATCTTTTTTGTATTTGAAAATTAATCATTTGTTCGTTCTAAAGGCATACTTGGATTTCAGACTGTGAGATTTATATGTTAAATCTTGAAGTTTTAGGTCATATTGAGTTGCTGAGAAATTTTGAGTTGTTTTCACATTGGTTTTTTCCAACTCAAGATAACTTCAAAGAAATTAATTGTTTGGGCGTTGAATTTCTTATATTTACATTTAGACATTAAAAAAAAAATGTGAGTTAGATCTTGATGTTATTGAAATTAATTGTTTGGGTGTTGAAATTCTTGACCTTTTCTTAAAAAGATTAAAAAAAAAAAAAAAACAACAACAAACAACTAGAATGAAGCGTAATGCATATGTTGTTGCTAGCTCACTTGTCAAGTCTCAACCATTTTATCCCATTCATTGAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAATTCAAATCTCATTGGTGAGTCAAACTTCAGGTTAAAGGCAACCTTATTTTGACTTACAATTCTCATGGGCTAAATCTTACATTTACCATAAACCCTTCAAACAAGGTTTTAATTATCGCACTGATATTGTAAACACCACAGGATCTGAAATTAGTCACTATAAAACTATGAGCCTAGCCAACCAACATATGTGAATTTGTGGTAAGCCACTATTTTTACCATTTTAAAACAAGCTTTGCATAAGCTGTGAAATGACACACAGCTTTGCCCCATTATTGGGAACCATGAGTTTTACTCGTACAATGAAGGTTTAGTATTGGCCGGTTTGATGATGATGGGCTTTAGTGAACCAATAAAACCTTTCCTCCAGTTTGATGATTTGTCATATTTATGTTGTGATTTATGCTCTAAAACCTCTTAATTGATTAACTAATTAATTTCATTCTTAATTATGCAATATTAATTTATCAATTAACGAAAAAATCTAAGGTTATTGCATGTAGTCTTGAACAATATGTAGTTGACATATAAGGTGGATCATGTTTAAGAAATAACCTAAAAGTCTATAGTATATGAATAAAGTTGAATGTTTTATCTTGGATACACTATGAATACGACCCGCTTTGTAATAGTTACAAATGGTTTGATCCAAACTGTTCATGTGGAGACATATGAGTGGGGTATCTATACAAAGAGTTTGTATAAAATCGAACTACGAAATATTTAATCTCTTTTTGTAAATCCATTAATTGATGAGATTAATATTTC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BLAST of Cla003882 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KSZ0_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_5G651660 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1021.5 bits (2640), Expect = 4.7e-295 Identity = 516/618 (83.50%), Postives = 551/618 (89.16%), Query Frame = 1
BLAST of Cla003882 vs. TrEMBL
Match: M5XXI5_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa001682mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 506.5 bits (1303), Expect = 5.0e-140 Identity = 297/631 (47.07%), Postives = 393/631 (62.28%), Query Frame = 1
BLAST of Cla003882 vs. TrEMBL
Match: B9H418_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0004s14130g PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 498.8 bits (1283), Expect = 1.1e-137 Identity = 290/651 (44.55%), Postives = 408/651 (62.67%), Query Frame = 1
BLAST of Cla003882 vs. TrEMBL
Match: B9H417_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0004s14130g PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 498.8 bits (1283), Expect = 1.1e-137 Identity = 290/651 (44.55%), Postives = 408/651 (62.67%), Query Frame = 1
BLAST of Cla003882 vs. TrEMBL
Match: B9SX39_RICCO (Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis GN=RCOM_0304050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 495.4 bits (1274), Expect = 1.2e-136 Identity = 289/652 (44.33%), Postives = 409/652 (62.73%), Query Frame = 1
BLAST of Cla003882 vs. NCBI nr
Match: gi|659119457|ref|XP_008459668.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103498717 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1036.9 bits (2680), Expect = 1.5e-299 Identity = 522/612 (85.29%), Postives = 561/612 (91.67%), Query Frame = 1
BLAST of Cla003882 vs. NCBI nr
Match: gi|449447789|ref|XP_004141650.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101210920 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1021.5 bits (2640), Expect = 6.7e-295 Identity = 516/618 (83.50%), Postives = 551/618 (89.16%), Query Frame = 1
BLAST of Cla003882 vs. NCBI nr
Match: gi|596279542|ref|XP_007225249.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa001682mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 506.5 bits (1303), Expect = 7.2e-140 Identity = 297/631 (47.07%), Postives = 393/631 (62.28%), Query Frame = 1
BLAST of Cla003882 vs. NCBI nr
Match: gi|224080071|ref|XP_002306006.1| (hypothetical protein POPTR_0004s14130g [Populus trichocarpa]) HSP 1 Score: 498.8 bits (1283), Expect = 1.5e-137 Identity = 290/651 (44.55%), Postives = 408/651 (62.67%), Query Frame = 1
BLAST of Cla003882 vs. NCBI nr
Match: gi|566166437|ref|XP_002306005.2| (hypothetical protein POPTR_0004s14130g [Populus trichocarpa]) HSP 1 Score: 498.8 bits (1283), Expect = 1.5e-137 Identity = 290/651 (44.55%), Postives = 408/651 (62.67%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (97103)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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