ClCG11G014040 (gene) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTGGGTCCGAAGCAGAGATAGATAGGATTAGCGAACAGAGATTGCGTCTCTTCACCCGGCGGCGCGTGAATCTTACGCGAGTGTTGATGGCGCAGTACGGCGAAGGTAAATGGAAGAGCAAACGGTCGCTGTTAATCGCGACGGTGAACTTTCTGTTGTTTCTTCTGGTGGCAGTTTCTGCAGACAGAGGCCTGAAGATGCCGGAGGTTTCAACGCTGGAAGGAACACGGCGAAGTCTTTCCGATCAGCGGCGAGATTTAAAAAGTCTTCTCAAAATCGCGAAGACTTTTCTTTGGCAATCGGACGGCTCCGGTTATGAACATGTCTGGCCTGTAAGTGGACTCGATTCTCCAGATTTATTATTATTTTTATTAATGTTTAAAAAAAAAAACAAAATTATTATAATTTATAATAAAAATTAGATTTGAAAAGAATACGTAAGATCCTGAGGAGATGAATAAAATATTAGGGAAAAAAAAAAGTCCCACTTTATATTATATTTAAGGTGGCATGAGTTCAAACTCTACTTGTGCTCTCTTTTGTTTTATTTTTCATTTTTCAATTTTCTTTTCTCTTTAATTTCTTGTTTGTTTTTGTTTTACTTTTGATTATTTTATTTTTATTTTTAAGCTAGTTGAATAATATAATATTTTAATTATTTGAAAAATATATTATATTGCCATTTATTTATTTTCAAAGAAATTTAAATTTAAATTTAAGTATTAATTATAGTTAAATTATAAAATTAGTCTTTTTGTCTAAATTTGGTATCTCGAGTTTAAATTTTGAGTTTTTGAACTTTTGTTTTTTTTGCCCATTTTTTATTTTACCTTTAAATGATTAATGTAATCTCGGTGATGTCAGGATAGATATAGTTACAATGAATTAAAAAATAAAAAAAAATAAATGAAAAATAAAACAAAAAAAGTGCACAAATAGATCTCAAACTTACACTACTAGTTGCCATTTGTGAATTTTGAAGCATCGGTTTAGACATTTTTTTAAAATATTTTGTTTTTCGTGTGTTTTCAAAAGATAGGGATTTATAAAAATTTATTTCAACTTTTAAAAAAAACATAGCACACTTTAGTTAGGGTAATAATTGGGTGTAGTTTTCTTTTAAAAAAAACACTACATACAATTGTGGTAGGATATTCGAACCACAAACCTTTGATACTCAACACATACCAATGTCAATTGAGCTAAGGCCACATTTTCCCCAGATTAAATGTAATCCATTAACGGTAATCTAAAAAATGAGTCCCAGTTGATTATAATTGTTGTTGTTTACTTGTGTTCTGCAATCATAACGAGTTGTGGGCTTTGACTCCAAATCTGTAATCAAAATGTGTAATTTGATTGAGAAATGAAGTGTGTTTAATTTGACTGTGGTTGAATATTACGTAAGATCTACTACCTTTACCGTTATCATTATAGATATTGTTTCTATAATAATATGAAAATTATGAATTTGTCACATTTATTGTTACCTTTATTTTTATCGTTACCATAACCATTATTTCTGGACTCTAATGGTAACAGTAACAAACGTTAGGGTCAAGCAGAAACGGTAATGATATAGTAATAATAAAATGTGATAGATTCCTAATTCTAAGTAAATGCAATCAAAAGCAATTCAATTACATTTTAAATTCAGGTTCATTAGAATTGACCTATCAATAGAATCTCATTATAATTATATCAATTTTGATTACCGTTTAATAAACATGGCCTAAACTCGTAGTTTTAACCATTACACCCTATATTTTGTTTCTTAAAATAGAAAAAAATTGAAAGGTTAACATTGAAATTGACTTAACAGGAGATGAAGCTTGGGTGGCCCATTGTTTTTGGCACAGTAGTAGGATTCATTGGAGGGGCTTTCGGGAGCATCGGCGGTATTGGTGGAGGCGGCTTTTTCCTTCCAATGCTTAATCTCATTCTTGGATTTGATGCCAAATCCTCCACCGCCATGTCCAAATGTAAGAAACTCCTCTACATTAATACCAATCTTCATTAATTCATCTATATTCATGTTATTATAAATAGAAAATTTTTTTTTTTACAATTTTAGTCCATAATTAATTTATTTTAAAATGTATTAAAGGTAGTTACTTAAGAAAGAAAATAAAAGGATCTTTGGTGTTTATATGTTTGAACAATTTATAGGTATGATAATGGGTGCAGCAGTGTCGACTGTTTGTTATAACCTTAAACTAAGGCATCCATTGTTGGATGTGCCAATGATTGACTACGATTTGGTGCTTCTGGTCCAGCCCATGCTCATGCTTGGCATCAGCATTGGAGTCATTTTCAATGTCATTTTTGCCGATTGGATGGTCACAATTCTCCTCATTATTCTCTTCTTATGTAATAAATATTATGCAACTCTCCTCTCGTTAATCTCCGGTTTACTAACGATTTGATTTTTTAATTTTTTAAAATTTATACTTGTTTTTTTCTTAAATTTCATAAGTCTGAGTTTTTACGATTTTTAAAGAAACACTTGATTTTTTTTGTCAAATTTGGTAAACTAAGGCTCTATTTCAAAATATTGGTGAAAAGTGGACGACAAAGCAACAAAAAATAGTGTTTATAAGATTACTTTTTTAAAAATAAAAAACTAAAAGTCAAATAGTTATTAAACAGAGACTTATTTACTTGTTCATTTTCTCAAAATTACAAAAAGTATTTTCAAAGTTTATCATTTGTTTCAAAAGTACATATATTCTTTAAAAAGTCTCAAAATTATTTTGATCATTCATAAACATTACAAAACTACTTTTGGAATAGTAATCTTTTAGAAGGTTGGATCCTACAACATTTTAATAAATTTATACTCTATAGATAGTTTTATAATGTTTATGAAATACAATGACAATATCGCAACTTGCAAAATAATATGAGTATTTTTTAGACAAAATTCGGAGTATTATTTTGTAATTTTGCCTCTATTTTTCTATATTCGGTTTGTTCTTTGACACCAGATTTTATTAATTTTTTCCCATTTCTTTGAAAGTCATATCAACCAAGGCATTTCTAAGGGGAGTTAAAACTTGGGAGAAGGAAACGCTTCTCAAAAGGGTTATGCATCTCTCCCCTAATTCTTTTACTTTGTTTAAAATTTGAATTCTTTCTCTTCTACTAAACTTGTTTTGAATTGGATCGGGTCGGATCGGGTCGACTTTGATTTAGGAAGCGGCTGGTGAGTTTGATTAATGTTTTATTCATTATAAGAAAATTTTAATGTTTATTATACTATCTTCTATTCTAATTGTAGCATTGTATTGGTTATTTTAGTATAATTTTTCTTTTTTCTTTATGTATTAATCGATGATATTTACTTATAGCAACATGATGTGTAAAATTTGAATCTTTAACCTCTTAGTAAATGATTCATATTTTATATTAGTTAGCTATGTTTATGTTTATATTGGCAGTTATGAATGTACTTTGATTAATTGTGATTACTAATAGAATACAAATGTTATAATGTGTTTTAAAGTATGCTAGATTTTACAATTAACCATTAATTACATGTAATTGGTTTTTAAATGGAGGCTTTAATTAGAGTCATTATTCCATTATCAGCCACTGAAGGTCAAGATGGAGAGAGGGACTACAAAGCTATTCCTGGTGGGCCCCAACAAGAAACAGAGAAAGCACAATCAGGAGTAAGGGCACACTGAAGTCATATGACAATATATTTAGGAAAATAAAATATAATTATTTTAAATGTCATAATTATTGTAACTATTTTTAAATATATTAAAATTTTACTATCTATTAGCAATATTTTGCTATATTAGAAAACATGTCTAAATTAAATTTAAAAAGAAATATAAATCGAAAACATGCCTAAAGTTATAAGAGAAAAAAGGGTGATGGGTGCATCTCACGTGTTTTTTCTACGTATAATTAGTTGTACAAGATAAAAATGATTTAGTCCTTGCGAGTTGTCGTTGCAACTTATTAAATTATTCATTTATTTAAAGGTTTCCTATATATATAGCCTTAATTGTAGGCCGAACTATTGAATTTCAGATCTCAATTGTGAAGAATGTTCATTGGAAGGAATTGGGTCTTCTTTTCTTGGTTTGGCTCGCCTTCCTTGTCTTCCAGATTTTCAAGGTGCCCTTCCTTCTCTTATTATTATTATTATTTATTTTAGTTTTCTCTAAGAAGACGTAGAGTATTTGAAAAACTTTAAATTCAGCATAATTCGCGTATGAAAATAGGAAAGAATTAATATTTGGAAGCCTAAATTTAGGCTGTAATATATGAAAGATAGACCAGGTAAATCTAGGTTTGGTTTAAATTCAATTAATTACAGGAAAATTTAGGAATAGTTGCAAATATAGTAATCAAACTTATATTACCAAATATAACATAATGTAAAAAACTTATGACAAATATGTATTTTTTTCCTTTATAATATGGCTTTACGGAAAAACTCTATAATCTTTTTTTAGAATCATAATTGAAATTTTAAATTTGACCCTTTTCATATTTGCATGCTTTGATGGACCGTTTTAACAGGAGAAGACAGTGTCATGTTCGTGGGAATATTGGATATTAAACTTTCTGCAGGTATGTCTTATGGTTAATTGTAAACCACTTCATTTAGAGTTTCAGCTAAAAGCGTTTGGATTGACTAGAGAAAAAAATGTTTTCTAAAAGGATTATTTTTGTTAAAACTATTTTGATAAAAATTGTTTAAAATAAACGTTATTTTGAGTGGTTACCGAATACTTCAATTTTTTACATAATAATTTATTTTCAAAATTATAATACCTTAAATATACTAAATCATCTCTATTAGTTTTAGGTAATTTAAAAAATCTCAACCGGTCTAAAATTTTCTTTTAAACATTGTTAATTTAGACTTCATTTGATAACTATTTAGTTTTTGCAAAATTAACTTGTTTATAATATTTTTCATCTTTATTAAGTAAAAAAACACTGTCATTTTTCAAATTTTATATTATCTGAAC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BLAST of ClCG11G014040 vs. TrEMBL
Match: B9H9B5_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0006s25880g PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 261.5 bits (667), Expect = 9.0e-67 Identity = 128/202 (63.37%), Postives = 158/202 (78.22%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. TrEMBL
Match: A0A067KDQ8_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_07783 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 260.4 bits (664), Expect = 2.0e-66 Identity = 130/202 (64.36%), Postives = 162/202 (80.20%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. TrEMBL
Match: B9RS52_RICCO (Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis GN=RCOM_0803020 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 259.2 bits (661), Expect = 4.5e-66 Identity = 127/202 (62.87%), Postives = 155/202 (76.73%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. TrEMBL
Match: V4WBV1_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10008167mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 259.2 bits (661), Expect = 4.5e-66 Identity = 132/202 (65.35%), Postives = 158/202 (78.22%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. TrEMBL
Match: A0A067GJD4_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g011811mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 258.5 bits (659), Expect = 7.6e-66 Identity = 132/202 (65.35%), Postives = 157/202 (77.72%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. TAIR10
Match: AT2G25737.1 (AT2G25737.1 Sulfite exporter TauE/SafE family protein) HSP 1 Score: 233.8 bits (595), Expect = 1.0e-61 Identity = 118/195 (60.51%), Postives = 140/195 (71.79%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. TAIR10
Match: AT2G36630.1 (AT2G36630.1 Sulfite exporter TauE/SafE family protein) HSP 1 Score: 173.7 bits (439), Expect = 1.2e-43 Identity = 90/196 (45.92%), Postives = 124/196 (63.27%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. TAIR10
Match: AT1G61740.1 (AT1G61740.1 Sulfite exporter TauE/SafE family protein) HSP 1 Score: 97.4 bits (241), Expect = 1.1e-20 Identity = 48/137 (35.04%), Postives = 86/137 (62.77%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. TAIR10
Match: AT4G21250.1 (AT4G21250.1 Sulfite exporter TauE/SafE family protein) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 5.6e-20 Identity = 45/117 (38.46%), Postives = 71/117 (60.68%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. TAIR10
Match: AT1G11540.1 (AT1G11540.1 Sulfite exporter TauE/SafE family protein) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 2.1e-11 Identity = 33/82 (40.24%), Postives = 51/82 (62.20%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. NCBI nr
Match: gi|566178174|ref|XP_002309560.2| (hypothetical protein POPTR_0006s25880g [Populus trichocarpa]) HSP 1 Score: 261.5 bits (667), Expect = 1.3e-66 Identity = 128/202 (63.37%), Postives = 158/202 (78.22%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. NCBI nr
Match: gi|802633385|ref|XP_012077447.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105638269 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 260.4 bits (664), Expect = 2.9e-66 Identity = 130/202 (64.36%), Postives = 162/202 (80.20%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. NCBI nr
Match: gi|802633387|ref|XP_012077449.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105638270 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 260.4 bits (664), Expect = 2.9e-66 Identity = 130/202 (64.36%), Postives = 160/202 (79.21%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. NCBI nr
Match: gi|223544391|gb|EEF45912.1| (conserved hypothetical protein [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 259.2 bits (661), Expect = 6.4e-66 Identity = 127/202 (62.87%), Postives = 155/202 (76.73%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G014040 vs. NCBI nr
Match: gi|1000972679|ref|XP_015573182.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC8271211 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 259.2 bits (661), Expect = 6.4e-66 Identity = 127/202 (62.87%), Postives = 155/202 (76.73%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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