ClCG11G009130 (gene) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAAAAAAAACAACAGTACGAGGACCTTCTAAAATCATTTCCCTCTTCCACTTTCTTCTTCATTCTTCAACCCGTCTCCTTCTCAGAGCTTCCATTAGGCAGCATCGAATCACACAGCCTCCTTCAACTCAGCTGAACAGAAGCTTACTTCACTTCTGGGAGCAATGGTTGGAGCAGGAGGCTTTCTCCCTCTTCATTGTTTCTGGTCCCGGAAGTCCGAACCCGAACCCGAACCCGAACCTGATCGCGACCCGGTCCTGCTCGTCACCGGCATTGGGGGCTCCATTCTTCACGCCAAGAACAAGAAACTGTTCGGCTTAGAGACCCGTGTGTGGGTGCGGATCTTCTTGTCCGACCTAATGTTTCGTGAGAAGCTCATTTCCCTCTACAATCCCGACACAGGTCCTTACTCATTCCCCTTCCAATCCCAATCCTAATTCTCTGTGTCTTTGTTTCATTTCATAGCTTTTAGTTTTGAGCGTTTGGTTGCTGCTATGGAAGTGATGGAATCTAGATGGTTTTAGATTATTCCATTTGCACGTGTTTTGGGGCTTCTTTTTAGGGTGGGTGAAGTTTGGGAGCACTTTTTTCTTCTTTTTATTAAAAGGAAAGTGTTTTAATGTGCTTACTTACGTTATGCTTTCATAAATTTTTATTTTGTTGCACTCAATCCAGTCCAAAAGTGATTCTATTCATCATTATTTTTTTTCCTCTTATTTTCTTAAAAGGGAATTTAATCAAATTTTCCTGTTACACTATAGTAAAAAATAAGTGATTCTATTAATCACAAATTTGTTTTTTTCCCCTTAAGATTCTTGGTAAACACTTTTTTTCCCCTTCTTCTTTTAAATGTTTTAAAATCAATATGATTCTTTTTTTTTAAAAAATAAACTAATGCATAAAAAATGGAAAAAAAACATTTAGTTGTCAATAATTTCTTATTGAGCACCATTCTGTTTACCAAGTCAAACTGCTGGTAGGATAATGAAAGAAACCAGATAATAGAACTTGGAAATTATATTGAAATATCAATAGGAAAATAAAGCAAGATACTTCCCAGTGTTTCAACTTTCAAGATACCCTCTTCTAAAAACTCAAGACTAAAGCTAAACCACTACAGAATCCCCTTCTATTTTTAGCAAACTCTTAATACCTTATCTTGCCCATTACTGAACAGAGAAGTCTTAAAATATTATTCATTAGGTTACCCGAAATGATGCTTTTTTTCAAAATTTTTAATTTTTAAAAATTTATTTTATATATATATATCAAGGCTGTTTTCTAATATAGGAAATGAACCAAAATATTTACAAATATAGCAAAATTTCACTGTCTATTTGCGATAGATTGTGATAGACTACTATCTATGTCTATCTGTGTCATGATAGACACAACATATCTAAAATTTGTAGTCTATCCGGATCTATTGGAAACTGTGATATTTTGCTATTATTTGTAACTATTTTCTGCAGTTTTGTCATTTAAAATAATTTTTCATATATATATTTACACTACTATTAGTCATGAGTGATGACAATGTGTTGTTCCTTCCCTGGTTCAAATAGGAAGTGGTTGCATTAATTTGCAGTGAAATTCTTGTAATATTCAGATCTGGGGTTTTAACTACAAGATCAGCCTTCATCAAACTCACTGAAACTTCCCAAAAGCTTAAAACCCCTCTGATTGATATAATATGGAAGTTTAATGTTCCCAAGAAGATCAAAGTTTTTCTTTGGAGTTTGGCTTATAAAATATTGAACAAAAACGAAAGAGTTTGCTAACTGGAGCCTTTCACCTTCGGCAAGTAGCTTGTGCTTCAGAGAAGAAGAAAATATTGATCATTTATTTATCCAGTGCCCTTCTGCTTCAGGTGGTTGGAATCTTCTTTTAAATACTTGTTGTTTGCCTTTGTGTTTGCCAAATTCTGTGATGAAGTGGATTTTTGAAGCATTAAATGGTCGGAACCTTAATGGAAAAATTGAGGCTTTGTGGAAAATTGCGGTTCAAGCTTACCTTTGGGAAGTTTGGAGGGAAGGGAATCGGAGGGTCTTGAAGATATGTCTGATACGTCTTACACTTTATTTATTTATTTTTTAAGAAATGAATTCAACTATGAAATTATCCAAAGAGATAAAAAATTGGTCCCATTCAAAGGGAATACAAAAGATGTCTCCAATTTGCATCAAGGAAATTTAAACTATGACTTTTGAGGGGTTGTAAACTTTTACACCAAAAGAGAGCATTGAAAATATATAACTCTAAAACATCCCTTTAAGATCTTTCTTTACCTTGGAAAATTCTTGCATATCTTTCCTCCCAAATCTTCCATAAAACAACTCAAACCATGATGGACCATATGGGGGTGTTAGGTCTCCCAATTTCAAGTTGGTGGAGTTGGTTATTATAGCCCACTTCATGTTTGGGGCACCGACTATAATAGTTGTGTTTACAACTATTTATTACATACATTAAATACTATTTCAAAACCCTCTTAGCTATAGTATTTACTATTTTCCACTGATCCTCTCTTTTTCTCTTTGCTATAGATTACAGTGTTTACTATTTCCTATCCAAACTAAAATAGTCTGCACCCCAAACACAGACTATAACTTGGACTAAAATAGTATGTACCCCAAACACAAACTAGCCACAGACTATGATAACCACAAACTATAATAACCAACTCAATGTCCCAAAACACCCCACATACTCTTTTGTAGACTTAAAGGATGATCAATAATTAACATCCTAAACCATGCAATAGAATCAGATGGAGGAGGTATGGACTAGCCGAAAGCAGAAAATAACTCAGCCCAAATCTTAGCAACAAATAGGCACTTGAAGAATATATGGTTCTGGGTTTCCTTATCTCTCTGGCAGAGCAACATCAAGATGGAGAGGTGGATCCAGGTGCATCTCTTTTGAAGCCTATCCATAGTACTAAGGCAAGAATGGACAATTCCCAAAGAAGAAATTTAATTCTTTTTGGGCAAGGAAACTTTGATATGTTTTTGTAAAGGTTCTGTGATGCTCACGAATTGGTAACAATGAGATGGGAAGTCAGTGAATTAACGGTGAAAGTACTGCTGTTGTTAAGCTTCCATTTCCAACTGTTGGGCCGGTGTGTGAGTTGAATGACAGGGACAAGCTGATTAAGGGAGACTCATTCGACAGTTCCATTATCTTTGAGATTTCTTTTAAAATTTAGAACCCACGAGCTGTTTCCGAGGTTCCAAAAGTTAGCAATGGAGGCTTTTTTAGATTCAGCAATGGGAAAAAGCCTTGGGCAACATTTTCTAAGGGCTTCATTCCCAATTCAAGGGTCAAATCAAAATGAAGCGGTTTTGCCATCCCCAGCAATGCACTGTATGTGGTTAAAAATAAGATCCTTCTACTGTATGTGGTTAAAAATAAGATCCTTCTTTTACTAATGTGATTCCATGGATTTTTTTTGAAGGAGATATGATGATTCAAGGAAGGTTTTTTTTTTTTATCACAATGATGAGAACCATACTTTGCCTTGATGGTTTTTCTCTAAGGAGCCCTTTTTCCTGTCTAAAGTGCCTAGTCCATTTAGTTATAAGTTGAAAGTTTTGAAGAAGAGTATGCACTTTACTTGGCTAGCAGTGTATGGGAGGGTTAACACCATTGTTTATTTTGAGATTGTGCACAGCTGGTGCATTTTTGTGCAAGCATTCGTGGGAGGGATCTTGATCACTTGTTGGGGCTTTGTGCTTTTTAGTCTTAATGTACGTGACTTTTTGGAATGCTTTCAAAGTAAATTTGGCTCCTTGTTAGTGGATCAGGGATGCTTTTGTTGAGCTATTTCCTTATTCTCCATTCTTGAGGAGGGGGAGTGTTATGGAATTGATGAACAAAGAAAATAGAAAACTTAAAATAATAGAGAACCGACATATAGATTTACATGATTCACTTACAGTATGTTAGTTACATCCACGGGAAGAGGGAGAACAATTTATTACTAGGAAGAATAATGCAGATTATAGAGTAAATGGTGCTTCTAGCGTTAGAGAGTTTATATAGTGCACTTCTCTAAACCATCATAATCATAAATAAATCGAAAATAATATAAATATGAGAAATATGAATTCAACTTAGGTTTTTTAATTTTTAGGATAAAGTTGCTACATGGGAGCAGGTTTGGATTGCCTCCACGCTATAATGCTTCTTTGTGGGCATCTATATCTTTTGTATGTAGTCTTCCCATTTTTATTTTTGCAATTTGGAAGAGTTACCTCCACTTCTGGCCTTTCTTGTAGTTGCACTTTATTGAAAAAAAGAAAACCTTCCAATTTCAATCAGGATGGGTTTTCCAAGCATATGGGGCAAAGAAGACTTTAAAGTGATTTTTTGCCATGTCGATTAGGTTAGTACCACACTTTCGAGACCTTTTAATTGAATATATACCAACAATAATGTCCATATAAACTATTCGAAGAAGGAAACTTCTCCACCTTTTGTTCTTGAGTTTGCAAAGTCTTATCTGAATTTCCTAACTGAGCATCACAGGTTTTTTGTTTTTTCAGGCTGTACTGAATGCGTGGATGATAACATAGAAATTTTGGTCCCTGATGGTGATGATGGCCTGTATGCGATTGATATTTTAGATCCATCTTCGGTAAGATAACATGAAAATTTCTACTTTGGCCTTTATAACTTATTCATCATTTTATAGTGATAAATCGGTGAGCGAATGTCTCCCATTTTTTAACTTCACCAAATTCTCCCAAGTTGTGTGGTAACGTTTCTGTTATTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN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ATGAGATGGGAAGTCAGTGAATTAACGGTGAAAGTACTGCTGTTGTTAAGCTTCCATTTCCAACTGTTGGGCCGAACCCACGAGCTGTTTCCGAGGTTCCAAAAGTTAGCAATGGAGGCTTTTTTAGATTCAGCAATGGGAAAAAGCCTTGGGCAACATTTTCTAAGGGCTTCATTCCCAATTCAAGGGTCAAATCAAAATGAAGCGGTTTTGCCATCCCCAGCAATGCACTGCTGTACTGAATGCGTGGATGATAACATAGAAATTTTGGTCCCTGATGGTGATGATGGCCTGTATGCGATTGATATTTTAGATCCATCTTCGGTGGTAAAATGCCTCCATGTGGATGACGTGTATCATTTTCATGATATGATTGATATGCTTGTTGGATGCGGGTACAAGAAGGGAACCACATTGTTTGGTTTTGGTTATGACTTCCGGCAGAGGGCATTGATTGTTCTTGGTGACAGAATTGGCAAAGCTATGGATGGTCTTAAAGCTAAGTTGGAAACTGCCAGTAAAGCTTCTGGTGGTAGAAAAGTGAATTTAATATCTCATTCTATGGGTGGGCTGCTAATTTCGTGTTTCATGTCACTCCATAATGATACTTTTTCCAGATATGTAAATAAGTGGATCTCTATAGCTTGCCCTTTCCAAGGTGCACCGGGATGCATCAATGATTGTCTGTTGACTGGATTGCAATTTGTTGAAGGCTTTGAAAGCCAATTTTTTGTATCTCGATGGACGTTTCACCAGCTGTTGGTTGAATGTCCTTCAATTTATGAGATGCTGGCAAATCTGGGATTCAATTGGCATGCACAACCACAGATCCAAGTTTGGCGAAAGAGTTCTGTCGATGGGAAAACTTCTGTTGATTTGAAGTCGTATGGCCCAACTGACAGTATTGCTTTATTTGAAGAAGCATTAAGAAATAACGAGATAAAATTTCATGGAAAGACCATTCCTCTGCCCTTCAACTTTGATATTCTCAAATGGGCTACTGGTACTCGCCAAGTAATTGATAGCGCAAGAATACCAGATGGAGTCGCCTTCTATAATATTTATGGAACATCATTCGATACACCTTTTGATGTGTGCTATGGCTCAGAGTCATTGCCGATTGAGGACTTGTCTGAAATCTGCCAAACTTTGCCTCAGTATTCCTATGTGGATGGAGATGGTACAGTTCCTAGTGAATCAGCCAAGGCTGATGGTTTTGAAGCAATTGAGAGAGTAGGAATCGCAGCAAGTCATCGAGGACTTTTGAAAGACGAAACAGTGTTTCAGTATATCCAGAAGTGGTTGGGAGTTGAAGAGAAGAAGACTAGTAAGCACCTAACAACTTCCAAAGTGGTCGATGCTTCTCTGAAGTAG MRWEVSELTVKVLLLLSFHFQLLGRTHELFPRFQKLAMEAFLDSAMGKSLGQHFLRASFPIQGSNQNEAVLPSPAMHCCTECVDDNIEILVPDGDDGLYAIDILDPSSVVKCLHVDDVYHFHDMIDMLVGCGYKKGTTLFGFGYDFRQRALIVLGDRIGKAMDGLKAKLETASKASGGRKVNLISHSMGGLLISCFMSLHNDTFSRYVNKWISIACPFQGAPGCINDCLLTGLQFVEGFESQFFVSRWTFHQLLVECPSIYEMLANLGFNWHAQPQIQVWRKSSVDGKTSVDLKSYGPTDSIALFEEALRNNEIKFHGKTIPLPFNFDILKWATGTRQVIDSARIPDGVAFYNIYGTSFDTPFDVCYGSESLPIEDLSEICQTLPQYSYVDGDGTVPSESAKADGFEAIERVGIAASHRGLLKDETVFQYIQKWLGVEEKKTSKHLTTSKVVDASLK
BLAST of ClCG11G009130 vs. Swiss-Prot
Match: LCAT3_ARATH (Phospholipase A(1) LCAT3 OS=Arabidopsis thaliana GN=LCAT3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 1.6e-148 Identity = 255/377 (67.64%), Postives = 303/377 (80.37%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. Swiss-Prot
Match: LCAT4_ARATH (Lecithin-cholesterol acyltransferase-like 4 OS=Arabidopsis thaliana GN=LCAT4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 373.2 bits (957), Expect = 4.0e-102 Identity = 182/363 (50.14%), Postives = 246/363 (67.77%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LHR5_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G093800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 723.8 bits (1867), Expect = 1.3e-205 Identity = 350/378 (92.59%), Postives = 364/378 (96.30%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. TrEMBL
Match: A0A061F5E5_THECC (Lecithin:cholesterol acyltransferase 3 OS=Theobroma cacao GN=TCM_025110 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 582.0 bits (1499), Expect = 6.2e-163 Identity = 276/376 (73.40%), Postives = 318/376 (84.57%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. TrEMBL
Match: I1N411_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_18G244500 PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 578.6 bits (1490), Expect = 6.9e-162 Identity = 275/375 (73.33%), Postives = 314/375 (83.73%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2RB37_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_004G264000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 578.6 bits (1490), Expect = 6.9e-162 Identity = 274/376 (72.87%), Postives = 320/376 (85.11%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. TrEMBL
Match: A0A072UC29_MEDTR (Lecithin:cholesterol acyltransferase family protein OS=Medicago truncatula GN=MTR_7g080450 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 578.2 bits (1489), Expect = 9.0e-162 Identity = 277/374 (74.06%), Postives = 315/374 (84.22%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. TAIR10
Match: AT3G03310.1 (AT3G03310.1 lecithin:cholesterol acyltransferase 3) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 9.2e-150 Identity = 255/377 (67.64%), Postives = 303/377 (80.37%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. TAIR10
Match: AT4G19860.1 (AT4G19860.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 373.2 bits (957), Expect = 2.2e-103 Identity = 182/363 (50.14%), Postives = 246/363 (67.77%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. TAIR10
Match: AT3G03370.2 (AT3G03370.2 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 3.0e-07 Identity = 28/51 (54.90%), Postives = 33/51 (64.71%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. NCBI nr
Match: gi|449442247|ref|XP_004138893.1| (PREDICTED: phospholipase A(1) LCAT3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 723.8 bits (1867), Expect = 1.9e-205 Identity = 350/378 (92.59%), Postives = 364/378 (96.30%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. NCBI nr
Match: gi|659082295|ref|XP_008441766.1| (PREDICTED: phospholipase A(1) LCAT3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 722.2 bits (1863), Expect = 5.5e-205 Identity = 350/378 (92.59%), Postives = 364/378 (96.30%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. NCBI nr
Match: gi|1009118245|ref|XP_015875755.1| (PREDICTED: phospholipase A(1) LCAT3 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 594.0 bits (1530), Expect = 2.3e-166 Identity = 280/378 (74.07%), Postives = 328/378 (86.77%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. NCBI nr
Match: gi|590637791|ref|XP_007029217.1| (Lecithin:cholesterol acyltransferase 3 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 582.0 bits (1499), Expect = 9.0e-163 Identity = 276/376 (73.40%), Postives = 318/376 (84.57%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G009130 vs. NCBI nr
Match: gi|823154131|ref|XP_012476928.1| (PREDICTED: phospholipase A(1) LCAT3 isoform X1 [Gossypium raimondii]) HSP 1 Score: 578.6 bits (1490), Expect = 9.9e-162 Identity = 274/376 (72.87%), Postives = 320/376 (85.11%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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